Q97YP9 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97YP9 - Oligo/dipeptide transport, permease protein (DppC-1)

UniProt:	Q97YP9	Sequences: MSKRNVGFSSYIRDFLSSKIGLVGLIILIILLIFTGIALSIPAKVYVSWNNPAAWNQYPEHVPPAWLSIFYPGKYFTTEELSPINMSLYSPAKNIFVAIITYQFNWSKVLPAYNVYFITSSNVTPIEEVIYWSKPDGYTLQVNVPAGVFNVPFDLTSIRGDILSYISSITGKTPNIVNSTVLSSALFNSPKSNFTVIEQGKYVVKIEIVSSLPMNITKSRLILLGNSYGLMGTDYFGRPLDLGILLGLPNALEIGVLTSLVAVLVGVFVGGISGYLGGNKDSIIQWVTLVFLALPALPFLVAVSFVAEPNIVIEALLIAFLSWPFYAIIARSMALSIKSNSYVEADKLLGIPSYRVFFTHFMPRLIPITVAYMVLGVPAGILLAQTLAFLGIAPANIVTWGGILDAAETYQAQVNGWWWWVVFPGAMVVIVAIPFVLIGFAIERVTLGER	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	450 (437)
Sequences:	308 (269)
Seq/√Len:	12.9

ECOLI - YEJE
HALSA - Q9HMW2 Q9HMX1
SULSO - Q97YP9 Q97YP2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
440_F	447_L	4.277	1.00
337_I	342_Y	3.707	0.99
234_D	238_R	3.675	0.99
269_V	284_I	3.459	0.99
12_I	16_L	3.372	0.98
225_G	229_G	3.096	0.97
384_A	393_A	2.962	0.96
247_G	266_G	2.621	0.93
436_V	443_E	2.617	0.93
371_A	436_V	2.602	0.92
270_G	360_H	2.536	0.91
428_V	435_F	2.504	0.91
286_W	289_L	2.490	0.90
266_G	270_G	2.449	0.90
17_S	279_N	2.394	0.89
49_W	55_W	2.354	0.88
425_G	428_V	2.324	0.87
351_I	447_L	2.311	0.87
275_Y	323_W	2.230	0.85
384_A	391_G	2.223	0.84
322_S	385_Q	2.212	0.84
378_P	435_F	2.190	0.84
287_V	291_F	2.164	0.83
384_A	439_G	2.115	0.81
11_Y	446_T	2.114	0.81
343_V	361_F	2.066	0.80
351_I	355_R	2.051	0.79
28_L	254_I	2.006	0.78
333_M	368_I	2.006	0.78
443_E	447_L	2.002	0.77
28_L	318_I	1.997	0.77
384_A	388_A	1.984	0.77
323_W	390_L	1.976	0.76
281_D	331_R	1.974	0.76
239_P	286_W	1.965	0.76
332_S	371_A	1.955	0.76
337_I	361_F	1.946	0.75
21_G	441_A	1.943	0.75
286_W	385_Q	1.925	0.75
326_Y	389_F	1.923	0.74
390_L	424_P	1.917	0.74
125_P	147_G	1.902	0.74
332_S	374_V	1.894	0.73
324_P	342_Y	1.890	0.73
281_D	439_G	1.880	0.73
284_I	327_A	1.869	0.72
331_R	393_A	1.850	0.71
281_D	384_A	1.842	0.71
420_W	424_P	1.825	0.70
254_I	270_G	1.817	0.70
274_G	323_W	1.805	0.70
371_A	374_V	1.804	0.69
229_G	378_P	1.803	0.69
364_R	440_F	1.801	0.69
286_W	363_P	1.778	0.68
374_V	396_N	1.771	0.68
346_D	356_V	1.770	0.68
261_V	316_L	1.755	0.67
322_S	383_L	1.745	0.67
399_T	445_V	1.742	0.67
405_D	417_W	1.725	0.66
335_L	371_A	1.713	0.65
332_S	398_V	1.696	0.64
28_L	35_T	1.696	0.64
338_K	363_P	1.673	0.63
374_V	447_L	1.650	0.62
334_A	342_Y	1.643	0.62
245_L	294_L	1.623	0.61
259_S	447_L	1.603	0.60
334_A	371_A	1.594	0.59
342_Y	361_F	1.590	0.59
231_M	423_F	1.584	0.59
18_S	445_V	1.561	0.58
367_P	423_F	1.555	0.58
59_P	225_G	1.547	0.57
335_L	384_A	1.546	0.57
374_V	378_P	1.545	0.57
432_A	443_E	1.543	0.57
108_K	113_Y	1.541	0.57
345_A	363_P	1.521	0.56
81_L	260_L	1.520	0.56
337_I	368_I	1.517	0.56
441_A	445_V	1.507	0.55
418_W	425_G	1.505	0.55
345_A	387_L	1.502	0.55
341_S	396_N	1.501	0.55
374_V	440_F	1.500	0.55
233_T	247_G	1.500	0.55
384_A	399_T	1.495	0.54
393_A	440_F	1.493	0.54
299_F	382_L	1.484	0.54
21_G	446_T	1.480	0.54
352_P	356_V	1.479	0.54
363_P	401_G	1.477	0.54
285_Q	328_I	1.475	0.53
298_P	418_W	1.461	0.53
246_L	381_I	1.459	0.53
247_G	331_R	1.450	0.52
352_P	449_E	1.410	0.50
108_K	112_A	1.410	0.50
401_G	424_P	1.404	0.50
263_V	273_S	1.401	0.50
38_A	246_L	1.400	0.50
295_P	350_G	1.395	0.49
396_N	447_L	1.392	0.49
257_L	370_V	1.379	0.48
231_M	427_M	1.379	0.48
274_G	445_V	1.372	0.48
355_R	358_F	1.368	0.48
329_I	428_V	1.366	0.48
330_A	436_V	1.365	0.48
255_G	311_I	1.363	0.48
256_V	283_I	1.363	0.48
325_F	384_A	1.359	0.47
261_V	272_I	1.350	0.47
156_T	168_S	1.348	0.47
299_F	446_T	1.348	0.47
356_V	361_F	1.347	0.47
86_M	89_Y	1.341	0.46
14_D	21_G	1.341	0.46
24_G	437_L	1.340	0.46
270_G	389_F	1.339	0.46
374_V	388_A	1.338	0.46
14_D	446_T	1.335	0.46
177_V	283_I	1.334	0.46
85_N	88_L	1.322	0.45
36_G	161_D	1.312	0.45
271_G	373_M	1.310	0.45
277_G	439_G	1.303	0.44
266_G	326_Y	1.303	0.44
21_G	368_I	1.288	0.44
393_A	447_L	1.285	0.44
299_F	321_L	1.280	0.43
336_S	371_A	1.278	0.43
64_P	229_G	1.275	0.43
232_G	237_G	1.267	0.43
322_S	325_F	1.267	0.43
260_L	280_K	1.267	0.43
425_G	435_F	1.262	0.42
298_P	365_L	1.261	0.42
318_I	449_E	1.257	0.42
363_P	424_P	1.256	0.42
182_L	188_N	1.254	0.42
19_K	117_F	1.250	0.42
335_L	393_A	1.243	0.41
232_G	350_G	1.243	0.41
256_V	343_V	1.239	0.41
393_A	439_G	1.238	0.41
327_A	361_F	1.238	0.41
240_L	252_L	1.230	0.41
66_W	229_G	1.219	0.40
254_I	332_S	1.209	0.40
161_D	165_Y	1.207	0.40
387_L	400_W	1.207	0.40
286_W	447_L	1.204	0.39
375_L	378_P	1.203	0.39
377_V	423_F	1.201	0.39
13_R	16_L	1.200	0.39
273_S	329_I	1.199	0.39
297_L	399_T	1.197	0.39
373_M	432_A	1.195	0.39
244_I	399_T	1.188	0.39
267_V	422_V	1.173	0.38
244_I	423_F	1.171	0.38
442_I	448_G	1.170	0.38
150_N	430_I	1.169	0.38
273_S	289_L	1.169	0.38
275_Y	363_P	1.156	0.37
390_L	401_G	1.152	0.37
346_D	442_I	1.143	0.36
393_A	402_G	1.137	0.36
273_S	362_M	1.135	0.36
339_S	343_V	1.134	0.36
292_L	324_P	1.127	0.36
377_V	418_W	1.127	0.36
35_T	249_P	1.126	0.36
88_L	96_F	1.126	0.36
289_L	292_L	1.125	0.36
42_P	431_V	1.123	0.36
261_V	348_L	1.123	0.36
390_L	441_A	1.120	0.35
269_V	283_I	1.114	0.35
439_G	443_E	1.107	0.35
274_G	390_L	1.106	0.35
38_A	249_P	1.103	0.35
251_A	293_A	1.097	0.34
371_A	432_A	1.096	0.34
276_L	407_A	1.094	0.34
400_W	427_M	1.092	0.34
16_L	20_I	1.092	0.34
298_P	367_P	1.089	0.34
337_I	435_F	1.085	0.34
297_L	420_W	1.085	0.34
225_G	298_P	1.083	0.34
124_T	130_I	1.083	0.34
370_V	445_V	1.083	0.34
274_G	290_V	1.082	0.34
421_V	445_V	1.079	0.33
396_N	402_G	1.074	0.33
364_R	399_T	1.074	0.33
407_A	420_W	1.073	0.33
303_V	325_F	1.070	0.33
308_E	343_V	1.069	0.33
185_A	189_S	1.069	0.33
299_F	428_V	1.069	0.33
266_G	389_F	1.068	0.33
285_Q	332_S	1.068	0.33
273_S	285_Q	1.067	0.33
289_L	425_G	1.066	0.33
13_R	27_I	1.065	0.33
249_P	389_F	1.063	0.33
136_D	140_L	1.063	0.33
302_A	408_E	1.061	0.33
298_P	400_W	1.061	0.33
173_T	188_N	1.060	0.33
306_V	438_I	1.059	0.33
259_S	272_I	1.049	0.32
364_R	369_T	1.048	0.32
160_G	185_A	1.048	0.32
49_W	333_M	1.047	0.32
350_G	360_H	1.046	0.32
179_S	183_S	1.045	0.32
231_M	237_G	1.042	0.32
371_A	443_E	1.034	0.31
402_G	406_A	1.034	0.31
378_P	424_P	1.033	0.31
271_G	341_S	1.030	0.31
255_G	380_G	1.028	0.31
335_L	359_T	1.028	0.31
432_A	436_V	1.027	0.31
128_E	280_K	1.020	0.31
198_E	230_L	1.019	0.31
324_P	382_L	1.018	0.31
311_I	366_I	1.016	0.31
29_I	215_N	1.013	0.30
375_L	432_A	1.010	0.30
254_I	371_A	1.003	0.30
318_I	346_D	0.999	0.30
29_I	426_A	0.996	0.30
345_A	439_G	0.994	0.30
118_I	121_S	0.990	0.29
211_S	214_M	0.990	0.29
81_L	167_S	0.984	0.29
368_I	419_W	0.983	0.29
83_P	89_Y	0.982	0.29
40_S	422_V	0.977	0.29
314_E	357_F	0.975	0.29
206_I	215_N	0.975	0.29
302_A	349_L	0.974	0.29
436_V	440_F	0.972	0.29
277_G	345_A	0.967	0.28
327_A	385_Q	0.964	0.28
347_K	356_V	0.963	0.28
276_L	353_S	0.962	0.28
264_L	268_F	0.961	0.28
314_E	424_P	0.960	0.28
286_W	443_E	0.960	0.28
363_P	390_L	0.956	0.28
81_L	256_V	0.956	0.28
318_I	376_G	0.954	0.28
64_P	420_W	0.951	0.28
45_V	56_N	0.951	0.28
299_F	342_Y	0.950	0.28
440_F	443_E	0.948	0.28
271_G	334_A	0.948	0.28
371_A	418_W	0.947	0.28
207_E	210_S	0.945	0.28
18_S	446_T	0.945	0.28
175_N	190_P	0.939	0.27
225_G	378_P	0.933	0.27
307_A	351_I	0.933	0.27
337_I	340_N	0.933	0.27
101_T	147_G	0.931	0.27
325_F	386_T	0.931	0.27
178_N	187_F	0.928	0.27
11_Y	14_D	0.926	0.27
31_L	427_M	0.924	0.27
137_G	203_V	0.923	0.27
183_S	210_S	0.922	0.27
180_T	184_S	0.922	0.27
243_G	402_G	0.919	0.26
380_G	449_E	0.919	0.26
255_G	337_I	0.912	0.26
238_R	419_W	0.910	0.26
277_G	363_P	0.910	0.26
403_I	432_A	0.909	0.26
243_G	436_V	0.909	0.26
302_A	431_V	0.907	0.26
302_A	311_I	0.905	0.26
329_I	383_L	0.901	0.26
333_M	337_I	0.899	0.26
335_L	385_Q	0.898	0.26
391_G	439_G	0.896	0.26
233_T	266_G	0.895	0.26
237_G	419_W	0.894	0.25
385_Q	437_L	0.893	0.25
176_I	186_L	0.892	0.25
290_V	353_S	0.891	0.25
265_V	268_F	0.890	0.25
286_W	290_V	0.889	0.25
12_I	397_I	0.886	0.25
158_I	175_N	0.885	0.25
351_I	440_F	0.884	0.25
334_A	432_A	0.880	0.25
303_V	433_I	0.879	0.25
254_I	359_T	0.879	0.25
102_Y	106_W	0.877	0.25
271_G	371_A	0.877	0.25
249_P	446_T	0.875	0.25
15_F	19_K	0.874	0.25
317_L	321_L	0.874	0.25
345_A	401_G	0.874	0.25
124_T	137_G	0.869	0.25
293_A	343_V	0.866	0.24
272_I	290_V	0.865	0.24
274_G	338_K	0.865	0.24
74_K	78_T	0.863	0.24
304_S	403_I	0.862	0.24
407_A	424_P	0.859	0.24
355_R	390_L	0.859	0.24
330_A	445_V	0.857	0.24
244_I	281_D	0.857	0.24
108_K	114_N	0.855	0.24
336_S	432_A	0.854	0.24
107_S	261_V	0.853	0.24
200_G	204_V	0.853	0.24
338_K	351_I	0.853	0.24
321_L	324_P	0.852	0.24
251_A	445_V	0.852	0.24
242_L	305_F	0.851	0.24
305_F	393_A	0.849	0.24
341_S	344_E	0.849	0.24
337_I	378_P	0.849	0.24
364_R	384_A	0.849	0.24
29_I	209_V	0.846	0.24
285_Q	335_L	0.842	0.23
334_A	367_P	0.841	0.23
255_G	318_I	0.840	0.23
284_I	335_L	0.839	0.23
331_R	439_G	0.838	0.23
252_L	392_I	0.837	0.23
298_P	317_L	0.836	0.23
370_V	446_T	0.835	0.23
94_N	158_I	0.834	0.23
241_D	276_L	0.833	0.23
101_T	138_Y	0.832	0.23
334_A	365_L	0.831	0.23
55_W	66_W	0.831	0.23
371_A	399_T	0.830	0.23
393_A	448_G	0.830	0.23
237_G	436_V	0.829	0.23
200_G	206_I	0.825	0.23
329_I	425_G	0.823	0.23
115_V	178_N	0.822	0.23
388_A	436_V	0.822	0.23
19_K	22_L	0.821	0.23
432_A	447_L	0.821	0.23
338_K	424_P	0.819	0.23
269_V	278_G	0.818	0.23
30_I	176_I	0.818	0.23
256_V	404_L	0.815	0.23
315_A	329_I	0.810	0.22
248_L	259_S	0.809	0.22
87_S	90_S	0.808	0.22
86_M	353_S	0.807	0.22
132_W	270_G	0.804	0.22
20_I	396_N	0.804	0.22
387_L	390_L	0.804	0.22
176_I	209_V	0.803	0.22
144_V	149_F	0.803	0.22
76_F	261_V	0.800	0.22
232_G	295_P	0.799	0.22
301_V	435_F	0.798	0.22
290_V	331_R	0.797	0.22
315_A	321_L	0.795	0.22
369_T	433_I	0.793	0.22
15_F	386_T	0.788	0.22
381_I	417_W	0.785	0.21
93_K	98_A	0.785	0.21
232_G	360_H	0.785	0.21
364_R	448_G	0.785	0.21
105_N	145_P	0.783	0.21
21_G	447_L	0.779	0.21
21_G	380_G	0.776	0.21
95_I	176_I	0.775	0.21
229_G	432_A	0.773	0.21
323_W	371_A	0.770	0.21
371_A	393_A	0.769	0.21
161_D	168_S	0.769	0.21
16_L	22_L	0.767	0.21
244_I	388_A	0.765	0.21
229_G	243_G	0.764	0.21
270_G	295_P	0.764	0.21
382_L	432_A	0.763	0.21
110_L	113_Y	0.761	0.21
348_L	421_V	0.759	0.21
250_N	315_A	0.759	0.21
259_S	378_P	0.759	0.21
273_S	414_V	0.758	0.20
243_G	396_N	0.756	0.20
299_F	322_S	0.756	0.20
44_K	414_V	0.755	0.20
289_L	436_V	0.754	0.20
186_L	189_S	0.753	0.20
202_Y	208_I	0.750	0.20
102_Y	105_N	0.749	0.20
21_G	28_L	0.747	0.20
182_L	186_L	0.747	0.20
66_W	225_G	0.746	0.20
285_Q	293_A	0.745	0.20
289_L	363_P	0.744	0.20
64_P	135_P	0.743	0.20
151_V	160_G	0.742	0.20
292_L	337_I	0.742	0.20
280_K	430_I	0.740	0.20
231_M	360_H	0.737	0.20
105_N	111_P	0.734	0.20
133_S	147_G	0.733	0.20
370_V	374_V	0.733	0.20
199_Q	202_Y	0.730	0.20
323_W	327_A	0.728	0.20
246_L	431_V	0.728	0.20
122_N	359_T	0.728	0.20
289_L	443_E	0.726	0.19
135_P	229_G	0.726	0.19
102_Y	113_Y	0.725	0.19
310_N	338_K	0.725	0.19
393_A	400_W	0.724	0.19
281_D	393_A	0.724	0.19
255_G	367_P	0.722	0.19
261_V	389_F	0.720	0.19
320_F	409_T	0.718	0.19
378_P	432_A	0.715	0.19
368_I	425_G	0.714	0.19
106_W	111_P	0.712	0.19
262_A	380_G	0.712	0.19
176_I	192_S	0.710	0.19
296_A	300_L	0.709	0.19
265_V	385_Q	0.708	0.19
160_G	317_L	0.707	0.19
241_D	439_G	0.704	0.19
33_I	136_D	0.703	0.19
341_S	443_E	0.702	0.19
105_N	108_K	0.702	0.19
274_G	381_I	0.701	0.19
125_P	129_V	0.700	0.19
112_A	202_Y	0.700	0.19
29_I	283_I	0.699	0.19
124_T	127_E	0.699	0.19
298_P	321_L	0.698	0.19
240_L	392_I	0.698	0.19
18_S	341_S	0.698	0.19
247_G	286_W	0.697	0.19
198_E	202_Y	0.696	0.18
52_P	249_P	0.695	0.18
254_I	380_G	0.692	0.18
254_I	267_V	0.692	0.18
11_Y	341_S	0.692	0.18
103_Q	106_W	0.692	0.18
348_L	372_Y	0.690	0.18
297_L	379_A	0.689	0.18
229_G	234_D	0.687	0.18
327_A	417_W	0.682	0.18
365_L	374_V	0.682	0.18
171_G	174_P	0.680	0.18
259_S	266_G	0.679	0.18
225_G	432_A	0.677	0.18
229_G	425_G	0.676	0.18
392_I	435_F	0.673	0.18
122_N	154_D	0.673	0.18
243_G	416_G	0.672	0.18
371_A	440_F	0.672	0.18
70_F	228_Y	0.671	0.18
251_A	256_V	0.669	0.18
381_I	392_I	0.666	0.18
335_L	418_W	0.666	0.18
21_G	329_I	0.665	0.18
274_G	363_P	0.665	0.18
282_S	364_R	0.664	0.17
225_G	399_T	0.663	0.17
238_R	289_L	0.663	0.17
30_I	69_I	0.662	0.17
305_F	437_L	0.662	0.17
435_F	441_A	0.659	0.17
15_F	360_H	0.659	0.17
436_V	444_R	0.658	0.17
130_I	142_V	0.658	0.17
151_V	211_S	0.656	0.17
328_I	400_W	0.655	0.17
299_F	336_S	0.654	0.17
329_I	338_K	0.653	0.17
374_V	443_E	0.652	0.17
158_I	268_F	0.652	0.17
336_S	403_I	0.650	0.17
319_A	340_N	0.650	0.17
402_G	428_V	0.647	0.17
254_I	318_I	0.646	0.17
371_A	425_G	0.645	0.17
275_Y	401_G	0.644	0.17
28_L	216_I	0.643	0.17
37_I	40_S	0.643	0.17
275_Y	338_K	0.643	0.17
346_D	448_G	0.643	0.17
286_W	335_L	0.643	0.17
244_I	346_D	0.642	0.17
281_D	448_G	0.642	0.17
321_L	400_W	0.642	0.17
340_N	442_I	0.642	0.17
367_P	374_V	0.641	0.17
62_V	66_W	0.640	0.17
16_L	334_A	0.638	0.17
293_A	296_A	0.637	0.17
81_L	263_V	0.636	0.17
243_G	403_I	0.633	0.17
11_Y	394_P	0.631	0.17
348_L	440_F	0.630	0.16
371_A	447_L	0.630	0.16
364_R	383_L	0.627	0.16
321_L	333_M	0.627	0.16
364_R	436_V	0.626	0.16
418_W	423_F	0.626	0.16
257_L	322_S	0.624	0.16
250_N	299_F	0.623	0.16
386_T	390_L	0.620	0.16
330_A	364_R	0.620	0.16
335_L	432_A	0.618	0.16
119_T	294_L	0.617	0.16
323_W	381_I	0.617	0.16
330_A	370_V	0.615	0.16
270_G	275_Y	0.614	0.16
200_G	208_I	0.614	0.16
344_E	407_A	0.613	0.16
329_I	385_Q	0.612	0.16
66_W	135_P	0.612	0.16
24_G	57_Q	0.610	0.16
17_S	421_V	0.609	0.16
401_G	441_A	0.607	0.16
259_S	440_F	0.607	0.16
225_G	234_D	0.606	0.16
316_L	346_D	0.604	0.16
244_I	286_W	0.603	0.16
341_S	380_G	0.602	0.16
163_L	185_A	0.602	0.16
344_E	420_W	0.599	0.16
380_G	394_P	0.598	0.16
231_M	317_L	0.598	0.16
160_G	167_S	0.595	0.16
285_Q	327_A	0.595	0.16
391_G	448_G	0.594	0.15
23_V	172_K	0.593	0.15
343_V	347_K	0.593	0.15
338_K	402_G	0.592	0.15
118_I	128_E	0.592	0.15
370_V	377_V	0.591	0.15
268_F	358_F	0.590	0.15
277_G	443_E	0.589	0.15
158_I	184_S	0.587	0.15
117_F	130_I	0.587	0.15
300_L	420_W	0.586	0.15
418_W	441_A	0.586	0.15
266_G	279_N	0.582	0.15
286_W	388_A	0.581	0.15
344_E	367_P	0.581	0.15
239_P	242_L	0.579	0.15
260_L	437_L	0.579	0.15
109_V	112_A	0.579	0.15
256_V	441_A	0.577	0.15
289_L	293_A	0.573	0.15
293_A	373_M	0.573	0.15
249_P	294_L	0.572	0.15
107_S	111_P	0.572	0.15
292_L	326_Y	0.572	0.15
381_I	435_F	0.571	0.15
259_S	449_E	0.568	0.15
328_I	443_E	0.568	0.15
145_P	149_F	0.568	0.15
134_K	140_L	0.567	0.15
277_G	286_W	0.566	0.15
281_D	325_F	0.563	0.15
167_S	190_P	0.562	0.15
364_R	443_E	0.560	0.15
29_I	347_K	0.559	0.15
229_G	399_T	0.557	0.15
335_L	388_A	0.556	0.14
380_G	429_V	0.556	0.14
111_P	121_S	0.555	0.14
102_Y	108_K	0.552	0.14
115_V	137_G	0.551	0.14
229_G	443_E	0.549	0.14
277_G	323_W	0.548	0.14
385_Q	402_G	0.548	0.14
156_T	186_L	0.547	0.14
28_L	275_Y	0.546	0.14
368_I	447_L	0.546	0.14
27_I	63_P	0.545	0.14
99_I	182_L	0.545	0.14
243_G	371_A	0.544	0.14
334_A	425_G	0.543	0.14
219_S	223_L	0.542	0.14
133_S	150_N	0.541	0.14
340_N	369_T	0.540	0.14
64_P	399_T	0.540	0.14
321_L	385_Q	0.540	0.14
251_A	341_S	0.540	0.14
74_K	338_K	0.539	0.14
180_T	186_L	0.539	0.14
21_G	254_I	0.537	0.14
333_M	399_T	0.537	0.14
244_I	384_A	0.537	0.14
23_V	346_D	0.537	0.14
364_R	371_A	0.535	0.14
33_I	175_N	0.535	0.14
344_E	380_G	0.532	0.14
24_G	61_H	0.531	0.14
240_L	360_H	0.531	0.14
20_I	440_F	0.530	0.14
137_G	143_N	0.529	0.14
29_I	155_L	0.527	0.14
42_P	335_L	0.527	0.14
56_N	347_K	0.524	0.14
439_G	448_G	0.524	0.14
394_P	447_L	0.523	0.14
330_A	342_Y	0.523	0.14
248_L	333_M	0.522	0.14
393_A	406_A	0.521	0.14
162_I	203_V	0.520	0.14
266_G	360_H	0.520	0.14
323_W	363_P	0.520	0.14
15_F	438_I	0.519	0.14
336_S	420_W	0.519	0.14
101_T	119_T	0.519	0.14
253_E	359_T	0.519	0.14
371_A	396_N	0.518	0.14
105_N	294_L	0.517	0.14
259_S	332_S	0.517	0.14
112_A	116_Y	0.516	0.13
399_T	443_E	0.515	0.13
134_K	338_K	0.515	0.13
238_R	245_L	0.513	0.13
114_N	121_S	0.511	0.13
261_V	375_L	0.509	0.13
249_P	393_A	0.509	0.13
112_A	135_P	0.509	0.13
249_P	328_I	0.509	0.13
161_D	176_I	0.508	0.13
116_Y	123_V	0.508	0.13
278_G	288_T	0.507	0.13
248_L	286_W	0.505	0.13
156_T	159_R	0.505	0.13
318_I	383_L	0.504	0.13
288_T	335_L	0.503	0.13
247_G	389_F	0.502	0.13
293_A	395_A	0.501	0.13
367_P	447_L	0.501	0.13
345_A	441_A	0.500	0.13
278_G	430_I	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3tuiA	2	0.4511	99.9	0.789	Contact Map
4tquM	1	0.56	99.9	0.794	Contact Map
4ymuD	2	0.4622	99.9	0.81	Contact Map
3d31C	2	0.5089	99.9	0.817	Contact Map
3rlfF	1	0.8756	99.9	0.819	Contact Map
2onkC	2	0.5156	99.9	0.823	Contact Map
3rlfG	1	0.5689	99.8	0.827	Contact Map
4tquN	1	0.5822	99.8	0.842	Contact Map
2kogA	1	0.0911	11.2	0.978	Contact Map
3hd7A	1	0.0889	9.1	0.979	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0126 seconds.