Q980K6 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980K6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q980K6	Sequences: MKTTLSVIKADIGSLAGHHVVHPDTIAAANKILAEAKRNNIISDYYITYVGDDLQLIMTHNRGELDTRVHETAWNAFKEAAKIAKDLGLYAAGQDLLSDSFSGNLRGMGPGIAEIEFEERPAEPVVIFMADKTEPGAYNLPLYKIFADPFNTAGLVIDPTMHEGYKFEVLDVYEGESIMLNTPEESYDLLALIGTPSRYIVRRVYRKADNLQASVVSVERLNLIAGKYVGKDDPVMVVRAQHGLPALGEILEAFTVPYLVPGWMRGSHYGPLMPVSQKDARATRFDGPPRLISLGFNIKNGKLVGPTDLFDDPAFDEVRRTAVIIADYIRKHGPFMPHRLEPQEMEYTTLPLVIEKLKNRFKKETDMYKTKPSVYSHESSHE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	382 (362)
Sequences:	146 (80)
Seq/√Len:	4.2

SULSO - Q980K6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
169_V	189_L	6.672	0.99
143_Y	186_S	4.979	0.95
71_E	75_N	3.708	0.80
88_G	299_K	3.383	0.73
5_L	125_V	3.146	0.67
185_E	360_R	3.131	0.67
126_V	293_S	3.079	0.65
5_L	117_F	2.921	0.61
123_E	161_M	2.525	0.49
62_R	66_D	2.513	0.49
355_E	358_K	2.497	0.48
12_I	25_T	2.394	0.45
158_D	243_G	2.337	0.44
62_R	68_R	2.310	0.43
130_A	142_L	2.259	0.41
29_A	56_L	2.227	0.41
248_G	287_G	2.137	0.38
138_Y	219_E	2.136	0.38
315_F	338_H	2.124	0.38
7_V	127_I	2.119	0.37
134_E	328_Y	2.110	0.37
130_A	196_P	2.101	0.37
55_Q	129_M	2.074	0.36
216_V	236_M	2.062	0.36
256_V	332_H	2.051	0.36
3_T	123_E	2.040	0.35
29_A	76_A	2.023	0.35
212_Q	244_L	1.995	0.34
278_K	311_D	1.951	0.33
29_A	54_L	1.933	0.32
317_E	320_R	1.923	0.32
182_T	189_L	1.913	0.32
180_L	192_L	1.908	0.32
59_T	303_L	1.908	0.32
252_E	284_R	1.890	0.31
28_A	31_K	1.856	0.30
43_S	69_V	1.849	0.30
196_P	220_R	1.840	0.30
142_L	236_M	1.839	0.30
150_F	334_P	1.824	0.30
195_T	342_P	1.791	0.29
123_E	215_V	1.791	0.29
244_L	328_Y	1.787	0.29
130_A	261_P	1.749	0.28
284_R	315_F	1.745	0.28
26_I	222_N	1.739	0.28
206_R	209_D	1.732	0.27
21_V	315_F	1.700	0.27
138_Y	236_M	1.682	0.26
195_T	336_M	1.653	0.26
325_I	328_Y	1.648	0.26
252_E	315_F	1.646	0.25
248_G	286_D	1.637	0.25
48_T	57_I	1.633	0.25
41_I	69_V	1.631	0.25
178_I	361_F	1.622	0.25
277_Q	294_L	1.618	0.25
80_A	192_L	1.611	0.25
130_A	220_R	1.608	0.25
264_M	270_G	1.605	0.25
115_I	212_Q	1.593	0.24
43_S	161_M	1.592	0.24
220_R	223_L	1.583	0.24
80_A	219_E	1.572	0.24
32_I	76_A	1.563	0.24
91_A	341_E	1.558	0.24
284_R	338_H	1.553	0.23
75_N	302_K	1.552	0.23
40_N	75_N	1.533	0.23
80_A	216_V	1.522	0.23
127_I	237_V	1.516	0.23
25_T	91_A	1.494	0.22
79_E	82_K	1.479	0.22
118_E	130_A	1.464	0.22
188_D	331_K	1.462	0.22
144_K	150_F	1.457	0.21
14_S	204_V	1.455	0.21
56_L	125_V	1.449	0.21
99_D	102_S	1.449	0.21
261_P	341_E	1.426	0.21
184_E	207_K	1.419	0.21
41_I	79_E	1.410	0.21
291_L	336_M	1.402	0.20
3_T	298_I	1.398	0.20
26_I	30_N	1.396	0.20
207_K	244_L	1.393	0.20
21_V	338_H	1.389	0.20
118_E	344_E	1.382	0.20
256_V	331_K	1.381	0.20
21_V	244_L	1.376	0.20
66_D	85_K	1.371	0.20
162_H	188_D	1.357	0.19
145_I	309_L	1.350	0.19
248_G	288_P	1.345	0.19
263_W	270_G	1.336	0.19
244_L	326_A	1.335	0.19
99_D	329_I	1.332	0.19
29_A	33_L	1.327	0.19
126_V	247_L	1.319	0.19
252_E	338_H	1.319	0.19
272_L	313_P	1.318	0.19
248_G	264_M	1.316	0.19
138_Y	216_V	1.309	0.19
69_V	181_N	1.304	0.19
218_V	336_M	1.303	0.19
122_A	303_L	1.299	0.18
257_P	305_G	1.291	0.18
67_T	71_E	1.288	0.18
83_I	212_Q	1.286	0.18
14_S	298_I	1.284	0.18
130_A	138_Y	1.279	0.18
189_L	201_V	1.275	0.18
295_G	305_G	1.275	0.18
12_I	299_K	1.273	0.18
87_L	315_F	1.268	0.18
5_L	283_T	1.264	0.18
264_M	286_D	1.263	0.18
33_L	80_A	1.252	0.18
98_S	299_K	1.247	0.18
192_L	216_V	1.241	0.17
21_V	50_V	1.239	0.17
29_A	80_A	1.238	0.17
257_P	322_A	1.238	0.17
264_M	288_P	1.235	0.17
80_A	138_Y	1.230	0.17
142_L	196_P	1.225	0.17
5_L	75_N	1.223	0.17
21_V	134_E	1.222	0.17
119_E	213_A	1.221	0.17
264_M	287_G	1.217	0.17
172_V	220_R	1.214	0.17
100_S	253_A	1.212	0.17
82_K	106_R	1.212	0.17
5_L	160_T	1.203	0.17
80_A	191_A	1.202	0.17
172_V	344_E	1.188	0.17
315_F	327_D	1.187	0.17
98_S	213_A	1.174	0.16
16_A	191_A	1.173	0.16
27_A	30_N	1.168	0.16
125_V	215_V	1.156	0.16
38_R	201_V	1.150	0.16
143_Y	332_H	1.144	0.16
101_F	133_T	1.139	0.16
7_V	237_V	1.138	0.16
42_I	78_K	1.137	0.16
220_R	261_P	1.135	0.16
134_E	244_L	1.135	0.16
130_A	236_M	1.135	0.16
84_A	253_A	1.134	0.16
345_M	351_P	1.134	0.16
42_I	291_L	1.131	0.16
57_I	237_V	1.121	0.15
3_T	14_S	1.115	0.15
31_K	35_E	1.114	0.15
45_Y	304_V	1.109	0.15
57_I	275_V	1.109	0.15
227_K	255_T	1.099	0.15
76_A	80_A	1.095	0.15
248_G	251_L	1.095	0.15
136_G	196_P	1.090	0.15
197_S	343_Q	1.088	0.15
16_A	19_H	1.082	0.15
139_N	271_P	1.082	0.15
21_V	328_Y	1.079	0.15
180_L	329_I	1.072	0.15
177_S	362_K	1.070	0.15
36_A	332_H	1.068	0.15
65_L	329_I	1.065	0.15
14_S	327_D	1.063	0.15
253_A	281_R	1.060	0.15
43_S	61_N	1.060	0.15
45_Y	55_Q	1.060	0.15
106_R	224_I	1.046	0.14
211_L	275_V	1.044	0.14
65_L	204_V	1.042	0.14
161_M	251_L	1.028	0.14
15_L	204_V	1.027	0.14
185_E	335_F	1.022	0.14
345_M	353_V	1.018	0.14
130_A	227_K	1.016	0.14
130_A	170_L	1.015	0.14
86_D	300_N	1.013	0.14
273_M	313_P	1.012	0.14
134_E	261_P	1.009	0.14
276_S	279_D	1.009	0.14
59_T	268_H	1.008	0.14
64_E	356_K	1.007	0.14
57_I	125_V	1.005	0.14
336_M	342_P	1.002	0.14
142_L	213_A	1.001	0.14
28_A	76_A	1.000	0.14
135_P	158_D	0.999	0.14
138_Y	269_Y	0.997	0.14
123_E	301_G	0.996	0.14
117_F	125_V	0.996	0.14
121_P	160_T	0.995	0.14
48_T	294_L	0.994	0.14
138_Y	142_L	0.992	0.14
75_N	272_L	0.992	0.14
158_D	242_H	0.989	0.14
197_S	200_I	0.987	0.13
248_G	270_G	0.985	0.13
315_F	339_R	0.977	0.13
48_T	80_A	0.974	0.13
340_L	346_E	0.974	0.13
261_P	269_Y	0.973	0.13
16_A	138_Y	0.970	0.13
170_L	201_V	0.969	0.13
142_L	244_L	0.967	0.13
130_A	172_V	0.966	0.13
255_T	342_P	0.964	0.13
29_A	129_M	0.963	0.13
57_I	294_L	0.962	0.13
147_A	312_D	0.958	0.13
247_L	293_S	0.952	0.13
26_I	54_L	0.952	0.13
150_F	332_H	0.950	0.13
251_L	287_G	0.950	0.13
29_A	150_F	0.949	0.13
12_I	291_L	0.948	0.13
178_I	293_S	0.946	0.13
161_M	244_L	0.945	0.13
142_L	170_L	0.942	0.13
86_D	166_K	0.937	0.13
58_M	193_I	0.936	0.13
313_P	323_V	0.935	0.13
80_A	180_L	0.930	0.13
172_V	196_P	0.929	0.13
14_S	91_A	0.925	0.13
12_I	179_M	0.917	0.13
173_Y	261_P	0.917	0.13
12_I	80_A	0.915	0.13
175_G	202_R	0.912	0.12
111_G	202_R	0.910	0.12
65_L	105_L	0.904	0.12
57_I	258_Y	0.903	0.12
106_R	219_E	0.903	0.12
54_L	250_I	0.902	0.12
115_I	356_K	0.899	0.12
82_K	220_R	0.897	0.12
162_H	350_L	0.896	0.12
75_N	283_T	0.895	0.12
195_T	218_V	0.894	0.12
270_G	287_G	0.892	0.12
270_G	286_D	0.888	0.12
121_P	170_L	0.884	0.12
282_A	311_D	0.884	0.12
43_S	276_S	0.882	0.12
335_F	348_T	0.882	0.12
67_T	182_T	0.880	0.12
170_L	261_P	0.879	0.12
327_D	338_H	0.879	0.12
16_A	192_L	0.878	0.12
192_L	361_F	0.876	0.12
42_I	250_I	0.873	0.12
126_V	329_I	0.867	0.12
336_M	341_E	0.865	0.12
135_P	242_H	0.861	0.12
161_M	215_V	0.860	0.12
67_T	302_K	0.859	0.12
241_Q	246_A	0.859	0.12
25_T	80_A	0.858	0.12
138_Y	192_L	0.855	0.12
240_A	250_I	0.852	0.12
36_A	136_G	0.851	0.12
263_W	351_P	0.847	0.12
62_R	69_V	0.844	0.12
227_K	352_L	0.841	0.12
160_T	201_V	0.839	0.12
12_I	78_K	0.839	0.12
168_E	205_Y	0.837	0.12
46_Y	341_E	0.837	0.12
106_R	331_K	0.836	0.12
43_S	59_T	0.835	0.12
27_A	105_L	0.834	0.12
145_I	250_I	0.831	0.11
205_Y	364_E	0.829	0.11
14_S	195_T	0.828	0.11
220_R	313_P	0.827	0.11
64_E	115_I	0.825	0.11
206_R	212_Q	0.818	0.11
259_L	329_I	0.817	0.11
171_D	198_R	0.814	0.11
12_I	34_A	0.814	0.11
180_L	219_E	0.812	0.11
140_L	213_A	0.812	0.11
275_V	294_L	0.811	0.11
130_A	269_Y	0.811	0.11
100_S	294_L	0.807	0.11
138_Y	191_A	0.806	0.11
135_P	243_G	0.803	0.11
35_E	318_V	0.800	0.11
199_Y	305_G	0.799	0.11
143_Y	301_G	0.797	0.11
12_I	303_L	0.795	0.11
127_I	216_V	0.794	0.11
149_P	183_P	0.792	0.11
142_L	216_V	0.792	0.11
182_T	186_S	0.790	0.11
73_A	254_F	0.789	0.11
192_L	236_M	0.789	0.11
169_V	360_R	0.789	0.11
75_N	210_N	0.788	0.11
48_T	344_E	0.786	0.11
252_E	312_D	0.783	0.11
293_S	309_L	0.782	0.11
142_L	212_Q	0.773	0.11
142_L	220_R	0.769	0.11
325_I	332_H	0.768	0.11
100_S	293_S	0.768	0.11
98_S	189_L	0.766	0.11
166_K	181_N	0.763	0.11
302_K	363_K	0.762	0.11
144_K	334_P	0.760	0.11
87_L	280_A	0.760	0.11
210_N	244_L	0.758	0.11
220_R	242_H	0.757	0.11
42_I	317_E	0.755	0.11
25_T	54_L	0.751	0.11
76_A	174_E	0.750	0.11
126_V	309_L	0.750	0.11
25_T	175_G	0.750	0.11
134_E	343_Q	0.746	0.10
7_V	235_V	0.743	0.10
21_V	135_P	0.742	0.10
258_Y	296_F	0.741	0.10
28_A	105_L	0.739	0.10
152_T	335_F	0.737	0.10
322_A	359_N	0.735	0.10
197_S	353_V	0.731	0.10
253_A	358_K	0.731	0.10
195_T	253_A	0.729	0.10
193_I	338_H	0.729	0.10
118_E	213_A	0.728	0.10
74_W	301_G	0.727	0.10
130_A	213_A	0.726	0.10
211_L	361_F	0.725	0.10
251_L	288_P	0.722	0.10
138_Y	180_L	0.721	0.10
111_G	290_R	0.720	0.10
170_L	206_R	0.719	0.10
36_A	153_A	0.718	0.10
178_I	185_E	0.717	0.10
191_A	236_M	0.715	0.10
48_T	129_M	0.713	0.10
280_A	315_F	0.713	0.10
54_L	129_M	0.713	0.10
15_L	195_T	0.713	0.10
43_S	258_Y	0.712	0.10
196_P	261_P	0.710	0.10
14_S	20_V	0.708	0.10
244_L	261_P	0.707	0.10
50_V	328_Y	0.707	0.10
88_G	247_L	0.706	0.10
192_L	219_E	0.705	0.10
129_M	202_R	0.701	0.10
21_V	284_R	0.701	0.10
263_W	345_M	0.700	0.10
172_V	261_P	0.700	0.10
29_A	334_P	0.700	0.10
166_K	205_Y	0.699	0.10
146_F	238_V	0.697	0.10
309_L	312_D	0.696	0.10
14_S	282_A	0.695	0.10
49_Y	136_G	0.694	0.10
42_I	279_D	0.692	0.10
270_G	288_P	0.692	0.10
7_V	57_I	0.690	0.10
130_A	244_L	0.689	0.10
214_S	303_L	0.684	0.10
21_V	327_D	0.682	0.10
133_T	285_F	0.679	0.10
65_L	293_S	0.679	0.10
128_F	250_I	0.678	0.10
129_M	296_F	0.677	0.10
196_P	213_A	0.676	0.10
88_G	224_I	0.676	0.10
251_L	264_M	0.676	0.10
138_Y	329_I	0.675	0.10
20_V	361_F	0.675	0.10
15_L	138_Y	0.674	0.10
312_D	339_R	0.669	0.10
48_T	277_Q	0.667	0.10
166_K	207_K	0.663	0.10
206_R	218_V	0.663	0.10
284_R	339_R	0.661	0.10
106_R	317_E	0.661	0.10
353_V	360_R	0.661	0.10
3_T	43_S	0.660	0.10
111_G	295_G	0.659	0.10
191_A	216_V	0.658	0.10
91_A	211_L	0.657	0.10
55_Q	193_I	0.655	0.10
194_G	339_R	0.655	0.10
250_I	300_N	0.654	0.09
290_R	335_F	0.653	0.09
16_A	219_E	0.653	0.09
201_V	236_M	0.651	0.09
57_I	277_Q	0.650	0.09
87_L	304_V	0.649	0.09
161_M	205_Y	0.649	0.09
153_A	219_E	0.647	0.09
196_P	269_Y	0.646	0.09
214_S	255_T	0.642	0.09
22_H	321_T	0.639	0.09
261_P	307_T	0.639	0.09
105_L	182_T	0.639	0.09
192_L	323_V	0.637	0.09
33_L	56_L	0.636	0.09
23_P	29_A	0.635	0.09
55_Q	150_F	0.635	0.09
220_R	244_L	0.634	0.09
112_I	129_M	0.634	0.09
21_V	252_E	0.633	0.09
134_E	242_H	0.632	0.09
170_L	244_L	0.632	0.09
156_V	214_S	0.631	0.09
101_F	285_F	0.630	0.09
210_N	273_M	0.626	0.09
75_N	78_K	0.626	0.09
61_N	331_K	0.625	0.09
177_S	299_K	0.622	0.09
100_S	283_T	0.618	0.09
185_E	348_T	0.618	0.09
106_R	166_K	0.614	0.09
180_L	216_V	0.612	0.09
50_V	55_Q	0.611	0.09
170_L	213_A	0.610	0.09
65_L	179_M	0.610	0.09
203_R	236_M	0.608	0.09
20_V	307_T	0.605	0.09
177_S	180_L	0.605	0.09
50_V	134_E	0.603	0.09
76_A	180_L	0.602	0.09
46_Y	329_I	0.601	0.09
77_F	103_G	0.598	0.09
196_P	212_Q	0.598	0.09
15_L	192_L	0.597	0.09
238_V	275_V	0.597	0.09
14_S	87_L	0.590	0.09
224_I	246_A	0.590	0.09
21_V	292_I	0.589	0.09
129_M	345_M	0.589	0.09
227_K	307_T	0.589	0.09
39_N	293_S	0.587	0.09
311_D	317_E	0.585	0.09
124_P	288_P	0.585	0.09
85_K	146_F	0.584	0.09
76_A	215_V	0.583	0.09
36_A	296_F	0.582	0.09
24_D	62_R	0.581	0.09
150_F	190_L	0.579	0.09
14_S	108_M	0.578	0.09
222_N	258_Y	0.578	0.09
29_A	125_V	0.574	0.09
336_M	339_R	0.574	0.09
22_H	157_I	0.574	0.09
318_V	325_I	0.574	0.09
135_P	261_P	0.574	0.09
19_H	54_L	0.573	0.09
190_L	194_G	0.570	0.09
170_L	196_P	0.570	0.09
24_D	123_E	0.570	0.09
176_E	220_R	0.569	0.09
79_E	206_R	0.568	0.09
46_Y	294_L	0.568	0.09
20_V	191_A	0.565	0.09
160_T	186_S	0.565	0.09
80_A	240_A	0.565	0.09
25_T	211_L	0.564	0.09
314_A	338_H	0.564	0.09
90_Y	294_L	0.564	0.09
190_L	339_R	0.562	0.09
206_R	261_P	0.561	0.09
199_Y	359_N	0.558	0.09
165_Y	183_P	0.557	0.09
3_T	20_V	0.556	0.09
173_Y	353_V	0.554	0.09
8_I	11_D	0.553	0.09
187_Y	285_F	0.552	0.09
178_I	258_Y	0.552	0.09
180_L	342_P	0.551	0.08
42_I	79_E	0.551	0.08
75_N	354_I	0.549	0.08
41_I	163_E	0.549	0.08
6_S	320_R	0.548	0.08
26_I	34_A	0.544	0.08
253_A	282_A	0.544	0.08
339_R	345_M	0.543	0.08
87_L	284_R	0.540	0.08
16_A	307_T	0.540	0.08
15_L	19_H	0.540	0.08
295_G	322_A	0.539	0.08
251_L	286_D	0.537	0.08
69_V	251_L	0.537	0.08
227_K	302_K	0.536	0.08
124_P	286_D	0.536	0.08
220_R	278_K	0.536	0.08
163_E	189_L	0.533	0.08
47_I	215_V	0.533	0.08
185_E	304_V	0.531	0.08
76_A	138_Y	0.529	0.08
207_K	328_Y	0.528	0.08
199_Y	321_T	0.527	0.08
158_D	328_Y	0.527	0.08
29_A	55_Q	0.526	0.08
15_L	46_Y	0.526	0.08
152_T	290_R	0.525	0.08
83_I	318_V	0.525	0.08
151_N	204_V	0.525	0.08
157_I	325_I	0.524	0.08
159_P	178_I	0.524	0.08
78_K	331_K	0.524	0.08
5_L	38_R	0.520	0.08
160_T	250_I	0.519	0.08
136_G	291_L	0.518	0.08
185_E	215_V	0.518	0.08
14_S	25_T	0.517	0.08
75_N	300_N	0.516	0.08
15_L	216_V	0.516	0.08
159_P	219_E	0.515	0.08
312_D	315_F	0.515	0.08
83_I	302_K	0.513	0.08
46_Y	191_A	0.513	0.08
128_F	235_V	0.513	0.08
175_G	311_D	0.512	0.08
125_V	201_V	0.512	0.08
3_T	85_K	0.512	0.08
69_V	291_L	0.510	0.08
27_A	91_A	0.510	0.08
21_V	314_A	0.510	0.08
13_G	17_G	0.509	0.08
73_A	139_N	0.509	0.08
30_N	283_T	0.508	0.08
91_A	336_M	0.508	0.08
305_G	335_F	0.508	0.08
84_A	316_D	0.506	0.08
157_I	348_T	0.503	0.08
79_E	189_L	0.503	0.08
124_P	229_V	0.503	0.08
210_N	216_V	0.502	0.08
159_P	350_L	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3r1mA	5	0.9293	100	0.027	Contact Map
3t2cA	5	0.9738	100	0.044	Contact Map
1nm8A	1	0.2042	36	0.984	Contact Map
2j5cA	1	0.0628	33.3	0.984	Contact Map
4earA	3	0.1545	11.6	0.987	Contact Map
3wd8A	2	0.2827	11.1	0.987	Contact Map
3ozfA	4	0.2827	10.9	0.987	Contact Map
4h7oA	6	0.1806	8.7	0.988	Contact Map
2vofA	1	0.1859	8.2	0.988	Contact Map
3ls0A	1	0.2513	8.2	0.988	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.011 seconds.