Q981B7 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q981B7 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q981B7	Sequences: MIDNTLITKPSYVAHSMDKLSDIISKMKENKMWTVPVIKDRKLIGLISYKDLLSRRVSLETKAINIMSPSVTVQIDEDINRLIAKFYTTKARVIPVINEKREFIGLVTRESLLSYLLKANEIPENRTAREYMTSPATSIDENDSIARARWLMIRDNISRLPATKEYRLTGIISARDIVDALYSVSGRKRESIMKDEERVMAMPVKEIMKYPVITANGKDSLTDVVEKLLKFRISGMPVMEGDRLSGVISGLDIIKAVAEKMQLSIPIEAKIPQELKSNLEFKANIDDILERYLSKIERLTEVINFKVSFKEEMRSSTGNKKLYTAMVRVTTKIGDYVARDTDWEPVVALKNAVEKIEERILRKLRKIEESNKKGIKAEEA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	380 (313)
Sequences:	131 (99)
Seq/√Len:	5.6

HALSA - Q9HPF4
SULSO - Q981B7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
190_E	194_K	6.356	1.00
191_S	194_K	5.616	0.99
215_A	238_V	3.297	0.82
190_E	193_M	3.252	0.81
172_I	207_I	3.087	0.77
147_R	151_L	3.049	0.76
136_A	173_S	3.019	0.76
187_R	191_S	2.834	0.71
213_I	233_I	2.723	0.67
186_G	191_S	2.592	0.63
83_I	96_V	2.469	0.59
53_L	143_D	2.324	0.54
116_L	128_A	2.318	0.54
171_I	233_I	2.294	0.53
111_S	248_I	2.265	0.52
163_T	186_G	2.227	0.51
93_V	195_D	2.134	0.48
54_S	104_I	2.117	0.47
341_T	344_E	2.111	0.47
145_I	223_D	2.111	0.47
171_I	195_D	2.091	0.47
86_F	94_I	2.055	0.45
188_K	191_S	1.994	0.43
186_G	190_E	1.983	0.43
74_Q	219_D	1.949	0.42
248_I	272_P	1.927	0.41
148_A	283_A	1.926	0.41
128_A	224_V	1.917	0.41
126_R	215_A	1.901	0.40
82_L	293_L	1.866	0.39
360_I	371_N	1.836	0.38
207_I	248_I	1.823	0.38
77_E	245_S	1.791	0.37
187_R	190_E	1.781	0.36
150_W	154_R	1.753	0.35
78_D	334_G	1.722	0.34
99_E	107_V	1.711	0.34
63_A	242_D	1.688	0.33
209_K	231_F	1.677	0.33
90_K	194_K	1.670	0.33
111_S	244_L	1.669	0.33
95_P	331_T	1.642	0.32
145_I	303_I	1.633	0.32
143_D	171_I	1.618	0.31
340_D	358_E	1.615	0.31
289_L	325_A	1.608	0.31
187_R	194_K	1.607	0.31
73_V	139_I	1.596	0.31
62_K	348_A	1.596	0.31
356_I	360_I	1.590	0.30
341_T	358_E	1.577	0.30
90_K	276_K	1.550	0.29
186_G	194_K	1.531	0.29
91_A	303_I	1.530	0.29
142_N	164_K	1.526	0.29
178_V	181_L	1.518	0.28
178_V	220_S	1.503	0.28
171_I	273_Q	1.496	0.28
54_S	57_V	1.485	0.27
159_R	173_S	1.484	0.27
139_I	160_L	1.483	0.27
168_L	212_V	1.483	0.27
133_T	316_S	1.475	0.27
139_I	243_R	1.468	0.27
77_E	127_T	1.467	0.27
63_A	219_D	1.461	0.27
165_E	169_T	1.448	0.26
171_I	234_S	1.443	0.26
143_D	262_Q	1.441	0.26
53_L	147_R	1.435	0.26
53_L	56_R	1.427	0.26
81_R	219_D	1.423	0.26
92_R	323_Y	1.414	0.26
207_I	288_I	1.405	0.25
96_V	161_P	1.394	0.25
66_I	160_L	1.393	0.25
126_R	220_S	1.383	0.25
170_G	176_D	1.383	0.25
176_D	208_M	1.376	0.25
90_K	188_K	1.374	0.25
224_V	327_V	1.356	0.24
244_L	248_I	1.355	0.24
232_R	295_K	1.354	0.24
79_I	115_Y	1.352	0.24
54_S	213_I	1.349	0.24
234_S	284_N	1.348	0.24
207_I	290_E	1.332	0.23
172_I	216_N	1.331	0.23
340_D	344_E	1.330	0.23
118_K	226_E	1.325	0.23
114_S	239_M	1.314	0.23
74_Q	107_V	1.312	0.23
160_L	204_V	1.302	0.23
139_I	151_L	1.292	0.23
163_T	366_K	1.292	0.23
132_M	142_N	1.287	0.22
81_R	106_L	1.267	0.22
207_I	222_T	1.264	0.22
97_I	137_T	1.264	0.22
228_L	364_L	1.256	0.22
165_E	336_Y	1.253	0.22
223_D	291_R	1.235	0.21
148_A	233_I	1.230	0.21
69_P	100_K	1.225	0.21
179_D	298_R	1.214	0.21
94_I	326_M	1.211	0.21
95_P	133_T	1.206	0.21
189_R	209_K	1.191	0.20
83_I	254_I	1.182	0.20
164_K	291_R	1.181	0.20
334_G	348_A	1.178	0.20
343_W	365_R	1.175	0.20
161_P	328_R	1.175	0.20
73_V	112_L	1.173	0.20
200_M	239_M	1.173	0.20
53_L	187_R	1.159	0.19
85_K	94_I	1.151	0.19
99_E	254_I	1.151	0.19
111_S	247_V	1.147	0.19
131_Y	139_I	1.145	0.19
227_K	245_S	1.142	0.19
81_R	172_I	1.137	0.19
128_A	253_I	1.118	0.19
128_A	236_M	1.114	0.19
187_R	284_N	1.111	0.18
131_Y	244_L	1.105	0.18
219_D	227_K	1.100	0.18
82_L	350_K	1.098	0.18
226_E	248_I	1.098	0.18
144_S	242_D	1.098	0.18
289_L	295_K	1.094	0.18
145_I	245_S	1.094	0.18
285_I	297_E	1.089	0.18
162_A	172_I	1.079	0.18
148_A	339_R	1.078	0.18
56_R	104_I	1.064	0.18
224_V	328_R	1.062	0.17
230_K	345_P	1.059	0.17
143_D	147_R	1.058	0.17
133_T	232_R	1.042	0.17
224_V	236_M	1.035	0.17
95_P	225_V	1.032	0.17
207_I	273_Q	1.031	0.17
63_A	67_M	1.031	0.17
151_L	310_K	1.022	0.17
122_I	258_A	1.019	0.17
57_V	132_M	1.017	0.17
173_S	221_L	1.015	0.17
195_D	247_V	1.011	0.17
112_L	274_E	1.010	0.16
305_F	331_T	1.009	0.16
142_N	167_R	1.002	0.16
229_L	264_S	1.002	0.16
179_D	239_M	0.995	0.16
169_T	281_F	0.993	0.16
172_I	332_K	0.992	0.16
164_K	169_T	0.990	0.16
106_L	276_K	0.990	0.16
221_L	371_N	0.989	0.16
123_P	267_I	0.986	0.16
76_D	207_I	0.979	0.16
290_E	333_I	0.978	0.16
143_D	209_K	0.975	0.16
187_R	192_I	0.974	0.16
112_L	177_I	0.974	0.16
143_D	240_E	0.969	0.16
172_I	233_I	0.966	0.16
95_P	112_L	0.966	0.16
109_R	363_K	0.963	0.16
185_S	301_E	0.961	0.16
173_S	235_G	0.961	0.16
221_L	338_A	0.956	0.15
107_V	138_S	0.954	0.15
53_L	58_S	0.953	0.15
100_K	230_K	0.953	0.15
171_I	209_K	0.952	0.15
166_Y	276_K	0.944	0.15
127_T	130_E	0.943	0.15
68_S	114_S	0.943	0.15
145_I	199_V	0.942	0.15
165_E	248_I	0.942	0.15
306_K	360_I	0.940	0.15
76_D	165_E	0.940	0.15
114_S	178_V	0.937	0.15
147_R	310_K	0.936	0.15
73_V	132_M	0.935	0.15
116_L	238_V	0.931	0.15
166_Y	215_A	0.929	0.15
313_M	361_L	0.921	0.15
82_L	213_I	0.918	0.15
204_V	318_G	0.914	0.15
63_A	345_P	0.913	0.15
101_R	238_V	0.913	0.15
56_R	185_S	0.903	0.15
96_V	254_I	0.900	0.15
349_L	360_I	0.898	0.14
67_M	73_V	0.895	0.14
100_K	171_I	0.894	0.14
90_K	172_I	0.892	0.14
168_L	318_G	0.891	0.14
123_P	183_S	0.890	0.14
163_T	171_I	0.889	0.14
139_I	253_I	0.888	0.14
203_P	255_K	0.888	0.14
96_V	162_A	0.888	0.14
147_R	207_I	0.884	0.14
157_I	295_K	0.883	0.14
54_S	60_E	0.876	0.14
188_K	192_I	0.876	0.14
185_S	199_V	0.872	0.14
263_L	351_N	0.871	0.14
233_I	350_K	0.870	0.14
215_A	219_D	0.870	0.14
291_R	298_R	0.870	0.14
65_N	210_Y	0.866	0.14
165_E	297_E	0.865	0.14
140_D	171_I	0.865	0.14
240_E	291_R	0.863	0.14
148_A	172_I	0.862	0.14
137_T	164_K	0.862	0.14
156_N	346_V	0.858	0.14
54_S	61_T	0.857	0.14
63_A	102_E	0.855	0.14
224_V	238_V	0.852	0.14
157_I	173_S	0.851	0.14
99_E	169_T	0.851	0.14
69_P	136_A	0.850	0.14
164_K	209_K	0.848	0.14
170_G	208_M	0.846	0.14
82_L	323_Y	0.845	0.14
137_T	272_P	0.844	0.14
102_E	262_Q	0.843	0.14
105_G	170_G	0.841	0.14
172_I	177_I	0.836	0.13
148_A	290_E	0.834	0.13
133_T	249_S	0.830	0.13
123_P	157_I	0.828	0.13
131_Y	276_K	0.828	0.13
113_L	334_G	0.828	0.13
56_R	333_I	0.827	0.13
145_I	373_K	0.824	0.13
66_I	126_R	0.823	0.13
225_V	328_R	0.823	0.13
102_E	107_V	0.822	0.13
55_R	58_S	0.822	0.13
217_G	247_V	0.822	0.13
111_S	218_K	0.820	0.13
64_I	247_V	0.818	0.13
52_L	172_I	0.818	0.13
167_R	188_K	0.814	0.13
188_K	194_K	0.812	0.13
200_M	340_D	0.810	0.13
70_S	172_I	0.809	0.13
180_A	350_K	0.809	0.13
124_E	135_P	0.807	0.13
67_M	106_L	0.803	0.13
144_S	327_V	0.800	0.13
338_A	371_N	0.800	0.13
190_E	325_A	0.799	0.13
228_L	247_V	0.799	0.13
322_L	341_T	0.798	0.13
208_M	348_A	0.790	0.13
329_V	364_L	0.789	0.13
153_I	228_L	0.788	0.13
52_L	202_M	0.787	0.13
164_K	336_Y	0.787	0.13
53_L	190_E	0.786	0.13
321_K	341_T	0.785	0.13
159_R	235_G	0.784	0.13
186_G	192_I	0.784	0.13
258_A	311_E	0.779	0.13
138_S	346_V	0.778	0.13
152_M	292_Y	0.776	0.13
73_V	277_S	0.774	0.12
220_S	323_Y	0.773	0.12
187_R	290_E	0.772	0.12
292_Y	326_M	0.771	0.12
76_D	178_V	0.769	0.12
164_K	215_A	0.765	0.12
302_V	327_V	0.762	0.12
245_S	291_R	0.761	0.12
141_E	205_K	0.761	0.12
255_K	337_V	0.760	0.12
90_K	204_V	0.759	0.12
73_V	79_I	0.757	0.12
161_P	168_L	0.757	0.12
68_S	248_I	0.754	0.12
197_E	262_Q	0.754	0.12
90_K	101_R	0.753	0.12
141_E	261_M	0.752	0.12
351_N	361_L	0.750	0.12
56_R	66_I	0.749	0.12
111_S	138_S	0.747	0.12
53_L	57_V	0.744	0.12
216_N	238_V	0.744	0.12
116_L	225_V	0.743	0.12
200_M	312_E	0.742	0.12
194_K	223_D	0.741	0.12
61_T	106_L	0.733	0.12
139_I	184_V	0.728	0.12
77_E	82_L	0.727	0.12
253_I	329_V	0.726	0.12
53_L	220_S	0.726	0.12
327_V	352_A	0.722	0.12
63_A	164_K	0.721	0.12
112_L	295_K	0.720	0.12
96_V	236_M	0.718	0.12
177_I	264_S	0.716	0.12
135_P	310_K	0.716	0.12
237_P	344_E	0.716	0.12
272_P	307_V	0.714	0.12
234_S	309_F	0.713	0.12
58_S	234_S	0.711	0.12
322_L	352_A	0.709	0.12
208_M	334_G	0.708	0.12
143_D	163_T	0.708	0.12
78_D	112_L	0.708	0.12
173_S	365_R	0.706	0.12
325_A	370_S	0.706	0.12
157_I	249_S	0.706	0.12
67_M	167_R	0.705	0.11
61_T	168_L	0.705	0.11
84_A	313_M	0.702	0.11
56_R	142_N	0.698	0.11
223_D	283_A	0.698	0.11
53_L	366_K	0.697	0.11
163_T	357_E	0.697	0.11
322_L	340_D	0.697	0.11
72_T	172_I	0.696	0.11
160_L	349_L	0.695	0.11
201_A	343_W	0.694	0.11
82_L	332_K	0.694	0.11
294_S	301_E	0.692	0.11
196_E	207_I	0.691	0.11
75_I	277_S	0.690	0.11
60_E	77_E	0.688	0.11
74_Q	298_R	0.688	0.11
77_E	309_F	0.687	0.11
186_G	189_R	0.685	0.11
54_S	164_K	0.681	0.11
109_R	234_S	0.680	0.11
105_G	148_A	0.678	0.11
56_R	60_E	0.675	0.11
178_V	233_I	0.674	0.11
156_N	159_R	0.674	0.11
302_V	352_A	0.672	0.11
207_I	346_V	0.672	0.11
257_V	307_V	0.670	0.11
139_I	226_E	0.670	0.11
83_I	166_Y	0.669	0.11
66_I	215_A	0.669	0.11
280_E	309_F	0.667	0.11
59_L	365_R	0.665	0.11
101_R	368_E	0.663	0.11
108_T	289_L	0.661	0.11
302_V	306_K	0.658	0.11
138_S	160_L	0.658	0.11
296_I	324_T	0.655	0.11
125_N	343_W	0.653	0.11
206_E	305_F	0.653	0.11
274_E	343_W	0.653	0.11
281_F	372_K	0.651	0.11
177_I	253_I	0.650	0.11
236_M	325_A	0.649	0.11
142_N	363_K	0.646	0.11
54_S	132_M	0.645	0.11
101_R	138_S	0.643	0.11
79_I	99_E	0.640	0.11
74_Q	102_E	0.637	0.11
160_L	249_S	0.633	0.11
94_I	205_K	0.632	0.11
214_T	364_L	0.630	0.10
168_L	254_I	0.629	0.10
81_R	311_E	0.629	0.10
54_S	100_K	0.627	0.10
187_R	264_S	0.626	0.10
111_S	132_M	0.625	0.10
164_K	216_N	0.624	0.10
248_I	256_A	0.623	0.10
95_P	246_G	0.617	0.10
174_A	247_V	0.616	0.10
322_L	344_E	0.615	0.10
149_R	344_E	0.613	0.10
109_R	219_D	0.612	0.10
158_S	168_L	0.610	0.10
54_S	233_I	0.608	0.10
101_R	223_D	0.608	0.10
53_L	172_I	0.605	0.10
70_S	282_K	0.601	0.10
322_L	361_L	0.601	0.10
156_N	298_R	0.598	0.10
250_G	321_K	0.597	0.10
268_E	329_V	0.597	0.10
79_I	163_T	0.596	0.10
186_G	280_E	0.595	0.10
146_A	251_L	0.594	0.10
101_R	337_V	0.592	0.10
136_A	141_E	0.590	0.10
61_T	369_E	0.589	0.10
242_D	245_S	0.587	0.10
129_R	134_S	0.586	0.10
147_R	291_R	0.586	0.10
130_E	139_I	0.586	0.10
214_T	228_L	0.584	0.10
335_D	364_L	0.583	0.10
203_P	211_P	0.579	0.10
158_S	307_V	0.579	0.10
249_S	342_D	0.577	0.10
83_I	172_I	0.574	0.10
166_Y	281_F	0.573	0.10
52_L	55_R	0.572	0.10
123_P	321_K	0.567	0.10
52_L	178_V	0.566	0.10
128_A	238_V	0.565	0.10
54_S	209_K	0.564	0.10
183_S	260_K	0.563	0.10
68_S	75_I	0.561	0.10
165_E	265_I	0.560	0.10
178_V	273_Q	0.558	0.10
103_F	269_A	0.556	0.10
152_M	370_S	0.556	0.10
63_A	118_K	0.554	0.10
75_I	99_E	0.553	0.10
97_I	104_I	0.553	0.10
171_I	213_I	0.552	0.10
242_D	285_I	0.551	0.10
143_D	189_R	0.545	0.09
134_S	219_D	0.545	0.09
213_I	276_K	0.544	0.09
95_P	305_F	0.544	0.09
135_P	160_L	0.542	0.09
123_P	364_L	0.541	0.09
99_E	214_T	0.541	0.09
129_R	310_K	0.540	0.09
177_I	363_K	0.539	0.09
314_R	322_L	0.538	0.09
218_K	253_I	0.538	0.09
140_D	215_A	0.534	0.09
177_I	307_V	0.533	0.09
206_E	331_T	0.532	0.09
84_A	364_L	0.532	0.09
183_S	225_V	0.530	0.09
212_V	340_D	0.529	0.09
178_V	184_V	0.528	0.09
189_R	339_R	0.527	0.09
114_S	243_R	0.527	0.09
169_T	336_Y	0.527	0.09
140_D	231_F	0.525	0.09
253_I	349_L	0.525	0.09
172_I	241_G	0.521	0.09
155_D	269_A	0.521	0.09
287_D	291_R	0.520	0.09
281_F	284_N	0.517	0.09
177_I	247_V	0.514	0.09
115_Y	182_Y	0.514	0.09
103_F	371_N	0.514	0.09
207_I	298_R	0.513	0.09
312_E	340_D	0.510	0.09
170_G	252_D	0.510	0.09
221_L	235_G	0.509	0.09
189_R	233_I	0.508	0.09
255_K	338_A	0.508	0.09
161_P	238_V	0.507	0.09
158_S	173_S	0.506	0.09
147_R	187_R	0.506	0.09
138_S	204_V	0.503	0.09
89_T	248_I	0.502	0.09
344_E	348_A	0.501	0.09
312_E	323_Y	0.501	0.09
280_E	310_K	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2yzqA	2	0.5763	100	0.675	Contact Map
3kh5A	1	0.6658	100	0.687	Contact Map
3ddjA	1	0.6816	100	0.69	Contact Map
3t4nC	1	0.6526	100	0.707	Contact Map
2qrdG	1	0.6789	100	0.709	Contact Map
2v8qE	1	0.6526	100	0.713	Contact Map
3l2bA	2	0.3395	99.9	0.795	Contact Map
2j9lA	3	0.3974	99.9	0.81	Contact Map
3pc3A	2	0.5579	99.9	0.812	Contact Map
4esyA	2	0.4	99.9	0.812	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.01 seconds.