TOP6B - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

TOP6B - Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B

UniProt:	Q97ZF0	Sequences: MSAKEKFASLSPAEFFKRNPELAGFPNPARALYQTVRELIENSLDATDVHGILPNIKITIDLIDESRQIYKVNVVDNGIGIPPQEVPNAFGRVLYSSKYVNRQTRGMYGLGVKAAVLYSQMHQDKPIEIETSPVNSKRLYTFKLKIDINKNEPIIVERGSVENNTGFHGTSVAISIPGDWPKAKSRIYEYIKRTYIITPYAEFIFKDPEGNVTYYPRLTNKIPKPPQEVKPHPYGVDREEIKIMINNLKRDYTIKEFLMSEFQSIGDTTADKILELVGLRPNKKVKNLTEEEITRLVETFKKYEDFRSPSADSLSVIGEDLIELGLKKIFNPDFTASITRKPKAYQGHPFIVEAGIAFGGSIPVGEEPIVLRYANKIPLIYDEKSDVIWKVVEELDWKRYGIESDQYQMVVMVHLCSTKIPYKSAGKESIAEVEDIEKEIKNALMEVARKLKLYLSEKRKEQEAKKKLLAYLKYVPEVSRSLAIFLASGNKELVPKYQGEIVEGLFKLISKKLDLINIEEYRKVYKVDSE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	530 (499)
Sequences:	173 (115)
Seq/√Len:	5.1

HALSA - TOP6B
SULSO - TOP6B

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
86_V	131_T	8.693	1.00
37_R	41_E	5.280	0.98
388_I	413_V	4.450	0.94
129_I	338_I	3.802	0.88
35_T	72_V	3.779	0.88
248_L	285_V	3.552	0.84
254_I	279_L	3.453	0.82
384_K	389_W	3.325	0.80
413_V	440_I	3.233	0.78
322_I	355_G	3.000	0.72
115_A	174_I	2.994	0.72
385_S	388_I	2.960	0.71
354_A	443_A	2.956	0.71
119_S	219_T	2.903	0.69
129_I	155_I	2.765	0.65
354_A	388_I	2.720	0.64
126_P	153_P	2.679	0.62
322_I	326_L	2.677	0.62
33_Y	37_R	2.660	0.62
33_Y	41_E	2.660	0.62
266_G	381_Y	2.620	0.61
26_P	422_Y	2.555	0.59
36_V	60_I	2.488	0.56
75_V	171_S	2.441	0.55
474_Y	481_S	2.401	0.54
244_M	257_F	2.371	0.53
30_R	193_R	2.353	0.52
354_A	385_S	2.349	0.52
230_K	261_E	2.313	0.51
129_I	395_L	2.297	0.50
333_D	458_K	2.291	0.50
104_T	173_A	2.262	0.49
195_Y	380_I	2.243	0.48
55_N	202_E	2.200	0.47
60_I	225_P	2.198	0.47
322_I	412_M	2.110	0.44
123_Q	380_I	2.098	0.44
98_K	474_Y	2.090	0.43
196_I	321_L	2.082	0.43
72_V	411_V	2.075	0.43
23_A	37_R	2.034	0.42
23_A	41_E	2.034	0.42
283_K	292_E	2.026	0.41
210_G	354_A	1.995	0.40
144_L	392_V	1.978	0.40
81_I	339_T	1.975	0.40
239_E	425_A	1.970	0.40
33_Y	419_K	1.957	0.39
118_Y	414_H	1.951	0.39
73_N	173_A	1.906	0.38
248_L	444_L	1.888	0.37
35_T	168_H	1.871	0.36
25_F	325_G	1.865	0.36
229_V	313_S	1.854	0.36
79_I	200_Y	1.828	0.35
58_I	464_A	1.827	0.35
392_V	395_L	1.820	0.35
376_K	422_Y	1.819	0.35
95_Y	414_H	1.797	0.34
98_K	481_S	1.796	0.34
13_A	35_T	1.795	0.34
415_L	430_I	1.770	0.33
41_E	108_Y	1.763	0.33
37_R	108_Y	1.763	0.33
236_V	426_G	1.748	0.33
108_Y	198_T	1.729	0.32
475_V	501_I	1.714	0.32
108_Y	114_A	1.702	0.32
108_Y	200_Y	1.669	0.31
118_Y	381_Y	1.665	0.30
340_R	439_E	1.654	0.30
317_I	422_Y	1.649	0.30
153_P	315_S	1.644	0.30
115_A	467_K	1.629	0.29
237_D	425_A	1.622	0.29
37_R	239_E	1.621	0.29
41_E	239_E	1.621	0.29
473_K	476_P	1.614	0.29
139_L	426_G	1.610	0.29
99_Y	107_M	1.610	0.29
345_Y	420_I	1.602	0.29
79_I	376_K	1.602	0.29
355_G	476_P	1.599	0.29
23_A	108_Y	1.592	0.28
9_S	30_R	1.582	0.28
115_A	410_V	1.568	0.28
84_Q	457_E	1.563	0.28
98_K	382_D	1.563	0.28
23_A	33_Y	1.561	0.28
284_K	287_N	1.553	0.27
149_N	394_E	1.546	0.27
86_V	142_F	1.544	0.27
382_D	416_C	1.542	0.27
141_T	159_G	1.542	0.27
138_R	160_S	1.542	0.27
486_L	504_G	1.539	0.27
50_H	79_I	1.536	0.27
28_P	226_P	1.523	0.27
236_V	275_E	1.521	0.27
356_I	448_A	1.517	0.27
9_S	123_Q	1.515	0.26
205_F	420_I	1.508	0.26
99_Y	108_Y	1.506	0.26
257_F	296_L	1.505	0.26
227_Q	333_D	1.502	0.26
381_Y	414_H	1.495	0.26
180_W	186_R	1.486	0.26
399_R	405_D	1.481	0.26
9_S	333_D	1.470	0.25
58_I	274_L	1.468	0.25
113_K	200_Y	1.456	0.25
253_T	370_V	1.456	0.25
326_L	371_L	1.454	0.25
254_I	467_K	1.452	0.25
336_A	450_K	1.441	0.25
93_V	99_Y	1.439	0.25
194_T	342_P	1.419	0.24
39_L	112_V	1.414	0.24
245_I	285_V	1.409	0.24
17_K	121_M	1.403	0.24
104_T	107_M	1.402	0.24
195_Y	330_F	1.402	0.24
204_I	236_V	1.393	0.23
289_T	352_V	1.376	0.23
23_A	99_Y	1.373	0.23
396_D	399_R	1.372	0.23
181_P	415_L	1.372	0.23
123_Q	265_I	1.369	0.23
331_N	485_F	1.364	0.23
91_G	396_D	1.363	0.23
280_R	285_V	1.362	0.23
238_R	312_D	1.359	0.23
19_N	43_S	1.358	0.23
27_N	377_I	1.353	0.23
95_Y	118_Y	1.353	0.23
416_C	425_A	1.347	0.22
13_A	153_P	1.345	0.22
144_L	221_K	1.339	0.22
263_Q	376_K	1.335	0.22
226_P	337_S	1.332	0.22
147_D	428_E	1.329	0.22
123_Q	316_V	1.326	0.22
23_A	386_D	1.322	0.22
235_G	358_F	1.302	0.21
108_Y	386_D	1.294	0.21
94_L	230_K	1.291	0.21
117_L	269_T	1.290	0.21
35_T	180_W	1.290	0.21
49_V	100_V	1.280	0.21
137_K	273_I	1.271	0.21
114_A	401_G	1.263	0.21
186_R	424_S	1.262	0.21
155_I	230_K	1.255	0.20
357_A	362_I	1.254	0.20
147_D	426_G	1.253	0.20
113_K	391_V	1.250	0.20
501_I	504_G	1.249	0.20
27_N	178_G	1.243	0.20
22_L	114_A	1.241	0.20
17_K	382_D	1.237	0.20
404_S	407_Y	1.229	0.20
354_A	413_V	1.229	0.20
124_D	316_V	1.228	0.20
205_F	418_T	1.227	0.20
34_Q	47_T	1.223	0.20
155_I	222_I	1.223	0.20
17_K	89_A	1.220	0.20
155_I	302_K	1.212	0.19
110_L	423_K	1.211	0.19
384_K	462_Q	1.208	0.19
110_L	418_T	1.202	0.19
226_P	406_Q	1.195	0.19
176_I	230_K	1.188	0.19
220_N	285_V	1.186	0.19
107_M	386_D	1.180	0.19
392_V	410_V	1.178	0.19
326_L	412_M	1.177	0.19
50_H	376_K	1.174	0.19
341_K	422_Y	1.166	0.19
37_R	114_A	1.166	0.19
41_E	114_A	1.166	0.19
41_E	200_Y	1.160	0.18
37_R	200_Y	1.160	0.18
132_S	467_K	1.160	0.18
320_D	336_A	1.159	0.18
37_R	423_K	1.155	0.18
41_E	423_K	1.155	0.18
30_R	483_A	1.147	0.18
99_Y	114_A	1.135	0.18
33_Y	200_Y	1.134	0.18
332_P	385_S	1.130	0.18
219_T	455_L	1.127	0.18
32_L	129_I	1.120	0.18
89_A	423_K	1.120	0.18
39_L	237_D	1.116	0.18
71_K	444_L	1.115	0.18
131_T	148_I	1.114	0.18
237_D	426_G	1.112	0.17
264_S	307_R	1.097	0.17
39_L	239_E	1.094	0.17
328_K	370_V	1.091	0.17
235_G	350_F	1.091	0.17
119_S	209_E	1.089	0.17
503_E	508_L	1.085	0.17
283_K	430_I	1.082	0.17
197_I	479_S	1.082	0.17
86_V	298_E	1.078	0.17
17_K	197_I	1.077	0.17
235_G	334_F	1.075	0.17
120_Q	235_G	1.071	0.17
332_P	357_A	1.070	0.17
337_S	355_G	1.070	0.17
219_T	321_L	1.066	0.17
147_D	154_I	1.064	0.17
385_S	441_K	1.062	0.17
95_Y	381_Y	1.061	0.17
119_S	398_K	1.060	0.17
491_K	500_E	1.057	0.16
23_A	237_D	1.056	0.16
277_V	381_Y	1.053	0.16
128_E	143_K	1.052	0.16
354_A	430_I	1.049	0.16
34_Q	48_D	1.045	0.16
13_A	152_E	1.044	0.16
96_S	461_E	1.044	0.16
313_S	425_A	1.042	0.16
266_G	269_T	1.041	0.16
44_L	257_F	1.039	0.16
201_A	384_K	1.039	0.16
164_N	273_I	1.036	0.16
150_K	428_E	1.035	0.16
13_A	119_S	1.033	0.16
202_E	216_P	1.030	0.16
174_I	330_F	1.029	0.16
60_I	209_E	1.028	0.16
39_L	426_G	1.026	0.16
236_V	398_K	1.023	0.16
102_R	238_R	1.023	0.16
177_P	415_L	1.019	0.16
291_E	370_V	1.018	0.16
21_E	391_V	1.017	0.16
261_E	455_L	1.015	0.16
43_S	326_L	1.015	0.16
474_Y	501_I	1.014	0.16
252_Y	285_V	1.010	0.16
99_Y	386_D	1.010	0.16
70_Y	302_K	1.008	0.16
31_A	178_G	1.003	0.16
153_P	417_S	1.000	0.15
94_L	100_V	1.000	0.15
351_I	354_A	0.997	0.15
117_L	120_Q	0.997	0.15
316_V	325_G	0.996	0.15
118_Y	266_G	0.996	0.15
170_T	201_A	0.991	0.15
22_L	323_E	0.987	0.15
343_K	355_G	0.986	0.15
131_T	289_T	0.986	0.15
279_L	381_Y	0.977	0.15
74_V	228_E	0.976	0.15
498_Q	502_V	0.975	0.15
285_V	300_F	0.973	0.15
195_Y	415_L	0.969	0.15
108_Y	391_V	0.967	0.15
133_P	286_K	0.965	0.15
237_D	262_F	0.962	0.15
21_E	72_V	0.962	0.15
8_A	438_K	0.961	0.15
262_F	288_L	0.958	0.15
27_N	428_E	0.958	0.15
131_T	248_L	0.956	0.15
500_E	504_G	0.953	0.15
355_G	373_Y	0.953	0.15
64_D	292_E	0.953	0.15
153_P	348_H	0.953	0.15
23_A	423_K	0.951	0.15
23_A	200_Y	0.949	0.15
79_I	108_Y	0.947	0.15
263_Q	266_G	0.941	0.14
30_R	96_S	0.939	0.14
60_I	486_L	0.938	0.14
150_K	155_I	0.933	0.14
412_M	479_S	0.933	0.14
106_G	109_G	0.932	0.14
88_N	242_K	0.931	0.14
16_F	374_A	0.929	0.14
56_I	460_K	0.927	0.14
74_V	152_E	0.925	0.14
108_Y	423_K	0.923	0.14
355_G	498_Q	0.921	0.14
227_Q	341_K	0.920	0.14
37_R	132_S	0.920	0.14
41_E	132_S	0.920	0.14
340_R	449_R	0.920	0.14
86_V	248_L	0.916	0.14
115_A	432_E	0.916	0.14
307_R	354_A	0.914	0.14
249_K	253_T	0.912	0.14
131_T	254_I	0.911	0.14
358_F	449_R	0.910	0.14
430_I	445_M	0.909	0.14
180_W	198_T	0.908	0.14
178_G	428_E	0.902	0.14
293_I	300_F	0.899	0.14
133_P	274_L	0.898	0.14
33_Y	386_D	0.896	0.14
303_Y	445_M	0.889	0.14
114_A	377_I	0.889	0.14
79_I	263_Q	0.884	0.14
322_I	476_P	0.884	0.14
88_N	92_R	0.882	0.14
377_I	391_V	0.881	0.14
292_E	298_E	0.880	0.14
44_L	349_P	0.879	0.13
239_E	423_K	0.878	0.13
20_P	348_H	0.875	0.13
110_L	113_K	0.874	0.13
249_K	503_E	0.874	0.13
352_V	415_L	0.871	0.13
58_I	253_T	0.870	0.13
329_I	344_A	0.870	0.13
129_I	288_L	0.869	0.13
207_D	210_G	0.869	0.13
180_W	208_P	0.868	0.13
242_K	293_I	0.867	0.13
296_L	368_P	0.865	0.13
104_T	113_K	0.865	0.13
36_V	312_D	0.865	0.13
41_E	198_T	0.864	0.13
37_R	198_T	0.864	0.13
333_D	495_P	0.861	0.13
72_V	192_K	0.859	0.13
362_I	390_K	0.858	0.13
13_A	295_R	0.857	0.13
303_Y	469_L	0.856	0.13
30_R	428_E	0.852	0.13
33_Y	113_K	0.852	0.13
232_H	372_R	0.850	0.13
99_Y	391_V	0.849	0.13
271_D	284_K	0.848	0.13
23_A	107_M	0.848	0.13
129_I	272_K	0.843	0.13
13_A	456_S	0.841	0.13
147_D	497_Y	0.837	0.13
163_N	474_Y	0.835	0.13
191_I	213_T	0.834	0.13
219_T	262_F	0.832	0.13
148_I	429_S	0.832	0.13
91_G	115_A	0.832	0.13
382_D	423_K	0.830	0.13
21_E	308_S	0.828	0.13
380_I	473_K	0.828	0.13
333_D	426_G	0.827	0.13
146_I	153_P	0.825	0.13
23_A	49_V	0.824	0.13
360_G	431_A	0.822	0.13
43_S	168_H	0.822	0.13
87_P	315_S	0.822	0.13
468_L	497_Y	0.821	0.13
173_A	210_G	0.817	0.13
56_I	220_N	0.814	0.13
108_Y	113_K	0.813	0.13
56_I	356_I	0.813	0.13
331_N	455_L	0.812	0.12
114_A	407_Y	0.810	0.12
33_Y	108_Y	0.809	0.12
33_Y	110_L	0.805	0.12
236_V	319_E	0.805	0.12
187_I	292_E	0.801	0.12
318_G	421_P	0.801	0.12
44_L	195_Y	0.797	0.12
31_A	300_F	0.797	0.12
7_F	422_Y	0.796	0.12
336_A	373_Y	0.794	0.12
234_Y	444_L	0.790	0.12
18_R	163_N	0.790	0.12
238_R	457_E	0.790	0.12
37_R	237_D	0.789	0.12
41_E	237_D	0.789	0.12
99_Y	110_L	0.789	0.12
189_E	370_V	0.787	0.12
10_L	442_N	0.787	0.12
92_R	178_G	0.786	0.12
239_E	426_G	0.786	0.12
27_N	303_Y	0.784	0.12
131_T	215_Y	0.784	0.12
13_A	261_E	0.781	0.12
8_A	349_P	0.776	0.12
260_S	471_Y	0.775	0.12
481_S	501_I	0.774	0.12
418_T	476_P	0.774	0.12
235_G	449_R	0.773	0.12
120_Q	439_E	0.773	0.12
196_I	301_K	0.771	0.12
148_I	423_K	0.771	0.12
20_P	370_V	0.770	0.12
282_N	287_N	0.768	0.12
104_T	424_S	0.767	0.12
99_Y	237_D	0.767	0.12
215_Y	356_I	0.763	0.12
355_G	463_E	0.760	0.12
441_K	445_M	0.758	0.12
348_H	418_T	0.757	0.12
54_P	77_N	0.755	0.12
45_D	77_N	0.755	0.12
45_D	76_D	0.755	0.12
42_N	77_N	0.755	0.12
76_D	80_G	0.755	0.12
38_E	76_D	0.755	0.12
77_N	80_G	0.755	0.12
42_N	76_D	0.755	0.12
38_E	77_N	0.755	0.12
54_P	76_D	0.755	0.12
30_R	390_K	0.752	0.12
17_K	36_V	0.752	0.12
371_L	390_K	0.752	0.12
438_K	467_K	0.752	0.12
38_E	42_N	0.751	0.12
38_E	54_P	0.751	0.12
42_N	45_D	0.751	0.12
42_N	54_P	0.751	0.12
38_E	45_D	0.751	0.12
45_D	80_G	0.751	0.12
42_N	80_G	0.751	0.12
54_P	80_G	0.751	0.12
38_E	80_G	0.751	0.12
45_D	54_P	0.751	0.12
445_M	448_A	0.751	0.12
502_V	508_L	0.751	0.12
468_L	471_Y	0.751	0.12
326_L	390_K	0.750	0.12
96_S	373_Y	0.749	0.12
359_G	421_P	0.747	0.12
56_I	434_E	0.746	0.12
265_I	390_K	0.746	0.12
197_I	418_T	0.745	0.12
22_L	389_W	0.744	0.12
336_A	376_K	0.744	0.12
6_K	288_L	0.743	0.12
107_M	239_E	0.743	0.12
469_L	500_E	0.741	0.12
8_A	65_E	0.739	0.11
108_Y	377_I	0.734	0.11
19_N	48_D	0.732	0.11
196_I	302_K	0.731	0.11
30_R	405_D	0.730	0.11
238_R	344_A	0.730	0.11
256_E	392_V	0.730	0.11
128_E	215_Y	0.729	0.11
61_D	287_N	0.728	0.11
273_I	319_E	0.727	0.11
125_K	129_I	0.725	0.11
41_E	99_Y	0.724	0.11
37_R	99_Y	0.724	0.11
23_A	114_A	0.721	0.11
23_A	198_T	0.715	0.11
95_Y	416_C	0.714	0.11
117_L	358_F	0.714	0.11
22_L	409_M	0.712	0.11
220_N	438_K	0.710	0.11
228_E	350_F	0.709	0.11
355_G	458_K	0.708	0.11
50_H	81_I	0.708	0.11
21_E	237_D	0.705	0.11
189_E	358_F	0.705	0.11
85_E	88_N	0.705	0.11
168_H	262_F	0.704	0.11
255_K	292_E	0.703	0.11
95_Y	424_S	0.702	0.11
90_F	439_E	0.700	0.11
58_I	220_N	0.698	0.11
93_V	382_D	0.697	0.11
99_Y	113_K	0.696	0.11
33_Y	428_E	0.695	0.11
171_S	412_M	0.694	0.11
439_E	449_R	0.693	0.11
21_E	376_K	0.693	0.11
22_L	27_N	0.693	0.11
210_G	265_I	0.693	0.11
113_K	242_K	0.693	0.11
91_G	192_K	0.692	0.11
155_I	295_R	0.691	0.11
155_I	345_Y	0.691	0.11
352_V	430_I	0.690	0.11
288_L	293_I	0.689	0.11
488_S	492_E	0.689	0.11
97_S	454_Y	0.688	0.11
367_E	470_A	0.687	0.11
107_M	112_V	0.686	0.11
92_R	152_E	0.686	0.11
267_D	291_E	0.685	0.11
91_G	261_E	0.685	0.11
200_Y	423_K	0.684	0.11
270_A	414_H	0.684	0.11
32_L	473_K	0.682	0.11
103_Q	359_G	0.682	0.11
51_G	150_K	0.680	0.11
81_I	241_I	0.679	0.11
311_A	388_I	0.676	0.11
231_P	439_E	0.676	0.11
112_V	407_Y	0.676	0.11
203_F	412_M	0.673	0.11
113_K	377_I	0.671	0.11
25_F	422_Y	0.669	0.11
298_E	438_K	0.669	0.11
99_Y	425_A	0.669	0.11
92_R	398_K	0.668	0.11
314_L	418_T	0.668	0.11
63_I	465_K	0.667	0.11
89_A	263_Q	0.667	0.11
203_F	452_K	0.666	0.11
97_S	321_L	0.664	0.11
373_Y	376_K	0.663	0.11
64_D	288_L	0.663	0.11
23_A	113_K	0.663	0.11
41_E	186_R	0.663	0.11
37_R	186_R	0.663	0.11
124_D	230_K	0.662	0.10
306_F	377_I	0.658	0.10
176_I	409_M	0.658	0.10
40_I	395_L	0.658	0.10
315_S	348_H	0.658	0.10
83_P	300_F	0.658	0.10
419_K	474_Y	0.655	0.10
149_N	294_T	0.653	0.10
174_I	443_A	0.651	0.10
112_V	239_E	0.651	0.10
178_G	299_T	0.651	0.10
203_F	454_Y	0.651	0.10
103_Q	309_P	0.650	0.10
139_L	163_N	0.650	0.10
41_E	414_H	0.649	0.10
37_R	414_H	0.649	0.10
246_N	486_L	0.649	0.10
129_I	281_P	0.648	0.10
474_Y	504_G	0.648	0.10
56_I	216_P	0.648	0.10
69_I	293_I	0.648	0.10
262_F	381_Y	0.647	0.10
15_F	96_S	0.647	0.10
350_F	359_G	0.647	0.10
17_K	423_K	0.645	0.10
218_L	336_A	0.644	0.10
33_Y	93_V	0.644	0.10
33_Y	423_K	0.644	0.10
23_A	93_V	0.643	0.10
237_D	277_V	0.642	0.10
322_I	500_E	0.642	0.10
255_K	271_D	0.641	0.10
30_R	322_I	0.639	0.10
152_E	288_L	0.639	0.10
39_L	404_S	0.639	0.10
93_V	110_L	0.637	0.10
37_R	93_V	0.635	0.10
41_E	93_V	0.635	0.10
103_Q	111_G	0.634	0.10
414_H	449_R	0.632	0.10
235_G	431_A	0.631	0.10
43_S	266_G	0.631	0.10
382_D	425_A	0.631	0.10
8_A	251_D	0.631	0.10
87_P	90_F	0.630	0.10
20_P	170_T	0.630	0.10
97_S	118_Y	0.628	0.10
37_R	377_I	0.627	0.10
41_E	377_I	0.627	0.10
337_S	460_K	0.625	0.10
301_K	462_Q	0.624	0.10
41_E	416_C	0.624	0.10
37_R	416_C	0.624	0.10
128_E	230_K	0.623	0.10
119_S	328_K	0.623	0.10
396_D	471_Y	0.623	0.10
30_R	58_I	0.622	0.10
87_P	421_P	0.621	0.10
237_D	423_K	0.621	0.10
167_F	387_V	0.619	0.10
420_I	464_A	0.618	0.10
389_W	413_V	0.618	0.10
144_L	447_V	0.617	0.10
197_I	393_E	0.616	0.10
98_K	501_I	0.616	0.10
309_P	379_L	0.615	0.10
341_K	450_K	0.613	0.10
120_Q	194_T	0.611	0.10
192_K	418_T	0.610	0.10
116_V	414_H	0.609	0.10
116_V	119_S	0.608	0.10
122_H	485_F	0.608	0.10
31_A	208_P	0.608	0.10
130_E	322_I	0.605	0.10
236_V	345_Y	0.605	0.10
358_F	421_P	0.604	0.10
478_V	482_L	0.604	0.10
252_Y	256_E	0.603	0.10
146_I	295_R	0.602	0.10
167_F	401_G	0.602	0.10
95_Y	117_L	0.602	0.10
26_P	466_K	0.601	0.10
46_A	74_V	0.600	0.10
407_Y	422_Y	0.599	0.10
128_E	173_A	0.598	0.10
10_L	94_L	0.598	0.10
147_D	454_Y	0.598	0.10
114_A	414_H	0.598	0.10
111_G	379_L	0.597	0.10
89_A	129_I	0.593	0.10
345_Y	350_F	0.592	0.10
57_K	430_I	0.592	0.10
102_R	143_K	0.592	0.10
481_S	491_K	0.591	0.10
288_L	433_V	0.590	0.10
13_A	482_L	0.590	0.10
117_L	179_D	0.590	0.10
15_F	103_Q	0.590	0.10
188_Y	205_F	0.588	0.10
86_V	229_V	0.588	0.10
324_L	441_K	0.587	0.10
108_Y	112_V	0.587	0.10
419_K	433_V	0.586	0.10
235_G	340_R	0.585	0.10
341_K	489_G	0.584	0.10
305_D	308_S	0.584	0.10
89_A	377_I	0.583	0.10
26_P	325_G	0.583	0.10
503_E	506_F	0.582	0.10
58_I	71_K	0.580	0.10
7_F	383_E	0.580	0.10
12_P	451_L	0.580	0.10
153_P	270_A	0.579	0.10
144_L	220_N	0.578	0.09
108_Y	401_G	0.577	0.09
12_P	460_K	0.577	0.09
87_P	352_V	0.575	0.09
28_P	128_E	0.575	0.09
409_M	474_Y	0.574	0.09
30_R	261_E	0.574	0.09
381_Y	416_C	0.573	0.09
94_L	403_E	0.573	0.09
30_R	303_Y	0.573	0.09
252_Y	460_K	0.572	0.09
468_L	498_Q	0.572	0.09
131_T	142_F	0.572	0.09
183_A	468_L	0.570	0.09
241_I	297_V	0.570	0.09
374_A	397_W	0.570	0.09
231_P	429_S	0.570	0.09
113_K	180_W	0.568	0.09
183_A	502_V	0.568	0.09
103_Q	190_Y	0.567	0.09
402_I	467_K	0.567	0.09
44_L	105_R	0.566	0.09
89_A	424_S	0.564	0.09
96_S	376_K	0.564	0.09
342_P	382_D	0.563	0.09
217_R	372_R	0.563	0.09
217_R	232_H	0.563	0.09
173_A	203_F	0.561	0.09
118_Y	416_C	0.558	0.09
172_V	264_S	0.558	0.09
292_E	341_K	0.557	0.09
323_E	420_I	0.557	0.09
58_I	189_E	0.557	0.09
57_K	204_I	0.557	0.09
244_M	343_K	0.556	0.09
266_G	434_E	0.556	0.09
252_Y	327_K	0.556	0.09
291_E	365_G	0.555	0.09
408_Q	439_E	0.555	0.09
116_V	300_F	0.550	0.09
98_K	500_E	0.550	0.09
41_E	428_E	0.550	0.09
37_R	428_E	0.550	0.09
30_R	253_T	0.549	0.09
143_K	157_E	0.549	0.09
343_K	422_Y	0.548	0.09
113_K	386_D	0.545	0.09
104_T	299_T	0.545	0.09
234_Y	430_I	0.545	0.09
73_N	123_Q	0.544	0.09
286_K	338_I	0.543	0.09
320_D	339_T	0.542	0.09
12_P	423_K	0.542	0.09
155_I	298_E	0.541	0.09
71_K	131_T	0.540	0.09
296_L	381_Y	0.537	0.09
248_L	251_D	0.537	0.09
147_D	506_F	0.537	0.09
354_A	497_Y	0.537	0.09
492_E	502_V	0.536	0.09
130_E	361_S	0.536	0.09
345_Y	436_I	0.536	0.09
163_N	481_S	0.535	0.09
27_N	236_V	0.535	0.09
255_K	485_F	0.534	0.09
129_I	290_E	0.533	0.09
155_I	455_L	0.533	0.09
41_E	386_D	0.533	0.09
37_R	386_D	0.533	0.09
51_G	297_V	0.532	0.09
196_I	418_T	0.532	0.09
20_P	65_E	0.532	0.09
41_E	426_G	0.532	0.09
37_R	426_G	0.532	0.09
275_E	302_K	0.528	0.09
402_I	407_Y	0.527	0.09
36_V	355_G	0.526	0.09
144_L	211_N	0.525	0.09
89_A	239_E	0.525	0.09
416_C	423_K	0.524	0.09
360_G	436_I	0.524	0.09
47_T	110_L	0.524	0.09
11_S	115_A	0.524	0.09
15_F	358_F	0.522	0.09
282_N	418_T	0.521	0.09
72_V	295_R	0.521	0.09
289_T	292_E	0.520	0.09
53_L	217_R	0.518	0.09
79_I	387_V	0.518	0.09
28_P	485_F	0.518	0.09
275_E	490_N	0.517	0.09
145_K	324_L	0.517	0.09
321_L	414_H	0.516	0.09
191_I	331_N	0.515	0.09
95_Y	266_G	0.513	0.09
293_I	441_K	0.511	0.09
99_Y	180_W	0.511	0.09
9_S	434_E	0.511	0.09
168_H	457_E	0.510	0.09
132_S	237_D	0.510	0.09
377_I	429_S	0.509	0.09
364_V	475_V	0.509	0.09
62_L	412_M	0.507	0.09
254_I	326_L	0.507	0.09
263_Q	389_W	0.506	0.09
289_T	455_L	0.506	0.09
22_L	384_K	0.504	0.09
35_T	267_D	0.504	0.09
171_S	299_T	0.504	0.09
486_L	497_Y	0.504	0.09
163_N	166_G	0.504	0.09
99_Y	239_E	0.503	0.09
82_P	426_G	0.503	0.09
196_I	308_S	0.503	0.09
37_R	270_A	0.503	0.09
41_E	270_A	0.503	0.09
28_P	452_K	0.502	0.09
275_E	282_N	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2q2eB	2	0.9604	100	0.38	Contact Map
2zbkB	1	0.9547	100	0.387	Contact Map
1mu5A	1	0.8679	100	0.416	Contact Map
3lnuA	1	0.5509	100	0.865	Contact Map
1kijA	2	0.6377	100	0.866	Contact Map
4urlA	1	0.6	100	0.866	Contact Map
4wubA	2	0.6434	100	0.867	Contact Map
4i3hA	2	0.7057	100	0.871	Contact Map
3cwvA	1	0.5679	100	0.872	Contact Map
1s16A	2	0.6113	100	0.876	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0137 seconds.