Q97Z26 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97Z26 - Biotin synthase (BioB)

UniProt:	Q97Z26	Sequences: MTLRLISSPDWVRLSFGADMVLGFSSGVFLKGALNTTINLLQYYPDGCKANCSYCGQAREVANGPECKTLIRVEWPLRPLNEVLKRIYERQGNPEYGLQRICIGQLAHPRASPDAIEITRRIRNAGIELQISELVTATYTFKHHMIEMRKAGADMIDVAIDAANEKVFEELRGKKARSMHSWKRYLEAIDEAVEVFGKKNAGIHLIIGLGESEKDAVNLMWYAHSRGAKISLFAFYPEAGTPMEKRKPVPVHVYRRMQIARWLIENDIVDINAFKFDDKGELIDVEIPSDITLNELAPAFMTSGCPGCNRPYSNERPGRVLKNVPWYLDREMTLRSIKASRLDSLIKKVVR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	351 (309)
Sequences:	114 (94)
Seq/√Len:	5.3

SULSO - Q97Z26

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
207_I	216_A	4.423	0.95
217_V	282_L	4.257	0.94
212_S	215_D	3.790	0.89
51_N	60_E	3.589	0.86
221_W	225_S	3.579	0.86
18_A	38_I	3.174	0.78
54_Y	172_R	3.150	0.77
217_V	260_A	3.037	0.74
314_N	323_N	2.909	0.71
61_V	234_A	2.876	0.70
77_L	194_E	2.578	0.61
225_S	270_D	2.542	0.60
214_K	218_N	2.514	0.59
108_H	114_D	2.279	0.51
162_A	171_L	2.270	0.51
254_Y	314_N	2.140	0.46
261_R	303_S	2.098	0.45
166_K	248_P	2.097	0.45
17_G	37_T	2.050	0.43
24_F	160_I	2.035	0.43
138_T	158_V	2.019	0.42
17_G	57_Q	1.976	0.41
41_L	47_G	1.946	0.40
318_G	324_V	1.915	0.39
129_L	228_A	1.903	0.39
254_Y	323_N	1.901	0.39
70_L	313_S	1.877	0.38
39_N	104_G	1.859	0.37
167_V	171_L	1.851	0.37
40_L	58_A	1.846	0.37
37_T	57_Q	1.832	0.36
326_W	332_M	1.828	0.36
39_N	322_K	1.827	0.36
14_L	19_D	1.820	0.36
99_Q	307_G	1.819	0.36
58_A	244_E	1.817	0.36
158_V	215_D	1.811	0.36
189_I	228_A	1.802	0.35
274_F	282_L	1.786	0.35
139_Y	153_A	1.779	0.35
203_I	228_A	1.749	0.34
106_L	158_V	1.728	0.33
213_E	253_V	1.725	0.33
35_N	172_R	1.709	0.33
104_G	322_K	1.687	0.32
39_N	71_I	1.684	0.32
166_K	170_E	1.674	0.32
261_R	265_E	1.646	0.31
249_V	314_N	1.636	0.31
36_T	172_R	1.622	0.30
71_I	236_Y	1.607	0.30
59_R	263_L	1.606	0.30
104_G	313_S	1.595	0.29
54_Y	103_I	1.594	0.29
151_A	318_G	1.592	0.29
36_T	309_N	1.575	0.29
50_A	168_F	1.564	0.29
71_I	313_S	1.558	0.28
51_N	58_A	1.555	0.28
37_T	104_G	1.540	0.28
17_G	234_A	1.535	0.28
221_W	270_D	1.523	0.27
19_D	78_R	1.516	0.27
37_T	70_L	1.513	0.27
57_Q	104_G	1.512	0.27
264_I	274_F	1.493	0.27
57_Q	70_L	1.491	0.27
249_V	323_N	1.488	0.27
315_E	323_N	1.468	0.26
216_A	225_S	1.467	0.26
71_I	104_G	1.464	0.26
159_A	280_G	1.458	0.26
17_G	70_L	1.450	0.26
39_N	313_S	1.441	0.25
186_L	222_Y	1.437	0.25
220_M	230_I	1.434	0.25
224_H	230_I	1.428	0.25
156_I	235_F	1.425	0.25
71_I	322_K	1.405	0.24
203_I	223_A	1.404	0.24
70_L	104_G	1.383	0.24
158_V	228_A	1.383	0.24
40_L	321_L	1.370	0.24
56_G	238_E	1.369	0.24
189_I	223_A	1.356	0.23
168_F	261_R	1.353	0.23
235_F	241_T	1.347	0.23
156_I	165_E	1.334	0.23
12_V	202_G	1.323	0.22
136_T	314_N	1.318	0.22
156_I	251_V	1.314	0.22
116_I	147_E	1.310	0.22
53_S	251_V	1.301	0.22
41_L	71_I	1.300	0.22
138_T	228_A	1.287	0.22
51_N	155_M	1.275	0.21
166_K	215_D	1.271	0.21
17_G	36_T	1.270	0.21
71_I	238_E	1.258	0.21
171_L	200_N	1.250	0.21
162_A	338_K	1.248	0.21
162_A	167_V	1.237	0.20
197_G	201_A	1.233	0.20
254_Y	315_E	1.231	0.20
136_T	249_V	1.228	0.20
149_R	197_G	1.227	0.20
154_D	319_R	1.227	0.20
68_K	156_I	1.224	0.20
313_S	322_K	1.223	0.20
160_I	172_R	1.219	0.20
192_A	303_S	1.217	0.20
23_G	264_I	1.215	0.20
142_K	195_V	1.205	0.20
22_L	103_I	1.188	0.19
122_I	156_I	1.178	0.19
104_G	241_T	1.176	0.19
145_M	197_G	1.175	0.19
84_L	128_E	1.157	0.19
237_P	312_Y	1.154	0.19
148_M	165_E	1.153	0.19
221_W	264_I	1.152	0.19
106_L	194_E	1.149	0.19
197_G	203_I	1.148	0.19
132_S	259_I	1.147	0.19
236_Y	322_K	1.146	0.19
168_F	185_Y	1.144	0.19
72_R	237_P	1.137	0.18
35_N	309_N	1.136	0.18
214_K	277_D	1.127	0.18
136_T	323_N	1.127	0.18
59_R	306_P	1.120	0.18
167_V	257_M	1.120	0.18
85_K	147_E	1.115	0.18
155_M	159_A	1.110	0.18
136_T	320_V	1.110	0.18
159_A	202_G	1.106	0.18
136_T	163_A	1.106	0.18
82_E	226_R	1.100	0.18
13_R	253_V	1.097	0.18
107_A	137_A	1.091	0.17
57_Q	172_R	1.084	0.17
18_A	322_K	1.083	0.17
60_E	73_V	1.078	0.17
35_N	54_Y	1.072	0.17
113_P	163_A	1.070	0.17
234_A	312_Y	1.069	0.17
195_V	228_A	1.069	0.17
106_L	157_D	1.065	0.17
197_G	228_A	1.062	0.17
39_N	238_E	1.060	0.17
17_G	61_V	1.060	0.17
13_R	38_I	1.059	0.17
56_G	207_I	1.057	0.17
80_L	121_R	1.057	0.17
98_L	306_P	1.056	0.17
104_G	236_Y	1.053	0.17
138_T	197_G	1.050	0.17
56_G	171_L	1.048	0.17
182_W	186_L	1.047	0.17
41_L	56_G	1.042	0.17
228_A	266_N	1.033	0.16
84_L	247_K	1.025	0.16
51_N	59_R	1.020	0.16
39_N	70_L	1.018	0.16
213_E	328_L	1.015	0.16
105_Q	137_A	1.014	0.16
129_L	195_V	1.013	0.16
99_Q	337_I	1.004	0.16
172_R	185_Y	1.003	0.16
16_F	119_T	1.003	0.16
40_L	248_P	1.002	0.16
54_Y	57_Q	0.998	0.16
36_T	57_Q	0.995	0.16
38_I	322_K	0.995	0.16
41_L	241_T	0.994	0.16
22_L	173_G	0.994	0.16
82_E	198_K	0.986	0.16
116_I	120_R	0.981	0.15
29_F	73_V	0.968	0.15
24_F	76_P	0.968	0.15
235_F	312_Y	0.968	0.15
301_M	328_L	0.966	0.15
182_W	227_G	0.963	0.15
111_A	321_L	0.962	0.15
105_Q	153_A	0.961	0.15
101_I	119_T	0.958	0.15
39_N	236_Y	0.952	0.15
219_L	223_A	0.951	0.15
18_A	37_T	0.947	0.15
168_F	320_V	0.937	0.15
14_L	243_M	0.933	0.15
203_I	332_M	0.931	0.15
105_Q	313_S	0.929	0.15
162_A	243_M	0.928	0.15
18_A	39_N	0.922	0.14
47_G	71_I	0.921	0.14
53_S	242_P	0.919	0.14
104_G	130_Q	0.918	0.14
164_N	201_A	0.918	0.14
153_A	157_D	0.914	0.14
45_P	180_H	0.914	0.14
231_S	303_S	0.913	0.14
302_T	325_P	0.912	0.14
82_E	250_P	0.906	0.14
193_V	197_G	0.903	0.14
286_E	292_T	0.899	0.14
168_F	181_S	0.898	0.14
172_R	309_N	0.896	0.14
276_F	312_Y	0.883	0.14
108_H	139_Y	0.883	0.14
191_E	282_L	0.880	0.14
189_I	298_P	0.879	0.14
20_M	27_G	0.878	0.14
80_L	336_S	0.877	0.14
193_V	203_I	0.876	0.14
118_I	226_R	0.873	0.14
56_G	71_I	0.872	0.14
234_A	328_L	0.869	0.14
145_M	203_I	0.864	0.14
35_N	57_Q	0.862	0.13
131_I	207_I	0.857	0.13
74_E	338_K	0.855	0.13
238_E	273_A	0.845	0.13
56_G	256_R	0.844	0.13
70_L	322_K	0.843	0.13
39_N	105_Q	0.841	0.13
145_M	157_D	0.835	0.13
78_R	318_G	0.832	0.13
218_N	257_M	0.831	0.13
57_Q	241_T	0.823	0.13
59_R	83_V	0.822	0.13
138_T	182_W	0.818	0.13
35_N	130_Q	0.817	0.13
58_A	83_V	0.814	0.13
249_V	254_Y	0.812	0.13
50_A	165_E	0.811	0.13
103_I	276_F	0.810	0.13
58_A	66_E	0.809	0.13
61_V	70_L	0.806	0.13
297_A	300_F	0.802	0.13
39_N	56_G	0.802	0.13
193_V	228_A	0.800	0.13
26_S	81_N	0.799	0.13
136_T	157_D	0.799	0.13
17_G	172_R	0.799	0.13
167_V	293_L	0.799	0.13
277_D	281_E	0.796	0.13
47_G	185_Y	0.795	0.12
115_A	243_M	0.794	0.12
106_L	138_T	0.793	0.12
131_I	191_E	0.792	0.12
24_F	130_Q	0.789	0.12
274_F	316_R	0.786	0.12
327_Y	331_E	0.782	0.12
164_N	297_A	0.778	0.12
72_R	255_R	0.778	0.12
101_I	118_I	0.775	0.12
37_T	236_Y	0.774	0.12
37_T	313_S	0.772	0.12
230_I	234_A	0.765	0.12
198_K	336_S	0.764	0.12
38_I	105_Q	0.764	0.12
119_T	319_R	0.762	0.12
88_Y	244_E	0.762	0.12
272_N	338_K	0.759	0.12
219_L	267_D	0.757	0.12
272_N	331_E	0.755	0.12
104_G	203_I	0.753	0.12
168_F	172_R	0.753	0.12
183_K	276_F	0.750	0.12
143_H	287_I	0.750	0.12
33_A	218_N	0.749	0.12
82_E	273_A	0.745	0.12
113_P	271_I	0.745	0.12
17_G	104_G	0.743	0.12
205_L	220_M	0.742	0.12
256_R	280_G	0.741	0.12
181_S	282_L	0.739	0.12
229_K	266_N	0.738	0.12
215_D	279_K	0.737	0.12
27_G	56_G	0.732	0.12
263_L	318_G	0.728	0.12
63_N	201_A	0.727	0.12
235_F	256_R	0.725	0.11
225_S	247_K	0.725	0.11
13_R	118_I	0.724	0.11
132_S	197_G	0.720	0.11
118_I	132_S	0.720	0.11
50_A	174_K	0.719	0.11
223_A	228_A	0.715	0.11
228_A	243_M	0.714	0.11
46_D	219_L	0.712	0.11
206_I	240_G	0.710	0.11
195_V	203_I	0.710	0.11
122_I	128_E	0.706	0.11
106_L	228_A	0.705	0.11
201_A	328_L	0.703	0.11
58_A	135_V	0.702	0.11
183_K	242_P	0.700	0.11
167_V	298_P	0.697	0.11
32_G	98_L	0.693	0.11
57_Q	313_S	0.691	0.11
18_A	104_G	0.690	0.11
37_T	322_K	0.690	0.11
11_W	77_L	0.689	0.11
247_K	334_L	0.687	0.11
245_K	279_K	0.687	0.11
41_L	50_A	0.686	0.11
172_R	326_W	0.686	0.11
44_Y	243_M	0.686	0.11
17_G	313_S	0.684	0.11
113_P	227_G	0.683	0.11
18_A	136_T	0.682	0.11
13_R	157_D	0.679	0.11
163_A	301_M	0.676	0.11
212_S	226_R	0.674	0.11
236_Y	313_S	0.674	0.11
297_A	332_M	0.674	0.11
202_G	213_E	0.673	0.11
235_F	300_F	0.671	0.11
68_K	114_D	0.668	0.11
217_V	271_I	0.666	0.11
21_V	135_V	0.666	0.11
63_N	74_E	0.664	0.11
50_A	185_Y	0.663	0.11
225_S	271_I	0.662	0.11
167_V	334_L	0.662	0.11
256_R	300_F	0.660	0.11
70_L	231_S	0.653	0.11
262_W	300_F	0.652	0.11
153_A	213_E	0.651	0.11
183_K	222_Y	0.649	0.11
96_Y	160_I	0.647	0.10
183_K	186_L	0.644	0.10
145_M	149_R	0.636	0.10
116_I	121_R	0.635	0.10
98_L	140_T	0.635	0.10
85_K	88_Y	0.631	0.10
153_A	180_H	0.628	0.10
33_A	315_E	0.624	0.10
117_E	287_I	0.621	0.10
41_L	108_H	0.618	0.10
165_E	169_E	0.617	0.10
260_A	324_V	0.617	0.10
285_V	301_M	0.616	0.10
116_I	151_A	0.616	0.10
274_F	283_I	0.616	0.10
97_G	318_G	0.613	0.10
18_A	236_Y	0.612	0.10
56_G	243_M	0.612	0.10
192_A	261_R	0.611	0.10
119_T	156_I	0.603	0.10
156_I	209_L	0.597	0.10
103_I	280_G	0.597	0.10
166_K	294_N	0.596	0.10
50_A	158_V	0.596	0.10
264_I	288_P	0.595	0.10
57_Q	325_P	0.594	0.10
217_V	270_D	0.593	0.10
57_Q	107_A	0.591	0.10
297_A	326_W	0.591	0.10
168_F	191_E	0.589	0.10
264_I	290_D	0.589	0.10
158_V	201_A	0.587	0.10
73_V	225_S	0.586	0.10
70_L	234_A	0.586	0.10
122_I	200_N	0.586	0.10
206_I	315_E	0.585	0.10
269_V	282_L	0.583	0.10
137_A	241_T	0.582	0.10
58_A	273_A	0.579	0.10
71_I	105_Q	0.577	0.10
185_Y	203_I	0.576	0.10
73_V	235_F	0.573	0.10
201_A	205_L	0.573	0.10
83_V	163_A	0.572	0.10
12_V	78_R	0.569	0.10
107_A	241_T	0.568	0.10
157_D	323_N	0.568	0.10
77_L	222_Y	0.567	0.10
180_H	238_E	0.567	0.10
104_G	238_E	0.564	0.09
37_T	241_T	0.561	0.09
105_Q	145_M	0.560	0.09
39_N	54_Y	0.559	0.09
263_L	302_T	0.559	0.09
39_N	57_Q	0.559	0.09
149_R	227_G	0.558	0.09
19_D	189_I	0.557	0.09
271_I	283_I	0.555	0.09
60_E	234_A	0.554	0.09
205_L	227_G	0.554	0.09
141_F	288_P	0.553	0.09
159_A	197_G	0.553	0.09
185_Y	265_E	0.553	0.09
309_N	325_P	0.553	0.09
185_Y	197_G	0.553	0.09
104_G	107_A	0.552	0.09
129_L	250_P	0.552	0.09
141_F	189_I	0.551	0.09
297_A	324_V	0.548	0.09
45_P	197_G	0.547	0.09
298_P	301_M	0.546	0.09
223_A	251_V	0.546	0.09
49_K	256_R	0.545	0.09
170_E	284_D	0.544	0.09
103_I	122_I	0.542	0.09
172_R	234_A	0.540	0.09
277_D	331_E	0.540	0.09
70_L	105_Q	0.540	0.09
118_I	141_F	0.539	0.09
218_N	222_Y	0.538	0.09
145_M	159_A	0.537	0.09
201_A	290_D	0.537	0.09
215_D	226_R	0.536	0.09
182_W	263_L	0.535	0.09
107_A	186_L	0.535	0.09
71_I	237_P	0.535	0.09
117_E	273_A	0.535	0.09
89_E	278_D	0.534	0.09
47_G	238_E	0.533	0.09
57_Q	231_S	0.533	0.09
151_A	271_I	0.532	0.09
68_K	262_W	0.532	0.09
220_M	257_M	0.532	0.09
159_A	203_I	0.530	0.09
163_A	248_P	0.529	0.09
20_M	200_N	0.529	0.09
58_A	267_D	0.529	0.09
194_E	284_D	0.528	0.09
219_L	251_V	0.527	0.09
169_E	216_A	0.523	0.09
137_A	185_Y	0.523	0.09
87_I	288_P	0.523	0.09
17_G	54_Y	0.523	0.09
97_G	252_H	0.521	0.09
86_R	238_E	0.520	0.09
154_D	277_D	0.520	0.09
28_V	82_E	0.519	0.09
141_F	200_N	0.518	0.09
18_A	71_I	0.518	0.09
158_V	197_G	0.516	0.09
28_V	57_Q	0.514	0.09
51_N	316_R	0.514	0.09
128_E	289_S	0.513	0.09
148_M	151_A	0.513	0.09
17_G	35_N	0.513	0.09
35_N	230_I	0.512	0.09
80_L	191_E	0.512	0.09
113_P	281_E	0.512	0.09
39_N	172_R	0.512	0.09
38_I	313_S	0.509	0.09
57_Q	139_Y	0.509	0.09
147_E	290_D	0.509	0.09
222_Y	312_Y	0.507	0.09
256_R	316_R	0.506	0.09
51_N	263_L	0.505	0.09
45_P	157_D	0.505	0.09
101_I	217_V	0.505	0.09
187_E	331_E	0.504	0.09
273_A	318_G	0.503	0.09
12_V	168_F	0.502	0.09
246_R	299_A	0.501	0.09
82_E	109_P	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1r30A	2	0.8348	99.9	0.833	Contact Map
3t7vA	1	0.8746	99.9	0.837	Contact Map
4rtbA	2	0.8917	99.9	0.84	Contact Map
3iixA	1	0.9031	99.9	0.846	Contact Map
4wcxA	1	0.9316	99.9	0.848	Contact Map
4r33A	2	0.8632	99.9	0.85	Contact Map
1tv8A	2	0.8433	99.8	0.863	Contact Map
2qgqA	1	0.7322	99.8	0.867	Contact Map
4u0oB	1	0.6895	99.8	0.868	Contact Map
1oltA	1	0.886	99.8	0.868	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0101 seconds.