Q97ZH9 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZH9 - Ribonucleotide reductase (Nrd)

UniProt:	Q97ZH9	Sequences: MKEMEQLLYSTSLRKIKVIKRDGKVDEFKLEKILSKLSSVPDEVTDGIVNDVQANVKDNAIDTRVIADIVERNLIENSLKYPFLMELAKRYVLARIYNHVFGKGKWKDFDEKDLLLSYNALKVLEARYLLKDPNTLRYIETPQMLFRRVARFLASVERKYGKSEAEVKQLEDKFYEMISDLKFVPNSPTLMNSETRLGILSACFVIPVKDAMTTPEGDGIYDALRATALVHQQGGGTGFDFSELRPKGDVVASTAGVASGPVSFMKVFDASTDVIKQGGKRRGANMGVMHAWHADIEDFIRAKTGQLKDVQLQNFNISVGAYDYFMDAVVKGESVPLINPRKTKIAGRDHEYYITKARGYMSEEWIQEVILSELEEKGGVVSLDESKIITVDEALVIASKEGAVVKYVNAKSLFDEIVKGAWDSGDPGLLFIDTINRRHPVWYLGKINATNPCGEEPLLPWESCNLGSINLEKFVIERDGKAAIDWDGLAEIIRYGVRFLDNVIDANRYPLKQIEDATKRTRKVGLGVMGLARMFIKLGIAYDSVDAIYLSYQLAKFIFYHAYKASIEIAKEKGTFPTYDARLYRDIWESALDFDSLLQTAEISDKPSDYVKKLTSVVDKLDFDLLKGERLKYGLRNSTVVSIAPTGTISIIAGTSSSIEPLFALAFVRNVAVGKFIEIDPLFLEYLRKYELDDPEVIQKIAESGIIGDNVFMPRSLRKLFRTAHEVPPIYHVMHQAAWQQWNDSGTSKTINLRSEEPPETVEKVYLLAWKLGIKGITVYRDKSKQQQVIYFGVKKEREEYEKKKEEVEKKTQLLPSSLRMEKKFVEVSETYAGGCKTCEL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	841 (677)
Sequences:	1320 (502)
Seq/√Len:	19.3

ECOLI - RIR1 RIR3
BACSU - RIR1 NRDEB
HALSA - Q9HMU3 Q9HPG8
SULSO - Q97ZH9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
330_V	771_K	8.679	1.00
490_A	564_K	5.927	1.00
571_K	629_E	5.382	1.00
327_D	392_D	5.246	1.00
564_K	629_E	5.042	1.00
563_Y	630_R	5.027	1.00
528_V	555_A	4.713	1.00
173_K	491_E	4.638	1.00
515_E	519_K	4.570	1.00
497_V	524_V	4.418	1.00
226_A	513_Q	4.120	1.00
543_D	722_R	3.932	1.00
497_V	640_V	3.728	1.00
690_Y	716_S	3.718	1.00
549_Y	553_Q	3.529	1.00
494_R	568_E	3.508	1.00
539_G	720_L	3.494	1.00
246_P	294_A	3.489	1.00
595_D	627_K	3.483	1.00
112_K	179_S	3.336	1.00
734_M	768_L	3.300	1.00
70_V	74_L	3.260	1.00
567_I	629_E	3.249	1.00
222_D	225_R	3.050	0.99
147_R	151_R	3.009	0.99
584_Y	635_L	3.001	0.99
580_D	585_R	2.959	0.99
490_A	561_H	2.958	0.99
338_I	343_T	2.957	0.99
563_Y	635_L	2.934	0.99
629_E	633_Y	2.908	0.99
182_K	488_G	2.854	0.99
498_R	572_E	2.814	0.99
332_G	409_N	2.788	0.99
71_E	74_L	2.773	0.98
209_K	219_G	2.680	0.98
512_K	515_E	2.655	0.98
734_M	772_L	2.651	0.98
442_W	583_L	2.561	0.97
624_D	627_K	2.548	0.97
567_I	633_Y	2.541	0.97
336_P	399_S	2.541	0.97
332_G	411_K	2.510	0.97
553_Q	620_K	2.492	0.97
409_N	412_S	2.492	0.97
622_D	625_L	2.483	0.97
349_D	397_I	2.470	0.97
435_I	457_P	2.467	0.97
686_Y	721_F	2.457	0.97
559_F	563_Y	2.411	0.96
391_V	395_L	2.404	0.96
334_S	407_Y	2.396	0.96
324_Y	327_D	2.393	0.96
715_R	719_K	2.386	0.96
559_F	641_V	2.348	0.96
265_M	312_L	2.344	0.96
154_A	174_F	2.335	0.95
457_P	746_G	2.320	0.95
26_D	32_K	2.315	0.95
172_D	176_E	2.315	0.95
327_D	331_K	2.303	0.95
334_S	409_N	2.264	0.95
542_Y	658_S	2.250	0.94
323_D	770_W	2.241	0.94
336_P	404_V	2.224	0.94
336_P	407_Y	2.216	0.94
296_I	319_V	2.216	0.94
159_K	169_Q	2.181	0.93
389_I	392_D	2.172	0.93
68_D	95_R	2.165	0.93
768_L	772_L	2.148	0.93
490_A	560_Y	2.125	0.93
477_E	482_A	2.124	0.93
41_P	87_L	2.117	0.92
571_K	633_Y	2.114	0.92
218_D	225_R	2.112	0.92
366_I	407_Y	2.083	0.92
494_R	564_K	2.083	0.92
467_G	496_G	2.076	0.92
541_A	720_L	2.070	0.91
32_K	63_T	2.001	0.90
241_F	261_P	1.989	0.90
421_A	766_Y	1.981	0.90
531_L	551_S	1.961	0.89
516_D	520_R	1.953	0.89
548_I	738_A	1.949	0.89
147_R	171_E	1.940	0.89
592_L	630_R	1.912	0.88
328_A	333_E	1.911	0.88
74_L	78_S	1.902	0.88
567_I	571_K	1.902	0.88
583_L	596_S	1.895	0.87
62_D	65_V	1.887	0.87
575_T	579_Y	1.885	0.87
444_L	578_T	1.877	0.87
557_F	622_D	1.854	0.86
321_A	429_L	1.853	0.86
208_V	223_A	1.831	0.85
33_I	36_K	1.821	0.85
297_E	408_V	1.811	0.85
269_D	314_N	1.800	0.84
265_M	315_F	1.795	0.84
328_A	336_P	1.789	0.84
304_T	311_Q	1.788	0.84
115_L	181_L	1.782	0.84
187_S	284_A	1.780	0.84
390_T	393_E	1.736	0.82
457_P	776_G	1.727	0.82
267_V	270_A	1.691	0.80
272_T	285_N	1.688	0.80
265_M	302_A	1.681	0.80
63_T	98_N	1.663	0.79
262_V	302_A	1.660	0.79
560_Y	626_L	1.659	0.79
746_G	776_G	1.658	0.79
36_K	67_A	1.653	0.79
442_W	596_S	1.648	0.79
218_D	229_L	1.646	0.78
539_G	686_Y	1.644	0.78
435_I	776_G	1.635	0.78
628_G	632_K	1.625	0.78
397_I	401_E	1.611	0.77
63_T	67_A	1.602	0.77
730_I	768_L	1.601	0.76
330_V	767_L	1.600	0.76
326_M	431_F	1.594	0.76
490_A	494_R	1.578	0.75
528_V	558_I	1.578	0.75
568_E	571_K	1.577	0.75
323_D	437_R	1.565	0.75
71_E	78_S	1.564	0.75
592_L	595_D	1.560	0.75
567_I	630_R	1.558	0.74
591_A	596_S	1.558	0.74
685_E	689_K	1.540	0.74
32_K	94_A	1.539	0.74
71_E	91_Y	1.537	0.73
456_E	745_S	1.526	0.73
328_A	399_S	1.524	0.73
489_L	558_I	1.518	0.72
246_P	339_N	1.516	0.72
568_E	633_Y	1.515	0.72
579_Y	631_L	1.513	0.72
78_S	746_G	1.511	0.72
302_A	312_L	1.509	0.72
733_V	753_L	1.501	0.72
686_Y	720_L	1.496	0.71
55_N	77_N	1.488	0.71
568_E	629_E	1.482	0.71
563_Y	584_Y	1.479	0.70
434_T	437_R	1.476	0.70
170_L	173_K	1.471	0.70
200_L	506_A	1.470	0.70
624_D	628_G	1.465	0.70
732_H	749_K	1.461	0.69
71_E	95_R	1.451	0.69
67_A	98_N	1.448	0.69
221_Y	271_S	1.443	0.69
557_F	561_H	1.441	0.68
100_V	141_T	1.436	0.68
440_P	459_L	1.428	0.68
502_N	573_K	1.419	0.67
788_Q	791_Y	1.400	0.66
28_F	60_A	1.395	0.66
722_R	727_V	1.392	0.66
221_Y	267_V	1.391	0.66
418_V	762_V	1.390	0.66
95_R	99_H	1.387	0.65
476_I	485_D	1.374	0.65
54_A	58_D	1.370	0.64
70_V	95_R	1.370	0.64
344_K	350_H	1.369	0.64
157_E	502_N	1.365	0.64
253_S	275_I	1.337	0.62
71_E	75_I	1.330	0.62
394_A	398_A	1.327	0.62
751_I	765_V	1.314	0.61
97_Y	100_V	1.313	0.61
25_V	61_I	1.310	0.61
29_K	59_N	1.297	0.60
181_L	653_A	1.296	0.60
218_D	222_D	1.295	0.60
28_F	33_I	1.289	0.60
564_K	626_L	1.287	0.59
176_E	180_D	1.286	0.59
148_R	194_E	1.283	0.59
325_F	530_G	1.283	0.59
625_L	628_G	1.278	0.59
401_E	404_V	1.270	0.58
30_L	34_L	1.264	0.58
36_K	39_S	1.250	0.57
534_M	550_L	1.250	0.57
338_I	404_V	1.249	0.57
474_F	492_I	1.241	0.57
407_Y	632_K	1.238	0.56
529_M	646_T	1.237	0.56
434_T	438_R	1.230	0.56
291_A	319_V	1.225	0.56
78_S	266_K	1.223	0.55
431_F	766_Y	1.222	0.55
64_R	99_H	1.219	0.55
476_I	483_A	1.207	0.54
552_Y	742_W	1.203	0.54
74_L	91_Y	1.201	0.54
41_P	74_L	1.197	0.54
486_W	557_F	1.192	0.53
51_D	77_N	1.189	0.53
200_L	498_R	1.189	0.53
249_D	341_R	1.188	0.53
188_P	281_R	1.185	0.53
567_I	626_L	1.184	0.53
658_S	752_N	1.183	0.53
113_D	143_Q	1.180	0.53
47_G	83_F	1.177	0.53
53_Q	57_K	1.173	0.52
143_Q	175_Y	1.173	0.52
43_E	90_R	1.172	0.52
28_F	36_K	1.165	0.52
288_V	318_S	1.164	0.52
632_K	689_K	1.163	0.52
168_K	171_E	1.161	0.51
490_A	629_E	1.157	0.51
67_A	95_R	1.154	0.51
575_T	580_D	1.151	0.51
337_L	408_V	1.145	0.50
67_A	77_N	1.143	0.50
194_E	258_A	1.140	0.50
305_G	750_T	1.139	0.50
29_K	32_K	1.133	0.50
473_K	537_K	1.132	0.50
70_V	89_K	1.128	0.49
187_S	202_A	1.127	0.49
534_M	554_L	1.126	0.49
60_A	65_V	1.117	0.49
54_A	57_K	1.115	0.49
175_Y	179_S	1.110	0.48
536_I	662_L	1.109	0.48
44_V	90_R	1.104	0.48
100_V	139_I	1.102	0.48
49_V	74_L	1.098	0.47
74_L	95_R	1.097	0.47
288_V	454_G	1.092	0.47
188_P	202_A	1.090	0.47
593_D	742_W	1.088	0.47
736_Q	749_K	1.088	0.47
63_T	94_A	1.087	0.47
559_F	594_F	1.083	0.47
471_L	558_I	1.082	0.46
235_G	283_G	1.082	0.46
51_D	58_D	1.079	0.46
41_P	60_A	1.070	0.46
284_A	776_G	1.069	0.46
733_V	737_A	1.064	0.45
67_A	94_A	1.063	0.45
581_A	585_R	1.062	0.45
563_Y	641_V	1.059	0.45
230_V	777_I	1.057	0.45
151_R	168_K	1.045	0.44
503_V	507_N	1.045	0.44
36_K	70_V	1.045	0.44
542_Y	732_H	1.044	0.44
154_A	171_E	1.043	0.44
31_E	34_L	1.042	0.44
789_V	792_F	1.040	0.44
93_L	97_Y	1.038	0.44
285_N	656_S	1.037	0.44
53_Q	67_A	1.036	0.44
177_M	492_I	1.035	0.43
291_A	296_I	1.034	0.43
28_F	70_V	1.027	0.43
43_E	63_T	1.027	0.43
28_F	53_Q	1.026	0.43
487_D	628_G	1.024	0.43
32_K	36_K	1.024	0.43
159_K	171_E	1.023	0.43
112_K	176_E	1.022	0.43
109_F	176_E	1.022	0.43
291_A	413_L	1.022	0.43
221_Y	228_A	1.021	0.43
32_K	39_S	1.019	0.43
593_D	597_L	1.017	0.42
71_E	90_R	1.016	0.42
224_L	267_V	1.014	0.42
23_G	32_K	1.014	0.42
435_I	746_G	1.013	0.42
450_T	456_E	1.013	0.42
167_V	520_R	1.012	0.42
38_S	59_N	1.009	0.42
552_Y	741_Q	1.007	0.42
404_V	407_Y	1.003	0.42
45_T	48_I	1.001	0.41
501_D	636_R	1.001	0.41
501_D	573_K	0.999	0.41
559_F	657_S	0.996	0.41
113_D	175_Y	0.991	0.41
70_V	91_Y	0.989	0.41
303_K	317_I	0.987	0.41
241_F	268_F	0.981	0.40
152_F	198_G	0.981	0.40
33_I	37_L	0.977	0.40
623_F	642_S	0.976	0.40
396_V	400_K	0.973	0.40
630_R	716_S	0.973	0.40
46_D	83_F	0.973	0.40
88_A	113_D	0.973	0.40
576_F	582_R	0.971	0.40
447_I	571_K	0.969	0.39
259_S	303_K	0.968	0.39
543_D	547_A	0.968	0.39
635_L	640_V	0.966	0.39
628_G	631_L	0.966	0.39
452_P	779_V	0.965	0.39
87_L	95_R	0.963	0.39
468_S	644_A	0.961	0.39
289_M	293_H	0.960	0.39
157_E	498_R	0.960	0.39
40_V	87_L	0.957	0.39
85_M	96_I	0.957	0.39
348_R	448_N	0.957	0.39
33_I	67_A	0.952	0.38
406_K	716_S	0.949	0.38
441_V	576_F	0.949	0.38
258_A	263_S	0.948	0.38
440_P	457_P	0.947	0.38
411_K	415_D	0.947	0.38
262_V	727_V	0.945	0.38
539_G	764_K	0.944	0.38
120_A	542_Y	0.944	0.38
739_W	747_T	0.943	0.38
25_V	44_V	0.942	0.38
86_E	96_I	0.933	0.37
512_K	516_D	0.931	0.37
192_N	272_T	0.929	0.37
346_A	398_A	0.927	0.37
60_A	63_T	0.925	0.37
393_E	397_I	0.923	0.37
487_D	490_A	0.922	0.37
297_E	416_E	0.921	0.37
26_D	63_T	0.921	0.37
288_V	450_T	0.921	0.37
59_N	74_L	0.920	0.36
74_L	99_H	0.920	0.36
231_H	276_K	0.920	0.36
256_G	278_G	0.920	0.36
29_K	42_D	0.919	0.36
109_F	112_K	0.914	0.36
408_V	553_Q	0.913	0.36
74_L	96_I	0.913	0.36
560_Y	622_D	0.912	0.36
685_E	690_Y	0.910	0.36
143_Q	179_S	0.909	0.36
522_R	636_R	0.908	0.36
777_I	780_Y	0.907	0.36
180_D	412_S	0.905	0.36
496_G	526_L	0.903	0.35
445_G	581_A	0.903	0.35
122_K	126_A	0.901	0.35
230_V	649_I	0.901	0.35
389_I	393_E	0.898	0.35
187_S	282_R	0.895	0.35
450_T	514_I	0.895	0.35
736_Q	747_T	0.893	0.35
225_R	229_L	0.889	0.35
266_K	270_A	0.888	0.35
625_L	629_E	0.888	0.35
32_K	67_A	0.888	0.35
33_I	53_Q	0.886	0.35
310_V	314_N	0.885	0.34
475_V	488_G	0.884	0.34
277_Q	281_R	0.882	0.34
153_L	503_V	0.882	0.34
546_D	549_Y	0.882	0.34
250_V	341_R	0.880	0.34
333_E	409_N	0.880	0.34
329_V	411_K	0.879	0.34
483_A	540_I	0.879	0.34
73_N	76_E	0.877	0.34
329_V	337_L	0.877	0.34
92_V	121_L	0.875	0.34
71_E	89_K	0.874	0.34
28_F	69_I	0.873	0.34
35_S	51_D	0.870	0.34
56_V	70_V	0.869	0.34
680_D	710_N	0.868	0.33
297_E	406_K	0.868	0.33
492_I	495_Y	0.866	0.33
303_K	426_D	0.866	0.33
418_V	650_S	0.865	0.33
61_I	69_I	0.865	0.33
498_R	502_N	0.864	0.33
594_F	627_K	0.864	0.33
769_A	777_I	0.863	0.33
132_D	137_R	0.862	0.33
246_P	404_V	0.860	0.33
597_L	740_Q	0.858	0.33
550_L	554_L	0.856	0.33
438_R	596_S	0.856	0.33
89_K	93_L	0.855	0.33
222_D	513_Q	0.854	0.33
647_G	762_V	0.854	0.33
248_G	727_V	0.854	0.33
51_D	134_N	0.854	0.33
533_R	655_T	0.853	0.33
408_V	413_L	0.853	0.33
403_A	408_V	0.852	0.33
523_K	638_S	0.852	0.33
465_N	504_I	0.852	0.33
440_P	746_G	0.851	0.33
571_K	628_G	0.850	0.32
96_I	99_H	0.850	0.32
660_E	750_T	0.842	0.32
503_V	526_L	0.840	0.32
39_S	42_D	0.838	0.32
180_D	408_V	0.836	0.32
26_D	34_L	0.835	0.32
23_G	27_E	0.832	0.31
264_F	649_I	0.829	0.31
485_D	488_G	0.828	0.31
116_L	146_F	0.827	0.31
33_I	92_V	0.822	0.31
203_C	453_C	0.821	0.31
204_F	447_I	0.820	0.31
34_L	53_Q	0.820	0.31
477_E	483_A	0.819	0.31
174_F	499_F	0.818	0.31
33_I	70_V	0.817	0.31
51_D	56_V	0.817	0.31
23_G	26_D	0.816	0.31
28_F	34_L	0.816	0.31
650_S	657_S	0.814	0.30
88_A	96_I	0.814	0.30
39_S	99_H	0.814	0.30
91_Y	100_V	0.813	0.30
93_L	121_L	0.807	0.30
192_N	232_Q	0.807	0.30
41_P	99_H	0.804	0.30
199_I	305_G	0.804	0.30
182_K	491_E	0.804	0.30
74_L	86_E	0.802	0.30
70_V	78_S	0.801	0.30
331_K	408_V	0.801	0.30
42_D	101_F	0.800	0.30
471_L	528_V	0.798	0.30
37_L	88_A	0.796	0.30
576_F	581_A	0.796	0.30
547_A	735_H	0.795	0.29
662_L	665_L	0.794	0.29
147_R	172_D	0.793	0.29
186_N	316_N	0.791	0.29
475_V	537_K	0.789	0.29
96_I	177_M	0.787	0.29
715_R	718_R	0.787	0.29
52_V	109_F	0.786	0.29
733_V	774_I	0.786	0.29
29_K	54_A	0.785	0.29
145_L	194_E	0.785	0.29
450_T	745_S	0.785	0.29
284_A	567_I	0.784	0.29
626_L	629_E	0.784	0.29
312_L	315_F	0.783	0.29
74_L	79_L	0.779	0.29
230_V	311_Q	0.777	0.29
236_G	453_C	0.777	0.29
571_K	580_D	0.777	0.29
137_R	412_S	0.775	0.28
151_R	172_D	0.774	0.28
391_V	399_S	0.772	0.28
367_Q	401_E	0.770	0.28
61_I	118_Y	0.769	0.28
27_E	35_S	0.769	0.28
266_K	311_Q	0.768	0.28
31_E	53_Q	0.768	0.28
728_P	765_V	0.767	0.28
26_D	29_K	0.767	0.28
89_K	96_I	0.767	0.28
70_V	83_F	0.766	0.28
47_G	50_N	0.766	0.28
114_L	406_K	0.766	0.28
443_Y	581_A	0.766	0.28
70_V	99_H	0.764	0.28
71_E	92_V	0.764	0.28
62_D	68_D	0.763	0.28
28_F	32_K	0.762	0.28
594_F	597_L	0.762	0.28
111_E	150_A	0.761	0.28
78_S	84_L	0.758	0.28
109_F	180_D	0.757	0.27
321_A	407_Y	0.757	0.27
40_V	67_A	0.755	0.27
637_N	640_V	0.755	0.27
487_D	540_I	0.754	0.27
68_D	72_R	0.753	0.27
289_M	299_F	0.753	0.27
620_K	624_D	0.753	0.27
34_L	50_N	0.752	0.27
571_K	579_Y	0.752	0.27
290_H	432_I	0.752	0.27
38_S	42_D	0.752	0.27
91_Y	96_I	0.750	0.27
61_I	98_N	0.748	0.27
141_T	144_M	0.747	0.27
333_E	491_E	0.747	0.27
440_P	639_T	0.747	0.27
110_D	144_M	0.745	0.27
449_A	457_P	0.745	0.27
251_V	511_L	0.745	0.27
41_P	44_V	0.744	0.27
28_F	57_K	0.744	0.27
65_V	68_D	0.743	0.27
159_K	632_K	0.742	0.27
35_S	38_S	0.741	0.27
73_N	83_F	0.740	0.27
472_E	537_K	0.739	0.27
458_L	717_L	0.736	0.26
530_G	533_R	0.736	0.26
281_R	453_C	0.736	0.26
63_T	68_D	0.735	0.26
72_R	515_E	0.735	0.26
205_V	523_K	0.734	0.26
252_A	406_K	0.734	0.26
483_A	685_E	0.734	0.26
567_I	579_Y	0.734	0.26
349_D	398_A	0.733	0.26
453_C	466_L	0.733	0.26
331_K	771_K	0.732	0.26
686_Y	717_L	0.731	0.26
246_P	249_D	0.731	0.26
50_N	57_K	0.729	0.26
50_N	54_A	0.729	0.26
510_P	672_A	0.729	0.26
28_F	41_P	0.728	0.26
503_V	524_V	0.727	0.26
590_S	593_D	0.727	0.26
203_C	451_N	0.726	0.26
125_E	129_L	0.726	0.26
681_P	711_V	0.726	0.26
521_T	578_T	0.724	0.26
35_S	42_D	0.724	0.26
791_Y	794_V	0.724	0.26
183_F	467_G	0.724	0.26
36_K	94_A	0.723	0.26
203_C	236_G	0.721	0.26
71_E	77_N	0.720	0.26
225_R	513_Q	0.720	0.26
262_V	730_I	0.719	0.26
36_K	95_R	0.717	0.26
67_A	70_V	0.717	0.26
147_R	175_Y	0.716	0.25
454_G	463_S	0.715	0.25
784_S	788_Q	0.714	0.25
40_V	53_Q	0.709	0.25
540_I	650_S	0.708	0.25
338_I	406_K	0.707	0.25
75_I	88_A	0.707	0.25
59_N	65_V	0.707	0.25
123_V	311_Q	0.706	0.25
224_L	332_G	0.704	0.25
42_D	46_D	0.703	0.25
365_W	368_E	0.703	0.25
109_F	169_Q	0.702	0.25
332_G	488_G	0.701	0.25
67_A	71_E	0.699	0.25
78_S	85_M	0.699	0.25
180_D	409_N	0.698	0.25
543_D	731_Y	0.698	0.25
186_N	276_K	0.695	0.24
78_S	204_F	0.694	0.24
430_L	649_I	0.694	0.24
146_F	181_L	0.694	0.24
61_I	66_I	0.693	0.24
157_E	501_D	0.692	0.24
203_C	466_L	0.692	0.24
36_K	41_P	0.692	0.24
203_C	281_R	0.691	0.24
482_A	689_K	0.691	0.24
56_V	66_I	0.690	0.24
302_A	317_I	0.689	0.24
73_N	77_N	0.686	0.24
128_Y	453_C	0.686	0.24
158_R	497_V	0.686	0.24
483_A	538_L	0.685	0.24
204_F	465_N	0.685	0.24
33_I	95_R	0.685	0.24
224_L	271_S	0.684	0.24
493_I	679_I	0.683	0.24
487_D	571_K	0.683	0.24
52_V	74_L	0.683	0.24
26_D	31_E	0.683	0.24
37_L	53_Q	0.682	0.24
545_V	628_G	0.682	0.24
49_V	54_A	0.682	0.24
169_Q	632_K	0.682	0.24
449_A	460_P	0.682	0.24
236_G	284_A	0.680	0.24
127_R	274_V	0.679	0.24
652_I	659_I	0.679	0.24
71_E	85_M	0.679	0.24
205_V	315_F	0.679	0.24
240_D	460_P	0.679	0.24
201_S	251_V	0.679	0.24
26_D	30_L	0.678	0.24
324_Y	328_A	0.678	0.24
493_I	771_K	0.678	0.24
494_R	629_E	0.677	0.24
264_F	274_V	0.677	0.24
75_I	78_S	0.677	0.24
47_G	70_V	0.677	0.24
131_K	247_K	0.676	0.24
645_P	748_S	0.675	0.24
210_D	572_E	0.675	0.24
248_G	685_E	0.675	0.24
33_I	63_T	0.675	0.24
64_R	78_S	0.675	0.24
300_I	322_Y	0.675	0.24
392_D	396_V	0.674	0.23
51_D	99_H	0.673	0.23
46_D	53_Q	0.673	0.23
63_T	74_L	0.672	0.23
218_D	575_T	0.672	0.23
46_D	49_V	0.671	0.23
89_K	95_R	0.670	0.23
53_Q	66_I	0.670	0.23
685_E	711_V	0.669	0.23
55_N	58_D	0.668	0.23
157_E	572_E	0.668	0.23
241_F	265_M	0.665	0.23
241_F	287_G	0.664	0.23
66_I	513_Q	0.664	0.23
318_S	449_A	0.664	0.23
38_S	45_T	0.664	0.23
236_G	451_N	0.663	0.23
529_M	655_T	0.662	0.23
666_A	718_R	0.662	0.23
713_M	717_L	0.661	0.23
66_I	558_I	0.661	0.23
85_M	117_S	0.661	0.23
469_I	567_I	0.660	0.23
296_I	413_L	0.660	0.23
180_D	540_I	0.659	0.23
321_A	627_K	0.659	0.23
48_I	53_Q	0.658	0.23
60_A	70_V	0.657	0.23
289_M	572_E	0.656	0.23
23_G	29_K	0.655	0.23
314_N	423_D	0.655	0.23
101_F	108_D	0.654	0.23
477_E	538_L	0.654	0.23
41_P	49_V	0.653	0.23
60_A	64_R	0.653	0.23
490_A	557_F	0.653	0.23
63_T	91_Y	0.653	0.23
34_L	61_I	0.651	0.22
506_A	579_Y	0.650	0.22
344_K	676_F	0.649	0.22
493_I	561_H	0.649	0.22
321_A	412_S	0.649	0.22
232_Q	468_S	0.649	0.22
65_V	89_K	0.648	0.22
36_K	71_E	0.648	0.22
226_A	512_K	0.648	0.22
173_K	196_R	0.648	0.22
128_Y	203_C	0.647	0.22
173_K	301_R	0.647	0.22
490_A	568_E	0.647	0.22
336_P	391_V	0.646	0.22
38_S	56_V	0.645	0.22
412_S	628_G	0.645	0.22
511_L	675_K	0.643	0.22
146_F	184_V	0.643	0.22
159_K	581_A	0.642	0.22
537_K	682_L	0.642	0.22
236_G	281_R	0.642	0.22
560_Y	564_K	0.641	0.22
475_V	538_L	0.640	0.22
61_I	490_A	0.640	0.22
157_E	174_F	0.639	0.22
39_S	63_T	0.639	0.22
520_R	578_T	0.638	0.22
563_Y	567_I	0.638	0.22
483_A	689_K	0.638	0.22
650_S	754_R	0.638	0.22
451_N	466_L	0.638	0.22
107_K	553_Q	0.637	0.22
69_I	75_I	0.637	0.22
77_N	95_R	0.637	0.22
189_T	503_V	0.635	0.22
284_A	470_N	0.635	0.22
64_R	70_V	0.635	0.22
258_A	471_L	0.635	0.22
594_F	657_S	0.635	0.22
546_D	628_G	0.634	0.22
34_L	40_V	0.633	0.22
281_R	451_N	0.633	0.22
33_I	580_D	0.633	0.22
326_M	770_W	0.633	0.22
33_I	218_D	0.631	0.22
408_V	743_N	0.631	0.22
236_G	466_L	0.630	0.22
649_I	766_Y	0.630	0.22
282_R	647_G	0.630	0.22
49_V	56_V	0.629	0.21
31_E	54_A	0.628	0.21
52_V	331_K	0.626	0.21
557_F	621_L	0.626	0.21
305_G	424_S	0.626	0.21
36_K	91_Y	0.623	0.21
227_T	239_F	0.623	0.21
185_P	774_I	0.623	0.21
222_D	226_A	0.622	0.21
90_R	100_V	0.621	0.21
327_D	334_S	0.620	0.21
531_L	735_H	0.620	0.21
177_M	495_Y	0.620	0.21
60_A	577_P	0.618	0.21
96_I	129_L	0.618	0.21
249_D	681_P	0.617	0.21
140_E	623_F	0.616	0.21
54_A	625_L	0.615	0.21
188_P	277_Q	0.615	0.21
63_T	78_S	0.615	0.21
458_L	744_D	0.614	0.21
45_T	101_F	0.614	0.21
516_D	577_P	0.614	0.21
154_A	157_E	0.613	0.21
35_S	632_K	0.612	0.21
31_E	51_D	0.612	0.21
63_T	71_E	0.611	0.21
541_A	628_G	0.611	0.21
56_V	61_I	0.611	0.21
58_D	80_K	0.610	0.21
580_D	631_L	0.610	0.21
570_A	634_G	0.610	0.21
737_A	772_L	0.610	0.21
110_D	141_T	0.610	0.21
730_I	764_K	0.610	0.21
453_C	645_P	0.610	0.21
146_F	442_W	0.609	0.21
167_V	171_E	0.609	0.21
330_V	768_L	0.609	0.21
29_K	348_R	0.608	0.21
325_F	335_V	0.608	0.21
62_D	66_I	0.607	0.21
515_E	627_K	0.607	0.21
181_L	184_V	0.607	0.21
710_N	713_M	0.606	0.21
31_E	35_S	0.606	0.21
429_L	577_P	0.605	0.20
453_C	748_S	0.603	0.20
221_Y	650_S	0.603	0.20
43_E	47_G	0.601	0.20
45_T	52_V	0.600	0.20
58_D	63_T	0.600	0.20
88_A	129_L	0.600	0.20
310_V	781_R	0.600	0.20
301_R	737_A	0.599	0.20
281_R	466_L	0.598	0.20
92_V	125_E	0.597	0.20
246_P	630_R	0.597	0.20
232_Q	518_T	0.596	0.20
26_D	39_S	0.596	0.20
28_F	95_R	0.595	0.20
60_A	74_L	0.594	0.20
427_P	445_G	0.594	0.20
67_A	74_L	0.593	0.20
459_L	521_T	0.592	0.20
31_E	38_S	0.592	0.20
502_N	572_E	0.591	0.20
54_A	571_K	0.591	0.20
48_I	56_V	0.591	0.20
50_N	58_D	0.590	0.20
149_V	190_L	0.590	0.20
559_F	597_L	0.590	0.20
128_Y	451_N	0.589	0.20
585_R	590_S	0.589	0.20
294_A	405_V	0.588	0.20
319_V	417_I	0.587	0.20
545_V	549_Y	0.586	0.20
291_A	321_A	0.586	0.20
37_L	572_E	0.586	0.20
70_V	94_A	0.585	0.20
231_H	234_G	0.585	0.20
38_S	50_N	0.583	0.20
523_K	652_I	0.583	0.20
169_Q	343_T	0.583	0.20
624_D	631_L	0.582	0.20
599_Q	742_W	0.582	0.20
60_A	89_K	0.581	0.19
515_E	571_K	0.580	0.19
473_K	568_E	0.580	0.19
299_F	530_G	0.580	0.19
188_P	453_C	0.579	0.19
59_N	107_K	0.579	0.19
128_Y	236_G	0.579	0.19
337_L	410_A	0.578	0.19
751_I	769_A	0.577	0.19
203_C	645_P	0.577	0.19
493_I	562_A	0.577	0.19
92_V	96_I	0.577	0.19
452_P	456_E	0.576	0.19
204_F	230_V	0.576	0.19
111_E	418_V	0.575	0.19
96_I	100_V	0.575	0.19
284_A	403_A	0.575	0.19
338_I	403_A	0.575	0.19
202_A	779_V	0.574	0.19
36_K	63_T	0.573	0.19
457_P	658_S	0.573	0.19
81_Y	87_L	0.573	0.19
274_V	655_T	0.572	0.19
25_V	150_A	0.572	0.19
50_N	56_V	0.571	0.19
184_V	649_I	0.571	0.19
48_I	66_I	0.570	0.19
237_T	429_L	0.570	0.19
236_G	748_S	0.570	0.19
276_K	306_Q	0.569	0.19
646_T	650_S	0.569	0.19
547_A	743_N	0.569	0.19
269_D	543_D	0.569	0.19
584_Y	592_L	0.569	0.19
327_D	389_I	0.568	0.19
510_P	664_A	0.568	0.19
60_A	71_E	0.567	0.19
62_D	180_D	0.567	0.19
33_I	39_S	0.566	0.19
288_V	518_T	0.566	0.19
108_D	331_K	0.566	0.19
258_A	559_F	0.565	0.19
24_K	42_D	0.564	0.19
75_I	89_K	0.562	0.19
563_Y	594_F	0.562	0.19
745_S	776_G	0.562	0.19
487_D	580_D	0.561	0.19
24_K	30_L	0.561	0.19
219_G	222_D	0.561	0.19
473_K	488_G	0.559	0.19
128_Y	466_L	0.558	0.19
122_K	297_E	0.556	0.19
487_D	545_V	0.556	0.19
291_A	329_V	0.556	0.19
175_Y	292_W	0.555	0.18
784_S	787_Q	0.555	0.18
328_A	410_A	0.555	0.18
57_K	111_E	0.554	0.18
128_Y	281_R	0.554	0.18
463_S	654_G	0.554	0.18
331_K	631_L	0.554	0.18
339_N	677_I	0.553	0.18
68_D	89_K	0.553	0.18
32_K	98_N	0.553	0.18
395_L	399_S	0.552	0.18
521_T	638_S	0.551	0.18
59_N	650_S	0.551	0.18
46_D	56_V	0.550	0.18
34_L	42_D	0.550	0.18
46_D	473_K	0.549	0.18
278_G	674_G	0.548	0.18
199_I	507_N	0.548	0.18
253_S	272_T	0.548	0.18
53_Q	58_D	0.547	0.18
579_Y	584_Y	0.547	0.18
781_R	784_S	0.547	0.18
64_R	403_A	0.547	0.18
524_V	589_E	0.546	0.18
211_A	256_G	0.546	0.18
34_L	52_V	0.545	0.18
301_R	338_I	0.545	0.18
47_G	54_A	0.545	0.18
269_D	310_V	0.545	0.18
568_E	627_K	0.545	0.18
72_R	76_E	0.545	0.18
456_E	642_S	0.544	0.18
62_D	524_V	0.544	0.18
239_F	268_F	0.544	0.18
84_L	205_V	0.544	0.18
178_I	400_K	0.543	0.18
242_S	347_G	0.542	0.18
90_R	96_I	0.542	0.18
409_N	539_G	0.542	0.18
543_D	679_I	0.541	0.18
564_K	625_L	0.541	0.18
579_Y	594_F	0.541	0.18
63_T	95_R	0.540	0.18
262_V	303_K	0.540	0.18
78_S	91_Y	0.540	0.18
463_S	514_I	0.540	0.18
244_L	302_A	0.540	0.18
394_A	397_I	0.540	0.18
48_I	52_V	0.539	0.18
327_D	771_K	0.538	0.18
37_L	631_L	0.538	0.18
31_E	56_V	0.537	0.18
141_T	225_R	0.537	0.18
203_C	748_S	0.537	0.18
232_Q	744_D	0.536	0.18
562_A	747_T	0.536	0.18
186_N	231_H	0.536	0.18
75_I	84_L	0.536	0.18
540_I	733_V	0.536	0.18
64_R	71_E	0.535	0.18
430_L	435_I	0.535	0.18
24_K	159_K	0.534	0.18
736_Q	739_W	0.534	0.18
309_D	315_F	0.534	0.18
495_Y	571_K	0.534	0.18
26_D	98_N	0.533	0.18
82_P	89_K	0.533	0.18
54_A	716_S	0.533	0.18
435_I	745_S	0.533	0.18
611_V	737_A	0.532	0.18
469_I	493_I	0.532	0.18
119_N	651_I	0.532	0.18
43_E	407_Y	0.531	0.18
154_A	495_Y	0.530	0.18
146_F	182_K	0.530	0.18
466_L	645_P	0.530	0.18
81_Y	96_I	0.530	0.18
266_K	535_F	0.529	0.18
52_V	64_R	0.529	0.18
585_R	589_E	0.528	0.17
767_L	771_K	0.528	0.17
733_V	765_V	0.527	0.17
207_P	240_D	0.527	0.17
130_L	495_Y	0.527	0.17
24_K	35_S	0.527	0.17
396_V	399_S	0.526	0.17
266_K	413_L	0.526	0.17
39_S	68_D	0.526	0.17
647_G	718_R	0.525	0.17
77_N	100_V	0.525	0.17
72_R	108_D	0.525	0.17
66_I	85_M	0.524	0.17
77_N	99_H	0.524	0.17
107_K	632_K	0.524	0.17
147_R	168_K	0.524	0.17
23_G	63_T	0.524	0.17
126_A	493_I	0.524	0.17
295_D	781_R	0.523	0.17
24_K	27_E	0.523	0.17
37_L	49_V	0.523	0.17
29_K	62_D	0.523	0.17
445_G	465_N	0.523	0.17
539_G	716_S	0.522	0.17
665_L	723_T	0.521	0.17
47_G	52_V	0.521	0.17
92_V	99_H	0.520	0.17
131_K	726_E	0.520	0.17
235_G	465_N	0.520	0.17
307_L	311_Q	0.520	0.17
202_A	452_P	0.520	0.17
229_L	287_G	0.520	0.17
150_A	392_D	0.519	0.17
231_H	518_T	0.519	0.17
683_F	687_L	0.519	0.17
72_R	764_K	0.518	0.17
176_E	179_S	0.518	0.17
60_A	628_G	0.518	0.17
77_N	97_Y	0.518	0.17
39_S	95_R	0.517	0.17
44_V	47_G	0.517	0.17
41_P	85_M	0.517	0.17
451_N	645_P	0.517	0.17
169_Q	173_K	0.517	0.17
441_V	459_L	0.517	0.17
142_P	190_L	0.516	0.17
143_Q	147_R	0.514	0.17
298_D	733_V	0.514	0.17
51_D	109_F	0.514	0.17
32_K	35_S	0.514	0.17
236_G	645_P	0.513	0.17
87_L	101_F	0.513	0.17
451_N	748_S	0.512	0.17
476_I	487_D	0.511	0.17
43_E	73_N	0.511	0.17
204_F	235_G	0.511	0.17
301_R	416_E	0.511	0.17
540_I	546_D	0.511	0.17
583_L	591_A	0.510	0.17
523_K	647_G	0.509	0.17
439_H	447_I	0.509	0.17
466_L	525_G	0.509	0.17
429_L	766_Y	0.509	0.17
99_H	549_Y	0.508	0.17
244_L	426_D	0.508	0.17
210_D	778_T	0.508	0.17
50_N	491_E	0.508	0.17
650_S	658_S	0.508	0.17
29_K	51_D	0.508	0.17
288_V	320_G	0.507	0.17
188_P	203_C	0.507	0.17
146_F	197_L	0.507	0.17
65_V	628_G	0.507	0.17
724_A	766_Y	0.506	0.17
86_E	89_K	0.506	0.17
99_H	107_K	0.505	0.17
185_P	499_F	0.505	0.17
788_Q	794_V	0.504	0.17
420_G	651_I	0.503	0.17
134_N	545_V	0.503	0.17
331_K	406_K	0.503	0.17
590_S	595_D	0.503	0.17
237_T	448_N	0.503	0.17
140_E	745_S	0.503	0.17
221_Y	419_K	0.502	0.17
559_F	593_D	0.502	0.17
92_V	746_G	0.502	0.17
471_L	637_N	0.501	0.16
68_D	539_G	0.501	0.16
625_L	632_K	0.501	0.16
27_E	42_D	0.501	0.16
175_Y	556_K	0.500	0.16
28_F	54_A	0.500	0.16
439_H	459_L	0.500	0.16
94_A	658_S	0.500	0.16
30_L	49_V	0.500	0.16
92_V	95_R	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3hncA	2	0.8205	100	0.206	Contact Map
3k8tA	2	0.7087	100	0.215	Contact Map
2xapA	4	0.7931	100	0.258	Contact Map
2wghA	2	0.7289	100	0.282	Contact Map
1peqA	2	0.7146	100	0.334	Contact Map
3o0qA	2	0.6885	100	0.342	Contact Map
1l1lA	1	0.6671	100	0.518	Contact Map
4u3eA	2	0.654	99.9	0.924	Contact Map
1h7bA	2	0.5161	77.3	0.985	Contact Map
3ix3A	2	0.1807	31.6	0.988	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0247 seconds.