Q97ZB8 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97ZB8 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97ZB8	Sequences: MILKTLLEVIDILESKDPLQKIRERLESKVKYEEIKAGEVTFIKALYEGVGNNKVEILGRLGAIQMVGVNKGLVSDADGAIISLAVLLELLNLRDKGIELNLDVLFVTNLSIKAKLIPHKPFDFMVPLVGLDEALKVEVEPSASLVISIDSTKGNRIVKFDDFAITHVVKDGYILKLHDNVIDIYNKITGHEIYMVPLTTGDLTPLDYNVSHISTLISPWLYTDSPVIGIATVSKQVIPGYETGVLNIEMLEHASRFCIELLKYIENGGKVYEEKELEELENRLGKSSLLKAKRR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	295 (292)
Sequences:	155 (104)
Seq/√Len:	6.1

SULSO - Q97ZB8 Q7LXI4

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
73_L	77_A	4.601	0.97
200_T	290_L	4.130	0.95
25_R	88_L	3.921	0.93
117_I	126_V	3.902	0.93
73_L	81_I	3.707	0.91
182_I	193_I	3.507	0.88
2_I	255_S	3.398	0.87
88_L	91_L	3.233	0.84
181_V	228_I	2.998	0.78
58_L	91_L	2.930	0.77
166_T	196_V	2.871	0.75
199_T	210_V	2.847	0.74
149_I	258_C	2.721	0.71
77_A	81_I	2.668	0.69
248_I	252_E	2.636	0.68
176_K	179_D	2.590	0.67
53_N	144_S	2.512	0.64
210_V	280_L	2.489	0.64
158_V	196_V	2.441	0.62
81_I	251_L	2.317	0.58
163_F	189_T	2.273	0.56
165_I	230_I	2.189	0.53
42_F	129_V	2.169	0.53
187_K	239_P	2.154	0.52
9_V	84_L	2.112	0.51
106_F	280_L	2.099	0.50
156_R	179_D	2.081	0.49
184_I	239_P	2.066	0.49
176_K	199_T	2.012	0.47
23_R	32_Y	2.008	0.47
57_I	213_I	2.005	0.47
32_Y	43_I	1.981	0.46
26_L	91_L	1.969	0.45
184_I	188_I	1.880	0.42
37_A	126_V	1.826	0.40
2_I	6_L	1.794	0.39
200_T	287_S	1.785	0.39
5_T	88_L	1.783	0.39
248_I	251_L	1.778	0.39
60_R	138_E	1.765	0.38
105_L	143_A	1.745	0.38
84_L	110_L	1.703	0.36
13_L	84_L	1.678	0.35
163_F	185_Y	1.645	0.34
92_N	96_K	1.628	0.34
163_F	230_I	1.628	0.34
50_V	99_E	1.617	0.33
3_L	248_I	1.606	0.33
123_D	242_E	1.593	0.33
176_K	276_E	1.591	0.33
2_I	84_L	1.589	0.33
77_A	159_K	1.565	0.32
16_K	185_Y	1.557	0.32
34_E	39_E	1.556	0.32
153_K	232_T	1.547	0.31
25_R	91_L	1.534	0.31
184_I	264_Y	1.534	0.31
160_F	194_Y	1.533	0.31
246_L	252_E	1.531	0.31
23_R	30_V	1.520	0.30
6_L	251_L	1.516	0.30
82_I	251_L	1.502	0.30
101_N	267_N	1.455	0.29
157_I	165_I	1.444	0.28
32_Y	35_I	1.404	0.27
70_N	123_D	1.403	0.27
4_K	8_E	1.403	0.27
42_F	143_A	1.402	0.27
146_V	225_S	1.395	0.27
279_E	283_R	1.394	0.27
194_Y	197_P	1.390	0.27
13_L	22_I	1.372	0.26
44_K	272_Y	1.359	0.26
6_L	85_A	1.352	0.26
94_R	99_E	1.346	0.25
143_A	201_G	1.330	0.25
50_V	101_N	1.315	0.25
57_I	191_H	1.314	0.25
221_L	255_S	1.308	0.24
120_K	211_S	1.292	0.24
191_H	235_K	1.292	0.24
90_L	268_G	1.284	0.24
20_Q	24_E	1.272	0.23
22_I	83_S	1.266	0.23
195_M	242_E	1.259	0.23
23_R	27_E	1.249	0.23
3_L	149_I	1.249	0.23
23_R	92_N	1.246	0.23
163_F	234_S	1.243	0.23
147_I	209_N	1.239	0.23
241_Y	250_M	1.238	0.23
123_D	183_D	1.235	0.23
132_D	221_L	1.230	0.22
58_L	120_K	1.223	0.22
6_L	123_D	1.214	0.22
26_L	88_L	1.212	0.22
187_K	264_Y	1.211	0.22
111_S	128_L	1.199	0.22
11_D	251_L	1.181	0.21
185_Y	188_I	1.169	0.21
157_I	220_W	1.165	0.21
277_L	287_S	1.164	0.21
9_V	73_L	1.163	0.21
47_Y	106_F	1.162	0.21
8_E	25_R	1.160	0.21
135_L	245_V	1.150	0.21
64_I	77_A	1.145	0.20
237_V	281_E	1.144	0.20
58_L	137_V	1.143	0.20
185_Y	196_V	1.141	0.20
7_L	248_I	1.139	0.20
126_V	221_L	1.132	0.20
239_P	288_S	1.130	0.20
235_K	259_I	1.129	0.20
239_P	286_K	1.129	0.20
246_L	251_L	1.126	0.20
55_V	144_S	1.124	0.20
200_T	289_L	1.116	0.20
48_E	156_R	1.115	0.20
6_L	252_E	1.099	0.19
36_K	213_I	1.099	0.19
84_L	210_V	1.098	0.19
265_I	277_L	1.097	0.19
86_V	259_I	1.097	0.19
36_K	237_V	1.086	0.19
134_A	195_M	1.077	0.19
169_V	217_I	1.073	0.19
81_I	248_I	1.073	0.19
170_K	272_Y	1.060	0.18
111_S	241_Y	1.047	0.18
81_I	246_L	1.046	0.18
242_E	266_E	1.044	0.18
64_I	241_Y	1.036	0.18
157_I	288_S	1.036	0.18
70_N	264_Y	1.029	0.18
163_F	258_C	1.025	0.18
152_T	213_I	1.024	0.18
118_P	290_L	1.021	0.18
198_L	210_V	1.019	0.18
268_G	278_E	1.016	0.18
120_K	269_G	1.010	0.17
55_V	143_A	1.010	0.17
63_A	111_S	1.008	0.17
54_K	103_D	1.005	0.17
57_I	86_V	1.000	0.17
51_G	165_I	0.998	0.17
158_V	255_S	0.994	0.17
126_V	239_P	0.990	0.17
123_D	239_P	0.990	0.17
6_L	69_V	0.986	0.17
195_M	198_L	0.983	0.17
64_I	73_L	0.975	0.17
30_V	228_I	0.973	0.17
118_P	239_P	0.973	0.17
176_K	220_W	0.972	0.17
82_I	163_F	0.971	0.17
134_A	137_V	0.967	0.17
31_K	179_D	0.964	0.17
52_N	103_D	0.962	0.16
193_I	251_L	0.959	0.16
149_I	198_L	0.950	0.16
61_L	80_A	0.950	0.16
69_V	123_D	0.947	0.16
21_K	132_D	0.945	0.16
81_I	252_E	0.944	0.16
63_A	127_P	0.942	0.16
183_D	264_Y	0.939	0.16
5_T	196_V	0.934	0.16
63_A	112_I	0.934	0.16
18_P	64_I	0.932	0.16
188_I	247_N	0.922	0.16
115_K	207_D	0.920	0.16
46_L	184_I	0.920	0.16
147_I	163_F	0.919	0.16
163_F	233_V	0.918	0.16
99_E	278_E	0.917	0.16
6_L	188_I	0.916	0.16
57_I	149_I	0.913	0.16
15_S	96_K	0.910	0.15
115_K	127_P	0.908	0.15
209_N	272_Y	0.905	0.15
64_I	149_I	0.905	0.15
28_S	34_E	0.904	0.15
3_L	186_N	0.904	0.15
28_S	224_D	0.898	0.15
221_L	266_E	0.897	0.15
6_L	26_L	0.896	0.15
198_L	251_L	0.892	0.15
86_V	133_E	0.890	0.15
13_L	156_R	0.889	0.15
23_R	141_P	0.884	0.15
176_K	278_E	0.883	0.15
130_G	134_A	0.879	0.15
144_S	165_I	0.873	0.15
24_E	33_E	0.865	0.15
103_D	135_L	0.860	0.15
11_D	73_L	0.859	0.15
55_V	287_S	0.858	0.15
112_I	127_P	0.854	0.14
156_R	183_D	0.849	0.14
46_L	105_L	0.843	0.14
26_L	45_A	0.842	0.14
158_V	211_S	0.839	0.14
10_I	246_L	0.837	0.14
25_R	73_L	0.836	0.14
30_V	268_G	0.835	0.14
259_I	271_V	0.834	0.14
80_A	244_G	0.825	0.14
157_I	211_S	0.822	0.14
5_T	191_H	0.822	0.14
4_K	221_L	0.811	0.14
279_E	290_L	0.805	0.14
4_K	51_G	0.804	0.14
21_K	224_D	0.802	0.14
33_E	137_V	0.799	0.14
24_E	117_I	0.799	0.14
96_K	146_V	0.797	0.13
266_E	275_K	0.796	0.13
166_T	187_K	0.795	0.13
188_I	195_M	0.794	0.13
143_A	258_C	0.794	0.13
91_L	107_V	0.790	0.13
21_K	157_I	0.789	0.13
244_G	285_G	0.784	0.13
153_K	247_N	0.783	0.13
42_F	258_C	0.779	0.13
14_E	245_V	0.779	0.13
171_D	291_K	0.778	0.13
176_K	198_L	0.777	0.13
2_I	188_I	0.776	0.13
44_K	143_A	0.775	0.13
94_R	146_V	0.773	0.13
5_T	25_R	0.773	0.13
18_P	191_H	0.772	0.13
120_K	176_K	0.763	0.13
14_E	135_L	0.759	0.13
127_P	152_T	0.757	0.13
30_V	171_D	0.756	0.13
241_Y	247_N	0.754	0.13
105_L	140_E	0.752	0.13
23_R	171_D	0.752	0.13
281_E	286_K	0.750	0.13
10_I	36_K	0.745	0.13
183_D	252_E	0.743	0.13
158_V	259_I	0.742	0.13
157_I	209_N	0.741	0.13
133_E	195_M	0.741	0.13
224_D	288_S	0.740	0.13
195_M	256_R	0.735	0.12
73_L	251_L	0.734	0.12
6_L	196_V	0.731	0.12
47_Y	220_W	0.731	0.12
25_R	81_I	0.729	0.12
69_V	266_E	0.728	0.12
143_A	221_L	0.728	0.12
278_E	282_N	0.727	0.12
61_L	244_G	0.724	0.12
9_V	81_I	0.722	0.12
41_T	216_L	0.713	0.12
195_M	252_E	0.712	0.12
236_Q	277_L	0.712	0.12
38_G	63_A	0.711	0.12
188_I	220_W	0.709	0.12
161_D	250_M	0.708	0.12
70_N	239_P	0.706	0.12
20_Q	272_Y	0.705	0.12
20_Q	113_K	0.705	0.12
141_P	146_V	0.704	0.12
7_L	252_E	0.702	0.12
16_K	94_R	0.701	0.12
82_I	105_L	0.699	0.12
35_I	82_I	0.697	0.12
91_L	249_E	0.696	0.12
110_L	147_I	0.693	0.12
80_A	152_T	0.693	0.12
32_Y	48_E	0.692	0.12
166_T	183_D	0.691	0.12
146_V	281_E	0.690	0.12
2_I	7_L	0.690	0.12
173_Y	196_V	0.686	0.12
166_T	248_I	0.686	0.12
144_S	163_F	0.685	0.12
7_L	25_R	0.683	0.12
171_D	189_T	0.681	0.12
31_K	158_V	0.680	0.12
71_K	123_D	0.679	0.12
193_I	246_L	0.677	0.12
63_A	115_K	0.675	0.12
158_V	235_K	0.674	0.12
207_D	217_I	0.671	0.12
183_D	186_N	0.670	0.11
33_E	57_I	0.669	0.11
25_R	173_Y	0.667	0.11
53_N	196_V	0.663	0.11
73_L	246_L	0.660	0.11
146_V	169_V	0.657	0.11
186_N	235_K	0.657	0.11
51_G	101_N	0.655	0.11
69_V	242_E	0.654	0.11
43_I	83_S	0.653	0.11
84_L	255_S	0.652	0.11
157_I	198_L	0.652	0.11
157_I	270_K	0.652	0.11
77_A	217_I	0.650	0.11
84_L	183_D	0.648	0.11
55_V	134_A	0.648	0.11
7_L	255_S	0.646	0.11
166_T	291_K	0.646	0.11
2_I	242_E	0.645	0.11
161_D	253_H	0.643	0.11
31_K	43_I	0.643	0.11
147_I	265_I	0.643	0.11
23_R	96_K	0.642	0.11
45_A	173_Y	0.642	0.11
64_I	286_K	0.641	0.11
117_I	156_R	0.640	0.11
77_A	251_L	0.638	0.11
55_V	58_L	0.635	0.11
141_P	179_D	0.635	0.11
22_I	104_V	0.633	0.11
2_I	259_I	0.633	0.11
225_S	254_A	0.631	0.11
146_V	274_E	0.630	0.11
119_H	243_T	0.628	0.11
16_K	45_A	0.625	0.11
85_A	286_K	0.623	0.11
196_V	213_I	0.621	0.11
45_A	249_E	0.619	0.11
9_V	85_A	0.618	0.11
107_V	221_L	0.615	0.11
143_A	198_L	0.613	0.11
30_V	95_D	0.612	0.11
176_K	274_E	0.612	0.11
23_R	26_L	0.611	0.11
61_L	119_H	0.605	0.11
183_D	187_K	0.604	0.11
55_V	280_L	0.604	0.11
186_N	193_I	0.603	0.11
13_L	33_E	0.602	0.11
126_V	253_H	0.597	0.10
221_L	234_S	0.594	0.10
82_I	258_C	0.590	0.10
114_A	285_G	0.589	0.10
182_I	238_I	0.588	0.10
166_T	199_T	0.586	0.10
58_L	144_S	0.586	0.10
81_I	239_P	0.584	0.10
58_L	107_V	0.580	0.10
73_L	88_L	0.579	0.10
4_K	106_F	0.578	0.10
209_N	287_S	0.578	0.10
82_I	173_Y	0.576	0.10
115_K	152_T	0.573	0.10
163_F	254_A	0.573	0.10
64_I	110_L	0.571	0.10
231_A	240_G	0.570	0.10
139_V	230_I	0.570	0.10
2_I	58_L	0.568	0.10
8_E	34_E	0.568	0.10
53_N	165_I	0.568	0.10
234_S	280_L	0.566	0.10
247_N	250_M	0.565	0.10
156_R	176_K	0.565	0.10
5_T	43_I	0.563	0.10
139_V	198_L	0.562	0.10
50_V	188_I	0.561	0.10
11_D	210_V	0.560	0.10
46_L	239_P	0.560	0.10
159_K	207_D	0.559	0.10
149_I	251_L	0.558	0.10
64_I	161_D	0.554	0.10
54_K	135_L	0.554	0.10
42_F	134_A	0.554	0.10
8_E	165_I	0.553	0.10
7_L	247_N	0.551	0.10
106_F	160_F	0.548	0.10
129_V	245_V	0.548	0.10
188_I	266_E	0.548	0.10
131_L	255_S	0.548	0.10
58_L	146_V	0.546	0.10
23_R	50_V	0.544	0.10
163_F	211_S	0.543	0.10
73_L	268_G	0.542	0.10
176_K	281_E	0.542	0.10
32_Y	92_N	0.539	0.10
275_K	278_E	0.539	0.10
123_D	266_E	0.539	0.10
157_I	177_L	0.537	0.10
129_V	287_S	0.537	0.10
83_S	252_E	0.537	0.10
20_Q	270_K	0.535	0.10
211_S	292_A	0.535	0.10
144_S	234_S	0.534	0.10
58_L	134_A	0.533	0.10
287_S	290_L	0.533	0.10
112_I	115_K	0.528	0.10
70_N	184_I	0.528	0.10
184_I	278_E	0.526	0.10
193_I	207_D	0.526	0.10
16_K	210_V	0.525	0.10
131_L	210_V	0.523	0.10
133_E	198_L	0.522	0.10
88_L	96_K	0.520	0.09
177_L	199_T	0.520	0.09
173_Y	200_T	0.520	0.09
210_V	281_E	0.518	0.09
42_F	57_I	0.515	0.09
82_I	148_S	0.514	0.09
134_A	291_K	0.514	0.09
61_L	285_G	0.513	0.09
279_E	282_N	0.513	0.09
11_D	96_K	0.511	0.09
210_V	237_V	0.511	0.09
161_D	242_E	0.510	0.09
12_I	117_I	0.510	0.09
111_S	127_P	0.509	0.09
176_K	286_K	0.508	0.09
53_N	283_R	0.508	0.09
113_K	238_I	0.506	0.09
22_I	101_N	0.506	0.09
6_L	91_L	0.505	0.09
58_L	143_A	0.505	0.09
85_A	209_N	0.505	0.09
81_I	191_H	0.505	0.09
187_K	251_L	0.504	0.09
252_E	256_R	0.503	0.09
2_I	81_I	0.503	0.09
55_V	105_L	0.502	0.09
36_K	270_K	0.502	0.09
86_V	165_I	0.502	0.09
196_V	235_K	0.502	0.09
51_G	274_E	0.501	0.09
30_V	107_V	0.501	0.09
214_S	218_S	0.501	0.09
215_T	218_S	0.501	0.09
230_I	234_S	0.500	0.09
2_I	55_V	0.500	0.09
80_A	115_K	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3pp8A	2	0.6983	51.9	0.976	Contact Map
2rb7A	2	0.8542	48.3	0.977	Contact Map
1a4iA	2	0.5356	37.9	0.978	Contact Map
2w6kA	1	0.2407	30.8	0.979	Contact Map
4h2kA	1	0.7492	27.1	0.98	Contact Map
4xcvA	2	0.7186	25.2	0.98	Contact Map
3by5A	2	0.2068	22.1	0.981	Contact Map
1y0yA	5	0.7458	20.2	0.981	Contact Map
3ramA	4	0.8678	18	0.981	Contact Map
1q7lA	2	0.5186	17.1	0.982	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0097 seconds.