Q980U2 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980U2 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q980U2	Sequences: MRDLKTLLIVIDGVSYSVFNQFRYNLDTMNNLIENGSFGKLESVFPTITPVALASLFTGYLPLNHGITSTKIFIKGNSLSKPLSAHSSTPLKVDPIWYLLAKKGYKVVVASAPQALPDKWKLKNLTLFDPYKSKIKECSDGALLNIGNTTINEVNFDIESNNNEYTIKITDIENNTLSLKLRQNEWTSPLEVIMGCKGKEMKGTFRLKGLSNGVYLTPVSFLIPSWSNNQELQNEIWENVVKKYGMLLDGDYISLKSNIIGFSEYYETLKFAYEFFYNYSLYLLKREEWDFAITYLPIVDNIQHLLFGVDDSQSLDYVFQVYKMADNFVKAHIELADNIIICSDHGINKVKKRLYLNKFLEELNVLKTVDDKKIDWKRTKAYYGGGGIIRINLREREKFGIVGKKEFNKLIKYLTINLERLEDPDTGERIFTVIYSNETPASDRQGDIMIDGVNPKYSISSNIEKDTIFENVIPYRTTTADHGYYRNDDINGIIIFYGKNFTKKQVNMKIVDVTPTILKLYGINCKSDGKIVNEVFKNGHADSTK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	545 (514)
Sequences:	128 (111)
Seq/√Len:	4.9

SULSO - Q980U2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
29_M	329_V	4.281	0.92
10_V	53_L	4.117	0.91
512_D	529_G	4.086	0.90
365_V	410_L	3.878	0.88
6_T	517_I	3.452	0.81
28_T	330_K	3.439	0.80
10_V	50_P	3.286	0.77
50_P	53_L	2.936	0.68
53_L	70_T	2.934	0.68
446_G	498_G	2.852	0.66
515_P	529_G	2.730	0.62
299_V	306_L	2.684	0.61
446_G	483_G	2.677	0.60
391_I	407_F	2.649	0.60
251_D	255_L	2.619	0.59
391_I	402_V	2.609	0.58
12_D	36_G	2.529	0.56
49_T	290_D	2.492	0.55
329_V	339_I	2.457	0.53
516_T	529_G	2.432	0.53
49_T	446_G	2.407	0.52
32_L	341_I	2.387	0.51
6_T	520_L	2.355	0.50
512_D	515_P	2.316	0.49
264_E	295_Y	2.292	0.48
93_V	498_G	2.266	0.47
49_T	515_P	2.221	0.46
346_G	482_H	2.200	0.45
245_G	357_N	2.172	0.44
300_D	345_H	2.144	0.43
300_D	344_D	2.144	0.43
233_Q	381_A	2.118	0.43
50_P	70_T	2.115	0.43
252_Y	339_I	2.063	0.41
357_N	374_I	2.059	0.41
7_L	456_K	2.031	0.40
240_V	245_G	2.019	0.40
255_L	303_Q	2.016	0.39
9_I	15_S	1.986	0.39
67_I	410_L	1.933	0.37
397_E	400_G	1.930	0.37
381_A	396_R	1.929	0.37
55_S	65_H	1.926	0.37
10_V	70_T	1.922	0.37
400_G	447_D	1.917	0.36
245_G	251_D	1.917	0.36
236_I	240_V	1.915	0.36
51_V	528_D	1.900	0.36
215_Y	218_P	1.884	0.36
492_G	496_F	1.874	0.35
304_H	447_D	1.847	0.34
185_E	405_K	1.822	0.34
97_W	113_P	1.819	0.34
20_N	38_F	1.819	0.34
304_H	326_D	1.818	0.34
376_W	379_T	1.817	0.34
393_L	396_R	1.812	0.33
47_T	317_Y	1.811	0.33
286_R	339_I	1.809	0.33
26_L	284_L	1.806	0.33
9_I	394_R	1.789	0.33
129_D	186_W	1.763	0.32
127_L	186_W	1.762	0.32
96_I	446_G	1.757	0.32
117_P	379_T	1.756	0.32
97_W	456_K	1.742	0.31
54_A	117_P	1.742	0.31
66_G	292_A	1.734	0.31
109_V	418_L	1.731	0.31
112_A	514_T	1.723	0.31
491_N	494_I	1.722	0.31
64_N	528_D	1.715	0.31
184_N	263_S	1.714	0.31
300_D	304_H	1.703	0.30
304_H	344_D	1.703	0.30
304_H	345_H	1.703	0.30
300_D	346_G	1.688	0.30
56_L	144_L	1.684	0.30
491_N	497_Y	1.680	0.30
13_G	392_N	1.675	0.30
290_D	446_G	1.662	0.29
181_L	184_N	1.652	0.29
29_M	495_I	1.648	0.29
290_D	515_P	1.641	0.29
58_T	290_D	1.630	0.28
240_V	523_I	1.626	0.28
23_R	377_K	1.599	0.28
322_Y	512_D	1.599	0.28
182_R	185_E	1.591	0.27
326_D	392_N	1.585	0.27
47_T	65_H	1.580	0.27
79_L	368_T	1.571	0.27
31_N	286_R	1.569	0.27
28_T	53_L	1.563	0.27
6_T	393_L	1.559	0.27
49_T	451_D	1.559	0.27
245_G	374_I	1.554	0.26
381_A	392_N	1.545	0.26
367_K	414_L	1.542	0.26
12_D	345_H	1.536	0.26
12_D	300_D	1.536	0.26
12_D	344_D	1.536	0.26
19_F	187_T	1.532	0.26
25_N	319_F	1.531	0.26
393_L	407_F	1.531	0.26
117_P	360_L	1.521	0.26
49_T	58_T	1.517	0.26
251_D	397_E	1.513	0.25
396_R	402_V	1.508	0.25
438_E	530_K	1.500	0.25
97_W	117_P	1.494	0.25
26_L	339_I	1.488	0.25
516_T	523_I	1.488	0.25
194_M	214_V	1.479	0.25
46_P	50_P	1.465	0.24
10_V	295_Y	1.462	0.24
60_Y	66_G	1.455	0.24
367_K	378_R	1.446	0.24
176_T	532_V	1.442	0.24
104_G	343_S	1.433	0.24
337_D	401_I	1.430	0.23
211_S	309_V	1.425	0.23
14_V	514_T	1.422	0.23
70_T	376_W	1.418	0.23
150_T	169_I	1.416	0.23
27_D	46_P	1.415	0.23
117_P	215_Y	1.408	0.23
339_I	513_V	1.407	0.23
26_L	215_Y	1.402	0.23
36_G	345_H	1.392	0.23
36_G	300_D	1.392	0.23
36_G	344_D	1.392	0.23
213_G	306_L	1.388	0.23
13_G	236_I	1.384	0.22
239_N	245_G	1.384	0.22
394_R	403_G	1.381	0.22
49_T	96_I	1.376	0.22
10_V	28_T	1.375	0.22
283_L	477_T	1.373	0.22
5_K	8_L	1.369	0.22
427_G	430_I	1.358	0.22
492_G	497_Y	1.347	0.22
49_T	483_G	1.346	0.22
239_N	244_Y	1.331	0.21
26_L	181_L	1.329	0.21
15_S	70_T	1.319	0.21
182_R	517_I	1.316	0.21
51_V	163_N	1.312	0.21
77_N	448_I	1.312	0.21
123_K	126_T	1.312	0.21
97_W	322_Y	1.308	0.21
43_S	347_I	1.299	0.21
256_K	318_V	1.291	0.20
30_N	495_I	1.287	0.20
264_E	297_P	1.285	0.20
7_L	505_Q	1.280	0.20
203_G	206_R	1.279	0.20
97_W	245_G	1.274	0.20
488_D	494_I	1.271	0.20
380_K	413_Y	1.266	0.20
365_V	417_N	1.264	0.20
392_N	400_G	1.263	0.20
396_R	400_G	1.243	0.19
381_A	400_G	1.243	0.19
67_I	155_N	1.238	0.19
245_G	379_T	1.232	0.19
434_I	448_I	1.230	0.19
32_L	482_H	1.228	0.19
113_P	396_R	1.226	0.19
14_V	430_I	1.224	0.19
240_V	501_F	1.223	0.19
144_L	147_G	1.217	0.19
123_K	129_D	1.217	0.19
284_L	292_A	1.214	0.19
363_L	455_P	1.214	0.19
306_L	479_T	1.209	0.19
411_I	448_I	1.209	0.19
59_G	516_T	1.205	0.19
12_D	59_G	1.199	0.19
304_H	346_G	1.196	0.19
357_N	379_T	1.192	0.18
12_D	49_T	1.189	0.18
376_W	410_L	1.188	0.18
187_T	217_T	1.185	0.18
238_E	335_L	1.183	0.18
53_L	69_S	1.180	0.18
50_P	376_W	1.178	0.18
95_P	100_L	1.177	0.18
18_V	253_I	1.175	0.18
188_S	377_K	1.174	0.18
336_A	377_K	1.174	0.18
156_F	409_K	1.170	0.18
311_D	349_K	1.168	0.18
112_A	116_L	1.166	0.18
106_K	494_I	1.162	0.18
233_Q	375_D	1.160	0.18
248_L	255_L	1.159	0.18
412_K	500_N	1.149	0.18
54_A	386_G	1.142	0.17
105_Y	521_Y	1.136	0.17
399_F	513_V	1.134	0.17
31_N	405_K	1.134	0.17
329_V	516_T	1.132	0.17
286_R	415_T	1.130	0.17
105_Y	290_D	1.129	0.17
406_E	415_T	1.127	0.17
7_L	457_Y	1.123	0.17
381_A	395_E	1.123	0.17
265_Y	384_G	1.120	0.17
117_P	381_A	1.120	0.17
75_K	129_D	1.119	0.17
36_G	59_G	1.116	0.17
108_V	283_L	1.116	0.17
24_Y	27_D	1.114	0.17
297_P	301_N	1.112	0.17
113_P	418_L	1.112	0.17
24_Y	421_L	1.111	0.17
155_N	159_E	1.108	0.17
393_L	402_V	1.107	0.17
500_N	527_S	1.105	0.17
50_P	65_H	1.103	0.17
21_Q	152_N	1.101	0.17
304_H	392_N	1.100	0.17
96_I	514_T	1.100	0.17
194_M	448_I	1.099	0.17
59_G	446_G	1.085	0.16
399_F	501_F	1.084	0.16
13_G	27_D	1.081	0.16
233_Q	245_G	1.078	0.16
187_T	356_L	1.077	0.16
50_P	97_W	1.077	0.16
214_V	441_A	1.076	0.16
12_D	304_H	1.075	0.16
62_P	282_Y	1.074	0.16
62_P	66_G	1.073	0.16
76_G	363_L	1.071	0.16
18_V	22_F	1.070	0.16
244_Y	449_M	1.069	0.16
119_K	367_K	1.066	0.16
13_G	303_Q	1.063	0.16
59_G	345_H	1.063	0.16
59_G	300_D	1.063	0.16
59_G	344_D	1.063	0.16
212_N	480_A	1.060	0.16
344_D	447_D	1.059	0.16
345_H	447_D	1.059	0.16
300_D	447_D	1.059	0.16
380_K	406_E	1.051	0.16
513_V	522_G	1.051	0.16
124_N	127_L	1.051	0.16
407_F	411_I	1.045	0.16
399_F	422_E	1.040	0.16
117_P	245_G	1.039	0.16
12_D	346_G	1.030	0.16
193_I	405_K	1.030	0.16
13_G	322_Y	1.029	0.15
203_G	219_V	1.026	0.15
18_V	479_T	1.024	0.15
237_W	276_F	1.023	0.15
203_G	209_G	1.023	0.15
389_I	414_L	1.021	0.15
326_D	344_D	1.018	0.15
300_D	326_D	1.018	0.15
326_D	345_H	1.018	0.15
213_G	503_K	1.018	0.15
236_I	251_D	1.016	0.15
66_G	282_Y	1.014	0.15
488_D	492_G	1.013	0.15
56_L	342_C	1.011	0.15
156_F	161_N	1.011	0.15
259_I	449_M	1.005	0.15
291_F	343_S	1.004	0.15
136_K	140_D	1.003	0.15
494_I	498_G	1.003	0.15
512_D	516_T	1.001	0.15
113_P	375_D	0.997	0.15
46_P	97_W	0.996	0.15
35_N	159_E	0.995	0.15
54_A	112_A	0.991	0.15
457_Y	480_A	0.988	0.15
354_L	523_I	0.988	0.15
73_F	496_F	0.986	0.15
37_S	522_G	0.985	0.15
100_L	346_G	0.985	0.15
27_D	326_D	0.983	0.15
91_L	434_I	0.982	0.15
185_E	210_L	0.981	0.15
6_T	104_G	0.980	0.15
146_I	318_V	0.978	0.15
113_P	381_A	0.978	0.15
35_N	519_K	0.974	0.15
46_P	58_T	0.974	0.15
365_V	511_V	0.972	0.15
343_S	480_A	0.968	0.14
145_N	162_N	0.966	0.14
492_G	498_G	0.966	0.14
405_K	428_E	0.963	0.14
117_P	357_N	0.962	0.14
296_L	410_L	0.960	0.14
106_K	419_E	0.956	0.14
93_V	427_G	0.950	0.14
236_I	303_Q	0.949	0.14
497_Y	525_C	0.947	0.14
184_N	432_T	0.946	0.14
238_E	406_E	0.946	0.14
27_D	318_V	0.946	0.14
240_V	393_L	0.945	0.14
323_K	407_F	0.943	0.14
102_K	260_I	0.940	0.14
483_G	498_G	0.940	0.14
360_L	480_A	0.939	0.14
494_I	497_Y	0.938	0.14
97_W	515_P	0.935	0.14
218_P	357_N	0.934	0.14
10_V	69_S	0.934	0.14
326_D	447_D	0.932	0.14
404_K	436_S	0.931	0.14
443_D	531_I	0.930	0.14
350_V	353_R	0.930	0.14
346_G	521_Y	0.930	0.14
12_D	46_P	0.927	0.14
326_D	337_D	0.927	0.14
26_L	240_V	0.925	0.14
297_P	303_Q	0.925	0.14
36_G	304_H	0.923	0.14
46_P	54_A	0.921	0.14
31_N	163_N	0.920	0.14
131_Y	135_I	0.919	0.14
235_E	517_I	0.908	0.14
494_I	509_K	0.907	0.14
55_S	431_F	0.907	0.14
47_T	53_L	0.906	0.14
377_K	513_V	0.900	0.13
11_I	342_C	0.897	0.13
245_G	400_G	0.894	0.13
304_H	529_G	0.893	0.13
210_L	371_D	0.893	0.13
150_T	173_E	0.893	0.13
392_N	529_G	0.893	0.13
240_V	532_V	0.893	0.13
176_T	401_I	0.893	0.13
368_T	431_F	0.891	0.13
324_M	329_V	0.890	0.13
276_F	458_S	0.890	0.13
63_L	395_E	0.886	0.13
79_L	501_F	0.886	0.13
395_E	418_L	0.881	0.13
118_D	376_W	0.881	0.13
104_G	406_E	0.879	0.13
418_L	453_V	0.879	0.13
361_E	408_N	0.879	0.13
304_H	512_D	0.878	0.13
349_K	417_N	0.874	0.13
97_W	381_A	0.874	0.13
395_E	493_I	0.871	0.13
402_V	410_L	0.870	0.13
375_D	395_E	0.870	0.13
403_G	495_I	0.867	0.13
102_K	524_N	0.866	0.13
393_L	400_G	0.864	0.13
254_S	389_I	0.863	0.13
10_V	15_S	0.858	0.13
494_I	520_L	0.858	0.13
493_I	515_P	0.858	0.13
16_Y	491_N	0.858	0.13
181_L	522_G	0.857	0.13
202_K	338_N	0.855	0.13
107_V	480_A	0.855	0.13
6_T	302_I	0.854	0.13
70_T	525_C	0.852	0.13
60_Y	390_R	0.852	0.13
10_V	65_H	0.850	0.13
334_E	414_L	0.849	0.13
113_P	343_S	0.849	0.13
36_G	346_G	0.848	0.13
299_V	354_L	0.846	0.13
487_N	492_G	0.845	0.13
285_K	405_K	0.843	0.13
389_I	509_K	0.843	0.13
455_P	508_M	0.843	0.13
323_K	339_I	0.840	0.13
15_S	53_L	0.840	0.13
11_I	268_T	0.836	0.13
247_L	287_E	0.835	0.13
378_R	480_A	0.835	0.13
48_I	292_A	0.829	0.12
162_N	282_Y	0.829	0.12
104_G	511_V	0.828	0.12
374_I	433_V	0.828	0.12
364_N	381_A	0.827	0.12
5_K	480_A	0.826	0.12
219_V	340_I	0.826	0.12
421_L	530_K	0.825	0.12
306_L	514_T	0.825	0.12
168_K	178_S	0.824	0.12
365_V	423_D	0.822	0.12
127_L	187_T	0.820	0.12
41_L	385_G	0.820	0.12
418_L	518_L	0.819	0.12
43_S	303_Q	0.819	0.12
16_Y	28_T	0.817	0.12
31_N	188_S	0.816	0.12
392_N	447_D	0.814	0.12
37_S	531_I	0.813	0.12
70_T	483_G	0.812	0.12
117_P	375_D	0.808	0.12
265_Y	318_V	0.807	0.12
116_L	384_G	0.807	0.12
113_P	275_F	0.807	0.12
345_H	482_H	0.806	0.12
300_D	482_H	0.806	0.12
344_D	482_H	0.806	0.12
32_L	337_D	0.804	0.12
32_L	51_V	0.803	0.12
393_L	447_D	0.802	0.12
13_G	36_G	0.802	0.12
212_N	337_D	0.802	0.12
162_N	435_Y	0.801	0.12
21_Q	154_V	0.800	0.12
245_G	375_D	0.795	0.12
224_P	439_T	0.795	0.12
173_E	427_G	0.795	0.12
32_L	495_I	0.795	0.12
204_T	231_E	0.793	0.12
333_I	413_Y	0.791	0.12
376_W	414_L	0.791	0.12
54_A	97_W	0.791	0.12
6_T	21_Q	0.789	0.12
75_K	387_G	0.789	0.12
43_S	73_F	0.789	0.12
31_N	320_Q	0.788	0.12
96_I	108_V	0.786	0.12
308_G	479_T	0.786	0.12
150_T	154_V	0.785	0.12
49_T	228_N	0.782	0.12
107_V	390_R	0.780	0.12
24_Y	53_L	0.776	0.12
297_P	325_A	0.774	0.12
324_M	391_I	0.774	0.12
35_N	513_V	0.774	0.12
295_Y	317_Y	0.774	0.12
13_G	360_L	0.774	0.12
414_L	480_A	0.774	0.12
33_I	153_E	0.772	0.12
239_N	271_F	0.772	0.12
44_V	510_I	0.772	0.12
248_L	251_D	0.771	0.12
236_I	250_G	0.769	0.12
315_L	341_I	0.767	0.12
276_F	297_P	0.763	0.12
32_L	336_A	0.762	0.12
341_I	495_I	0.762	0.12
36_G	46_P	0.762	0.12
14_V	51_V	0.762	0.12
114_Q	127_L	0.760	0.11
233_Q	239_N	0.757	0.11
179_L	329_V	0.756	0.11
85_A	94_D	0.755	0.11
100_L	350_V	0.754	0.11
128_F	531_I	0.751	0.11
491_N	498_G	0.749	0.11
292_A	297_P	0.749	0.11
295_Y	301_N	0.748	0.11
100_L	521_Y	0.748	0.11
54_A	260_I	0.748	0.11
345_H	446_G	0.745	0.11
300_D	446_G	0.745	0.11
344_D	446_G	0.745	0.11
21_Q	170_T	0.742	0.11
29_M	517_I	0.742	0.11
296_L	305_L	0.742	0.11
33_I	405_K	0.740	0.11
391_I	412_K	0.739	0.11
104_G	409_K	0.738	0.11
21_Q	105_Y	0.738	0.11
11_I	22_F	0.736	0.11
245_G	456_K	0.736	0.11
6_T	456_K	0.736	0.11
159_E	454_N	0.735	0.11
460_S	521_Y	0.735	0.11
126_T	132_K	0.734	0.11
54_A	236_I	0.732	0.11
10_V	39_G	0.732	0.11
516_T	532_V	0.730	0.11
10_V	16_Y	0.728	0.11
296_L	479_T	0.727	0.11
36_G	49_T	0.725	0.11
67_I	72_I	0.721	0.11
270_K	377_K	0.720	0.11
434_I	516_T	0.720	0.11
37_S	454_N	0.715	0.11
6_T	213_G	0.713	0.11
103_K	502_T	0.712	0.11
304_H	400_G	0.712	0.11
94_D	433_V	0.712	0.11
115_A	297_P	0.712	0.11
51_V	385_G	0.711	0.11
278_N	331_A	0.709	0.11
111_S	275_F	0.707	0.11
421_L	434_I	0.706	0.11
153_E	156_F	0.704	0.11
22_F	319_F	0.704	0.11
35_N	148_N	0.704	0.11
85_A	91_L	0.701	0.11
409_K	528_D	0.700	0.11
281_L	501_F	0.699	0.11
251_D	254_S	0.699	0.11
13_G	386_G	0.698	0.11
275_F	297_P	0.698	0.11
95_P	251_D	0.697	0.11
165_Y	168_K	0.697	0.11
245_G	254_S	0.696	0.11
13_G	232_L	0.696	0.11
18_V	532_V	0.694	0.11
240_V	256_K	0.694	0.11
102_K	324_M	0.693	0.11
35_N	213_G	0.691	0.11
10_V	330_K	0.691	0.11
21_Q	438_E	0.689	0.11
283_L	418_L	0.687	0.11
275_F	299_V	0.684	0.11
345_H	392_N	0.684	0.11
300_D	392_N	0.684	0.11
344_D	392_N	0.684	0.11
238_E	299_V	0.684	0.11
171_D	373_K	0.681	0.10
360_L	397_E	0.680	0.10
16_Y	53_L	0.679	0.10
460_S	511_V	0.679	0.10
345_H	360_L	0.679	0.10
97_W	295_Y	0.679	0.10
344_D	360_L	0.679	0.10
300_D	360_L	0.679	0.10
264_E	449_M	0.678	0.10
374_I	434_I	0.678	0.10
49_T	498_G	0.677	0.10
345_H	529_G	0.677	0.10
300_D	529_G	0.677	0.10
344_D	529_G	0.677	0.10
400_G	406_E	0.674	0.10
28_T	70_T	0.674	0.10
110_A	237_W	0.673	0.10
350_V	481_D	0.673	0.10
47_T	278_N	0.673	0.10
323_K	528_D	0.672	0.10
13_G	381_A	0.671	0.10
446_G	451_D	0.671	0.10
13_G	458_S	0.670	0.10
367_K	523_I	0.670	0.10
447_D	529_G	0.669	0.10
53_L	295_Y	0.669	0.10
12_D	58_T	0.668	0.10
18_V	339_I	0.668	0.10
92_K	140_D	0.667	0.10
27_D	233_Q	0.665	0.10
47_T	393_L	0.663	0.10
24_Y	31_N	0.663	0.10
268_T	301_N	0.663	0.10
19_F	27_D	0.661	0.10
92_K	374_I	0.660	0.10
341_I	457_Y	0.660	0.10
151_I	177_L	0.660	0.10
98_Y	281_L	0.659	0.10
190_L	420_R	0.658	0.10
93_V	328_F	0.657	0.10
25_N	420_R	0.657	0.10
357_N	360_L	0.657	0.10
9_I	96_I	0.657	0.10
181_L	427_G	0.656	0.10
26_L	117_P	0.656	0.10
320_Q	391_I	0.656	0.10
59_G	512_D	0.655	0.10
62_P	438_E	0.652	0.10
13_G	41_L	0.651	0.10
332_H	336_A	0.651	0.10
113_P	397_E	0.649	0.10
198_G	494_I	0.649	0.10
104_G	389_I	0.648	0.10
10_V	246_M	0.646	0.10
300_D	343_S	0.646	0.10
297_P	461_S	0.645	0.10
288_E	333_I	0.644	0.10
179_L	354_L	0.643	0.10
243_K	247_L	0.642	0.10
72_I	387_G	0.642	0.10
282_Y	334_E	0.639	0.10
216_L	508_M	0.638	0.10
359_F	509_K	0.637	0.10
378_R	405_K	0.636	0.10
161_N	503_K	0.635	0.10
366_L	369_V	0.635	0.10
36_G	322_Y	0.634	0.10
295_Y	325_A	0.634	0.10
431_F	438_E	0.634	0.10
104_G	360_L	0.629	0.10
458_S	478_T	0.628	0.10
96_I	152_N	0.627	0.10
290_D	498_G	0.626	0.10
420_R	430_I	0.626	0.10
264_E	301_N	0.624	0.10
405_K	532_V	0.623	0.10
339_I	517_I	0.622	0.10
58_T	300_D	0.622	0.10
58_T	344_D	0.622	0.10
58_T	345_H	0.622	0.10
524_N	531_I	0.621	0.10
112_A	115_A	0.621	0.10
84_S	87_S	0.621	0.10
46_P	49_T	0.621	0.10
396_R	423_D	0.621	0.10
245_G	326_D	0.620	0.10
30_N	51_V	0.619	0.10
110_A	312_S	0.618	0.10
381_A	402_V	0.618	0.10
354_L	400_G	0.617	0.10
319_F	413_Y	0.617	0.10
26_L	392_N	0.615	0.10
396_R	401_I	0.614	0.10
392_N	457_Y	0.613	0.10
77_N	457_Y	0.612	0.10
103_K	339_I	0.611	0.10
299_V	441_A	0.611	0.10
421_L	426_T	0.610	0.10
340_I	354_L	0.610	0.10
69_S	518_L	0.609	0.10
14_V	264_E	0.608	0.10
365_V	418_L	0.606	0.10
78_S	438_E	0.605	0.10
6_T	95_P	0.604	0.10
344_D	512_D	0.604	0.10
345_H	512_D	0.604	0.10
300_D	512_D	0.604	0.10
187_T	453_V	0.603	0.10
161_N	504_K	0.602	0.10
44_V	56_L	0.601	0.10
107_V	324_M	0.600	0.10
240_V	279_Y	0.599	0.10
347_I	478_T	0.597	0.10
156_F	162_N	0.597	0.10
188_S	398_K	0.596	0.10
66_G	463_I	0.596	0.10
153_E	171_D	0.595	0.09
400_G	418_L	0.590	0.09
26_L	514_T	0.589	0.09
41_L	44_V	0.588	0.09
22_F	101_A	0.588	0.09
69_S	347_I	0.588	0.09
496_F	501_F	0.587	0.09
320_Q	404_K	0.585	0.09
107_V	431_F	0.584	0.09
357_N	364_N	0.584	0.09
422_E	430_I	0.582	0.09
100_L	518_L	0.582	0.09
51_V	340_I	0.580	0.09
329_V	341_I	0.579	0.09
56_L	363_L	0.578	0.09
149_T	170_T	0.578	0.09
184_N	420_R	0.577	0.09
401_I	501_F	0.577	0.09
339_I	515_P	0.576	0.09
62_P	326_D	0.575	0.09
56_L	508_M	0.574	0.09
398_K	487_N	0.572	0.09
79_L	374_I	0.571	0.09
23_R	513_V	0.571	0.09
75_K	380_K	0.570	0.09
247_L	254_S	0.570	0.09
260_I	325_A	0.570	0.09
19_F	497_Y	0.567	0.09
331_A	413_Y	0.567	0.09
8_L	63_L	0.566	0.09
73_F	395_E	0.566	0.09
49_T	342_C	0.565	0.09
56_L	112_A	0.565	0.09
159_E	414_L	0.564	0.09
164_E	168_K	0.562	0.09
9_I	98_Y	0.562	0.09
192_V	382_Y	0.561	0.09
26_L	46_P	0.561	0.09
325_A	480_A	0.561	0.09
27_D	392_N	0.560	0.09
12_D	446_G	0.558	0.09
365_V	448_I	0.556	0.09
247_L	456_K	0.554	0.09
59_G	304_H	0.554	0.09
513_V	529_G	0.554	0.09
355_Y	369_V	0.553	0.09
68_T	446_G	0.552	0.09
305_L	410_L	0.551	0.09
318_V	340_I	0.550	0.09
439_T	463_I	0.549	0.09
487_N	498_G	0.549	0.09
97_W	512_D	0.549	0.09
90_P	340_I	0.548	0.09
104_G	370_D	0.546	0.09
383_Y	480_A	0.546	0.09
101_A	387_G	0.546	0.09
396_R	517_I	0.546	0.09
78_S	399_F	0.546	0.09
50_P	67_I	0.545	0.09
49_T	68_T	0.544	0.09
264_E	294_T	0.543	0.09
97_W	457_Y	0.543	0.09
43_S	396_R	0.543	0.09
189_P	460_S	0.542	0.09
30_N	528_D	0.541	0.09
96_I	290_D	0.540	0.09
295_Y	419_E	0.539	0.09
244_Y	254_S	0.538	0.09
240_V	243_K	0.538	0.09
245_G	381_A	0.538	0.09
117_P	233_Q	0.537	0.09
418_L	454_N	0.537	0.09
163_N	171_D	0.537	0.09
384_G	514_T	0.536	0.09
125_L	128_F	0.534	0.09
55_S	488_D	0.534	0.09
49_T	516_T	0.534	0.09
206_R	333_I	0.534	0.09
380_K	393_L	0.532	0.09
15_S	50_P	0.531	0.09
52_A	518_L	0.530	0.09
248_L	445_Q	0.530	0.09
56_L	205_F	0.530	0.09
13_G	43_S	0.529	0.09
27_D	330_K	0.529	0.09
12_D	529_G	0.529	0.09
382_Y	397_E	0.527	0.09
7_L	101_A	0.526	0.09
127_L	130_P	0.526	0.09
380_K	416_I	0.525	0.09
143_L	150_T	0.523	0.09
262_F	305_L	0.522	0.09
312_S	407_F	0.521	0.09
359_F	365_V	0.521	0.09
426_T	429_R	0.521	0.09
33_I	38_F	0.521	0.09
95_P	340_I	0.519	0.09
511_V	517_I	0.518	0.09
343_S	396_R	0.518	0.09
333_I	389_I	0.517	0.09
130_P	221_F	0.516	0.09
245_G	396_R	0.516	0.09
96_I	194_M	0.516	0.09
66_G	329_V	0.516	0.09
36_G	58_T	0.515	0.09
237_W	397_E	0.512	0.09
334_E	360_L	0.512	0.09
251_D	515_P	0.511	0.09
180_K	517_I	0.511	0.09
434_I	522_G	0.511	0.09
30_N	336_A	0.510	0.09
175_N	448_I	0.510	0.09
178_S	514_T	0.509	0.09
233_Q	330_K	0.509	0.09
360_L	364_N	0.509	0.09
213_G	532_V	0.507	0.09
446_G	478_T	0.507	0.09
54_A	289_W	0.507	0.09
105_Y	298_I	0.506	0.09
53_L	431_F	0.506	0.09
94_D	337_D	0.506	0.09
113_P	215_Y	0.505	0.09
339_I	369_V	0.505	0.09
374_I	450_I	0.504	0.09
108_V	483_G	0.503	0.09
512_D	522_G	0.503	0.09
175_N	410_L	0.503	0.09
149_T	171_D	0.502	0.09
59_G	529_G	0.501	0.09
47_T	50_P	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3q3qA	2	0.8128	100	0.709	Contact Map
3nkqA	1	0.6367	100	0.734	Contact Map
3szyA	1	0.6789	100	0.735	Contact Map
2gsoA	1	0.6495	100	0.737	Contact Map
4lr2A	1	0.6459	100	0.741	Contact Map
1ei6A	2	0.6734	100	0.75	Contact Map
4gtwA	1	0.6807	100	0.753	Contact Map
4fdiA	2	0.6092	99.9	0.859	Contact Map
3b5qA	1	0.5193	99.9	0.863	Contact Map
1fsuA	1	0.5835	99.9	0.866	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0141 seconds.