GATE - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

GATE - Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit E

UniProt:	Q97ZH6	Sequences: MSELNYEELGLKVGLEIHQQLNTPHKLFCNCSTNLEEEYKLTLERYLRPALSELGEVDVAALFEWKKGKKYVYRIPITTSCLVEADEEPPHAINEEALKIALAIAMALNSNIVDEIYVMRKIVIDGSNTTGFQRTAIIALGGMLKDEEVSIQSIAVEEDAARKIDEGTDQVTYSLDRLGIPLIEISTGPDIRSPEQAERVALKIGQLLRMTGKVKRGIGTIRQDLNISIKGGTKIEIKGVQKLELIPDIVRYEAIRQFNLLKIKEELYRRGLTKELVLSNFVVKDVTELFKNTNSKIIKNGIEKGGLVYGIRAYKLKGVLGWELIPKKRRFGTEIADYVRALAGLGGLFHSDELPNYGITEEEINKVREALNATTEDALILIVGERERLDKAVEVIKDRILLAFDGIPKETRGALDDGTTKFLRPQPGSARMYPETDIPPRRIDEKLLEDAKKLVPESPESKMKRYIVLGLSEELAKEIIRDPRLDLFEELVNKYSPRVPPVVIASTITNTLKYVKSKGGDISKINEEDIEELIKSIYESRISKDSISEILVEYTTSKNVELKDIIRKYEVLPIEELEKIIDDIINSNLDEIRKRKDKAVNLIMSKVMSKVKGRADGKIVLELIRSRLKNVIE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	633 (612)
Sequences:	192 (142)
Seq/√Len:	5.7

HALSA - GATE
SULSO - GATE

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
147_E	196_Q	5.641	0.99
286_V	310_G	5.176	0.99
191_I	197_A	5.169	0.98
577_L	611_V	4.887	0.98
351_S	379_L	4.196	0.94
367_V	379_L	4.154	0.94
582_D	627_R	4.090	0.94
110_S	154_I	4.026	0.93
351_S	367_V	3.729	0.90
298_I	308_V	3.700	0.89
234_K	426_Q	3.696	0.89
361_E	365_N	3.501	0.87
336_A	340_R	3.420	0.85
338_Y	402_L	3.408	0.85
104_I	108_L	3.359	0.84
5_N	8_E	3.155	0.80
457_E	465_R	3.036	0.77
9_L	218_I	2.931	0.74
19_Q	208_L	2.882	0.73
339_V	345_L	2.868	0.73
603_I	624_I	2.834	0.72
562_L	566_I	2.706	0.68
582_D	585_I	2.534	0.63
536_S	562_L	2.518	0.62
583_D	610_K	2.495	0.61
105_A	139_A	2.489	0.61
171_V	308_V	2.481	0.61
345_L	384_G	2.475	0.61
588_N	591_E	2.457	0.60
572_L	580_I	2.386	0.58
428_G	434_P	2.372	0.57
515_V	520_G	2.370	0.57
36_E	78_T	2.300	0.55
627_R	630_N	2.295	0.55
22_N	215_K	2.282	0.54
505_A	519_G	2.263	0.53
69_K	554_Y	2.256	0.53
491_L	504_I	2.252	0.53
163_K	173_Y	2.172	0.50
35_L	237_I	2.171	0.50
288_E	291_K	2.128	0.49
9_L	626_S	2.128	0.49
371_L	379_L	2.104	0.48
607_V	611_V	2.098	0.48
19_Q	214_V	2.094	0.48
592_I	603_I	2.080	0.47
304_K	444_D	2.069	0.47
329_R	333_T	2.054	0.46
585_I	628_L	2.043	0.46
31_C	81_C	2.036	0.46
491_L	531_E	2.027	0.45
102_L	112_I	2.025	0.45
396_I	577_L	2.002	0.44
429_S	478_E	1.983	0.44
190_D	197_A	1.979	0.44
507_T	547_I	1.949	0.43
143_M	148_E	1.942	0.42
136_A	622_E	1.935	0.42
152_Q	173_Y	1.934	0.42
93_I	585_I	1.932	0.42
105_A	166_E	1.930	0.42
96_E	113_V	1.923	0.42
264_K	268_Y	1.918	0.42
237_I	420_T	1.914	0.41
272_L	426_Q	1.899	0.41
208_L	214_V	1.889	0.41
511_T	515_V	1.883	0.40
65_W	87_E	1.859	0.40
43_L	85_A	1.845	0.39
49_P	62_L	1.841	0.39
67_K	71_Y	1.818	0.38
373_A	379_L	1.791	0.37
93_I	136_A	1.769	0.37
108_L	536_S	1.746	0.36
423_L	461_S	1.738	0.36
29_C	81_C	1.737	0.36
589_L	593_R	1.717	0.35
69_K	621_L	1.716	0.35
77_I	174_S	1.714	0.35
501_P	505_A	1.700	0.34
173_Y	197_A	1.696	0.34
331_F	624_I	1.694	0.34
578_E	627_R	1.692	0.34
600_V	621_L	1.688	0.34
259_N	262_K	1.686	0.34
339_V	384_G	1.683	0.34
107_A	451_A	1.680	0.34
145_K	148_E	1.675	0.34
521_D	524_K	1.674	0.34
107_A	455_V	1.669	0.33
293_T	363_E	1.664	0.33
50_A	139_A	1.664	0.33
591_E	602_L	1.647	0.33
511_T	519_G	1.632	0.32
59_V	426_Q	1.630	0.32
446_K	468_V	1.629	0.32
550_I	553_E	1.614	0.32
588_N	607_V	1.610	0.32
329_R	337_D	1.606	0.32
225_L	459_P	1.605	0.32
605_S	617_G	1.604	0.31
166_E	479_I	1.600	0.31
583_D	615_A	1.599	0.31
532_E	562_L	1.597	0.31
503_V	507_T	1.596	0.31
64_E	124_I	1.595	0.31
299_K	303_E	1.588	0.31
173_Y	570_E	1.580	0.31
198_E	247_P	1.577	0.31
49_P	417_D	1.576	0.31
389_L	396_I	1.575	0.31
491_L	495_Y	1.574	0.31
7_E	192_R	1.569	0.30
195_E	381_L	1.568	0.30
212_G	337_D	1.557	0.30
455_V	485_L	1.547	0.30
9_L	258_F	1.546	0.30
159_D	186_S	1.542	0.30
37_E	567_R	1.538	0.30
314_Y	525_I	1.535	0.29
163_K	460_E	1.532	0.29
233_T	409_K	1.526	0.29
84_E	129_T	1.511	0.29
37_E	564_D	1.505	0.29
381_L	416_D	1.498	0.28
409_K	422_F	1.497	0.28
574_I	619_I	1.495	0.28
340_R	426_Q	1.492	0.28
150_S	188_G	1.487	0.28
43_L	520_G	1.486	0.28
591_E	606_K	1.485	0.28
597_D	629_K	1.478	0.28
151_I	284_K	1.477	0.28
324_L	333_T	1.476	0.28
149_V	196_Q	1.470	0.28
479_I	509_T	1.469	0.28
37_E	538_Y	1.466	0.28
335_I	339_V	1.450	0.27
109_N	143_M	1.445	0.27
231_G	367_V	1.442	0.27
534_I	537_I	1.441	0.27
108_L	388_R	1.433	0.27
19_Q	209_R	1.430	0.27
49_P	308_V	1.428	0.26
501_P	506_S	1.427	0.26
101_A	585_I	1.410	0.26
271_G	404_F	1.410	0.26
204_I	246_I	1.408	0.26
345_L	396_I	1.405	0.26
94_N	136_A	1.403	0.26
317_K	368_R	1.401	0.26
413_G	423_L	1.389	0.25
233_T	465_R	1.386	0.25
351_S	371_L	1.373	0.25
245_L	423_L	1.370	0.25
233_T	457_E	1.367	0.25
124_I	573_P	1.365	0.25
234_K	331_F	1.362	0.25
345_L	601_N	1.361	0.25
108_L	368_R	1.359	0.25
107_A	530_I	1.353	0.24
272_L	340_R	1.351	0.24
264_K	537_I	1.340	0.24
269_R	581_I	1.340	0.24
375_T	384_G	1.335	0.24
5_N	230_K	1.331	0.24
137_I	533_L	1.328	0.24
451_A	454_L	1.327	0.24
426_Q	458_S	1.323	0.24
159_D	206_Q	1.322	0.24
149_V	421_K	1.319	0.24
206_Q	545_D	1.318	0.24
588_N	606_K	1.309	0.23
606_K	609_S	1.304	0.23
146_D	246_I	1.292	0.23
515_V	519_G	1.291	0.23
282_V	365_N	1.288	0.23
507_T	548_S	1.279	0.23
398_D	543_S	1.276	0.23
574_I	615_A	1.274	0.23
159_D	162_R	1.272	0.22
98_L	551_L	1.270	0.22
162_R	174_S	1.269	0.22
197_A	546_S	1.263	0.22
295_S	355_P	1.256	0.22
207_L	479_I	1.254	0.22
407_I	533_L	1.252	0.22
32_S	212_G	1.249	0.22
501_P	508_I	1.247	0.22
104_I	369_E	1.247	0.22
542_I	592_I	1.245	0.22
258_F	420_T	1.243	0.22
129_T	175_L	1.242	0.22
611_V	615_A	1.238	0.22
469_L	614_R	1.226	0.21
149_V	577_L	1.223	0.21
313_A	339_V	1.223	0.21
536_S	566_I	1.218	0.21
64_E	137_I	1.216	0.21
140_L	183_I	1.210	0.21
188_G	193_S	1.205	0.21
505_A	517_S	1.191	0.21
595_R	609_S	1.190	0.21
502_V	603_I	1.187	0.20
313_A	400_I	1.184	0.20
300_N	549_E	1.183	0.20
11_L	52_S	1.182	0.20
550_I	577_L	1.182	0.20
366_K	369_E	1.179	0.20
252_Y	419_T	1.178	0.20
514_Y	517_S	1.177	0.20
152_Q	188_G	1.176	0.20
580_I	584_I	1.175	0.20
31_C	135_T	1.171	0.20
148_E	444_D	1.170	0.20
313_A	422_F	1.167	0.20
288_E	563_K	1.167	0.20
566_I	572_L	1.166	0.20
415_L	601_N	1.163	0.20
584_I	620_V	1.160	0.20
339_V	396_I	1.157	0.20
512_L	530_I	1.156	0.20
101_A	589_L	1.154	0.20
289_L	515_V	1.153	0.20
580_I	611_V	1.148	0.20
62_L	92_A	1.147	0.20
248_D	251_R	1.146	0.20
63_F	214_V	1.139	0.19
69_K	577_L	1.136	0.19
300_N	512_L	1.133	0.19
470_G	607_V	1.128	0.19
313_A	320_L	1.127	0.19
174_S	459_P	1.126	0.19
103_A	451_A	1.125	0.19
149_V	615_A	1.125	0.19
571_V	577_L	1.124	0.19
349_F	356_N	1.124	0.19
507_T	511_T	1.120	0.19
197_A	414_A	1.118	0.19
33_T	215_K	1.118	0.19
330_R	354_L	1.115	0.19
6_Y	46_Y	1.115	0.19
579_K	583_D	1.113	0.19
250_V	373_A	1.113	0.19
310_G	499_V	1.110	0.19
105_A	440_P	1.109	0.19
409_K	426_Q	1.109	0.19
107_A	454_L	1.105	0.19
206_Q	225_L	1.101	0.19
450_D	513_K	1.099	0.19
380_I	479_I	1.099	0.19
322_W	518_K	1.096	0.19
290_F	308_V	1.095	0.18
578_E	601_N	1.095	0.18
12_K	67_K	1.094	0.18
71_Y	156_V	1.094	0.18
71_Y	595_R	1.089	0.18
36_E	80_S	1.078	0.18
193_S	251_R	1.078	0.18
77_I	162_R	1.075	0.18
100_I	626_S	1.069	0.18
135_T	327_K	1.069	0.18
49_P	114_D	1.062	0.18
112_I	584_I	1.061	0.18
396_I	550_I	1.059	0.18
103_A	602_L	1.051	0.18
130_T	469_L	1.049	0.18
99_K	447_L	1.048	0.18
116_I	443_I	1.048	0.18
327_K	466_Y	1.047	0.17
80_S	107_A	1.047	0.17
206_Q	486_D	1.045	0.17
33_T	379_L	1.044	0.17
316_L	400_I	1.043	0.17
209_R	214_V	1.041	0.17
63_F	422_F	1.038	0.17
533_L	551_L	1.036	0.17
324_L	329_R	1.034	0.17
331_F	603_I	1.032	0.17
331_F	338_Y	1.032	0.17
221_I	349_F	1.030	0.17
106_M	448_L	1.029	0.17
319_V	382_I	1.029	0.17
396_I	518_K	1.029	0.17
98_L	235_I	1.028	0.17
511_T	514_Y	1.028	0.17
161_A	188_G	1.027	0.17
607_V	618_K	1.026	0.17
105_A	161_A	1.025	0.17
345_L	382_I	1.024	0.17
304_K	386_R	1.024	0.17
155_A	310_G	1.022	0.17
197_A	478_E	1.021	0.17
144_L	200_V	1.019	0.17
249_I	349_F	1.017	0.17
320_L	480_I	1.017	0.17
204_I	459_P	1.014	0.17
289_L	360_T	1.013	0.17
103_A	107_A	1.013	0.17
451_A	455_V	1.013	0.17
149_V	629_K	1.013	0.17
393_V	455_V	1.008	0.17
37_E	370_A	1.006	0.17
63_F	244_E	1.004	0.17
98_L	441_R	1.003	0.17
534_I	622_E	1.002	0.17
401_L	468_V	1.001	0.17
95_E	390_D	1.000	0.17
308_V	439_P	0.998	0.17
422_F	457_E	0.997	0.17
292_N	417_D	0.996	0.16
210_M	480_I	0.995	0.16
160_A	580_I	0.995	0.16
186_S	426_Q	0.994	0.16
340_R	458_S	0.989	0.16
605_S	624_I	0.987	0.16
46_Y	110_S	0.985	0.16
124_I	416_D	0.984	0.16
245_L	576_E	0.980	0.16
536_S	628_L	0.980	0.16
144_L	190_D	0.979	0.16
286_V	367_V	0.979	0.16
301_G	469_L	0.978	0.16
537_I	544_K	0.978	0.16
398_D	499_V	0.976	0.16
110_S	274_K	0.975	0.16
94_N	477_K	0.971	0.16
326_P	329_R	0.970	0.16
416_D	508_I	0.970	0.16
115_E	162_R	0.969	0.16
151_I	187_T	0.968	0.16
398_D	419_T	0.966	0.16
215_K	229_I	0.965	0.16
415_L	600_V	0.962	0.16
462_K	516_K	0.962	0.16
592_I	609_S	0.962	0.16
173_Y	629_K	0.961	0.16
162_R	620_V	0.961	0.16
593_R	623_L	0.959	0.16
72_V	172_T	0.957	0.16
162_R	481_R	0.956	0.16
71_Y	620_V	0.956	0.16
313_A	345_L	0.955	0.16
307_L	386_R	0.952	0.16
250_V	628_L	0.951	0.16
100_I	214_V	0.951	0.16
386_R	390_D	0.948	0.16
50_A	104_I	0.946	0.16
402_L	592_I	0.945	0.16
464_K	468_V	0.945	0.16
468_V	526_N	0.944	0.16
290_F	468_V	0.941	0.15
101_A	567_R	0.936	0.15
316_L	392_A	0.936	0.15
543_S	616_D	0.935	0.15
36_E	438_I	0.934	0.15
369_E	528_E	0.933	0.15
504_I	563_K	0.933	0.15
345_L	513_K	0.931	0.15
19_Q	221_I	0.929	0.15
302_I	580_I	0.928	0.15
209_R	221_I	0.928	0.15
95_E	563_K	0.927	0.15
488_F	605_S	0.926	0.15
540_S	592_I	0.924	0.15
103_A	607_V	0.923	0.15
49_P	419_T	0.923	0.15
384_G	389_L	0.923	0.15
227_I	387_E	0.922	0.15
110_S	139_A	0.919	0.15
159_D	454_L	0.919	0.15
69_K	117_Y	0.918	0.15
536_S	563_K	0.915	0.15
174_S	479_I	0.915	0.15
398_D	563_K	0.915	0.15
67_K	441_R	0.913	0.15
415_L	419_T	0.912	0.15
602_L	628_L	0.912	0.15
546_S	570_E	0.912	0.15
403_A	408_P	0.910	0.15
339_V	400_I	0.910	0.15
144_L	615_A	0.908	0.15
245_L	584_I	0.906	0.15
161_A	175_L	0.903	0.15
370_A	443_I	0.900	0.15
167_G	172_T	0.899	0.15
173_Y	402_L	0.898	0.15
195_E	247_P	0.896	0.15
237_I	249_I	0.895	0.15
505_A	511_T	0.894	0.15
71_Y	234_K	0.892	0.15
596_K	605_S	0.889	0.15
164_I	381_L	0.886	0.14
80_S	480_I	0.883	0.14
164_I	563_K	0.883	0.14
310_G	534_I	0.883	0.14
47_L	295_S	0.882	0.14
366_K	564_D	0.882	0.14
31_C	432_M	0.881	0.14
374_T	490_E	0.878	0.14
108_L	582_D	0.877	0.14
415_L	621_L	0.877	0.14
42_T	416_D	0.876	0.14
63_F	341_A	0.875	0.14
233_T	570_E	0.875	0.14
261_L	326_P	0.874	0.14
404_F	611_V	0.872	0.14
7_E	528_E	0.871	0.14
188_G	300_N	0.867	0.14
230_K	615_A	0.867	0.14
41_L	75_I	0.865	0.14
112_I	231_G	0.863	0.14
62_L	71_Y	0.860	0.14
541_R	593_R	0.858	0.14
583_D	587_S	0.856	0.14
393_V	510_N	0.856	0.14
196_Q	526_N	0.855	0.14
122_I	163_K	0.852	0.14
100_I	446_K	0.852	0.14
217_G	392_A	0.849	0.14
129_T	488_F	0.849	0.14
414_A	475_L	0.847	0.14
6_Y	212_G	0.845	0.14
369_E	376_E	0.845	0.14
499_V	505_A	0.843	0.14
103_A	525_I	0.840	0.14
79_T	225_L	0.840	0.14
264_K	564_D	0.840	0.14
384_G	462_K	0.840	0.14
150_S	190_D	0.840	0.14
561_E	585_I	0.838	0.14
331_F	335_I	0.838	0.14
595_R	618_K	0.838	0.14
210_M	451_A	0.837	0.14
254_A	574_I	0.836	0.14
251_R	391_K	0.836	0.14
173_Y	575_E	0.835	0.14
265_E	626_S	0.835	0.14
54_L	466_Y	0.834	0.14
156_V	381_L	0.834	0.14
345_L	389_L	0.833	0.14
66_K	540_S	0.831	0.14
545_D	612_K	0.827	0.14
123_V	128_N	0.827	0.14
208_L	244_E	0.827	0.14
11_L	329_R	0.826	0.13
118_V	414_A	0.825	0.13
171_V	586_N	0.822	0.13
512_L	523_S	0.819	0.13
68_G	225_L	0.817	0.13
501_P	504_I	0.816	0.13
321_G	329_R	0.813	0.13
372_N	528_E	0.813	0.13
250_V	286_V	0.810	0.13
575_E	579_K	0.805	0.13
160_A	542_I	0.804	0.13
218_I	603_I	0.804	0.13
192_R	196_Q	0.804	0.13
164_I	237_I	0.802	0.13
351_S	400_I	0.801	0.13
317_K	379_L	0.800	0.13
63_F	107_A	0.800	0.13
103_A	242_K	0.798	0.13
170_Q	249_I	0.798	0.13
22_N	33_T	0.798	0.13
209_R	241_Q	0.797	0.13
209_R	219_G	0.796	0.13
405_D	499_V	0.796	0.13
273_T	312_R	0.792	0.13
210_M	235_I	0.791	0.13
580_I	615_A	0.790	0.13
139_A	397_K	0.788	0.13
405_D	573_P	0.786	0.13
281_F	297_I	0.786	0.13
421_K	542_I	0.785	0.13
266_E	329_R	0.784	0.13
290_F	367_V	0.784	0.13
63_F	202_L	0.783	0.13
386_R	444_D	0.782	0.13
376_E	499_V	0.782	0.13
381_L	519_G	0.782	0.13
505_A	516_K	0.781	0.13
112_I	588_N	0.780	0.13
163_K	171_V	0.780	0.13
36_E	79_T	0.777	0.13
63_F	159_D	0.772	0.13
344_G	617_G	0.772	0.13
7_E	539_E	0.772	0.13
31_C	91_H	0.770	0.13
112_I	509_T	0.770	0.13
499_V	549_E	0.769	0.13
49_P	65_W	0.769	0.13
138_I	394_E	0.768	0.13
110_S	351_S	0.768	0.13
136_A	607_V	0.766	0.13
387_E	552_V	0.765	0.13
80_S	272_L	0.764	0.13
499_V	590_D	0.763	0.13
388_R	628_L	0.762	0.12
100_I	564_D	0.761	0.12
159_D	463_M	0.761	0.12
87_E	107_A	0.761	0.12
386_R	541_R	0.760	0.12
115_E	460_E	0.760	0.12
36_E	624_I	0.758	0.12
493_N	589_L	0.757	0.12
91_H	152_Q	0.756	0.12
299_K	415_L	0.756	0.12
244_E	285_D	0.756	0.12
22_N	186_S	0.755	0.12
438_I	442_R	0.754	0.12
490_E	562_L	0.754	0.12
323_E	471_L	0.752	0.12
8_E	366_K	0.752	0.12
233_T	422_F	0.751	0.12
282_V	299_K	0.750	0.12
530_I	534_I	0.749	0.12
249_I	420_T	0.745	0.12
186_S	416_D	0.744	0.12
323_E	329_R	0.744	0.12
341_A	611_V	0.743	0.12
227_I	307_L	0.740	0.12
24_P	548_S	0.740	0.12
234_K	451_A	0.739	0.12
415_L	421_K	0.738	0.12
69_K	396_I	0.737	0.12
193_S	307_L	0.735	0.12
535_K	592_I	0.733	0.12
468_V	581_I	0.733	0.12
198_E	522_I	0.733	0.12
145_K	378_A	0.732	0.12
335_I	396_I	0.730	0.12
191_I	414_A	0.729	0.12
525_I	614_R	0.729	0.12
147_E	577_L	0.729	0.12
147_E	615_A	0.729	0.12
144_L	306_G	0.728	0.12
312_R	499_V	0.728	0.12
137_I	235_I	0.725	0.12
28_F	31_C	0.724	0.12
107_A	151_I	0.724	0.12
12_K	627_R	0.722	0.12
69_K	428_G	0.721	0.12
507_T	551_L	0.721	0.12
8_E	530_I	0.721	0.12
578_E	600_V	0.720	0.12
11_L	475_L	0.719	0.12
65_W	624_I	0.718	0.12
162_R	572_L	0.718	0.12
83_V	88_E	0.718	0.12
227_I	547_I	0.718	0.12
139_A	173_Y	0.717	0.12
42_T	336_A	0.717	0.12
227_I	429_S	0.716	0.12
94_N	463_M	0.716	0.12
112_I	448_L	0.715	0.12
371_L	422_F	0.714	0.12
162_R	351_S	0.713	0.12
107_A	210_M	0.711	0.12
409_K	458_S	0.710	0.12
208_L	241_Q	0.709	0.12
360_T	363_E	0.708	0.12
104_I	379_L	0.706	0.12
316_L	471_L	0.705	0.12
13_V	202_L	0.703	0.12
23_T	138_I	0.703	0.12
93_I	161_A	0.703	0.12
98_L	416_D	0.703	0.12
195_E	237_I	0.702	0.12
444_D	567_R	0.701	0.12
299_K	369_E	0.699	0.12
11_L	323_E	0.698	0.12
591_E	600_V	0.698	0.12
351_S	516_K	0.698	0.12
176_D	410_E	0.697	0.12
130_T	504_I	0.696	0.12
212_G	551_L	0.696	0.12
13_V	475_L	0.695	0.12
191_I	557_S	0.695	0.12
314_Y	449_E	0.694	0.11
46_Y	70_K	0.693	0.11
155_A	183_I	0.693	0.11
116_I	135_T	0.692	0.11
321_G	542_I	0.692	0.11
102_L	539_E	0.692	0.11
145_K	374_T	0.691	0.11
33_T	373_A	0.690	0.11
362_E	576_E	0.690	0.11
43_L	122_I	0.689	0.11
313_A	389_L	0.689	0.11
150_S	296_K	0.689	0.11
420_T	623_L	0.689	0.11
59_V	272_L	0.688	0.11
320_L	335_I	0.688	0.11
550_I	554_Y	0.687	0.11
35_L	196_Q	0.687	0.11
388_R	536_S	0.686	0.11
575_E	578_E	0.686	0.11
159_D	610_K	0.685	0.11
196_Q	492_V	0.685	0.11
389_L	505_A	0.685	0.11
300_N	577_L	0.684	0.11
513_K	518_K	0.684	0.11
93_I	526_N	0.683	0.11
492_V	621_L	0.683	0.11
213_K	372_N	0.683	0.11
361_E	622_E	0.681	0.11
535_K	538_Y	0.676	0.11
164_I	550_I	0.676	0.11
107_A	624_I	0.676	0.11
23_T	419_T	0.676	0.11
37_E	443_I	0.675	0.11
99_K	369_E	0.674	0.11
416_D	540_S	0.674	0.11
390_D	523_S	0.674	0.11
75_I	80_S	0.674	0.11
143_M	522_I	0.673	0.11
562_L	615_A	0.673	0.11
422_F	466_Y	0.672	0.11
227_I	508_I	0.672	0.11
369_E	586_N	0.672	0.11
102_L	565_I	0.671	0.11
463_M	600_V	0.670	0.11
367_V	586_N	0.670	0.11
537_I	572_L	0.668	0.11
457_E	466_Y	0.667	0.11
273_T	288_E	0.666	0.11
302_I	487_L	0.665	0.11
241_Q	617_G	0.665	0.11
381_L	549_E	0.664	0.11
119_M	347_G	0.664	0.11
425_P	435_E	0.664	0.11
119_M	435_E	0.664	0.11
347_G	435_E	0.664	0.11
347_G	425_P	0.664	0.11
119_M	425_P	0.664	0.11
6_Y	343_A	0.664	0.11
31_C	100_I	0.662	0.11
105_A	231_G	0.660	0.11
265_E	468_V	0.660	0.11
394_E	577_L	0.660	0.11
112_I	398_D	0.659	0.11
173_Y	199_R	0.658	0.11
112_I	540_S	0.657	0.11
397_K	401_L	0.656	0.11
313_A	384_G	0.656	0.11
19_Q	605_S	0.656	0.11
244_E	349_F	0.655	0.11
206_Q	247_P	0.655	0.11
288_E	370_A	0.654	0.11
413_G	426_Q	0.653	0.11
105_A	211_T	0.652	0.11
156_V	508_I	0.652	0.11
372_N	533_L	0.651	0.11
52_S	160_A	0.650	0.11
577_L	623_L	0.649	0.11
141_G	254_A	0.649	0.11
345_L	400_I	0.648	0.11
206_Q	210_M	0.648	0.11
62_L	296_K	0.646	0.11
193_S	581_I	0.642	0.11
25_H	345_L	0.641	0.11
235_I	348_L	0.639	0.11
287_T	548_S	0.639	0.11
221_I	599_A	0.638	0.11
602_L	610_K	0.637	0.11
105_A	549_E	0.636	0.11
160_A	245_L	0.636	0.11
101_A	195_E	0.636	0.11
493_N	583_D	0.634	0.11
162_R	460_E	0.634	0.11
187_T	336_A	0.633	0.11
272_L	336_A	0.630	0.11
324_L	499_V	0.629	0.11
248_D	507_T	0.629	0.11
101_A	620_V	0.628	0.11
419_T	600_V	0.628	0.11
16_E	26_K	0.628	0.11
14_G	26_K	0.628	0.11
18_H	26_K	0.628	0.11
14_G	18_H	0.628	0.11
51_L	455_V	0.627	0.11
92_A	568_K	0.627	0.11
84_E	355_P	0.627	0.11
378_A	604_M	0.626	0.11
54_L	374_T	0.625	0.11
19_Q	100_I	0.625	0.11
539_E	590_D	0.624	0.11
247_P	620_V	0.624	0.11
339_V	422_F	0.624	0.11
367_V	542_I	0.623	0.11
49_P	85_A	0.623	0.11
33_T	346_G	0.620	0.10
105_A	566_I	0.619	0.10
225_L	247_P	0.619	0.10
152_Q	426_Q	0.617	0.10
173_Y	190_D	0.615	0.10
124_I	592_I	0.613	0.10
11_L	321_G	0.612	0.10
292_N	393_V	0.611	0.10
571_V	619_I	0.611	0.10
353_E	358_G	0.610	0.10
413_G	505_A	0.609	0.10
446_K	589_L	0.609	0.10
63_F	208_L	0.608	0.10
52_S	240_V	0.607	0.10
244_E	340_R	0.606	0.10
423_L	607_V	0.606	0.10
223_Q	363_E	0.606	0.10
265_E	372_N	0.605	0.10
210_M	483_P	0.603	0.10
291_K	305_G	0.603	0.10
171_V	298_I	0.602	0.10
114_D	571_V	0.602	0.10
147_E	599_A	0.601	0.10
511_T	517_S	0.600	0.10
64_E	356_N	0.598	0.10
258_F	472_S	0.598	0.10
149_V	530_I	0.597	0.10
395_V	430_A	0.596	0.10
430_A	434_P	0.595	0.10
38_E	252_Y	0.595	0.10
397_K	444_D	0.592	0.10
137_I	517_S	0.592	0.10
59_V	94_N	0.592	0.10
70_K	607_V	0.591	0.10
289_L	508_I	0.590	0.10
331_F	426_Q	0.590	0.10
348_L	375_T	0.590	0.10
173_Y	428_G	0.589	0.10
130_T	466_Y	0.589	0.10
212_G	329_R	0.589	0.10
186_S	379_L	0.589	0.10
526_N	529_D	0.589	0.10
24_P	164_I	0.588	0.10
351_S	422_F	0.588	0.10
8_E	269_R	0.588	0.10
492_V	537_I	0.588	0.10
94_N	607_V	0.588	0.10
185_I	208_L	0.587	0.10
116_I	428_G	0.587	0.10
366_K	372_N	0.586	0.10
296_K	625_R	0.586	0.10
294_N	615_A	0.586	0.10
282_V	473_E	0.585	0.10
148_E	487_L	0.585	0.10
247_P	545_D	0.582	0.10
147_E	439_P	0.579	0.10
309_Y	498_R	0.578	0.10
50_A	500_P	0.578	0.10
95_E	99_K	0.578	0.10
96_E	554_Y	0.578	0.10
487_L	575_E	0.578	0.10
163_K	190_D	0.578	0.10
360_T	462_K	0.578	0.10
591_E	624_I	0.577	0.10
108_L	586_N	0.577	0.10
33_T	487_L	0.576	0.10
143_M	593_R	0.575	0.10
372_N	390_D	0.574	0.10
18_H	27_L	0.573	0.10
16_E	27_L	0.573	0.10
14_G	27_L	0.573	0.10
59_V	141_G	0.573	0.10
210_M	455_V	0.573	0.10
190_D	337_D	0.573	0.10
167_G	479_I	0.572	0.10
144_L	583_D	0.571	0.10
141_G	409_K	0.570	0.10
291_K	490_E	0.570	0.10
315_K	596_K	0.570	0.10
298_I	302_I	0.569	0.10
524_K	583_D	0.569	0.10
108_L	185_I	0.568	0.10
213_K	513_K	0.568	0.10
49_P	407_I	0.568	0.10
8_E	138_I	0.567	0.10
159_D	351_S	0.566	0.10
36_E	336_A	0.566	0.10
96_E	323_E	0.565	0.10
137_I	402_L	0.565	0.10
84_E	175_L	0.565	0.10
396_I	400_I	0.563	0.10
115_E	122_I	0.563	0.10
356_N	379_L	0.562	0.10
41_L	479_I	0.560	0.10
112_I	597_D	0.560	0.10
309_Y	420_T	0.560	0.10
500_P	505_A	0.560	0.10
359_I	480_I	0.559	0.10
129_T	355_P	0.559	0.10
316_L	380_I	0.558	0.10
80_S	441_R	0.557	0.10
44_E	610_K	0.557	0.10
28_F	260_L	0.557	0.10
356_N	513_K	0.556	0.10
304_K	539_E	0.556	0.10
324_L	331_F	0.555	0.10
23_T	124_I	0.555	0.10
69_K	434_P	0.555	0.10
210_M	340_R	0.554	0.10
218_I	241_Q	0.554	0.10
294_N	568_K	0.553	0.10
167_G	170_Q	0.553	0.10
353_E	435_E	0.552	0.10
353_E	425_P	0.552	0.10
119_M	353_E	0.552	0.10
347_G	353_E	0.552	0.10
234_K	274_K	0.551	0.10
319_V	325_I	0.551	0.10
203_K	298_I	0.550	0.10
140_L	530_I	0.548	0.10
504_I	620_V	0.548	0.10
234_K	272_L	0.548	0.10
261_L	264_K	0.547	0.10
19_Q	219_G	0.547	0.10
508_I	537_I	0.546	0.10
64_E	151_I	0.545	0.10
365_N	592_I	0.543	0.10
601_N	605_S	0.543	0.10
123_V	435_E	0.543	0.10
123_V	425_P	0.543	0.10
123_V	347_G	0.543	0.10
119_M	123_V	0.543	0.10
91_H	249_I	0.542	0.10
119_M	358_G	0.541	0.10
358_G	435_E	0.541	0.10
347_G	358_G	0.541	0.10
358_G	425_P	0.541	0.10
76_P	225_L	0.539	0.09
423_L	586_N	0.538	0.09
48_R	584_I	0.538	0.09
13_V	152_Q	0.538	0.09
143_M	444_D	0.538	0.09
604_M	617_G	0.538	0.09
112_I	348_L	0.537	0.09
206_Q	459_P	0.537	0.09
422_F	465_R	0.536	0.09
116_I	570_E	0.535	0.09
385_E	539_E	0.535	0.09
104_I	535_K	0.533	0.09
138_I	336_A	0.532	0.09
340_R	514_Y	0.531	0.09
364_I	577_L	0.531	0.09
106_M	610_K	0.531	0.09
138_I	494_K	0.530	0.09
234_K	329_R	0.529	0.09
102_L	447_L	0.528	0.09
39_Y	76_P	0.528	0.09
321_G	333_T	0.528	0.09
420_T	592_I	0.528	0.09
227_I	385_E	0.527	0.09
248_D	252_Y	0.526	0.09
129_T	272_L	0.526	0.09
565_I	569_Y	0.525	0.09
48_R	160_A	0.525	0.09
108_L	113_V	0.525	0.09
470_G	520_G	0.524	0.09
230_K	529_D	0.524	0.09
7_E	300_N	0.523	0.09
63_F	426_Q	0.523	0.09
213_K	598_K	0.523	0.09
336_A	346_G	0.523	0.09
543_S	612_K	0.523	0.09
48_R	397_K	0.523	0.09
76_P	80_S	0.521	0.09
233_T	329_R	0.521	0.09
155_A	296_K	0.521	0.09
161_A	576_E	0.520	0.09
165_D	337_D	0.520	0.09
356_N	595_R	0.519	0.09
315_K	365_N	0.519	0.09
35_L	338_Y	0.518	0.09
209_R	216_R	0.518	0.09
300_N	423_L	0.517	0.09
94_N	245_L	0.517	0.09
502_V	508_I	0.517	0.09
19_Q	129_T	0.517	0.09
458_S	466_Y	0.516	0.09
371_L	593_R	0.516	0.09
356_N	581_I	0.516	0.09
84_E	223_Q	0.515	0.09
286_V	394_E	0.513	0.09
272_L	624_I	0.513	0.09
81_C	260_L	0.512	0.09
149_V	199_R	0.512	0.09
218_I	363_E	0.511	0.09
214_V	219_G	0.511	0.09
243_L	330_R	0.510	0.09
22_N	348_L	0.510	0.09
172_T	508_I	0.510	0.09
243_L	285_D	0.510	0.09
331_F	379_L	0.510	0.09
151_I	204_I	0.510	0.09
117_Y	136_A	0.509	0.09
41_L	85_A	0.509	0.09
108_L	373_A	0.508	0.09
596_K	625_R	0.508	0.09
423_L	474_E	0.507	0.09
44_E	70_K	0.507	0.09
330_R	364_I	0.507	0.09
60_A	352_D	0.507	0.09
108_L	207_L	0.507	0.09
50_A	117_Y	0.507	0.09
516_K	519_G	0.506	0.09
502_V	505_A	0.506	0.09
185_I	243_L	0.506	0.09
290_F	293_T	0.504	0.09
422_F	426_Q	0.503	0.09
191_I	429_S	0.503	0.09
138_I	144_L	0.503	0.09
218_I	409_K	0.503	0.09
66_K	199_R	0.502	0.09
265_E	269_R	0.502	0.09
533_L	547_I	0.500	0.09
196_Q	615_A	0.500	0.09
594_K	603_I	0.500	0.09
110_S	272_L	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1zq1C	1	0.793	100	0.32	Contact Map
2d6fC	1	0.7599	100	0.328	Contact Map
3h0lB	1	0.6035	100	0.633	Contact Map
3al0B	1	0.6998	100	0.636	Contact Map
3ip4B	1	0.703	100	0.636	Contact Map
3kfuF	2	0.5829	100	0.668	Contact Map
4wj3B	2	0.5861	100	0.68	Contact Map
4n0hB	1	0.4092	100	0.758	Contact Map
2hz7A	1	0.3997	99.9	0.922	Contact Map
1ng6A	1	0.2164	99.5	0.944	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0152 seconds.