ATGT - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

ATGT - tRNA-guanine(15) transglycosylase

UniProt:	Q980L7	Sequences: MTVFEVKYEDLAGRIGTLRTRSGTLETPAFFPVINVLKKDEISIDEIRNIGFKNFITNSYILYKNNYIKDDIHKELRSEEMIIMTDSGAYQILEYGEIGITNLQIVNYQLKIKPDIGVILDLPTGNINDYDNAKKTVYETLKRAEEASEIIVKNQDNNIIWVYPIQGGRYLDLVKTSAEGLSKFEHIYNMAALGSPTVLLEKYMYDTVIDMIYTAKSNIKRGIPFHLFGGGLPHIIPFAVALGVDSFDSASYIIYARDNRYITRTRVYKLEDLEYFPCSCPICSKYTPKDLLEMNEKERTKALAIHNLYTILEEFKATKQAIKEGRLFEYLQEKAYSHPAVYSAFKRLMKYKDYLEKFDPRIRGDPKGLFLFDGNSLHRPEIIRHSRFLERYIQKKDKISIYCYDKAISDTAYDFKEKIREKIADRNESDVFIAVPFFGLIPLEISDSYPLSQFEIPNEIDEDVIDDMKTKIISFLRRNNYQKVELINCEKLGLHIDSISTSS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	503 (453)
Sequences:	192 (151)
Seq/√Len:	7.1

HALSA - ATGT
SULSO - ATGT

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
276_F	288_P	6.342	1.00
20_T	23_G	6.316	1.00
278_C	283_C	4.348	0.98
130_Y	134_K	4.027	0.96
210_D	347_R	3.667	0.94
273_L	320_Q	3.400	0.91
7_K	17_T	3.395	0.90
275_Y	319_K	3.332	0.90
139_E	142_K	3.232	0.88
204_M	207_T	3.164	0.87
180_G	183_K	3.043	0.85
26_E	319_K	2.892	0.81
223_I	318_T	2.891	0.81
92_I	123_P	2.847	0.80
242_L	319_K	2.845	0.80
89_A	92_I	2.761	0.78
251_S	311_I	2.753	0.78
13_G	240_V	2.723	0.77
216_K	225_F	2.691	0.76
93_L	195_S	2.627	0.74
23_G	82_I	2.596	0.73
160_I	189_N	2.593	0.73
280_C	283_C	2.578	0.73
330_Y	334_K	2.506	0.71
117_G	159_I	2.492	0.70
37_L	62_L	2.480	0.70
203_Y	338_H	2.422	0.68
55_F	72_I	2.385	0.67
163_Y	188_Y	2.336	0.65
31_F	54_N	2.322	0.64
48_R	80_E	2.315	0.64
119_I	144_A	2.274	0.63
298_E	315_F	2.258	0.62
126_N	198_V	2.215	0.61
17_T	24_T	2.164	0.59
212_I	319_K	2.154	0.58
216_K	228_F	2.146	0.58
84_M	114_P	2.128	0.57
55_F	83_I	2.106	0.57
72_I	83_I	2.070	0.55
165_I	276_F	2.026	0.53
15_I	319_K	2.022	0.53
201_E	328_F	1.979	0.52
52_F	312_L	1.976	0.52
126_N	197_T	1.974	0.51
241_A	254_I	1.964	0.51
102_N	146_E	1.950	0.51
174_V	198_V	1.942	0.50
132_N	136_T	1.941	0.50
118_V	162_V	1.923	0.49
130_Y	172_D	1.909	0.49
68_I	75_E	1.895	0.48
8_Y	15_I	1.892	0.48
26_E	275_Y	1.872	0.48
89_A	123_P	1.861	0.47
72_I	400_S	1.853	0.47
93_L	254_I	1.851	0.47
240_V	318_T	1.850	0.47
213_Y	319_K	1.826	0.46
200_L	208_V	1.822	0.46
59_S	62_L	1.820	0.46
174_V	215_A	1.817	0.45
259_N	296_E	1.807	0.45
52_F	251_S	1.802	0.45
123_P	254_I	1.795	0.45
192_A	196_P	1.789	0.44
17_T	83_I	1.769	0.44
345_F	349_M	1.763	0.43
90_Y	118_V	1.758	0.43
90_Y	174_V	1.743	0.43
319_K	380_P	1.740	0.42
462_E	472_I	1.732	0.42
84_M	162_V	1.722	0.42
317_A	321_A	1.692	0.41
23_G	120_L	1.671	0.40
225_F	228_F	1.661	0.40
37_L	65_N	1.643	0.39
90_Y	192_A	1.625	0.38
106_V	326_R	1.576	0.36
259_N	299_R	1.566	0.36
15_I	275_Y	1.564	0.36
37_L	303_L	1.564	0.36
192_A	195_S	1.563	0.36
11_L	118_V	1.552	0.36
174_V	195_S	1.525	0.35
314_E	334_K	1.519	0.34
11_L	89_A	1.498	0.34
174_V	197_T	1.484	0.33
125_G	132_N	1.482	0.33
7_K	24_T	1.476	0.33
236_I	311_I	1.476	0.33
315_F	318_T	1.469	0.33
165_I	286_Y	1.466	0.33
20_T	345_F	1.466	0.33
90_Y	197_T	1.458	0.32
31_F	367_K	1.457	0.32
270_L	385_H	1.441	0.32
280_C	329_E	1.431	0.31
71_D	174_V	1.422	0.31
285_K	324_E	1.418	0.31
90_Y	196_P	1.411	0.31
228_F	380_P	1.399	0.30
212_I	242_L	1.385	0.30
89_A	195_S	1.384	0.30
162_V	197_T	1.373	0.30
127_I	204_M	1.371	0.29
264_R	344_A	1.370	0.29
301_K	305_I	1.364	0.29
197_T	331_L	1.360	0.29
160_I	190_M	1.353	0.29
119_I	164_P	1.353	0.29
114_P	230_G	1.348	0.29
275_Y	320_Q	1.347	0.29
108_Y	266_R	1.342	0.29
174_V	196_P	1.339	0.28
470_T	476_L	1.339	0.28
23_G	345_F	1.338	0.28
29_A	78_S	1.329	0.28
270_L	427_N	1.305	0.27
64_K	80_E	1.303	0.27
103_L	146_E	1.298	0.27
251_S	369_L	1.292	0.27
445_I	448_S	1.291	0.27
55_F	76_L	1.290	0.27
359_D	384_R	1.287	0.27
15_I	26_E	1.286	0.27
277_P	376_S	1.284	0.27
404_Y	407_A	1.283	0.27
40_D	337_S	1.275	0.27
227_L	239_A	1.272	0.26
164_P	228_F	1.259	0.26
20_T	82_I	1.259	0.26
34_I	294_M	1.254	0.26
31_F	68_I	1.253	0.26
76_L	147_A	1.252	0.26
123_P	381_E	1.244	0.26
126_N	174_V	1.238	0.25
142_K	200_L	1.233	0.25
22_S	333_E	1.229	0.25
240_V	319_K	1.221	0.25
135_K	149_E	1.219	0.25
14_R	27_T	1.215	0.25
42_I	269_K	1.212	0.25
335_A	379_R	1.211	0.25
266_R	330_Y	1.205	0.24
342_Y	371_L	1.205	0.24
26_E	324_E	1.204	0.24
74_K	441_I	1.202	0.24
192_A	198_V	1.199	0.24
209_I	242_L	1.187	0.24
190_M	246_S	1.185	0.24
30_F	193_L	1.177	0.24
219_I	330_Y	1.174	0.24
30_F	311_I	1.174	0.24
212_I	257_R	1.173	0.24
14_R	28_P	1.169	0.23
193_L	242_L	1.167	0.23
100_I	105_I	1.166	0.23
236_I	315_F	1.166	0.23
114_P	162_V	1.165	0.23
40_D	208_V	1.160	0.23
315_F	387_R	1.159	0.23
90_Y	237_P	1.158	0.23
261_Y	283_C	1.157	0.23
53_K	214_T	1.154	0.23
34_I	55_F	1.153	0.23
181_L	262_I	1.152	0.23
464_V	468_M	1.139	0.23
31_F	174_V	1.130	0.22
182_S	220_K	1.127	0.22
133_A	327_L	1.126	0.22
165_I	324_E	1.120	0.22
210_D	356_E	1.119	0.22
279_S	313_E	1.118	0.22
34_I	268_Y	1.106	0.22
195_S	254_I	1.103	0.22
93_L	123_P	1.092	0.21
44_I	303_L	1.092	0.21
399_I	447_D	1.090	0.21
166_Q	231_G	1.090	0.21
226_H	252_Y	1.090	0.21
261_Y	280_C	1.085	0.21
126_N	196_P	1.085	0.21
251_S	262_I	1.084	0.21
105_I	332_Q	1.080	0.21
123_P	261_Y	1.076	0.21
385_H	451_L	1.072	0.21
214_T	452_S	1.067	0.21
13_G	329_E	1.067	0.21
34_I	76_L	1.063	0.21
90_Y	198_V	1.057	0.20
261_Y	278_C	1.056	0.20
59_S	305_I	1.056	0.20
72_I	192_A	1.051	0.20
69_K	185_E	1.046	0.20
47_I	163_Y	1.046	0.20
192_A	237_P	1.040	0.20
123_P	195_S	1.039	0.20
286_Y	291_L	1.039	0.20
143_R	146_E	1.036	0.20
35_N	55_F	1.034	0.20
468_M	472_I	1.033	0.20
174_V	192_A	1.031	0.20
113_K	337_S	1.028	0.20
460_I	464_V	1.027	0.20
251_S	334_K	1.026	0.20
456_I	480_N	1.020	0.20
348_L	355_L	1.019	0.20
90_Y	126_N	1.018	0.20
25_L	54_N	1.017	0.20
224_P	380_P	1.016	0.19
18_L	184_F	1.016	0.19
163_Y	181_L	1.015	0.19
67_Y	93_L	1.013	0.19
109_Q	193_L	1.012	0.19
44_I	47_I	1.011	0.19
60_Y	85_T	1.008	0.19
119_I	139_E	1.003	0.19
129_D	268_Y	1.001	0.19
335_A	381_E	0.997	0.19
104_Q	270_L	0.994	0.19
37_L	312_L	0.992	0.19
462_E	466_D	0.992	0.19
123_P	280_C	0.988	0.19
161_W	174_V	0.982	0.19
278_C	329_E	0.977	0.19
141_L	145_E	0.975	0.19
90_Y	93_L	0.974	0.18
178_A	215_A	0.972	0.18
71_D	266_R	0.971	0.18
78_S	271_E	0.970	0.18
126_N	192_A	0.966	0.18
261_Y	275_Y	0.965	0.18
313_E	319_K	0.964	0.18
208_V	441_I	0.962	0.18
91_Q	166_Q	0.961	0.18
295_N	298_E	0.961	0.18
268_Y	273_L	0.958	0.18
106_V	351_Y	0.955	0.18
71_D	108_Y	0.955	0.18
12_A	436_P	0.954	0.18
188_Y	201_E	0.952	0.18
85_T	450_P	0.950	0.18
159_I	189_N	0.950	0.18
359_D	438_F	0.950	0.18
254_I	263_T	0.945	0.18
295_N	476_L	0.941	0.18
91_Q	231_G	0.940	0.18
193_L	352_K	0.940	0.18
283_C	329_E	0.940	0.18
13_G	123_P	0.939	0.18
8_Y	150_I	0.938	0.18
353_D	462_E	0.938	0.18
35_N	76_L	0.934	0.18
109_Q	204_M	0.930	0.17
29_A	400_S	0.923	0.17
259_N	270_L	0.922	0.17
135_K	396_K	0.919	0.17
212_I	323_K	0.916	0.17
282_I	302_A	0.913	0.17
41_E	118_V	0.912	0.17
276_F	319_K	0.911	0.17
216_K	380_P	0.908	0.17
93_L	367_K	0.908	0.17
89_A	136_T	0.904	0.17
26_E	380_P	0.904	0.17
31_F	195_S	0.900	0.17
226_H	249_S	0.900	0.17
48_R	55_F	0.900	0.17
96_G	203_Y	0.900	0.17
122_L	143_R	0.895	0.17
68_I	196_P	0.892	0.17
61_I	144_A	0.882	0.16
59_S	68_I	0.879	0.16
334_K	371_L	0.879	0.16
259_N	271_E	0.876	0.16
162_V	196_P	0.875	0.16
475_F	479_N	0.874	0.16
54_N	116_I	0.873	0.16
192_A	197_T	0.866	0.16
59_S	363_R	0.865	0.16
79_E	90_Y	0.864	0.16
9_E	118_V	0.863	0.16
129_D	134_K	0.855	0.16
46_E	146_E	0.855	0.16
34_I	353_D	0.854	0.16
472_I	480_N	0.854	0.16
436_P	475_F	0.852	0.16
261_Y	303_L	0.852	0.16
210_D	352_K	0.849	0.16
204_M	239_A	0.849	0.16
17_T	288_P	0.847	0.16
184_F	271_E	0.846	0.16
444_E	463_D	0.846	0.16
12_A	446_S	0.842	0.16
5_E	10_D	0.839	0.16
299_R	311_I	0.838	0.16
467_D	471_K	0.836	0.15
329_E	439_G	0.836	0.15
219_I	334_K	0.835	0.15
180_G	446_S	0.831	0.15
45_D	182_S	0.830	0.15
328_F	385_H	0.830	0.15
18_L	170_Y	0.829	0.15
162_V	451_L	0.829	0.15
85_T	231_G	0.827	0.15
249_S	252_Y	0.826	0.15
184_F	408_I	0.826	0.15
382_I	455_E	0.825	0.15
135_K	466_D	0.825	0.15
244_V	335_A	0.822	0.15
185_E	297_K	0.818	0.15
6_V	25_L	0.812	0.15
462_E	474_S	0.811	0.15
65_N	68_I	0.810	0.15
176_T	180_G	0.810	0.15
84_M	164_P	0.809	0.15
62_L	72_I	0.807	0.15
31_F	168_G	0.805	0.15
62_L	68_I	0.802	0.15
468_M	480_N	0.802	0.15
469_K	473_I	0.801	0.15
473_I	483_K	0.801	0.15
30_F	445_I	0.801	0.15
368_G	451_L	0.800	0.15
68_I	168_G	0.800	0.15
145_E	180_G	0.800	0.15
255_Y	449_Y	0.797	0.15
29_A	352_K	0.795	0.15
125_G	161_W	0.795	0.15
35_N	44_I	0.795	0.15
188_Y	381_E	0.795	0.15
26_E	160_I	0.793	0.15
74_K	357_K	0.791	0.15
174_V	266_R	0.790	0.15
19_R	24_T	0.789	0.15
146_E	472_I	0.789	0.15
128_N	219_I	0.788	0.15
35_N	47_I	0.787	0.15
92_I	195_S	0.785	0.14
85_T	166_Q	0.785	0.14
99_G	348_L	0.782	0.14
223_I	478_R	0.781	0.14
379_R	385_H	0.781	0.14
164_P	177_S	0.780	0.14
236_I	251_S	0.777	0.14
141_L	180_G	0.776	0.14
90_Y	205_Y	0.771	0.14
175_K	294_M	0.770	0.14
89_A	192_A	0.770	0.14
271_E	279_S	0.769	0.14
34_I	459_E	0.769	0.14
201_E	325_G	0.767	0.14
135_K	287_T	0.767	0.14
90_Y	195_S	0.766	0.14
315_F	333_E	0.762	0.14
171_L	212_I	0.761	0.14
11_L	331_L	0.761	0.14
123_P	363_R	0.761	0.14
25_L	235_I	0.760	0.14
220_K	434_A	0.759	0.14
130_Y	170_Y	0.758	0.14
30_F	348_L	0.758	0.14
183_K	284_S	0.757	0.14
122_L	136_T	0.756	0.14
31_F	198_V	0.755	0.14
118_V	164_P	0.755	0.14
89_A	93_L	0.754	0.14
75_E	236_I	0.748	0.14
255_Y	333_E	0.748	0.14
82_I	317_A	0.747	0.14
26_E	224_P	0.747	0.14
64_K	463_D	0.746	0.14
100_I	388_F	0.745	0.14
319_K	323_K	0.744	0.14
436_P	439_G	0.743	0.14
176_T	401_I	0.742	0.14
8_Y	357_K	0.742	0.14
250_A	254_I	0.739	0.14
163_Y	212_I	0.735	0.14
54_N	98_I	0.733	0.14
103_L	107_N	0.732	0.14
235_I	303_L	0.732	0.14
280_C	325_G	0.732	0.14
89_A	118_V	0.731	0.13
131_D	303_L	0.730	0.13
136_T	195_S	0.729	0.13
399_I	479_N	0.729	0.13
277_P	303_L	0.728	0.13
132_N	350_K	0.725	0.13
190_M	391_R	0.725	0.13
65_N	305_I	0.724	0.13
253_I	330_Y	0.723	0.13
388_F	391_R	0.721	0.13
133_A	240_V	0.720	0.13
283_C	325_G	0.720	0.13
234_H	332_Q	0.720	0.13
287_T	472_I	0.719	0.13
105_I	380_P	0.719	0.13
189_N	305_I	0.718	0.13
111_K	399_I	0.717	0.13
191_A	223_I	0.716	0.13
315_F	428_E	0.716	0.13
42_I	113_K	0.715	0.13
205_Y	388_F	0.714	0.13
305_I	333_E	0.712	0.13
25_L	370_F	0.712	0.13
197_T	214_T	0.709	0.13
176_T	179_E	0.708	0.13
460_I	463_D	0.707	0.13
45_D	271_E	0.706	0.13
29_A	257_R	0.704	0.13
99_G	319_K	0.703	0.13
48_R	70_D	0.703	0.13
108_Y	197_T	0.702	0.13
45_D	386_S	0.700	0.13
86_D	256_A	0.700	0.13
86_D	194_G	0.700	0.13
167_G	194_G	0.700	0.13
167_G	229_G	0.700	0.13
167_G	248_D	0.700	0.13
167_G	256_A	0.700	0.13
248_D	256_A	0.700	0.13
86_D	121_D	0.700	0.13
87_S	121_D	0.700	0.13
86_D	167_G	0.700	0.13
194_G	229_G	0.700	0.13
194_G	248_D	0.700	0.13
229_G	256_A	0.700	0.13
229_G	248_D	0.700	0.13
194_G	256_A	0.700	0.13
121_D	256_A	0.700	0.13
88_G	256_A	0.700	0.13
86_D	248_D	0.700	0.13
87_S	167_G	0.700	0.13
87_S	194_G	0.700	0.13
87_S	229_G	0.700	0.13
87_S	248_D	0.700	0.13
87_S	256_A	0.700	0.13
86_D	229_G	0.700	0.13
88_G	121_D	0.700	0.13
88_G	167_G	0.700	0.13
88_G	194_G	0.700	0.13
121_D	194_G	0.700	0.13
88_G	229_G	0.700	0.13
88_G	248_D	0.700	0.13
121_D	229_G	0.700	0.13
121_D	248_D	0.700	0.13
121_D	167_G	0.700	0.13
184_F	432_F	0.699	0.13
217_S	476_L	0.699	0.13
261_Y	276_F	0.698	0.13
251_S	438_F	0.697	0.13
190_M	361_R	0.697	0.13
69_K	383_I	0.697	0.13
435_V	454_F	0.696	0.13
44_I	235_I	0.696	0.13
36_V	108_Y	0.696	0.13
329_E	360_P	0.694	0.13
195_S	246_S	0.693	0.13
45_D	48_R	0.690	0.13
162_V	174_V	0.689	0.13
114_P	444_E	0.689	0.13
295_N	465_I	0.688	0.13
441_I	479_N	0.687	0.13
98_I	284_S	0.687	0.13
76_L	263_T	0.687	0.13
70_D	294_M	0.687	0.13
170_Y	447_D	0.686	0.13
262_I	454_F	0.684	0.13
92_I	137_V	0.684	0.13
92_I	106_V	0.681	0.13
210_D	279_S	0.680	0.13
120_L	201_E	0.678	0.13
95_Y	260_R	0.677	0.13
93_L	335_A	0.674	0.12
90_Y	162_V	0.673	0.12
434_A	452_S	0.673	0.12
70_D	158_N	0.672	0.12
79_E	303_L	0.672	0.12
148_S	396_K	0.671	0.12
20_T	208_V	0.671	0.12
282_I	449_Y	0.671	0.12
283_C	327_L	0.667	0.12
17_T	452_S	0.667	0.12
392_Y	444_E	0.666	0.12
26_E	313_E	0.664	0.12
205_Y	272_D	0.664	0.12
15_I	337_S	0.663	0.12
22_S	208_V	0.659	0.12
466_D	474_S	0.658	0.12
83_I	291_L	0.657	0.12
133_A	282_I	0.656	0.12
148_S	220_K	0.655	0.12
157_N	292_L	0.655	0.12
78_S	184_F	0.655	0.12
360_P	380_P	0.655	0.12
117_G	409_S	0.654	0.12
103_L	206_D	0.653	0.12
160_I	205_Y	0.651	0.12
102_N	120_L	0.651	0.12
142_K	210_D	0.651	0.12
161_W	195_S	0.650	0.12
338_H	370_F	0.650	0.12
19_R	294_M	0.649	0.12
19_R	355_L	0.648	0.12
26_E	212_I	0.646	0.12
332_Q	345_F	0.645	0.12
106_V	357_K	0.645	0.12
113_K	117_G	0.645	0.12
123_P	241_A	0.644	0.12
104_Q	292_L	0.642	0.12
107_N	292_L	0.640	0.12
332_Q	449_Y	0.639	0.12
314_E	338_H	0.637	0.12
202_K	257_R	0.637	0.12
64_K	265_T	0.637	0.12
462_E	473_I	0.636	0.12
243_G	307_N	0.634	0.12
313_E	477_R	0.634	0.12
200_L	205_Y	0.632	0.12
94_E	318_T	0.632	0.12
137_V	251_S	0.631	0.12
379_R	438_F	0.631	0.12
200_L	255_Y	0.629	0.12
325_G	381_E	0.628	0.12
64_K	99_G	0.627	0.12
67_Y	234_H	0.625	0.12
98_I	318_T	0.625	0.12
359_D	385_H	0.624	0.12
92_I	136_T	0.622	0.12
197_T	244_V	0.621	0.12
124_T	370_F	0.618	0.12
281_P	309_Y	0.617	0.12
175_K	217_S	0.616	0.12
472_I	482_Q	0.615	0.12
28_P	32_P	0.613	0.11
28_P	33_V	0.613	0.11
465_I	473_I	0.613	0.11
314_E	379_R	0.613	0.11
149_E	179_E	0.611	0.11
161_W	326_R	0.611	0.11
95_Y	203_Y	0.610	0.11
157_N	404_Y	0.609	0.11
478_R	483_K	0.607	0.11
378_H	401_I	0.607	0.11
469_K	476_L	0.604	0.11
336_Y	375_N	0.603	0.11
480_N	483_K	0.602	0.11
47_I	309_Y	0.599	0.11
282_I	315_F	0.597	0.11
396_K	428_E	0.594	0.11
6_V	351_Y	0.593	0.11
47_I	276_F	0.593	0.11
42_I	150_I	0.593	0.11
285_K	404_Y	0.591	0.11
261_Y	436_P	0.590	0.11
143_R	332_Q	0.589	0.11
284_S	287_T	0.588	0.11
227_L	230_G	0.588	0.11
117_G	325_G	0.587	0.11
396_K	401_I	0.586	0.11
13_G	118_V	0.586	0.11
228_F	276_F	0.583	0.11
356_E	359_D	0.583	0.11
64_K	75_E	0.583	0.11
41_E	197_T	0.583	0.11
31_F	161_W	0.583	0.11
479_N	483_K	0.582	0.11
359_D	381_E	0.582	0.11
385_H	438_F	0.580	0.11
123_P	278_C	0.576	0.11
120_L	188_Y	0.575	0.11
55_F	311_I	0.575	0.11
59_S	313_E	0.574	0.11
265_T	349_M	0.573	0.11
7_K	193_L	0.573	0.11
51_G	140_T	0.573	0.11
211_M	434_A	0.572	0.11
298_E	441_I	0.572	0.11
259_N	294_M	0.572	0.11
377_L	401_I	0.571	0.11
105_I	388_F	0.571	0.11
6_V	15_I	0.570	0.11
280_C	321_A	0.569	0.11
177_S	211_M	0.569	0.11
236_I	326_R	0.568	0.11
215_A	469_K	0.568	0.11
175_K	218_N	0.567	0.11
124_T	338_H	0.565	0.11
266_R	334_K	0.563	0.11
12_A	181_L	0.563	0.11
89_A	280_C	0.562	0.11
116_I	476_L	0.561	0.11
6_V	302_A	0.561	0.11
209_I	238_F	0.559	0.11
448_S	477_R	0.558	0.11
90_Y	324_E	0.558	0.11
224_P	319_K	0.557	0.11
95_Y	140_T	0.557	0.11
59_S	204_M	0.554	0.11
212_I	310_T	0.554	0.11
356_E	384_R	0.553	0.11
60_Y	266_R	0.552	0.11
74_K	348_L	0.551	0.11
117_G	294_M	0.550	0.11
219_I	266_R	0.550	0.11
165_I	209_I	0.550	0.11
183_K	242_L	0.549	0.11
170_Y	281_P	0.548	0.11
475_F	481_Y	0.547	0.11
93_L	125_G	0.547	0.11
111_K	395_K	0.546	0.10
342_Y	373_D	0.545	0.10
18_L	261_Y	0.544	0.10
333_E	430_D	0.543	0.10
227_L	336_Y	0.543	0.10
95_Y	250_A	0.542	0.10
69_K	382_I	0.542	0.10
35_N	253_I	0.541	0.10
142_K	387_R	0.540	0.10
112_I	322_I	0.540	0.10
13_G	92_I	0.539	0.10
196_P	211_M	0.537	0.10
84_M	118_V	0.537	0.10
224_P	360_P	0.537	0.10
180_G	466_D	0.536	0.10
29_A	239_A	0.535	0.10
38_K	253_I	0.535	0.10
7_K	64_K	0.534	0.10
294_M	302_A	0.534	0.10
72_I	205_Y	0.533	0.10
25_L	114_P	0.529	0.10
59_S	367_K	0.529	0.10
217_S	392_Y	0.528	0.10
29_A	281_P	0.528	0.10
179_E	390_E	0.527	0.10
140_T	250_A	0.527	0.10
123_P	436_P	0.527	0.10
228_F	261_Y	0.525	0.10
150_I	184_F	0.525	0.10
216_K	321_A	0.524	0.10
13_G	282_I	0.524	0.10
195_S	205_Y	0.523	0.10
68_I	192_A	0.521	0.10
257_R	349_M	0.520	0.10
180_G	242_L	0.520	0.10
353_D	390_E	0.520	0.10
31_F	197_T	0.519	0.10
74_K	210_D	0.517	0.10
290_D	470_T	0.516	0.10
173_L	336_Y	0.516	0.10
262_I	385_H	0.516	0.10
7_K	393_I	0.516	0.10
289_K	292_L	0.515	0.10
203_Y	250_A	0.514	0.10
454_F	468_M	0.512	0.10
85_T	91_Q	0.512	0.10
285_K	401_I	0.511	0.10
95_Y	232_L	0.511	0.10
261_Y	363_R	0.509	0.10
164_P	261_Y	0.509	0.10
195_S	237_P	0.509	0.10
131_D	135_K	0.507	0.10
221_R	385_H	0.507	0.10
251_S	310_T	0.506	0.10
195_S	198_V	0.506	0.10
175_K	477_R	0.506	0.10
117_G	224_P	0.505	0.10
162_V	198_V	0.504	0.10
21_R	53_K	0.504	0.10
148_S	401_I	0.504	0.10
463_D	481_Y	0.503	0.10
118_V	254_I	0.503	0.10
258_D	345_F	0.503	0.10
55_F	74_K	0.501	0.10
401_I	430_D	0.501	0.10
8_Y	103_L	0.500	0.10
135_K	138_Y	0.500	0.10
145_E	205_Y	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1iq8A	2	0.9085	100	0.383	Contact Map
4q8wA	2	0.664	100	0.533	Contact Map
2ashA	3	0.6481	100	0.537	Contact Map
2q07A	1	0.2127	99.9	0.874	Contact Map
2qiwA	2	0.4254	86	0.975	Contact Map
3vkjA	4	0.5746	78.8	0.977	Contact Map
2ze3A	2	0.4513	76.8	0.977	Contact Map
4oqvA	1	0.5129	72.8	0.978	Contact Map
1nvmA	2	0.5845	67.8	0.979	Contact Map
1goxA	4	0.5408	62.6	0.979	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0134 seconds.