Q97YI8 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97YI8 - Isocitrate lyase (AceA/icl)

UniProt:	Q97YI8	Sequences: MNIRDKWIEEEKSLEYEWSEDPRWRGIKRNYKPLDVVKLRGSIRIEYSLAKLASHKLWNLLNTEPYVATFGALTGSQAVEMAKAGLKAIYVSGWQVAADNNLSNQTYPDLSLYPSNSVPNLVKRLNNALIRADQISWSEGKHDIDYLLPIVADAEAGFGGPIHAFELTKALIEAGAAGVHFEDQLAAEKKCGHLGGKVLIPISAFIRVLNAARLASDVLGVPTILIARTDALNAKYLSNDVDETDNQFLTGKRTSEGYYEIKGGIEYAIARGLAYAPYADLLWFETSKPDLEEARQFAEAIHTHYPGKMLAYNLSPSFNWKKFMDDSKISKFMNELGEMGYKFQFITLAGWHLINYHTFKLARAYRNEGMPAYVRLQELEFQAQAEGYTAVSHQREVGTDYFDLVLTIASGGEASTTAMEGSTEAEQFVEAKQKVLK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	437 (417)
Sequences:	745 (181)
Seq/√Len:	8.9

ECOLI - ACEA
SULSO - Q97YI8

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
325_D	328_K	5.693	1.00
56_K	145_D	5.460	1.00
368_E	375_R	4.856	1.00
64_E	87_K	4.813	1.00
82_A	148_L	4.597	0.99
272_G	301_I	4.543	0.99
302_H	307_G	4.344	0.99
30_N	210_N	3.840	0.98
79_V	128_A	3.743	0.97
130_I	147_L	3.706	0.97
356_Y	383_A	3.497	0.96
268_A	284_F	3.269	0.94
384_Q	391_V	3.269	0.94
204_A	208_V	3.208	0.93
17_E	21_D	2.966	0.90
188_E	208_V	2.770	0.86
188_E	204_A	2.719	0.85
26_G	308_K	2.667	0.84
118_V	171_L	2.568	0.81
139_E	395_R	2.554	0.81
254_T	260_E	2.503	0.80
102_L	116_N	2.421	0.77
353_L	357_H	2.352	0.75
389_T	396_E	2.316	0.74
399_T	425_A	2.304	0.73
52_L	145_D	2.301	0.73
136_S	144_I	2.293	0.73
325_D	339_M	2.292	0.73
62_N	309_M	2.290	0.73
102_L	115_S	2.275	0.72
91_V	121_L	2.225	0.71
261_I	267_Y	2.201	0.70
210_N	408_I	2.196	0.70
368_E	371_P	2.175	0.69
328_K	339_M	2.113	0.66
420_E	425_A	2.090	0.66
59_N	63_T	2.087	0.65
165_F	405_V	2.042	0.64
118_V	121_L	2.036	0.63
83_K	396_E	2.032	0.63
26_G	307_G	2.026	0.63
188_E	207_R	2.015	0.63
414_A	417_T	2.012	0.62
273_L	301_I	1.995	0.62
205_F	208_V	1.994	0.62
136_S	142_H	1.991	0.62
154_A	168_T	1.952	0.60
384_Q	388_Y	1.952	0.60
288_K	323_F	1.939	0.59
371_P	374_V	1.924	0.59
206_I	244_T	1.919	0.59
165_F	169_K	1.912	0.58
164_A	200_I	1.900	0.58
232_L	268_A	1.896	0.58
60_L	148_L	1.871	0.57
161_P	207_R	1.864	0.56
161_P	204_A	1.863	0.56
200_I	208_V	1.830	0.55
70_F	358_T	1.824	0.55
363_R	367_N	1.823	0.55
51_K	55_H	1.818	0.54
188_E	396_E	1.818	0.54
161_P	188_E	1.800	0.54
263_G	267_Y	1.786	0.53
232_L	293_E	1.751	0.51
266_E	296_Q	1.744	0.51
204_A	207_R	1.740	0.51
302_H	308_K	1.724	0.50
18_W	24_W	1.720	0.50
321_K	326_D	1.717	0.50
79_V	106_T	1.713	0.50
331_K	335_E	1.691	0.49
46_E	51_K	1.691	0.49
194_L	425_A	1.667	0.48
69_T	358_T	1.666	0.48
102_L	120_N	1.651	0.47
373_Y	388_Y	1.636	0.46
388_Y	391_V	1.628	0.46
346_I	374_V	1.620	0.46
292_E	296_Q	1.602	0.45
205_F	210_N	1.583	0.44
328_K	331_K	1.556	0.43
205_F	267_Y	1.534	0.42
165_F	219_L	1.529	0.42
54_S	295_R	1.514	0.41
237_L	261_I	1.512	0.41
127_N	164_A	1.500	0.41
335_E	338_E	1.495	0.41
27_I	307_G	1.484	0.40
232_L	284_F	1.459	0.39
334_N	338_E	1.452	0.39
83_K	389_T	1.440	0.38
11_E	14_L	1.440	0.38
210_N	409_A	1.440	0.38
295_R	299_E	1.434	0.38
374_V	378_E	1.433	0.38
363_R	386_E	1.431	0.38
145_D	148_L	1.429	0.38
45_I	412_G	1.417	0.37
60_L	64_E	1.412	0.37
161_P	208_V	1.402	0.37
35_D	408_I	1.392	0.36
56_K	146_Y	1.376	0.36
18_W	22_P	1.369	0.35
244_T	284_F	1.366	0.35
168_T	179_V	1.364	0.35
205_F	284_F	1.362	0.35
164_A	208_V	1.359	0.35
244_T	270_A	1.358	0.35
27_I	308_K	1.353	0.35
73_L	100_N	1.332	0.34
169_K	219_L	1.325	0.34
208_V	396_E	1.319	0.33
366_R	374_V	1.315	0.33
364_A	368_E	1.301	0.33
243_E	246_N	1.290	0.32
136_S	143_D	1.286	0.32
42_S	130_I	1.285	0.32
12_K	16_Y	1.265	0.31
252_K	260_E	1.261	0.31
83_K	146_Y	1.260	0.31
355_N	390_A	1.260	0.31
168_T	181_F	1.254	0.31
100_N	121_L	1.252	0.31
47_Y	219_L	1.249	0.31
247_Q	270_A	1.246	0.31
233_N	261_I	1.243	0.31
383_A	396_E	1.241	0.31
116_N	200_I	1.240	0.30
274_A	362_A	1.229	0.30
173_E	412_G	1.228	0.30
18_W	21_D	1.221	0.30
38_K	138_S	1.213	0.29
102_L	121_L	1.209	0.29
16_Y	33_P	1.204	0.29
161_P	406_L	1.203	0.29
123_K	173_E	1.193	0.29
202_I	261_I	1.190	0.29
11_E	15_E	1.190	0.29
368_E	379_L	1.187	0.29
118_V	122_V	1.178	0.28
118_V	167_L	1.172	0.28
233_N	263_G	1.168	0.28
116_N	120_N	1.151	0.27
188_E	406_L	1.147	0.27
173_E	407_T	1.142	0.27
43_I	147_L	1.140	0.27
235_K	261_I	1.137	0.27
103_S	170_A	1.137	0.27
400_D	419_M	1.136	0.27
407_T	412_G	1.136	0.27
273_L	300_A	1.134	0.27
18_W	33_P	1.110	0.26
106_T	128_A	1.107	0.26
419_M	425_A	1.104	0.26
33_P	37_V	1.101	0.26
61_L	309_M	1.097	0.26
127_N	130_I	1.096	0.25
66_Y	300_A	1.092	0.25
30_N	408_I	1.092	0.25
51_K	222_P	1.088	0.25
360_K	386_E	1.084	0.25
136_S	146_Y	1.083	0.25
18_W	37_V	1.081	0.25
169_K	378_E	1.078	0.25
406_L	414_A	1.074	0.25
356_Y	379_L	1.067	0.25
44_R	47_Y	1.064	0.24
66_Y	369_G	1.061	0.24
296_Q	299_E	1.056	0.24
106_T	219_L	1.055	0.24
219_L	224_I	1.049	0.24
204_A	396_E	1.048	0.24
284_F	293_E	1.046	0.24
34_L	383_A	1.042	0.24
200_I	204_A	1.039	0.24
81_M	106_T	1.037	0.24
304_H	338_E	1.035	0.24
244_T	282_L	1.032	0.23
351_W	390_A	1.030	0.23
281_L	309_M	1.029	0.23
206_I	243_E	1.027	0.23
54_S	223_T	1.027	0.23
27_I	305_Y	1.026	0.23
16_Y	34_L	1.023	0.23
268_A	302_H	1.019	0.23
78_A	84_A	1.017	0.23
268_A	293_E	1.016	0.23
173_E	219_L	1.015	0.23
134_Q	173_E	1.005	0.23
83_K	144_I	1.004	0.23
406_L	410_S	0.999	0.22
146_Y	391_V	0.998	0.22
235_K	263_G	0.997	0.22
122_V	171_L	0.995	0.22
123_K	241_V	0.994	0.22
331_K	337_G	0.993	0.22
50_A	223_T	0.993	0.22
237_L	249_L	0.993	0.22
291_L	325_D	0.992	0.22
165_F	218_V	0.990	0.22
69_T	354_I	0.988	0.22
249_L	254_T	0.988	0.22
363_R	366_R	0.985	0.22
61_L	369_G	0.984	0.22
43_I	130_I	0.982	0.22
83_K	188_E	0.981	0.22
46_E	421_G	0.981	0.22
360_K	379_L	0.980	0.22
404_L	407_T	0.977	0.22
44_R	220_G	0.967	0.21
421_G	426_E	0.967	0.21
137_W	266_E	0.967	0.21
60_L	87_K	0.966	0.21
248_F	275_Y	0.964	0.21
178_G	389_T	0.959	0.21
87_K	366_R	0.955	0.21
208_V	406_L	0.947	0.21
261_I	421_G	0.947	0.21
384_Q	395_R	0.946	0.21
134_Q	218_V	0.944	0.21
123_K	127_N	0.944	0.21
232_L	426_E	0.942	0.21
237_L	322_K	0.936	0.21
59_N	304_H	0.934	0.21
379_L	391_V	0.934	0.21
202_I	267_Y	0.933	0.21
392_S	395_R	0.933	0.21
22_P	33_P	0.927	0.20
356_Y	396_E	0.923	0.20
389_T	395_R	0.922	0.20
21_D	24_W	0.918	0.20
82_A	145_D	0.917	0.20
232_L	287_S	0.913	0.20
225_L	417_T	0.913	0.20
68_A	337_G	0.906	0.20
205_F	268_A	0.903	0.20
118_V	154_A	0.899	0.20
16_Y	259_Y	0.897	0.20
304_H	307_G	0.895	0.19
205_F	293_E	0.893	0.19
41_G	351_W	0.891	0.19
146_Y	244_T	0.888	0.19
249_L	253_R	0.888	0.19
323_F	357_H	0.878	0.19
40_R	137_W	0.877	0.19
168_T	171_L	0.872	0.19
56_K	148_L	0.872	0.19
164_A	211_A	0.871	0.19
122_V	176_A	0.868	0.19
200_I	205_F	0.867	0.19
11_E	40_R	0.865	0.19
81_M	121_L	0.865	0.19
412_G	415_S	0.861	0.19
146_Y	237_L	0.859	0.19
208_V	416_T	0.858	0.18
66_Y	337_G	0.858	0.18
43_I	52_L	0.857	0.18
37_V	137_W	0.856	0.18
127_N	208_V	0.850	0.18
12_K	15_E	0.849	0.18
235_K	260_E	0.848	0.18
72_A	116_N	0.847	0.18
421_G	425_A	0.846	0.18
399_T	416_T	0.846	0.18
188_E	200_I	0.843	0.18
56_K	143_D	0.841	0.18
65_P	337_G	0.840	0.18
284_F	346_I	0.838	0.18
121_L	206_I	0.833	0.18
246_N	259_Y	0.833	0.18
43_I	49_L	0.832	0.18
91_V	115_S	0.832	0.18
272_G	346_I	0.830	0.18
417_T	420_E	0.830	0.18
41_G	137_W	0.829	0.18
173_E	287_S	0.828	0.18
45_I	181_F	0.827	0.18
356_Y	360_K	0.825	0.18
293_E	412_G	0.823	0.18
203_S	263_G	0.822	0.18
303_T	338_E	0.822	0.18
327_S	338_E	0.816	0.17
207_R	416_T	0.810	0.17
268_A	412_G	0.809	0.17
106_T	412_G	0.807	0.17
379_L	384_Q	0.807	0.17
355_N	395_R	0.806	0.17
407_T	410_S	0.805	0.17
206_I	246_N	0.799	0.17
383_A	389_T	0.797	0.17
76_S	104_N	0.795	0.17
129_L	147_L	0.794	0.17
26_G	302_H	0.794	0.17
124_R	361_L	0.794	0.17
25_R	32_K	0.788	0.17
27_I	265_I	0.788	0.17
241_V	379_L	0.785	0.17
62_N	65_P	0.783	0.17
267_Y	284_F	0.781	0.17
346_I	356_Y	0.780	0.17
254_T	376_L	0.779	0.17
406_L	417_T	0.778	0.16
232_L	341_Y	0.778	0.16
98_A	290_D	0.777	0.16
243_E	338_E	0.776	0.16
243_E	282_L	0.774	0.16
259_Y	331_K	0.772	0.16
17_E	22_P	0.770	0.16
324_M	329_I	0.769	0.16
263_G	268_A	0.768	0.16
83_K	204_A	0.768	0.16
247_Q	274_A	0.767	0.16
56_K	82_A	0.761	0.16
290_D	346_I	0.761	0.16
396_E	406_L	0.759	0.16
299_E	339_M	0.759	0.16
164_A	323_F	0.758	0.16
74_T	121_L	0.757	0.16
200_I	241_V	0.756	0.16
367_N	385_A	0.755	0.16
351_W	357_H	0.753	0.16
225_L	259_Y	0.751	0.16
274_A	383_A	0.750	0.16
207_R	396_E	0.748	0.16
164_A	404_L	0.744	0.16
107_Y	111_S	0.743	0.16
127_N	200_I	0.742	0.16
22_P	37_V	0.741	0.16
45_I	374_V	0.741	0.16
205_F	272_G	0.738	0.16
208_V	374_V	0.737	0.16
368_E	385_A	0.734	0.15
44_R	206_I	0.731	0.15
232_L	259_Y	0.731	0.15
127_N	173_E	0.731	0.15
17_E	224_I	0.730	0.15
335_E	339_M	0.730	0.15
346_I	383_A	0.727	0.15
232_L	301_I	0.727	0.15
134_Q	343_F	0.725	0.15
292_E	338_E	0.724	0.15
50_A	54_S	0.723	0.15
237_L	408_I	0.723	0.15
204_A	392_S	0.722	0.15
188_E	389_T	0.720	0.15
118_V	261_I	0.716	0.15
235_K	366_R	0.716	0.15
82_A	89_I	0.716	0.15
136_S	282_L	0.715	0.15
42_S	60_L	0.715	0.15
326_D	337_G	0.714	0.15
224_I	338_E	0.713	0.15
49_L	53_A	0.712	0.15
273_L	304_H	0.711	0.15
273_L	305_Y	0.711	0.15
65_P	338_E	0.709	0.15
139_E	372_A	0.709	0.15
293_E	369_G	0.708	0.15
309_M	417_T	0.705	0.15
203_S	267_Y	0.704	0.15
61_L	224_I	0.702	0.15
287_S	293_E	0.698	0.15
55_H	222_P	0.697	0.15
146_Y	389_T	0.697	0.15
207_R	409_A	0.697	0.15
232_L	262_K	0.696	0.15
121_L	171_L	0.693	0.15
325_D	331_K	0.693	0.15
129_L	282_L	0.691	0.15
292_E	299_E	0.691	0.15
290_D	399_T	0.691	0.15
76_S	351_W	0.690	0.14
136_S	147_L	0.689	0.14
15_E	37_V	0.688	0.14
43_I	51_K	0.687	0.14
29_R	217_D	0.687	0.14
24_W	208_V	0.686	0.14
194_L	255_S	0.686	0.14
205_F	374_V	0.686	0.14
139_E	204_A	0.686	0.14
356_Y	372_A	0.684	0.14
83_K	395_R	0.684	0.14
138_S	404_L	0.683	0.14
70_F	357_H	0.682	0.14
33_P	148_L	0.681	0.14
127_N	232_L	0.680	0.14
188_E	410_S	0.679	0.14
105_Q	127_N	0.679	0.14
121_L	326_D	0.676	0.14
343_F	355_N	0.675	0.14
20_E	24_W	0.675	0.14
116_N	188_E	0.673	0.14
194_L	399_T	0.673	0.14
384_Q	392_S	0.672	0.14
32_K	61_L	0.672	0.14
83_K	260_E	0.671	0.14
177_A	339_M	0.669	0.14
43_I	259_Y	0.668	0.14
122_V	164_A	0.666	0.14
366_R	412_G	0.666	0.14
76_S	355_N	0.666	0.14
100_N	115_S	0.665	0.14
68_A	369_G	0.663	0.14
326_D	374_V	0.662	0.14
343_F	347_T	0.661	0.14
218_V	226_I	0.661	0.14
27_I	302_H	0.660	0.14
200_I	207_R	0.660	0.14
379_L	383_A	0.660	0.14
351_W	355_N	0.658	0.14
56_K	270_A	0.658	0.14
110_L	258_Y	0.657	0.14
42_S	287_S	0.657	0.14
30_N	205_F	0.656	0.14
188_E	395_R	0.656	0.14
235_K	293_E	0.654	0.14
120_N	171_L	0.652	0.14
181_F	205_F	0.651	0.14
299_E	303_T	0.650	0.14
330_S	334_N	0.650	0.14
295_R	392_S	0.648	0.14
35_D	360_K	0.647	0.14
247_Q	295_R	0.646	0.14
32_K	147_L	0.646	0.14
188_E	416_T	0.645	0.14
30_N	410_S	0.644	0.14
194_L	420_E	0.643	0.14
28_K	43_I	0.643	0.14
232_L	267_Y	0.643	0.14
249_L	259_Y	0.638	0.13
304_H	367_N	0.637	0.13
181_F	268_A	0.637	0.13
91_V	353_L	0.636	0.13
261_I	346_I	0.635	0.13
68_A	81_M	0.635	0.13
72_A	151_V	0.635	0.13
247_Q	301_I	0.634	0.13
205_F	301_I	0.633	0.13
373_Y	391_V	0.633	0.13
363_R	379_L	0.631	0.13
206_I	210_N	0.628	0.13
383_A	399_T	0.627	0.13
395_R	406_L	0.627	0.13
323_F	374_V	0.625	0.13
274_A	279_A	0.625	0.13
203_S	233_N	0.624	0.13
116_N	151_V	0.619	0.13
99_D	397_V	0.619	0.13
181_F	223_T	0.617	0.13
269_I	300_A	0.616	0.13
207_R	406_L	0.616	0.13
59_N	404_L	0.614	0.13
69_T	400_D	0.613	0.13
20_E	25_R	0.613	0.13
161_P	425_A	0.613	0.13
211_A	303_T	0.612	0.13
32_K	44_R	0.610	0.13
30_N	208_V	0.609	0.13
164_A	181_F	0.609	0.13
52_L	56_K	0.606	0.13
81_M	333_M	0.606	0.13
140_G	414_A	0.606	0.13
372_A	384_Q	0.605	0.13
25_R	28_K	0.604	0.13
204_A	406_L	0.603	0.13
106_T	136_S	0.603	0.13
65_P	368_E	0.603	0.13
233_N	267_Y	0.603	0.13
130_I	337_G	0.603	0.13
406_L	416_T	0.602	0.13
121_L	168_T	0.602	0.13
65_P	224_I	0.602	0.13
354_I	390_A	0.601	0.13
247_Q	300_A	0.600	0.13
38_K	55_H	0.600	0.13
76_S	357_H	0.600	0.13
96_V	107_Y	0.599	0.13
246_N	250_T	0.597	0.13
69_T	336_L	0.597	0.13
404_L	408_I	0.596	0.13
118_V	176_A	0.596	0.13
243_E	357_H	0.593	0.13
379_L	388_Y	0.592	0.13
21_D	37_V	0.587	0.12
121_L	136_S	0.587	0.12
65_P	296_Q	0.587	0.12
186_A	396_E	0.586	0.12
194_L	204_A	0.586	0.12
100_N	165_F	0.584	0.12
50_A	171_L	0.583	0.12
321_K	329_I	0.583	0.12
219_L	412_G	0.582	0.12
27_I	414_A	0.581	0.12
243_E	247_Q	0.580	0.12
115_S	120_N	0.579	0.12
233_N	292_E	0.578	0.12
21_D	33_P	0.577	0.12
227_A	336_L	0.576	0.12
208_V	389_T	0.576	0.12
46_E	425_A	0.575	0.12
96_V	117_S	0.573	0.12
205_F	232_L	0.572	0.12
154_A	295_R	0.571	0.12
30_N	407_T	0.569	0.12
287_S	426_E	0.569	0.12
292_E	421_G	0.569	0.12
354_I	358_T	0.569	0.12
222_P	282_L	0.567	0.12
51_K	249_L	0.566	0.12
106_T	378_E	0.566	0.12
38_K	404_L	0.565	0.12
69_T	372_A	0.564	0.12
282_L	300_A	0.563	0.12
288_K	303_T	0.563	0.12
331_K	334_N	0.562	0.12
270_A	329_I	0.562	0.12
164_A	168_T	0.561	0.12
47_Y	279_A	0.561	0.12
87_K	282_L	0.558	0.12
232_L	265_I	0.557	0.12
296_Q	367_N	0.555	0.12
299_E	334_N	0.554	0.12
20_E	145_D	0.553	0.12
35_D	144_I	0.553	0.12
128_A	267_Y	0.553	0.12
111_S	172_I	0.552	0.12
225_L	262_K	0.552	0.12
106_T	267_Y	0.552	0.12
204_A	410_S	0.552	0.12
266_E	300_A	0.552	0.12
66_Y	91_V	0.551	0.12
140_G	376_L	0.550	0.12
290_D	383_A	0.549	0.12
73_L	353_L	0.549	0.12
91_V	226_I	0.549	0.12
269_I	378_E	0.548	0.12
45_I	293_E	0.547	0.12
286_T	319_N	0.546	0.12
102_L	170_A	0.546	0.12
118_V	225_L	0.546	0.12
37_V	44_R	0.545	0.12
127_N	379_L	0.545	0.12
45_I	363_R	0.544	0.12
25_R	169_K	0.544	0.12
205_F	244_T	0.544	0.12
83_K	293_E	0.543	0.12
28_K	44_R	0.543	0.12
255_S	413_E	0.543	0.12
66_Y	226_I	0.541	0.12
24_W	171_L	0.540	0.12
147_L	414_A	0.540	0.12
118_V	265_I	0.539	0.12
87_K	292_E	0.539	0.12
290_D	293_E	0.539	0.12
96_V	110_L	0.537	0.12
377_Q	390_A	0.536	0.12
25_R	225_L	0.535	0.11
366_R	386_E	0.535	0.11
52_L	59_N	0.535	0.11
207_R	241_V	0.535	0.11
68_A	334_N	0.532	0.11
173_E	254_T	0.532	0.11
263_G	266_E	0.531	0.11
371_P	379_L	0.531	0.11
116_N	194_L	0.531	0.11
106_T	408_I	0.529	0.11
288_K	392_S	0.529	0.11
346_I	369_G	0.528	0.11
349_A	352_H	0.527	0.11
348_L	393_H	0.527	0.11
203_S	261_I	0.526	0.11
312_Y	316_P	0.526	0.11
313_N	316_P	0.526	0.11
122_V	268_A	0.526	0.11
220_G	426_E	0.526	0.11
61_L	65_P	0.526	0.11
371_P	375_R	0.525	0.11
367_N	406_L	0.525	0.11
405_V	415_S	0.523	0.11
165_F	397_V	0.523	0.11
326_D	399_T	0.523	0.11
69_T	76_S	0.522	0.11
262_K	288_K	0.522	0.11
86_L	355_N	0.522	0.11
326_D	329_I	0.521	0.11
132_A	389_T	0.520	0.11
244_T	304_H	0.520	0.11
117_S	215_A	0.519	0.11
127_N	404_L	0.518	0.11
69_T	353_L	0.517	0.11
303_T	391_V	0.517	0.11
70_F	76_S	0.516	0.11
299_E	338_E	0.516	0.11
118_V	279_A	0.515	0.11
171_L	328_K	0.514	0.11
262_K	408_I	0.514	0.11
244_T	261_I	0.513	0.11
178_G	375_R	0.513	0.11
70_F	353_L	0.513	0.11
45_I	173_E	0.512	0.11
12_K	322_K	0.512	0.11
304_H	308_K	0.511	0.11
177_A	194_L	0.511	0.11
167_L	171_L	0.511	0.11
130_I	134_Q	0.511	0.11
204_A	356_Y	0.509	0.11
154_A	164_A	0.508	0.11
363_R	385_A	0.508	0.11
206_I	392_S	0.507	0.11
25_R	37_V	0.507	0.11
181_F	412_G	0.507	0.11
293_E	410_S	0.506	0.11
135_I	158_F	0.506	0.11
379_L	392_S	0.505	0.11
129_L	377_Q	0.505	0.11
173_E	410_S	0.503	0.11
325_D	335_E	0.503	0.11
178_G	346_I	0.503	0.11
43_I	47_Y	0.502	0.11
105_Q	288_K	0.502	0.11
291_L	367_N	0.501	0.11
207_R	356_Y	0.500	0.11
208_V	395_R	0.500	0.11
105_Q	204_A	0.500	0.11
128_A	328_K	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1dquA	4	0.9199	100	0.255	Contact Map
3i4eA	4	0.9291	100	0.35	Contact Map
3lg3A	4	0.9359	100	0.352	Contact Map
3eolA	4	0.8238	100	0.354	Contact Map
1f8mA	4	0.9725	100	0.362	Contact Map
3lyeA	4	0.6316	100	0.776	Contact Map
3eooA	4	0.659	100	0.788	Contact Map
1zlpA	4	0.643	100	0.788	Contact Map
1xg4A	4	0.6499	100	0.789	Contact Map
3fa4A	5	0.6613	100	0.791	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0127 seconds.