Q980C5 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q980C5 - tRNA(Met) cytidine acetyltransferase TmcA

UniProt:	Q980C5	Sequences: MIPGSNPGGRIHNVIEMFENYFMDAVKGYYRHLAIIESQDPLEKINSLIDDYLKVNKKPRVIYGFHPWLDNSKDRMKELKKRFENFLDIDYSNSEKYLGQSADLVILDAMDDFRPNYIARFVDMTKGGGIAIIYSDNILEGKLYKKSLTRYGVVKDLFEARFIELAKRYRGIIFFQGNDRITFTPYSSNETHKPYKKIPKSPKVSMELHELCLSSDQNKVLEESLFIMNLGKRVLVITAARGRGKSASIGLFLSYLMSEGNFGSIIVTSPTYYSSQEIFKFIIRGLEALNVKYKVITSRDGKIMKISTRDSRVKWVSPDLAKNEEGDLIVIDEAAAMGIEFLDYIVRSWDKVILVTTIHGYEGSGKAFLKYVDKLKGKVLLKNIKMDYPIRYAKGDPIEKFLFDVFLLDAEPHEVEYNGKLKIVEVPQEELFRDDDLLKSVYGILVTAHYRNSPDDLMLLGDMAFQKVIVGYSSENPVAVCQVVYEGGLTDKQIWDISNGLKNEGHLIPHRLIKYMRALDFGKLKGWRIMRIAVSPENQGKGIGSRVIEEVIKMAKGVDWIGSSFVADYSVLRFWIKNGFLPVYLSSIKNEELNGYSVIVIKALSERTKEFVVKLSSLLKDKLLRTSHQVYYNLNPQLIVLLLRNTYSERIEGEVPDLYVDKIKAYTEGKVPYNVIAEAAHFLVTKHFLELKADLSIEAEASLVARVLQGKSWYHAGLMLGLSSREVEDNVKQSLGVLLETYT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	743 (629)
Sequences:	695 (484)
Seq/√Len:	19.3

ECOLI - TMCA
HALSA - Q9HQH9
SULSO - Q980C5 Q97U12

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
563_S	600_V	8.296	1.00
552_I	602_K	7.868	1.00
221_L	248_S	7.482	1.00
471_G	543_I	6.887	1.00
479_A	534_V	6.460	1.00
508_I	562_G	5.893	1.00
548_I	578_N	5.276	1.00
548_I	580_F	4.807	1.00
545_S	578_N	4.698	1.00
529_I	548_I	4.496	1.00
113_F	118_I	4.249	1.00
583_V	601_I	3.971	1.00
267_V	278_I	3.745	1.00
157_L	429_E	3.723	1.00
566_V	571_V	3.624	1.00
103_D	126_K	3.416	1.00
526_G	560_W	3.336	1.00
425_E	467_K	3.273	1.00
552_I	580_F	3.161	0.99
253_L	330_V	3.138	0.99
485_Y	527_W	3.119	0.99
508_I	599_I	3.042	0.99
623_L	642_L	2.949	0.99
275_S	278_I	2.873	0.99
705_A	716_A	2.865	0.99
566_V	595_G	2.862	0.99
220_V	237_I	2.854	0.99
270_P	336_A	2.837	0.99
536_P	539_Q	2.795	0.99
481_C	547_V	2.721	0.98
366_K	566_V	2.717	0.98
627_S	639_I	2.697	0.98
329_I	349_W	2.693	0.98
282_I	313_V	2.660	0.98
230_L	233_R	2.650	0.98
441_V	477_P	2.643	0.98
724_S	732_K	2.633	0.98
481_C	551_V	2.574	0.97
141_G	146_K	2.567	0.97
507_L	564_S	2.564	0.97
212_C	221_L	2.563	0.97
582_P	598_V	2.534	0.97
331_I	354_L	2.527	0.97
247_A	281_F	2.486	0.97
618_L	662_K	2.434	0.96
441_V	468_V	2.390	0.96
424_V	472_Y	2.328	0.95
445_L	480_V	2.250	0.94
116_N	455_D	2.230	0.94
354_L	371_Y	2.190	0.94
712_S	727_V	2.141	0.93
711_K	719_M	2.107	0.92
410_A	443_G	2.098	0.92
441_V	480_V	2.096	0.92
251_L	285_G	2.076	0.92
161_R	435_D	2.069	0.91
703_L	727_V	2.067	0.91
512_L	583_V	2.054	0.91
511_R	599_I	2.041	0.91
518_A	615_L	2.040	0.91
101_S	127_G	2.034	0.91
723_S	726_E	2.032	0.91
441_V	460_L	2.019	0.90
502_K	586_S	1.998	0.90
432_F	461_G	1.998	0.90
511_R	584_Y	1.993	0.90
673_Y	713_W	1.972	0.89
527_W	558_V	1.970	0.89
471_G	479_A	1.951	0.89
526_G	562_G	1.950	0.89
329_I	345_I	1.941	0.89
223_E	382_K	1.932	0.88
253_L	278_I	1.932	0.88
409_D	439_K	1.931	0.88
342_L	371_Y	1.922	0.88
283_I	306_I	1.877	0.87
221_L	251_L	1.869	0.87
119_A	406_F	1.865	0.86
705_A	711_K	1.844	0.86
705_A	719_M	1.837	0.86
581_L	616_S	1.825	0.85
229_N	233_R	1.817	0.85
706_R	713_W	1.816	0.85
224_S	235_L	1.816	0.85
559_D	605_S	1.809	0.85
421_L	543_I	1.802	0.84
113_F	440_S	1.799	0.84
716_A	727_V	1.774	0.84
247_A	277_E	1.768	0.83
717_G	724_S	1.767	0.83
221_L	689_L	1.756	0.83
479_A	547_V	1.739	0.82
237_I	585_L	1.722	0.82
386_M	556_K	1.718	0.81
267_V	535_S	1.711	0.81
107_L	127_G	1.703	0.81
496_D	501_L	1.692	0.80
596_Y	631_Y	1.666	0.79
366_K	571_V	1.655	0.79
446_V	582_P	1.647	0.79
237_I	384_I	1.639	0.78
466_Q	482_Q	1.623	0.78
388_Y	394_K	1.605	0.77
235_L	328_L	1.601	0.77
449_H	531_R	1.600	0.76
565_F	665_A	1.595	0.76
236_V	372_V	1.590	0.76
545_S	548_I	1.566	0.75
93_N	274_S	1.564	0.75
356_T	368_F	1.557	0.74
408_L	572_L	1.557	0.74
639_I	704_V	1.554	0.74
656_P	735_L	1.551	0.74
477_P	645_N	1.529	0.73
451_R	592_E	1.526	0.73
94_S	120_R	1.522	0.73
389_P	616_S	1.505	0.72
136_D	367_A	1.494	0.71
366_K	371_Y	1.473	0.70
118_I	402_L	1.472	0.70
125_T	131_A	1.454	0.69
376_K	381_L	1.450	0.69
621_D	659_Y	1.448	0.69
249_I	355_V	1.442	0.69
339_I	371_Y	1.437	0.68
269_S	315_W	1.418	0.67
136_D	141_G	1.414	0.67
330_V	460_L	1.401	0.66
662_K	666_Y	1.395	0.66
478_V	543_I	1.392	0.66
619_L	623_L	1.388	0.65
723_S	729_D	1.388	0.65
444_I	539_Q	1.384	0.65
469_I	554_M	1.380	0.65
268_T	271_T	1.372	0.65
407_L	596_Y	1.371	0.64
508_I	526_G	1.368	0.64
141_G	148_L	1.367	0.64
464_A	542_G	1.367	0.64
132_I	384_I	1.365	0.64
605_S	608_T	1.361	0.64
249_I	265_I	1.359	0.64
552_I	561_I	1.356	0.64
586_S	590_N	1.349	0.63
170_R	553_K	1.347	0.63
329_I	352_V	1.346	0.63
502_K	716_A	1.335	0.62
236_V	269_S	1.331	0.62
426_V	470_V	1.331	0.62
546_R	550_E	1.327	0.62
356_T	739_L	1.324	0.62
393_A	397_P	1.314	0.61
489_L	600_V	1.314	0.61
110_M	134_Y	1.303	0.60
337_M	703_L	1.302	0.60
451_R	590_N	1.301	0.60
123_D	452_N	1.292	0.60
237_I	355_V	1.289	0.60
540_G	570_S	1.287	0.59
252_F	328_L	1.283	0.59
437_L	472_Y	1.276	0.59
113_F	463_M	1.276	0.59
713_W	728_E	1.259	0.58
440_S	476_N	1.252	0.57
367_A	371_Y	1.243	0.57
270_P	337_M	1.230	0.56
579_G	721_G	1.226	0.56
161_R	562_G	1.222	0.55
331_I	388_Y	1.220	0.55
114_R	455_D	1.219	0.55
535_S	539_Q	1.219	0.55
269_S	358_I	1.218	0.55
683_L	738_L	1.216	0.55
130_I	150_R	1.209	0.55
216_D	387_D	1.209	0.55
105_V	227_I	1.207	0.54
435_D	562_G	1.207	0.54
445_L	592_E	1.206	0.54
320_L	324_E	1.204	0.54
130_I	502_K	1.203	0.54
714_Y	724_S	1.198	0.54
487_G	509_P	1.196	0.54
490_T	493_Q	1.196	0.54
567_A	572_L	1.195	0.54
463_M	524_L	1.193	0.54
108_D	451_R	1.191	0.53
673_Y	706_R	1.191	0.53
254_S	538_N	1.189	0.53
237_I	440_S	1.186	0.53
539_Q	544_G	1.184	0.53
122_V	402_L	1.182	0.53
227_I	235_L	1.182	0.53
319_D	331_I	1.179	0.53
324_E	349_W	1.178	0.53
444_I	507_L	1.178	0.53
234_V	381_L	1.175	0.52
224_S	237_I	1.161	0.52
224_S	233_R	1.160	0.51
276_Q	479_A	1.158	0.51
237_I	468_V	1.156	0.51
489_L	522_G	1.153	0.51
376_K	383_N	1.152	0.51
559_D	670_K	1.152	0.51
319_D	673_Y	1.150	0.51
315_W	442_Y	1.150	0.51
233_R	351_K	1.148	0.51
266_I	349_W	1.146	0.51
121_F	124_M	1.144	0.50
283_I	287_E	1.139	0.50
362_E	391_R	1.138	0.50
352_V	579_G	1.131	0.50
131_A	398_I	1.130	0.50
484_V	530_M	1.128	0.49
517_R	586_S	1.123	0.49
346_V	352_V	1.123	0.49
390_I	446_V	1.123	0.49
400_K	404_D	1.116	0.49
221_L	330_V	1.110	0.48
267_V	279_F	1.110	0.48
324_E	329_I	1.109	0.48
529_I	604_L	1.108	0.48
89_I	264_S	1.106	0.48
585_L	675_V	1.105	0.48
436_D	606_E	1.103	0.48
604_L	656_P	1.099	0.48
515_Y	555_A	1.097	0.47
584_Y	590_N	1.094	0.47
289_L	318_P	1.089	0.47
253_L	354_L	1.088	0.47
427_P	430_E	1.083	0.47
362_E	449_H	1.077	0.46
391_R	449_H	1.077	0.46
105_V	355_V	1.075	0.46
342_L	593_L	1.074	0.46
118_I	352_V	1.072	0.46
431_L	435_D	1.070	0.46
135_S	146_K	1.070	0.46
317_S	389_P	1.067	0.46
125_T	274_S	1.062	0.45
460_L	468_V	1.058	0.45
329_I	603_A	1.058	0.45
106_I	497_I	1.054	0.45
342_L	367_A	1.050	0.44
362_E	531_R	1.050	0.44
391_R	531_R	1.050	0.44
340_E	364_S	1.049	0.44
666_Y	671_V	1.048	0.44
412_P	653_G	1.048	0.44
497_I	503_N	1.043	0.44
452_N	482_Q	1.042	0.44
127_G	401_F	1.039	0.44
337_M	364_S	1.038	0.44
275_S	355_V	1.036	0.44
363_G	391_R	1.036	0.44
113_F	247_A	1.028	0.43
265_I	676_I	1.022	0.43
91_Y	127_G	1.022	0.43
395_G	529_I	1.021	0.43
287_E	293_Y	1.020	0.43
522_G	559_D	1.020	0.43
498_S	560_W	1.018	0.42
529_I	578_N	1.017	0.42
123_D	482_Q	1.017	0.42
547_V	551_V	1.010	0.42
257_M	488_G	1.010	0.42
696_S	699_A	1.010	0.42
254_S	286_L	1.007	0.42
224_S	353_I	1.005	0.42
275_S	568_D	1.005	0.42
511_R	515_Y	1.004	0.42
103_D	129_G	1.002	0.41
389_P	646_T	0.999	0.41
227_I	230_L	0.995	0.41
92_S	636_P	0.995	0.41
269_S	541_K	0.994	0.41
446_V	631_Y	0.991	0.41
459_L	471_G	0.987	0.41
159_E	238_T	0.986	0.41
510_H	586_S	0.986	0.41
266_I	316_V	0.983	0.40
447_T	472_Y	0.983	0.40
665_A	671_V	0.978	0.40
212_C	389_P	0.974	0.40
570_S	634_L	0.974	0.40
480_V	597_S	0.973	0.40
226_F	716_A	0.972	0.40
231_G	234_V	0.972	0.40
99_G	362_E	0.971	0.40
99_G	391_R	0.971	0.40
224_S	230_L	0.971	0.40
363_G	449_H	0.970	0.40
722_L	727_V	0.969	0.39
251_L	441_V	0.968	0.39
123_D	367_A	0.966	0.39
571_V	595_G	0.962	0.39
665_A	675_V	0.960	0.39
451_R	482_Q	0.960	0.39
126_K	356_T	0.958	0.39
493_Q	497_I	0.957	0.39
592_E	600_V	0.957	0.39
426_V	441_V	0.952	0.38
545_S	658_L	0.951	0.38
116_N	453_S	0.950	0.38
479_A	685_T	0.948	0.38
363_G	531_R	0.944	0.38
364_S	587_S	0.944	0.38
382_K	426_V	0.942	0.38
135_S	141_G	0.940	0.38
132_I	330_V	0.937	0.38
106_I	723_S	0.937	0.38
134_Y	544_G	0.934	0.37
734_S	738_L	0.933	0.37
235_L	398_I	0.932	0.37
636_P	719_M	0.932	0.37
511_R	586_S	0.931	0.37
606_E	610_E	0.930	0.37
538_N	541_K	0.924	0.37
346_V	405_V	0.923	0.37
397_P	559_D	0.923	0.37
509_P	530_M	0.922	0.37
125_T	674_N	0.921	0.37
705_A	720_L	0.918	0.36
328_L	353_I	0.918	0.36
84_E	580_F	0.916	0.36
367_A	593_L	0.915	0.36
507_L	586_S	0.914	0.36
307_S	314_K	0.913	0.36
460_L	513_I	0.913	0.36
165_L	437_L	0.912	0.36
253_L	315_W	0.912	0.36
132_I	548_I	0.910	0.36
394_K	606_E	0.909	0.36
483_V	527_W	0.909	0.36
133_I	496_D	0.907	0.36
257_M	311_S	0.907	0.36
99_G	449_H	0.905	0.36
224_S	227_I	0.905	0.36
237_I	593_L	0.904	0.36
392_Y	586_S	0.900	0.35
255_Y	356_T	0.895	0.35
329_I	507_L	0.895	0.35
396_D	438_L	0.894	0.35
134_Y	571_V	0.892	0.35
280_K	284_R	0.889	0.35
464_A	619_L	0.888	0.35
586_S	591_E	0.887	0.35
462_D	562_G	0.886	0.35
279_F	443_G	0.884	0.34
254_S	285_G	0.884	0.34
714_Y	727_V	0.883	0.34
183_F	555_A	0.882	0.34
145_K	148_L	0.880	0.34
161_R	462_D	0.879	0.34
99_G	531_R	0.878	0.34
130_I	572_L	0.878	0.34
463_M	601_I	0.876	0.34
443_G	558_V	0.874	0.34
425_E	469_I	0.873	0.34
502_K	507_L	0.871	0.34
687_H	691_L	0.871	0.34
260_G	583_V	0.869	0.34
345_I	403_F	0.869	0.34
184_T	529_I	0.869	0.34
663_I	696_S	0.869	0.34
571_V	619_L	0.867	0.33
418_N	421_L	0.866	0.33
132_I	321_A	0.865	0.33
395_G	400_K	0.863	0.33
194_P	644_R	0.862	0.33
279_F	346_V	0.861	0.33
99_G	363_G	0.861	0.33
520_D	541_K	0.860	0.33
265_I	727_V	0.859	0.33
126_K	378_K	0.858	0.33
260_G	393_A	0.858	0.33
392_Y	452_N	0.857	0.33
229_N	234_V	0.857	0.33
364_S	631_Y	0.857	0.33
173_I	633_N	0.856	0.33
545_S	577_K	0.855	0.33
210_E	389_P	0.852	0.33
190_E	194_P	0.851	0.33
580_F	705_A	0.849	0.32
146_K	458_M	0.849	0.32
337_M	604_L	0.848	0.32
240_A	359_H	0.847	0.32
366_K	390_I	0.847	0.32
662_K	678_E	0.847	0.32
344_Y	738_L	0.847	0.32
282_I	306_I	0.841	0.32
424_V	504_E	0.839	0.32
276_Q	715_H	0.838	0.32
513_I	566_V	0.838	0.32
368_F	371_Y	0.836	0.32
345_I	349_W	0.836	0.32
666_Y	676_I	0.836	0.32
97_Y	325_E	0.836	0.32
539_Q	665_A	0.835	0.32
120_R	339_I	0.832	0.31
702_S	720_L	0.832	0.31
125_T	193_K	0.832	0.31
313_V	628_H	0.829	0.31
408_L	634_L	0.827	0.31
515_Y	584_Y	0.824	0.31
265_I	337_M	0.823	0.31
115_P	401_F	0.820	0.31
344_Y	491_D	0.819	0.31
407_L	527_W	0.819	0.31
141_G	147_S	0.818	0.31
707_V	731_V	0.817	0.31
663_I	734_S	0.816	0.31
346_V	539_Q	0.815	0.31
117_Y	343_D	0.815	0.31
234_V	506_H	0.814	0.31
392_Y	595_G	0.813	0.30
101_S	120_R	0.812	0.30
190_E	606_E	0.811	0.30
397_P	408_L	0.809	0.30
699_A	733_Q	0.808	0.30
276_Q	538_N	0.806	0.30
235_L	544_G	0.806	0.30
369_L	672_P	0.806	0.30
494_I	573_R	0.804	0.30
517_R	618_L	0.804	0.30
241_R	450_Y	0.803	0.30
241_R	528_R	0.803	0.30
450_Y	528_R	0.803	0.30
166_A	663_I	0.803	0.30
354_L	565_F	0.801	0.30
224_S	283_I	0.800	0.30
492_K	581_L	0.798	0.30
161_R	165_L	0.796	0.30
106_I	734_S	0.796	0.30
451_R	584_Y	0.795	0.29
95_E	364_S	0.795	0.29
442_Y	593_L	0.793	0.29
406_F	506_H	0.792	0.29
144_Y	147_S	0.792	0.29
577_K	632_Y	0.792	0.29
127_G	318_P	0.791	0.29
467_K	485_Y	0.790	0.29
573_R	577_K	0.790	0.29
151_Y	592_E	0.789	0.29
113_F	387_D	0.787	0.29
194_P	343_D	0.787	0.29
503_N	584_Y	0.784	0.29
127_G	482_Q	0.779	0.29
324_E	585_L	0.777	0.29
140_E	179_D	0.776	0.28
515_Y	588_I	0.776	0.28
483_V	580_F	0.773	0.28
343_D	374_K	0.772	0.28
161_R	356_T	0.771	0.28
431_L	460_L	0.770	0.28
494_I	519_L	0.770	0.28
667_T	736_G	0.769	0.28
100_Q	271_T	0.767	0.28
476_N	532_I	0.765	0.28
400_K	731_V	0.765	0.28
373_D	377_G	0.764	0.28
514_K	527_W	0.762	0.28
92_S	710_G	0.762	0.28
662_K	671_V	0.759	0.28
387_D	605_S	0.758	0.28
418_N	543_I	0.757	0.28
113_F	170_R	0.757	0.28
218_N	386_M	0.756	0.27
561_I	604_L	0.755	0.27
346_V	556_K	0.755	0.27
187_S	331_I	0.753	0.27
215_S	413_H	0.753	0.27
115_P	530_M	0.752	0.27
719_M	739_L	0.752	0.27
133_I	162_F	0.751	0.27
430_E	437_L	0.751	0.27
630_V	738_L	0.751	0.27
468_V	567_A	0.750	0.27
249_I	253_L	0.749	0.27
585_L	676_I	0.748	0.27
598_V	679_A	0.747	0.27
490_T	690_E	0.746	0.27
717_G	721_G	0.746	0.27
725_R	732_K	0.745	0.27
182_T	529_I	0.745	0.27
387_D	394_K	0.745	0.27
94_S	117_Y	0.744	0.27
471_G	478_V	0.743	0.27
162_F	219_K	0.743	0.27
344_Y	476_N	0.742	0.27
495_W	519_L	0.742	0.27
181_I	532_I	0.741	0.27
183_F	577_K	0.739	0.27
355_V	459_L	0.739	0.27
354_L	461_G	0.738	0.27
585_L	642_L	0.738	0.27
459_L	463_M	0.736	0.26
397_P	549_E	0.736	0.26
609_K	656_P	0.735	0.26
557_G	604_L	0.734	0.26
346_V	589_K	0.732	0.26
488_G	725_R	0.731	0.26
171_G	397_P	0.731	0.26
158_F	463_M	0.730	0.26
561_I	565_F	0.730	0.26
380_L	552_I	0.729	0.26
619_L	643_L	0.729	0.26
112_D	586_S	0.729	0.26
340_E	409_D	0.727	0.26
375_L	442_Y	0.726	0.26
431_L	468_V	0.726	0.26
553_K	589_K	0.726	0.26
401_F	405_V	0.725	0.26
95_E	511_R	0.724	0.26
270_P	515_Y	0.724	0.26
456_D	487_G	0.723	0.26
448_A	684_V	0.722	0.26
237_I	658_L	0.721	0.26
712_S	715_H	0.721	0.26
274_S	313_V	0.721	0.26
238_T	358_I	0.721	0.26
534_V	710_G	0.720	0.26
563_S	642_L	0.720	0.26
123_D	461_G	0.719	0.26
241_R	361_Y	0.719	0.26
361_Y	450_Y	0.719	0.26
361_Y	528_R	0.719	0.26
488_G	513_I	0.719	0.26
328_L	627_S	0.718	0.26
341_F	345_I	0.718	0.26
105_V	127_G	0.718	0.26
157_L	428_Q	0.718	0.26
234_V	252_F	0.717	0.26
492_K	588_I	0.717	0.26
359_H	403_F	0.717	0.26
336_A	522_G	0.713	0.25
115_P	129_G	0.712	0.25
260_G	611_F	0.712	0.25
327_D	409_D	0.711	0.25
270_P	521_F	0.711	0.25
422_K	704_V	0.711	0.25
268_T	331_I	0.709	0.25
162_F	695_L	0.709	0.25
135_S	148_L	0.709	0.25
375_L	444_I	0.704	0.25
509_P	526_G	0.701	0.25
266_I	581_L	0.701	0.25
364_S	601_I	0.699	0.25
454_P	594_N	0.698	0.25
540_G	578_N	0.697	0.25
442_Y	451_R	0.697	0.25
502_K	510_H	0.697	0.25
110_M	115_P	0.696	0.25
451_R	526_G	0.695	0.24
115_P	318_P	0.695	0.24
313_V	330_V	0.694	0.24
511_R	514_K	0.693	0.24
282_I	286_L	0.692	0.24
565_F	638_L	0.691	0.24
385_K	652_E	0.690	0.24
315_W	318_P	0.690	0.24
241_R	362_E	0.690	0.24
241_R	391_R	0.690	0.24
362_E	450_Y	0.690	0.24
362_E	528_R	0.690	0.24
391_R	450_Y	0.690	0.24
391_R	528_R	0.690	0.24
720_L	734_S	0.689	0.24
479_A	543_I	0.688	0.24
119_A	443_G	0.687	0.24
356_T	435_D	0.685	0.24
129_G	249_I	0.685	0.24
249_I	353_I	0.685	0.24
438_L	443_G	0.685	0.24
451_R	469_I	0.685	0.24
249_I	506_H	0.684	0.24
276_Q	379_V	0.684	0.24
498_S	519_L	0.683	0.24
273_Y	383_N	0.682	0.24
235_L	480_V	0.681	0.24
286_L	551_V	0.681	0.24
642_L	697_I	0.680	0.24
148_L	584_Y	0.679	0.24
616_S	646_T	0.679	0.24
377_G	419_G	0.678	0.24
117_Y	269_S	0.677	0.24
470_V	477_P	0.676	0.24
314_K	529_I	0.675	0.24
655_V	683_L	0.674	0.24
127_G	290_N	0.673	0.23
237_I	246_S	0.673	0.23
516_M	521_F	0.672	0.23
122_V	131_A	0.672	0.23
132_I	655_V	0.671	0.23
589_K	641_L	0.671	0.23
263_G	327_D	0.671	0.23
622_K	678_E	0.671	0.23
463_M	566_V	0.671	0.23
373_D	453_S	0.670	0.23
216_D	385_K	0.669	0.23
100_Q	588_I	0.668	0.23
274_S	356_T	0.668	0.23
336_A	584_Y	0.665	0.23
339_I	597_S	0.664	0.23
410_A	435_D	0.664	0.23
501_L	597_S	0.664	0.23
660_V	739_L	0.664	0.23
175_F	729_D	0.664	0.23
253_L	282_I	0.664	0.23
449_H	505_G	0.663	0.23
286_L	460_L	0.661	0.23
180_R	389_P	0.660	0.23
478_V	604_L	0.660	0.23
522_G	551_V	0.658	0.23
416_E	421_L	0.658	0.23
711_K	720_L	0.657	0.23
270_P	454_P	0.657	0.23
431_L	434_D	0.656	0.23
112_D	458_M	0.656	0.23
241_R	531_R	0.655	0.23
450_Y	531_R	0.655	0.23
528_R	531_R	0.655	0.23
352_V	356_T	0.655	0.23
642_L	658_L	0.654	0.23
580_F	665_A	0.652	0.23
233_R	382_K	0.652	0.23
565_F	658_L	0.652	0.23
423_I	469_I	0.651	0.22
431_L	522_G	0.650	0.22
460_L	668_E	0.650	0.22
178_N	183_F	0.650	0.22
588_I	716_A	0.650	0.22
356_T	710_G	0.648	0.22
243_R	399_E	0.647	0.22
219_K	545_S	0.647	0.22
603_A	635_N	0.647	0.22
426_V	437_L	0.646	0.22
472_Y	490_T	0.645	0.22
115_P	720_L	0.645	0.22
495_W	520_D	0.644	0.22
590_N	595_G	0.644	0.22
721_G	733_Q	0.643	0.22
465_F	484_V	0.643	0.22
362_E	456_D	0.643	0.22
391_R	456_D	0.643	0.22
92_S	620_K	0.643	0.22
693_A	738_L	0.642	0.22
340_E	345_I	0.642	0.22
104_L	309_R	0.641	0.22
123_D	403_F	0.641	0.22
241_R	449_H	0.641	0.22
449_H	528_R	0.641	0.22
656_P	680_A	0.639	0.22
494_I	584_Y	0.638	0.22
734_S	739_L	0.638	0.22
393_A	712_S	0.638	0.22
398_I	682_F	0.637	0.22
695_L	700_E	0.637	0.22
527_W	555_A	0.637	0.22
119_A	659_Y	0.636	0.22
112_D	148_L	0.635	0.22
555_A	561_I	0.635	0.22
154_V	585_L	0.634	0.22
101_S	398_I	0.634	0.22
505_G	531_R	0.633	0.22
491_D	523_K	0.633	0.22
138_I	163_I	0.632	0.22
498_S	565_F	0.631	0.22
175_F	635_N	0.630	0.22
257_M	459_L	0.630	0.22
110_M	435_D	0.630	0.22
291_V	313_V	0.629	0.22
251_L	314_K	0.628	0.21
232_K	642_L	0.625	0.21
509_P	592_E	0.624	0.21
162_F	381_L	0.624	0.21
613_V	712_S	0.624	0.21
315_W	484_V	0.623	0.21
116_N	508_I	0.623	0.21
412_P	439_K	0.622	0.21
413_H	535_S	0.622	0.21
344_Y	655_V	0.621	0.21
113_F	393_A	0.620	0.21
423_I	471_G	0.620	0.21
266_I	327_D	0.620	0.21
537_E	546_R	0.619	0.21
240_A	403_F	0.619	0.21
330_V	394_K	0.618	0.21
118_I	612_V	0.616	0.21
147_S	150_R	0.614	0.21
583_V	608_T	0.612	0.21
254_S	271_T	0.610	0.21
553_K	557_G	0.608	0.21
287_E	478_V	0.608	0.21
489_L	509_P	0.607	0.21
180_R	306_I	0.607	0.21
230_L	234_V	0.607	0.21
248_S	252_F	0.607	0.21
385_K	589_K	0.606	0.21
490_T	633_N	0.605	0.20
549_E	632_Y	0.603	0.20
290_N	512_L	0.602	0.20
414_E	556_K	0.601	0.20
109_A	355_V	0.601	0.20
361_Y	391_R	0.601	0.20
604_L	673_Y	0.600	0.20
406_F	423_I	0.600	0.20
369_L	372_V	0.599	0.20
150_R	457_L	0.599	0.20
343_D	676_I	0.598	0.20
445_L	448_A	0.598	0.20
337_M	447_T	0.593	0.20
349_W	673_Y	0.593	0.20
496_D	565_F	0.592	0.20
510_H	516_M	0.591	0.20
256_L	709_Q	0.591	0.20
135_S	406_F	0.591	0.20
635_N	712_S	0.591	0.20
735_L	739_L	0.590	0.20
236_V	253_L	0.589	0.20
389_P	721_G	0.589	0.20
623_L	631_Y	0.589	0.20
405_V	481_C	0.589	0.20
84_E	267_V	0.589	0.20
140_E	583_V	0.589	0.20
115_P	138_I	0.589	0.20
351_K	366_K	0.587	0.20
402_L	520_D	0.587	0.20
508_I	538_N	0.587	0.20
421_L	471_G	0.587	0.20
354_L	397_P	0.586	0.20
218_N	561_I	0.586	0.20
605_S	704_V	0.586	0.20
234_V	461_G	0.586	0.20
603_A	612_V	0.585	0.20
514_K	517_R	0.585	0.20
695_L	699_A	0.584	0.20
271_T	558_V	0.584	0.20
330_V	501_L	0.583	0.20
585_L	598_V	0.583	0.20
241_R	363_G	0.582	0.20
363_G	450_Y	0.582	0.20
363_G	528_R	0.582	0.20
614_K	640_V	0.581	0.20
407_L	529_I	0.581	0.20
326_G	529_I	0.581	0.20
304_M	329_I	0.579	0.19
116_N	366_K	0.579	0.19
337_M	453_S	0.579	0.19
260_G	405_V	0.579	0.19
115_P	435_D	0.578	0.19
565_F	634_L	0.578	0.19
97_Y	124_M	0.577	0.19
545_S	549_E	0.577	0.19
488_G	520_D	0.576	0.19
449_H	456_D	0.576	0.19
453_S	560_W	0.576	0.19
136_D	645_N	0.575	0.19
494_I	497_I	0.575	0.19
321_A	358_I	0.575	0.19
87_L	102_A	0.575	0.19
722_L	725_R	0.575	0.19
355_V	447_T	0.574	0.19
320_L	329_I	0.574	0.19
724_S	739_L	0.572	0.19
673_Y	707_V	0.572	0.19
729_D	733_Q	0.571	0.19
239_A	422_K	0.571	0.19
409_D	443_G	0.571	0.19
716_A	724_S	0.570	0.19
331_I	417_Y	0.570	0.19
85_N	188_S	0.570	0.19
407_L	669_G	0.569	0.19
526_G	622_K	0.569	0.19
320_L	398_I	0.569	0.19
666_Y	737_V	0.568	0.19
382_K	389_P	0.568	0.19
275_S	405_V	0.567	0.19
474_S	643_L	0.567	0.19
274_S	530_M	0.567	0.19
387_D	476_N	0.566	0.19
632_Y	712_S	0.566	0.19
411_E	439_K	0.566	0.19
282_I	403_F	0.566	0.19
526_G	535_S	0.566	0.19
122_V	477_P	0.565	0.19
305_K	310_D	0.565	0.19
123_D	593_L	0.565	0.19
375_L	434_D	0.565	0.19
526_G	539_Q	0.565	0.19
353_I	451_R	0.564	0.19
115_P	562_G	0.564	0.19
181_I	420_K	0.563	0.19
367_A	452_N	0.563	0.19
613_V	633_N	0.562	0.19
361_Y	531_R	0.562	0.19
452_N	593_L	0.561	0.19
118_I	121_F	0.561	0.19
637_Q	701_A	0.561	0.19
633_N	638_L	0.560	0.19
607_R	610_E	0.560	0.19
473_S	529_I	0.560	0.19
125_T	398_I	0.559	0.19
119_A	589_K	0.559	0.19
608_T	611_F	0.559	0.19
192_H	501_L	0.559	0.19
325_E	417_Y	0.559	0.19
111_D	426_V	0.559	0.19
253_L	495_W	0.558	0.19
189_N	193_K	0.557	0.19
94_S	271_T	0.557	0.19
493_Q	739_L	0.557	0.19
717_G	727_V	0.556	0.19
260_G	263_G	0.554	0.18
288_A	315_W	0.554	0.18
113_F	614_K	0.553	0.18
389_P	665_A	0.553	0.18
329_I	564_S	0.552	0.18
315_W	366_K	0.552	0.18
478_V	534_V	0.552	0.18
392_Y	454_P	0.551	0.18
116_N	129_G	0.549	0.18
130_I	500_G	0.549	0.18
342_L	504_E	0.549	0.18
142_K	580_F	0.549	0.18
469_I	483_V	0.549	0.18
149_T	585_L	0.548	0.18
308_T	313_V	0.547	0.18
361_Y	449_H	0.546	0.18
507_L	585_L	0.546	0.18
456_D	531_R	0.546	0.18
473_S	657_D	0.546	0.18
482_Q	659_Y	0.545	0.18
364_S	662_K	0.545	0.18
286_L	519_L	0.544	0.18
223_E	389_P	0.544	0.18
436_D	718_L	0.543	0.18
361_Y	507_L	0.543	0.18
233_R	236_V	0.542	0.18
239_A	716_A	0.541	0.18
543_I	687_H	0.541	0.18
349_W	451_R	0.538	0.18
519_L	581_L	0.538	0.18
330_V	638_L	0.538	0.18
236_V	354_L	0.538	0.18
286_L	544_G	0.538	0.18
265_I	715_H	0.536	0.18
531_R	594_N	0.536	0.18
104_L	129_G	0.536	0.18
453_S	727_V	0.536	0.18
99_G	565_F	0.535	0.18
643_L	666_Y	0.535	0.18
704_V	708_L	0.535	0.18
99_G	241_R	0.534	0.18
99_G	450_Y	0.534	0.18
99_G	528_R	0.534	0.18
507_L	510_H	0.533	0.18
119_A	564_S	0.532	0.18
363_G	456_D	0.532	0.18
720_L	723_S	0.532	0.18
171_G	440_S	0.532	0.18
408_L	548_I	0.532	0.18
463_M	666_Y	0.531	0.18
392_Y	590_N	0.531	0.18
267_V	358_I	0.531	0.18
125_T	291_V	0.531	0.18
127_G	454_P	0.531	0.18
410_A	446_V	0.530	0.18
422_K	436_D	0.530	0.18
282_I	589_K	0.530	0.18
344_Y	395_G	0.529	0.18
471_G	548_I	0.529	0.18
415_V	495_W	0.527	0.17
225_L	655_V	0.526	0.17
258_S	563_S	0.526	0.17
533_A	594_N	0.526	0.17
398_I	705_A	0.526	0.17
105_V	121_F	0.525	0.17
544_G	574_F	0.524	0.17
237_I	420_K	0.524	0.17
483_V	540_G	0.523	0.17
306_I	378_K	0.523	0.17
543_I	653_G	0.523	0.17
107_L	611_F	0.522	0.17
286_L	572_L	0.522	0.17
329_I	670_K	0.522	0.17
470_V	729_D	0.521	0.17
726_E	729_D	0.521	0.17
351_K	379_V	0.521	0.17
280_K	384_I	0.520	0.17
516_M	566_V	0.520	0.17
221_L	414_E	0.520	0.17
137_N	549_E	0.520	0.17
132_I	394_K	0.519	0.17
443_G	446_V	0.518	0.17
697_I	721_G	0.517	0.17
449_H	594_N	0.517	0.17
394_K	601_I	0.516	0.17
509_P	543_I	0.516	0.17
279_F	460_L	0.516	0.17
683_L	718_L	0.515	0.17
249_I	390_I	0.515	0.17
282_I	346_V	0.514	0.17
272_Y	304_M	0.513	0.17
637_Q	716_A	0.513	0.17
135_S	370_K	0.513	0.17
293_Y	483_V	0.513	0.17
325_E	577_K	0.512	0.17
638_L	676_I	0.512	0.17
308_T	698_E	0.512	0.17
341_F	617_S	0.512	0.17
194_P	692_K	0.512	0.17
257_M	313_V	0.511	0.17
509_P	559_D	0.511	0.17
516_M	547_V	0.510	0.17
565_F	600_V	0.510	0.17
726_E	733_Q	0.509	0.17
352_V	532_I	0.509	0.17
540_G	718_L	0.509	0.17
210_E	596_Y	0.509	0.17
436_D	607_R	0.509	0.17
154_V	212_C	0.508	0.17
190_E	645_N	0.508	0.17
142_K	163_I	0.508	0.17
190_E	477_P	0.508	0.17
148_L	458_M	0.507	0.17
570_S	719_M	0.507	0.17
316_V	529_I	0.506	0.17
556_K	701_A	0.506	0.17
275_S	602_K	0.506	0.17
452_N	521_F	0.505	0.17
370_K	442_Y	0.505	0.17
160_A	237_I	0.505	0.17
702_S	738_L	0.505	0.17
568_D	571_V	0.504	0.17
426_V	690_E	0.504	0.17
137_N	141_G	0.504	0.17
326_G	329_I	0.503	0.17
579_G	645_N	0.503	0.17
116_N	279_F	0.502	0.17
366_K	595_G	0.502	0.17
105_V	354_L	0.501	0.17
572_L	578_N	0.501	0.17
286_L	356_T	0.501	0.17
334_A	363_G	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zpaA	1	0.8533	100	0.475	Contact Map
2reeA	1	0.2234	99.5	0.938	Contact Map
4znkA	1	0.3122	99.3	0.945	Contact Map
1z4rA	1	0.2059	99.3	0.945	Contact Map
3c26A	2	0.3122	99.2	0.946	Contact Map
1n71A	4	0.1992	99.2	0.947	Contact Map
1yghA	1	0.2127	99.1	0.948	Contact Map
3efaA	2	0.1911	99.1	0.949	Contact Map
1m4iA	2	0.2355	99.1	0.949	Contact Map
4r3lA	1	0.2059	99.1	0.949	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0158 seconds.