Q980P6 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980P6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q980P6	Sequences: MNVKIAALASHSALDVFDGAKDEGFQTIGLCKKGRERPYLEFKAIMDKCIILEDFKEIISDKVQSILLSENAIIVPNRSLAVYVGYDGIEKMKTKVFGNRYMLRWEERIGEKNYYKILNEAKISIPKLFKPEEIDRPVIVKLPEAKRKVERGFFFAVNKEDFEAKLNELLRNNVIDNEGLKNMVIEEFVFGAHFNLNYFYSPIFNRLELISVDRRIQSDWDSLYRLPADIQIKLGRIPKLIEVGHEPVTIRESLLEKVFEIGYRFVDATQKLEPPGIIGPFTLQVMVTPDLDLVVYDVAPRIGGGTNVYMGTGSQYSKFYFGKPISLGRRIALEIKHAIINNLTEKILT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	349 (334)
Sequences:	198 (132)
Seq/√Len:	7.2

SULSO - Q980P6 PURP

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
343_L	346_K	7.631	1.00
198_Y	262_G	4.790	0.99
138_V	156_A	3.953	0.96
23_E	329_R	3.948	0.96
6_A	72_A	3.883	0.96
144_E	147_R	3.831	0.95
9_A	29_G	3.498	0.92
129_F	136_R	3.429	0.91
323_K	333_L	3.362	0.91
186_E	304_G	3.183	0.88
325_I	333_L	3.179	0.88
134_I	162_F	2.774	0.79
284_Q	304_G	2.617	0.75
73_I	348_L	2.594	0.74
288_T	292_D	2.552	0.73
121_A	268_A	2.549	0.73
160_E	164_A	2.508	0.72
151_R	283_L	2.437	0.69
90_E	104_R	2.429	0.69
74_I	92_M	2.428	0.69
186_E	284_Q	2.415	0.69
217_Q	242_E	2.385	0.68
127_K	187_E	2.220	0.62
4_K	28_I	2.209	0.61
207_L	262_G	2.171	0.60
50_I	53_E	2.148	0.59
26_Q	127_K	2.080	0.56
195_N	304_G	1.960	0.52
228_A	231_Q	1.935	0.51
250_I	293_L	1.907	0.50
147_R	239_K	1.905	0.50
5_I	270_Q	1.902	0.50
150_E	245_H	1.877	0.49
120_E	271_K	1.859	0.48
313_G	326_S	1.833	0.47
284_Q	303_G	1.817	0.46
186_E	195_N	1.798	0.45
299_A	303_G	1.787	0.45
186_E	303_G	1.761	0.44
271_K	347_I	1.759	0.44
73_I	97_F	1.742	0.43
124_S	288_T	1.728	0.43
195_N	284_Q	1.724	0.43
241_I	288_T	1.724	0.43
184_V	188_F	1.703	0.42
78_R	150_E	1.697	0.42
78_R	245_H	1.697	0.42
341_N	346_K	1.695	0.42
15_D	303_G	1.677	0.41
26_Q	48_K	1.650	0.40
78_R	195_N	1.646	0.40
123_I	293_L	1.645	0.40
306_T	313_G	1.641	0.40
108_R	195_N	1.635	0.39
245_H	297_D	1.629	0.39
150_E	297_D	1.629	0.39
267_D	270_Q	1.617	0.39
41_E	263_Y	1.607	0.38
217_Q	282_T	1.578	0.37
225_R	326_S	1.576	0.37
94_T	155_F	1.552	0.36
195_N	303_G	1.544	0.36
15_D	195_N	1.507	0.35
144_E	239_K	1.488	0.34
213_D	221_D	1.485	0.34
247_P	314_S	1.484	0.34
219_D	241_I	1.462	0.33
9_A	137_P	1.456	0.33
152_G	305_G	1.448	0.33
78_R	297_D	1.444	0.32
152_G	307_N	1.437	0.32
212_V	218_S	1.420	0.32
150_E	195_N	1.405	0.31
195_N	245_H	1.405	0.31
144_E	150_E	1.402	0.31
144_E	245_H	1.402	0.31
147_R	150_E	1.400	0.31
147_R	245_H	1.400	0.31
337_H	340_I	1.398	0.31
153_F	297_D	1.379	0.30
108_R	284_Q	1.376	0.30
287_V	291_L	1.374	0.30
5_I	335_I	1.368	0.30
196_L	258_V	1.348	0.29
152_G	306_T	1.344	0.29
137_P	198_Y	1.335	0.29
259_F	287_V	1.332	0.29
109_I	300_P	1.315	0.28
74_I	222_S	1.313	0.28
188_F	325_I	1.308	0.28
97_F	331_I	1.302	0.28
80_L	92_M	1.290	0.27
94_T	158_N	1.284	0.27
6_A	262_G	1.280	0.27
73_I	335_I	1.277	0.27
117_I	211_S	1.271	0.27
53_E	160_E	1.266	0.27
249_T	297_D	1.234	0.26
108_R	304_G	1.226	0.25
84_V	345_E	1.222	0.25
46_M	142_L	1.216	0.25
77_N	299_A	1.200	0.25
57_E	258_V	1.195	0.25
153_F	216_I	1.189	0.24
67_L	72_A	1.185	0.24
313_G	324_P	1.185	0.24
108_R	303_G	1.175	0.24
309_Y	313_G	1.173	0.24
137_P	227_P	1.172	0.24
78_R	144_E	1.164	0.24
299_A	315_Q	1.160	0.24
78_R	147_R	1.158	0.24
209_L	221_D	1.148	0.23
192_A	241_I	1.148	0.23
335_I	345_E	1.146	0.23
195_N	297_D	1.142	0.23
245_H	249_T	1.140	0.23
150_E	249_T	1.140	0.23
46_M	331_I	1.138	0.23
59_I	293_L	1.131	0.23
92_M	222_S	1.130	0.23
117_I	222_S	1.116	0.22
213_D	305_G	1.113	0.22
211_S	265_F	1.108	0.22
67_L	121_A	1.105	0.22
104_R	203_I	1.103	0.22
17_F	45_I	1.100	0.22
280_P	283_L	1.096	0.22
78_R	153_F	1.093	0.22
261_I	293_L	1.091	0.22
144_E	297_D	1.088	0.22
75_V	229_D	1.084	0.22
64_Q	96_V	1.082	0.21
147_R	297_D	1.081	0.21
87_D	156_A	1.073	0.21
137_P	155_F	1.073	0.21
145_A	238_P	1.072	0.21
77_N	249_T	1.072	0.21
336_K	340_I	1.071	0.21
243_V	291_L	1.064	0.21
123_I	166_L	1.059	0.21
164_A	258_V	1.057	0.21
204_F	321_F	1.057	0.21
15_D	313_G	1.055	0.21
182_N	264_R	1.052	0.21
124_S	292_D	1.043	0.20
115_Y	298_V	1.043	0.20
115_Y	300_P	1.039	0.20
150_E	197_N	1.038	0.20
197_N	245_H	1.038	0.20
251_R	305_G	1.038	0.20
161_D	214_R	1.038	0.20
305_G	313_G	1.038	0.20
195_N	298_V	1.033	0.20
85_G	123_I	1.026	0.20
32_K	54_D	1.024	0.20
153_F	245_H	1.022	0.20
150_E	153_F	1.022	0.20
8_L	30_L	1.022	0.20
87_D	151_R	1.022	0.20
108_R	297_D	1.019	0.20
107_E	153_F	1.011	0.20
53_E	57_E	1.007	0.20
217_Q	297_D	1.006	0.20
108_R	245_H	1.004	0.19
108_R	150_E	1.004	0.19
129_F	139_I	1.003	0.19
37_R	41_E	1.003	0.19
16_V	337_H	1.000	0.19
57_E	101_Y	0.997	0.19
213_D	307_N	0.995	0.19
201_S	225_R	0.990	0.19
108_R	186_E	0.990	0.19
130_K	133_E	0.988	0.19
175_I	227_P	0.987	0.19
260_E	264_R	0.986	0.19
35_R	117_I	0.985	0.19
5_I	281_F	0.982	0.19
219_D	288_T	0.978	0.19
200_Y	326_S	0.974	0.19
75_V	136_R	0.974	0.19
284_Q	297_D	0.973	0.19
144_E	217_Q	0.971	0.19
307_N	313_G	0.971	0.19
57_E	134_I	0.959	0.18
303_G	306_T	0.952	0.18
10_S	79_S	0.947	0.18
82_V	226_L	0.944	0.18
4_K	70_E	0.942	0.18
115_Y	297_D	0.942	0.18
109_I	115_Y	0.942	0.18
96_V	161_D	0.939	0.18
78_R	115_Y	0.936	0.18
251_R	307_N	0.930	0.18
69_S	75_V	0.927	0.18
31_C	36_E	0.922	0.18
297_D	303_G	0.921	0.18
15_D	284_Q	0.912	0.17
99_N	288_T	0.910	0.17
135_D	346_K	0.908	0.17
243_V	290_D	0.906	0.17
21_K	139_I	0.905	0.17
94_T	173_N	0.900	0.17
78_R	249_T	0.899	0.17
107_E	297_D	0.890	0.17
77_N	174_V	0.885	0.17
65_S	181_K	0.885	0.17
82_V	242_E	0.883	0.17
170_L	181_K	0.882	0.17
188_F	238_P	0.881	0.17
217_Q	241_I	0.873	0.16
112_K	240_L	0.872	0.16
35_R	275_P	0.867	0.16
46_M	112_K	0.866	0.16
159_K	260_E	0.865	0.16
83_Y	100_R	0.864	0.16
132_E	345_E	0.863	0.16
132_E	159_K	0.862	0.16
74_I	263_Y	0.860	0.16
152_G	217_Q	0.859	0.16
150_E	303_G	0.857	0.16
245_H	303_G	0.857	0.16
265_F	298_V	0.857	0.16
213_D	225_R	0.855	0.16
212_V	287_V	0.854	0.16
81_A	197_N	0.851	0.16
42_F	247_P	0.849	0.16
18_D	153_F	0.848	0.16
107_E	245_H	0.847	0.16
107_E	150_E	0.847	0.16
255_L	316_Y	0.837	0.16
275_P	278_I	0.836	0.16
196_L	285_V	0.836	0.16
81_A	254_L	0.834	0.16
31_C	65_S	0.833	0.16
54_D	132_E	0.832	0.16
221_D	225_R	0.831	0.16
80_L	103_L	0.830	0.16
193_H	216_I	0.830	0.16
78_R	256_E	0.827	0.16
15_D	197_N	0.822	0.15
15_D	150_E	0.820	0.15
15_D	245_H	0.820	0.15
159_K	163_E	0.819	0.15
22_D	100_R	0.818	0.15
144_E	152_G	0.817	0.15
283_L	295_V	0.817	0.15
201_S	208_E	0.816	0.15
229_D	233_K	0.816	0.15
25_F	339_I	0.811	0.15
198_Y	258_V	0.810	0.15
29_G	121_A	0.810	0.15
153_F	249_T	0.808	0.15
115_Y	245_H	0.806	0.15
115_Y	150_E	0.806	0.15
123_I	288_T	0.806	0.15
197_N	265_F	0.803	0.15
209_L	218_S	0.801	0.15
31_C	134_I	0.799	0.15
188_F	217_Q	0.797	0.15
271_K	339_I	0.796	0.15
69_S	160_E	0.794	0.15
299_A	314_S	0.789	0.15
78_R	108_R	0.788	0.15
144_E	195_N	0.783	0.15
78_R	197_N	0.780	0.15
250_I	288_T	0.780	0.15
147_R	217_Q	0.778	0.15
39_Y	334_E	0.774	0.14
17_F	153_F	0.773	0.14
71_N	162_F	0.773	0.14
94_T	160_E	0.769	0.14
147_R	195_N	0.769	0.14
131_P	134_I	0.767	0.14
203_I	343_L	0.766	0.14
239_K	299_A	0.765	0.14
92_M	96_V	0.761	0.14
30_L	138_V	0.758	0.14
147_R	152_G	0.755	0.14
217_Q	306_T	0.749	0.14
13_A	155_F	0.749	0.14
16_V	323_K	0.749	0.14
187_E	314_S	0.747	0.14
221_D	305_G	0.747	0.14
197_N	297_D	0.744	0.14
297_D	304_G	0.743	0.14
53_E	128_L	0.742	0.14
15_D	326_S	0.734	0.14
242_E	304_G	0.732	0.14
3_V	176_D	0.727	0.14
64_Q	94_T	0.725	0.14
112_K	298_V	0.724	0.14
144_E	242_E	0.723	0.14
242_E	303_G	0.723	0.14
66_I	210_I	0.722	0.13
87_D	278_I	0.722	0.13
18_D	22_D	0.721	0.13
117_I	265_F	0.721	0.13
13_A	256_E	0.721	0.13
22_D	123_I	0.719	0.13
15_D	108_R	0.718	0.13
339_I	343_L	0.718	0.13
164_A	189_V	0.715	0.13
206_R	320_Y	0.714	0.13
174_V	257_K	0.714	0.13
105_W	272_L	0.714	0.13
123_I	295_V	0.712	0.13
196_L	218_S	0.712	0.13
86_Y	217_Q	0.711	0.13
336_K	343_L	0.711	0.13
80_L	175_I	0.711	0.13
42_F	314_S	0.707	0.13
112_K	269_T	0.705	0.13
28_I	207_L	0.704	0.13
147_R	303_G	0.702	0.13
9_A	336_K	0.699	0.13
48_K	70_E	0.698	0.13
28_I	70_E	0.697	0.13
129_F	347_I	0.697	0.13
89_I	270_Q	0.695	0.13
153_F	195_N	0.693	0.13
94_T	274_P	0.691	0.13
282_T	305_G	0.689	0.13
261_I	321_F	0.688	0.13
147_R	197_N	0.684	0.13
136_R	234_L	0.683	0.13
7_A	17_F	0.679	0.13
195_N	242_E	0.678	0.13
258_V	293_L	0.678	0.13
221_D	307_N	0.676	0.13
168_E	342_N	0.673	0.13
274_P	345_E	0.673	0.13
144_E	303_G	0.672	0.13
242_E	282_T	0.671	0.13
77_N	150_E	0.670	0.13
77_N	245_H	0.670	0.13
87_D	160_E	0.667	0.13
305_G	314_S	0.664	0.12
131_P	135_D	0.661	0.12
34_G	158_N	0.660	0.12
119_N	315_Q	0.659	0.12
119_N	125_I	0.656	0.12
152_G	303_G	0.655	0.12
201_S	334_E	0.655	0.12
65_S	69_S	0.653	0.12
38_P	284_Q	0.652	0.12
127_K	130_K	0.651	0.12
73_I	99_N	0.651	0.12
254_L	280_P	0.650	0.12
15_D	193_H	0.646	0.12
65_S	331_I	0.645	0.12
132_E	135_D	0.645	0.12
96_V	331_I	0.645	0.12
189_V	202_P	0.644	0.12
193_H	322_G	0.641	0.12
109_I	297_D	0.641	0.12
214_R	314_S	0.640	0.12
3_V	71_N	0.639	0.12
66_I	293_L	0.638	0.12
86_Y	242_E	0.638	0.12
147_R	289_P	0.637	0.12
152_G	313_G	0.636	0.12
170_L	177_N	0.631	0.12
264_R	342_N	0.629	0.12
77_N	303_G	0.629	0.12
203_I	335_I	0.627	0.12
216_I	249_T	0.627	0.12
78_R	107_E	0.627	0.12
303_G	307_N	0.623	0.12
42_F	97_F	0.623	0.12
277_I	347_I	0.622	0.12
251_R	314_S	0.621	0.12
247_P	309_Y	0.620	0.12
109_I	261_I	0.620	0.12
78_R	303_G	0.618	0.12
271_K	336_K	0.618	0.12
64_Q	347_I	0.618	0.12
239_K	289_P	0.618	0.12
126_P	141_K	0.615	0.12
50_I	71_N	0.614	0.12
203_I	269_T	0.613	0.12
165_K	267_D	0.613	0.12
132_E	232_I	0.612	0.12
50_I	342_N	0.612	0.12
82_V	249_T	0.610	0.12
241_I	292_D	0.609	0.12
167_N	347_I	0.606	0.12
288_T	291_L	0.606	0.12
239_K	286_M	0.606	0.12
262_G	348_L	0.606	0.12
62_K	198_Y	0.605	0.11
115_Y	195_N	0.601	0.11
201_S	213_D	0.601	0.11
7_A	201_S	0.600	0.11
186_E	297_D	0.598	0.11
8_L	341_N	0.597	0.11
104_R	268_A	0.596	0.11
156_A	189_V	0.594	0.11
209_L	213_D	0.592	0.11
11_H	14_L	0.591	0.11
78_R	304_G	0.590	0.11
4_K	69_S	0.590	0.11
118_L	283_L	0.589	0.11
123_I	265_F	0.588	0.11
30_L	84_V	0.587	0.11
144_E	197_N	0.584	0.11
62_K	336_K	0.584	0.11
15_D	304_G	0.584	0.11
226_L	344_T	0.583	0.11
133_E	185_I	0.583	0.11
249_T	296_Y	0.582	0.11
78_R	242_E	0.580	0.11
12_S	83_Y	0.580	0.11
213_D	326_S	0.579	0.11
139_I	345_E	0.577	0.11
95_K	222_S	0.577	0.11
274_P	343_L	0.576	0.11
143_P	223_L	0.576	0.11
93_K	170_L	0.572	0.11
33_K	36_E	0.569	0.11
181_K	260_E	0.566	0.11
66_I	70_E	0.566	0.11
28_I	198_Y	0.565	0.11
15_D	78_R	0.564	0.11
99_N	214_R	0.564	0.11
206_R	261_I	0.564	0.11
9_A	13_A	0.563	0.11
152_G	333_L	0.563	0.11
76_P	251_R	0.562	0.11
247_P	305_G	0.562	0.11
108_R	121_A	0.561	0.11
182_N	336_K	0.561	0.11
167_N	258_V	0.559	0.11
93_K	260_E	0.557	0.11
115_Y	265_F	0.556	0.11
212_V	288_T	0.554	0.11
62_K	122_K	0.553	0.11
135_D	343_L	0.553	0.11
33_K	53_E	0.552	0.11
213_D	302_I	0.551	0.11
59_I	137_P	0.550	0.11
152_G	326_S	0.549	0.11
82_V	217_Q	0.549	0.11
51_I	160_E	0.548	0.11
196_L	293_L	0.547	0.11
42_F	320_Y	0.547	0.11
85_G	196_L	0.546	0.11
158_N	211_S	0.546	0.11
15_D	299_A	0.546	0.11
137_P	235_G	0.545	0.11
150_E	284_Q	0.545	0.11
245_H	284_Q	0.545	0.11
103_L	194_F	0.545	0.11
140_V	292_D	0.538	0.10
10_S	76_P	0.538	0.10
152_G	242_E	0.537	0.10
267_D	271_K	0.537	0.10
70_E	348_L	0.536	0.10
240_L	285_V	0.535	0.10
197_N	298_V	0.535	0.10
21_K	47_D	0.533	0.10
262_G	265_F	0.533	0.10
162_F	211_S	0.533	0.10
190_F	295_V	0.533	0.10
186_E	242_E	0.532	0.10
305_G	310_M	0.531	0.10
278_I	347_I	0.530	0.10
72_A	262_G	0.529	0.10
21_K	27_T	0.528	0.10
292_D	340_I	0.528	0.10
282_T	307_N	0.527	0.10
147_R	242_E	0.527	0.10
251_R	291_L	0.526	0.10
95_K	100_R	0.526	0.10
261_I	348_L	0.525	0.10
195_N	249_T	0.523	0.10
188_F	207_L	0.523	0.10
132_E	323_K	0.521	0.10
93_K	122_K	0.519	0.10
73_I	134_I	0.519	0.10
159_K	337_H	0.517	0.10
286_M	304_G	0.517	0.10
31_C	118_L	0.516	0.10
122_K	233_K	0.516	0.10
216_I	222_S	0.515	0.10
133_E	340_I	0.515	0.10
197_N	217_Q	0.515	0.10
85_G	251_R	0.514	0.10
104_R	151_R	0.513	0.10
225_R	305_G	0.513	0.10
15_D	297_D	0.512	0.10
6_A	28_I	0.511	0.10
133_E	278_I	0.510	0.10
13_A	231_Q	0.509	0.10
165_K	290_D	0.508	0.10
16_V	331_I	0.507	0.10
140_V	317_S	0.506	0.10
177_N	190_F	0.502	0.10
89_I	142_L	0.502	0.10
211_S	298_V	0.501	0.10
137_P	188_F	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2r7kA	5	0.9742	100	0.683	Contact Map
2pbzA	3	0.8338	100	0.703	Contact Map
2r85A	3	0.9427	100	0.706	Contact Map
3ln6A	2	0.8625	99.9	0.861	Contact Map
3e5nA	2	0.8453	99.9	0.865	Contact Map
2i87A	2	0.8625	99.9	0.866	Contact Map
3i12A	2	0.8854	99.9	0.868	Contact Map
3k3pA	2	0.808	99.9	0.869	Contact Map
1ehiA	2	0.8854	99.8	0.872	Contact Map
3tqtA	2	0.8481	99.8	0.874	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0099 seconds.