SYR - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

SYR - Arginine--tRNA ligase

UniProt:	Q97ZN1	Sequences: MDIIGRAKKELAEYVAAQLGISEEEVFKNITYPPREELGDLSLALPSLIKGNINEKAKLLQEYKGELIERIEVAGIYLNARLNLRNIFVSIFSKLDDSYGLEKIEKPKRIVVEHTSANPIHPLHIGHLRNTILGDALARALKARGHSVNVRFYVNDTGRQVAVLIYGLKLLGFPDPEPNVKKDLWLGIIYAMTNVILEIRKLREELKKLSESEYREKVRELDELIVIANDLRNRNEVLFDKLADAINAKEEPEKEIGEIIKKYEEGNDELKGIIRKYISYALEGFSETLSKLNIRFDNFDYESDLLWENMVNEVLKALLSSSAKIPYKGVIALDLDSFLGDEARSKLRIPKGLKIPPLVLMRSDGTTLYTVRDIAYTIFKFNQFNADFVINVIAEEQYIPQIQLRGALELLGYSRFAENLLHYSYGMVNIQGLRMSGRLGKIITIDEIYEKLDNIVRNKLKEKGGNMENIDDIANAALRYAILSVSANKPLSFDLNRITSFEQNSGPYLQYTYARAANILAKSTENLSMDKVDFSDLVGDKRNILILIAKFPEVFKNAVDNLRLEDLVAFLRELSDIFNSWYDKERVLQEQDPRKRMLRLYIVKGVSVVLKNGLSVLGIRSLERM	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	625 (588)
Sequences:	239 (174)
Seq/√Len:	7.2

ECOLI - SYR
BACSU - SYR
HALSA - SYR
SULSO - SYR

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
316_K	320_S	5.428	1.00
138_A	150_V	5.252	0.99
571_L	613_G	4.907	0.99
393_I	401_Q	4.369	0.98
422_H	426_G	3.931	0.96
142_K	150_V	3.914	0.96
113_E	153_Y	3.640	0.94
425_Y	428_V	3.560	0.93
469_N	473_I	3.308	0.90
55_E	554_V	3.254	0.89
380_K	391_N	3.254	0.89
113_E	435_M	3.206	0.88
135_D	139_R	3.082	0.86
52_N	55_E	3.037	0.85
288_T	446_D	3.019	0.85
58_K	61_Q	3.001	0.84
422_H	425_Y	2.939	0.83
377_T	391_N	2.810	0.80
424_S	428_V	2.803	0.80
77_Y	477_A	2.759	0.79
424_S	427_M	2.755	0.79
380_K	389_V	2.655	0.76
425_Y	430_I	2.580	0.74
109_R	147_S	2.579	0.74
317_A	321_S	2.556	0.73
422_H	428_V	2.507	0.71
117_A	289_L	2.461	0.70
333_L	473_I	2.419	0.68
184_L	394_A	2.413	0.68
541_K	599_R	2.397	0.68
380_K	482_I	2.384	0.67
391_N	400_P	2.358	0.66
112_V	141_L	2.344	0.66
55_E	58_K	2.336	0.66
187_G	362_R	2.306	0.65
274_I	400_P	2.275	0.63
438_R	515_R	2.254	0.63
477_A	507_P	2.250	0.63
291_K	471_D	2.240	0.62
115_T	289_L	2.239	0.62
422_H	427_M	2.189	0.60
294_I	443_I	2.187	0.60
130_N	425_Y	2.182	0.60
137_L	551_F	2.181	0.60
380_K	400_P	2.169	0.60
200_R	593_P	2.130	0.58
518_N	521_A	2.121	0.58
376_Y	380_K	2.113	0.57
59_L	70_R	2.105	0.57
67_L	97_D	2.067	0.56
423_Y	430_I	2.065	0.56
121_H	426_G	2.064	0.56
253_E	256_I	2.040	0.55
190_Y	371_V	2.025	0.54
190_Y	364_D	2.010	0.53
587_V	603_V	1.978	0.52
119_P	376_Y	1.978	0.52
544_I	611_K	1.953	0.51
30_I	537_L	1.917	0.50
380_K	405_R	1.903	0.49
117_A	152_F	1.874	0.48
100_G	612_N	1.872	0.48
404_L	410_L	1.866	0.48
274_I	391_N	1.865	0.48
153_Y	380_K	1.862	0.48
423_Y	426_G	1.858	0.48
284_G	446_D	1.851	0.47
163_V	288_T	1.828	0.46
262_K	269_E	1.792	0.45
284_G	288_T	1.786	0.45
121_H	505_S	1.784	0.45
578_F	603_V	1.752	0.43
59_L	85_R	1.740	0.43
117_A	274_I	1.735	0.43
473_I	588_L	1.727	0.43
53_I	77_Y	1.726	0.42
511_Y	582_Y	1.723	0.42
443_I	510_Q	1.713	0.42
440_G	493_F	1.698	0.41
123_L	362_R	1.679	0.41
293_N	568_V	1.668	0.40
117_A	376_Y	1.668	0.40
511_Y	515_R	1.656	0.40
374_I	412_G	1.649	0.40
511_Y	514_A	1.636	0.39
181_K	425_Y	1.629	0.39
360_L	405_R	1.613	0.38
6_R	10_E	1.610	0.38
375_A	567_L	1.608	0.38
608_V	612_N	1.594	0.38
452_L	499_T	1.594	0.38
130_N	288_T	1.591	0.37
301_Y	393_I	1.587	0.37
119_P	153_Y	1.586	0.37
42_S	362_R	1.583	0.37
11_L	611_K	1.580	0.37
420_L	424_S	1.580	0.37
84_L	139_R	1.578	0.37
59_L	527_L	1.575	0.37
130_N	301_Y	1.562	0.36
113_E	119_P	1.560	0.36
250_E	253_E	1.559	0.36
376_Y	479_R	1.556	0.36
568_V	622_L	1.547	0.36
117_A	121_H	1.541	0.36
358_L	370_T	1.539	0.36
396_E	427_M	1.537	0.36
123_L	154_V	1.534	0.35
133_L	497_R	1.533	0.35
471_D	580_S	1.528	0.35
512_T	579_N	1.522	0.35
226_V	230_D	1.518	0.35
253_E	260_I	1.517	0.35
183_D	284_G	1.516	0.35
303_S	422_H	1.490	0.34
168_L	371_V	1.488	0.34
520_L	603_V	1.485	0.34
138_A	530_D	1.474	0.33
511_Y	579_N	1.469	0.33
67_L	374_I	1.462	0.33
289_L	503_Q	1.462	0.33
519_I	587_V	1.453	0.33
144_R	494_D	1.452	0.33
115_T	167_G	1.447	0.32
119_P	380_K	1.438	0.32
59_L	531_K	1.435	0.32
567_L	609_V	1.425	0.32
364_D	371_V	1.420	0.31
365_G	493_F	1.420	0.31
107_P	146_H	1.418	0.31
143_A	616_V	1.415	0.31
33_P	137_L	1.413	0.31
452_L	495_L	1.409	0.31
264_E	362_R	1.409	0.31
520_L	609_V	1.407	0.31
400_P	426_G	1.399	0.31
137_L	547_L	1.397	0.31
368_L	371_V	1.394	0.31
423_Y	429_N	1.377	0.30
501_F	507_P	1.377	0.30
113_E	408_L	1.373	0.30
121_H	397_Q	1.373	0.30
154_V	363_S	1.371	0.30
423_Y	428_V	1.365	0.30
380_K	401_Q	1.356	0.29
99_Y	610_L	1.355	0.29
254_K	528_S	1.352	0.29
262_K	267_N	1.351	0.29
119_P	263_Y	1.349	0.29
480_Y	509_L	1.343	0.29
219_R	297_D	1.342	0.29
115_T	119_P	1.339	0.29
108_K	388_F	1.336	0.29
7_A	12_A	1.334	0.29
75_G	329_G	1.333	0.29
171_L	380_K	1.332	0.29
10_E	62_E	1.332	0.29
367_T	381_F	1.323	0.28
548_I	551_F	1.313	0.28
376_Y	401_Q	1.305	0.28
273_I	296_F	1.296	0.27
590_E	596_R	1.295	0.27
53_I	477_A	1.294	0.27
360_L	374_I	1.291	0.27
59_L	268_D	1.289	0.27
399_I	403_Q	1.287	0.27
221_L	392_V	1.283	0.27
52_N	499_T	1.282	0.27
388_F	392_V	1.280	0.27
197_L	586_R	1.279	0.27
364_D	368_L	1.278	0.27
567_L	613_G	1.276	0.27
372_R	436_S	1.276	0.27
116_S	411_L	1.274	0.27
15_V	18_Q	1.274	0.27
274_I	380_K	1.273	0.27
123_L	155_N	1.273	0.27
453_D	474_A	1.272	0.27
476_A	510_Q	1.271	0.27
264_E	372_R	1.269	0.27
420_L	477_A	1.254	0.26
420_L	426_G	1.251	0.26
24_E	147_S	1.247	0.26
126_G	438_R	1.245	0.26
106_K	137_L	1.241	0.26
112_V	137_L	1.239	0.26
480_Y	588_L	1.238	0.26
132_I	292_L	1.236	0.26
460_L	482_I	1.229	0.25
302_E	369_Y	1.225	0.25
134_G	302_E	1.225	0.25
134_G	369_Y	1.225	0.25
118_N	369_Y	1.225	0.25
118_N	302_E	1.225	0.25
118_N	134_G	1.225	0.25
115_T	391_N	1.225	0.25
121_H	400_P	1.222	0.25
117_A	405_R	1.220	0.25
43_L	522_K	1.216	0.25
515_R	582_Y	1.213	0.25
130_N	155_N	1.212	0.25
605_G	610_L	1.210	0.25
377_T	408_L	1.208	0.25
129_R	365_G	1.203	0.25
428_V	435_M	1.196	0.24
23_E	137_L	1.196	0.24
181_K	284_G	1.195	0.24
500_S	513_Y	1.193	0.24
163_V	280_Y	1.186	0.24
517_A	623_E	1.184	0.24
147_S	337_S	1.183	0.24
117_A	400_P	1.180	0.24
119_P	391_N	1.177	0.24
226_V	530_D	1.175	0.24
144_R	559_V	1.173	0.24
52_N	532_V	1.172	0.24
157_T	301_Y	1.167	0.24
481_A	491_L	1.166	0.24
313_E	318_L	1.163	0.24
187_G	284_G	1.161	0.23
140_A	602_I	1.155	0.23
115_T	131_T	1.155	0.23
121_H	274_I	1.154	0.23
158_G	365_G	1.152	0.23
123_L	183_D	1.151	0.23
593_P	597_M	1.149	0.23
529_M	532_V	1.148	0.23
155_N	485_V	1.148	0.23
380_K	393_I	1.141	0.23
274_I	405_R	1.136	0.23
121_H	152_F	1.136	0.23
117_A	391_N	1.131	0.23
367_T	545_L	1.131	0.23
30_I	41_L	1.131	0.23
391_N	426_G	1.127	0.23
12_A	594_R	1.127	0.23
162_A	391_N	1.127	0.23
223_E	624_R	1.127	0.23
128_L	504_N	1.124	0.22
152_F	392_V	1.122	0.22
115_T	400_P	1.122	0.22
61_Q	543_N	1.120	0.22
196_I	199_I	1.117	0.22
160_Q	511_Y	1.117	0.22
374_I	606_V	1.115	0.22
25_E	143_A	1.109	0.22
94_K	142_K	1.107	0.22
19_L	68_I	1.107	0.22
496_N	545_L	1.105	0.22
200_R	203_R	1.104	0.22
181_K	446_D	1.102	0.22
153_Y	435_M	1.101	0.22
124_H	438_R	1.099	0.22
145_G	438_R	1.098	0.22
268_D	283_E	1.096	0.22
115_T	393_I	1.093	0.22
249_K	494_D	1.092	0.22
422_H	430_I	1.090	0.22
120_I	482_I	1.088	0.22
561_N	615_S	1.086	0.21
514_A	574_L	1.083	0.21
274_I	401_Q	1.082	0.21
120_I	157_T	1.082	0.21
156_D	365_G	1.079	0.21
15_V	108_K	1.078	0.21
559_V	622_L	1.076	0.21
305_L	619_I	1.073	0.21
188_I	374_I	1.070	0.21
82_L	110_I	1.066	0.21
75_G	82_L	1.064	0.21
147_S	535_S	1.063	0.21
135_D	392_V	1.060	0.21
30_I	45_L	1.059	0.21
11_L	608_V	1.055	0.21
391_N	401_Q	1.053	0.21
171_L	405_R	1.049	0.21
376_Y	400_P	1.047	0.20
272_G	536_D	1.046	0.20
190_Y	446_D	1.046	0.20
75_G	481_A	1.037	0.20
365_G	440_G	1.035	0.20
154_V	287_E	1.034	0.20
508_Y	579_N	1.034	0.20
467_M	536_D	1.032	0.20
438_R	511_Y	1.032	0.20
113_E	479_R	1.031	0.20
425_Y	429_N	1.030	0.20
452_L	455_I	1.029	0.20
260_I	263_Y	1.027	0.20
119_P	160_Q	1.027	0.20
154_V	405_R	1.026	0.20
80_A	551_F	1.024	0.20
266_G	292_L	1.024	0.20
152_F	289_L	1.021	0.20
131_T	289_L	1.018	0.20
115_T	274_I	1.012	0.20
112_V	520_L	1.012	0.20
52_N	108_K	1.005	0.19
458_N	528_S	0.999	0.19
35_R	78_L	0.999	0.19
428_V	437_G	0.996	0.19
108_K	597_M	0.994	0.19
91_I	95_L	0.993	0.19
91_I	600_L	0.992	0.19
365_G	438_R	0.990	0.19
515_R	564_L	0.989	0.19
67_L	221_L	0.989	0.19
404_L	510_Q	0.986	0.19
590_E	593_P	0.985	0.19
99_Y	447_E	0.982	0.19
289_L	376_Y	0.979	0.19
157_T	400_P	0.978	0.19
68_I	320_S	0.977	0.19
59_L	551_F	0.975	0.19
315_L	525_E	0.975	0.19
159_R	164_L	0.972	0.19
289_L	442_I	0.972	0.19
52_N	610_L	0.969	0.19
451_K	495_L	0.968	0.19
312_N	487_A	0.968	0.19
586_R	590_E	0.968	0.19
420_L	425_Y	0.967	0.19
586_R	589_Q	0.965	0.18
155_N	362_R	0.963	0.18
157_T	380_K	0.960	0.18
493_F	515_R	0.958	0.18
167_G	506_G	0.956	0.18
376_Y	391_N	0.956	0.18
128_L	132_I	0.956	0.18
99_Y	367_T	0.955	0.18
15_V	22_S	0.955	0.18
382_N	385_N	0.953	0.18
60_L	78_L	0.952	0.18
263_Y	300_D	0.950	0.18
365_G	515_R	0.949	0.18
473_I	570_F	0.949	0.18
423_Y	427_M	0.944	0.18
399_I	478_L	0.940	0.18
381_F	389_V	0.938	0.18
377_T	380_K	0.937	0.18
309_N	568_V	0.935	0.18
504_N	511_Y	0.935	0.18
119_P	274_I	0.932	0.18
457_R	461_K	0.930	0.18
9_K	535_S	0.929	0.18
11_L	203_R	0.928	0.18
314_V	584_K	0.928	0.18
57_A	73_V	0.926	0.18
228_A	236_E	0.924	0.18
370_T	380_K	0.923	0.18
528_S	538_V	0.921	0.17
7_A	578_F	0.921	0.17
17_A	315_L	0.921	0.17
516_A	578_F	0.921	0.17
115_T	152_F	0.918	0.17
18_Q	22_S	0.917	0.17
253_E	257_G	0.915	0.17
129_R	158_G	0.912	0.17
510_Q	625_M	0.908	0.17
123_L	284_G	0.907	0.17
68_I	375_A	0.902	0.17
6_R	9_K	0.902	0.17
116_S	129_R	0.901	0.17
293_N	316_K	0.898	0.17
12_A	316_K	0.894	0.17
159_R	444_T	0.894	0.17
199_I	308_E	0.894	0.17
117_A	503_Q	0.891	0.17
540_D	575_S	0.890	0.17
156_D	302_E	0.889	0.17
118_N	156_D	0.889	0.17
134_G	156_D	0.889	0.17
156_D	369_Y	0.889	0.17
80_A	533_D	0.886	0.17
336_D	588_L	0.885	0.17
190_Y	368_L	0.885	0.17
130_N	181_K	0.884	0.17
145_G	564_L	0.882	0.17
65_G	544_I	0.882	0.17
305_L	311_V	0.882	0.17
30_I	530_D	0.882	0.17
258_E	262_K	0.879	0.17
264_E	417_A	0.879	0.17
160_Q	375_A	0.878	0.17
456_V	619_I	0.878	0.17
443_I	513_Y	0.876	0.16
393_I	405_R	0.876	0.16
458_N	468_E	0.875	0.16
412_G	578_F	0.874	0.16
443_I	481_A	0.868	0.16
40_D	552_P	0.868	0.16
220_E	610_L	0.867	0.16
616_V	623_E	0.866	0.16
219_R	451_K	0.865	0.16
397_Q	426_G	0.864	0.16
393_I	474_A	0.860	0.16
14_Y	18_Q	0.859	0.16
221_L	616_V	0.859	0.16
267_N	367_T	0.858	0.16
136_A	547_L	0.858	0.16
333_L	407_A	0.856	0.16
364_D	397_Q	0.855	0.16
11_L	18_Q	0.853	0.16
541_K	581_W	0.851	0.16
46_P	50_K	0.844	0.16
171_L	196_I	0.844	0.16
87_I	445_I	0.843	0.16
360_L	519_I	0.842	0.16
517_A	607_S	0.842	0.16
530_D	534_F	0.840	0.16
387_D	560_D	0.839	0.16
556_K	561_N	0.839	0.16
266_G	271_K	0.838	0.16
283_E	593_P	0.837	0.16
318_L	321_S	0.835	0.16
150_V	361_M	0.835	0.16
121_H	503_Q	0.834	0.16
114_H	176_P	0.833	0.16
24_E	567_L	0.833	0.16
313_E	319_L	0.832	0.16
410_L	469_N	0.832	0.16
103_K	554_V	0.831	0.16
528_S	610_L	0.830	0.16
130_N	133_L	0.829	0.15
555_F	567_L	0.829	0.15
159_R	163_V	0.829	0.15
150_V	203_R	0.828	0.15
110_I	169_K	0.827	0.15
16_A	227_I	0.825	0.15
158_G	564_L	0.825	0.15
117_A	401_Q	0.824	0.15
97_D	525_E	0.824	0.15
531_K	539_G	0.823	0.15
335_L	393_I	0.823	0.15
129_R	440_G	0.822	0.15
227_I	230_D	0.822	0.15
393_I	400_P	0.821	0.15
115_T	401_Q	0.821	0.15
30_I	595_K	0.820	0.15
112_V	417_A	0.818	0.15
119_P	400_P	0.818	0.15
480_Y	622_L	0.817	0.15
119_P	282_L	0.816	0.15
157_T	437_G	0.815	0.15
133_L	579_N	0.815	0.15
152_F	376_Y	0.815	0.15
575_S	600_L	0.814	0.15
575_S	625_M	0.814	0.15
600_L	621_S	0.813	0.15
137_L	623_E	0.813	0.15
579_N	582_Y	0.812	0.15
121_H	391_N	0.812	0.15
144_R	555_F	0.808	0.15
45_L	57_A	0.807	0.15
54_N	270_L	0.805	0.15
288_T	428_V	0.805	0.15
146_H	590_E	0.801	0.15
39_G	145_G	0.801	0.15
544_I	577_I	0.800	0.15
79_N	126_G	0.798	0.15
455_I	470_I	0.797	0.15
293_N	309_N	0.796	0.15
252_P	260_I	0.795	0.15
386_A	425_Y	0.793	0.15
145_G	365_G	0.791	0.15
54_N	76_I	0.790	0.15
130_N	157_T	0.789	0.15
362_R	446_D	0.788	0.15
482_I	485_V	0.787	0.15
92_F	609_V	0.786	0.15
154_V	447_E	0.786	0.15
506_G	514_A	0.782	0.15
428_V	522_K	0.782	0.15
131_T	160_Q	0.781	0.15
244_D	248_A	0.781	0.15
69_E	271_K	0.779	0.15
155_N	482_I	0.777	0.14
302_E	373_D	0.777	0.14
118_N	373_D	0.777	0.14
369_Y	373_D	0.777	0.14
134_G	373_D	0.777	0.14
445_I	508_Y	0.777	0.14
256_I	518_N	0.777	0.14
120_I	161_V	0.775	0.14
509_L	617_L	0.773	0.14
412_G	606_V	0.773	0.14
120_I	155_N	0.772	0.14
13_E	55_E	0.770	0.14
530_D	609_V	0.770	0.14
59_L	312_N	0.770	0.14
543_N	551_F	0.767	0.14
158_G	440_G	0.766	0.14
113_E	380_K	0.763	0.14
24_E	95_L	0.758	0.14
186_L	333_L	0.758	0.14
160_Q	357_P	0.756	0.14
113_E	307_W	0.755	0.14
148_V	602_I	0.755	0.14
227_I	530_D	0.754	0.14
320_S	550_K	0.754	0.14
463_K	512_T	0.753	0.14
397_Q	422_H	0.752	0.14
195_V	390_I	0.751	0.14
421_L	562_L	0.751	0.14
115_T	376_Y	0.750	0.14
225_I	245_A	0.750	0.14
412_G	504_N	0.749	0.14
45_L	233_N	0.746	0.14
114_H	400_P	0.744	0.14
58_K	557_N	0.743	0.14
121_H	401_Q	0.743	0.14
473_I	625_M	0.742	0.14
460_L	575_S	0.740	0.14
261_K	265_E	0.740	0.14
98_S	101_L	0.739	0.14
242_L	620_R	0.739	0.14
97_D	548_I	0.737	0.14
54_N	75_G	0.737	0.14
292_L	432_G	0.736	0.14
10_E	14_Y	0.735	0.14
145_G	515_R	0.735	0.14
358_L	403_Q	0.734	0.14
94_K	143_A	0.734	0.14
370_T	400_P	0.732	0.14
360_L	601_Y	0.729	0.14
129_R	438_R	0.729	0.14
114_H	437_G	0.728	0.14
167_G	393_I	0.727	0.14
274_I	289_L	0.727	0.14
97_D	237_V	0.726	0.14
34_P	77_Y	0.726	0.14
41_L	140_A	0.726	0.14
66_E	98_S	0.724	0.13
291_K	294_I	0.723	0.13
146_H	386_A	0.723	0.13
561_N	596_R	0.723	0.13
394_A	427_M	0.723	0.13
176_P	447_E	0.721	0.13
427_M	506_G	0.721	0.13
16_A	22_S	0.720	0.13
514_A	549_A	0.718	0.13
168_L	252_P	0.716	0.13
30_I	527_L	0.714	0.13
555_F	593_P	0.713	0.13
15_V	20_G	0.712	0.13
301_Y	424_S	0.711	0.13
129_R	373_D	0.711	0.13
531_K	624_R	0.711	0.13
278_I	289_L	0.710	0.13
157_T	391_N	0.710	0.13
17_A	89_V	0.709	0.13
366_T	425_Y	0.709	0.13
186_L	190_Y	0.709	0.13
111_V	389_V	0.708	0.13
133_L	425_Y	0.708	0.13
167_G	445_I	0.707	0.13
420_L	428_V	0.707	0.13
30_I	37_E	0.706	0.13
367_T	372_R	0.706	0.13
50_K	58_K	0.705	0.13
303_S	372_R	0.705	0.13
119_P	289_L	0.704	0.13
547_L	561_N	0.704	0.13
123_L	282_L	0.703	0.13
424_S	430_I	0.701	0.13
130_N	446_D	0.701	0.13
457_R	469_N	0.701	0.13
360_L	414_S	0.700	0.13
22_S	528_S	0.700	0.13
223_E	242_L	0.700	0.13
117_A	426_G	0.699	0.13
614_L	619_I	0.696	0.13
527_L	580_S	0.696	0.13
513_Y	517_A	0.695	0.13
123_L	446_D	0.694	0.13
167_G	474_A	0.692	0.13
267_N	539_G	0.692	0.13
11_L	65_G	0.690	0.13
128_L	599_R	0.689	0.13
437_G	505_S	0.688	0.13
113_E	394_A	0.687	0.13
97_D	101_L	0.687	0.13
40_D	570_F	0.684	0.13
110_I	409_E	0.683	0.13
163_V	444_T	0.682	0.13
509_L	608_V	0.681	0.13
155_N	491_L	0.680	0.13
284_G	425_Y	0.676	0.13
132_I	482_I	0.676	0.13
127_H	443_I	0.676	0.13
121_H	437_G	0.675	0.13
449_Y	478_L	0.673	0.13
368_L	403_Q	0.672	0.13
158_G	438_R	0.671	0.13
374_I	596_R	0.670	0.13
151_R	358_L	0.669	0.13
494_D	601_Y	0.668	0.12
113_E	401_Q	0.667	0.12
396_E	434_R	0.667	0.12
456_V	486_S	0.666	0.12
477_A	625_M	0.665	0.12
543_N	577_I	0.664	0.12
493_F	511_Y	0.664	0.12
104_I	538_V	0.662	0.12
448_I	548_I	0.661	0.12
576_D	606_V	0.660	0.12
116_S	190_Y	0.659	0.12
45_L	566_D	0.657	0.12
68_I	269_E	0.657	0.12
474_A	512_T	0.656	0.12
66_E	555_F	0.655	0.12
529_M	610_L	0.655	0.12
422_H	506_G	0.654	0.12
291_K	450_E	0.654	0.12
577_I	610_L	0.653	0.12
114_H	512_T	0.648	0.12
114_H	401_Q	0.646	0.12
117_A	479_R	0.646	0.12
356_P	372_R	0.645	0.12
514_A	623_E	0.645	0.12
290_S	450_E	0.645	0.12
72_E	624_R	0.643	0.12
119_P	444_T	0.643	0.12
170_L	221_L	0.643	0.12
181_K	288_T	0.642	0.12
336_D	474_A	0.641	0.12
480_Y	619_I	0.640	0.12
366_T	427_M	0.640	0.12
112_V	142_K	0.638	0.12
113_E	376_Y	0.638	0.12
43_L	473_I	0.638	0.12
303_S	397_Q	0.637	0.12
28_K	586_R	0.637	0.12
340_G	513_Y	0.637	0.12
79_N	187_G	0.636	0.12
164_L	394_A	0.636	0.12
111_V	268_D	0.635	0.12
22_S	229_N	0.634	0.12
581_W	619_I	0.633	0.12
194_N	198_E	0.633	0.12
153_Y	386_A	0.632	0.12
128_L	426_G	0.631	0.12
56_K	138_A	0.631	0.12
143_A	551_F	0.631	0.12
61_Q	82_L	0.631	0.12
364_D	425_Y	0.630	0.12
263_Y	307_W	0.630	0.12
523_S	573_E	0.629	0.12
154_V	582_Y	0.629	0.12
522_K	587_V	0.628	0.12
30_I	611_K	0.628	0.12
279_S	604_K	0.627	0.12
75_G	132_I	0.627	0.12
319_L	520_L	0.625	0.12
555_F	558_A	0.624	0.12
278_I	356_P	0.623	0.12
319_L	326_P	0.622	0.12
13_E	251_E	0.621	0.12
389_V	567_L	0.619	0.12
425_Y	489_K	0.618	0.12
16_A	593_P	0.616	0.12
122_P	330_V	0.616	0.12
224_L	228_A	0.616	0.12
21_I	26_V	0.614	0.12
50_K	404_L	0.614	0.12
541_K	585_E	0.614	0.12
117_A	380_K	0.613	0.12
245_A	249_K	0.610	0.12
99_Y	545_L	0.610	0.12
394_A	403_Q	0.610	0.12
288_T	435_M	0.609	0.12
75_G	599_R	0.608	0.12
104_I	107_P	0.608	0.12
127_H	510_Q	0.608	0.12
455_I	460_L	0.608	0.12
525_E	624_R	0.608	0.12
362_R	442_I	0.607	0.11
155_N	394_A	0.607	0.11
84_L	308_E	0.606	0.11
534_F	606_V	0.606	0.11
476_A	619_I	0.606	0.11
508_Y	512_T	0.605	0.11
324_K	382_N	0.605	0.11
543_N	591_Q	0.605	0.11
93_S	555_F	0.604	0.11
395_E	518_N	0.604	0.11
120_I	396_E	0.603	0.11
20_G	68_I	0.602	0.11
120_I	162_A	0.601	0.11
120_I	301_Y	0.600	0.11
391_N	425_Y	0.600	0.11
308_E	423_Y	0.600	0.11
366_T	446_D	0.599	0.11
128_L	380_K	0.598	0.11
154_V	559_V	0.597	0.11
121_H	405_R	0.597	0.11
199_I	610_L	0.597	0.11
15_V	528_S	0.597	0.11
57_A	318_L	0.596	0.11
40_D	45_L	0.596	0.11
426_G	430_I	0.595	0.11
115_T	171_L	0.595	0.11
68_I	538_V	0.594	0.11
155_N	301_Y	0.594	0.11
56_K	154_V	0.593	0.11
116_S	373_D	0.592	0.11
225_I	229_N	0.592	0.11
248_A	272_G	0.592	0.11
408_L	420_L	0.592	0.11
121_H	305_L	0.591	0.11
264_E	267_N	0.591	0.11
93_S	283_E	0.590	0.11
376_Y	405_R	0.590	0.11
266_G	471_D	0.590	0.11
596_R	615_S	0.589	0.11
194_N	394_A	0.589	0.11
59_L	97_D	0.589	0.11
392_V	617_L	0.588	0.11
164_L	260_I	0.588	0.11
414_S	459_K	0.588	0.11
222_D	320_S	0.588	0.11
296_F	494_D	0.587	0.11
532_V	582_Y	0.587	0.11
360_L	543_N	0.587	0.11
251_E	254_K	0.586	0.11
261_K	270_L	0.586	0.11
108_K	609_V	0.586	0.11
117_A	442_I	0.584	0.11
55_E	258_E	0.584	0.11
567_L	617_L	0.584	0.11
508_Y	614_L	0.582	0.11
313_E	414_S	0.582	0.11
6_R	600_L	0.581	0.11
322_S	474_A	0.580	0.11
271_K	521_A	0.579	0.11
123_L	259_I	0.579	0.11
66_E	97_D	0.579	0.11
303_S	408_L	0.578	0.11
129_R	156_D	0.578	0.11
256_I	334_D	0.578	0.11
423_Y	490_P	0.577	0.11
316_K	520_L	0.576	0.11
171_L	400_P	0.576	0.11
76_I	285_F	0.575	0.11
370_T	391_N	0.575	0.11
374_I	501_F	0.575	0.11
152_F	380_K	0.574	0.11
138_A	454_N	0.574	0.11
131_T	482_I	0.574	0.11
571_L	612_N	0.574	0.11
57_A	69_E	0.574	0.11
274_I	303_S	0.573	0.11
187_G	558_A	0.573	0.11
392_V	562_L	0.572	0.11
58_K	73_V	0.571	0.11
113_E	263_Y	0.571	0.11
186_L	377_T	0.570	0.11
136_A	614_L	0.570	0.11
228_A	232_R	0.570	0.11
57_A	387_D	0.570	0.11
300_D	307_W	0.569	0.11
119_P	482_I	0.569	0.11
425_Y	482_I	0.569	0.11
132_I	395_E	0.568	0.11
59_L	112_V	0.568	0.11
69_E	237_V	0.568	0.11
112_V	407_A	0.567	0.11
148_V	493_F	0.567	0.11
363_S	522_K	0.566	0.11
157_T	426_G	0.566	0.11
187_G	435_M	0.563	0.11
16_A	283_E	0.562	0.11
547_L	550_K	0.562	0.11
227_I	591_Q	0.562	0.11
99_Y	239_F	0.562	0.11
244_D	609_V	0.562	0.11
125_I	482_I	0.562	0.11
396_E	598_L	0.560	0.11
154_V	299_F	0.560	0.11
500_S	512_T	0.560	0.11
129_R	515_R	0.560	0.11
438_R	564_L	0.560	0.11
131_T	498_I	0.559	0.11
130_N	284_G	0.558	0.11
299_F	499_T	0.558	0.11
155_N	164_L	0.558	0.11
329_G	552_P	0.557	0.11
127_H	508_Y	0.557	0.11
234_R	610_L	0.556	0.11
438_R	522_K	0.556	0.11
536_D	595_K	0.554	0.11
413_Y	539_G	0.554	0.11
548_I	570_F	0.554	0.11
139_R	287_E	0.554	0.11
41_L	308_E	0.553	0.11
183_D	362_R	0.552	0.11
138_A	232_R	0.551	0.11
226_V	596_R	0.551	0.11
360_L	524_T	0.550	0.11
264_E	522_K	0.546	0.11
308_E	509_L	0.545	0.11
551_F	613_G	0.544	0.11
130_N	263_Y	0.543	0.11
120_I	130_N	0.543	0.11
160_Q	376_Y	0.542	0.11
146_H	587_V	0.541	0.10
109_R	466_N	0.541	0.10
119_P	152_F	0.540	0.10
133_L	162_A	0.540	0.10
68_I	73_V	0.539	0.10
226_V	229_N	0.538	0.10
171_L	393_I	0.538	0.10
325_I	608_V	0.538	0.10
41_L	315_L	0.538	0.10
7_A	542_R	0.537	0.10
331_I	404_L	0.537	0.10
301_Y	362_R	0.537	0.10
496_N	514_A	0.536	0.10
152_F	300_D	0.535	0.10
175_D	268_D	0.534	0.10
434_R	498_I	0.533	0.10
156_D	303_S	0.532	0.10
374_I	454_N	0.532	0.10
79_N	124_H	0.529	0.10
68_I	229_N	0.529	0.10
7_A	449_Y	0.529	0.10
179_N	281_A	0.528	0.10
396_E	485_V	0.528	0.10
362_R	366_T	0.528	0.10
228_A	231_L	0.528	0.10
61_Q	267_N	0.527	0.10
119_P	162_A	0.526	0.10
98_S	414_S	0.525	0.10
82_L	149_N	0.525	0.10
456_V	474_A	0.525	0.10
254_K	258_E	0.525	0.10
164_L	403_Q	0.525	0.10
138_A	529_M	0.524	0.10
7_A	82_L	0.524	0.10
68_I	450_E	0.524	0.10
163_V	476_A	0.524	0.10
468_E	574_L	0.523	0.10
245_A	535_S	0.523	0.10
40_D	329_G	0.523	0.10
160_Q	438_R	0.522	0.10
266_G	509_L	0.522	0.10
152_F	299_F	0.522	0.10
300_D	400_P	0.522	0.10
509_L	585_E	0.521	0.10
99_Y	313_E	0.520	0.10
281_A	489_K	0.520	0.10
59_L	196_I	0.520	0.10
561_N	591_Q	0.519	0.10
372_R	403_Q	0.519	0.10
42_S	447_E	0.518	0.10
39_G	532_V	0.517	0.10
598_L	602_I	0.516	0.10
140_A	392_V	0.516	0.10
315_L	454_N	0.516	0.10
46_P	132_I	0.516	0.10
519_I	522_K	0.516	0.10
167_G	171_L	0.515	0.10
172_G	477_A	0.515	0.10
33_P	447_E	0.515	0.10
328_K	332_A	0.514	0.10
358_L	377_T	0.513	0.10
148_V	537_L	0.512	0.10
124_H	397_Q	0.512	0.10
112_V	374_I	0.511	0.10
391_N	437_G	0.510	0.10
520_L	600_L	0.509	0.10
406_G	409_E	0.509	0.10
143_A	313_E	0.506	0.10
167_G	172_G	0.506	0.10
153_Y	372_R	0.506	0.10
419_N	423_Y	0.506	0.10
13_E	48_L	0.505	0.10
440_G	515_R	0.505	0.10
61_Q	104_I	0.504	0.10
242_L	267_N	0.504	0.10
456_V	551_F	0.502	0.10
300_D	379_F	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1f7uA	1	0.8992	100	0.32	Contact Map
4r3zB	1	0.888	100	0.36	Contact Map
4obyA	1	0.8736	100	0.364	Contact Map
4q2tA	1	0.888	100	0.367	Contact Map
2zueA	1	0.8912	100	0.369	Contact Map
1iq0A	1	0.8592	100	0.378	Contact Map
3fnrA	1	0.7008	100	0.563	Contact Map
3tqoA	1	0.5792	100	0.758	Contact Map
3h99A	1	0.6176	100	0.77	Contact Map
1li5A	1	0.5792	100	0.78	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0153 seconds.