Q97Y21 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97Y21 - Acetoin catabolism protein X homolog (AcoX)

UniProt:	Q97Y21	Sequences: MPAVGIIVNPESGRDIRRLVAKATFVSNYAKIDTIKRFLYGLNITNSVDEVVFMPDFYGISLDIISDIKDDVKFKLSTLDMRVENTADDTINASKYMIESGVDVIVSAGGDGTLRAVYKGAGDKVPILGLSLGTNNVLGALYEPTVLGMMLGFLLKENKAISNVVERIKTIKLFVNNEFKNLALVDLTFMSGWYVGARAIWDEYSLRYAFISKGELGDIGIPSIASLIRPITFQDDLGLMVKFGLGKIKVAATLAPGLVKEVFIDGISILKLGQEVHLPSGSYVIAFDGEKEMVVNSKDEAMVRIDRDGPLLVSIPKSLNYINSYYREEMGELRWAKKY	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	339 (321)
Sequences:	155 (120)
Seq/√Len:	6.7

SULSO - Q97Y21

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
211_I	225_A	7.049	1.00
4_V	42_L	3.774	0.94
13_G	31_K	3.585	0.92
176_N	299_D	3.349	0.88
173_L	187_L	2.954	0.81
19_L	310_P	2.906	0.80
20_V	201_W	2.833	0.78
198_R	262_V	2.772	0.76
13_G	310_P	2.750	0.76
31_K	309_G	2.693	0.74
31_K	310_P	2.605	0.72
13_G	19_L	2.566	0.70
12_S	143_E	2.549	0.70
19_L	309_G	2.514	0.69
13_G	309_G	2.478	0.68
26_V	30_A	2.384	0.64
8_V	12_S	2.378	0.64
33_D	169_K	2.293	0.61
171_I	303_V	2.267	0.60
19_L	31_K	2.194	0.58
14_R	104_V	2.169	0.57
138_L	305_I	2.126	0.55
270_L	276_V	2.109	0.54
129_G	312_L	2.062	0.53
159_K	318_S	2.047	0.52
107_S	117_V	2.039	0.52
152_G	258_L	1.960	0.49
23_A	196_G	1.955	0.49
50_E	77_S	1.926	0.48
13_G	25_F	1.900	0.47
42_L	149_M	1.899	0.47
31_K	147_L	1.894	0.46
13_G	26_V	1.874	0.46
268_S	274_Q	1.867	0.45
138_L	312_L	1.850	0.45
61_S	78_T	1.824	0.44
26_V	31_K	1.804	0.43
25_F	31_K	1.799	0.43
23_A	283_Y	1.769	0.42
147_L	309_G	1.760	0.41
94_S	98_I	1.756	0.41
236_D	272_L	1.701	0.39
90_T	240_M	1.687	0.39
119_K	181_N	1.686	0.39
28_N	31_K	1.678	0.38
25_F	28_N	1.668	0.38
118_Y	310_P	1.650	0.37
13_G	147_L	1.630	0.37
275_E	304_R	1.625	0.37
147_L	310_P	1.624	0.37
13_G	28_N	1.615	0.36
258_L	264_I	1.607	0.36
45_T	152_G	1.601	0.36
183_A	286_A	1.600	0.36
137_V	213_K	1.590	0.35
167_R	309_G	1.580	0.35
97_M	102_V	1.576	0.35
81_M	92_N	1.574	0.35
231_I	269_I	1.558	0.34
107_S	114_L	1.536	0.34
241_V	319_L	1.513	0.33
97_M	231_I	1.502	0.32
118_Y	309_G	1.485	0.32
268_S	311_L	1.480	0.32
230_P	233_F	1.475	0.32
31_K	129_G	1.474	0.32
35_I	315_I	1.471	0.31
188_T	209_A	1.469	0.31
206_L	221_I	1.468	0.31
272_L	307_R	1.468	0.31
19_L	25_F	1.453	0.31
168_I	312_L	1.446	0.31
186_D	286_A	1.395	0.29
146_V	319_L	1.395	0.29
192_G	205_S	1.393	0.29
176_N	264_I	1.386	0.29
77_S	123_D	1.382	0.29
210_F	305_I	1.370	0.28
129_G	309_G	1.366	0.28
39_L	42_L	1.350	0.28
167_R	310_P	1.349	0.28
21_A	71_D	1.344	0.27
54_M	211_I	1.341	0.27
171_I	305_I	1.324	0.27
181_N	287_F	1.323	0.27
117_V	231_I	1.323	0.27
129_G	310_P	1.305	0.26
90_T	130_L	1.301	0.26
24_T	30_A	1.299	0.26
137_V	233_F	1.296	0.26
76_L	224_I	1.290	0.26
24_T	221_I	1.287	0.26
31_K	318_S	1.286	0.26
19_L	118_Y	1.285	0.26
38_F	130_L	1.278	0.26
11_E	147_L	1.277	0.25
212_S	285_I	1.272	0.25
6_I	12_S	1.271	0.25
197_A	266_G	1.268	0.25
247_K	263_F	1.267	0.25
103_D	313_V	1.255	0.25
173_L	315_I	1.252	0.25
4_V	117_V	1.247	0.25
81_M	93_A	1.247	0.25
48_V	254_L	1.243	0.25
106_V	262_V	1.240	0.24
309_G	318_S	1.238	0.24
245_L	263_F	1.233	0.24
37_R	186_D	1.231	0.24
104_V	107_S	1.221	0.24
213_K	233_F	1.218	0.24
11_E	31_K	1.210	0.24
55_P	81_M	1.208	0.24
200_I	321_Y	1.207	0.24
156_K	159_K	1.206	0.24
4_V	149_M	1.201	0.23
143_E	149_M	1.201	0.23
60_I	255_A	1.194	0.23
127_I	242_K	1.183	0.23
25_F	310_P	1.181	0.23
28_N	58_Y	1.179	0.23
310_P	318_S	1.173	0.23
228_I	264_I	1.172	0.23
225_A	239_L	1.171	0.23
188_T	243_F	1.168	0.23
38_F	273_G	1.164	0.22
27_S	181_N	1.163	0.22
34_T	60_I	1.159	0.22
189_F	210_F	1.156	0.22
53_F	61_S	1.156	0.22
190_M	284_V	1.156	0.22
20_V	313_V	1.150	0.22
131_S	143_E	1.146	0.22
144_P	147_L	1.143	0.22
206_L	223_S	1.142	0.22
13_G	129_G	1.139	0.22
187_L	285_I	1.133	0.22
26_V	138_L	1.106	0.21
227_L	319_L	1.099	0.21
50_E	167_R	1.089	0.21
224_I	263_F	1.084	0.20
114_L	117_V	1.082	0.20
195_V	198_R	1.079	0.20
180_K	293_M	1.074	0.20
31_K	128_L	1.072	0.20
37_R	97_M	1.064	0.20
90_T	117_V	1.063	0.20
81_M	102_V	1.060	0.20
38_F	144_P	1.052	0.20
16_I	115_R	1.050	0.20
76_L	317_K	1.050	0.20
33_D	221_I	1.048	0.20
169_K	295_V	1.036	0.19
55_P	93_A	1.035	0.19
175_V	308_D	1.032	0.19
154_L	165_V	1.031	0.19
37_R	286_A	1.027	0.19
144_P	310_P	1.025	0.19
99_E	171_I	1.024	0.19
121_A	320_N	1.023	0.19
108_A	132_L	1.021	0.19
132_L	139_G	1.019	0.19
39_L	76_L	1.017	0.19
144_P	188_T	1.012	0.19
48_V	155_L	1.006	0.19
123_D	206_L	1.002	0.18
155_L	284_V	1.001	0.18
19_L	28_N	0.998	0.18
9_N	17_R	0.994	0.18
10_P	17_R	0.994	0.18
10_P	15_D	0.994	0.18
9_N	15_D	0.994	0.18
101_G	142_Y	0.994	0.18
114_L	129_G	0.987	0.18
66_S	137_V	0.986	0.18
23_A	64_I	0.986	0.18
271_K	324_S	0.979	0.18
95_K	313_V	0.978	0.18
29_Y	64_I	0.975	0.18
19_L	147_L	0.974	0.18
44_I	264_I	0.973	0.18
41_G	237_L	0.968	0.18
216_L	253_T	0.959	0.18
211_I	239_L	0.953	0.17
141_L	197_A	0.953	0.17
105_I	182_L	0.946	0.17
210_F	284_V	0.945	0.17
98_I	122_G	0.943	0.17
251_A	268_S	0.942	0.17
39_L	59_G	0.940	0.17
132_L	155_L	0.938	0.17
149_M	305_I	0.934	0.17
128_L	309_G	0.934	0.17
21_A	256_P	0.932	0.17
14_R	53_F	0.932	0.17
209_A	224_I	0.930	0.17
48_V	325_Y	0.929	0.17
116_A	223_S	0.926	0.17
261_E	300_E	0.926	0.17
26_V	129_G	0.923	0.17
50_E	303_V	0.923	0.17
116_A	239_L	0.916	0.17
42_L	54_M	0.912	0.17
42_L	268_S	0.908	0.16
24_T	165_V	0.905	0.16
28_N	309_G	0.901	0.16
144_P	221_I	0.900	0.16
186_D	201_W	0.898	0.16
14_R	23_A	0.896	0.16
44_I	76_L	0.894	0.16
47_S	97_M	0.891	0.16
222_P	283_Y	0.891	0.16
241_V	295_V	0.889	0.16
202_D	240_M	0.888	0.16
137_V	140_A	0.885	0.16
252_A	322_I	0.885	0.16
172_K	180_K	0.876	0.16
197_A	253_T	0.876	0.16
3_A	50_E	0.873	0.16
116_A	143_E	0.872	0.16
25_F	309_G	0.870	0.16
54_M	81_M	0.870	0.16
27_S	54_M	0.869	0.16
117_V	211_I	0.867	0.16
26_V	310_P	0.866	0.16
13_G	318_S	0.862	0.15
102_V	238_G	0.862	0.15
7_I	94_S	0.861	0.15
210_F	240_M	0.861	0.15
127_I	284_V	0.853	0.15
51_V	261_E	0.852	0.15
21_A	312_L	0.849	0.15
41_G	210_F	0.847	0.15
30_A	141_L	0.847	0.15
37_R	201_W	0.841	0.15
13_G	27_S	0.839	0.15
99_E	195_V	0.838	0.15
138_L	212_S	0.835	0.15
90_T	283_Y	0.834	0.15
13_G	128_L	0.834	0.15
26_V	309_G	0.834	0.15
117_V	160_A	0.834	0.15
144_P	294_V	0.832	0.15
189_F	238_G	0.828	0.15
235_D	317_K	0.827	0.15
10_P	18_R	0.824	0.15
9_N	18_R	0.824	0.15
15_D	18_R	0.824	0.15
19_L	167_R	0.811	0.15
128_L	310_P	0.804	0.14
60_I	243_F	0.803	0.14
242_K	260_K	0.799	0.14
50_E	75_K	0.798	0.14
95_K	302_M	0.795	0.14
56_D	146_V	0.791	0.14
187_L	308_D	0.790	0.14
188_T	286_A	0.790	0.14
237_L	307_R	0.788	0.14
54_M	93_A	0.782	0.14
138_L	143_E	0.780	0.14
31_K	118_Y	0.780	0.14
14_R	29_Y	0.778	0.14
56_D	219_I	0.778	0.14
251_A	274_Q	0.776	0.14
75_K	250_V	0.776	0.14
32_I	209_A	0.773	0.14
127_I	310_P	0.769	0.14
128_L	147_L	0.768	0.14
28_N	310_P	0.768	0.14
192_G	319_L	0.765	0.14
5_G	118_Y	0.762	0.14
54_M	117_V	0.762	0.14
178_E	244_G	0.760	0.14
105_I	149_M	0.759	0.14
200_I	269_I	0.756	0.14
13_G	167_R	0.755	0.14
86_T	99_E	0.754	0.13
34_T	171_I	0.750	0.13
60_I	78_T	0.750	0.13
245_L	258_L	0.745	0.13
12_S	48_V	0.743	0.13
242_K	317_K	0.742	0.13
25_F	30_A	0.741	0.13
183_A	186_D	0.740	0.13
31_K	167_R	0.740	0.13
229_R	269_I	0.739	0.13
39_L	117_V	0.739	0.13
84_E	315_I	0.732	0.13
81_M	258_L	0.732	0.13
189_F	308_D	0.727	0.13
29_Y	208_Y	0.725	0.13
34_T	130_L	0.724	0.13
106_V	314_S	0.724	0.13
45_T	125_V	0.722	0.13
153_F	323_N	0.722	0.13
56_D	211_I	0.720	0.13
159_K	263_F	0.719	0.13
203_E	232_T	0.715	0.13
226_S	291_K	0.710	0.13
14_R	206_L	0.708	0.13
47_S	305_I	0.707	0.13
171_I	272_L	0.705	0.13
181_N	188_T	0.704	0.13
144_P	227_L	0.703	0.13
144_P	309_G	0.703	0.13
26_V	144_P	0.699	0.13
3_A	259_V	0.698	0.13
48_V	143_E	0.695	0.12
3_A	75_K	0.695	0.12
120_G	295_V	0.695	0.12
108_A	139_G	0.695	0.12
54_M	115_R	0.693	0.12
56_D	225_A	0.693	0.12
120_G	206_L	0.692	0.12
177_N	225_A	0.690	0.12
80_D	105_I	0.690	0.12
53_F	204_Y	0.685	0.12
3_A	285_I	0.683	0.12
79_L	122_G	0.682	0.12
108_A	292_E	0.681	0.12
81_M	229_R	0.680	0.12
129_G	147_L	0.679	0.12
128_L	151_L	0.675	0.12
214_G	230_P	0.674	0.12
190_M	206_L	0.672	0.12
118_Y	144_P	0.670	0.12
13_G	118_Y	0.669	0.12
19_L	26_V	0.669	0.12
143_E	185_V	0.669	0.12
189_F	277_H	0.668	0.12
27_S	213_K	0.667	0.12
238_G	305_I	0.664	0.12
12_S	116_A	0.664	0.12
27_S	31_K	0.664	0.12
245_L	266_G	0.662	0.12
176_N	235_D	0.661	0.12
76_L	219_I	0.661	0.12
259_V	313_V	0.654	0.12
80_D	297_S	0.654	0.12
61_S	64_I	0.654	0.12
106_V	248_I	0.654	0.12
130_L	272_L	0.653	0.12
77_S	275_E	0.651	0.12
41_G	148_G	0.650	0.12
7_I	80_D	0.648	0.12
11_E	309_G	0.646	0.12
14_R	63_D	0.645	0.12
90_T	114_L	0.645	0.12
106_V	261_E	0.643	0.12
30_A	312_L	0.642	0.12
70_D	159_K	0.641	0.12
88_D	176_N	0.640	0.12
8_V	322_I	0.640	0.12
8_V	33_D	0.639	0.12
125_V	313_V	0.637	0.12
115_R	262_V	0.637	0.12
21_A	201_W	0.636	0.12
114_L	312_L	0.634	0.12
83_V	324_S	0.634	0.12
201_W	258_L	0.632	0.11
79_L	93_A	0.632	0.11
20_V	61_S	0.631	0.11
106_V	151_L	0.630	0.11
64_I	213_K	0.630	0.11
232_T	235_D	0.628	0.11
32_I	278_L	0.628	0.11
52_V	207_R	0.627	0.11
12_S	131_S	0.627	0.11
217_G	223_S	0.625	0.11
127_I	259_V	0.621	0.11
130_L	185_V	0.621	0.11
20_V	147_L	0.620	0.11
247_K	303_V	0.620	0.11
94_S	170_T	0.620	0.11
6_I	143_E	0.615	0.11
28_N	141_L	0.614	0.11
50_E	278_L	0.614	0.11
251_A	311_L	0.612	0.11
49_D	60_I	0.610	0.11
19_L	318_S	0.608	0.11
83_V	225_A	0.608	0.11
204_Y	307_R	0.606	0.11
19_L	27_S	0.605	0.11
76_L	202_D	0.605	0.11
52_V	100_S	0.604	0.11
65_I	104_V	0.603	0.11
5_G	9_N	0.602	0.11
5_G	17_R	0.602	0.11
5_G	10_P	0.602	0.11
5_G	15_D	0.602	0.11
53_F	208_Y	0.601	0.11
211_I	270_L	0.598	0.11
251_A	319_L	0.596	0.11
37_R	138_L	0.596	0.11
32_I	187_L	0.594	0.11
215_E	284_V	0.593	0.11
143_E	186_D	0.592	0.11
37_R	185_V	0.590	0.11
130_L	254_L	0.588	0.11
101_G	273_G	0.586	0.11
140_A	250_V	0.584	0.11
29_Y	137_V	0.584	0.11
230_P	323_N	0.583	0.11
34_T	254_L	0.582	0.11
14_R	64_I	0.582	0.11
173_L	197_A	0.581	0.11
154_L	164_V	0.580	0.11
63_D	67_D	0.578	0.11
122_G	207_R	0.577	0.11
214_G	267_I	0.575	0.11
300_E	324_S	0.574	0.11
102_V	117_V	0.573	0.11
44_I	171_I	0.573	0.11
196_G	203_E	0.571	0.11
116_A	254_L	0.570	0.11
90_T	303_V	0.570	0.11
14_R	59_G	0.570	0.11
268_S	273_G	0.569	0.11
52_V	243_F	0.568	0.11
195_V	278_L	0.568	0.11
45_T	83_V	0.567	0.11
51_V	59_G	0.565	0.11
65_I	76_L	0.564	0.10
23_A	119_K	0.564	0.10
127_I	309_G	0.562	0.10
283_Y	295_V	0.562	0.10
97_M	195_V	0.561	0.10
7_I	38_F	0.561	0.10
172_K	304_R	0.558	0.10
181_N	286_A	0.558	0.10
195_V	287_F	0.558	0.10
25_F	147_L	0.558	0.10
215_E	221_I	0.557	0.10
51_V	303_V	0.556	0.10
52_V	102_V	0.554	0.10
239_L	316_P	0.554	0.10
55_P	211_I	0.551	0.10
64_I	151_L	0.550	0.10
44_I	223_S	0.550	0.10
27_S	309_G	0.547	0.10
169_K	286_A	0.547	0.10
44_I	165_V	0.545	0.10
170_T	266_G	0.545	0.10
34_T	94_S	0.544	0.10
242_K	279_P	0.544	0.10
128_L	252_A	0.543	0.10
154_L	212_S	0.537	0.10
43_N	52_V	0.537	0.10
69_K	261_E	0.537	0.10
80_D	296_N	0.535	0.10
114_L	168_I	0.534	0.10
234_Q	304_R	0.533	0.10
167_R	311_L	0.533	0.10
26_V	312_L	0.532	0.10
208_Y	225_A	0.530	0.10
245_L	324_S	0.530	0.10
228_I	239_L	0.529	0.10
8_V	143_E	0.529	0.10
44_I	250_V	0.526	0.10
149_M	152_G	0.526	0.10
144_P	151_L	0.525	0.10
152_G	245_L	0.523	0.10
106_V	316_P	0.523	0.10
64_I	146_V	0.521	0.10
68_I	159_K	0.521	0.10
268_S	318_S	0.520	0.10
97_M	210_F	0.518	0.10
11_E	310_P	0.518	0.10
118_Y	318_S	0.515	0.10
16_I	20_V	0.514	0.10
48_V	52_V	0.513	0.10
188_T	195_V	0.512	0.10
188_T	221_I	0.509	0.10
153_F	236_D	0.509	0.10
80_D	147_L	0.508	0.10
93_A	188_T	0.508	0.10
125_V	159_K	0.505	0.10
68_I	105_I	0.505	0.10
19_L	128_L	0.505	0.10
223_S	284_V	0.503	0.10
120_G	304_R	0.503	0.10
79_L	254_L	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
1yt5A	4	0.6991	99.7	0.87	Contact Map
1z0sA	4	0.6873	99.7	0.87	Contact Map
2an1A	4	0.764	99.7	0.872	Contact Map
1u0tA	4	0.7463	99.6	0.881	Contact Map
2i2cA	3	0.708	99.6	0.887	Contact Map
3afoA	4	0.8112	99.5	0.89	Contact Map
2qv7A	2	0.7758	99.1	0.912	Contact Map
4werA	2	0.7404	99	0.916	Contact Map
3s40A	3	0.7581	98.9	0.919	Contact Map
3pfnA	4	0.7788	98.7	0.924	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0094 seconds.