Q97ZX9 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZX9 - Glycyl-tRNA synthetase (GlyS)

UniProt:	Q97ZX9	Sequences: MSEVIDKVLDLAKRRGIFWLSYEIYGGVAGFYDIGPVGVRIKNRIVELWRKYFVKDNGDFVVEIESPMIGPAKVFEASGHVESFTDPIVECNNCKRIYRADHLIEDILKKSVEGLKPEELTRIIKENNIRCQYCGGELGEVRLFNLLFTTNIGPYTGNLGYIRPETAQGMFTAFKRVYEATRQRLPIGIAQIGKVGRNEISPRQGLIRMREFTIMEIEFFIDPEDNNIENIPLYRFKDTKLNILTASEKEKDGKPQEFKLEESVREKIIIQPWMAYWMAVASSFVKALGINEFYFEEKLPYERAHYSKQTFDQIAVINGIKVEISGHAYRGDYDLSRHMKYSGQDLTIFRKYKEPKMIKKKTVIVNNTKLKDKELRKKIMELLNGKSAEEIEQMIRNNVMIDDKPLSEFINIVEREEKVHGEHFIPHVVEPSFGVERTLFLTILSAYKEKEGRVLLSLPRHLAPYDIAVFPLLEREELIRKSVEIRESLSEKYEVLYDDSGSIGRRYARADEIGIPFAITVDPQTLVDNSVTIRDRDSWKQVRVKIDDLKISLEKLFRGEAFNKIGIEVNDSNE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	574 (550)
Sequences:	498 (298)
Seq/√Len:	12.7

HALSA - Q9HMW7
SULSO - Q97ZX9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
481_K	525_T	5.506	1.00
240_K	257_E	4.873	1.00
76_E	82_E	4.413	1.00
61_V	188_G	4.276	1.00
130_R	137_E	4.176	1.00
260_L	269_I	3.823	0.99
195_V	214_I	3.552	0.99
243_I	269_I	3.521	0.99
260_L	279_A	3.475	0.99
105_E	112_V	3.462	0.99
399_V	403_D	3.346	0.98
350_R	422_E	3.228	0.98
448_K	457_S	3.222	0.98
359_K	416_E	3.215	0.98
357_M	418_K	3.186	0.97
285_V	313_Q	3.104	0.97
188_G	219_F	3.084	0.97
473_L	523_P	3.062	0.97
281_A	327_H	3.038	0.97
61_V	219_F	2.985	0.96
241_L	279_A	2.949	0.96
315_A	324_I	2.906	0.96
275_A	502_S	2.768	0.94
45_I	462_L	2.686	0.93
498_D	509_R	2.684	0.93
104_I	129_I	2.680	0.93
290_I	315_A	2.659	0.93
72_A	161_Y	2.595	0.92
11_L	456_L	2.580	0.92
402_D	405_P	2.573	0.92
121_T	141_V	2.545	0.91
471_P	506_R	2.544	0.91
234_Y	237_K	2.523	0.91
352_Y	421_G	2.518	0.91
535_D	538_S	2.513	0.91
349_F	421_G	2.416	0.89
185_L	424_F	2.395	0.88
23_E	176_R	2.371	0.88
9_L	16_G	2.336	0.87
448_K	455_L	2.320	0.87
350_R	424_F	2.260	0.85
262_E	266_E	2.259	0.85
258_F	268_I	2.256	0.85
209_M	436_E	2.237	0.84
119_E	122_R	2.236	0.84
241_L	269_I	2.226	0.84
233_L	264_V	2.221	0.84
116_K	119_E	2.165	0.82
122_R	126_E	2.143	0.82
14_R	512_E	2.129	0.81
410_I	414_E	2.129	0.81
399_V	402_D	2.124	0.81
245_T	248_E	2.070	0.79
70_G	75_F	2.066	0.79
290_I	441_L	2.060	0.79
176_R	453_R	2.032	0.78
322_V	446_A	2.017	0.77
478_L	482_S	2.015	0.77
373_K	377_K	2.000	0.77
98_Y	138_L	1.997	0.77
125_K	140_E	1.987	0.76
531_V	549_L	1.976	0.76
260_L	275_A	1.947	0.75
125_K	137_E	1.941	0.75
70_G	214_I	1.917	0.74
259_K	262_E	1.915	0.74
307_S	310_T	1.898	0.73
176_R	191_Q	1.887	0.72
54_V	190_A	1.885	0.72
215_M	435_V	1.881	0.72
500_S	509_R	1.867	0.72
170_M	191_Q	1.849	0.71
144_F	154_P	1.816	0.69
408_E	412_I	1.816	0.69
21_S	67_P	1.815	0.69
69_I	150_T	1.781	0.68
510_A	515_I	1.758	0.67
469_V	525_T	1.751	0.66
92_N	137_E	1.745	0.66
149_T	159_L	1.727	0.65
241_L	260_L	1.725	0.65
239_T	260_L	1.718	0.65
31_F	100_A	1.715	0.65
422_E	455_L	1.715	0.65
170_M	432_S	1.709	0.65
178_Y	183_Q	1.701	0.64
75_F	161_Y	1.694	0.64
239_T	279_A	1.676	0.63
68_M	196_G	1.673	0.63
269_I	279_A	1.665	0.62
19_W	182_R	1.657	0.62
226_N	329_Y	1.649	0.62
408_E	411_N	1.648	0.62
294_Y	314_I	1.647	0.62
242_N	282_S	1.638	0.61
104_I	124_I	1.637	0.61
77_A	185_L	1.631	0.61
524_Q	528_D	1.627	0.61
53_F	433_F	1.609	0.60
242_N	257_E	1.603	0.59
43_N	64_I	1.586	0.58
57_N	61_V	1.574	0.58
187_I	215_M	1.558	0.57
297_E	309_Q	1.558	0.57
377_K	381_E	1.556	0.57
347_T	425_I	1.553	0.57
172_T	191_Q	1.543	0.56
359_K	414_E	1.540	0.56
291_N	445_S	1.539	0.56
227_N	272_P	1.517	0.55
64_I	542_V	1.515	0.55
324_I	438_T	1.513	0.55
222_D	350_R	1.511	0.55
237_K	265_R	1.509	0.55
31_F	70_G	1.500	0.54
16_G	182_R	1.480	0.53
409_F	414_E	1.479	0.53
387_S	390_E	1.474	0.53
369_K	372_D	1.474	0.53
53_F	179_E	1.467	0.52
297_E	311_F	1.463	0.52
239_T	282_S	1.460	0.52
192_I	269_I	1.458	0.52
129_I	526_L	1.455	0.52
77_A	342_S	1.455	0.52
226_N	230_N	1.447	0.51
473_L	477_E	1.446	0.51
288_L	442_T	1.446	0.51
151_N	156_T	1.446	0.51
196_G	496_L	1.444	0.51
131_C	134_C	1.442	0.51
230_N	235_R	1.441	0.51
296_E	311_F	1.439	0.51
255_P	383_L	1.436	0.51
246_A	300_P	1.434	0.51
285_V	325_S	1.429	0.50
91_C	136_G	1.424	0.50
285_V	438_T	1.420	0.50
407_S	410_I	1.420	0.50
89_V	372_D	1.420	0.50
317_I	322_V	1.416	0.50
77_A	337_R	1.413	0.50
262_E	265_R	1.411	0.50
170_M	189_I	1.411	0.50
333_Y	381_E	1.400	0.49
403_D	406_L	1.387	0.48
296_E	314_I	1.378	0.48
468_A	510_A	1.374	0.48
184_R	549_L	1.374	0.48
19_W	23_E	1.367	0.47
107_I	129_I	1.365	0.47
184_R	226_N	1.361	0.47
544_V	549_L	1.358	0.47
468_A	515_I	1.356	0.47
147_L	309_Q	1.350	0.46
41_I	465_Y	1.346	0.46
68_M	102_H	1.338	0.46
121_T	140_E	1.337	0.46
382_L	385_G	1.330	0.45
57_N	219_F	1.328	0.45
105_E	462_L	1.325	0.45
524_Q	543_R	1.325	0.45
47_E	51_K	1.324	0.45
453_R	539_W	1.322	0.45
75_F	82_E	1.320	0.45
221_I	463_A	1.314	0.45
460_R	517_F	1.310	0.44
91_C	94_C	1.307	0.44
219_F	273_W	1.304	0.44
473_L	480_R	1.297	0.44
75_F	98_Y	1.291	0.43
18_F	206_L	1.287	0.43
548_D	551_I	1.285	0.43
92_N	139_G	1.283	0.43
243_I	268_I	1.282	0.43
147_L	298_K	1.281	0.43
429_V	519_I	1.268	0.42
131_C	136_G	1.267	0.42
57_N	438_T	1.265	0.42
298_K	309_Q	1.265	0.42
241_L	519_I	1.261	0.42
399_V	404_K	1.245	0.41
94_C	134_C	1.242	0.41
298_K	310_T	1.237	0.41
111_S	114_G	1.234	0.41
8_V	456_L	1.223	0.40
16_G	19_W	1.221	0.40
329_Y	429_V	1.218	0.40
281_A	325_S	1.212	0.39
294_Y	311_F	1.210	0.39
376_R	383_L	1.209	0.39
544_V	552_S	1.201	0.39
281_A	444_L	1.201	0.39
473_L	501_G	1.200	0.39
43_N	65_E	1.199	0.39
237_K	261_E	1.198	0.39
529_N	546_I	1.192	0.38
273_W	324_I	1.192	0.38
51_K	456_L	1.187	0.38
41_I	241_L	1.181	0.38
362_T	493_Y	1.179	0.38
41_I	442_T	1.177	0.38
31_F	69_I	1.177	0.38
345_D	423_H	1.166	0.37
298_K	311_F	1.157	0.37
272_P	505_R	1.157	0.37
65_E	214_I	1.151	0.36
296_E	309_Q	1.150	0.36
32_Y	333_Y	1.147	0.36
322_V	456_L	1.144	0.36
170_M	176_R	1.140	0.36
531_V	544_V	1.136	0.36
104_I	120_L	1.135	0.36
337_R	341_Y	1.132	0.36
372_D	376_R	1.130	0.35
297_E	310_T	1.122	0.35
66_S	189_I	1.120	0.35
106_D	109_K	1.119	0.35
147_L	297_E	1.117	0.35
485_I	546_I	1.112	0.35
401_I	404_K	1.109	0.34
348_I	467_I	1.101	0.34
22_Y	346_L	1.100	0.34
69_I	352_Y	1.099	0.34
379_I	382_L	1.091	0.34
105_E	113_E	1.091	0.34
483_V	524_Q	1.090	0.34
103_L	138_L	1.090	0.34
241_L	499_D	1.087	0.33
315_A	514_G	1.079	0.33
44_R	466_D	1.076	0.33
45_I	288_L	1.075	0.33
294_Y	297_E	1.073	0.33
185_L	191_Q	1.068	0.33
195_V	204_Q	1.067	0.33
307_S	329_Y	1.065	0.32
236_F	267_K	1.065	0.32
357_M	556_L	1.063	0.32
270_I	365_V	1.062	0.32
494_E	515_I	1.061	0.32
73_K	89_V	1.056	0.32
20_L	28_V	1.053	0.32
114_G	301_Y	1.045	0.32
378_K	381_E	1.044	0.31
272_P	329_Y	1.043	0.31
440_F	489_L	1.042	0.31
293_F	313_Q	1.042	0.31
105_E	363_V	1.041	0.31
183_Q	552_S	1.038	0.31
126_E	265_R	1.037	0.31
478_L	523_P	1.035	0.31
147_L	311_F	1.027	0.31
288_L	324_I	1.024	0.31
383_L	538_S	1.020	0.30
75_F	83_S	1.019	0.30
299_L	470_F	1.014	0.30
42_K	65_E	1.014	0.30
470_F	521_V	1.000	0.30
50_R	145_N	1.000	0.30
320_I	444_L	0.999	0.30
256_Q	538_S	0.998	0.29
239_T	283_S	0.996	0.29
91_C	134_C	0.995	0.29
455_L	468_A	0.994	0.29
481_K	526_L	0.992	0.29
161_Y	360_K	0.984	0.29
8_V	12_A	0.983	0.29
379_I	409_F	0.983	0.29
104_I	488_S	0.980	0.29
42_K	189_I	0.974	0.28
42_K	77_A	0.970	0.28
311_F	314_I	0.970	0.28
20_L	279_A	0.970	0.28
222_D	252_D	0.967	0.28
443_I	558_R	0.965	0.28
269_I	420_H	0.965	0.28
195_V	412_I	0.964	0.28
182_R	349_F	0.964	0.28
222_D	225_D	0.963	0.28
221_I	329_Y	0.962	0.28
170_M	543_R	0.958	0.28
147_L	296_E	0.955	0.28
27_G	98_Y	0.954	0.28
94_C	131_C	0.954	0.28
343_G	381_E	0.951	0.28
493_Y	554_E	0.947	0.27
13_K	543_R	0.942	0.27
89_V	97_I	0.942	0.27
16_G	91_C	0.940	0.27
472_L	536_R	0.940	0.27
371_K	376_R	0.939	0.27
88_I	96_R	0.938	0.27
159_L	345_D	0.936	0.27
172_T	271_Q	0.929	0.27
265_R	272_P	0.928	0.27
336_S	513_I	0.927	0.27
362_T	417_E	0.927	0.27
381_E	548_D	0.925	0.26
187_I	311_F	0.925	0.26
382_L	386_K	0.924	0.26
260_L	447_Y	0.923	0.26
472_L	482_S	0.921	0.26
357_M	455_L	0.914	0.26
19_W	207_I	0.914	0.26
75_F	373_K	0.912	0.26
43_N	521_V	0.911	0.26
235_R	487_E	0.906	0.26
14_R	23_E	0.903	0.26
485_I	550_K	0.902	0.26
147_L	196_G	0.900	0.25
89_V	139_G	0.899	0.25
102_H	195_V	0.898	0.25
234_Y	272_P	0.897	0.25
175_K	344_Q	0.897	0.25
41_I	96_R	0.895	0.25
350_R	455_L	0.893	0.25
206_L	209_M	0.893	0.25
161_Y	515_I	0.889	0.25
262_E	542_V	0.888	0.25
407_S	414_E	0.887	0.25
294_Y	310_T	0.887	0.25
44_R	89_V	0.886	0.25
11_L	458_L	0.885	0.25
154_P	313_Q	0.885	0.25
528_D	543_R	0.884	0.25
209_M	331_G	0.882	0.25
409_F	412_I	0.882	0.25
407_S	442_T	0.880	0.25
102_H	440_F	0.878	0.25
53_F	217_I	0.877	0.25
118_E	234_Y	0.876	0.25
238_D	551_I	0.875	0.24
269_I	361_K	0.875	0.24
297_E	314_I	0.874	0.24
443_I	458_L	0.873	0.24
67_P	104_I	0.872	0.24
261_E	265_R	0.870	0.24
336_S	340_K	0.868	0.24
181_T	217_I	0.865	0.24
554_E	558_R	0.865	0.24
296_E	310_T	0.862	0.24
144_F	535_D	0.862	0.24
41_I	443_I	0.861	0.24
179_E	453_R	0.861	0.24
351_K	469_V	0.858	0.24
234_Y	405_P	0.857	0.24
267_K	388_A	0.857	0.24
506_R	509_R	0.856	0.24
392_E	396_R	0.855	0.24
485_I	531_V	0.852	0.24
219_F	436_E	0.851	0.24
118_E	122_R	0.848	0.23
222_D	281_A	0.848	0.23
250_E	549_L	0.846	0.23
480_R	523_P	0.845	0.23
349_F	423_H	0.845	0.23
55_K	60_F	0.844	0.23
396_R	551_I	0.841	0.23
221_I	226_N	0.840	0.23
70_G	273_W	0.835	0.23
353_K	362_T	0.835	0.23
104_I	114_G	0.832	0.23
245_T	256_Q	0.832	0.23
10_D	176_R	0.831	0.23
91_C	131_C	0.828	0.23
154_P	160_G	0.828	0.23
21_S	24_I	0.827	0.23
32_Y	363_V	0.827	0.23
379_I	544_V	0.825	0.23
178_Y	348_I	0.824	0.23
75_F	81_V	0.824	0.23
215_M	228_I	0.823	0.23
414_E	419_V	0.823	0.23
358_I	519_I	0.822	0.23
98_Y	184_R	0.820	0.22
319_G	343_G	0.819	0.22
83_S	341_Y	0.817	0.22
403_D	519_I	0.816	0.22
394_M	398_N	0.814	0.22
294_Y	309_Q	0.814	0.22
498_D	506_R	0.813	0.22
294_Y	298_K	0.808	0.22
47_E	549_L	0.808	0.22
332_D	465_Y	0.808	0.22
144_F	200_I	0.802	0.22
139_G	315_A	0.802	0.22
161_Y	293_F	0.800	0.22
364_I	370_L	0.800	0.22
315_A	442_T	0.799	0.22
485_I	525_T	0.798	0.22
307_S	328_A	0.798	0.22
172_T	365_V	0.797	0.22
376_R	379_I	0.792	0.21
32_Y	116_K	0.790	0.21
69_I	229_E	0.790	0.21
473_L	478_L	0.788	0.21
81_V	88_I	0.787	0.21
381_E	399_V	0.785	0.21
175_K	515_I	0.784	0.21
182_R	501_G	0.782	0.21
138_L	538_S	0.779	0.21
98_Y	133_Y	0.779	0.21
222_D	352_Y	0.779	0.21
114_G	120_L	0.779	0.21
62_V	181_T	0.778	0.21
469_V	560_E	0.778	0.21
17_I	41_I	0.777	0.21
41_I	77_A	0.777	0.21
102_H	185_L	0.774	0.21
443_I	446_A	0.773	0.21
214_I	436_E	0.770	0.21
126_E	412_I	0.768	0.21
166_T	445_S	0.768	0.21
465_Y	513_I	0.768	0.21
89_V	191_Q	0.765	0.21
381_E	384_N	0.762	0.20
273_W	303_R	0.762	0.20
151_N	465_Y	0.761	0.20
127_N	260_L	0.760	0.20
94_C	136_G	0.759	0.20
46_V	155_Y	0.758	0.20
68_M	421_G	0.758	0.20
196_G	311_F	0.756	0.20
41_I	391_I	0.756	0.20
457_S	533_I	0.754	0.20
230_N	535_D	0.753	0.20
270_I	539_W	0.753	0.20
401_I	405_P	0.751	0.20
222_D	506_R	0.750	0.20
269_I	397_N	0.750	0.20
370_L	380_M	0.750	0.20
455_L	513_I	0.750	0.20
9_L	13_K	0.748	0.20
50_R	207_I	0.748	0.20
37_V	209_M	0.747	0.20
113_E	281_A	0.746	0.20
385_G	462_L	0.744	0.20
195_V	374_E	0.740	0.20
150_T	451_E	0.739	0.20
68_M	108_L	0.739	0.20
553_L	559_G	0.739	0.20
468_A	513_I	0.738	0.20
405_P	547_D	0.737	0.20
524_Q	530_S	0.734	0.20
8_V	443_I	0.733	0.19
142_R	222_D	0.733	0.19
145_N	154_P	0.731	0.19
126_E	399_V	0.730	0.19
268_I	535_D	0.729	0.19
308_K	478_L	0.729	0.19
343_G	525_T	0.728	0.19
93_N	137_E	0.727	0.19
400_M	405_P	0.726	0.19
217_I	450_K	0.725	0.19
196_G	298_K	0.725	0.19
369_K	519_I	0.724	0.19
287_A	461_H	0.724	0.19
13_K	16_G	0.721	0.19
382_L	416_E	0.720	0.19
161_Y	333_Y	0.719	0.19
106_D	548_D	0.718	0.19
61_V	217_I	0.716	0.19
54_V	122_R	0.715	0.19
184_R	447_Y	0.715	0.19
66_S	243_I	0.715	0.19
96_R	262_E	0.714	0.19
339_M	344_Q	0.712	0.19
472_L	537_D	0.712	0.19
104_I	515_I	0.711	0.19
419_V	558_R	0.711	0.19
226_N	233_L	0.708	0.19
42_K	213_T	0.707	0.19
104_I	123_I	0.706	0.19
87_P	117_P	0.706	0.19
475_R	483_V	0.706	0.19
98_Y	131_C	0.705	0.19
190_A	206_L	0.703	0.19
24_I	38_G	0.703	0.19
46_V	244_L	0.703	0.19
32_Y	103_L	0.702	0.18
54_V	268_I	0.702	0.18
219_F	277_W	0.701	0.18
141_V	480_R	0.700	0.18
360_K	458_L	0.699	0.18
303_R	438_T	0.698	0.18
301_Y	327_H	0.697	0.18
187_I	249_K	0.697	0.18
399_V	405_P	0.696	0.18
360_K	417_E	0.696	0.18
177_V	233_L	0.694	0.18
166_T	171_F	0.693	0.18
468_A	518_A	0.693	0.18
191_Q	213_T	0.693	0.18
54_V	530_S	0.692	0.18
244_L	455_L	0.692	0.18
298_K	307_S	0.691	0.18
485_I	521_V	0.691	0.18
70_G	74_V	0.688	0.18
230_N	303_R	0.687	0.18
176_R	185_L	0.686	0.18
125_K	393_Q	0.685	0.18
342_S	421_G	0.685	0.18
410_I	416_E	0.684	0.18
424_F	542_V	0.683	0.18
89_V	138_L	0.682	0.18
53_F	280_V	0.681	0.18
340_K	343_G	0.679	0.18
240_K	259_K	0.679	0.18
486_R	540_K	0.678	0.18
533_I	544_V	0.678	0.18
274_M	329_Y	0.677	0.18
234_Y	322_V	0.677	0.18
106_D	315_A	0.676	0.18
354_E	447_Y	0.675	0.18
102_H	421_G	0.675	0.18
533_I	542_V	0.674	0.18
523_P	539_W	0.673	0.18
298_K	314_I	0.673	0.18
342_S	533_I	0.672	0.18
357_M	416_E	0.672	0.18
313_Q	474_E	0.672	0.18
10_D	155_Y	0.671	0.18
473_L	500_S	0.671	0.18
283_S	397_N	0.670	0.18
346_L	394_M	0.669	0.17
46_V	435_V	0.669	0.17
94_C	388_A	0.668	0.17
225_D	390_E	0.667	0.17
115_L	120_L	0.667	0.17
64_I	347_T	0.666	0.17
15_R	38_G	0.664	0.17
243_I	366_N	0.662	0.17
173_A	181_T	0.662	0.17
315_A	465_Y	0.662	0.17
261_E	264_V	0.661	0.17
526_L	547_D	0.661	0.17
184_R	260_L	0.660	0.17
182_R	352_Y	0.660	0.17
44_R	375_L	0.659	0.17
94_C	482_S	0.659	0.17
103_L	502_S	0.659	0.17
106_D	180_A	0.658	0.17
492_K	521_V	0.658	0.17
222_D	227_N	0.657	0.17
39_V	55_K	0.657	0.17
470_F	515_I	0.656	0.17
332_D	336_S	0.655	0.17
215_M	472_L	0.655	0.17
367_N	478_L	0.652	0.17
354_E	419_V	0.652	0.17
458_L	502_S	0.652	0.17
14_R	112_V	0.651	0.17
147_L	294_Y	0.651	0.17
14_R	509_R	0.648	0.17
37_V	513_I	0.647	0.17
386_K	389_E	0.647	0.17
77_A	341_Y	0.646	0.17
365_V	400_M	0.645	0.17
201_S	557_F	0.644	0.17
161_Y	369_K	0.644	0.17
506_R	530_S	0.643	0.17
24_I	33_D	0.643	0.17
62_V	173_A	0.642	0.17
16_G	131_C	0.641	0.17
225_D	350_R	0.641	0.17
341_Y	458_L	0.641	0.17
517_F	556_L	0.640	0.17
358_I	529_N	0.640	0.17
64_I	324_I	0.640	0.17
104_I	117_P	0.638	0.17
12_A	439_L	0.637	0.17
196_G	309_Q	0.636	0.17
528_D	542_V	0.636	0.17
102_H	201_S	0.636	0.17
176_R	179_E	0.635	0.16
24_I	126_E	0.635	0.16
279_A	331_G	0.634	0.16
145_N	310_T	0.633	0.16
309_Q	314_I	0.633	0.16
531_V	550_K	0.632	0.16
531_V	543_R	0.631	0.16
177_V	314_I	0.631	0.16
89_V	369_K	0.630	0.16
418_K	538_S	0.629	0.16
161_Y	484_E	0.629	0.16
131_C	191_Q	0.629	0.16
11_L	26_G	0.628	0.16
121_T	521_V	0.628	0.16
52_Y	368_T	0.625	0.16
465_Y	505_R	0.624	0.16
38_G	313_Q	0.623	0.16
332_D	427_H	0.622	0.16
195_V	278_M	0.621	0.16
17_I	307_S	0.620	0.16
27_G	195_V	0.620	0.16
236_F	242_N	0.620	0.16
207_I	270_I	0.619	0.16
24_I	346_L	0.619	0.16
196_G	297_E	0.618	0.16
246_A	255_P	0.618	0.16
278_M	381_E	0.617	0.16
204_Q	319_G	0.616	0.16
534_R	541_Q	0.616	0.16
342_S	482_S	0.615	0.16
401_I	406_L	0.615	0.16
204_Q	377_K	0.615	0.16
287_A	427_H	0.614	0.16
170_M	470_F	0.614	0.16
501_G	527_V	0.614	0.16
196_G	296_E	0.614	0.16
267_K	415_R	0.614	0.16
303_R	310_T	0.613	0.16
48_L	461_H	0.613	0.16
102_H	194_K	0.613	0.16
351_K	408_E	0.608	0.16
121_T	505_R	0.608	0.16
14_R	66_S	0.608	0.16
10_D	112_V	0.607	0.16
151_N	279_A	0.607	0.16
131_C	182_R	0.606	0.16
417_E	447_Y	0.606	0.16
29_A	476_E	0.605	0.16
265_R	292_E	0.604	0.16
433_F	502_S	0.602	0.16
411_N	435_V	0.601	0.16
53_F	162_I	0.601	0.16
16_G	94_C	0.601	0.16
88_I	190_A	0.600	0.16
161_Y	365_V	0.598	0.15
551_I	555_K	0.598	0.15
542_V	546_I	0.598	0.15
143_L	381_E	0.597	0.15
15_R	29_A	0.596	0.15
175_K	244_L	0.596	0.15
55_K	490_S	0.596	0.15
542_V	552_S	0.595	0.15
46_V	156_T	0.595	0.15
436_E	450_K	0.595	0.15
100_A	112_V	0.594	0.15
318_N	444_L	0.592	0.15
88_I	97_I	0.591	0.15
75_F	105_E	0.591	0.15
124_I	550_K	0.590	0.15
42_K	470_F	0.589	0.15
213_T	421_G	0.589	0.15
447_Y	493_Y	0.589	0.15
128_N	262_E	0.588	0.15
307_S	429_V	0.588	0.15
259_K	353_K	0.588	0.15
258_F	364_I	0.588	0.15
514_G	528_D	0.587	0.15
393_Q	397_N	0.587	0.15
46_V	149_T	0.586	0.15
70_G	436_E	0.586	0.15
60_F	485_I	0.586	0.15
66_S	72_A	0.586	0.15
131_C	427_H	0.585	0.15
206_L	436_E	0.584	0.15
55_K	331_G	0.584	0.15
298_K	329_Y	0.583	0.15
238_D	259_K	0.582	0.15
446_A	514_G	0.579	0.15
115_L	469_V	0.577	0.15
473_L	527_V	0.576	0.15
100_A	105_E	0.576	0.15
331_G	433_F	0.575	0.15
197_R	431_P	0.574	0.15
129_I	269_I	0.574	0.15
275_A	363_V	0.574	0.15
343_G	364_I	0.574	0.15
340_K	424_F	0.574	0.15
296_E	445_S	0.573	0.15
43_N	192_I	0.572	0.15
129_I	138_L	0.572	0.15
120_L	123_I	0.572	0.15
556_L	559_G	0.572	0.15
196_G	525_T	0.571	0.15
367_N	422_E	0.570	0.15
409_F	413_V	0.569	0.15
185_L	469_V	0.569	0.15
365_V	370_L	0.567	0.15
42_K	170_M	0.567	0.15
462_L	527_V	0.567	0.15
322_V	383_L	0.565	0.15
87_P	467_I	0.564	0.15
47_E	505_R	0.564	0.15
11_L	137_E	0.564	0.15
139_G	418_K	0.561	0.14
130_R	135_G	0.561	0.14
389_E	410_I	0.560	0.14
241_L	259_K	0.559	0.14
240_K	519_I	0.558	0.14
115_L	342_S	0.558	0.14
531_V	548_D	0.556	0.14
407_S	519_I	0.556	0.14
53_F	61_V	0.555	0.14
97_I	104_I	0.555	0.14
10_D	468_A	0.555	0.14
249_K	310_T	0.554	0.14
28_V	526_L	0.553	0.14
297_E	445_S	0.553	0.14
281_A	299_L	0.553	0.14
31_F	214_I	0.553	0.14
182_R	500_S	0.553	0.14
470_F	513_I	0.553	0.14
77_A	188_G	0.552	0.14
308_K	559_G	0.552	0.14
214_I	297_E	0.552	0.14
530_S	552_S	0.550	0.14
108_L	422_E	0.550	0.14
477_E	482_S	0.550	0.14
376_R	419_V	0.550	0.14
339_M	441_L	0.549	0.14
258_F	266_E	0.549	0.14
281_A	493_Y	0.548	0.14
201_S	281_A	0.548	0.14
178_Y	412_I	0.547	0.14
34_I	64_I	0.547	0.14
180_A	313_Q	0.546	0.14
71_P	508_A	0.546	0.14
37_V	465_Y	0.545	0.14
298_K	445_S	0.545	0.14
42_K	422_E	0.543	0.14
17_I	37_V	0.543	0.14
162_I	360_K	0.542	0.14
340_K	418_K	0.542	0.14
51_K	485_I	0.542	0.14
303_R	325_S	0.542	0.14
342_S	352_Y	0.541	0.14
190_A	219_F	0.541	0.14
244_L	383_L	0.541	0.14
264_V	313_Q	0.541	0.14
348_I	515_I	0.540	0.14
525_T	542_V	0.540	0.14
67_P	446_A	0.540	0.14
291_N	324_I	0.540	0.14
190_A	217_I	0.540	0.14
21_S	243_I	0.539	0.14
336_S	551_I	0.538	0.14
67_P	77_A	0.537	0.14
447_Y	491_E	0.536	0.14
215_M	263_S	0.535	0.14
128_N	552_S	0.535	0.14
42_K	544_V	0.534	0.14
250_E	469_V	0.534	0.14
90_E	375_L	0.533	0.14
401_I	540_K	0.533	0.14
128_N	420_H	0.532	0.14
161_Y	529_N	0.532	0.14
120_L	377_K	0.532	0.14
114_G	221_I	0.532	0.14
225_D	478_L	0.530	0.14
297_E	329_Y	0.530	0.14
131_C	372_D	0.530	0.14
217_I	280_V	0.529	0.14
427_H	531_V	0.528	0.14
280_V	318_N	0.527	0.14
194_K	435_V	0.527	0.14
353_K	484_E	0.526	0.14
135_G	240_K	0.525	0.14
7_K	406_L	0.525	0.14
349_F	352_Y	0.525	0.14
106_D	136_G	0.524	0.14
366_N	519_I	0.524	0.14
72_A	365_V	0.523	0.14
47_E	405_P	0.522	0.14
98_Y	559_G	0.522	0.14
353_K	386_K	0.522	0.14
155_Y	277_W	0.520	0.13
269_I	476_E	0.519	0.13
21_S	184_R	0.519	0.13
400_M	403_D	0.519	0.13
290_I	356_K	0.518	0.13
476_E	483_V	0.517	0.13
473_L	533_I	0.517	0.13
83_S	508_A	0.517	0.13
492_K	554_E	0.516	0.13
124_I	397_N	0.516	0.13
310_T	445_S	0.516	0.13
66_S	97_I	0.515	0.13
121_T	125_K	0.515	0.13
471_P	498_D	0.515	0.13
310_T	314_I	0.515	0.13
147_L	314_I	0.515	0.13
525_T	531_V	0.514	0.13
87_P	348_I	0.513	0.13
114_G	159_L	0.512	0.13
311_F	445_S	0.512	0.13
309_Q	329_Y	0.512	0.13
32_Y	44_R	0.511	0.13
209_M	280_V	0.511	0.13
402_D	406_L	0.510	0.13
370_L	412_I	0.510	0.13
89_V	213_T	0.510	0.13
337_R	518_A	0.510	0.13
471_P	509_R	0.509	0.13
214_I	342_S	0.509	0.13
68_M	281_A	0.509	0.13
161_Y	351_K	0.509	0.13
275_A	406_L	0.508	0.13
530_S	557_F	0.508	0.13
105_E	424_F	0.508	0.13
263_S	311_F	0.508	0.13
102_H	412_I	0.506	0.13
184_R	394_M	0.506	0.13
52_Y	115_L	0.506	0.13
504_G	507_Y	0.505	0.13
308_K	340_K	0.505	0.13
504_G	511_D	0.505	0.13
507_Y	511_D	0.505	0.13
122_R	256_Q	0.505	0.13
105_E	254_K	0.504	0.13
204_Q	322_V	0.504	0.13
37_V	52_Y	0.504	0.13
373_K	456_L	0.504	0.13
76_E	155_Y	0.503	0.13
462_L	540_K	0.503	0.13
523_P	533_I	0.503	0.13
224_E	559_G	0.502	0.13
138_L	288_L	0.502	0.13
27_G	138_L	0.502	0.13
150_T	383_L	0.502	0.13
31_F	37_V	0.501	0.13
147_L	310_T	0.501	0.13
354_E	370_L	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zt5A	2	0.8728	100	0.454	Contact Map
1atiA	2	0.723	100	0.619	Contact Map
1g5hA	2	0.6951	100	0.703	Contact Map
3iklA	2	0.6132	100	0.729	Contact Map
3a32A	2	0.7247	100	0.759	Contact Map
3ialA	2	0.6707	100	0.8	Contact Map
1nyrA	2	0.6986	100	0.801	Contact Map
3uh0A	2	0.6864	100	0.802	Contact Map
2i4lA	2	0.7195	100	0.802	Contact Map
4hwtA	2	0.6812	100	0.808	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0146 seconds.