Q97ZE6 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZE6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97ZE6	Sequences: MINSSEGKSDNKIIEKATQILSKYPLCDSCLGRCFARLGYGLENKERGRAIKISLMLILDEKIKNHEIGDLSSIKRIMENLGPIAEKWYKLYFSSEFHSHPCYLCQNKIEDIKEDFSDKAFKLLSGLGVKSYVLGVELDEETKKKESKIIEEFTLMYYESIKHEIKREVGKTLSKRGYPPNMDNPEVEIVYRLSDLQVFIISKNIRTFYVYNRLNRNLPISSWFSKQGNEGLNTLLQRKIVFAFSEPTTVRILADYPIVIENEGRDKIDVGGYYIFKVMTVGKKELQAISAAKPTMRKYRVTVYSTSSLSDAIRVYGNIYDLYIDAKSFSELNEKLSKLKSQYEIIVLSVDLIDVKGRIKDIIENYLKSF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	370 (336)
Sequences:	217 (174)
Seq/√Len:	9.5

HALSA - Q9HNR4
SULSO - Q97ZE6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
275_I	283_K	4.976	1.00
27_C	30_C	3.334	0.95
30_C	33_R	3.222	0.94
332_L	336_L	2.960	0.91
249_T	297_R	2.850	0.89
275_I	281_V	2.768	0.88
58_I	324_I	2.764	0.88
27_C	33_R	2.714	0.87
167_R	171_K	2.621	0.85
245_S	297_R	2.608	0.85
354_D	357_G	2.344	0.77
244_F	256_Y	2.306	0.76
246_E	249_T	2.303	0.76
240_I	258_I	2.290	0.76
297_R	331_E	2.241	0.74
348_L	362_I	2.238	0.74
44_N	48_G	2.223	0.73
235_L	238_R	2.185	0.72
292_A	301_V	2.182	0.72
328_S	331_E	2.127	0.70
346_I	362_I	2.125	0.70
249_T	331_E	2.085	0.68
102_C	107_N	2.072	0.68
159_E	164_E	2.040	0.67
258_I	332_L	2.017	0.66
223_W	335_K	1.978	0.64
26_L	32_G	1.942	0.63
297_R	328_S	1.930	0.62
218_L	338_K	1.920	0.62
245_S	331_E	1.911	0.61
332_L	335_K	1.910	0.61
331_E	341_S	1.874	0.60
225_S	228_G	1.861	0.59
258_I	334_E	1.854	0.59
213_R	244_F	1.852	0.59
223_W	235_L	1.834	0.58
120_A	204_N	1.824	0.58
213_R	256_Y	1.813	0.57
185_P	193_L	1.808	0.57
54_S	58_I	1.796	0.56
130_K	161_I	1.792	0.56
348_L	360_K	1.783	0.56
247_P	297_R	1.775	0.55
32_G	44_N	1.748	0.54
249_T	328_S	1.745	0.54
220_I	236_L	1.709	0.52
244_F	247_P	1.706	0.52
31_L	35_F	1.690	0.52
283_K	286_L	1.646	0.50
235_L	335_K	1.645	0.50
173_L	260_I	1.634	0.49
335_K	341_S	1.633	0.49
246_E	297_R	1.630	0.49
28_D	32_G	1.621	0.48
252_I	297_R	1.613	0.48
245_S	328_S	1.599	0.48
309_L	358_R	1.594	0.47
122_K	125_S	1.593	0.47
331_E	335_K	1.572	0.46
173_L	183_D	1.565	0.46
173_L	353_I	1.553	0.45
246_E	331_E	1.538	0.45
220_I	244_F	1.534	0.45
247_P	256_Y	1.533	0.45
258_I	336_L	1.512	0.44
244_F	255_D	1.503	0.43
245_S	249_T	1.491	0.43
32_G	48_G	1.488	0.43
304_Y	356_K	1.470	0.42
47_R	52_K	1.466	0.42
67_E	75_K	1.460	0.41
220_I	256_Y	1.459	0.41
247_P	329_F	1.454	0.41
221_S	240_I	1.443	0.41
44_N	52_K	1.438	0.40
300_R	361_D	1.436	0.40
48_G	52_K	1.424	0.40
251_R	301_V	1.422	0.40
247_P	331_E	1.413	0.39
235_L	258_I	1.408	0.39
239_K	262_N	1.404	0.39
255_D	326_A	1.401	0.39
26_L	36_A	1.397	0.39
166_K	291_A	1.396	0.39
187_V	239_K	1.394	0.39
40_Y	51_I	1.390	0.38
135_G	330_S	1.389	0.38
47_R	50_A	1.388	0.38
59_L	64_K	1.385	0.38
31_L	36_A	1.379	0.38
96_E	353_I	1.377	0.38
328_S	341_S	1.377	0.38
54_S	57_L	1.370	0.38
222_S	237_Q	1.365	0.37
51_I	57_L	1.358	0.37
213_R	297_R	1.358	0.37
218_L	222_S	1.354	0.37
292_A	302_T	1.353	0.37
137_E	365_N	1.347	0.37
220_I	336_L	1.346	0.37
74_I	77_I	1.345	0.36
235_L	329_F	1.341	0.36
46_E	49_R	1.324	0.36
297_R	341_S	1.313	0.35
159_E	171_K	1.309	0.35
138_L	191_Y	1.308	0.35
297_R	335_K	1.303	0.35
124_L	154_T	1.301	0.35
249_T	329_F	1.292	0.34
208_F	264_G	1.281	0.34
44_N	47_R	1.266	0.33
46_E	55_L	1.256	0.33
242_F	248_T	1.249	0.33
259_V	345_I	1.247	0.33
47_R	164_E	1.247	0.33
243_A	327_K	1.245	0.32
245_S	255_D	1.236	0.32
124_L	200_I	1.234	0.32
244_F	341_S	1.230	0.32
322_L	362_I	1.229	0.32
60_D	64_K	1.222	0.32
187_V	195_D	1.216	0.31
213_R	255_D	1.215	0.31
256_Y	341_S	1.209	0.31
326_A	341_S	1.202	0.31
49_R	58_I	1.202	0.31
235_L	276_F	1.201	0.31
129_V	239_K	1.200	0.31
139_D	145_K	1.197	0.31
249_T	341_S	1.195	0.31
209_Y	245_S	1.183	0.30
131_S	207_T	1.177	0.30
164_E	167_R	1.175	0.30
25_P	32_G	1.170	0.30
235_L	336_L	1.166	0.29
297_R	329_F	1.162	0.29
238_R	258_I	1.161	0.29
167_R	185_P	1.159	0.29
128_G	312_A	1.152	0.29
53_I	57_L	1.148	0.29
47_R	57_L	1.148	0.29
120_A	173_L	1.144	0.29
213_R	220_I	1.139	0.28
247_P	328_S	1.134	0.28
164_E	170_G	1.116	0.28
24_Y	36_A	1.115	0.28
209_Y	247_P	1.113	0.28
235_L	247_P	1.109	0.27
328_S	335_K	1.108	0.27
61_E	85_A	1.105	0.27
28_D	44_N	1.102	0.27
289_I	302_T	1.101	0.27
29_S	43_E	1.099	0.27
32_G	47_R	1.099	0.27
223_W	238_R	1.096	0.27
50_A	54_S	1.093	0.27
228_G	237_Q	1.087	0.27
239_K	281_V	1.085	0.27
246_E	328_S	1.084	0.26
348_L	365_N	1.081	0.26
181_N	281_V	1.079	0.26
209_Y	258_I	1.057	0.26
50_A	53_I	1.055	0.25
90_K	313_I	1.053	0.25
32_G	36_A	1.041	0.25
216_R	253_L	1.034	0.25
250_V	257_P	1.031	0.25
144_K	222_S	1.030	0.25
152_E	324_I	1.030	0.25
223_W	336_L	1.026	0.25
111_D	278_V	1.026	0.25
236_L	281_V	1.021	0.24
300_R	359_I	1.019	0.24
202_S	265_R	1.015	0.24
163_H	242_F	1.013	0.24
49_R	54_S	1.012	0.24
245_S	329_F	1.012	0.24
252_I	331_E	1.008	0.24
32_G	43_E	1.003	0.24
209_Y	297_R	1.002	0.24
338_K	356_K	1.001	0.24
50_A	57_L	0.992	0.23
235_L	244_F	0.990	0.23
327_K	338_K	0.981	0.23
232_L	243_A	0.979	0.23
146_E	260_I	0.978	0.23
98_H	177_G	0.974	0.23
90_K	123_L	0.970	0.23
132_Y	169_V	0.970	0.23
245_S	341_S	0.965	0.23
329_F	341_S	0.964	0.23
360_K	365_N	0.964	0.23
213_R	247_P	0.963	0.22
213_R	341_S	0.959	0.22
110_E	220_I	0.957	0.22
96_E	100_H	0.957	0.22
300_R	362_I	0.952	0.22
290_S	320_Y	0.952	0.22
56_M	59_L	0.951	0.22
223_W	246_E	0.950	0.22
137_E	199_F	0.948	0.22
34_C	250_V	0.945	0.22
24_Y	32_G	0.945	0.22
160_S	219_P	0.943	0.22
249_T	252_I	0.937	0.22
162_K	166_K	0.936	0.22
326_A	329_F	0.936	0.22
246_E	261_E	0.936	0.22
235_L	297_R	0.936	0.22
249_T	335_K	0.934	0.22
32_G	35_F	0.931	0.22
109_I	290_S	0.930	0.21
187_V	277_K	0.928	0.21
244_F	326_A	0.928	0.21
246_E	341_S	0.927	0.21
247_P	252_I	0.925	0.21
215_N	218_L	0.925	0.21
243_A	292_A	0.923	0.21
119_K	198_V	0.917	0.21
351_D	361_D	0.914	0.21
174_S	177_G	0.914	0.21
238_R	335_K	0.910	0.21
261_E	297_R	0.910	0.21
25_P	37_R	0.902	0.21
244_F	297_R	0.898	0.21
159_E	167_R	0.898	0.21
222_S	248_T	0.898	0.21
218_L	232_L	0.896	0.20
326_A	331_E	0.894	0.20
32_G	52_K	0.892	0.20
256_Y	326_A	0.891	0.20
148_K	161_I	0.889	0.20
48_G	55_L	0.886	0.20
172_T	237_Q	0.885	0.20
122_K	316_Y	0.884	0.20
139_D	301_V	0.882	0.20
219_P	261_E	0.878	0.20
46_E	57_L	0.878	0.20
212_N	241_V	0.878	0.20
252_I	328_S	0.877	0.20
248_T	333_N	0.874	0.20
24_Y	47_R	0.874	0.20
206_R	283_K	0.872	0.20
231_G	333_N	0.871	0.20
38_L	48_G	0.870	0.20
245_S	326_A	0.869	0.20
209_Y	235_L	0.865	0.20
256_Y	297_R	0.865	0.20
224_F	237_Q	0.864	0.20
142_T	277_K	0.863	0.20
42_L	57_L	0.862	0.19
34_C	40_Y	0.860	0.19
222_S	231_G	0.859	0.19
249_T	256_Y	0.858	0.19
48_G	57_L	0.858	0.19
213_R	326_A	0.854	0.19
246_E	257_P	0.853	0.19
59_L	90_K	0.853	0.19
47_R	170_G	0.841	0.19
223_W	333_N	0.840	0.19
210_V	258_I	0.836	0.19
26_L	35_F	0.828	0.19
135_G	167_R	0.824	0.18
106_Q	166_K	0.822	0.18
59_L	117_S	0.821	0.18
31_L	34_C	0.818	0.18
216_R	261_E	0.818	0.18
264_G	295_T	0.817	0.18
244_F	329_F	0.811	0.18
209_Y	244_F	0.811	0.18
302_T	357_G	0.810	0.18
272_G	284_K	0.808	0.18
245_S	252_I	0.805	0.18
185_P	195_D	0.799	0.18
176_R	302_T	0.792	0.18
33_R	102_C	0.791	0.18
256_Y	329_F	0.790	0.18
254_A	326_A	0.788	0.18
278_V	343_Y	0.788	0.18
29_S	34_C	0.787	0.17
351_D	357_G	0.784	0.17
242_F	280_T	0.781	0.17
184_N	362_I	0.779	0.17
207_T	237_Q	0.777	0.17
216_R	254_A	0.776	0.17
244_F	249_T	0.774	0.17
46_E	53_I	0.773	0.17
262_N	265_R	0.772	0.17
46_E	60_D	0.771	0.17
235_L	256_Y	0.768	0.17
237_Q	303_V	0.767	0.17
58_I	61_E	0.767	0.17
35_F	43_E	0.766	0.17
53_I	58_I	0.764	0.17
50_A	55_L	0.764	0.17
145_K	222_S	0.760	0.17
193_L	237_Q	0.758	0.17
244_F	331_E	0.757	0.17
25_P	47_R	0.755	0.17
52_K	55_L	0.752	0.17
215_N	301_V	0.751	0.17
187_V	301_V	0.749	0.17
186_E	355_V	0.745	0.16
181_N	314_R	0.744	0.16
230_E	261_E	0.743	0.16
227_Q	333_N	0.742	0.16
295_T	366_Y	0.742	0.16
28_D	48_G	0.740	0.16
220_I	332_L	0.739	0.16
215_N	337_S	0.738	0.16
256_Y	331_E	0.736	0.16
207_T	262_N	0.735	0.16
153_F	311_D	0.734	0.16
245_S	256_Y	0.734	0.16
173_L	205_I	0.734	0.16
245_S	335_K	0.733	0.16
362_I	367_L	0.732	0.16
219_P	354_D	0.732	0.16
45_K	50_A	0.725	0.16
52_K	59_L	0.723	0.16
163_H	166_K	0.723	0.16
26_L	31_L	0.722	0.16
240_I	283_K	0.721	0.16
94_S	196_L	0.719	0.16
117_S	149_I	0.718	0.16
295_T	302_T	0.715	0.16
175_K	179_P	0.714	0.16
28_D	31_L	0.714	0.16
116_F	138_L	0.713	0.16
31_L	108_K	0.712	0.16
28_D	35_F	0.711	0.16
81_L	86_E	0.709	0.16
217_N	310_S	0.707	0.16
214_L	266_D	0.704	0.15
209_Y	255_D	0.702	0.15
291_A	301_V	0.701	0.15
118_D	134_L	0.700	0.15
303_V	309_L	0.699	0.15
235_L	332_L	0.699	0.15
105_C	299_Y	0.697	0.15
213_R	235_L	0.692	0.15
244_F	254_A	0.691	0.15
241_V	303_V	0.690	0.15
237_Q	334_E	0.688	0.15
239_K	285_E	0.687	0.15
101_P	314_R	0.687	0.15
221_S	319_I	0.686	0.15
55_L	324_I	0.686	0.15
250_V	295_T	0.685	0.15
46_E	52_K	0.684	0.15
38_L	47_R	0.684	0.15
127_L	139_D	0.683	0.15
247_P	255_D	0.682	0.15
235_L	245_S	0.681	0.15
35_F	51_I	0.678	0.15
167_R	186_E	0.673	0.15
241_V	276_F	0.671	0.15
246_E	256_Y	0.669	0.15
178_Y	194_S	0.667	0.15
74_I	79_E	0.665	0.15
295_T	364_E	0.662	0.14
203_K	217_N	0.661	0.14
197_Q	212_N	0.659	0.14
79_E	205_I	0.656	0.14
48_G	164_E	0.656	0.14
235_L	249_T	0.654	0.14
80_N	85_A	0.652	0.14
28_D	50_A	0.650	0.14
213_R	245_S	0.650	0.14
38_L	64_K	0.649	0.14
224_F	312_A	0.642	0.14
121_F	323_Y	0.642	0.14
198_V	277_K	0.641	0.14
145_K	243_A	0.640	0.14
346_I	353_I	0.639	0.14
25_P	31_L	0.636	0.14
130_K	231_G	0.635	0.14
82_G	85_A	0.635	0.14
50_A	149_I	0.635	0.14
301_V	365_N	0.631	0.14
120_A	134_L	0.631	0.14
328_S	333_N	0.631	0.14
159_E	208_F	0.624	0.14
35_F	44_N	0.624	0.14
147_S	219_P	0.621	0.14
254_A	283_K	0.620	0.14
320_Y	323_Y	0.620	0.14
326_A	332_L	0.618	0.14
46_E	50_A	0.618	0.14
140_E	148_K	0.616	0.13
332_L	341_S	0.615	0.13
255_D	341_S	0.614	0.13
173_L	292_A	0.612	0.13
252_I	339_L	0.611	0.13
290_S	304_Y	0.610	0.13
219_P	325_D	0.610	0.13
293_K	301_V	0.608	0.13
24_Y	34_C	0.605	0.13
58_I	62_K	0.604	0.13
187_V	262_N	0.602	0.13
174_S	274_Y	0.602	0.13
136_V	304_Y	0.602	0.13
223_W	258_I	0.599	0.13
206_R	278_V	0.599	0.13
136_V	200_I	0.599	0.13
92_Y	95_S	0.598	0.13
26_L	39_G	0.595	0.13
115_D	198_V	0.594	0.13
329_F	335_K	0.594	0.13
329_F	332_L	0.592	0.13
172_T	175_K	0.591	0.13
170_G	345_I	0.591	0.13
221_S	246_E	0.590	0.13
218_L	365_N	0.589	0.13
220_I	341_S	0.588	0.13
213_R	254_A	0.587	0.13
173_L	176_R	0.587	0.13
300_R	346_I	0.586	0.13
24_Y	44_N	0.585	0.13
199_F	324_I	0.581	0.13
39_G	42_L	0.581	0.13
39_G	44_N	0.580	0.13
219_P	315_V	0.579	0.13
79_E	85_A	0.579	0.13
77_I	80_N	0.578	0.13
268_I	289_I	0.575	0.13
223_W	257_P	0.575	0.13
326_A	335_K	0.574	0.13
38_L	44_N	0.574	0.13
209_Y	334_E	0.574	0.13
206_R	332_L	0.574	0.13
352_L	356_K	0.573	0.13
179_P	284_K	0.573	0.13
192_R	271_G	0.571	0.13
132_Y	266_D	0.571	0.13
160_S	302_T	0.570	0.13
77_I	81_L	0.570	0.13
180_P	189_I	0.569	0.13
213_R	329_F	0.568	0.13
209_Y	249_T	0.566	0.12
171_K	182_M	0.566	0.12
102_C	109_I	0.566	0.12
235_L	255_D	0.566	0.12
250_V	253_L	0.566	0.12
124_L	324_I	0.565	0.12
28_D	47_R	0.565	0.12
232_L	337_S	0.563	0.12
127_L	138_L	0.563	0.12
191_Y	306_T	0.562	0.12
134_L	169_V	0.562	0.12
109_I	178_Y	0.561	0.12
189_I	214_L	0.559	0.12
134_L	188_E	0.558	0.12
53_I	62_K	0.558	0.12
59_L	63_I	0.557	0.12
281_V	286_L	0.557	0.12
221_S	302_T	0.557	0.12
40_Y	66_H	0.556	0.12
146_E	164_E	0.554	0.12
159_E	225_S	0.554	0.12
97_F	204_N	0.551	0.12
245_S	254_A	0.549	0.12
125_S	275_I	0.548	0.12
277_K	314_R	0.546	0.12
210_V	240_I	0.544	0.12
102_C	105_C	0.544	0.12
61_E	64_K	0.543	0.12
108_K	311_D	0.542	0.12
36_A	274_Y	0.542	0.12
226_K	291_A	0.538	0.12
259_V	343_Y	0.537	0.12
360_K	367_L	0.537	0.12
80_N	84_I	0.536	0.12
329_F	343_Y	0.535	0.12
105_C	216_R	0.535	0.12
105_C	211_Y	0.534	0.12
27_C	32_G	0.532	0.12
301_V	348_L	0.532	0.12
246_E	252_I	0.532	0.12
245_S	261_E	0.528	0.12
328_S	332_L	0.528	0.12
177_G	187_V	0.524	0.12
173_L	189_I	0.522	0.12
82_G	88_W	0.522	0.12
213_R	331_E	0.522	0.12
38_L	57_L	0.521	0.12
223_W	332_L	0.521	0.12
214_L	217_N	0.520	0.12
146_E	290_S	0.518	0.12
163_H	171_K	0.518	0.12
208_F	287_Q	0.514	0.12
156_M	309_L	0.513	0.11
219_P	297_R	0.513	0.11
238_R	276_F	0.511	0.11
59_L	66_H	0.510	0.11
228_G	242_F	0.509	0.11
82_G	86_E	0.506	0.11
251_R	358_R	0.503	0.11
227_Q	248_T	0.502	0.11
164_E	168_E	0.502	0.11
99_S	173_L	0.501	0.11
55_L	59_L	0.501	0.11
165_I	303_V	0.501	0.11
44_N	57_L	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2v9kA	1	0.8757	100	0.357	Contact Map
2apoA	1	0.3459	96.8	0.942	Contact Map
2ausC	1	0.3459	96.7	0.942	Contact Map
1r3eA	1	0.3108	96.3	0.945	Contact Map
1k8wA	1	0.3135	95.4	0.949	Contact Map
3u28A	1	0.4162	94.4	0.952	Contact Map
2dirA	1	0.2486	49.1	0.97	Contact Map
1sgvA	1	0.2865	18.7	0.976	Contact Map
2hjhA	2	0.1514	10.2	0.979	Contact Map
4jonA	1	0.2865	6.8	0.98	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0102 seconds.