Q97ZM0 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZM0 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97ZM0	Sequences: MHKIPAELCIKCKSHKNLCGLPYCPIMERFRGMVSSLQKIEIDTSFKLVEGSTPPSGIVGEKGYPKVSLIVNIPPSVYGEDARKYENVKEWWGRINLGDIIKLRSSLISSITTVKVEKATEYYDTEIPLAIISDNPIVTEAKLKTLEAKLKFDGVILPRGPSGIAEQIKVLDNPKVPTKLDKLIFDDAKSTEAILELYRYNVDYYKIIHALSFGLLGRKKNRRFVPTRWAITAVDSIVGKFLYNKIINYNEINEIEVYHSSYLGNYFYVILYPSKFNSTWIEIWHPLSLWSQELTISELKENFWGEYEYLDGGYMAARLAVLEHLEQIKRQSGIIIIREITEEYFAPVGNWHIRETVRNAMKNRLGKYDNLNLAISEVNKKLKAKINLFELRTINSLINQKSIYDFFK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	408 (381)
Sequences:	209 (173)
Seq/√Len:	8.8

HALSA - Q9HS89
SULSO - Q97ZM0 Q97V92

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
256_E	328_I	5.948	1.00
258_Y	324_H	4.889	1.00
57_G	213_F	4.837	1.00
324_H	328_I	4.073	0.98
236_S	240_K	3.579	0.96
264_G	343_E	3.376	0.95
19_C	24_C	3.326	0.94
177_P	206_K	3.311	0.94
320_A	358_R	3.227	0.93
325_L	332_S	3.221	0.93
267_F	352_H	3.212	0.93
194_I	237_I	3.200	0.93
183_L	188_A	3.176	0.92
245_K	326_E	3.078	0.91
180_L	210_A	2.966	0.90
19_C	25_P	2.962	0.89
368_Y	374_A	2.920	0.89
194_I	211_L	2.870	0.88
20_G	24_C	2.839	0.87
250_N	329_K	2.705	0.85
174_P	177_P	2.549	0.81
20_G	25_P	2.527	0.80
187_D	222_R	2.513	0.80
348_V	352_H	2.480	0.79
309_Y	315_M	2.466	0.78
73_I	141_A	2.374	0.76
274_S	333_G	2.362	0.75
310_L	313_G	2.332	0.74
258_Y	328_I	2.318	0.74
276_F	320_A	2.214	0.70
79_G	82_A	2.132	0.67
344_Y	352_H	2.116	0.66
255_I	371_L	2.094	0.66
344_Y	360_A	2.051	0.64
270_I	378_V	2.025	0.63
52_S	82_A	1.952	0.60
119_A	124_D	1.940	0.59
202_V	206_K	1.923	0.59
128_P	299_L	1.872	0.56
239_G	322_L	1.832	0.55
256_E	365_L	1.826	0.55
238_V	242_L	1.786	0.53
280_W	310_L	1.786	0.53
309_Y	350_N	1.763	0.52
250_N	270_I	1.756	0.52
74_P	161_P	1.748	0.51
74_P	348_V	1.728	0.50
194_I	375_I	1.718	0.50
173_N	239_G	1.683	0.48
108_I	394_I	1.650	0.47
286_P	290_W	1.607	0.45
247_I	303_F	1.598	0.45
58_I	315_M	1.597	0.45
235_D	355_E	1.593	0.45
309_Y	314_Y	1.560	0.43
62_K	223_R	1.548	0.43
401_K	405_D	1.531	0.42
204_Y	286_P	1.525	0.42
58_I	350_N	1.523	0.42
58_I	71_V	1.499	0.41
313_G	352_H	1.478	0.40
75_P	79_G	1.478	0.40
75_P	82_A	1.477	0.40
72_N	236_S	1.471	0.39
315_M	350_N	1.467	0.39
70_I	129_L	1.467	0.39
179_K	200_Y	1.465	0.39
286_P	291_S	1.463	0.39
249_Y	335_I	1.441	0.38
222_R	270_I	1.430	0.38
284_W	340_I	1.422	0.37
83_R	246_I	1.421	0.37
58_I	61_E	1.419	0.37
87_N	335_I	1.416	0.37
58_I	309_Y	1.402	0.37
71_V	82_A	1.396	0.36
313_G	353_I	1.381	0.36
269_V	344_Y	1.377	0.36
280_W	313_G	1.366	0.35
140_E	173_N	1.362	0.35
250_N	364_R	1.362	0.35
71_V	109_S	1.361	0.35
67_V	249_Y	1.360	0.35
58_I	70_I	1.356	0.35
107_L	161_P	1.340	0.34
311_D	353_I	1.335	0.34
188_A	196_E	1.329	0.34
269_V	360_A	1.327	0.34
311_D	356_T	1.326	0.34
143_L	163_G	1.325	0.34
283_I	353_I	1.323	0.34
350_N	353_I	1.323	0.34
235_D	354_R	1.322	0.33
263_L	336_I	1.303	0.33
211_L	318_R	1.302	0.33
369_D	376_S	1.302	0.33
360_A	400_Q	1.298	0.33
59_V	63_G	1.297	0.33
261_S	266_Y	1.291	0.32
153_D	324_H	1.290	0.32
247_I	306_E	1.274	0.32
21_L	29_R	1.267	0.31
311_D	343_E	1.266	0.31
228_R	330_R	1.261	0.31
264_G	341_T	1.255	0.31
336_I	344_Y	1.255	0.31
243_Y	247_I	1.245	0.31
29_R	399_N	1.245	0.31
280_W	344_Y	1.244	0.31
70_I	309_Y	1.241	0.30
58_I	299_L	1.240	0.30
336_I	360_A	1.237	0.30
69_L	348_V	1.233	0.30
323_E	358_R	1.232	0.30
317_A	378_V	1.231	0.30
51_G	161_P	1.229	0.30
258_Y	267_F	1.225	0.30
211_L	216_L	1.223	0.30
88_V	283_I	1.219	0.30
234_V	340_I	1.216	0.30
74_P	136_P	1.216	0.30
258_Y	300_K	1.212	0.29
89_K	211_L	1.208	0.29
249_Y	326_E	1.202	0.29
21_L	310_L	1.198	0.29
277_N	333_G	1.197	0.29
283_I	313_G	1.197	0.29
135_N	340_I	1.196	0.29
271_L	361_M	1.192	0.29
299_L	350_N	1.190	0.29
211_L	237_I	1.188	0.29
278_S	299_L	1.186	0.28
228_R	338_R	1.172	0.28
344_Y	400_Q	1.166	0.28
52_S	75_P	1.160	0.28
143_L	348_V	1.158	0.27
193_A	371_L	1.152	0.27
291_S	306_E	1.151	0.27
157_L	299_L	1.137	0.27
210_A	236_S	1.137	0.27
244_N	364_R	1.133	0.27
71_V	130_A	1.131	0.27
173_N	176_V	1.127	0.26
174_P	331_Q	1.124	0.26
249_Y	329_K	1.120	0.26
181_D	184_I	1.119	0.26
330_R	370_N	1.114	0.26
74_P	79_G	1.108	0.26
215_L	292_Q	1.103	0.26
255_I	367_K	1.101	0.26
74_P	286_P	1.101	0.26
129_L	236_S	1.098	0.25
370_N	381_K	1.094	0.25
138_V	223_R	1.092	0.25
313_G	356_T	1.082	0.25
246_I	281_I	1.080	0.25
50_E	138_V	1.072	0.25
211_L	382_L	1.065	0.24
311_D	350_N	1.064	0.24
165_A	168_I	1.058	0.24
89_K	205_Y	1.057	0.24
154_G	343_E	1.055	0.24
254_E	367_K	1.053	0.24
249_Y	404_Y	1.053	0.24
110_S	141_A	1.050	0.24
279_T	354_R	1.049	0.24
178_T	223_R	1.043	0.24
286_P	306_E	1.042	0.24
66_K	223_R	1.033	0.23
74_P	305_G	1.032	0.23
239_G	310_L	1.030	0.23
59_V	374_A	1.028	0.23
137_I	174_P	1.027	0.23
99_D	193_A	1.025	0.23
145_T	340_I	1.019	0.23
209_H	317_A	1.019	0.23
276_F	313_G	1.018	0.23
267_F	389_F	1.016	0.23
287_L	336_I	1.016	0.23
237_I	316_A	1.014	0.23
42_I	224_F	1.012	0.23
133_S	384_A	1.010	0.23
321_V	334_I	1.010	0.23
222_R	235_D	1.010	0.23
161_P	224_F	1.009	0.23
83_R	112_T	1.006	0.23
63_G	146_L	1.000	0.22
239_G	280_W	0.994	0.22
202_V	222_R	0.987	0.22
250_N	385_K	0.984	0.22
196_E	209_H	0.984	0.22
133_S	174_P	0.978	0.22
112_T	253_N	0.977	0.22
177_P	181_D	0.975	0.22
297_S	344_Y	0.974	0.22
153_D	156_I	0.974	0.22
235_D	290_W	0.971	0.22
271_L	334_I	0.970	0.22
368_Y	377_E	0.969	0.21
313_G	343_E	0.966	0.21
239_G	308_E	0.958	0.21
211_L	346_A	0.958	0.21
51_G	65_P	0.952	0.21
222_R	355_E	0.951	0.21
106_S	267_F	0.946	0.21
291_S	313_G	0.946	0.21
97_L	280_W	0.945	0.21
70_I	236_S	0.944	0.21
75_P	305_G	0.943	0.21
156_I	162_S	0.943	0.21
99_D	296_I	0.943	0.21
194_I	246_I	0.941	0.21
280_W	352_H	0.936	0.21
24_C	284_W	0.934	0.20
177_P	239_G	0.933	0.20
58_I	109_S	0.932	0.20
257_V	271_L	0.932	0.20
135_N	150_L	0.931	0.20
181_D	210_A	0.927	0.20
291_S	311_D	0.927	0.20
246_I	385_K	0.925	0.20
19_C	284_W	0.925	0.20
130_A	294_L	0.924	0.20
223_R	330_R	0.923	0.20
211_L	230_A	0.923	0.20
48_L	62_K	0.922	0.20
160_G	233_A	0.916	0.20
74_P	144_K	0.914	0.20
174_P	322_L	0.914	0.20
50_E	53_T	0.913	0.20
148_A	340_I	0.909	0.20
245_K	329_K	0.908	0.20
135_N	211_L	0.907	0.20
96_N	114_V	0.906	0.20
280_W	311_D	0.905	0.20
284_W	351_W	0.901	0.20
49_V	144_K	0.901	0.20
238_V	326_E	0.894	0.19
52_S	242_L	0.894	0.19
270_I	375_I	0.892	0.19
86_E	119_A	0.889	0.19
239_G	374_A	0.889	0.19
329_K	379_N	0.886	0.19
108_I	263_L	0.884	0.19
281_I	286_P	0.884	0.19
58_I	278_S	0.883	0.19
317_A	379_N	0.882	0.19
99_D	406_F	0.878	0.19
166_E	241_F	0.878	0.19
101_I	339_E	0.876	0.19
297_S	311_D	0.876	0.19
103_L	205_Y	0.873	0.19
338_R	344_Y	0.872	0.19
299_L	315_M	0.870	0.19
280_W	341_T	0.869	0.19
167_Q	246_I	0.867	0.19
235_D	320_A	0.867	0.19
72_N	341_T	0.866	0.19
30_F	346_A	0.863	0.19
124_D	170_V	0.861	0.19
129_L	172_D	0.859	0.18
186_D	238_V	0.857	0.18
56_S	63_G	0.856	0.18
174_P	239_G	0.855	0.18
86_E	89_K	0.854	0.18
253_N	367_K	0.850	0.18
278_S	317_A	0.847	0.18
105_S	253_N	0.846	0.18
75_P	161_P	0.846	0.18
127_I	288_S	0.842	0.18
91_W	104_R	0.842	0.18
86_E	208_I	0.839	0.18
284_W	342_E	0.838	0.18
187_D	235_D	0.837	0.18
289_L	344_Y	0.835	0.18
263_L	289_L	0.832	0.18
331_Q	339_E	0.831	0.18
235_D	276_F	0.822	0.18
21_L	280_W	0.820	0.17
50_E	171_L	0.816	0.17
176_V	181_D	0.816	0.17
278_S	311_D	0.816	0.17
167_Q	404_Y	0.813	0.17
323_E	330_R	0.812	0.17
104_R	186_D	0.808	0.17
209_H	353_I	0.808	0.17
308_E	406_F	0.807	0.17
107_L	350_N	0.807	0.17
157_L	344_Y	0.806	0.17
126_E	129_L	0.804	0.17
246_I	324_H	0.803	0.17
114_V	124_D	0.802	0.17
252_I	364_R	0.802	0.17
141_A	152_F	0.801	0.17
61_E	353_I	0.801	0.17
128_P	215_L	0.799	0.17
399_N	402_S	0.798	0.17
112_T	230_A	0.796	0.17
313_G	344_Y	0.795	0.17
105_S	184_I	0.792	0.17
107_L	224_F	0.792	0.17
243_Y	352_H	0.790	0.17
285_H	384_A	0.790	0.17
264_G	406_F	0.790	0.17
341_T	344_Y	0.789	0.17
116_V	329_K	0.789	0.17
114_V	245_K	0.788	0.17
54_P	79_G	0.788	0.17
316_A	351_W	0.786	0.17
133_S	181_D	0.783	0.17
264_G	352_H	0.781	0.17
266_Y	310_L	0.781	0.17
194_I	360_A	0.779	0.16
146_L	167_Q	0.779	0.16
292_Q	306_E	0.775	0.16
74_P	82_A	0.774	0.16
138_V	190_S	0.774	0.16
27_M	293_E	0.773	0.16
359_N	362_K	0.772	0.16
319_L	358_R	0.772	0.16
181_D	253_N	0.771	0.16
86_E	337_I	0.770	0.16
202_V	288_S	0.766	0.16
61_E	350_N	0.762	0.16
98_G	317_A	0.761	0.16
86_E	211_L	0.760	0.16
311_D	315_M	0.758	0.16
290_W	355_E	0.758	0.16
131_I	140_E	0.758	0.16
58_I	311_D	0.757	0.16
97_L	274_S	0.756	0.16
20_G	54_P	0.755	0.16
269_V	336_I	0.755	0.16
182_K	196_E	0.754	0.16
82_A	313_G	0.753	0.16
21_L	24_C	0.752	0.16
251_E	387_N	0.751	0.16
236_S	311_D	0.748	0.16
284_W	289_L	0.746	0.16
299_L	311_D	0.744	0.16
274_S	277_N	0.739	0.16
263_L	344_Y	0.737	0.16
243_Y	246_I	0.736	0.15
133_S	242_L	0.734	0.15
108_I	192_E	0.734	0.15
152_F	346_A	0.734	0.15
46_F	193_A	0.732	0.15
280_W	361_M	0.730	0.15
121_E	317_A	0.729	0.15
72_N	234_V	0.727	0.15
60_G	65_P	0.725	0.15
299_L	313_G	0.724	0.15
146_L	321_V	0.723	0.15
18_L	205_Y	0.722	0.15
93_G	97_L	0.720	0.15
246_I	364_R	0.719	0.15
22_P	106_S	0.716	0.15
167_Q	272_Y	0.716	0.15
61_E	291_S	0.713	0.15
49_V	178_T	0.713	0.15
103_L	388_L	0.712	0.15
319_L	351_W	0.711	0.15
130_A	345_F	0.706	0.15
286_P	358_R	0.705	0.15
189_K	379_N	0.704	0.15
206_K	249_Y	0.701	0.15
283_I	311_D	0.699	0.15
284_W	310_L	0.698	0.15
61_E	205_Y	0.697	0.15
402_S	405_D	0.697	0.15
27_M	216_L	0.697	0.15
99_D	248_N	0.695	0.15
315_M	331_Q	0.695	0.15
331_Q	350_N	0.691	0.14
266_Y	348_V	0.691	0.14
252_I	392_R	0.689	0.14
290_W	337_I	0.689	0.14
358_R	389_F	0.688	0.14
228_R	290_W	0.688	0.14
263_L	321_V	0.687	0.14
19_C	29_R	0.684	0.14
347_P	360_A	0.684	0.14
198_Y	204_Y	0.684	0.14
224_F	267_F	0.683	0.14
176_V	207_I	0.682	0.14
185_F	314_Y	0.681	0.14
246_I	254_E	0.679	0.14
240_K	267_F	0.678	0.14
74_P	207_I	0.676	0.14
89_K	95_I	0.675	0.14
210_A	288_S	0.674	0.14
51_G	354_R	0.673	0.14
108_I	269_V	0.672	0.14
307_Y	378_V	0.666	0.14
103_L	107_L	0.663	0.14
106_S	266_Y	0.663	0.14
238_V	249_Y	0.662	0.14
70_I	100_I	0.662	0.14
63_G	370_N	0.661	0.14
331_Q	371_L	0.660	0.14
49_V	209_H	0.659	0.14
170_V	178_T	0.656	0.14
344_Y	353_I	0.651	0.14
280_W	335_I	0.650	0.14
67_V	116_V	0.649	0.14
17_N	181_D	0.649	0.14
102_K	180_L	0.649	0.14
339_E	353_I	0.649	0.14
132_I	393_T	0.648	0.14
239_G	297_S	0.645	0.14
58_I	279_T	0.644	0.14
274_S	302_N	0.644	0.14
140_E	288_S	0.643	0.13
62_K	334_I	0.642	0.13
100_I	337_I	0.641	0.13
71_V	350_N	0.640	0.13
92_W	313_G	0.640	0.13
204_Y	291_S	0.638	0.13
144_K	284_W	0.637	0.13
311_D	345_F	0.636	0.13
99_D	143_L	0.635	0.13
213_F	324_H	0.634	0.13
371_L	374_A	0.634	0.13
239_G	344_Y	0.633	0.13
206_K	285_H	0.632	0.13
194_I	261_S	0.632	0.13
46_F	240_K	0.630	0.13
82_A	132_I	0.629	0.13
255_I	270_I	0.629	0.13
283_I	341_T	0.627	0.13
115_K	165_A	0.625	0.13
152_F	310_L	0.625	0.13
283_I	291_S	0.625	0.13
98_G	138_V	0.625	0.13
186_D	325_L	0.624	0.13
275_K	329_K	0.623	0.13
204_Y	306_E	0.623	0.13
47_K	376_S	0.623	0.13
108_I	207_I	0.619	0.13
253_N	369_D	0.618	0.13
377_E	403_I	0.618	0.13
70_I	337_I	0.617	0.13
53_T	71_V	0.617	0.13
72_N	213_F	0.617	0.13
72_N	344_Y	0.616	0.13
45_S	241_F	0.616	0.13
73_I	113_T	0.615	0.13
106_S	137_I	0.615	0.13
23_Y	96_N	0.614	0.13
236_S	336_I	0.613	0.13
175_K	363_N	0.612	0.13
215_L	276_F	0.610	0.13
166_E	224_F	0.610	0.13
288_S	322_L	0.608	0.13
53_T	129_L	0.607	0.13
53_T	342_E	0.605	0.13
66_K	245_K	0.604	0.13
58_I	276_F	0.604	0.13
203_D	238_V	0.604	0.13
211_L	366_G	0.602	0.13
249_Y	377_E	0.602	0.13
177_P	288_S	0.600	0.13
256_E	278_S	0.598	0.13
31_R	230_A	0.598	0.13
97_L	348_V	0.597	0.13
330_R	372_N	0.597	0.13
223_R	252_I	0.596	0.13
235_D	311_D	0.593	0.13
276_F	291_S	0.592	0.13
163_G	344_Y	0.592	0.13
188_A	218_R	0.591	0.12
71_V	128_P	0.590	0.12
69_L	126_E	0.590	0.12
22_P	68_S	0.589	0.12
178_T	373_L	0.589	0.12
246_I	258_Y	0.588	0.12
263_L	356_T	0.587	0.12
84_K	300_K	0.586	0.12
348_V	384_A	0.585	0.12
106_S	247_I	0.583	0.12
193_A	228_R	0.580	0.12
147_E	324_H	0.580	0.12
172_D	266_Y	0.579	0.12
318_R	330_R	0.578	0.12
326_E	329_K	0.578	0.12
250_N	330_R	0.577	0.12
178_T	382_L	0.576	0.12
209_H	373_L	0.574	0.12
128_P	315_M	0.574	0.12
293_E	388_L	0.573	0.12
145_T	148_A	0.572	0.12
61_E	311_D	0.570	0.12
92_W	262_Y	0.569	0.12
124_D	350_N	0.568	0.12
266_Y	344_Y	0.567	0.12
70_I	230_A	0.565	0.12
86_E	267_F	0.565	0.12
167_Q	362_K	0.562	0.12
177_P	202_V	0.562	0.12
61_E	389_F	0.560	0.12
179_K	196_E	0.560	0.12
177_P	216_L	0.559	0.12
128_P	210_A	0.559	0.12
58_I	132_I	0.557	0.12
176_V	340_I	0.555	0.12
297_S	340_I	0.554	0.12
269_V	317_A	0.554	0.12
236_S	318_R	0.553	0.12
278_S	380_K	0.552	0.12
135_N	364_R	0.550	0.12
367_K	371_L	0.549	0.12
236_S	278_S	0.544	0.12
119_A	369_D	0.543	0.12
212_S	350_N	0.543	0.12
78_Y	145_T	0.542	0.12
189_K	198_Y	0.542	0.12
307_Y	315_M	0.542	0.12
73_I	151_K	0.541	0.12
269_V	374_A	0.540	0.12
168_I	392_R	0.540	0.12
57_G	259_H	0.539	0.12
63_G	362_K	0.538	0.12
281_I	353_I	0.538	0.12
63_G	255_I	0.538	0.12
167_Q	245_K	0.537	0.12
130_A	316_A	0.536	0.11
398_I	403_I	0.536	0.11
16_K	40_I	0.536	0.11
56_S	86_E	0.535	0.11
136_P	316_A	0.534	0.11
117_E	376_S	0.533	0.11
23_Y	344_Y	0.533	0.11
61_E	345_F	0.532	0.11
124_D	133_S	0.531	0.11
33_M	135_N	0.531	0.11
224_F	322_L	0.530	0.11
275_K	403_I	0.530	0.11
52_S	340_I	0.529	0.11
260_S	344_Y	0.529	0.11
64_Y	108_I	0.529	0.11
18_L	91_W	0.529	0.11
126_E	406_F	0.529	0.11
93_G	263_L	0.528	0.11
54_P	339_E	0.527	0.11
85_Y	130_A	0.527	0.11
242_L	335_I	0.525	0.11
247_I	289_L	0.524	0.11
199_R	321_V	0.523	0.11
121_E	230_A	0.522	0.11
53_T	172_D	0.522	0.11
24_C	29_R	0.520	0.11
209_H	316_A	0.520	0.11
132_I	279_T	0.520	0.11
320_A	355_E	0.519	0.11
60_G	228_R	0.518	0.11
71_V	299_L	0.515	0.11
133_S	138_V	0.514	0.11
23_Y	297_S	0.513	0.11
164_I	313_G	0.512	0.11
32_G	240_K	0.509	0.11
95_I	103_L	0.509	0.11
55_P	60_G	0.509	0.11
57_G	258_Y	0.507	0.11
198_Y	351_W	0.506	0.11
209_H	304_W	0.505	0.11
69_L	90_E	0.505	0.11
169_K	274_S	0.505	0.11
299_L	309_Y	0.502	0.11
174_P	316_A	0.501	0.11
89_K	203_D	0.501	0.11
285_H	291_S	0.501	0.11
218_R	371_L	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zvvY	1	0.027	18.9	0.983	Contact Map
1qgpA	1	0.1667	18.7	0.983	Contact Map
4l7mA	1	0.1667	17.4	0.983	Contact Map
2qzqA	1	0.3529	13.2	0.984	Contact Map
1qhkA	1	0.1127	8.8	0.985	Contact Map
2rfbA	1	0.1642	7.9	0.986	Contact Map
2klnA	1	0.2868	7.4	0.986	Contact Map
1nu4A	5	0.2157	7.1	0.986	Contact Map
3pjpA	3	0.424	7.1	0.986	Contact Map
1p7nA	2	0.3284	7	0.986	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.011 seconds.