Q980N3 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980N3 - tRNA(Ile2) 2-agmatinylcytidine synthetase TiaS

UniProt:	Q980N3	Sequences: MKYVIGIDDHDSYKFGCTTHFSVILTSYLYKNHSTILLDLPYLVRLNPNIPWKTRGNASIKLIVEFNGTKKELADIIFSYSIEYVKDVSLALEHGRKPGIAIMEYDKYITLFDKLYDFYIKGISDIIPIDYAKKFAEKNDIELRGDRGIIGSIAGLGMSGDYTYELITYRKKENWLKKRMINKDSVKRVDESTFPLTFANYDYINDTPLITPHGTDPILYGIRGASIQHLIKAMELIESNEDIDFFAIFKTNQSTDIHFQKIGNRFYQETKKVVQVKNVRILEGGDVIVETTDNDILFVYKETGELNSAAKLLKKGDEIVAYGAVKPSIAYGKIIELERFEILKLYDLELVNPKCPRCGGSTNSLGKNKGYRCKKCKYIINTTNKSTKNIMRNLSLGMYQTRSYRHLTKPIFLELENNKPSFYEERKFLEMYRSTLYKLDYHL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	443 (394)
Sequences:	221 (173)
Seq/√Len:	8.7

HALSA - Q9HNG8
SULSO - Q980N3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
97_K	145_G	4.656	0.99
161_D	413_L	4.502	0.99
22_S	249_F	4.148	0.98
301_K	304_G	3.896	0.98
225_A	413_L	3.692	0.97
274_V	291_T	3.658	0.96
85_V	100_I	3.530	0.96
363_N	372_R	3.275	0.93
347_D	389_N	3.063	0.91
50_I	126_I	2.986	0.89
129_I	150_I	2.984	0.89
175_W	214_G	2.902	0.88
302_E	307_N	2.803	0.86
256_D	339_R	2.650	0.83
302_E	403_S	2.649	0.83
301_K	307_N	2.629	0.82
301_K	306_L	2.472	0.78
97_K	144_R	2.403	0.76
193_T	197_T	2.349	0.74
400_Q	411_I	2.323	0.73
8_D	11_D	2.312	0.73
172_K	175_W	2.306	0.73
199_A	401_T	2.229	0.70
46_L	154_A	2.229	0.70
306_L	402_R	2.216	0.69
121_K	125_D	2.188	0.68
400_Q	404_Y	2.172	0.68
310_A	340_F	2.165	0.68
354_K	361_S	2.107	0.65
289_V	297_L	2.100	0.65
198_F	209_L	2.058	0.63
136_A	143_L	2.040	0.63
161_D	225_A	2.009	0.61
189_V	200_N	2.006	0.61
49_N	324_A	1.985	0.60
288_I	298_F	1.978	0.60
118_F	153_I	1.914	0.58
178_K	244_D	1.909	0.57
281_I	311_K	1.909	0.57
299_V	400_Q	1.896	0.57
326_K	332_G	1.864	0.55
168_T	220_Y	1.818	0.54
297_L	321_A	1.810	0.53
22_S	60_I	1.808	0.53
306_L	339_R	1.808	0.53
307_N	402_R	1.745	0.50
10_H	20_H	1.733	0.50
197_T	233_A	1.731	0.50
404_Y	408_T	1.719	0.49
125_D	268_Q	1.717	0.49
230_L	248_I	1.716	0.49
307_N	339_R	1.682	0.48
312_L	393_N	1.681	0.48
81_S	102_I	1.675	0.47
23_V	245_F	1.674	0.47
146_D	167_I	1.668	0.47
96_R	401_T	1.657	0.47
189_V	233_A	1.651	0.46
182_N	303_T	1.650	0.46
158_M	257_I	1.643	0.46
78_F	102_I	1.637	0.46
298_F	334_I	1.621	0.45
5_I	25_L	1.607	0.45
258_H	338_E	1.587	0.44
149_I	200_N	1.586	0.44
299_V	404_Y	1.570	0.43
342_I	345_L	1.554	0.42
274_V	289_V	1.551	0.42
198_F	210_I	1.550	0.42
200_N	210_I	1.545	0.42
52_W	96_R	1.545	0.42
170_R	179_R	1.538	0.42
126_I	216_D	1.532	0.41
41_P	247_A	1.527	0.41
304_G	402_R	1.516	0.41
115_L	153_I	1.493	0.40
9_D	12_S	1.490	0.40
121_K	131_Y	1.473	0.39
320_V	341_E	1.460	0.38
302_E	339_R	1.459	0.38
105_Y	111_L	1.451	0.38
339_R	404_Y	1.450	0.38
373_C	376_C	1.434	0.37
256_D	402_R	1.431	0.37
195_P	311_K	1.426	0.37
31_K	244_D	1.393	0.36
302_E	306_L	1.393	0.36
97_K	133_K	1.384	0.35
123_I	260_Q	1.382	0.35
227_I	363_N	1.382	0.35
184_D	344_K	1.379	0.35
274_V	296_I	1.377	0.35
21_F	50_I	1.375	0.35
31_K	276_V	1.373	0.35
296_I	335_I	1.372	0.35
213_H	347_D	1.366	0.35
314_K	346_Y	1.348	0.34
60_I	288_I	1.347	0.34
123_I	257_I	1.341	0.34
282_L	288_I	1.340	0.34
309_A	340_F	1.334	0.33
166_L	230_L	1.323	0.33
303_T	403_S	1.317	0.33
49_N	237_I	1.313	0.33
304_G	307_N	1.308	0.32
356_P	378_Y	1.307	0.32
360_G	413_L	1.307	0.32
304_G	339_R	1.303	0.32
128_P	150_I	1.297	0.32
99_G	146_D	1.292	0.32
206_D	273_V	1.282	0.32
58_A	133_K	1.282	0.32
27_S	128_P	1.275	0.31
189_V	198_F	1.274	0.31
251_T	256_D	1.272	0.31
319_I	368_N	1.270	0.31
47_N	169_Y	1.260	0.31
44_V	150_I	1.257	0.31
10_H	405_R	1.251	0.30
53_K	169_Y	1.250	0.30
44_V	153_I	1.249	0.30
197_T	248_I	1.244	0.30
259_F	271_K	1.240	0.30
51_P	267_Y	1.240	0.30
39_D	42_Y	1.240	0.30
250_K	319_I	1.231	0.30
84_Y	88_V	1.229	0.30
213_H	248_I	1.226	0.29
145_G	213_H	1.220	0.29
27_S	164_Y	1.203	0.29
5_I	29_L	1.202	0.29
10_H	96_R	1.201	0.29
336_E	403_S	1.199	0.29
4_V	60_I	1.198	0.29
147_R	150_I	1.197	0.28
44_V	119_Y	1.186	0.28
339_R	402_R	1.185	0.28
322_Y	398_M	1.182	0.28
176_L	411_I	1.180	0.28
118_F	132_A	1.177	0.28
96_R	400_Q	1.177	0.28
51_P	123_I	1.176	0.28
276_V	317_D	1.176	0.28
58_A	158_M	1.176	0.28
207_T	216_D	1.173	0.28
300_Y	326_K	1.173	0.28
139_N	291_T	1.171	0.28
302_E	336_E	1.170	0.28
6_G	156_L	1.161	0.27
96_R	404_Y	1.156	0.27
63_I	326_K	1.139	0.26
10_H	404_Y	1.132	0.26
185_S	297_L	1.131	0.26
9_D	148_G	1.127	0.26
254_S	405_R	1.123	0.26
293_D	372_R	1.122	0.26
5_I	239_S	1.120	0.26
353_P	362_T	1.118	0.26
52_W	401_T	1.111	0.26
39_D	113_D	1.103	0.25
30_Y	244_D	1.101	0.25
176_L	241_E	1.099	0.25
96_R	402_R	1.097	0.25
52_W	326_K	1.097	0.25
97_K	304_G	1.095	0.25
190_D	282_L	1.093	0.25
401_T	404_Y	1.091	0.25
179_R	317_D	1.089	0.25
105_Y	136_A	1.086	0.25
6_G	9_D	1.086	0.25
185_S	219_L	1.079	0.25
302_E	402_R	1.079	0.25
111_L	119_Y	1.076	0.24
88_V	294_N	1.076	0.24
133_K	368_N	1.074	0.24
171_K	242_D	1.071	0.24
119_Y	158_M	1.066	0.24
141_I	157_G	1.062	0.24
59_S	118_F	1.059	0.24
122_G	127_I	1.058	0.24
227_I	374_K	1.052	0.24
5_I	374_K	1.050	0.24
199_A	404_Y	1.050	0.24
119_Y	136_A	1.049	0.24
157_G	216_D	1.047	0.24
4_V	61_K	1.047	0.24
83_E	249_F	1.046	0.24
198_F	337_L	1.045	0.23
299_V	402_R	1.045	0.23
371_Y	397_G	1.042	0.23
219_L	251_T	1.041	0.23
119_Y	257_I	1.039	0.23
199_A	400_Q	1.037	0.23
219_L	241_E	1.037	0.23
149_I	413_L	1.037	0.23
41_P	51_P	1.036	0.23
369_K	378_Y	1.033	0.23
20_H	96_R	1.029	0.23
103_M	112_F	1.028	0.23
146_D	149_I	1.028	0.23
15_F	51_P	1.026	0.23
60_I	102_I	1.018	0.23
300_Y	336_E	1.018	0.23
277_K	290_E	1.018	0.23
197_T	200_N	1.013	0.23
179_R	241_E	1.008	0.22
307_N	400_Q	1.003	0.22
121_K	127_I	1.000	0.22
121_K	150_I	1.000	0.22
47_N	53_K	0.997	0.22
119_Y	288_I	0.986	0.22
281_I	369_K	0.984	0.22
4_V	372_R	0.983	0.22
96_R	299_V	0.982	0.22
200_N	220_Y	0.978	0.21
11_D	19_T	0.977	0.21
8_D	17_C	0.977	0.21
8_D	19_T	0.977	0.21
11_D	17_C	0.977	0.21
85_V	99_G	0.976	0.21
233_A	336_E	0.976	0.21
205_N	220_Y	0.975	0.21
212_P	286_D	0.974	0.21
301_K	402_R	0.974	0.21
112_F	119_Y	0.967	0.21
78_F	142_E	0.959	0.21
187_K	201_Y	0.952	0.21
369_K	382_T	0.945	0.21
52_W	129_I	0.944	0.21
49_N	216_D	0.940	0.20
174_N	378_Y	0.937	0.20
325_V	356_P	0.936	0.20
77_I	367_K	0.934	0.20
106_D	236_L	0.933	0.20
42_Y	167_I	0.926	0.20
225_A	360_G	0.925	0.20
273_V	318_E	0.923	0.20
322_Y	401_T	0.923	0.20
162_Y	250_K	0.923	0.20
5_I	121_K	0.914	0.20
25_L	84_Y	0.914	0.20
264_N	315_K	0.912	0.20
220_Y	234_M	0.911	0.20
339_R	400_Q	0.910	0.20
298_F	346_Y	0.910	0.20
385_K	409_K	0.909	0.20
185_S	403_S	0.908	0.20
101_A	178_K	0.906	0.19
46_L	353_P	0.905	0.19
115_L	139_N	0.903	0.19
50_I	372_R	0.903	0.19
143_L	391_M	0.903	0.19
144_R	401_T	0.899	0.19
215_T	308_S	0.896	0.19
189_V	230_L	0.894	0.19
257_I	294_N	0.894	0.19
214_G	404_Y	0.892	0.19
237_I	319_I	0.892	0.19
174_N	249_F	0.891	0.19
58_A	137_E	0.889	0.19
196_L	229_H	0.887	0.19
42_Y	146_D	0.886	0.19
365_L	369_K	0.879	0.19
179_R	370_G	0.878	0.19
192_S	236_L	0.875	0.19
251_T	339_R	0.873	0.19
23_V	249_F	0.872	0.19
301_K	404_Y	0.870	0.19
198_F	413_L	0.869	0.19
149_I	269_E	0.869	0.19
303_T	401_T	0.869	0.19
8_D	18_T	0.867	0.18
11_D	18_T	0.867	0.18
10_H	299_V	0.866	0.18
58_A	145_G	0.866	0.18
44_V	121_K	0.865	0.18
199_A	209_L	0.863	0.18
25_L	29_L	0.861	0.18
101_A	176_L	0.859	0.18
15_F	208_P	0.859	0.18
238_E	335_I	0.858	0.18
127_I	186_V	0.858	0.18
319_I	350_L	0.855	0.18
119_Y	157_G	0.854	0.18
256_D	400_Q	0.853	0.18
319_I	342_I	0.852	0.18
226_S	235_E	0.851	0.18
20_H	97_K	0.851	0.18
155_G	167_I	0.850	0.18
135_F	153_I	0.847	0.18
189_V	210_I	0.842	0.18
89_S	195_P	0.841	0.18
200_N	211_T	0.840	0.18
400_Q	408_T	0.838	0.18
191_E	237_I	0.835	0.18
306_L	310_A	0.835	0.18
22_S	25_L	0.833	0.18
248_I	263_G	0.829	0.18
190_D	336_E	0.828	0.17
307_N	310_A	0.826	0.17
189_V	306_L	0.825	0.17
83_E	184_D	0.815	0.17
147_R	256_D	0.814	0.17
29_L	34_S	0.814	0.17
215_T	286_D	0.811	0.17
256_D	322_Y	0.807	0.17
97_K	175_W	0.806	0.17
256_D	306_L	0.804	0.17
342_I	375_K	0.804	0.17
185_S	241_E	0.803	0.17
181_I	239_S	0.803	0.17
178_K	238_E	0.797	0.17
6_G	11_D	0.796	0.17
251_T	307_N	0.789	0.17
299_V	337_L	0.787	0.16
209_L	216_D	0.787	0.16
157_G	270_T	0.787	0.16
365_L	370_G	0.786	0.16
214_G	400_Q	0.784	0.16
129_I	232_K	0.783	0.16
349_E	367_K	0.781	0.16
38_L	171_K	0.781	0.16
29_L	80_Y	0.780	0.16
143_L	156_L	0.777	0.16
7_I	85_V	0.777	0.16
65_E	69_T	0.776	0.16
155_G	168_T	0.776	0.16
88_V	125_D	0.774	0.16
150_I	409_K	0.771	0.16
4_V	58_A	0.770	0.16
213_H	250_K	0.769	0.16
123_I	362_T	0.768	0.16
6_G	222_I	0.768	0.16
46_L	122_G	0.768	0.16
62_L	287_V	0.767	0.16
120_I	123_I	0.765	0.16
228_Q	232_K	0.764	0.16
175_W	319_I	0.764	0.16
8_D	12_S	0.763	0.16
301_K	339_R	0.761	0.16
97_K	214_G	0.760	0.16
199_A	408_T	0.760	0.16
153_I	157_G	0.759	0.16
167_I	337_L	0.758	0.16
95_G	218_I	0.757	0.16
215_T	365_L	0.753	0.16
235_E	394_L	0.751	0.16
82_I	236_L	0.750	0.16
214_G	324_A	0.749	0.16
369_K	372_R	0.744	0.16
76_I	133_K	0.743	0.15
16_G	336_E	0.742	0.15
299_V	306_L	0.742	0.15
28_Y	191_E	0.740	0.15
371_Y	385_K	0.739	0.15
20_H	199_A	0.739	0.15
124_S	359_G	0.738	0.15
4_V	164_Y	0.737	0.15
273_V	343_L	0.736	0.15
58_A	102_I	0.736	0.15
49_N	112_F	0.734	0.15
313_L	392_R	0.734	0.15
114_K	138_K	0.733	0.15
168_T	248_I	0.732	0.15
313_L	317_D	0.732	0.15
127_I	138_K	0.726	0.15
275_Q	377_K	0.725	0.15
170_R	216_D	0.724	0.15
301_K	403_S	0.724	0.15
137_E	178_K	0.723	0.15
96_R	144_R	0.721	0.15
161_D	360_G	0.721	0.15
207_T	247_A	0.720	0.15
5_I	293_D	0.713	0.15
198_F	405_R	0.708	0.15
197_T	407_L	0.708	0.15
96_R	199_A	0.705	0.15
307_N	404_Y	0.705	0.15
388_K	415_L	0.704	0.15
129_I	144_R	0.703	0.15
94_H	390_I	0.703	0.15
164_Y	186_V	0.702	0.15
392_R	399_Y	0.698	0.14
80_Y	111_L	0.697	0.14
91_A	144_R	0.696	0.14
307_N	403_S	0.696	0.14
100_I	257_I	0.694	0.14
241_E	287_V	0.693	0.14
285_G	352_N	0.693	0.14
27_S	391_M	0.689	0.14
51_P	91_A	0.688	0.14
129_I	283_E	0.687	0.14
99_G	150_I	0.687	0.14
159_S	237_I	0.686	0.14
51_P	214_G	0.686	0.14
306_L	404_Y	0.684	0.14
191_E	335_I	0.683	0.14
58_A	408_T	0.681	0.14
260_Q	324_A	0.680	0.14
41_P	127_I	0.680	0.14
231_I	409_K	0.679	0.14
86_K	248_I	0.678	0.14
307_N	336_E	0.678	0.14
90_L	123_I	0.677	0.14
60_I	263_G	0.677	0.14
159_S	257_I	0.676	0.14
128_P	275_Q	0.674	0.14
232_K	235_E	0.672	0.14
100_I	382_T	0.671	0.14
241_E	345_L	0.667	0.14
275_Q	278_N	0.665	0.14
120_I	124_S	0.664	0.14
210_I	267_Y	0.663	0.14
15_F	21_F	0.662	0.14
83_E	180_M	0.661	0.14
174_N	367_K	0.660	0.14
39_D	250_K	0.659	0.14
96_R	251_T	0.658	0.14
125_D	130_D	0.656	0.14
247_A	295_D	0.653	0.14
254_S	392_R	0.652	0.14
362_T	413_L	0.652	0.14
128_P	278_N	0.651	0.14
175_W	244_D	0.651	0.14
274_V	297_L	0.650	0.14
123_I	156_L	0.650	0.14
350_L	387_T	0.650	0.14
179_R	219_L	0.649	0.13
174_N	177_K	0.647	0.13
206_D	277_K	0.646	0.13
13_Y	93_E	0.645	0.13
122_G	154_A	0.644	0.13
113_D	138_K	0.644	0.13
49_N	413_L	0.643	0.13
31_K	396_L	0.641	0.13
13_Y	372_R	0.641	0.13
96_R	286_D	0.641	0.13
149_I	210_I	0.640	0.13
185_S	303_T	0.640	0.13
303_T	399_Y	0.640	0.13
306_L	400_Q	0.640	0.13
273_V	320_V	0.638	0.13
272_K	335_I	0.638	0.13
89_S	356_P	0.638	0.13
16_G	145_G	0.637	0.13
185_S	189_V	0.637	0.13
132_A	153_I	0.634	0.13
268_Q	363_N	0.632	0.13
58_A	209_L	0.632	0.13
164_Y	227_I	0.631	0.13
97_K	172_K	0.630	0.13
270_T	413_L	0.629	0.13
136_A	351_V	0.629	0.13
256_D	307_N	0.629	0.13
155_G	202_D	0.627	0.13
76_I	318_E	0.625	0.13
248_I	396_L	0.625	0.13
306_L	401_T	0.624	0.13
149_I	362_T	0.623	0.13
367_K	409_K	0.623	0.13
297_L	337_L	0.623	0.13
267_Y	398_M	0.622	0.13
7_I	205_N	0.621	0.13
172_K	181_I	0.621	0.13
113_D	391_M	0.618	0.13
238_E	383_T	0.616	0.13
241_E	276_V	0.614	0.13
58_A	81_S	0.614	0.13
3_Y	324_A	0.613	0.13
123_I	321_A	0.612	0.13
51_P	60_I	0.609	0.13
50_I	214_G	0.609	0.13
153_I	385_K	0.608	0.13
21_F	214_G	0.603	0.13
293_D	325_V	0.603	0.13
260_Q	361_S	0.602	0.13
241_E	399_Y	0.599	0.13
288_I	334_I	0.598	0.13
82_I	277_K	0.597	0.12
266_F	300_Y	0.597	0.12
35_T	39_D	0.595	0.12
162_Y	190_D	0.594	0.12
339_R	401_T	0.594	0.12
34_S	127_I	0.592	0.12
141_I	167_I	0.591	0.12
256_D	299_V	0.587	0.12
317_D	392_R	0.586	0.12
202_D	303_T	0.586	0.12
253_Q	364_S	0.585	0.12
96_R	403_S	0.584	0.12
321_A	397_G	0.584	0.12
306_L	337_L	0.584	0.12
123_I	344_K	0.583	0.12
177_K	241_E	0.582	0.12
46_L	59_S	0.581	0.12
145_G	237_I	0.578	0.12
20_H	306_L	0.578	0.12
44_V	181_I	0.577	0.12
85_V	263_G	0.576	0.12
254_S	326_K	0.576	0.12
334_I	394_L	0.575	0.12
300_Y	337_L	0.575	0.12
153_I	201_Y	0.575	0.12
23_V	218_I	0.572	0.12
136_A	141_I	0.572	0.12
52_W	300_Y	0.572	0.12
10_H	286_D	0.571	0.12
50_I	267_Y	0.568	0.12
79_S	244_D	0.566	0.12
22_S	62_L	0.566	0.12
127_I	264_N	0.566	0.12
44_V	325_V	0.565	0.12
367_K	396_L	0.564	0.12
41_P	407_L	0.564	0.12
133_K	389_N	0.564	0.12
310_A	365_L	0.562	0.12
291_T	296_I	0.562	0.12
149_I	363_N	0.562	0.12
255_T	285_G	0.559	0.12
400_Q	412_F	0.559	0.12
16_G	97_K	0.558	0.12
318_E	354_K	0.558	0.12
306_L	408_T	0.558	0.12
10_H	21_F	0.557	0.12
25_L	277_K	0.557	0.12
20_H	404_Y	0.557	0.12
20_H	401_T	0.556	0.12
29_L	386_S	0.556	0.12
178_K	236_L	0.556	0.12
277_K	315_K	0.552	0.12
293_D	347_D	0.551	0.12
41_P	166_L	0.551	0.12
193_T	226_S	0.550	0.12
183_K	186_V	0.548	0.12
119_Y	415_L	0.548	0.12
214_G	267_Y	0.546	0.12
128_P	327_P	0.545	0.12
193_T	248_I	0.544	0.12
188_R	192_S	0.543	0.12
58_A	78_F	0.543	0.12
225_A	375_K	0.543	0.12
194_F	270_T	0.541	0.11
352_N	385_K	0.541	0.11
120_I	236_L	0.539	0.11
283_E	390_I	0.539	0.11
226_S	300_Y	0.539	0.11
355_C	376_C	0.536	0.11
355_C	373_C	0.536	0.11
60_I	214_G	0.536	0.11
133_K	172_K	0.535	0.11
40_L	250_K	0.532	0.11
147_R	270_T	0.532	0.11
227_I	365_L	0.531	0.11
239_S	374_K	0.531	0.11
173_E	382_T	0.529	0.11
233_A	407_L	0.528	0.11
299_V	302_E	0.527	0.11
249_F	385_K	0.527	0.11
154_A	349_E	0.526	0.11
300_Y	372_R	0.526	0.11
225_A	365_L	0.523	0.11
115_L	157_G	0.522	0.11
285_G	413_L	0.521	0.11
209_L	339_R	0.520	0.11
62_L	203_Y	0.519	0.11
16_G	21_F	0.518	0.11
85_V	167_I	0.518	0.11
158_M	372_R	0.516	0.11
310_A	401_T	0.515	0.11
16_G	167_I	0.515	0.11
172_K	310_A	0.511	0.11
276_V	289_V	0.510	0.11
142_E	237_I	0.509	0.11
219_L	334_I	0.509	0.11
282_L	395_S	0.508	0.11
339_R	408_T	0.508	0.11
220_Y	310_A	0.508	0.11
58_A	210_I	0.508	0.11
111_L	123_I	0.507	0.11
29_L	215_T	0.507	0.11
361_S	369_K	0.506	0.11
394_L	399_Y	0.506	0.11
130_D	386_S	0.505	0.11
351_V	386_S	0.504	0.11
320_V	343_L	0.504	0.11
202_D	316_G	0.503	0.11
41_P	126_I	0.502	0.11
369_K	413_L	0.501	0.11
147_R	199_A	0.500	0.11
91_A	222_I	0.500	0.11
306_L	403_S	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3au7A	1	0.7675	100	0.288	Contact Map
3u02A	3	0.5553	100	0.507	Contact Map
4gn4B	1	0.2144	95	0.967	Contact Map
1vd4A	1	0.1242	93.1	0.969	Contact Map
4gnxB	1	0.2641	90.7	0.971	Contact Map
1vq8Z	1	0.158	87.4	0.973	Contact Map
2k4xA	1	0.1084	87	0.973	Contact Map
1ffkW	1	0.1467	86.3	0.973	Contact Map
3j21g	1	0.1016	85.4	0.974	Contact Map
3j21i	1	0.158	80.6	0.975	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0114 seconds.