Q97YT0 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97YT0 - Toluene-4-monooxygenase system protein A. carboxy end (TmoA)

UniProt:	Q97YT0	Sequences: MSREGSLGQTKGEVKQVLSNISEGLMKNYRNTVEFAARMREKGPAYKEAGEYLVAKGFWLSVRLIGALTGVSMDYLTPLDARIMSYKEFMTEWVGAQLKRLLEDYGIRLPWYWKWFELELDHWHHDFIIGLYTWRRTLNVSFRGPTPDERKWLNEKYPHWEMFFGRVWDLYIKKIIDGQIPLPLTAVHLCAVCQVPIQAPANGKYLRIYLKEYKGKMYTFDSPACLWIFEQEPERYAGRRTYTQRVLEGMIQFTEEAYKDPKRLLDEVIWNMGQTEEGEAGLDPTDGAYALLYREKDPDFFNRIKKYTEA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	310 (278)
Sequences:	191 (100)
Seq/√Len:	6.0

SULSO - Q97YT0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
221_D	225_C	5.023	0.98
52_Y	231_Q	4.245	0.95
211_K	230_E	4.068	0.94
193_C	225_C	3.897	0.93
226_L	230_E	3.748	0.91
252_Q	262_K	3.621	0.89
70_G	124_H	3.493	0.88
193_C	221_D	3.439	0.87
111_W	227_W	3.036	0.79
282_L	286_D	2.760	0.71
129_I	171_Y	2.683	0.69
112_Y	289_Y	2.670	0.69
182_L	278_G	2.658	0.68
211_K	226_L	2.641	0.68
58_F	116_F	2.635	0.68
66_G	127_F	2.577	0.66
154_N	161_E	2.554	0.65
252_Q	264_L	2.549	0.65
144_G	168_W	2.499	0.63
286_D	290_A	2.435	0.61
70_G	174_K	2.408	0.60
289_Y	293_Y	2.372	0.59
121_D	159_H	2.254	0.55
95_G	120_L	2.211	0.53
71_V	131_L	2.188	0.52
44_P	82_R	2.170	0.52
82_R	149_E	2.140	0.51
43_G	288_A	2.124	0.50
122_H	126_D	2.101	0.49
262_K	266_D	2.096	0.49
43_G	81_A	1.979	0.45
268_V	272_M	1.945	0.44
281_G	286_D	1.889	0.42
94_V	109_L	1.856	0.41
252_Q	266_D	1.818	0.40
70_G	130_G	1.812	0.39
266_D	271_N	1.767	0.38
118_L	201_A	1.758	0.38
161_E	169_D	1.736	0.37
173_K	177_D	1.718	0.36
151_K	155_E	1.703	0.36
168_W	171_Y	1.702	0.36
43_G	217_M	1.663	0.34
288_A	291_L	1.655	0.34
58_F	108_R	1.638	0.34
222_S	229_F	1.636	0.34
108_R	114_K	1.607	0.33
264_L	267_E	1.574	0.32
64_L	155_E	1.534	0.30
252_Q	263_R	1.521	0.30
214_K	218_Y	1.490	0.29
26_M	54_V	1.484	0.29
82_R	200_P	1.456	0.28
147_P	192_V	1.455	0.28
26_M	138_L	1.446	0.28
267_E	287_G	1.439	0.28
262_K	267_E	1.438	0.28
44_P	290_A	1.420	0.27
275_T	278_G	1.418	0.27
88_E	156_K	1.401	0.27
47_K	107_I	1.391	0.26
138_L	211_K	1.383	0.26
262_K	289_Y	1.377	0.26
154_N	159_H	1.365	0.26
95_G	107_I	1.342	0.25
87_K	121_D	1.334	0.25
135_R	272_M	1.324	0.24
185_T	252_Q	1.315	0.24
265_L	287_G	1.315	0.24
137_T	272_M	1.300	0.24
210_L	288_A	1.298	0.24
70_G	129_I	1.292	0.24
282_L	291_L	1.283	0.23
264_L	269_I	1.279	0.23
148_D	173_K	1.274	0.23
212_E	288_A	1.256	0.23
205_Y	208_I	1.236	0.22
26_M	36_A	1.235	0.22
154_N	165_G	1.221	0.22
44_P	214_K	1.215	0.22
24_G	27_K	1.209	0.22
24_G	28_N	1.209	0.22
25_L	28_N	1.209	0.22
185_T	247_L	1.205	0.22
51_E	55_A	1.205	0.22
39_M	155_E	1.199	0.21
262_K	293_Y	1.197	0.21
281_G	290_A	1.197	0.21
205_Y	291_L	1.195	0.21
7_L	90_M	1.186	0.21
210_L	217_M	1.180	0.21
123_W	159_H	1.178	0.21
94_V	113_W	1.173	0.21
82_R	188_H	1.170	0.21
197_I	230_E	1.159	0.20
113_W	117_E	1.156	0.20
286_D	291_L	1.154	0.20
161_E	165_G	1.153	0.20
172_I	293_Y	1.152	0.20
153_L	168_W	1.148	0.20
107_I	120_L	1.146	0.20
137_T	251_I	1.145	0.20
117_E	273_G	1.143	0.20
252_Q	267_E	1.137	0.20
192_V	212_E	1.134	0.20
114_K	117_E	1.126	0.20
251_I	272_M	1.117	0.19
96_A	103_E	1.107	0.19
287_G	291_L	1.104	0.19
97_Q	262_K	1.103	0.19
81_A	92_E	1.100	0.19
97_Q	264_L	1.097	0.19
11_K	27_K	1.097	0.19
11_K	28_N	1.097	0.19
11_K	25_L	1.097	0.19
11_K	24_G	1.097	0.19
55_A	60_L	1.096	0.19
82_R	133_T	1.095	0.19
70_G	127_F	1.092	0.19
112_Y	293_Y	1.082	0.19
130_G	243_T	1.065	0.18
39_M	168_W	1.061	0.18
185_T	264_L	1.060	0.18
247_L	269_I	1.057	0.18
185_T	271_N	1.048	0.18
62_V	119_E	1.046	0.18
148_D	151_K	1.026	0.18
197_I	211_K	1.025	0.18
64_L	291_L	1.014	0.17
154_N	160_W	1.014	0.17
119_E	225_C	1.010	0.17
264_L	271_N	1.009	0.17
39_M	173_K	1.005	0.17
275_T	284_P	1.002	0.17
186_A	243_T	0.999	0.17
121_D	163_F	0.993	0.17
10_T	28_N	0.989	0.17
10_T	24_G	0.989	0.17
10_T	27_K	0.989	0.17
10_T	25_L	0.989	0.17
26_M	206_L	0.988	0.17
122_H	159_H	0.983	0.17
45_A	212_E	0.975	0.17
103_E	293_Y	0.975	0.17
284_P	289_Y	0.975	0.17
224_A	289_Y	0.969	0.16
147_P	172_I	0.969	0.16
82_R	97_Q	0.969	0.16
45_A	159_H	0.968	0.16
54_V	201_A	0.965	0.16
239_R	273_G	0.958	0.16
129_I	168_W	0.953	0.16
6_S	24_G	0.950	0.16
6_S	27_K	0.950	0.16
6_S	28_N	0.950	0.16
6_S	25_L	0.950	0.16
192_V	226_L	0.950	0.16
23_E	46_Y	0.948	0.16
282_L	290_A	0.945	0.16
173_K	208_I	0.944	0.16
164_F	228_I	0.943	0.16
39_M	280_A	0.935	0.16
212_E	217_M	0.929	0.16
121_D	200_P	0.926	0.16
193_C	224_A	0.920	0.15
26_M	116_F	0.914	0.15
152_W	236_Y	0.914	0.15
102_L	222_S	0.904	0.15
277_E	286_D	0.904	0.15
90_M	97_Q	0.904	0.15
245_R	248_E	0.903	0.15
22_S	27_K	0.896	0.15
22_S	28_N	0.896	0.15
22_S	25_L	0.896	0.15
108_R	111_W	0.895	0.15
97_Q	293_Y	0.893	0.15
168_W	227_W	0.891	0.15
136_R	184_L	0.890	0.15
8_G	141_S	0.888	0.15
194_Q	229_F	0.883	0.15
35_F	149_E	0.883	0.15
100_R	227_W	0.881	0.15
55_A	186_A	0.881	0.15
264_L	289_Y	0.878	0.15
128_I	131_L	0.873	0.15
7_L	13_E	0.868	0.15
60_L	233_P	0.865	0.14
278_G	286_D	0.860	0.14
160_W	165_G	0.853	0.14
103_E	291_L	0.852	0.14
130_G	135_R	0.850	0.14
265_L	268_V	0.848	0.14
229_F	233_P	0.847	0.14
115_W	200_P	0.847	0.14
165_G	169_D	0.842	0.14
127_F	274_Q	0.832	0.14
146_T	287_G	0.830	0.14
81_A	213_Y	0.825	0.14
6_S	11_K	0.822	0.14
247_L	252_Q	0.822	0.14
73_M	78_P	0.817	0.14
20_N	27_K	0.816	0.14
20_N	28_N	0.816	0.14
20_N	25_L	0.816	0.14
20_N	24_G	0.816	0.14
191_A	218_Y	0.814	0.14
97_Q	263_R	0.814	0.14
26_M	240_R	0.804	0.13
60_L	229_F	0.800	0.13
111_W	183_P	0.800	0.13
135_R	182_L	0.795	0.13
62_V	268_V	0.788	0.13
159_H	162_M	0.788	0.13
243_T	246_V	0.787	0.13
54_V	118_L	0.787	0.13
187_V	249_G	0.784	0.13
162_M	294_R	0.783	0.13
290_A	293_Y	0.782	0.13
97_Q	267_E	0.779	0.13
16_Q	69_T	0.779	0.13
90_M	104_D	0.778	0.13
217_M	288_A	0.773	0.13
11_K	22_S	0.771	0.13
94_V	112_Y	0.770	0.13
154_N	169_D	0.770	0.13
44_P	288_A	0.769	0.13
59_W	193_C	0.765	0.13
135_R	284_P	0.765	0.13
22_S	190_C	0.765	0.13
135_R	278_G	0.762	0.13
39_M	218_Y	0.759	0.13
97_Q	252_Q	0.756	0.13
147_P	155_E	0.753	0.13
223_P	292_L	0.747	0.13
178_G	215_G	0.747	0.13
134_W	183_P	0.746	0.13
4_E	192_V	0.744	0.12
288_A	294_R	0.742	0.12
135_R	268_V	0.741	0.12
25_L	32_T	0.741	0.12
27_K	32_T	0.741	0.12
24_G	32_T	0.741	0.12
28_N	32_T	0.741	0.12
214_K	234_E	0.738	0.12
170_L	174_K	0.732	0.12
117_E	291_L	0.728	0.12
4_E	209_Y	0.724	0.12
6_S	10_T	0.715	0.12
26_M	146_T	0.714	0.12
105_Y	122_H	0.713	0.12
114_K	148_D	0.712	0.12
267_E	271_N	0.712	0.12
83_I	149_E	0.712	0.12
195_V	211_K	0.709	0.12
82_R	262_K	0.703	0.12
159_H	205_Y	0.702	0.12
11_K	20_N	0.698	0.12
135_R	174_K	0.694	0.12
56_K	105_Y	0.686	0.12
78_P	88_E	0.684	0.12
267_E	270_W	0.682	0.12
67_A	214_K	0.681	0.12
107_I	228_I	0.681	0.12
35_F	165_G	0.680	0.12
61_S	108_R	0.674	0.11
112_Y	227_W	0.674	0.11
55_A	74_D	0.672	0.11
224_A	227_W	0.671	0.11
6_S	26_M	0.664	0.11
63_R	243_T	0.664	0.11
138_L	197_I	0.660	0.11
11_K	32_T	0.657	0.11
10_T	22_S	0.648	0.11
116_F	247_L	0.646	0.11
142_F	180_I	0.645	0.11
263_R	289_Y	0.643	0.11
118_L	286_D	0.643	0.11
15_K	167_V	0.643	0.11
113_W	227_W	0.643	0.11
202_N	206_L	0.640	0.11
151_K	205_Y	0.638	0.11
72_S	126_D	0.637	0.11
82_R	293_Y	0.637	0.11
43_G	63_R	0.633	0.11
63_R	66_G	0.632	0.11
87_K	227_W	0.629	0.11
129_I	195_V	0.629	0.11
133_T	138_L	0.625	0.11
109_L	208_I	0.625	0.11
267_E	280_A	0.624	0.11
103_E	284_P	0.624	0.11
43_G	264_L	0.624	0.11
113_W	134_W	0.624	0.11
60_L	194_Q	0.623	0.11
146_T	168_W	0.623	0.11
70_G	285_T	0.622	0.11
263_R	266_D	0.621	0.11
97_Q	170_L	0.619	0.11
138_L	269_I	0.619	0.11
112_Y	220_F	0.618	0.11
36_A	96_A	0.618	0.11
240_R	248_E	0.617	0.11
52_Y	112_Y	0.616	0.11
7_L	182_L	0.614	0.11
123_W	133_T	0.613	0.11
26_M	151_K	0.613	0.11
172_I	181_P	0.612	0.11
135_R	146_T	0.612	0.11
74_D	153_L	0.611	0.11
191_A	239_R	0.611	0.11
203_G	285_T	0.610	0.11
35_F	44_P	0.608	0.11
284_P	287_G	0.607	0.11
166_R	234_E	0.606	0.10
91_T	234_E	0.605	0.10
48_E	232_E	0.603	0.10
41_E	91_T	0.600	0.10
60_L	74_D	0.599	0.10
119_E	221_D	0.598	0.10
104_D	183_P	0.598	0.10
190_C	225_C	0.598	0.10
130_G	136_R	0.596	0.10
218_Y	229_F	0.594	0.10
74_D	88_E	0.594	0.10
92_E	227_W	0.593	0.10
44_P	188_H	0.592	0.10
151_K	291_L	0.591	0.10
97_Q	289_Y	0.586	0.10
192_V	220_F	0.586	0.10
15_K	33_V	0.585	0.10
137_T	249_G	0.584	0.10
104_D	128_I	0.583	0.10
130_G	137_T	0.583	0.10
15_K	31_N	0.582	0.10
10_T	20_N	0.578	0.10
132_Y	277_E	0.578	0.10
266_D	289_Y	0.577	0.10
217_M	226_L	0.577	0.10
238_G	290_A	0.572	0.10
200_P	284_P	0.572	0.10
131_L	271_N	0.571	0.10
58_F	293_Y	0.570	0.10
218_Y	238_G	0.568	0.10
100_R	278_G	0.568	0.10
97_Q	278_G	0.567	0.10
108_R	227_W	0.566	0.10
31_N	101_L	0.565	0.10
58_F	112_Y	0.565	0.10
130_G	175_I	0.565	0.10
58_F	111_W	0.564	0.10
151_K	165_G	0.562	0.10
171_Y	227_W	0.560	0.10
91_T	95_G	0.560	0.10
82_R	290_A	0.558	0.10
57_G	263_R	0.558	0.10
66_G	273_G	0.557	0.10
41_E	234_E	0.557	0.10
10_T	32_T	0.553	0.10
117_E	127_F	0.550	0.10
40_R	107_I	0.549	0.10
281_G	293_Y	0.548	0.10
58_F	224_A	0.548	0.10
102_L	236_Y	0.548	0.10
281_G	288_A	0.547	0.10
201_A	204_K	0.545	0.10
44_P	210_L	0.544	0.10
46_Y	49_A	0.544	0.10
140_V	145_P	0.544	0.10
6_S	22_S	0.541	0.10
210_L	263_R	0.541	0.10
37_A	193_C	0.540	0.10
6_S	20_N	0.539	0.10
151_K	280_A	0.538	0.10
129_I	144_G	0.538	0.10
92_E	171_Y	0.537	0.10
194_Q	242_Y	0.537	0.10
86_Y	140_V	0.536	0.10
209_Y	223_P	0.536	0.10
159_H	176_I	0.535	0.10
246_V	268_V	0.534	0.10
262_K	271_N	0.534	0.10
267_E	291_L	0.534	0.10
244_Q	268_V	0.526	0.09
116_F	149_E	0.525	0.09
70_G	146_T	0.525	0.09
31_N	37_A	0.524	0.09
195_V	208_I	0.524	0.09
104_D	112_Y	0.521	0.09
227_W	273_G	0.520	0.09
136_R	185_T	0.517	0.09
104_D	111_W	0.515	0.09
85_S	220_F	0.514	0.09
73_M	149_E	0.514	0.09
15_K	112_Y	0.513	0.09
113_W	173_K	0.513	0.09
198_Q	221_D	0.512	0.09
73_M	185_T	0.512	0.09
182_L	277_E	0.512	0.09
269_I	276_E	0.512	0.09
130_G	247_L	0.511	0.09
6_S	32_T	0.511	0.09
144_G	281_G	0.510	0.09
124_H	174_K	0.508	0.09
175_I	290_A	0.507	0.09
57_G	95_G	0.507	0.09
26_M	275_T	0.507	0.09
58_F	281_G	0.506	0.09
185_T	262_K	0.505	0.09
112_Y	224_A	0.505	0.09
70_G	197_I	0.504	0.09
148_D	163_F	0.504	0.09
159_H	277_E	0.503	0.09
93_W	160_W	0.503	0.09
263_R	267_E	0.503	0.09
113_W	116_F	0.502	0.09
35_F	270_W	0.502	0.09
18_L	98_L	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3u52A	2	0.9032	100	0.353	Contact Map
3ge3A	2	0.9032	100	0.359	Contact Map
2incA	2	0.9032	100	0.359	Contact Map
1mtyD	2	0.9484	100	0.419	Contact Map
1mtyB	2	0.3806	100	0.795	Contact Map
1mhyB	2	0.3806	100	0.796	Contact Map
2incB	2	0.2968	99.9	0.823	Contact Map
3u52C	2	0.3161	99.9	0.837	Contact Map
3ge3B	2	0.2323	99.9	0.84	Contact Map
4mudA	2	0.3355	99.8	0.856	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0098 seconds.