AUBA - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

AUBA - RNA-binding protein AU-1

UniProt:	Q97Z43	Sequences: MKGRVRIRGIYATALTSIFSSLSYEIVQQSVEISERFMQEINNLSADITIKDFEDDRGKIIVMGNGIIEDDLRNVFKYSFHWRSPVKLYSVIEIDESCTYANFKVEPCLREGIVIKPPYDGKIILSETKAVSKYAIVWRGKGITTFSEHIVDEEEKMRLLTLSLPLNRKGYNVKWRSNAKYVALNELKEDLERLILRYENREFRDQGEDFYLITLSLPDKLYLDEVRKNVVDTVKYHHMLKLSYNREVDSLEKDKKGSLGKLLEGLISDFLKIEHIKADGKVIYLRGGKVIEKEVNDNGYRIVLRREFEGNGILDGIGKKIEEGDYDIVEYNSDKWYQIHKYYSGIDNSLKGVYINISTPPELLRGKIRYLDLEIDIAIRDSEIALLDEDELNKKSIYMPSSLVNKAKEVVNYLINRIQQNKLS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	424 (404)
Sequences:	105 (74)
Seq/√Len:	3.7

HALSA - AUBA
SULSO - AUBA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
322_E	351_K	4.134	0.83
157_M	320_K	3.540	0.71
135_A	187_L	3.309	0.66
158_R	163_S	3.243	0.64
273_I	331_Y	3.219	0.63
16_T	33_I	3.207	0.63
190_D	194_L	3.206	0.63
284_Y	368_I	3.174	0.62
316_G	350_L	3.040	0.58
157_M	163_S	2.893	0.54
247_E	250_S	2.864	0.54
291_I	328_I	2.851	0.53
16_T	37_F	2.809	0.52
157_M	160_L	2.709	0.49
158_R	161_T	2.648	0.48
40_E	292_E	2.611	0.47
160_L	163_S	2.583	0.46
386_L	389_E	2.580	0.46
135_A	173_V	2.488	0.43
135_A	194_L	2.459	0.42
102_N	261_K	2.379	0.40
33_I	37_F	2.289	0.38
142_G	316_G	2.285	0.38
182_V	375_I	2.280	0.38
29_Q	82_W	2.234	0.36
184_L	316_G	2.197	0.36
127_E	144_T	2.144	0.34
157_M	161_T	2.140	0.34
310_G	368_I	2.135	0.34
386_L	412_N	2.125	0.34
50_I	61_I	2.114	0.33
250_S	273_I	2.001	0.31
389_E	408_K	1.978	0.30
344_S	347_D	1.952	0.30
77_K	183_A	1.950	0.29
386_L	393_N	1.949	0.29
226_V	357_I	1.922	0.29
158_R	164_L	1.910	0.29
187_L	343_Y	1.903	0.28
344_S	351_K	1.880	0.28
17_S	40_E	1.869	0.28
344_S	349_S	1.855	0.27
228_K	294_E	1.854	0.27
49_T	177_S	1.848	0.27
38_M	409_E	1.843	0.27
129_K	140_G	1.812	0.26
54_E	393_N	1.797	0.26
317_I	378_A	1.791	0.26
226_V	229_N	1.784	0.26
4_R	414_L	1.784	0.26
272_K	284_Y	1.761	0.25
59_K	215_L	1.735	0.25
157_M	164_L	1.723	0.25
256_K	292_E	1.715	0.24
40_E	187_L	1.679	0.24
256_K	302_I	1.676	0.24
309_E	321_I	1.652	0.23
155_E	158_R	1.641	0.23
302_I	389_E	1.631	0.23
19_F	189_E	1.606	0.22
17_S	21_S	1.593	0.22
283_I	311_N	1.582	0.22
65_N	357_I	1.579	0.22
103_F	375_I	1.570	0.21
11_Y	359_T	1.563	0.21
275_H	362_E	1.552	0.21
341_K	350_L	1.537	0.21
125_L	302_I	1.533	0.21
49_T	176_R	1.520	0.21
19_F	91_V	1.513	0.20
62_V	207_G	1.499	0.20
66_G	194_L	1.489	0.20
158_R	162_L	1.487	0.20
366_G	400_P	1.480	0.20
160_L	164_L	1.476	0.20
20_S	50_I	1.466	0.20
124_I	292_E	1.454	0.19
160_L	320_K	1.452	0.19
28_Q	48_I	1.452	0.19
155_E	162_L	1.430	0.19
135_A	172_N	1.426	0.19
7_I	107_P	1.425	0.19
31_V	50_I	1.424	0.19
20_S	39_Q	1.408	0.19
44_L	183_A	1.403	0.19
49_T	54_E	1.402	0.19
28_Q	172_N	1.399	0.18
4_R	135_A	1.390	0.18
75_V	147_S	1.385	0.18
161_T	164_L	1.384	0.18
18_I	80_F	1.384	0.18
135_A	386_L	1.370	0.18
6_R	175_W	1.357	0.18
74_N	256_K	1.354	0.18
225_E	267_I	1.350	0.18
4_R	129_K	1.344	0.18
75_V	357_I	1.339	0.17
301_R	367_K	1.339	0.17
213_I	301_R	1.319	0.17
117_P	413_Y	1.318	0.17
178_N	260_G	1.317	0.17
252_E	360_P	1.314	0.17
316_G	398_Y	1.308	0.17
248_V	369_R	1.304	0.17
10_I	13_T	1.302	0.17
5_V	64_G	1.272	0.16
209_D	302_I	1.268	0.16
113_I	377_I	1.257	0.16
166_L	351_K	1.251	0.16
386_L	390_D	1.248	0.16
407_A	411_V	1.244	0.16
94_I	412_N	1.241	0.16
370_Y	376_D	1.239	0.16
376_D	388_D	1.239	0.16
352_G	376_D	1.239	0.16
315_D	356_N	1.239	0.16
370_Y	388_D	1.239	0.16
356_N	376_D	1.239	0.16
342_Y	352_G	1.239	0.16
352_G	356_N	1.239	0.16
356_N	370_Y	1.239	0.16
352_G	370_Y	1.239	0.16
342_Y	370_Y	1.239	0.16
342_Y	376_D	1.239	0.16
315_D	376_D	1.239	0.16
315_D	370_Y	1.239	0.16
342_Y	356_N	1.239	0.16
315_D	388_D	1.239	0.16
356_N	388_D	1.239	0.16
342_Y	388_D	1.239	0.16
315_D	342_Y	1.239	0.16
352_G	388_D	1.239	0.16
315_D	352_G	1.239	0.16
262_L	316_G	1.233	0.16
45_S	258_S	1.231	0.16
173_V	194_L	1.228	0.16
49_T	149_H	1.225	0.16
126_S	187_L	1.224	0.16
7_I	146_F	1.221	0.16
188_K	357_I	1.217	0.16
386_L	408_K	1.214	0.16
174_K	210_F	1.213	0.16
322_E	344_S	1.208	0.15
223_L	362_E	1.204	0.15
210_F	330_E	1.198	0.15
377_I	384_I	1.193	0.15
215_L	236_Y	1.190	0.15
106_E	386_L	1.190	0.15
286_R	329_V	1.188	0.15
155_E	328_I	1.176	0.15
26_I	409_E	1.169	0.15
86_V	151_V	1.169	0.15
97_S	170_G	1.166	0.15
9_G	237_H	1.158	0.15
19_F	357_I	1.158	0.15
24_Y	95_D	1.154	0.15
392_L	407_A	1.151	0.15
15_L	267_I	1.149	0.15
173_V	208_E	1.146	0.15
94_I	156_K	1.144	0.15
148_E	159_L	1.142	0.15
248_V	336_W	1.141	0.15
363_L	412_N	1.136	0.14
93_E	207_G	1.136	0.14
9_G	14_A	1.130	0.14
52_D	150_I	1.127	0.14
159_L	163_S	1.124	0.14
34_S	385_A	1.122	0.14
391_E	394_K	1.120	0.14
115_I	382_S	1.115	0.14
336_W	386_L	1.108	0.14
78_Y	242_L	1.107	0.14
29_Q	197_R	1.106	0.14
272_K	287_G	1.101	0.14
152_D	159_L	1.101	0.14
103_F	182_V	1.100	0.14
80_F	406_K	1.097	0.14
152_D	156_K	1.096	0.14
169_K	257_G	1.094	0.14
190_D	220_K	1.092	0.14
158_R	304_L	1.089	0.14
8_R	14_A	1.087	0.14
248_V	314_L	1.086	0.14
63_M	137_V	1.085	0.14
325_D	360_P	1.083	0.14
313_I	415_I	1.083	0.14
79_S	288_G	1.082	0.14
151_V	199_E	1.080	0.14
283_I	323_E	1.076	0.14
28_Q	46_A	1.075	0.14
6_R	147_S	1.067	0.14
236_Y	327_D	1.059	0.13
152_D	328_I	1.052	0.13
201_R	414_L	1.052	0.13
194_L	343_Y	1.040	0.13
26_I	357_I	1.037	0.13
218_P	371_L	1.031	0.13
92_I	174_K	1.026	0.13
23_S	319_K	1.022	0.13
235_K	305_R	1.018	0.13
326_Y	357_I	1.017	0.13
50_I	126_S	1.016	0.13
91_V	375_I	1.008	0.13
283_I	344_S	1.005	0.13
132_S	378_A	1.003	0.13
85_P	152_D	1.001	0.13
28_Q	330_E	0.999	0.13
21_S	196_L	0.998	0.13
70_D	203_F	0.997	0.13
99_T	386_L	0.996	0.13
20_S	46_A	0.996	0.13
79_S	219_D	0.996	0.13
44_L	195_I	0.993	0.13
94_I	106_E	0.993	0.13
12_A	258_S	0.990	0.13
90_S	308_F	0.985	0.12
185_N	393_N	0.981	0.12
192_E	363_L	0.980	0.12
51_K	54_E	0.978	0.12
7_I	15_L	0.977	0.12
126_S	341_K	0.976	0.12
20_S	139_R	0.974	0.12
291_I	304_L	0.967	0.12
100_Y	386_L	0.964	0.12
18_I	55_D	0.961	0.12
13_T	315_D	0.959	0.12
13_T	352_G	0.959	0.12
13_T	342_Y	0.959	0.12
13_T	376_D	0.959	0.12
13_T	356_N	0.959	0.12
13_T	388_D	0.959	0.12
13_T	370_Y	0.959	0.12
36_R	237_H	0.958	0.12
114_V	117_P	0.955	0.12
256_K	308_F	0.954	0.12
138_W	380_R	0.954	0.12
320_K	378_A	0.946	0.12
82_W	197_R	0.945	0.12
73_R	160_L	0.945	0.12
147_S	363_L	0.944	0.12
157_M	162_L	0.943	0.12
73_R	386_L	0.941	0.12
252_E	325_D	0.938	0.12
207_G	232_D	0.937	0.12
48_I	70_D	0.936	0.12
304_L	328_I	0.936	0.12
242_L	329_V	0.921	0.12
225_E	349_S	0.921	0.12
46_A	184_L	0.915	0.12
4_R	117_P	0.912	0.12
85_P	368_I	0.911	0.12
202_E	258_S	0.910	0.12
242_L	327_D	0.909	0.12
70_D	368_I	0.908	0.12
11_Y	16_T	0.906	0.12
317_I	321_I	0.902	0.12
35_E	124_I	0.900	0.11
236_Y	334_D	0.899	0.11
124_I	139_R	0.899	0.11
88_L	210_F	0.898	0.11
19_F	159_L	0.898	0.11
50_I	289_K	0.898	0.11
73_R	208_E	0.896	0.11
24_Y	414_L	0.896	0.11
113_I	117_P	0.893	0.11
199_E	414_L	0.889	0.11
173_V	192_E	0.888	0.11
94_I	100_Y	0.888	0.11
22_L	319_K	0.884	0.11
24_Y	368_I	0.881	0.11
7_I	158_R	0.878	0.11
164_L	167_N	0.875	0.11
47_D	105_V	0.875	0.11
82_W	318_G	0.873	0.11
157_M	414_L	0.872	0.11
78_Y	215_L	0.871	0.11
81_H	412_N	0.870	0.11
7_I	328_I	0.870	0.11
328_I	341_K	0.867	0.11
50_I	283_I	0.864	0.11
11_Y	325_D	0.862	0.11
51_K	159_L	0.860	0.11
92_I	137_V	0.860	0.11
92_I	302_I	0.859	0.11
128_T	243_S	0.859	0.11
177_S	326_Y	0.856	0.11
81_H	201_R	0.850	0.11
39_Q	153_E	0.850	0.11
9_G	13_T	0.849	0.11
47_D	61_I	0.849	0.11
189_E	258_S	0.849	0.11
46_A	142_G	0.848	0.11
24_Y	302_I	0.844	0.11
165_P	183_A	0.844	0.11
20_S	88_L	0.841	0.11
333_S	365_R	0.839	0.11
271_L	368_I	0.839	0.11
38_M	302_I	0.838	0.11
147_S	321_I	0.836	0.11
94_I	393_N	0.835	0.11
118_P	362_E	0.834	0.11
120_D	192_E	0.833	0.11
59_K	63_M	0.833	0.11
179_A	380_R	0.833	0.11
252_E	285_L	0.832	0.11
349_S	383_E	0.832	0.11
142_G	172_N	0.826	0.11
312_G	354_Y	0.825	0.11
4_R	140_G	0.823	0.11
4_R	142_G	0.822	0.11
111_E	152_D	0.821	0.11
25_E	60_I	0.820	0.11
51_K	208_E	0.819	0.11
308_F	316_G	0.819	0.11
197_R	245_N	0.817	0.11
171_Y	379_I	0.816	0.11
104_K	309_E	0.816	0.11
63_M	382_S	0.816	0.11
8_R	13_T	0.815	0.11
36_R	342_Y	0.814	0.11
36_R	376_D	0.814	0.11
36_R	388_D	0.814	0.11
36_R	370_Y	0.814	0.11
36_R	356_N	0.814	0.11
36_R	352_G	0.814	0.11
36_R	315_D	0.814	0.11
320_K	379_I	0.812	0.11
31_V	100_Y	0.811	0.11
7_I	142_G	0.811	0.11
16_T	32_E	0.809	0.10
74_N	254_D	0.809	0.10
50_I	368_I	0.806	0.10
223_L	230_V	0.805	0.10
169_K	402_S	0.802	0.10
132_S	229_N	0.802	0.10
246_R	296_N	0.800	0.10
279_D	336_W	0.794	0.10
348_N	371_L	0.794	0.10
135_A	159_L	0.793	0.10
63_M	215_L	0.792	0.10
248_V	381_D	0.792	0.10
139_R	282_V	0.791	0.10
24_Y	284_Y	0.787	0.10
38_M	84_S	0.787	0.10
213_I	416_N	0.785	0.10
44_L	328_I	0.784	0.10
94_I	386_L	0.783	0.10
42_N	399_M	0.781	0.10
34_S	154_E	0.773	0.10
359_T	392_L	0.770	0.10
59_K	91_V	0.770	0.10
61_I	129_K	0.767	0.10
165_P	386_L	0.765	0.10
185_N	386_L	0.764	0.10
237_H	280_G	0.762	0.10
83_R	107_P	0.762	0.10
78_Y	327_D	0.761	0.10
190_D	400_P	0.760	0.10
314_L	325_D	0.759	0.10
132_S	173_V	0.758	0.10
271_L	304_L	0.757	0.10
47_D	402_S	0.756	0.10
40_E	193_R	0.755	0.10
82_W	285_L	0.755	0.10
331_Y	355_I	0.754	0.10
80_F	400_P	0.754	0.10
120_D	304_L	0.754	0.10
20_S	23_S	0.753	0.10
406_K	413_Y	0.751	0.10
124_I	154_E	0.751	0.10
275_H	388_D	0.751	0.10
275_H	376_D	0.751	0.10
275_H	370_Y	0.751	0.10
275_H	352_G	0.751	0.10
275_H	342_Y	0.751	0.10
275_H	315_D	0.751	0.10
275_H	356_N	0.751	0.10
142_G	398_Y	0.749	0.10
337_Y	365_R	0.749	0.10
58_G	236_Y	0.749	0.10
131_V	350_L	0.747	0.10
385_A	415_I	0.746	0.10
120_D	398_Y	0.744	0.10
7_I	307_E	0.741	0.10
286_R	327_D	0.740	0.10
125_L	389_E	0.740	0.10
138_W	350_L	0.739	0.10
136_I	406_K	0.738	0.10
164_L	304_L	0.737	0.10
313_I	316_G	0.735	0.10
258_S	367_K	0.734	0.10
326_Y	367_K	0.732	0.10
28_Q	147_S	0.732	0.10
78_Y	236_Y	0.731	0.10
5_V	347_D	0.730	0.10
6_R	306_R	0.730	0.10
20_S	399_M	0.729	0.10
250_S	331_Y	0.728	0.10
48_I	222_Y	0.727	0.10
61_I	399_M	0.727	0.10
84_S	132_S	0.721	0.10
164_L	317_I	0.720	0.10
177_S	207_G	0.720	0.10
195_I	199_E	0.720	0.10
31_V	165_P	0.719	0.10
98_C	400_P	0.719	0.10
84_S	260_G	0.718	0.10
308_F	327_D	0.714	0.10
82_W	245_N	0.713	0.10
188_K	226_V	0.713	0.10
50_I	406_K	0.712	0.10
172_N	414_L	0.712	0.10
353_V	387_L	0.712	0.10
163_S	177_S	0.710	0.10
83_R	207_G	0.710	0.10
135_A	341_K	0.708	0.09
181_Y	279_D	0.707	0.09
104_K	154_E	0.702	0.09
166_L	240_L	0.702	0.09
163_S	320_K	0.701	0.09
92_I	207_G	0.699	0.09
127_E	401_S	0.695	0.09
329_V	336_W	0.695	0.09
29_Q	206_Q	0.693	0.09
100_Y	393_N	0.691	0.09
84_S	229_N	0.689	0.09
71_D	156_K	0.687	0.09
187_L	393_N	0.687	0.09
226_V	326_Y	0.686	0.09
331_Y	402_S	0.686	0.09
111_E	187_L	0.685	0.09
171_Y	371_L	0.684	0.09
343_Y	415_I	0.682	0.09
386_L	415_I	0.682	0.09
11_Y	62_V	0.682	0.09
180_K	363_L	0.681	0.09
267_I	310_G	0.681	0.09
230_V	414_L	0.679	0.09
270_F	416_N	0.679	0.09
202_E	393_N	0.677	0.09
9_G	36_R	0.676	0.09
51_K	177_S	0.676	0.09
30_S	397_I	0.674	0.09
225_E	390_D	0.674	0.09
101_A	271_L	0.673	0.09
17_S	42_N	0.673	0.09
344_S	409_E	0.670	0.09
28_Q	261_K	0.670	0.09
194_L	414_L	0.666	0.09
122_K	152_D	0.660	0.09
241_K	325_D	0.656	0.09
4_R	26_I	0.655	0.09
35_E	189_E	0.653	0.09
61_I	305_R	0.653	0.09
288_G	291_I	0.652	0.09
156_K	161_T	0.651	0.09
125_L	152_D	0.651	0.09
185_N	319_K	0.649	0.09
202_E	412_N	0.645	0.09
126_S	135_A	0.645	0.09
233_T	238_H	0.644	0.09
224_D	227_R	0.644	0.09
224_D	233_T	0.644	0.09
227_R	372_D	0.644	0.09
224_D	238_H	0.644	0.09
224_D	372_D	0.644	0.09
227_R	233_T	0.644	0.09
238_H	372_D	0.644	0.09
233_T	372_D	0.644	0.09
227_R	238_H	0.644	0.09
183_A	414_L	0.643	0.09
102_N	309_E	0.641	0.09
175_W	241_K	0.641	0.09
116_K	125_L	0.641	0.09
234_V	311_N	0.640	0.09
120_D	271_L	0.639	0.09
222_Y	320_K	0.638	0.09
361_P	371_L	0.637	0.09
58_G	215_L	0.636	0.09
152_D	412_N	0.633	0.09
327_D	364_L	0.632	0.09
158_R	378_A	0.631	0.09
190_D	207_G	0.630	0.09
39_Q	321_I	0.629	0.09
159_L	173_V	0.626	0.09
94_I	408_K	0.624	0.09
135_A	142_G	0.623	0.09
226_V	257_G	0.620	0.09
20_S	414_L	0.620	0.09
194_L	366_G	0.618	0.09
21_S	115_I	0.616	0.09
125_L	202_E	0.613	0.09
49_T	355_I	0.613	0.09
69_E	379_I	0.612	0.09
15_L	151_V	0.611	0.09
141_K	170_G	0.610	0.09
353_V	382_S	0.606	0.09
44_L	310_G	0.606	0.09
296_N	367_K	0.606	0.09
120_D	383_E	0.605	0.09
121_G	226_V	0.604	0.09
44_L	124_I	0.603	0.09
188_K	254_D	0.603	0.09
245_N	411_V	0.602	0.09
51_K	176_R	0.602	0.09
6_R	400_P	0.600	0.08
61_I	396_S	0.600	0.08
278_A	334_D	0.599	0.08
39_Q	85_P	0.598	0.08
28_Q	42_N	0.597	0.08
185_N	341_K	0.596	0.08
129_K	147_S	0.594	0.08
96_E	403_L	0.593	0.08
140_G	152_D	0.593	0.08
218_P	384_I	0.591	0.08
63_M	171_Y	0.591	0.08
50_I	60_I	0.591	0.08
166_L	180_K	0.590	0.08
159_L	417_R	0.588	0.08
15_L	378_A	0.587	0.08
257_G	261_K	0.586	0.08
56_D	168_R	0.585	0.08
132_S	357_I	0.583	0.08
111_E	232_D	0.582	0.08
29_Q	34_S	0.580	0.08
28_Q	47_D	0.580	0.08
167_N	198_Y	0.580	0.08
26_I	226_V	0.578	0.08
207_G	251_L	0.576	0.08
88_L	247_E	0.576	0.08
84_S	366_G	0.576	0.08
118_P	285_L	0.574	0.08
5_V	378_A	0.573	0.08
5_V	302_I	0.572	0.08
159_L	316_G	0.571	0.08
305_R	399_M	0.571	0.08
17_S	102_N	0.571	0.08
213_I	355_I	0.570	0.08
75_V	129_K	0.569	0.08
68_I	124_I	0.569	0.08
7_I	185_N	0.568	0.08
138_W	165_P	0.567	0.08
215_L	242_L	0.565	0.08
144_T	413_Y	0.564	0.08
69_E	211_Y	0.562	0.08
30_S	325_D	0.562	0.08
5_V	128_T	0.562	0.08
78_Y	258_S	0.561	0.08
80_F	397_I	0.561	0.08
142_G	266_L	0.561	0.08
130_A	247_E	0.559	0.08
204_R	390_D	0.559	0.08
160_L	378_A	0.559	0.08
151_V	399_M	0.558	0.08
171_Y	216_S	0.556	0.08
225_E	331_Y	0.556	0.08
393_N	412_N	0.556	0.08
191_L	216_S	0.555	0.08
18_I	147_S	0.552	0.08
23_S	344_S	0.551	0.08
162_L	243_S	0.550	0.08
147_S	414_L	0.547	0.08
161_T	378_A	0.546	0.08
29_Q	339_I	0.543	0.08
381_D	401_S	0.542	0.08
11_Y	290_V	0.542	0.08
186_E	319_K	0.542	0.08
26_I	47_D	0.541	0.08
106_E	413_Y	0.539	0.08
99_T	321_I	0.539	0.08
124_I	203_F	0.538	0.08
7_I	201_R	0.538	0.08
46_A	95_D	0.538	0.08
49_T	140_G	0.537	0.08
73_R	125_L	0.536	0.08
292_E	402_S	0.535	0.08
192_E	225_E	0.531	0.08
47_D	156_K	0.530	0.08
166_L	197_R	0.528	0.08
125_L	401_S	0.525	0.08
13_T	36_R	0.524	0.08
19_F	234_V	0.524	0.08
182_V	391_E	0.522	0.08
183_A	328_I	0.522	0.08
4_R	261_K	0.521	0.08
127_E	368_I	0.520	0.08
104_K	307_E	0.517	0.08
43_N	368_I	0.517	0.08
132_S	182_V	0.515	0.08
203_F	226_V	0.515	0.08
80_F	390_D	0.514	0.08
65_N	188_K	0.514	0.08
51_K	304_L	0.514	0.08
97_S	386_L	0.510	0.08
130_A	144_T	0.508	0.08
39_Q	152_D	0.506	0.08
15_L	307_E	0.506	0.08
177_S	204_R	0.505	0.08
45_S	341_K	0.504	0.08
139_R	197_R	0.503	0.08
19_F	130_A	0.503	0.08
341_K	353_V	0.503	0.08
100_Y	132_S	0.503	0.08
116_K	401_S	0.501	0.08
122_K	416_N	0.500	0.08
249_D	406_K	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3exmA	1	0.375	100	0.824	Contact Map
2p12A	2	0.3467	99.7	0.896	Contact Map
4oxpA	1	0.316	99.3	0.921	Contact Map
2bx2L	3	0.7453	98.9	0.932	Contact Map
3cw2C	1	0.5283	58.2	0.977	Contact Map
2r5xA	1	0.25	24.3	0.982	Contact Map
4wesA	1	0.2783	21.1	0.982	Contact Map
1v6fA	1	0.1203	17.2	0.983	Contact Map
3u7qA	1	0.25	13.7	0.984	Contact Map
3gqsA	1	0.2217	11.2	0.984	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.011 seconds.