Q980Q0 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980Q0 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q980Q0	Sequences: MAQIVNTERHSRLLPAPSSFEEGVVKFGDKEINIGGPLPTLAKDEKLVRVTHSLCPACYRLLPATIFEKEGKLFIRKICPEHGEFEDLYYADSSLYYKFDYWEYEGKGPKVPYVDLKSPCPYNCGLCPMHHQHSALVNLVITNRCDLSCWYCFFYAEKAGYVYEPTLEQIKFMVDQLKKQDITLVIQVTGGEPTLREDIIEIIKMLRENGVKHIQLNSWGGTFAKLYLEDPDKAIKYARALREAGVNTVYMSFDGTTRKTNPKNHWEIPYTLEVFRRAGMTSVVLVPTVIKTVNDNDLGNIVKFAAYNMDVVRSVNFQPVSLTGMMKRNMRAKFRITIPEVIKNIEEQTDGEITKDSWYPIGTSVVFSRLVEALTGKEQFEMANHPSCGAGTYVYVEWRNHEPHFIPISKFIDLEGLLEYLKEKEEELREGANKVWVASKVLYSIRKFIDKEQGPKDFDVYKMLYNIIIHHNYEALGEWHYRTLFLGSMHFMDLYNYDVQRVMRCDIHYVVPDGRVIPFCTYNVLNDLYRDKVLREYQIPLDKWTKEHGENSLGDAIKYKRIASTLENSEIYKNTYKSFQQM	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	582 (458)
Sequences:	285 (184)
Seq/√Len:	8.6

SULSO - Q980Q0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
69_K	86_E	4.498	0.99
175_D	209_N	3.942	0.98
357_S	410_K	3.906	0.98
174_V	206_L	3.686	0.96
302_V	345_I	3.539	0.95
51_T	64_A	3.389	0.94
199_I	237_Y	3.266	0.93
119_P	123_N	3.260	0.93
252_S	265_H	3.167	0.92
363_T	506_D	3.074	0.91
502_V	521_T	2.978	0.89
91_A	340_E	2.966	0.89
200_I	237_Y	2.833	0.86
166_T	169_Q	2.815	0.86
501_R	520_C	2.779	0.85
300_N	303_K	2.772	0.85
505_C	520_C	2.771	0.85
198_D	201_E	2.765	0.85
289_V	298_L	2.670	0.83
497_Y	502_V	2.657	0.82
284_V	507_I	2.603	0.81
90_Y	339_P	2.603	0.81
120_C	124_C	2.530	0.79
231_P	277_R	2.523	0.79
257_T	296_N	2.516	0.79
120_C	127_C	2.504	0.78
124_C	127_C	2.456	0.77
150_W	265_H	2.432	0.76
171_K	205_M	2.421	0.76
388_C	520_C	2.392	0.75
239_R	243_E	2.373	0.74
54_L	486_L	2.366	0.74
121_P	124_C	2.305	0.72
54_L	497_Y	2.243	0.70
171_K	209_N	2.187	0.68
501_R	505_C	2.169	0.67
141_I	188_V	2.166	0.67
230_D	236_K	2.143	0.66
150_W	266_W	2.139	0.66
189_T	252_S	2.101	0.65
303_K	352_E	2.079	0.64
238_A	278_A	2.077	0.64
88_L	297_D	2.064	0.63
261_N	265_H	2.026	0.62
121_P	130_H	2.024	0.62
92_D	407_P	2.017	0.61
134_S	137_V	1.985	0.60
388_C	505_C	1.982	0.60
276_R	310_D	1.969	0.59
132_Q	506_D	1.947	0.58
119_P	128_P	1.947	0.58
252_S	325_M	1.933	0.58
99_F	390_A	1.919	0.57
236_K	239_R	1.892	0.56
188_V	217_N	1.885	0.56
154_F	189_T	1.876	0.55
358_W	486_L	1.865	0.55
297_D	300_N	1.848	0.54
124_C	130_H	1.830	0.54
205_M	209_N	1.814	0.53
306_A	405_F	1.813	0.53
121_P	127_C	1.773	0.51
188_V	206_L	1.749	0.50
196_R	199_I	1.742	0.50
142_T	198_D	1.726	0.49
167_L	201_E	1.721	0.49
305_A	484_L	1.711	0.49
114_V	128_P	1.708	0.48
511_V	517_I	1.702	0.48
102_W	296_N	1.698	0.48
339_P	346_E	1.697	0.48
344_N	347_E	1.689	0.48
357_S	486_L	1.683	0.47
189_T	341_V	1.682	0.47
76_R	84_E	1.680	0.47
146_D	289_V	1.680	0.47
137_V	177_L	1.650	0.46
189_T	265_H	1.647	0.46
92_D	250_Y	1.644	0.46
57_A	85_F	1.607	0.44
81_E	249_V	1.604	0.44
157_E	252_S	1.603	0.44
76_R	86_E	1.602	0.44
292_T	295_D	1.590	0.43
150_W	252_S	1.588	0.43
179_K	300_N	1.563	0.42
111_V	177_L	1.563	0.42
140_V	217_N	1.557	0.42
392_T	395_Y	1.555	0.42
290_I	320_V	1.553	0.42
56_P	85_F	1.546	0.42
52_H	61_L	1.546	0.42
249_V	271_T	1.537	0.41
361_I	487_G	1.526	0.41
312_V	419_E	1.498	0.40
222_T	230_D	1.497	0.40
141_I	170_I	1.491	0.39
223_F	274_V	1.489	0.39
301_I	315_V	1.489	0.39
336_I	344_N	1.487	0.39
129_M	503_M	1.477	0.39
131_H	503_M	1.462	0.38
120_C	130_H	1.454	0.38
411_F	455_P	1.453	0.38
170_I	272_L	1.452	0.38
154_F	265_H	1.452	0.38
150_W	497_Y	1.442	0.37
109_P	132_Q	1.439	0.37
78_I	84_E	1.438	0.37
144_R	489_M	1.437	0.37
127_C	130_H	1.422	0.37
388_C	501_R	1.420	0.36
206_L	214_I	1.411	0.36
252_S	290_I	1.406	0.36
306_A	396_V	1.388	0.35
283_V	312_V	1.371	0.35
246_V	292_T	1.346	0.34
48_V	141_I	1.345	0.34
341_V	488_S	1.335	0.33
299_G	349_T	1.329	0.33
517_I	522_Y	1.328	0.33
140_V	189_T	1.327	0.33
261_N	268_I	1.315	0.32
102_W	536_E	1.313	0.32
86_E	151_Y	1.307	0.32
86_E	277_R	1.306	0.32
203_I	464_L	1.303	0.32
146_D	251_M	1.291	0.32
252_S	266_W	1.290	0.32
265_H	325_M	1.280	0.31
416_G	419_E	1.279	0.31
195_L	273_E	1.279	0.31
52_H	63_P	1.276	0.31
513_D	517_I	1.272	0.31
203_I	237_Y	1.272	0.31
198_D	351_G	1.262	0.31
62_L	77_K	1.262	0.31
81_E	208_E	1.261	0.30
413_D	416_G	1.257	0.30
99_F	339_P	1.254	0.30
87_D	331_R	1.251	0.30
260_T	297_D	1.250	0.30
197_E	275_F	1.249	0.30
142_T	288_T	1.243	0.30
146_D	219_W	1.243	0.30
71_G	454_G	1.242	0.30
134_S	508_H	1.240	0.30
51_T	496_N	1.239	0.30
62_L	85_F	1.237	0.30
135_A	252_S	1.225	0.29
246_V	507_I	1.213	0.29
523_N	530_R	1.210	0.29
169_Q	172_F	1.209	0.29
126_L	134_S	1.200	0.28
169_Q	296_N	1.199	0.28
54_L	59_Y	1.194	0.28
385_H	501_R	1.194	0.28
224_A	280_M	1.194	0.28
136_L	361_I	1.192	0.28
74_F	88_L	1.191	0.28
136_L	248_T	1.189	0.28
261_N	272_L	1.184	0.28
256_T	300_N	1.180	0.28
236_K	274_V	1.176	0.27
111_V	332_A	1.172	0.27
451_K	515_R	1.164	0.27
230_D	298_L	1.160	0.27
490_H	496_N	1.150	0.27
199_I	351_G	1.146	0.26
293_V	345_I	1.141	0.26
180_Q	362_G	1.136	0.26
150_W	154_F	1.134	0.26
297_D	362_G	1.129	0.26
238_A	249_V	1.129	0.26
354_T	357_S	1.125	0.26
261_N	290_I	1.121	0.26
80_P	214_I	1.118	0.26
273_E	277_R	1.113	0.25
107_K	504_R	1.113	0.25
213_H	409_S	1.111	0.25
154_F	252_S	1.110	0.25
261_N	266_W	1.107	0.25
57_A	283_V	1.104	0.25
131_H	497_Y	1.103	0.25
150_W	195_L	1.095	0.25
259_K	314_S	1.094	0.25
213_H	473_Y	1.085	0.25
67_F	76_R	1.082	0.24
68_E	73_L	1.080	0.24
140_V	154_F	1.077	0.24
60_R	515_R	1.074	0.24
112_P	181_D	1.071	0.24
99_F	279_G	1.069	0.24
49_R	100_D	1.069	0.24
77_K	325_M	1.068	0.24
132_Q	363_T	1.065	0.24
166_T	267_E	1.063	0.24
141_I	457_D	1.059	0.24
276_R	291_K	1.059	0.24
81_E	315_V	1.055	0.24
91_A	343_K	1.054	0.24
318_Q	491_F	1.054	0.24
154_F	266_W	1.053	0.24
338_I	346_E	1.051	0.23
274_V	510_V	1.049	0.23
252_S	488_S	1.046	0.23
195_L	305_A	1.043	0.23
277_R	439_S	1.040	0.23
282_S	386_P	1.039	0.23
137_V	188_V	1.038	0.23
153_F	315_V	1.036	0.23
216_L	313_R	1.035	0.23
440_K	443_Y	1.031	0.23
187_Q	286_V	1.026	0.23
204_K	221_G	1.024	0.23
53_S	64_A	1.020	0.23
165_P	196_R	1.020	0.23
224_A	402_E	1.018	0.22
200_I	528_L	1.018	0.22
126_L	133_H	1.018	0.22
295_D	508_H	1.011	0.22
81_E	476_L	1.010	0.22
282_S	327_K	1.008	0.22
410_K	486_L	1.007	0.22
140_V	265_H	1.005	0.22
197_E	237_Y	1.004	0.22
62_L	249_V	1.004	0.22
186_I	486_L	1.004	0.22
164_E	490_H	0.998	0.22
200_I	240_A	0.996	0.22
224_A	304_F	0.995	0.22
298_L	344_N	0.991	0.22
297_D	506_D	0.988	0.22
166_T	443_Y	0.987	0.22
358_W	410_K	0.985	0.22
298_L	347_E	0.984	0.21
135_A	140_V	0.984	0.21
90_Y	246_V	0.983	0.21
207_R	441_V	0.983	0.21
214_I	243_E	0.981	0.21
136_L	504_R	0.978	0.21
256_T	297_D	0.975	0.21
195_L	267_E	0.974	0.21
316_N	487_G	0.971	0.21
172_F	515_R	0.970	0.21
156_A	284_V	0.969	0.21
241_L	492_M	0.968	0.21
101_Y	343_K	0.967	0.21
350_D	470_H	0.966	0.21
53_S	77_K	0.966	0.21
301_I	313_R	0.963	0.21
184_L	506_D	0.961	0.21
331_R	416_G	0.960	0.21
275_F	283_V	0.957	0.21
296_N	300_N	0.954	0.21
272_L	304_F	0.951	0.21
203_I	432_A	0.948	0.20
221_G	239_R	0.948	0.20
146_D	517_I	0.948	0.20
301_I	304_F	0.944	0.20
388_C	411_F	0.943	0.20
146_D	298_L	0.943	0.20
178_K	182_I	0.940	0.20
196_R	237_Y	0.939	0.20
151_Y	486_L	0.939	0.20
53_S	317_F	0.934	0.20
277_R	454_G	0.933	0.20
154_F	219_W	0.931	0.20
262_P	266_W	0.930	0.20
166_T	174_V	0.927	0.20
141_I	241_L	0.927	0.20
167_L	205_M	0.922	0.20
140_V	252_S	0.917	0.20
171_K	208_E	0.916	0.20
77_K	85_F	0.915	0.20
261_N	269_P	0.914	0.20
394_V	405_F	0.914	0.20
155_Y	189_T	0.910	0.19
289_V	513_D	0.910	0.19
305_A	311_V	0.908	0.19
161_Y	531_D	0.907	0.19
153_F	164_E	0.907	0.19
258_R	275_F	0.903	0.19
286_V	491_F	0.903	0.19
362_G	393_Y	0.901	0.19
451_K	500_Q	0.901	0.19
287_P	346_E	0.900	0.19
314_S	537_Y	0.899	0.19
357_S	434_K	0.894	0.19
206_L	211_V	0.893	0.19
524_V	531_D	0.886	0.19
295_D	423_E	0.885	0.19
60_R	80_P	0.885	0.19
137_V	494_L	0.883	0.19
155_Y	217_N	0.883	0.19
289_V	344_N	0.882	0.19
59_Y	213_H	0.875	0.19
116_L	119_P	0.873	0.18
236_K	516_V	0.872	0.18
215_Q	501_R	0.870	0.18
213_H	250_Y	0.870	0.18
219_W	271_T	0.869	0.18
54_L	502_V	0.869	0.18
361_I	513_D	0.866	0.18
189_T	264_N	0.864	0.18
140_V	322_L	0.860	0.18
141_I	199_I	0.858	0.18
346_E	351_G	0.858	0.18
230_D	446_R	0.858	0.18
151_Y	497_Y	0.857	0.18
140_V	524_V	0.855	0.18
146_D	262_P	0.854	0.18
289_V	320_V	0.851	0.18
268_I	312_V	0.851	0.18
198_D	202_I	0.846	0.18
271_T	325_M	0.845	0.18
247_N	476_L	0.845	0.18
312_V	403_P	0.845	0.18
284_V	476_L	0.844	0.18
110_K	182_I	0.841	0.18
223_F	275_F	0.838	0.18
350_D	357_S	0.838	0.18
231_P	278_A	0.837	0.18
472_N	475_A	0.836	0.18
201_E	422_K	0.835	0.18
287_P	301_I	0.832	0.17
151_Y	534_L	0.832	0.17
437_V	442_L	0.829	0.17
504_R	507_I	0.827	0.17
140_V	188_V	0.824	0.17
111_V	181_D	0.824	0.17
250_Y	390_A	0.822	0.17
114_V	119_P	0.821	0.17
133_H	363_T	0.821	0.17
362_G	504_R	0.818	0.17
385_H	504_R	0.818	0.17
354_T	410_K	0.818	0.17
170_I	196_R	0.817	0.17
293_V	499_V	0.817	0.17
237_Y	247_N	0.816	0.17
196_R	351_G	0.815	0.17
298_L	352_E	0.814	0.17
89_Y	214_I	0.813	0.17
51_T	260_T	0.813	0.17
150_W	386_P	0.809	0.17
178_K	211_V	0.806	0.17
82_H	285_L	0.800	0.17
120_C	529_Y	0.799	0.17
219_W	265_H	0.795	0.17
224_A	271_T	0.793	0.17
168_E	353_I	0.792	0.16
56_P	520_C	0.791	0.16
532_K	536_E	0.791	0.16
73_L	183_T	0.790	0.16
385_H	388_C	0.789	0.16
132_Q	135_A	0.789	0.16
162_V	481_Y	0.788	0.16
325_M	491_F	0.788	0.16
52_H	73_L	0.786	0.16
489_M	507_I	0.786	0.16
141_I	195_L	0.785	0.16
155_Y	267_E	0.783	0.16
238_A	332_A	0.781	0.16
73_L	222_T	0.779	0.16
259_K	271_T	0.778	0.16
127_C	529_Y	0.777	0.16
90_Y	99_F	0.776	0.16
392_T	414_L	0.776	0.16
185_V	476_L	0.774	0.16
164_E	509_Y	0.773	0.16
464_L	521_T	0.770	0.16
291_K	503_M	0.769	0.16
215_Q	244_A	0.768	0.16
187_Q	489_M	0.767	0.16
195_L	198_D	0.764	0.16
252_S	534_L	0.763	0.16
187_Q	491_F	0.759	0.16
319_P	491_F	0.755	0.16
279_G	533_V	0.754	0.16
55_C	58_C	0.753	0.16
338_I	351_G	0.752	0.16
288_T	496_N	0.751	0.16
135_A	189_T	0.749	0.16
312_V	459_D	0.747	0.15
247_N	328_R	0.745	0.15
413_D	419_E	0.744	0.15
217_N	534_L	0.743	0.15
73_L	461_Y	0.742	0.15
106_G	487_G	0.741	0.15
265_H	488_S	0.741	0.15
170_I	205_M	0.738	0.15
72_K	486_L	0.738	0.15
442_L	449_I	0.738	0.15
137_V	500_Q	0.737	0.15
188_V	203_I	0.737	0.15
252_S	261_N	0.736	0.15
199_I	216_L	0.736	0.15
142_T	489_M	0.736	0.15
185_V	248_T	0.735	0.15
189_T	488_S	0.735	0.15
108_G	112_P	0.733	0.15
297_D	304_F	0.731	0.15
103_E	492_M	0.730	0.15
360_P	523_N	0.729	0.15
74_F	114_V	0.727	0.15
196_R	480_H	0.726	0.15
203_I	240_A	0.722	0.15
75_I	476_L	0.721	0.15
333_K	517_I	0.720	0.15
119_P	132_Q	0.720	0.15
230_D	238_A	0.719	0.15
336_I	449_I	0.718	0.15
146_D	265_H	0.717	0.15
418_L	452_E	0.717	0.15
154_F	326_M	0.713	0.15
68_E	93_S	0.713	0.15
340_E	414_L	0.712	0.15
92_D	131_H	0.710	0.15
81_E	343_K	0.709	0.15
358_W	388_C	0.709	0.15
187_Q	213_H	0.708	0.15
166_T	460_V	0.708	0.15
271_T	292_T	0.705	0.15
86_E	106_G	0.705	0.15
434_K	459_D	0.704	0.15
296_N	345_I	0.704	0.15
135_A	325_M	0.703	0.15
82_H	320_V	0.703	0.15
151_Y	252_S	0.702	0.14
136_L	250_Y	0.702	0.14
288_T	508_H	0.701	0.14
291_K	496_N	0.700	0.14
118_S	123_N	0.699	0.14
120_C	518_P	0.699	0.14
48_V	73_L	0.696	0.14
132_Q	364_S	0.696	0.14
436_W	439_S	0.695	0.14
273_E	296_N	0.694	0.14
279_G	511_V	0.693	0.14
249_V	404_H	0.692	0.14
214_I	346_E	0.691	0.14
282_S	313_R	0.688	0.14
62_L	433_N	0.688	0.14
189_T	219_W	0.686	0.14
136_L	362_G	0.685	0.14
336_I	430_E	0.685	0.14
144_R	244_A	0.684	0.14
140_V	155_Y	0.684	0.14
196_R	202_I	0.684	0.14
436_W	440_K	0.682	0.14
361_I	364_S	0.680	0.14
238_A	274_V	0.679	0.14
127_C	518_P	0.677	0.14
312_V	416_G	0.676	0.14
147_L	410_K	0.676	0.14
307_Y	440_K	0.675	0.14
168_E	535_R	0.675	0.14
176_Q	221_G	0.674	0.14
201_E	237_Y	0.674	0.14
173_M	407_P	0.673	0.14
151_Y	290_I	0.671	0.14
153_F	244_A	0.668	0.14
158_K	507_I	0.666	0.14
138_N	323_T	0.666	0.14
168_E	186_I	0.665	0.14
222_T	236_K	0.663	0.14
174_V	188_V	0.663	0.14
293_V	300_N	0.662	0.14
386_P	393_Y	0.661	0.14
169_Q	176_Q	0.661	0.14
258_R	449_I	0.660	0.14
172_F	214_I	0.660	0.14
177_L	510_V	0.659	0.14
168_E	474_E	0.659	0.14
356_D	486_L	0.657	0.14
297_D	407_P	0.657	0.14
361_I	504_R	0.653	0.13
60_R	240_A	0.653	0.13
221_G	349_T	0.652	0.13
256_T	409_S	0.651	0.13
342_I	362_G	0.649	0.13
68_E	71_G	0.648	0.13
188_V	524_V	0.646	0.13
246_V	305_A	0.645	0.13
449_I	453_Q	0.645	0.13
156_A	210_G	0.644	0.13
151_Y	265_H	0.644	0.13
393_Y	396_V	0.643	0.13
301_I	320_V	0.643	0.13
219_W	252_S	0.643	0.13
299_G	517_I	0.643	0.13
315_V	507_I	0.643	0.13
475_A	515_R	0.642	0.13
491_F	519_F	0.642	0.13
173_M	409_S	0.641	0.13
128_P	451_K	0.640	0.13
447_K	503_M	0.640	0.13
265_H	497_Y	0.638	0.13
56_P	255_G	0.638	0.13
179_K	429_R	0.638	0.13
121_P	518_P	0.638	0.13
173_M	250_Y	0.635	0.13
209_N	496_N	0.635	0.13
136_L	173_M	0.634	0.13
220_G	360_P	0.634	0.13
223_F	436_W	0.632	0.13
433_N	438_A	0.631	0.13
136_L	184_L	0.631	0.13
199_I	202_I	0.629	0.13
92_D	362_G	0.629	0.13
220_G	251_M	0.625	0.13
186_I	296_N	0.624	0.13
195_L	237_Y	0.623	0.13
98_K	502_V	0.620	0.13
207_R	315_V	0.619	0.13
385_H	520_C	0.617	0.13
240_A	306_A	0.617	0.13
444_S	447_K	0.617	0.13
150_W	261_N	0.617	0.13
395_Y	398_W	0.615	0.13
97_Y	298_L	0.615	0.13
70_E	405_F	0.614	0.13
320_V	333_K	0.614	0.13
179_K	275_F	0.614	0.13
362_G	506_D	0.611	0.13
328_R	522_Y	0.611	0.13
279_G	283_V	0.609	0.13
222_T	268_I	0.609	0.13
135_A	506_D	0.609	0.13
280_M	441_V	0.607	0.13
174_V	335_R	0.607	0.13
208_E	344_N	0.605	0.13
77_K	534_L	0.605	0.13
435_V	438_A	0.603	0.13
140_V	178_K	0.602	0.13
187_Q	215_Q	0.602	0.13
195_L	240_A	0.601	0.12
169_Q	474_E	0.600	0.12
250_Y	407_P	0.599	0.12
285_L	313_R	0.599	0.12
426_E	504_R	0.598	0.12
62_L	325_M	0.596	0.12
121_P	529_Y	0.596	0.12
50_V	61_L	0.596	0.12
249_V	312_V	0.596	0.12
168_E	277_R	0.595	0.12
223_F	528_L	0.595	0.12
179_K	456_K	0.594	0.12
123_N	533_V	0.593	0.12
187_Q	507_I	0.593	0.12
155_Y	310_D	0.593	0.12
240_A	398_W	0.592	0.12
325_M	534_L	0.592	0.12
132_Q	353_I	0.591	0.12
169_Q	413_D	0.588	0.12
112_P	501_R	0.586	0.12
201_E	448_F	0.585	0.12
251_M	516_V	0.585	0.12
433_N	499_V	0.585	0.12
252_S	262_P	0.585	0.12
326_M	492_M	0.583	0.12
434_K	437_V	0.582	0.12
143_N	164_E	0.582	0.12
250_Y	491_F	0.579	0.12
169_Q	495_Y	0.578	0.12
217_N	341_V	0.578	0.12
199_I	282_S	0.578	0.12
90_Y	185_V	0.578	0.12
142_T	508_H	0.577	0.12
138_N	157_E	0.577	0.12
98_K	258_R	0.576	0.12
138_N	495_Y	0.576	0.12
243_E	394_V	0.576	0.12
287_P	321_S	0.574	0.12
81_E	225_K	0.573	0.12
207_R	486_L	0.572	0.12
184_L	211_V	0.572	0.12
173_M	345_I	0.572	0.12
56_P	511_V	0.572	0.12
276_R	308_N	0.572	0.12
48_V	241_L	0.571	0.12
124_C	529_Y	0.571	0.12
442_L	445_I	0.569	0.12
277_R	515_R	0.568	0.12
260_T	534_L	0.568	0.12
252_S	264_N	0.567	0.12
67_F	471_H	0.566	0.12
451_K	454_G	0.566	0.12
186_I	301_I	0.566	0.12
45_E	275_F	0.565	0.12
212_K	249_V	0.565	0.12
201_E	452_E	0.564	0.12
71_G	412_I	0.564	0.12
432_A	438_A	0.564	0.12
60_R	81_E	0.563	0.12
164_E	489_M	0.563	0.12
188_V	534_L	0.562	0.12
77_K	252_S	0.561	0.12
420_Y	424_K	0.561	0.12
111_V	179_K	0.558	0.12
146_D	476_L	0.556	0.12
51_T	498_D	0.556	0.12
62_L	431_G	0.555	0.12
339_P	349_T	0.555	0.12
297_D	467_I	0.554	0.12
391_G	417_L	0.554	0.12
324_G	518_P	0.554	0.12
62_L	268_I	0.554	0.12
403_P	419_E	0.553	0.12
124_C	518_P	0.553	0.12
121_P	312_V	0.551	0.12
217_N	323_T	0.550	0.12
90_Y	498_D	0.550	0.12
66_I	96_Y	0.549	0.12
167_L	499_V	0.549	0.12
326_M	534_L	0.549	0.12
88_L	96_Y	0.545	0.11
135_A	265_H	0.543	0.11
163_Y	169_Q	0.543	0.11
137_V	271_T	0.542	0.11
492_M	520_C	0.542	0.11
137_V	237_Y	0.542	0.11
135_A	217_N	0.542	0.11
196_R	200_I	0.540	0.11
217_N	524_V	0.539	0.11
130_H	529_Y	0.538	0.11
219_W	266_W	0.538	0.11
271_T	275_F	0.538	0.11
385_H	393_Y	0.536	0.11
155_Y	270_Y	0.536	0.11
439_S	462_K	0.535	0.11
180_Q	412_I	0.535	0.11
291_K	405_F	0.534	0.11
97_Y	249_V	0.532	0.11
257_T	298_L	0.531	0.11
109_P	302_V	0.531	0.11
481_Y	507_I	0.531	0.11
195_L	199_I	0.531	0.11
150_W	290_I	0.531	0.11
389_G	394_V	0.531	0.11
430_E	499_V	0.530	0.11
62_L	283_V	0.529	0.11
151_Y	388_C	0.529	0.11
459_D	462_K	0.529	0.11
275_F	357_S	0.528	0.11
171_K	175_D	0.528	0.11
240_A	302_V	0.527	0.11
194_T	199_I	0.526	0.11
243_E	296_N	0.525	0.11
464_L	502_V	0.524	0.11
206_L	219_W	0.524	0.11
146_D	387_S	0.524	0.11
146_D	158_K	0.522	0.11
347_E	454_G	0.522	0.11
250_Y	389_G	0.522	0.11
298_L	342_I	0.520	0.11
70_E	300_N	0.520	0.11
404_H	413_D	0.519	0.11
56_P	495_Y	0.519	0.11
130_H	286_V	0.518	0.11
170_I	173_M	0.517	0.11
216_L	448_F	0.517	0.11
46_K	312_V	0.516	0.11
150_W	289_V	0.516	0.11
490_H	509_Y	0.516	0.11
243_E	259_K	0.516	0.11
140_V	150_W	0.515	0.11
102_W	136_L	0.515	0.11
406_I	412_I	0.514	0.11
166_T	306_A	0.513	0.11
154_F	264_N	0.513	0.11
250_Y	393_Y	0.511	0.11
123_N	494_L	0.510	0.11
158_K	243_E	0.509	0.11
284_V	339_P	0.509	0.11
456_K	459_D	0.507	0.11
72_K	303_K	0.506	0.11
132_Q	185_V	0.504	0.11
67_F	434_K	0.504	0.11
123_N	266_W	0.504	0.11
246_V	322_L	0.503	0.11
237_Y	307_Y	0.503	0.11
438_A	453_Q	0.502	0.11
207_R	283_V	0.501	0.11
205_M	441_V	0.501	0.11
59_Y	141_I	0.500	0.11
58_C	219_W	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1tv8A	2	0.5309	100	0.871	Contact Map
4k36A	1	0.6134	100	0.885	Contact Map
3c8fA	1	0.3918	100	0.886	Contact Map
2a5hA	4	0.6392	99.9	0.892	Contact Map
2yx0A	1	0.4777	99.9	0.895	Contact Map
4m7tA	1	0.4141	99.9	0.896	Contact Map
2z2uA	1	0.4003	99.9	0.897	Contact Map
3rfaA	1	0.5601	99.9	0.908	Contact Map
4rtbA	2	0.6289	99.8	0.91	Contact Map
4njhA	2	0.3265	99.8	0.911	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.