Q97YP2 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97YP2 - Oligo/dipeptide transport, permease protein (DppC-2)

UniProt:	Q97YP2	Sequences: MNLMRIPPILRLKLLWVALIIFIFLLGSIAYGFFTAPKANPYTPAGQYAASPYAVPSWASIFYGNLPPDIKVPNDYDLIAAKTASVINYWHLSNFTFNGDAVIIIYNSSYGPKGETNFQKTLYSYGNTGNGSVEIIIEGTNPLNLTLYHDFLYNYLLPRETKFGDYEFYIIQASISAYATNAYYTFNGYVINPSNATFWLFLAGNYLPTNLVTLSTVFKYLGNGGWNYILASSASAGETPWFYTSNIPPNESAVASVIMLQSMFNSTGNYKVEFTINYIPNGPNSKLVVYLSDLYFEFLGSRYGVLGTDNNGASVFAEYSQGGIFDLELAILAGLAIVFIGAVFGLFAGYYGGKLDQILTSFTDFILLLPGLAILIVLITIFQQIFTVFPKDILIIIVLVILSWPPTSRTIRGQVLQVRNMAFVEAAKALGMSNMEIIRKHVLRHVFPIIIAQLIFDIPAVIGIESALDFLGIGILKFPTWGNMLGFSINASLDAPGFAWWWILTPGIALFLLGVSLFYIGEAITRYYGSLVGETH	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	536 (514)
Sequences:	110 (98)
Seq/√Len:	4.3

SULSO - Q97YP2 Q97YP9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
522_E	529_G	5.282	0.97
349_G	404_W	2.860	0.60
412_R	474_G	2.854	0.60
419_R	483_N	2.747	0.57
451_I	527_Y	2.733	0.57
448_P	505_T	2.679	0.55
6_I	10_L	2.625	0.53
340_I	343_V	2.557	0.51
135_I	149_H	2.533	0.51
345_G	356_D	2.466	0.49
356_D	465_E	2.463	0.48
468_L	481_W	2.455	0.48
474_G	522_E	2.452	0.48
409_R	474_G	2.450	0.48
356_D	412_R	2.450	0.48
349_G	471_L	2.386	0.46
318_E	452_A	2.290	0.43
395_I	506_P	2.279	0.43
309_D	521_G	2.277	0.43
474_G	529_G	2.272	0.43
324_I	527_Y	2.245	0.42
348_A	443_L	2.241	0.42
518_F	525_T	2.216	0.41
510_L	517_L	2.154	0.39
455_I	529_G	2.153	0.39
485_L	506_P	2.150	0.39
452_A	477_K	2.138	0.39
471_L	506_P	2.114	0.38
431_G	441_H	2.095	0.38
307_G	312_G	2.092	0.38
348_A	510_L	2.089	0.37
452_A	455_I	2.067	0.37
525_T	529_G	2.066	0.37
522_E	525_T	2.053	0.36
344_F	359_L	2.053	0.36
352_G	521_G	2.045	0.36
409_R	529_G	2.032	0.36
427_A	437_I	2.031	0.36
322_G	412_R	2.007	0.35
412_R	465_E	2.003	0.35
455_I	477_K	1.996	0.35
455_I	522_E	1.996	0.35
523_A	527_Y	1.979	0.34
521_G	524_I	1.977	0.34
445_H	530_S	1.975	0.34
452_A	518_F	1.972	0.34
300_G	304_G	1.967	0.34
409_R	522_E	1.954	0.34
404_W	471_L	1.911	0.33
474_G	525_T	1.911	0.33
441_H	472_G	1.888	0.32
318_E	455_I	1.886	0.32
465_E	474_G	1.870	0.32
426_A	444_R	1.866	0.31
403_S	466_S	1.851	0.31
472_G	530_S	1.840	0.31
372_L	480_T	1.838	0.31
409_R	526_R	1.821	0.30
370_P	431_G	1.819	0.30
379_I	484_M	1.803	0.30
444_R	482_G	1.794	0.30
331_I	372_L	1.793	0.30
352_G	444_R	1.790	0.29
345_G	412_R	1.789	0.29
346_L	527_Y	1.787	0.29
368_L	470_F	1.779	0.29
507_G	517_L	1.775	0.29
370_P	472_G	1.767	0.29
452_A	525_T	1.763	0.29
455_I	518_F	1.761	0.29
361_S	444_R	1.759	0.29
361_S	426_A	1.758	0.29
314_S	444_R	1.758	0.29
381_I	394_L	1.752	0.29
443_L	475_I	1.748	0.28
345_G	465_E	1.742	0.28
452_A	529_G	1.736	0.28
318_E	518_F	1.692	0.27
424_V	437_I	1.685	0.27
346_L	454_L	1.685	0.27
352_G	426_A	1.680	0.27
418_V	423_F	1.680	0.27
410_T	466_S	1.680	0.27
34_F	101_A	1.643	0.26
187_N	355_L	1.643	0.26
452_A	522_E	1.641	0.26
17_V	342_A	1.638	0.26
468_L	482_G	1.633	0.26
349_G	365_F	1.632	0.26
361_S	525_T	1.625	0.26
450_I	485_L	1.620	0.25
374_I	402_L	1.613	0.25
445_H	529_G	1.606	0.25
396_I	410_T	1.601	0.25
445_H	522_E	1.600	0.25
300_G	485_L	1.587	0.25
400_V	475_I	1.578	0.24
318_E	323_G	1.578	0.24
24_F	339_F	1.560	0.24
471_L	482_G	1.559	0.24
331_I	523_A	1.551	0.24
444_R	468_L	1.539	0.24
363_T	528_Y	1.539	0.24
342_A	466_S	1.524	0.23
313_A	506_P	1.514	0.23
458_I	532_V	1.514	0.23
348_A	433_S	1.512	0.23
47_Q	304_G	1.512	0.23
401_I	429_A	1.512	0.23
465_E	521_G	1.511	0.23
186_F	192_N	1.507	0.23
346_L	422_A	1.507	0.23
28_S	320_S	1.498	0.23
356_D	474_G	1.497	0.23
437_I	449_I	1.486	0.22
262_S	423_F	1.485	0.22
319_Y	347_F	1.477	0.22
315_V	520_I	1.474	0.22
33_F	515_V	1.472	0.22
18_A	510_L	1.471	0.22
24_F	34_F	1.461	0.22
138_E	508_I	1.450	0.22
361_S	469_D	1.449	0.22
337_I	403_S	1.448	0.22
318_E	477_K	1.439	0.21
437_I	501_W	1.434	0.21
455_I	525_T	1.428	0.21
378_L	402_L	1.425	0.21
361_S	416_L	1.424	0.21
455_I	475_I	1.424	0.21
431_G	472_G	1.422	0.21
472_G	482_G	1.419	0.21
56_P	394_L	1.415	0.21
444_R	525_T	1.412	0.21
477_K	518_F	1.405	0.21
396_I	458_I	1.404	0.21
341_G	356_D	1.396	0.21
411_I	512_L	1.389	0.20
426_A	468_L	1.388	0.20
404_W	426_A	1.384	0.20
422_A	525_T	1.380	0.20
322_G	349_G	1.379	0.20
325_F	359_L	1.375	0.20
345_G	370_P	1.375	0.20
422_A	452_A	1.368	0.20
368_L	519_Y	1.363	0.20
416_L	468_L	1.361	0.20
332_L	390_P	1.355	0.20
493_L	531_L	1.354	0.20
377_V	513_L	1.352	0.20
480_T	527_Y	1.350	0.20
324_I	470_F	1.345	0.20
441_H	524_I	1.343	0.20
361_S	364_D	1.334	0.19
465_E	472_G	1.333	0.19
322_G	341_G	1.324	0.19
456_F	459_P	1.322	0.19
191_I	194_S	1.318	0.19
349_G	527_Y	1.316	0.19
422_A	532_V	1.314	0.19
442_V	485_L	1.314	0.19
71_K	77_D	1.305	0.19
409_R	412_R	1.303	0.19
175_I	512_L	1.296	0.19
424_V	442_V	1.294	0.19
373_A	420_N	1.294	0.19
325_F	380_T	1.293	0.19
519_Y	523_A	1.286	0.19
444_R	469_D	1.282	0.18
518_F	527_Y	1.282	0.18
327_L	349_G	1.267	0.18
314_S	482_G	1.263	0.18
437_I	488_S	1.262	0.18
348_A	475_I	1.253	0.18
413_G	452_A	1.250	0.18
378_L	416_L	1.248	0.18
134_E	186_F	1.246	0.18
340_I	481_W	1.241	0.18
426_A	482_G	1.238	0.18
375_L	403_S	1.233	0.18
311_N	413_G	1.229	0.18
424_V	450_I	1.227	0.17
330_A	530_S	1.221	0.17
352_G	361_S	1.219	0.17
419_R	432_M	1.214	0.17
396_I	464_I	1.214	0.17
100_D	104_I	1.213	0.17
360_T	416_L	1.212	0.17
9_I	467_A	1.208	0.17
452_A	483_N	1.205	0.17
352_G	468_L	1.205	0.17
326_D	524_I	1.201	0.17
396_I	483_N	1.195	0.17
434_N	442_V	1.194	0.17
323_G	414_Q	1.190	0.17
370_P	441_H	1.188	0.17
359_L	520_I	1.188	0.17
370_P	530_S	1.187	0.17
23_I	347_F	1.185	0.17
477_K	529_G	1.183	0.17
416_L	427_A	1.179	0.17
118_F	126_G	1.177	0.17
319_Y	466_S	1.175	0.17
356_D	521_G	1.174	0.17
356_D	370_P	1.172	0.17
361_S	404_W	1.169	0.17
312_G	414_Q	1.168	0.16
317_A	340_I	1.159	0.16
68_P	82_K	1.157	0.16
437_I	481_W	1.156	0.16
412_R	522_E	1.153	0.16
324_I	409_R	1.152	0.16
433_S	505_T	1.151	0.16
20_I	440_K	1.144	0.16
326_D	474_G	1.143	0.16
392_D	505_T	1.140	0.16
28_S	423_F	1.136	0.16
451_I	480_T	1.135	0.16
452_A	469_D	1.135	0.16
350_Y	482_G	1.135	0.16
312_G	404_W	1.133	0.16
361_S	521_G	1.131	0.16
430_L	467_A	1.130	0.16
451_I	525_T	1.128	0.16
395_I	479_P	1.127	0.16
477_K	522_E	1.125	0.16
441_H	530_S	1.124	0.16
422_A	461_V	1.122	0.16
188_G	341_G	1.118	0.16
314_S	361_S	1.118	0.16
324_I	525_T	1.111	0.16
437_I	442_V	1.104	0.15
356_D	361_S	1.104	0.15
443_L	519_Y	1.103	0.15
322_G	404_W	1.102	0.15
307_G	441_H	1.102	0.15
15_L	531_L	1.101	0.15
452_A	463_G	1.098	0.15
22_F	294_L	1.096	0.15
177_A	369_L	1.092	0.15
321_Q	513_L	1.090	0.15
324_I	526_R	1.086	0.15
437_I	485_L	1.082	0.15
15_L	522_E	1.079	0.15
447_F	510_L	1.078	0.15
334_G	529_G	1.073	0.15
360_T	413_G	1.071	0.15
324_I	474_G	1.071	0.15
21_I	27_G	1.064	0.15
416_L	481_W	1.064	0.15
349_G	482_G	1.063	0.15
35_T	480_T	1.056	0.15
366_I	396_I	1.048	0.15
450_I	456_F	1.045	0.15
353_G	404_W	1.045	0.15
414_Q	475_I	1.041	0.14
518_F	526_R	1.039	0.14
341_G	345_G	1.039	0.14
361_S	365_F	1.038	0.14
396_I	503_I	1.037	0.14
21_I	59_A	1.034	0.14
373_A	503_I	1.032	0.14
422_A	518_F	1.031	0.14
423_F	493_L	1.028	0.14
15_L	529_G	1.025	0.14
416_L	419_R	1.025	0.14
220_Y	512_L	1.024	0.14
346_L	470_F	1.024	0.14
351_Y	489_I	1.022	0.14
324_I	421_M	1.021	0.14
450_I	459_P	1.015	0.14
316_F	351_Y	1.015	0.14
335_L	355_L	1.009	0.14
429_A	522_E	1.007	0.14
318_E	522_E	1.006	0.14
350_Y	426_A	1.006	0.14
323_G	419_R	1.004	0.14
400_V	483_N	1.002	0.14
237_G	362_F	1.001	0.14
8_P	12_L	1.000	0.14
190_V	228_Y	0.998	0.14
359_L	409_R	0.997	0.14
446_V	531_L	0.997	0.14
349_G	525_T	0.996	0.14
522_E	526_R	0.995	0.14
444_R	530_S	0.994	0.14
352_G	482_G	0.994	0.14
455_I	483_N	0.993	0.14
345_G	472_G	0.992	0.14
115_E	128_T	0.991	0.14
309_D	524_I	0.984	0.14
318_E	529_G	0.983	0.14
337_I	449_I	0.983	0.14
344_F	358_I	0.983	0.14
312_G	353_G	0.982	0.14
378_L	429_A	0.980	0.14
73_P	144_N	0.978	0.14
324_I	346_L	0.977	0.14
345_G	521_G	0.969	0.13
428_K	437_I	0.967	0.13
32_G	503_I	0.966	0.13
422_A	458_I	0.964	0.13
398_V	406_P	0.961	0.13
209_T	212_V	0.959	0.13
149_H	249_P	0.958	0.13
323_G	396_I	0.957	0.13
364_D	507_G	0.957	0.13
9_I	13_K	0.953	0.13
304_G	364_D	0.953	0.13
367_L	418_V	0.952	0.13
463_G	529_G	0.952	0.13
307_G	431_G	0.948	0.13
444_R	471_L	0.948	0.13
521_G	525_T	0.946	0.13
55_V	58_W	0.944	0.13
438_I	527_Y	0.943	0.13
422_A	477_K	0.943	0.13
477_K	525_T	0.942	0.13
444_R	470_F	0.938	0.13
345_G	431_G	0.937	0.13
179_A	189_Y	0.936	0.13
326_D	412_R	0.936	0.13
15_L	523_A	0.935	0.13
361_S	527_Y	0.934	0.13
104_I	508_I	0.934	0.13
474_G	527_Y	0.931	0.13
444_R	473_I	0.931	0.13
529_G	533_G	0.929	0.13
426_A	521_G	0.924	0.13
84_A	87_I	0.924	0.13
462_I	473_I	0.923	0.13
413_G	468_L	0.922	0.13
361_S	406_P	0.921	0.13
26_L	531_L	0.919	0.13
315_V	369_L	0.914	0.13
300_G	501_W	0.912	0.13
518_F	522_E	0.910	0.13
304_G	523_A	0.910	0.13
352_G	526_R	0.910	0.13
475_I	518_F	0.909	0.13
415_V	524_I	0.908	0.13
312_G	408_S	0.908	0.13
360_T	452_A	0.906	0.13
396_I	400_V	0.905	0.13
8_P	528_Y	0.904	0.13
455_I	521_G	0.903	0.13
12_L	347_F	0.902	0.13
360_T	469_D	0.902	0.13
74_N	362_F	0.898	0.12
409_R	525_T	0.897	0.12
313_A	488_S	0.893	0.12
393_I	405_P	0.892	0.12
419_R	520_I	0.890	0.12
308_T	358_I	0.889	0.12
15_L	424_V	0.888	0.12
340_I	344_F	0.886	0.12
304_G	473_I	0.883	0.12
470_F	527_Y	0.878	0.12
400_V	503_I	0.878	0.12
84_A	433_S	0.878	0.12
336_A	347_F	0.877	0.12
308_T	421_M	0.875	0.12
314_S	404_W	0.875	0.12
309_D	356_D	0.875	0.12
260_L	473_I	0.874	0.12
361_S	414_Q	0.870	0.12
309_D	414_Q	0.868	0.12
322_G	361_S	0.866	0.12
392_D	439_R	0.864	0.12
404_W	408_S	0.862	0.12
346_L	421_M	0.861	0.12
329_L	440_K	0.861	0.12
349_G	415_V	0.860	0.12
165_D	206_Y	0.859	0.12
353_G	482_G	0.857	0.12
336_A	443_L	0.856	0.12
468_L	471_L	0.856	0.12
407_T	485_L	0.854	0.12
407_T	438_I	0.851	0.12
451_I	523_A	0.850	0.12
8_P	533_G	0.849	0.12
373_A	513_L	0.848	0.12
340_I	427_A	0.848	0.12
348_A	356_D	0.848	0.12
5_R	8_P	0.848	0.12
407_T	480_T	0.847	0.12
410_T	475_I	0.846	0.12
428_K	432_M	0.845	0.12
432_M	529_G	0.843	0.12
345_G	474_G	0.842	0.12
407_T	512_L	0.839	0.12
13_K	195_N	0.838	0.12
352_G	525_T	0.835	0.12
429_A	529_G	0.833	0.12
174_S	211_L	0.831	0.12
404_W	468_L	0.830	0.12
370_P	482_G	0.829	0.12
186_F	193_P	0.828	0.12
149_H	155_Y	0.828	0.12
303_Y	459_P	0.827	0.12
346_L	438_I	0.827	0.12
463_G	469_D	0.826	0.12
276_I	512_L	0.826	0.12
323_G	477_K	0.824	0.12
324_I	528_Y	0.824	0.12
201_F	229_I	0.823	0.12
22_F	430_L	0.823	0.12
415_V	452_A	0.821	0.11
348_A	398_V	0.819	0.11
201_F	267_T	0.818	0.11
443_L	490_N	0.817	0.11
346_L	514_G	0.816	0.11
377_V	392_D	0.816	0.11
417_Q	452_A	0.814	0.11
218_F	222_G	0.811	0.11
370_P	412_R	0.811	0.11
319_Y	505_T	0.809	0.11
215_S	218_F	0.808	0.11
4_M	37_P	0.808	0.11
474_G	526_R	0.803	0.11
424_V	532_V	0.802	0.11
330_A	370_P	0.800	0.11
144_N	148_Y	0.798	0.11
319_Y	341_G	0.797	0.11
306_L	509_A	0.796	0.11
441_H	469_D	0.793	0.11
322_G	359_L	0.793	0.11
322_G	471_L	0.792	0.11
315_V	325_F	0.790	0.11
356_D	472_G	0.789	0.11
58_W	62_F	0.789	0.11
422_A	439_R	0.787	0.11
416_L	452_A	0.786	0.11
54_A	62_F	0.786	0.11
325_F	375_L	0.783	0.11
187_N	347_F	0.783	0.11
349_G	426_A	0.782	0.11
106_Y	111_G	0.780	0.11
322_G	474_G	0.779	0.11
159_R	204_G	0.779	0.11
171_I	397_I	0.778	0.11
444_R	472_G	0.778	0.11
52_P	60_S	0.778	0.11
105_I	119_Q	0.777	0.11
304_G	507_G	0.777	0.11
483_N	522_E	0.776	0.11
383_Q	424_V	0.775	0.11
404_W	482_G	0.772	0.11
365_F	525_T	0.772	0.11
54_A	59_A	0.767	0.11
364_D	368_L	0.766	0.11
334_G	522_E	0.764	0.11
452_A	474_G	0.764	0.11
507_G	515_V	0.764	0.11
456_F	532_V	0.764	0.11
477_K	503_I	0.763	0.11
466_S	480_T	0.762	0.11
189_Y	193_P	0.762	0.11
482_G	506_P	0.761	0.11
102_V	229_I	0.760	0.11
431_G	530_S	0.757	0.11
5_R	11_R	0.756	0.11
57_S	276_I	0.754	0.11
211_L	222_G	0.754	0.11
408_S	417_Q	0.754	0.11
364_D	424_V	0.753	0.11
424_V	440_K	0.752	0.11
57_S	60_S	0.752	0.11
328_E	487_F	0.750	0.11
361_S	465_E	0.749	0.11
456_F	518_F	0.748	0.11
405_P	423_F	0.746	0.11
171_I	381_I	0.745	0.11
416_L	446_V	0.744	0.11
347_F	355_L	0.743	0.11
318_E	413_G	0.741	0.11
526_R	529_G	0.741	0.11
333_A	437_I	0.741	0.11
312_G	482_G	0.741	0.11
415_V	457_D	0.738	0.11
460_A	464_I	0.736	0.10
476_L	513_L	0.734	0.10
183_Y	362_F	0.734	0.10
455_I	503_I	0.732	0.10
351_Y	381_I	0.731	0.10
353_G	426_A	0.729	0.10
322_G	420_N	0.729	0.10
322_G	426_A	0.728	0.10
468_L	473_I	0.727	0.10
372_L	485_L	0.727	0.10
363_T	395_I	0.727	0.10
415_V	424_V	0.724	0.10
178_Y	369_L	0.723	0.10
395_I	528_Y	0.723	0.10
412_R	529_G	0.723	0.10
7_P	30_A	0.723	0.10
445_H	524_I	0.722	0.10
186_F	212_V	0.722	0.10
374_I	480_T	0.721	0.10
38_K	528_Y	0.717	0.10
108_S	113_K	0.716	0.10
409_R	528_Y	0.714	0.10
391_K	503_I	0.709	0.10
130_N	133_V	0.709	0.10
341_G	465_E	0.708	0.10
356_D	431_G	0.708	0.10
29_I	39_A	0.708	0.10
415_V	423_F	0.708	0.10
119_Q	126_G	0.706	0.10
369_L	436_E	0.706	0.10
421_M	531_L	0.706	0.10
359_L	427_A	0.705	0.10
170_I	268_G	0.705	0.10
424_V	506_P	0.704	0.10
524_I	530_S	0.703	0.10
310_N	440_K	0.702	0.10
9_I	524_I	0.700	0.10
323_G	452_A	0.698	0.10
374_I	515_V	0.696	0.10
312_G	426_A	0.695	0.10
376_I	413_G	0.694	0.10
30_A	189_Y	0.693	0.10
453_Q	492_S	0.693	0.10
409_R	452_A	0.691	0.10
391_K	419_R	0.690	0.10
107_N	128_T	0.690	0.10
144_N	342_A	0.689	0.10
10_L	13_K	0.688	0.10
404_W	412_R	0.687	0.10
147_L	175_I	0.686	0.10
459_P	462_I	0.686	0.10
359_L	402_L	0.686	0.10
227_N	512_L	0.685	0.10
28_S	467_A	0.685	0.10
482_G	530_S	0.684	0.10
216_T	222_G	0.682	0.10
195_N	211_L	0.682	0.10
154_N	466_S	0.680	0.10
507_G	510_L	0.678	0.10
368_L	522_E	0.678	0.10
4_M	8_P	0.676	0.10
349_G	526_R	0.673	0.10
189_Y	192_N	0.673	0.10
452_A	475_I	0.673	0.10
445_H	472_G	0.673	0.10
355_L	512_L	0.672	0.10
322_G	526_R	0.671	0.10
488_S	531_L	0.669	0.10
412_R	429_A	0.669	0.10
16_W	470_F	0.667	0.10
358_I	531_L	0.667	0.10
396_I	455_I	0.666	0.10
443_L	493_L	0.664	0.10
21_I	213_T	0.664	0.10
441_H	482_G	0.664	0.10
37_P	513_L	0.662	0.10
323_G	391_K	0.661	0.10
326_D	452_A	0.660	0.10
376_I	509_A	0.660	0.10
349_G	412_R	0.660	0.10
341_G	412_R	0.659	0.10
373_A	391_K	0.658	0.10
359_L	415_V	0.657	0.10
322_G	525_T	0.654	0.10
364_D	525_T	0.652	0.10
325_F	478_F	0.651	0.10
314_S	530_S	0.651	0.10
35_T	372_L	0.650	0.10
9_I	330_A	0.650	0.10
12_L	414_Q	0.649	0.10
370_P	465_E	0.648	0.10
39_A	423_F	0.648	0.10
445_H	474_G	0.647	0.10
472_G	521_G	0.646	0.10
315_V	401_I	0.644	0.09
323_G	475_I	0.644	0.09
361_S	468_L	0.644	0.09
314_S	352_G	0.644	0.09
427_A	481_W	0.644	0.09
307_G	469_D	0.643	0.09
466_S	519_Y	0.642	0.09
368_L	437_I	0.642	0.09
411_I	452_A	0.641	0.09
382_F	506_P	0.641	0.09
175_I	188_G	0.640	0.09
350_Y	410_T	0.638	0.09
163_F	175_I	0.637	0.09
90_W	512_L	0.636	0.09
308_T	330_A	0.635	0.09
366_I	394_L	0.634	0.09
462_I	513_L	0.631	0.09
424_V	488_S	0.630	0.09
475_I	483_N	0.629	0.09
109_S	263_M	0.629	0.09
414_Q	426_A	0.628	0.09
331_I	494_D	0.627	0.09
15_L	376_I	0.627	0.09
365_F	412_R	0.624	0.09
325_F	392_D	0.624	0.09
327_L	515_V	0.623	0.09
373_A	446_V	0.621	0.09
47_Q	59_A	0.620	0.09
396_I	419_R	0.620	0.09
360_T	477_K	0.620	0.09
522_E	531_L	0.619	0.09
305_V	341_G	0.619	0.09
437_I	506_P	0.619	0.09
322_G	409_R	0.617	0.09
373_A	416_L	0.616	0.09
307_G	369_L	0.616	0.09
434_N	514_G	0.615	0.09
368_L	529_G	0.615	0.09
414_Q	449_I	0.614	0.09
410_T	464_I	0.614	0.09
396_I	475_I	0.613	0.09
483_N	529_G	0.612	0.09
361_S	412_R	0.611	0.09
221_L	339_F	0.611	0.09
418_V	449_I	0.610	0.09
399_L	427_A	0.607	0.09
353_G	370_P	0.606	0.09
318_E	360_T	0.605	0.09
165_D	177_A	0.605	0.09
21_I	41_P	0.605	0.09
459_P	502_W	0.604	0.09
188_G	192_N	0.601	0.09
337_I	511_F	0.600	0.09
201_F	508_I	0.600	0.09
86_V	102_V	0.599	0.09
173_A	177_A	0.598	0.09
436_E	471_L	0.598	0.09
19_L	70_I	0.598	0.09
448_P	468_L	0.597	0.09
444_R	526_R	0.597	0.09
459_P	517_L	0.597	0.09
402_L	510_L	0.596	0.09
451_I	474_G	0.595	0.09
416_L	469_D	0.594	0.09
465_E	530_S	0.593	0.09
104_I	222_G	0.590	0.09
333_A	512_L	0.589	0.09
21_I	56_P	0.589	0.09
361_S	466_S	0.589	0.09
36_A	362_F	0.588	0.09
315_V	490_N	0.588	0.09
465_E	469_D	0.587	0.09
439_R	469_D	0.587	0.09
458_I	462_I	0.586	0.09
463_G	477_K	0.586	0.09
22_F	399_L	0.584	0.09
469_D	518_F	0.583	0.09
322_G	444_R	0.582	0.09
155_Y	275_T	0.582	0.09
214_L	335_L	0.581	0.09
404_W	525_T	0.581	0.09
364_D	533_G	0.581	0.09
24_F	98_N	0.580	0.09
416_L	483_N	0.580	0.09
327_L	404_W	0.580	0.09
13_K	16_W	0.579	0.09
406_P	416_L	0.579	0.09
206_Y	280_P	0.577	0.09
334_G	531_L	0.577	0.09
419_R	502_W	0.576	0.09
366_I	391_K	0.576	0.09
350_Y	444_R	0.575	0.09
420_N	469_D	0.574	0.09
32_G	393_I	0.573	0.09
409_R	481_W	0.570	0.09
449_I	532_V	0.570	0.09
209_T	221_L	0.570	0.09
29_I	32_G	0.567	0.09
390_P	508_I	0.564	0.09
15_L	26_L	0.562	0.09
419_R	529_G	0.561	0.09
309_D	518_F	0.561	0.09
373_A	452_A	0.560	0.09
412_R	521_G	0.560	0.09
420_N	513_L	0.559	0.09
121_T	164_G	0.558	0.09
456_F	470_F	0.557	0.09
234_A	335_L	0.556	0.09
55_V	62_F	0.556	0.09
194_S	201_F	0.556	0.09
369_L	408_S	0.555	0.09
175_I	191_I	0.555	0.09
361_S	507_G	0.553	0.09
341_G	370_P	0.553	0.09
361_S	518_F	0.551	0.09
4_M	22_F	0.551	0.09
450_I	470_F	0.550	0.09
449_I	459_P	0.548	0.09
33_F	511_F	0.545	0.09
291_L	316_F	0.545	0.09
452_A	532_V	0.544	0.09
5_R	476_L	0.544	0.09
405_P	527_Y	0.542	0.08
314_S	426_A	0.542	0.08
190_V	201_F	0.542	0.08
323_G	423_F	0.542	0.08
85_S	217_V	0.542	0.08
102_V	110_Y	0.542	0.08
361_S	482_G	0.541	0.08
322_G	364_D	0.541	0.08
349_G	361_S	0.541	0.08
479_P	501_W	0.539	0.08
412_R	525_T	0.539	0.08
337_I	532_V	0.539	0.08
449_I	501_W	0.538	0.08
396_I	485_L	0.537	0.08
365_F	404_W	0.537	0.08
476_L	488_S	0.536	0.08
373_A	379_I	0.536	0.08
506_P	516_S	0.536	0.08
403_S	406_P	0.535	0.08
414_Q	518_F	0.535	0.08
432_M	503_I	0.534	0.08
39_A	304_G	0.534	0.08
441_H	465_E	0.533	0.08
190_V	221_L	0.533	0.08
321_Q	364_D	0.533	0.08
404_W	526_R	0.532	0.08
382_F	395_I	0.531	0.08
200_L	207_L	0.531	0.08
503_I	518_F	0.529	0.08
188_G	191_I	0.529	0.08
294_L	519_Y	0.529	0.08
488_S	506_P	0.528	0.08
86_V	137_I	0.528	0.08
426_A	471_L	0.527	0.08
309_D	345_G	0.525	0.08
312_G	361_S	0.524	0.08
349_G	370_P	0.523	0.08
208_P	237_G	0.522	0.08
377_V	439_R	0.521	0.08
195_N	201_F	0.521	0.08
313_A	424_V	0.520	0.08
313_A	469_D	0.517	0.08
11_R	440_K	0.516	0.08
427_A	501_W	0.516	0.08
329_L	436_E	0.515	0.08
396_I	502_W	0.515	0.08
430_L	450_I	0.515	0.08
422_A	456_F	0.514	0.08
138_E	239_T	0.513	0.08
474_G	524_I	0.512	0.08
24_F	358_I	0.511	0.08
437_I	472_G	0.511	0.08
41_P	50_A	0.511	0.08
94_N	245_S	0.511	0.08
419_R	425_E	0.511	0.08
125_Y	203_A	0.510	0.08
412_R	471_L	0.509	0.08
72_V	77_D	0.508	0.08
425_E	432_M	0.508	0.08
420_N	463_G	0.508	0.08
358_I	512_L	0.507	0.08
4_M	11_R	0.507	0.08
309_D	312_G	0.506	0.08
174_S	224_G	0.506	0.08
446_V	503_I	0.505	0.08
474_G	483_N	0.504	0.08
452_A	524_I	0.504	0.08
216_T	256_S	0.504	0.08
473_I	505_T	0.503	0.08
332_L	527_Y	0.503	0.08
442_V	450_I	0.503	0.08
307_G	370_P	0.501	0.08
364_D	382_F	0.501	0.08
24_F	220_Y	0.501	0.08
360_T	406_P	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3tuiA	2	0.3899	99.9	0.836	Contact Map
4tquM	1	0.4776	99.9	0.848	Contact Map
4ymuD	2	0.3974	99.9	0.853	Contact Map
3d31C	2	0.4384	99.8	0.869	Contact Map
3rlfF	1	0.75	99.8	0.87	Contact Map
3rlfG	1	0.4869	99.8	0.871	Contact Map
2onkC	2	0.444	99.8	0.872	Contact Map
4tquN	1	0.4963	99.7	0.883	Contact Map
4x33B	1	0.5317	70.4	0.973	Contact Map
4o2wA	3	0.528	38.6	0.978	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0133 seconds.