Q97ZM3 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZM3 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97ZM3	Sequences: MLKKIGFLVNPYAGSGGRIGKKGSDELNIENPEIPMRVTRFLSKAPEDAIYLTPRLKMGEIHFTKSKLKYETIPIGEKKKTTRYDTIDSVREFVKRGVDIIVFVGGDGTARDVAEGLQGAEIPILGVPAGVKMHSGVFANTPEAAAILLTKFLHDEAKTVKEEILDIDEEAYRKGTYFVKLYHIVLTISSNNLLTPSKGEMQYSEDELGEIADYIIDNMDDNITYIMGPGSTVKYIERKLKIDTPFLGIDIIRGKKLIKENVNYFDLINLTGELKIVLTPIGKQGFLIGRGNLELGPIFLRKVKKDDLIVVSTFSKLYTINCLRIDTGDENLDKLFSGVYNVIVGYNKFYAIKTCQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	356 (349)
Sequences:	338 (256)
Seq/√Len:	13.7

HALSA - Q9HRC1
SULSO - Q97ZM3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
15_S	24_S	4.112	1.00
251_I	262_V	4.110	1.00
276_I	303_V	3.896	1.00
236_I	311_V	3.874	1.00
51_Y	63_F	3.743	0.99
139_A	145_A	3.575	0.99
288_I	327_T	3.547	0.99
278_L	288_I	3.508	0.99
259_K	262_V	3.453	0.99
87_I	112_D	3.307	0.98
251_I	270_L	3.097	0.98
60_E	64_T	3.092	0.98
325_I	354_T	3.046	0.97
288_I	300_L	3.046	0.97
50_I	71_E	2.908	0.97
63_F	68_L	2.890	0.96
237_E	244_T	2.854	0.96
41_F	146_A	2.848	0.96
40_R	143_E	2.740	0.95
12_Y	24_S	2.739	0.95
310_V	340_Y	2.728	0.95
54_P	74_P	2.677	0.94
301_R	332_L	2.600	0.93
8_L	90_V	2.590	0.93
39_T	65_K	2.576	0.93
226_I	267_L	2.567	0.93
124_I	185_V	2.539	0.93
163_E	181_L	2.529	0.92
7_F	38_V	2.518	0.92
104_V	127_V	2.471	0.92
227_M	233_V	2.456	0.91
268_I	298_I	2.430	0.91
264_Y	296_G	2.418	0.91
4_K	50_I	2.366	0.90
264_Y	299_F	2.342	0.89
98_V	101_I	2.320	0.89
227_M	237_E	2.310	0.88
288_I	308_L	2.282	0.88
54_P	89_S	2.224	0.86
114_A	183_H	2.166	0.85
141_T	324_R	2.116	0.83
332_L	335_L	2.106	0.83
224_T	251_I	2.047	0.81
165_L	181_L	2.023	0.80
251_I	267_L	2.017	0.80
328_G	333_D	1.955	0.78
12_Y	15_S	1.937	0.77
63_F	70_Y	1.912	0.76
300_L	336_F	1.886	0.75
222_N	254_G	1.848	0.74
56_L	100_I	1.838	0.74
133_M	138_F	1.830	0.73
8_L	113_V	1.806	0.72
100_I	149_L	1.801	0.72
94_V	116_G	1.774	0.71
60_E	72_T	1.760	0.70
19_I	24_S	1.750	0.70
263_N	266_D	1.731	0.69
226_I	262_V	1.730	0.69
301_R	329_D	1.729	0.69
90_V	119_G	1.719	0.68
90_V	113_V	1.718	0.68
226_I	251_I	1.717	0.68
39_T	66_S	1.701	0.67
133_M	146_A	1.698	0.67
314_F	348_K	1.698	0.67
304_K	307_D	1.656	0.65
251_I	259_K	1.651	0.65
264_Y	298_I	1.644	0.65
116_G	185_V	1.623	0.64
66_S	70_Y	1.605	0.63
54_P	58_M	1.603	0.63
9_V	68_L	1.603	0.63
165_L	351_A	1.598	0.62
202_Q	210_E	1.595	0.62
55_R	76_G	1.558	0.60
226_I	295_L	1.544	0.60
9_V	62_H	1.542	0.59
21_K	26_E	1.530	0.59
20_G	263_N	1.490	0.57
214_Y	343_I	1.482	0.56
165_L	179_V	1.472	0.56
224_T	262_V	1.469	0.56
15_S	19_I	1.452	0.55
101_I	122_I	1.449	0.55
84_Y	88_D	1.421	0.53
190_S	279_T	1.419	0.53
19_I	32_P	1.412	0.53
305_K	308_L	1.405	0.52
148_L	187_T	1.399	0.52
271_T	299_F	1.389	0.51
141_T	215_I	1.388	0.51
214_Y	347_N	1.357	0.50
7_F	127_V	1.351	0.49
62_H	66_S	1.343	0.49
95_K	310_V	1.330	0.48
20_G	295_L	1.321	0.48
297_P	333_D	1.319	0.48
339_V	353_K	1.307	0.47
297_P	329_D	1.296	0.46
277_V	311_V	1.293	0.46
288_I	336_F	1.278	0.45
93_F	101_I	1.268	0.45
103_F	110_A	1.262	0.45
224_T	253_R	1.262	0.45
179_V	200_E	1.255	0.44
275_K	307_D	1.244	0.44
15_S	18_R	1.244	0.44
81_T	94_V	1.240	0.43
81_T	313_T	1.236	0.43
104_V	280_P	1.230	0.43
177_Y	200_E	1.220	0.42
55_R	74_P	1.209	0.42
175_G	326_D	1.205	0.42
254_G	274_L	1.201	0.41
38_V	127_V	1.184	0.41
102_V	149_L	1.181	0.40
26_E	296_G	1.179	0.40
51_Y	300_L	1.164	0.39
267_L	271_T	1.163	0.39
161_K	317_L	1.146	0.39
298_I	302_K	1.143	0.38
170_E	174_K	1.127	0.38
305_K	340_Y	1.127	0.38
301_R	335_L	1.119	0.37
219_M	252_I	1.116	0.37
90_V	117_L	1.114	0.37
211_I	216_I	1.113	0.37
261_N	294_E	1.113	0.37
49_A	68_L	1.109	0.37
111_R	182_Y	1.105	0.36
201_M	208_L	1.101	0.36
78_K	82_T	1.087	0.36
104_V	136_G	1.086	0.36
138_F	286_F	1.084	0.35
113_V	124_I	1.078	0.35
27_L	30_E	1.077	0.35
30_E	172_Y	1.075	0.35
181_L	184_I	1.073	0.35
39_T	62_H	1.068	0.35
172_Y	286_F	1.068	0.35
18_R	37_R	1.050	0.34
92_E	95_K	1.047	0.34
35_P	62_H	1.044	0.34
212_A	240_L	1.040	0.33
45_A	127_V	1.036	0.33
324_R	352_I	1.019	0.32
9_V	66_S	1.016	0.32
76_G	81_T	1.016	0.32
92_E	96_R	1.014	0.32
124_I	164_I	1.008	0.32
88_D	95_K	0.998	0.31
339_V	351_A	0.996	0.31
223_I	275_K	0.991	0.31
182_Y	252_I	0.990	0.31
4_K	189_S	0.987	0.31
243_D	260_E	0.985	0.31
88_D	92_E	0.981	0.31
341_N	353_K	0.981	0.31
215_I	277_V	0.981	0.31
197_S	286_F	0.980	0.31
41_F	133_M	0.975	0.30
101_I	272_G	0.971	0.30
146_A	190_S	0.970	0.30
61_I	92_E	0.966	0.30
20_G	104_V	0.959	0.30
46_P	64_T	0.958	0.30
90_V	93_F	0.957	0.29
9_V	354_T	0.956	0.29
322_C	352_I	0.955	0.29
299_F	327_T	0.953	0.29
64_T	70_Y	0.950	0.29
185_V	324_R	0.947	0.29
83_R	87_I	0.944	0.29
51_Y	336_F	0.943	0.29
227_M	277_V	0.941	0.29
141_T	233_V	0.939	0.29
231_S	243_D	0.937	0.29
182_Y	194_L	0.937	0.29
220_D	254_G	0.933	0.28
5_I	51_Y	0.929	0.28
9_V	35_P	0.926	0.28
344_V	350_Y	0.926	0.28
287_L	310_V	0.923	0.28
271_T	287_L	0.923	0.28
172_Y	229_P	0.917	0.28
87_I	115_E	0.916	0.28
4_K	302_K	0.914	0.28
276_I	295_L	0.903	0.27
329_D	333_D	0.900	0.27
300_L	325_I	0.900	0.27
171_A	178_F	0.897	0.27
300_L	304_K	0.897	0.27
24_S	152_F	0.893	0.27
127_V	233_V	0.888	0.26
219_M	225_Y	0.884	0.26
308_L	351_A	0.881	0.26
163_E	204_S	0.877	0.26
285_G	323_L	0.877	0.26
229_P	263_N	0.877	0.26
160_V	189_S	0.874	0.26
217_D	351_A	0.871	0.26
117_L	183_H	0.869	0.26
20_G	229_P	0.864	0.26
172_Y	279_T	0.862	0.25
267_L	333_D	0.862	0.25
90_V	317_L	0.859	0.25
52_L	73_I	0.858	0.25
13_A	16_G	0.857	0.25
180_K	334_K	0.851	0.25
211_I	217_D	0.850	0.25
175_G	345_G	0.849	0.25
327_T	336_F	0.848	0.25
276_I	279_T	0.838	0.24
131_V	229_P	0.837	0.24
41_F	102_V	0.836	0.24
297_P	332_L	0.833	0.24
340_Y	354_T	0.833	0.24
11_P	16_G	0.831	0.24
11_P	14_G	0.831	0.24
229_P	295_L	0.829	0.24
149_L	204_S	0.828	0.24
61_I	65_K	0.827	0.24
216_I	219_M	0.824	0.24
58_M	89_S	0.818	0.24
231_S	279_T	0.817	0.24
153_L	310_V	0.812	0.23
113_V	149_L	0.812	0.23
167_I	172_Y	0.809	0.23
226_I	276_I	0.806	0.23
42_L	175_G	0.805	0.23
5_I	50_I	0.802	0.23
196_P	277_V	0.800	0.23
164_I	313_T	0.794	0.23
189_S	317_L	0.793	0.23
244_T	280_P	0.788	0.23
271_T	302_K	0.788	0.23
69_K	180_K	0.783	0.22
33_E	37_R	0.783	0.22
237_E	242_I	0.782	0.22
111_R	293_L	0.780	0.22
72_T	309_I	0.780	0.22
134_H	193_L	0.778	0.22
100_I	192_N	0.778	0.22
134_H	284_Q	0.775	0.22
7_F	208_L	0.772	0.22
208_L	280_P	0.771	0.22
115_E	194_L	0.765	0.22
299_F	305_K	0.765	0.22
147_I	236_I	0.761	0.22
49_A	153_L	0.760	0.21
91_R	121_E	0.760	0.21
153_L	339_V	0.759	0.21
148_L	194_L	0.758	0.21
112_D	287_L	0.755	0.21
15_S	32_P	0.755	0.21
146_A	344_V	0.752	0.21
81_T	269_N	0.752	0.21
248_G	261_N	0.750	0.21
51_Y	76_G	0.748	0.21
24_S	244_T	0.748	0.21
219_M	313_T	0.745	0.21
10_N	16_G	0.744	0.21
10_N	14_G	0.744	0.21
301_R	354_T	0.742	0.21
38_V	104_V	0.742	0.21
249_I	336_F	0.741	0.21
186_L	328_G	0.738	0.21
86_T	342_V	0.738	0.21
21_K	296_G	0.736	0.21
58_M	284_Q	0.733	0.21
83_R	213_D	0.731	0.20
125_L	310_V	0.727	0.20
148_L	164_I	0.725	0.20
131_V	325_I	0.723	0.20
92_E	270_L	0.717	0.20
82_T	330_E	0.714	0.20
60_E	156_E	0.710	0.20
38_V	45_A	0.707	0.20
233_V	336_F	0.706	0.20
211_I	219_M	0.703	0.20
188_I	248_G	0.700	0.19
19_I	26_E	0.699	0.19
272_G	354_T	0.697	0.19
93_F	119_G	0.696	0.19
74_P	139_A	0.696	0.19
7_F	93_F	0.696	0.19
302_K	332_L	0.696	0.19
252_I	313_T	0.695	0.19
113_V	213_D	0.693	0.19
209_G	264_Y	0.692	0.19
7_F	63_F	0.692	0.19
10_N	13_A	0.692	0.19
140_N	202_Q	0.691	0.19
37_R	112_D	0.687	0.19
227_M	264_Y	0.685	0.19
267_L	270_L	0.684	0.19
216_I	225_Y	0.677	0.19
216_I	236_I	0.676	0.19
152_F	327_T	0.676	0.19
188_I	261_N	0.675	0.19
245_P	313_T	0.675	0.19
254_G	295_L	0.674	0.19
6_G	10_N	0.673	0.19
104_V	179_V	0.673	0.19
57_K	61_I	0.672	0.18
275_K	343_I	0.671	0.18
221_D	331_N	0.670	0.18
265_F	269_N	0.670	0.18
119_G	315_S	0.669	0.18
264_Y	268_I	0.667	0.18
41_F	129_A	0.666	0.18
182_Y	219_M	0.665	0.18
15_S	131_V	0.660	0.18
112_D	115_E	0.659	0.18
172_Y	348_K	0.659	0.18
251_I	333_D	0.658	0.18
163_E	184_I	0.658	0.18
101_I	183_H	0.656	0.18
54_P	310_V	0.656	0.18
30_E	82_T	0.656	0.18
136_G	208_L	0.656	0.18
48_D	154_H	0.653	0.18
69_K	218_N	0.650	0.18
262_V	299_F	0.650	0.18
259_K	266_D	0.649	0.18
15_S	353_K	0.649	0.18
226_I	306_D	0.648	0.18
104_V	283_K	0.647	0.18
113_V	266_D	0.647	0.18
139_A	262_V	0.646	0.18
131_V	191_N	0.644	0.18
134_H	195_T	0.644	0.18
327_T	333_D	0.644	0.18
287_L	309_I	0.644	0.18
179_V	267_L	0.642	0.18
281_I	326_D	0.642	0.18
194_L	272_G	0.641	0.17
104_V	146_A	0.640	0.17
72_T	351_A	0.639	0.17
91_R	218_N	0.638	0.17
54_P	73_I	0.637	0.17
151_K	156_E	0.635	0.17
55_R	113_V	0.634	0.17
341_N	349_F	0.630	0.17
308_L	336_F	0.630	0.17
141_T	262_V	0.629	0.17
16_G	23_G	0.629	0.17
14_G	23_G	0.629	0.17
121_E	331_N	0.626	0.17
146_A	179_V	0.624	0.17
87_I	171_A	0.623	0.17
242_I	252_I	0.623	0.17
195_T	245_P	0.622	0.17
156_E	233_V	0.621	0.17
199_G	206_D	0.620	0.17
169_E	173_R	0.619	0.17
222_N	256_K	0.618	0.17
64_T	121_E	0.618	0.17
111_R	198_K	0.618	0.17
338_G	344_V	0.618	0.17
129_A	133_M	0.617	0.17
146_A	293_L	0.614	0.17
323_L	345_G	0.613	0.17
47_E	88_D	0.611	0.17
275_K	309_I	0.611	0.17
112_D	262_V	0.611	0.17
8_L	93_F	0.610	0.17
144_A	157_A	0.610	0.17
153_L	301_R	0.609	0.17
15_S	30_E	0.606	0.16
300_L	332_L	0.605	0.16
265_F	332_L	0.605	0.16
15_S	80_K	0.603	0.16
69_K	287_L	0.603	0.16
123_P	241_K	0.603	0.16
32_P	57_K	0.602	0.16
64_T	302_K	0.602	0.16
287_L	302_K	0.599	0.16
148_L	184_I	0.597	0.16
295_L	348_K	0.597	0.16
217_D	346_Y	0.597	0.16
41_F	149_L	0.596	0.16
229_P	233_V	0.595	0.16
278_L	327_T	0.594	0.16
101_I	114_A	0.594	0.16
33_E	36_M	0.592	0.16
8_L	347_N	0.592	0.16
295_L	332_L	0.591	0.16
138_F	227_M	0.590	0.16
7_F	283_K	0.589	0.16
112_D	158_K	0.589	0.16
113_V	117_L	0.589	0.16
51_Y	264_Y	0.588	0.16
219_M	227_M	0.588	0.16
219_M	254_G	0.587	0.16
69_K	72_T	0.587	0.16
112_D	276_I	0.587	0.16
120_A	185_V	0.587	0.16
190_S	244_T	0.585	0.16
224_T	259_K	0.585	0.16
86_T	131_V	0.585	0.16
4_K	35_P	0.585	0.16
101_I	336_F	0.584	0.16
101_I	123_P	0.583	0.16
229_P	280_P	0.581	0.16
297_P	301_R	0.581	0.16
262_V	268_I	0.580	0.16
101_I	254_G	0.580	0.16
13_A	23_G	0.579	0.16
24_S	189_S	0.579	0.16
101_I	258_I	0.579	0.16
229_P	244_T	0.579	0.16
159_T	193_L	0.578	0.16
167_I	295_L	0.578	0.16
46_P	332_L	0.577	0.16
144_A	264_Y	0.576	0.16
177_Y	352_I	0.575	0.16
81_T	260_E	0.573	0.15
281_I	287_L	0.570	0.15
134_H	332_L	0.568	0.15
147_I	163_E	0.566	0.15
218_N	225_Y	0.566	0.15
4_K	52_L	0.565	0.15
251_I	279_T	0.564	0.15
17_G	20_G	0.564	0.15
53_T	161_K	0.564	0.15
46_P	277_V	0.563	0.15
117_L	125_L	0.562	0.15
11_P	23_G	0.562	0.15
97_G	215_I	0.560	0.15
233_V	277_V	0.560	0.15
93_F	283_K	0.559	0.15
279_T	320_I	0.559	0.15
220_D	225_Y	0.559	0.15
12_Y	210_E	0.559	0.15
37_R	326_D	0.555	0.15
147_I	201_M	0.553	0.15
259_K	312_S	0.552	0.15
149_L	180_K	0.552	0.15
91_R	221_D	0.551	0.15
202_Q	206_D	0.551	0.15
98_V	324_R	0.551	0.15
176_T	180_K	0.550	0.15
89_S	147_I	0.550	0.15
248_G	296_G	0.550	0.15
164_I	283_K	0.549	0.15
214_Y	245_P	0.549	0.15
12_Y	353_K	0.548	0.15
6_G	17_G	0.548	0.15
21_K	32_P	0.547	0.15
217_D	330_E	0.547	0.15
214_Y	218_N	0.547	0.15
231_S	244_T	0.547	0.15
148_L	319_T	0.546	0.15
217_D	347_N	0.545	0.15
209_G	300_L	0.544	0.15
142_P	312_S	0.544	0.15
136_G	184_I	0.544	0.15
224_T	252_I	0.544	0.15
133_M	149_L	0.543	0.15
95_K	331_N	0.543	0.15
188_I	345_G	0.542	0.15
187_T	266_D	0.541	0.15
175_G	288_I	0.541	0.15
111_R	165_L	0.540	0.15
186_L	325_I	0.539	0.15
4_K	235_Y	0.539	0.15
268_I	299_F	0.538	0.15
55_R	73_I	0.538	0.15
5_I	319_T	0.537	0.15
327_T	338_G	0.537	0.15
57_K	79_K	0.536	0.14
71_E	96_R	0.535	0.14
164_I	185_V	0.535	0.14
263_N	300_L	0.535	0.14
127_V	340_Y	0.534	0.14
224_T	271_T	0.531	0.14
120_A	252_I	0.530	0.14
146_A	177_Y	0.529	0.14
213_D	239_K	0.528	0.14
286_F	348_K	0.527	0.14
71_E	215_I	0.527	0.14
165_L	308_L	0.526	0.14
324_R	344_V	0.526	0.14
89_S	97_G	0.525	0.14
101_I	343_I	0.524	0.14
111_R	180_K	0.523	0.14
233_V	324_R	0.523	0.14
191_N	231_S	0.522	0.14
224_T	274_L	0.522	0.14
19_I	229_P	0.522	0.14
115_E	252_I	0.521	0.14
9_V	276_I	0.521	0.14
52_L	57_K	0.521	0.14
17_G	23_G	0.519	0.14
51_Y	68_L	0.518	0.14
254_G	342_V	0.517	0.14
74_P	204_S	0.516	0.14
15_S	264_Y	0.515	0.14
15_S	21_K	0.515	0.14
99_D	216_I	0.515	0.14
12_Y	310_V	0.515	0.14
209_G	239_K	0.514	0.14
174_K	269_N	0.513	0.14
127_V	194_L	0.512	0.14
339_V	354_T	0.510	0.14
225_Y	334_K	0.509	0.14
33_E	196_P	0.509	0.14
219_M	257_L	0.509	0.14
7_F	54_P	0.508	0.14
31_N	36_M	0.508	0.14
279_T	286_F	0.507	0.14
138_F	244_T	0.507	0.14
78_K	84_Y	0.507	0.14
34_I	113_V	0.507	0.14
8_L	73_I	0.507	0.14
273_E	348_K	0.506	0.14
287_L	327_T	0.504	0.14
172_Y	320_I	0.503	0.14
173_R	247_L	0.502	0.14
133_M	200_E	0.501	0.14
6_G	11_P	0.501	0.14
12_Y	30_E	0.500	0.14

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qv7A	2	0.6994	99.2	0.912	Contact Map
4werA	2	0.6798	99.1	0.916	Contact Map
2an1A	4	0.6798	98.9	0.923	Contact Map
3s40A	3	0.7107	98.8	0.926	Contact Map
1u0tA	4	0.7079	98.7	0.929	Contact Map
1yt5A	4	0.6376	98.6	0.93	Contact Map
1z0sA	4	0.6011	98.5	0.933	Contact Map
2i2cA	3	0.6208	98.3	0.936	Contact Map
2bonA	1	0.691	98.2	0.938	Contact Map
4v24A	1	0.7697	97.2	0.95	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0104 seconds.