Q97XT4 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97XT4 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97XT4	Sequences: MSYFIFRKLDINNSYILFLLFLILLSLLVLRVTAIRLYLNLSHEEVYLMKVINKSRETLYNIYYTLYKINVYRKIFSNWFYVIHKLRKGEKDIDVVLKNGSKGKCNIKCILTLTTIISEFSSINSRKFNFDDNNRLYYDNNLIIQENNTTWLLSIGGFIKNNDYWFFPKYNVKFNTIGYGIFETFIIEQYYTEIQGEVIDIGANIGDSAIYFALKGASHVYAFEPLPLVYKAALQNIKLNNLENKITLINGAVGSKEGKVKVPLNINLEDSGGFYITNQGDVEVPLFSFDDIVKNMVKDPYLLKMDCEGCEADIILNSDSISYFEKILVESHPHITKVSDKALLSKLRKLKYKCEERYRVGKTKLFYCSKIN	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	372 (302)
Sequences:	150 (140)
Seq/√Len:	8.1

SULSO - Q97XT4 Q7LXE9

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
290_D	317_N	4.503	0.99
289_F	320_S	4.243	0.98
223_F	292_I	3.553	0.95
203_A	233_A	3.458	0.94
305_M	314_I	3.305	0.92
203_A	222_A	3.234	0.91
201_I	253_V	2.856	0.85
330_E	356_E	2.686	0.81
200_D	304_K	2.614	0.79
161_N	164_Y	2.481	0.75
230_Y	248_L	2.455	0.74
204_N	330_E	2.400	0.73
197_E	357_R	2.329	0.70
287_F	291_D	2.310	0.70
254_G	310_C	2.255	0.68
290_D	303_L	2.237	0.67
202_G	206_G	2.158	0.64
330_E	364_K	2.142	0.63
307_C	314_I	2.128	0.63
201_I	330_E	2.123	0.63
306_D	309_G	2.032	0.59
252_A	284_V	2.018	0.59
202_G	224_E	2.017	0.59
348_R	351_K	1.987	0.57
321_I	331_S	1.971	0.57
354_C	366_F	1.966	0.57
190_Y	332_H	1.951	0.56
289_F	343_L	1.927	0.55
321_I	340_D	1.913	0.54
317_N	352_Y	1.902	0.54
254_G	262_V	1.900	0.54
208_S	332_H	1.883	0.53
198_V	302_L	1.872	0.53
303_L	314_I	1.864	0.52
290_D	318_S	1.859	0.52
320_S	354_C	1.856	0.52
257_E	287_F	1.852	0.52
197_E	301_Y	1.851	0.52
255_S	316_L	1.840	0.51
193_E	327_I	1.815	0.50
321_I	330_E	1.803	0.50
199_I	293_V	1.787	0.49
223_F	253_V	1.785	0.49
359_R	367_Y	1.775	0.49
227_P	282_V	1.771	0.49
311_E	332_H	1.769	0.48
164_Y	220_V	1.754	0.48
226_L	264_L	1.743	0.47
156_G	164_Y	1.649	0.44
220_V	263_P	1.636	0.43
164_Y	171_N	1.636	0.43
229_V	303_L	1.621	0.42
200_D	206_G	1.610	0.42
216_G	347_L	1.607	0.42
198_V	220_V	1.604	0.42
201_I	314_I	1.603	0.42
303_L	329_V	1.603	0.42
206_G	224_E	1.591	0.41
290_D	340_D	1.588	0.41
197_E	326_K	1.584	0.41
303_L	317_N	1.569	0.40
311_E	315_I	1.566	0.40
249_I	292_I	1.554	0.40
164_Y	357_R	1.551	0.40
328_L	332_H	1.508	0.38
290_D	311_E	1.502	0.38
277_T	289_F	1.500	0.38
233_A	345_S	1.493	0.37
200_D	224_E	1.467	0.36
202_G	306_D	1.451	0.36
328_L	331_S	1.451	0.36
332_H	336_T	1.427	0.35
254_G	302_L	1.425	0.35
308_E	311_E	1.423	0.35
255_S	313_D	1.421	0.35
220_V	357_R	1.417	0.34
200_D	309_G	1.412	0.34
254_G	258_G	1.405	0.34
332_H	340_D	1.387	0.33
254_G	286_L	1.384	0.33
250_N	300_P	1.377	0.33
317_N	321_I	1.367	0.33
356_E	366_F	1.361	0.32
336_T	340_D	1.360	0.32
330_E	366_F	1.351	0.32
290_D	315_I	1.351	0.32
189_Q	365_L	1.351	0.32
290_D	321_I	1.349	0.32
320_S	338_V	1.341	0.32
246_I	325_E	1.340	0.32
202_G	304_K	1.319	0.31
204_N	340_D	1.310	0.31
306_D	311_E	1.308	0.31
327_I	357_R	1.306	0.30
257_E	291_D	1.298	0.30
301_Y	354_C	1.288	0.30
307_C	318_S	1.273	0.29
230_Y	344_L	1.267	0.29
159_I	164_Y	1.261	0.29
161_N	165_W	1.261	0.29
303_L	307_C	1.261	0.29
304_K	309_G	1.252	0.29
254_G	294_K	1.247	0.28
201_I	305_M	1.235	0.28
252_A	286_L	1.212	0.27
290_D	352_Y	1.206	0.27
200_D	290_D	1.206	0.27
329_V	340_D	1.202	0.27
90_E	253_V	1.198	0.27
290_D	307_C	1.189	0.27
307_C	317_N	1.184	0.26
151_W	243_E	1.179	0.26
195_Q	228_L	1.168	0.26
204_N	331_S	1.166	0.26
293_V	320_S	1.163	0.26
199_I	320_S	1.160	0.26
249_I	295_N	1.153	0.25
308_E	331_S	1.145	0.25
212_F	236_N	1.139	0.25
332_H	344_L	1.138	0.25
244_N	352_Y	1.129	0.25
203_A	308_E	1.123	0.24
89_G	323_Y	1.119	0.24
321_I	332_H	1.117	0.24
302_L	327_I	1.115	0.24
290_D	336_T	1.110	0.24
202_G	311_E	1.099	0.24
307_C	353_K	1.099	0.24
125_S	255_S	1.098	0.24
230_Y	257_E	1.093	0.24
202_G	309_G	1.090	0.24
200_D	311_E	1.090	0.24
191_Y	367_Y	1.088	0.23
202_G	289_F	1.083	0.23
307_C	311_E	1.080	0.23
329_V	332_H	1.076	0.23
305_M	327_I	1.068	0.23
254_G	260_V	1.067	0.23
219_H	247_T	1.066	0.23
208_S	321_I	1.063	0.23
289_F	321_I	1.062	0.23
314_I	329_V	1.061	0.23
341_K	345_S	1.053	0.22
308_E	332_H	1.052	0.22
199_I	302_L	1.046	0.22
220_V	240_N	1.043	0.22
204_N	208_S	1.032	0.22
330_E	340_D	1.031	0.22
330_E	344_L	1.024	0.22
204_N	207_D	1.023	0.22
303_L	353_K	1.021	0.22
125_S	284_V	1.020	0.21
202_G	352_Y	1.020	0.21
199_I	289_F	1.020	0.21
161_N	203_A	1.016	0.21
223_F	264_L	1.010	0.21
262_V	310_C	1.010	0.21
305_M	338_V	1.002	0.21
200_D	317_N	0.999	0.21
212_F	254_G	0.993	0.21
159_I	165_W	0.992	0.21
312_A	343_L	0.991	0.21
198_V	357_R	0.987	0.21
331_S	344_L	0.986	0.21
288_S	291_D	0.978	0.20
314_I	330_E	0.978	0.20
181_I	277_T	0.972	0.20
120_F	315_I	0.964	0.20
331_S	352_Y	0.964	0.20
289_F	314_I	0.958	0.20
223_F	352_Y	0.958	0.20
317_N	325_E	0.958	0.20
206_G	306_D	0.950	0.20
329_V	352_Y	0.947	0.20
113_L	116_I	0.947	0.20
167_F	178_G	0.945	0.19
159_I	284_V	0.945	0.19
152_L	351_K	0.943	0.19
249_I	343_L	0.940	0.19
203_A	207_D	0.940	0.19
191_Y	302_L	0.937	0.19
139_D	199_I	0.936	0.19
198_V	209_A	0.933	0.19
204_N	336_T	0.930	0.19
307_C	315_I	0.926	0.19
331_S	340_D	0.926	0.19
104_K	109_C	0.924	0.19
301_Y	321_I	0.923	0.19
269_E	272_G	0.916	0.19
294_K	319_D	0.915	0.19
195_Q	204_N	0.914	0.19
224_E	233_A	0.913	0.19
321_I	329_V	0.911	0.19
202_G	225_P	0.902	0.18
202_G	308_E	0.900	0.18
226_L	262_V	0.896	0.18
329_V	336_T	0.890	0.18
252_A	351_K	0.889	0.18
214_L	307_C	0.885	0.18
78_N	284_V	0.877	0.18
301_Y	326_K	0.871	0.18
322_S	325_E	0.866	0.18
202_G	317_N	0.863	0.17
213_A	220_V	0.862	0.17
193_E	203_A	0.853	0.17
250_N	313_D	0.853	0.17
336_T	354_C	0.852	0.17
144_I	254_G	0.851	0.17
216_G	284_V	0.848	0.17
232_A	240_N	0.847	0.17
280_G	367_Y	0.846	0.17
302_L	365_L	0.844	0.17
218_S	252_A	0.843	0.17
200_D	306_D	0.839	0.17
204_N	284_V	0.837	0.17
91_K	283_E	0.836	0.17
209_A	318_S	0.836	0.17
307_C	310_C	0.836	0.17
236_N	242_L	0.835	0.17
76_F	101_S	0.831	0.17
301_Y	357_R	0.830	0.17
204_N	321_I	0.825	0.17
209_A	367_Y	0.823	0.17
168_P	252_A	0.823	0.17
261_K	285_P	0.819	0.16
344_L	368_C	0.819	0.16
231_K	351_K	0.817	0.16
160_K	194_I	0.817	0.16
61_N	250_N	0.816	0.16
224_E	306_D	0.816	0.16
331_S	336_T	0.813	0.16
303_L	321_I	0.812	0.16
362_K	368_C	0.812	0.16
359_R	365_L	0.811	0.16
122_S	242_L	0.799	0.16
122_S	149_T	0.792	0.16
223_F	317_N	0.792	0.16
248_L	368_C	0.785	0.16
206_G	304_K	0.785	0.16
314_I	332_H	0.783	0.16
102_K	312_A	0.782	0.16
233_A	262_V	0.782	0.16
365_L	368_C	0.780	0.16
198_V	218_S	0.779	0.16
305_M	311_E	0.776	0.15
258_G	363_T	0.771	0.15
172_V	221_Y	0.771	0.15
316_L	344_L	0.765	0.15
360_V	366_F	0.764	0.15
69_I	205_I	0.761	0.15
317_N	336_T	0.759	0.15
206_G	317_N	0.757	0.15
203_A	219_H	0.756	0.15
212_F	302_L	0.756	0.15
195_Q	323_Y	0.748	0.15
109_C	282_V	0.747	0.15
331_S	357_R	0.746	0.15
204_N	305_M	0.746	0.15
236_N	342_A	0.745	0.15
208_S	341_K	0.745	0.15
168_P	355_E	0.744	0.15
325_E	348_R	0.738	0.15
205_I	368_C	0.738	0.15
340_D	344_L	0.735	0.15
110_I	307_C	0.735	0.15
130_F	194_I	0.735	0.15
153_L	287_F	0.735	0.15
226_L	327_I	0.733	0.15
254_G	301_Y	0.731	0.15
205_I	359_R	0.730	0.15
329_V	354_C	0.728	0.14
311_E	327_I	0.727	0.14
235_Q	319_D	0.727	0.14
224_E	352_Y	0.724	0.14
164_Y	345_S	0.721	0.14
141_N	253_V	0.720	0.14
190_Y	341_K	0.718	0.14
199_I	255_S	0.717	0.14
224_E	317_N	0.715	0.14
341_K	357_R	0.713	0.14
88_K	178_G	0.713	0.14
194_I	285_P	0.713	0.14
121_S	199_I	0.712	0.14
68_K	80_F	0.711	0.14
340_D	354_C	0.709	0.14
314_I	333_P	0.704	0.14
201_I	364_K	0.701	0.14
65_T	71_V	0.700	0.14
330_E	336_T	0.699	0.14
305_M	330_E	0.696	0.14
218_S	248_L	0.696	0.14
312_A	363_T	0.696	0.14
81_Y	195_Q	0.695	0.14
62_I	87_R	0.695	0.14
185_F	212_F	0.694	0.14
292_I	351_K	0.691	0.14
288_S	351_K	0.687	0.14
204_N	314_I	0.687	0.14
73_R	93_I	0.681	0.14
198_V	324_F	0.678	0.13
205_I	307_C	0.676	0.13
158_F	284_V	0.674	0.13
331_S	354_C	0.673	0.13
75_I	93_I	0.671	0.13
299_D	302_L	0.670	0.13
164_Y	168_P	0.670	0.13
314_I	327_I	0.669	0.13
243_E	257_E	0.668	0.13
103_G	123_I	0.666	0.13
330_E	354_C	0.666	0.13
128_F	155_I	0.665	0.13
244_N	295_N	0.665	0.13
284_V	328_L	0.664	0.13
336_T	364_K	0.663	0.13
224_E	304_K	0.657	0.13
183_E	209_A	0.653	0.13
290_D	304_K	0.649	0.13
256_K	328_L	0.648	0.13
224_E	289_F	0.647	0.13
208_S	215_K	0.645	0.13
288_S	365_L	0.644	0.13
202_G	252_A	0.641	0.13
204_N	332_H	0.638	0.13
356_E	364_K	0.638	0.13
178_G	181_I	0.637	0.13
229_V	307_C	0.637	0.13
195_Q	295_N	0.636	0.13
148_N	300_P	0.635	0.13
151_W	225_P	0.635	0.13
155_I	242_L	0.630	0.13
220_V	301_Y	0.627	0.13
248_L	346_K	0.627	0.13
237_I	347_L	0.627	0.13
154_S	274_F	0.626	0.13
358_Y	364_K	0.625	0.13
300_P	316_L	0.623	0.12
74_K	194_I	0.621	0.12
139_D	166_F	0.620	0.12
315_I	321_I	0.619	0.12
63_Y	76_F	0.619	0.12
112_T	319_D	0.618	0.12
244_N	293_V	0.618	0.12
112_T	287_F	0.615	0.12
209_A	240_N	0.614	0.12
236_N	240_N	0.613	0.12
196_G	309_G	0.613	0.12
300_P	342_A	0.613	0.12
179_Y	203_A	0.612	0.12
357_R	367_Y	0.611	0.12
332_H	354_C	0.611	0.12
84_H	334_H	0.611	0.12
222_A	225_P	0.610	0.12
133_N	299_D	0.610	0.12
239_L	305_M	0.610	0.12
205_I	305_M	0.610	0.12
110_I	117_I	0.604	0.12
195_Q	286_L	0.602	0.12
309_G	330_E	0.602	0.12
196_G	277_T	0.602	0.12
91_K	363_T	0.601	0.12
66_L	349_K	0.599	0.12
164_Y	341_K	0.598	0.12
306_D	331_S	0.597	0.12
117_I	214_L	0.595	0.12
143_I	253_V	0.589	0.12
102_K	237_I	0.589	0.12
337_K	367_Y	0.588	0.12
293_V	366_F	0.587	0.12
114_T	123_I	0.586	0.12
186_I	204_N	0.586	0.12
155_I	218_S	0.586	0.12
122_S	133_N	0.586	0.12
164_Y	260_V	0.584	0.12
193_E	326_K	0.583	0.12
197_E	286_L	0.583	0.12
78_N	299_D	0.581	0.12
194_I	366_F	0.580	0.12
115_T	351_K	0.578	0.12
272_G	303_L	0.578	0.12
300_P	345_S	0.577	0.12
207_D	332_H	0.576	0.12
201_I	332_H	0.576	0.12
88_K	128_F	0.575	0.12
317_N	326_K	0.574	0.12
248_L	262_V	0.573	0.12
332_H	341_K	0.571	0.12
198_V	365_L	0.569	0.12
254_G	342_A	0.568	0.12
232_A	239_L	0.568	0.12
160_K	299_D	0.568	0.12
198_V	311_E	0.567	0.11
213_A	292_I	0.566	0.11
234_L	272_G	0.566	0.11
161_N	326_K	0.564	0.11
69_I	92_D	0.564	0.11
255_S	258_G	0.564	0.11
121_S	257_E	0.564	0.11
110_I	120_F	0.563	0.11
66_L	101_S	0.563	0.11
198_V	336_T	0.563	0.11
116_I	328_L	0.561	0.11
104_K	270_D	0.560	0.11
132_D	292_I	0.560	0.11
144_I	158_F	0.559	0.11
226_L	252_A	0.559	0.11
97_L	252_A	0.555	0.11
227_P	250_N	0.553	0.11
206_G	309_G	0.552	0.11
337_K	340_D	0.550	0.11
86_L	252_A	0.550	0.11
164_Y	204_N	0.550	0.11
159_I	252_A	0.550	0.11
212_F	326_K	0.549	0.11
130_F	256_K	0.549	0.11
63_Y	246_I	0.549	0.11
202_G	303_L	0.547	0.11
223_F	318_S	0.547	0.11
329_V	363_T	0.545	0.11
262_V	317_N	0.544	0.11
252_A	314_I	0.543	0.11
290_D	338_V	0.543	0.11
206_G	311_E	0.542	0.11
307_C	324_F	0.541	0.11
165_W	176_T	0.540	0.11
201_I	358_Y	0.538	0.11
85_K	90_E	0.537	0.11
218_S	301_Y	0.536	0.11
190_Y	314_I	0.534	0.11
64_Y	335_I	0.531	0.11
199_I	248_L	0.529	0.11
300_P	318_S	0.528	0.11
66_L	69_I	0.527	0.11
96_V	283_E	0.526	0.11
307_C	332_H	0.525	0.11
198_V	340_D	0.524	0.11
329_V	365_L	0.523	0.11
302_L	368_C	0.519	0.11
186_I	231_K	0.518	0.11
352_Y	363_T	0.518	0.11
198_V	333_P	0.516	0.11
64_Y	69_I	0.515	0.11
131_D	253_V	0.514	0.11
199_I	328_L	0.513	0.11
210_I	236_N	0.511	0.11
98_K	155_I	0.510	0.11
106_N	289_F	0.510	0.11
208_S	330_E	0.507	0.11
239_L	355_E	0.506	0.11
149_T	193_E	0.504	0.10
78_N	204_N	0.504	0.10
209_A	289_F	0.502	0.10
128_F	349_K	0.501	0.10
177_I	325_E	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2py6A	4	0.879	100	0.564	Contact Map
3lecA	2	0.422	87.5	0.94	Contact Map
3kr9A	1	0.414	86.4	0.941	Contact Map
2esrA	2	0.4274	86.4	0.941	Contact Map
3gnlA	1	0.4194	85.3	0.941	Contact Map
4m37A	2	0.5511	83.3	0.943	Contact Map
2fhpA	1	0.4946	83.3	0.943	Contact Map
4c4aA	1	0.4892	82.9	0.943	Contact Map
3dh0A	1	0.5	81.8	0.944	Contact Map
4ikpA	3	0.4866	81.8	0.944	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.01 seconds.