Q980R7 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980R7 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q980R7	Sequences: MGRDYFLDRDIIIDKEGNVYTVLTNYNPPGYVFAYLKYVYTGKGIWNGYERIFKKYGVHNLIKINQRFNFESCYDASFPIVLLSNISRHLKPEERLREILKKSVSDSIIYALISFIEEYVRVNDIGVTGSILLGNYHSNSDIDIIIYGRKSALDFIESFDGFEKDSEWIIEANENYGINFSSLLYDNRRRGIYRGIKISVLFADDKPWRYCNDICKKIGKVKFKAHISGDYEALIYPSVAYVLDNNEYNVSKIVSYEGIFSSALFGKRQVEVEGLLMSCEKENVVIIGDKDVRGFIRPL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	299 (287)
Sequences:	123 (112)
Seq/√Len:	6.6

SULSO - Q980R7 Q981C5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
227_I	270_V	4.790	0.98
194_R	227_I	3.644	0.92
64_I	225_A	3.498	0.90
181_S	188_R	3.489	0.90
227_I	253_I	3.297	0.87
32_V	86_I	3.234	0.86
25_N	183_L	3.060	0.83
12_I	81_V	2.977	0.81
112_L	142_I	2.594	0.71
86_I	226_H	2.501	0.68
221_V	276_L	2.463	0.66
13_I	90_L	2.440	0.66
116_I	295_F	2.411	0.65
37_K	199_S	2.280	0.60
11_I	37_K	2.109	0.54
216_K	278_S	2.099	0.53
95_R	98_E	2.095	0.53
183_L	258_G	2.039	0.51
42_G	86_I	2.028	0.51
264_L	270_V	2.027	0.51
147_Y	274_G	2.024	0.51
187_N	262_S	1.945	0.48
268_R	277_M	1.916	0.47
55_K	62_I	1.894	0.46
19_V	205_D	1.878	0.45
125_I	142_I	1.863	0.45
37_K	234_L	1.858	0.44
272_V	285_V	1.799	0.42
46_W	82_L	1.786	0.42
14_D	182_S	1.776	0.41
199_S	259_I	1.754	0.41
9_R	46_W	1.733	0.40
199_S	257_E	1.719	0.39
193_Y	199_S	1.715	0.39
37_K	257_E	1.709	0.39
44_G	52_I	1.690	0.38
133_L	208_W	1.688	0.38
101_K	275_L	1.674	0.38
37_K	263_A	1.649	0.37
116_I	286_I	1.644	0.37
44_G	134_G	1.587	0.35
108_I	196_I	1.567	0.34
199_S	262_S	1.558	0.34
252_K	284_V	1.556	0.34
169_I	172_A	1.553	0.34
125_I	144_I	1.547	0.34
143_D	237_P	1.534	0.33
141_D	237_P	1.534	0.33
259_I	262_S	1.524	0.33
190_R	201_L	1.523	0.33
115_F	142_I	1.509	0.32
92_P	268_R	1.509	0.32
222_K	271_E	1.490	0.32
21_T	198_I	1.480	0.31
234_L	268_R	1.448	0.30
7_L	82_L	1.437	0.30
32_V	112_L	1.434	0.30
287_I	296_I	1.430	0.30
99_I	116_I	1.424	0.30
187_N	199_S	1.421	0.29
264_L	268_R	1.421	0.29
13_I	88_R	1.407	0.29
158_S	181_S	1.405	0.29
257_E	262_S	1.396	0.29
229_G	240_A	1.385	0.28
21_T	35_Y	1.380	0.28
17_G	133_L	1.353	0.27
21_T	37_K	1.344	0.27
135_N	183_L	1.338	0.27
199_S	235_I	1.334	0.27
199_S	263_A	1.334	0.27
196_I	272_V	1.328	0.27
88_R	138_S	1.325	0.27
198_I	263_A	1.322	0.26
259_I	277_M	1.321	0.26
99_I	180_F	1.320	0.26
205_D	256_Y	1.309	0.26
120_V	158_S	1.307	0.26
111_A	276_L	1.302	0.26
32_V	223_F	1.291	0.26
57_G	62_I	1.290	0.26
79_P	292_V	1.286	0.25
108_I	146_I	1.286	0.25
144_I	273_E	1.280	0.25
21_T	257_E	1.275	0.25
187_N	277_M	1.275	0.25
140_S	143_D	1.264	0.25
140_S	237_P	1.264	0.25
285_V	296_I	1.254	0.25
254_V	272_V	1.249	0.24
151_S	205_D	1.248	0.24
149_R	217_K	1.239	0.24
116_I	193_Y	1.238	0.24
104_V	253_I	1.230	0.24
17_G	270_V	1.228	0.24
71_E	74_Y	1.220	0.24
40_Y	45_I	1.215	0.23
126_G	148_G	1.211	0.23
40_Y	44_G	1.208	0.23
225_A	242_V	1.197	0.23
147_Y	263_A	1.194	0.23
14_D	20_Y	1.193	0.23
27_N	91_K	1.187	0.23
99_I	226_H	1.184	0.23
199_S	258_G	1.184	0.23
19_V	206_K	1.184	0.23
187_N	235_I	1.181	0.23
38_Y	126_G	1.167	0.22
189_R	262_S	1.167	0.22
142_I	226_H	1.162	0.22
13_I	17_G	1.159	0.22
115_F	194_R	1.154	0.22
152_A	186_D	1.151	0.22
196_I	258_G	1.149	0.22
16_E	133_L	1.144	0.22
96_L	113_I	1.142	0.22
20_Y	96_L	1.140	0.22
90_L	118_E	1.137	0.21
28_P	202_F	1.124	0.21
168_W	294_G	1.123	0.21
37_K	187_N	1.123	0.21
186_D	199_S	1.122	0.21
111_A	227_I	1.118	0.21
128_T	271_E	1.110	0.21
96_L	109_I	1.106	0.21
150_K	242_V	1.104	0.21
257_E	268_R	1.102	0.21
75_D	100_L	1.102	0.21
91_K	296_I	1.097	0.20
55_K	272_V	1.094	0.20
186_D	263_A	1.092	0.20
57_G	159_F	1.092	0.20
139_N	181_S	1.091	0.20
286_I	292_V	1.091	0.20
92_P	129_G	1.087	0.20
128_T	132_L	1.082	0.20
37_K	259_I	1.078	0.20
89_H	282_E	1.070	0.20
125_I	200_V	1.065	0.20
44_G	132_L	1.065	0.20
40_Y	82_L	1.063	0.20
6_F	41_T	1.060	0.20
94_E	157_E	1.053	0.19
9_R	201_L	1.044	0.19
8_D	12_I	1.042	0.19
187_N	257_E	1.034	0.19
190_R	288_G	1.032	0.19
186_D	277_M	1.026	0.19
17_G	112_L	1.026	0.19
201_L	258_G	1.024	0.19
262_S	291_D	1.019	0.19
42_G	269_Q	1.017	0.19
37_K	268_R	1.013	0.19
111_A	170_I	1.012	0.18
87_S	101_K	1.011	0.18
191_G	236_Y	1.010	0.18
27_N	206_K	1.005	0.18
10_D	36_L	1.002	0.18
25_N	135_N	0.998	0.18
276_L	285_V	0.996	0.18
111_A	194_R	0.996	0.18
28_P	256_Y	0.995	0.18
176_Y	183_L	0.992	0.18
49_Y	99_I	0.990	0.18
25_N	258_G	0.990	0.18
24_T	203_A	0.989	0.18
90_L	216_K	0.973	0.18
99_I	222_K	0.967	0.18
78_F	250_V	0.962	0.17
92_P	257_E	0.962	0.17
183_L	199_S	0.959	0.17
88_R	293_R	0.958	0.17
86_I	119_Y	0.949	0.17
92_P	190_R	0.940	0.17
13_I	19_V	0.934	0.17
50_E	185_Y	0.927	0.17
86_I	89_H	0.927	0.17
21_T	199_S	0.924	0.17
13_I	16_E	0.922	0.17
240_A	268_R	0.921	0.17
54_K	80_I	0.919	0.16
233_A	294_G	0.918	0.16
142_I	292_V	0.908	0.16
187_N	268_R	0.907	0.16
98_E	104_V	0.907	0.16
19_V	42_G	0.905	0.16
86_I	223_F	0.904	0.16
11_I	277_M	0.896	0.16
58_V	62_I	0.893	0.16
100_L	264_L	0.890	0.16
40_Y	272_V	0.889	0.16
226_H	269_Q	0.889	0.16
132_L	274_G	0.889	0.16
79_P	286_I	0.887	0.16
79_P	197_K	0.886	0.16
201_L	272_V	0.884	0.16
129_G	141_D	0.879	0.16
129_G	143_D	0.879	0.16
129_G	237_P	0.879	0.16
260_F	274_G	0.873	0.16
259_I	263_A	0.873	0.16
119_Y	157_E	0.867	0.15
168_W	202_F	0.866	0.15
65_N	185_Y	0.866	0.15
128_T	174_E	0.863	0.15
35_Y	219_G	0.862	0.15
6_F	64_I	0.859	0.15
81_V	179_N	0.857	0.15
109_I	220_K	0.855	0.15
120_V	150_K	0.854	0.15
130_S	143_D	0.854	0.15
130_S	237_P	0.854	0.15
130_S	141_D	0.854	0.15
12_I	269_Q	0.852	0.15
31_Y	196_I	0.852	0.15
126_G	143_D	0.850	0.15
126_G	141_D	0.850	0.15
126_G	237_P	0.850	0.15
18_N	68_F	0.850	0.15
199_S	268_R	0.849	0.15
52_I	61_L	0.849	0.15
259_I	268_R	0.847	0.15
161_G	233_A	0.846	0.15
152_A	172_A	0.846	0.15
92_P	287_I	0.844	0.15
183_L	187_N	0.840	0.15
92_P	168_W	0.838	0.15
9_R	272_V	0.836	0.15
99_I	296_I	0.834	0.15
15_K	216_K	0.828	0.15
69_N	86_I	0.827	0.15
98_E	101_K	0.827	0.15
97_R	166_S	0.826	0.15
241_Y	283_N	0.822	0.15
223_F	250_V	0.822	0.15
19_V	127_V	0.822	0.15
221_V	272_V	0.821	0.15
199_S	234_L	0.818	0.15
143_D	274_G	0.817	0.15
141_D	274_G	0.817	0.15
237_P	274_G	0.817	0.15
37_K	68_F	0.816	0.14
72_S	87_S	0.815	0.14
96_L	189_R	0.815	0.14
37_K	277_M	0.811	0.14
187_N	290_K	0.798	0.14
116_I	195_G	0.792	0.14
186_D	268_R	0.787	0.14
259_I	290_K	0.787	0.14
263_A	296_I	0.786	0.14
10_D	290_K	0.786	0.14
46_W	135_N	0.786	0.14
196_I	285_V	0.785	0.14
17_G	292_V	0.781	0.14
200_V	230_D	0.778	0.14
221_V	282_E	0.775	0.14
227_I	282_E	0.773	0.14
166_S	225_A	0.771	0.14
36_L	235_I	0.770	0.14
98_E	169_I	0.768	0.14
80_I	142_I	0.767	0.14
190_R	289_D	0.764	0.14
100_L	104_V	0.762	0.14
92_P	140_S	0.760	0.13
63_K	248_Y	0.759	0.13
181_S	203_A	0.758	0.13
137_H	142_I	0.754	0.13
148_G	274_G	0.753	0.13
73_C	279_C	0.753	0.13
6_F	256_Y	0.749	0.13
219_G	295_F	0.748	0.13
15_K	181_S	0.746	0.13
182_S	250_V	0.743	0.13
113_I	216_K	0.740	0.13
192_I	282_E	0.739	0.13
21_T	268_R	0.739	0.13
130_S	189_R	0.738	0.13
8_D	199_S	0.737	0.13
20_Y	282_E	0.736	0.13
238_S	260_F	0.735	0.13
11_I	290_K	0.730	0.13
42_G	226_H	0.729	0.13
143_D	147_Y	0.723	0.13
141_D	147_Y	0.723	0.13
147_Y	237_P	0.723	0.13
155_F	191_G	0.723	0.13
75_D	78_F	0.721	0.13
157_E	188_R	0.709	0.13
168_W	200_V	0.709	0.13
142_I	195_G	0.707	0.13
20_Y	268_R	0.704	0.13
50_E	132_L	0.702	0.13
37_K	258_G	0.701	0.12
257_E	263_A	0.700	0.12
190_R	255_S	0.700	0.12
257_E	277_M	0.700	0.12
11_I	259_I	0.698	0.12
75_D	95_R	0.697	0.12
36_L	198_I	0.696	0.12
46_W	51_R	0.691	0.12
53_F	227_I	0.689	0.12
81_V	153_L	0.685	0.12
87_S	253_I	0.683	0.12
75_D	127_V	0.683	0.12
230_D	265_F	0.678	0.12
11_I	199_S	0.677	0.12
134_G	296_I	0.675	0.12
227_I	232_E	0.675	0.12
71_E	289_D	0.673	0.12
92_P	235_I	0.667	0.12
262_S	290_K	0.666	0.12
222_K	296_I	0.666	0.12
30_G	72_S	0.666	0.12
90_L	133_L	0.665	0.12
82_L	267_K	0.663	0.12
116_I	124_D	0.661	0.12
125_I	164_K	0.660	0.12
170_I	296_I	0.660	0.12
216_K	233_A	0.658	0.12
199_S	264_L	0.656	0.12
103_S	209_R	0.655	0.12
168_W	236_Y	0.652	0.12
34_A	184_L	0.650	0.12
172_A	259_I	0.647	0.12
51_R	56_Y	0.644	0.12
52_I	86_I	0.641	0.12
87_S	153_L	0.640	0.12
45_I	265_F	0.640	0.12
21_T	277_M	0.640	0.12
73_C	214_I	0.638	0.11
69_N	146_I	0.638	0.11
235_I	268_R	0.637	0.11
15_K	194_R	0.635	0.11
36_L	277_M	0.628	0.11
15_K	218_I	0.628	0.11
180_F	187_N	0.627	0.11
112_L	292_V	0.622	0.11
111_A	180_F	0.620	0.11
178_I	273_E	0.620	0.11
44_G	109_I	0.619	0.11
29_P	102_K	0.617	0.11
136_Y	233_A	0.615	0.11
55_K	58_V	0.614	0.11
260_F	294_G	0.614	0.11
174_E	234_L	0.613	0.11
45_I	75_D	0.607	0.11
277_M	289_D	0.606	0.11
228_S	243_L	0.605	0.11
255_S	279_C	0.602	0.11
29_P	84_S	0.601	0.11
159_F	233_A	0.597	0.11
152_A	199_S	0.596	0.11
91_K	241_Y	0.594	0.11
234_L	257_E	0.594	0.11
94_E	192_I	0.590	0.11
132_L	260_F	0.588	0.11
224_K	280_E	0.588	0.11
78_F	186_D	0.587	0.11
37_K	264_L	0.587	0.11
235_I	259_I	0.583	0.11
21_T	79_P	0.582	0.11
6_F	89_H	0.580	0.11
94_E	110_Y	0.580	0.11
135_N	227_I	0.577	0.11
103_S	184_L	0.576	0.11
77_S	227_I	0.576	0.11
127_V	230_D	0.576	0.11
86_I	266_G	0.569	0.10
177_G	285_V	0.568	0.10
42_G	248_Y	0.568	0.10
97_R	118_E	0.567	0.10
187_N	263_A	0.566	0.10
37_K	186_D	0.565	0.10
168_W	174_E	0.564	0.10
242_V	286_I	0.564	0.10
153_L	182_S	0.563	0.10
128_T	267_K	0.562	0.10
118_E	241_Y	0.561	0.10
36_L	289_D	0.560	0.10
19_V	230_D	0.557	0.10
129_G	140_S	0.556	0.10
63_K	83_L	0.554	0.10
179_N	289_D	0.550	0.10
135_N	257_E	0.549	0.10
58_V	254_V	0.549	0.10
9_R	258_G	0.548	0.10
191_G	261_S	0.548	0.10
104_V	256_Y	0.546	0.10
76_A	145_I	0.545	0.10
75_D	186_D	0.545	0.10
183_L	235_I	0.544	0.10
36_L	259_I	0.544	0.10
102_K	281_K	0.541	0.10
104_V	116_I	0.541	0.10
130_S	140_S	0.538	0.10
38_Y	237_P	0.535	0.10
38_Y	143_D	0.535	0.10
38_Y	141_D	0.535	0.10
104_V	283_N	0.534	0.10
126_G	140_S	0.532	0.10
28_P	71_E	0.531	0.10
194_R	285_V	0.531	0.10
86_I	281_K	0.530	0.10
8_D	37_K	0.529	0.10
117_E	122_V	0.528	0.10
108_I	174_E	0.527	0.10
94_E	100_L	0.525	0.10
28_P	275_L	0.524	0.10
14_D	18_N	0.524	0.10
223_F	260_F	0.523	0.10
196_I	296_I	0.522	0.10
81_V	217_K	0.521	0.10
252_K	281_K	0.520	0.10
142_I	181_S	0.518	0.10
160_D	203_A	0.518	0.10
292_V	296_I	0.517	0.10
249_N	278_S	0.517	0.10
98_E	154_D	0.516	0.10
159_F	265_F	0.513	0.10
96_L	203_A	0.512	0.10
20_Y	144_I	0.511	0.10
32_V	256_Y	0.510	0.10
90_L	191_G	0.509	0.10
37_K	290_K	0.508	0.10
33_F	171_E	0.507	0.10
33_F	202_F	0.506	0.10
83_L	114_S	0.504	0.10
112_L	239_V	0.501	0.10
13_I	170_I	0.500	0.10
128_T	247_E	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3jz0A	2	0.6187	94.4	0.943	Contact Map
1no5A	4	0.3077	94	0.944	Contact Map
1ylqA	2	0.301	93.5	0.945	Contact Map
1wotA	1	0.3278	91.4	0.948	Contact Map
1knyA	2	0.6087	88.9	0.951	Contact Map
2rffA	1	0.3512	88.6	0.951	Contact Map
2pbeA	1	0.5619	85.7	0.953	Contact Map
3nybA	1	0.612	82.5	0.955	Contact Map
2hhpA	1	0.6321	81.9	0.955	Contact Map
4ud4A	1	0.5518	81.6	0.956	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0092 seconds.