CAPPA - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

CAPPA - Phosphoenolpyruvate carboxylase

UniProt:	Q97WG4	Sequences: MRIIPRTMSTQHPDNAKVPEWAKSEVIEGEDEVKEAFLAYSMYGVHEVMWDAEGKDVDTHVVRKLLSNYPDYFREHILGKDLFLTYRLPNPKVEGADRKVFAETMESIPITYDLAEKFYGNGITIPVFEVILPMTTSSLEIISVARYYEKAVANEDELELYDGVKVKDLVGEIYPKVIEVIPLVEDRDSLQNINNIVEGYYKVIKPKYMRVFLARSDPAMNYGMITAVLSVKIALSELYKLSESLNFEIYPIIGVGSLPFRGHLSPENYEKVLEEYKGVYTYTIQSAFKYDYDYDKVKSAISSINNSRISPARILEKYEEDVLRKITILYTERYQPIIESLANAINDVSVLLPRRRARKLHIGLFGYSRSAGKVSLPRAISFVGSLYSIGIPPELIGISSLSNLDEKEWDIFKQNYVNFKHDLQTAARFLNWESFKLIKDIWKISEDTIAKIKEDIDYAESVIGIKLGGIDYDSRKHILMSSLFLLSFKEKILQESKKYLYEMALIRRSLG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	511 (477)
Sequences:	107 (92)
Seq/√Len:	4.2

HALSA - CAPPA
SULSO - CAPPA

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
416_Y	422_D	3.967	0.84
7_T	305_N	3.781	0.81
218_P	227_A	3.742	0.81
46_H	305_N	3.600	0.78
197_V	295_D	3.179	0.68
246_N	348_V	3.162	0.68
197_V	238_L	3.152	0.67
159_E	163_G	3.135	0.67
258_L	509_S	3.089	0.66
507_R	511_G	2.929	0.61
57_V	362_I	2.854	0.59
229_L	327_T	2.752	0.56
190_L	237_E	2.733	0.56
194_N	237_E	2.626	0.52
228_V	416_Y	2.596	0.51
249_I	412_F	2.587	0.51
352_L	384_G	2.539	0.50
108_I	214_A	2.412	0.46
215_R	227_A	2.410	0.46
104_T	220_M	2.323	0.43
45_V	429_F	2.278	0.42
194_N	244_S	2.272	0.42
135_T	275_E	2.229	0.41
32_E	35_E	2.220	0.40
127_V	389_I	2.170	0.39
225_I	240_K	2.159	0.39
227_A	360_L	2.159	0.39
58_D	65_L	2.156	0.39
270_E	371_A	2.122	0.38
215_R	218_P	2.118	0.38
106_E	155_E	2.106	0.37
275_E	394_E	2.037	0.35
199_G	202_K	2.008	0.34
141_I	243_E	1.998	0.34
329_L	408_E	1.975	0.34
412_F	456_I	1.936	0.33
82_L	233_I	1.931	0.32
64_K	99_K	1.922	0.32
52_A	86_Y	1.880	0.31
301_I	305_N	1.877	0.31
57_V	61_V	1.869	0.31
84_L	501_Y	1.832	0.30
9_S	289_K	1.826	0.30
203_V	284_I	1.820	0.30
218_P	364_L	1.808	0.29
305_N	374_V	1.797	0.29
101_F	509_S	1.797	0.29
26_V	357_A	1.787	0.29
220_M	330_Y	1.786	0.29
311_P	317_K	1.779	0.29
238_L	408_E	1.773	0.28
57_V	360_L	1.756	0.28
192_N	195_N	1.753	0.28
213_L	457_D	1.749	0.28
274_E	385_S	1.717	0.27
213_L	231_V	1.706	0.27
164_V	412_F	1.687	0.26
221_N	365_F	1.684	0.26
50_W	58_D	1.680	0.26
152_V	347_D	1.675	0.26
126_P	297_V	1.665	0.26
180_V	200_Y	1.650	0.26
202_K	306_N	1.649	0.26
323_L	411_I	1.633	0.25
250_Y	384_G	1.632	0.25
165_K	347_D	1.624	0.25
269_Y	303_S	1.611	0.25
213_L	510_L	1.601	0.24
193_I	205_K	1.593	0.24
235_L	251_P	1.588	0.24
65_L	73_F	1.587	0.24
30_E	97_D	1.577	0.24
116_E	192_N	1.567	0.24
50_W	355_R	1.559	0.24
229_L	463_I	1.559	0.24
211_V	389_I	1.558	0.24
58_D	61_V	1.549	0.23
7_T	304_I	1.548	0.23
306_N	391_I	1.540	0.23
195_N	249_I	1.539	0.23
50_W	128_F	1.538	0.23
406_E	412_F	1.536	0.23
500_L	509_S	1.536	0.23
11_Q	14_D	1.533	0.23
84_L	379_A	1.524	0.23
58_D	73_F	1.507	0.22
164_V	456_I	1.505	0.22
84_L	214_A	1.503	0.22
221_N	364_L	1.500	0.22
245_L	264_L	1.485	0.22
146_R	186_D	1.481	0.22
298_K	352_L	1.476	0.22
211_V	238_L	1.475	0.22
72_Y	274_E	1.474	0.22
64_K	359_K	1.469	0.22
232_K	275_E	1.469	0.22
80_K	268_N	1.468	0.22
21_W	206_P	1.468	0.22
58_D	288_F	1.465	0.22
484_F	503_M	1.462	0.22
63_R	97_D	1.461	0.22
52_A	104_T	1.453	0.21
299_S	413_K	1.452	0.21
127_V	345_I	1.414	0.21
72_Y	264_L	1.412	0.21
284_I	381_S	1.411	0.21
105_M	145_A	1.411	0.21
192_N	237_E	1.408	0.20
227_A	362_I	1.408	0.20
65_L	128_F	1.405	0.20
100_V	263_H	1.399	0.20
310_S	391_I	1.396	0.20
293_D	418_N	1.395	0.20
236_S	508_R	1.394	0.20
86_Y	100_V	1.391	0.20
208_Y	391_I	1.388	0.20
28_E	220_M	1.382	0.20
296_K	299_S	1.381	0.20
64_K	221_N	1.376	0.20
50_W	65_L	1.375	0.20
362_I	502_E	1.375	0.20
476_K	479_L	1.373	0.20
507_R	510_L	1.369	0.20
46_H	180_V	1.368	0.20
65_L	288_F	1.367	0.20
97_D	106_E	1.361	0.20
341_L	349_S	1.361	0.20
220_M	224_M	1.352	0.19
363_G	368_S	1.347	0.19
58_D	361_H	1.342	0.19
40_Y	143_S	1.340	0.19
21_W	98_R	1.337	0.19
348_V	428_R	1.336	0.19
50_W	288_F	1.329	0.19
109_P	148_Y	1.329	0.19
282_Y	289_K	1.320	0.19
91_P	97_D	1.319	0.19
242_S	348_V	1.308	0.19
82_L	139_L	1.307	0.19
190_L	213_L	1.307	0.19
224_M	416_Y	1.303	0.19
237_E	424_Q	1.301	0.18
187_R	230_S	1.301	0.18
58_D	355_R	1.301	0.18
263_H	425_T	1.296	0.18
233_I	362_I	1.294	0.18
152_V	264_L	1.291	0.18
121_N	391_I	1.288	0.18
45_V	431_N	1.280	0.18
73_F	361_H	1.275	0.18
141_I	312_A	1.275	0.18
7_T	46_H	1.274	0.18
249_I	436_K	1.269	0.18
237_E	509_S	1.268	0.18
9_S	103_E	1.254	0.18
67_S	385_S	1.246	0.18
374_V	395_L	1.241	0.17
129_E	367_Y	1.237	0.17
90_N	132_L	1.236	0.17
29_G	118_F	1.235	0.17
248_E	332_E	1.235	0.17
135_T	394_E	1.234	0.17
176_K	372_G	1.233	0.17
264_L	461_S	1.232	0.17
135_T	382_F	1.230	0.17
62_V	84_L	1.225	0.17
218_P	221_N	1.224	0.17
4_I	7_T	1.224	0.17
218_P	376_L	1.220	0.17
78_L	430_L	1.219	0.17
220_M	510_L	1.216	0.17
73_F	355_R	1.210	0.17
290_Y	431_N	1.209	0.17
194_N	311_P	1.204	0.17
61_V	65_L	1.201	0.17
424_Q	459_A	1.194	0.17
48_V	110_I	1.192	0.17
16_A	192_N	1.189	0.17
249_I	461_S	1.188	0.17
65_L	361_H	1.188	0.17
50_W	73_F	1.186	0.17
39_A	498_K	1.186	0.17
347_D	354_R	1.185	0.16
119_Y	504_A	1.180	0.16
115_A	279_V	1.179	0.16
71_D	461_S	1.178	0.16
50_W	361_H	1.177	0.16
479_L	503_M	1.175	0.16
195_N	299_S	1.175	0.16
64_K	360_L	1.175	0.16
91_P	148_Y	1.171	0.16
52_A	134_M	1.170	0.16
9_S	126_P	1.169	0.16
504_A	507_R	1.168	0.16
213_L	238_L	1.162	0.16
165_K	296_K	1.162	0.16
272_V	282_Y	1.160	0.16
240_K	321_D	1.159	0.16
348_V	429_F	1.147	0.16
208_Y	248_E	1.144	0.16
104_T	209_M	1.143	0.16
7_T	45_V	1.137	0.16
264_L	284_I	1.136	0.16
231_V	258_L	1.135	0.16
120_G	191_Q	1.133	0.16
255_V	360_L	1.132	0.16
73_F	131_I	1.130	0.16
310_S	352_L	1.126	0.16
316_E	465_I	1.125	0.16
479_L	499_Y	1.122	0.15
163_G	389_I	1.121	0.15
99_K	148_Y	1.121	0.15
62_V	78_L	1.118	0.15
9_S	359_K	1.116	0.15
152_V	408_E	1.111	0.15
40_Y	74_R	1.104	0.15
218_P	365_F	1.104	0.15
382_F	394_E	1.097	0.15
72_Y	278_G	1.096	0.15
429_F	454_E	1.095	0.15
80_K	436_K	1.089	0.15
58_D	126_P	1.083	0.15
248_E	351_L	1.078	0.15
65_L	355_R	1.076	0.15
8_M	13_P	1.072	0.15
8_M	11_Q	1.072	0.15
8_M	12_H	1.072	0.15
8_M	14_D	1.072	0.15
203_V	466_K	1.055	0.14
191_Q	436_K	1.053	0.14
138_S	198_E	1.050	0.14
275_E	422_D	1.050	0.14
391_I	434_S	1.049	0.14
128_F	232_K	1.046	0.14
134_M	383_V	1.044	0.14
341_L	416_Y	1.043	0.14
215_R	477_H	1.041	0.14
19_P	58_D	1.040	0.14
328_I	453_K	1.039	0.14
99_K	221_N	1.038	0.14
33_V	381_S	1.037	0.14
49_M	283_T	1.037	0.14
97_D	359_K	1.036	0.14
39_A	151_A	1.032	0.14
164_V	343_N	1.031	0.14
164_V	270_E	1.031	0.14
351_L	429_F	1.029	0.14
63_R	91_P	1.027	0.14
137_S	184_V	1.023	0.14
100_V	140_E	1.017	0.14
295_D	461_S	1.016	0.14
33_V	106_E	1.015	0.14
384_G	503_M	1.012	0.14
275_E	416_Y	1.011	0.14
101_F	409_W	1.009	0.14
232_K	361_H	1.009	0.14
268_N	271_K	1.009	0.14
50_W	148_Y	1.007	0.14
228_V	423_L	1.005	0.14
129_E	369_R	1.004	0.14
21_W	56_D	1.003	0.14
412_F	422_D	1.001	0.14
237_E	315_L	1.000	0.14
37_F	50_W	0.998	0.14
207_K	246_N	0.997	0.14
148_Y	360_L	0.995	0.14
4_I	208_Y	0.993	0.14
90_N	214_A	0.992	0.14
10_T	13_P	0.988	0.14
10_T	14_D	0.988	0.14
72_Y	461_S	0.988	0.14
128_F	288_F	0.988	0.14
354_R	383_V	0.987	0.14
193_I	339_E	0.987	0.14
355_R	361_H	0.983	0.13
61_V	275_E	0.982	0.13
58_D	214_A	0.981	0.13
66_L	84_L	0.981	0.13
504_A	511_G	0.980	0.13
5_P	8_M	0.980	0.13
304_I	504_A	0.976	0.13
56_D	134_M	0.971	0.13
199_G	347_D	0.967	0.13
288_F	361_H	0.967	0.13
58_D	128_F	0.965	0.13
65_L	266_P	0.965	0.13
289_K	359_K	0.962	0.13
67_S	264_L	0.960	0.13
33_V	93_V	0.958	0.13
136_T	161_Y	0.958	0.13
436_K	508_R	0.957	0.13
4_I	249_I	0.956	0.13
56_D	98_R	0.955	0.13
96_A	220_M	0.954	0.13
148_Y	361_H	0.951	0.13
4_I	181_I	0.949	0.13
195_N	284_I	0.948	0.13
312_A	329_L	0.948	0.13
65_L	131_I	0.947	0.13
159_E	199_G	0.946	0.13
39_A	152_V	0.946	0.13
125_I	159_E	0.945	0.13
77_I	504_A	0.944	0.13
229_L	385_S	0.943	0.13
97_D	145_A	0.939	0.13
95_G	383_V	0.938	0.13
140_E	331_T	0.937	0.13
221_N	342_A	0.933	0.13
52_A	59_T	0.932	0.13
64_K	365_F	0.928	0.13
151_A	193_I	0.927	0.13
49_M	212_F	0.927	0.13
37_F	58_D	0.925	0.13
73_F	288_F	0.916	0.13
298_K	419_F	0.915	0.13
58_D	131_I	0.914	0.13
184_V	499_Y	0.914	0.13
328_I	414_Q	0.912	0.12
45_V	165_K	0.911	0.12
184_V	193_I	0.909	0.12
64_K	97_D	0.908	0.12
270_E	307_S	0.907	0.12
107_S	111_T	0.907	0.12
219_A	353_P	0.905	0.12
353_P	392_P	0.905	0.12
219_A	392_P	0.905	0.12
19_P	355_R	0.904	0.12
266_P	366_G	0.895	0.12
241_L	245_L	0.893	0.12
65_L	76_H	0.893	0.12
40_Y	302_S	0.892	0.12
38_L	289_K	0.891	0.12
104_T	119_Y	0.891	0.12
80_K	198_E	0.889	0.12
21_W	27_I	0.887	0.12
23_K	323_L	0.887	0.12
423_L	459_A	0.886	0.12
149_E	427_A	0.886	0.12
141_I	200_Y	0.886	0.12
65_L	297_V	0.885	0.12
229_L	260_F	0.884	0.12
161_Y	506_I	0.884	0.12
46_H	417_V	0.877	0.12
38_L	43_Y	0.876	0.12
384_G	510_L	0.874	0.12
152_V	226_T	0.872	0.12
205_K	412_F	0.871	0.12
3_I	86_Y	0.869	0.12
102_A	265_S	0.867	0.12
32_E	36_A	0.867	0.12
27_I	229_L	0.866	0.12
267_E	296_K	0.865	0.12
71_D	504_A	0.864	0.12
304_I	502_E	0.864	0.12
242_S	248_E	0.864	0.12
99_K	175_P	0.862	0.12
68_N	345_I	0.861	0.12
110_I	289_K	0.861	0.12
371_A	495_E	0.859	0.12
29_G	103_E	0.858	0.12
228_V	422_D	0.858	0.12
130_V	180_V	0.851	0.12
33_V	199_G	0.851	0.12
467_L	500_L	0.850	0.12
383_V	435_F	0.848	0.12
146_R	383_V	0.848	0.12
225_I	412_F	0.847	0.12
43_Y	465_I	0.846	0.12
27_I	504_A	0.846	0.12
141_I	488_F	0.845	0.12
144_V	293_D	0.844	0.12
103_E	289_K	0.843	0.12
111_T	226_T	0.842	0.12
227_A	365_F	0.840	0.12
128_F	364_L	0.840	0.12
72_Y	155_E	0.839	0.12
48_V	63_R	0.835	0.12
164_V	332_E	0.831	0.11
111_T	431_N	0.829	0.11
99_K	369_R	0.827	0.11
362_I	365_F	0.826	0.11
19_P	65_L	0.826	0.11
249_I	428_R	0.819	0.11
45_V	226_T	0.818	0.11
190_L	227_A	0.817	0.11
197_V	395_L	0.817	0.11
190_L	231_V	0.816	0.11
276_Y	383_V	0.816	0.11
239_Y	385_S	0.815	0.11
21_W	339_E	0.813	0.11
335_Q	422_D	0.812	0.11
249_I	290_Y	0.811	0.11
313_R	414_Q	0.811	0.11
174_Y	428_R	0.810	0.11
193_I	332_E	0.810	0.11
198_E	454_E	0.808	0.11
475_R	484_F	0.807	0.11
266_P	355_R	0.803	0.11
284_I	304_I	0.800	0.11
198_E	314_I	0.797	0.11
107_S	282_Y	0.795	0.11
16_A	484_F	0.794	0.11
73_F	128_F	0.792	0.11
74_R	296_K	0.791	0.11
203_V	206_P	0.791	0.11
24_S	197_V	0.789	0.11
48_V	98_R	0.788	0.11
283_T	334_Y	0.787	0.11
209_M	284_I	0.784	0.11
50_W	214_A	0.784	0.11
346_N	376_L	0.784	0.11
58_D	64_K	0.784	0.11
148_Y	288_F	0.784	0.11
16_A	435_F	0.783	0.11
397_G	401_L	0.779	0.11
19_P	73_F	0.778	0.11
227_A	255_V	0.776	0.11
37_F	65_L	0.775	0.11
65_L	113_D	0.775	0.11
222_Y	282_Y	0.775	0.11
248_E	385_S	0.774	0.11
176_K	481_S	0.773	0.11
153_A	163_G	0.773	0.11
299_S	306_N	0.773	0.11
215_R	226_T	0.770	0.11
62_V	360_L	0.770	0.11
65_L	126_P	0.769	0.11
225_I	308_R	0.768	0.11
327_T	412_F	0.768	0.11
142_I	429_F	0.766	0.11
37_F	287_A	0.764	0.11
225_I	401_L	0.764	0.11
58_D	148_Y	0.764	0.11
115_A	200_Y	0.763	0.11
135_T	338_I	0.763	0.11
211_V	401_L	0.762	0.11
298_K	349_S	0.761	0.11
193_I	225_I	0.759	0.11
73_F	266_P	0.759	0.11
272_V	426_A	0.758	0.11
153_A	428_R	0.757	0.11
224_M	264_L	0.757	0.11
394_E	416_Y	0.756	0.11
64_K	175_P	0.755	0.11
19_P	361_H	0.755	0.11
203_V	209_M	0.754	0.11
80_K	389_I	0.753	0.11
191_Q	271_K	0.748	0.11
302_S	310_S	0.743	0.10
266_P	288_F	0.742	0.10
20_E	134_M	0.742	0.10
64_K	355_R	0.741	0.10
232_K	363_G	0.739	0.10
64_K	127_V	0.738	0.10
73_F	232_K	0.737	0.10
20_E	98_R	0.737	0.10
83_F	452_I	0.736	0.10
128_F	266_P	0.735	0.10
139_L	302_S	0.734	0.10
72_Y	349_S	0.734	0.10
37_F	165_K	0.733	0.10
111_T	258_L	0.731	0.10
208_Y	250_Y	0.730	0.10
27_I	141_I	0.726	0.10
63_R	105_M	0.726	0.10
43_Y	184_V	0.723	0.10
58_D	297_V	0.723	0.10
324_R	419_F	0.719	0.10
61_V	128_F	0.717	0.10
34_K	270_E	0.717	0.10
91_P	99_K	0.717	0.10
19_P	50_W	0.717	0.10
302_S	368_S	0.716	0.10
245_L	372_G	0.715	0.10
218_P	346_N	0.714	0.10
429_F	464_G	0.712	0.10
435_F	477_H	0.712	0.10
29_G	109_P	0.711	0.10
9_S	15_N	0.709	0.10
288_F	355_R	0.708	0.10
180_V	374_V	0.706	0.10
331_T	415_N	0.704	0.10
297_V	355_R	0.701	0.10
117_K	503_M	0.700	0.10
148_Y	222_Y	0.699	0.10
113_D	361_H	0.699	0.10
62_V	214_A	0.698	0.10
428_R	453_K	0.698	0.10
32_E	366_G	0.697	0.10
209_M	337_I	0.697	0.10
430_L	467_L	0.695	0.10
348_V	391_I	0.695	0.10
242_S	450_A	0.694	0.10
80_K	231_V	0.693	0.10
195_N	296_K	0.689	0.10
225_I	423_L	0.687	0.10
342_A	365_F	0.686	0.10
457_D	461_S	0.686	0.10
154_N	282_Y	0.682	0.10
59_T	112_Y	0.682	0.10
327_T	426_A	0.676	0.10
477_H	481_S	0.673	0.10
134_M	158_L	0.672	0.10
148_Y	355_R	0.672	0.10
209_M	269_Y	0.672	0.10
215_R	276_Y	0.670	0.10
277_K	418_N	0.670	0.10
328_I	457_D	0.670	0.10
211_V	334_Y	0.670	0.10
160_L	385_S	0.666	0.10
9_S	136_T	0.664	0.10
179_E	336_P	0.664	0.10
299_S	312_A	0.664	0.10
193_I	433_E	0.663	0.10
284_I	427_A	0.662	0.10
228_V	386_L	0.661	0.10
225_I	451_K	0.661	0.10
3_I	207_K	0.659	0.10
408_E	466_K	0.658	0.10
22_A	96_A	0.655	0.10
98_R	289_K	0.653	0.09
270_E	321_D	0.650	0.09
255_V	268_N	0.650	0.09
270_E	303_S	0.650	0.09
244_S	407_K	0.649	0.09
65_L	148_Y	0.649	0.09
52_A	93_V	0.648	0.09
190_L	282_Y	0.648	0.09
500_L	504_A	0.645	0.09
253_I	506_I	0.645	0.09
61_V	113_D	0.644	0.09
72_Y	78_L	0.641	0.09
73_F	113_D	0.640	0.09
186_D	189_S	0.640	0.09
253_I	456_I	0.640	0.09
121_N	264_L	0.639	0.09
93_V	134_M	0.639	0.09
92_K	140_E	0.639	0.09
310_S	448_T	0.637	0.09
105_M	412_F	0.636	0.09
331_T	343_N	0.635	0.09
38_L	154_N	0.635	0.09
64_K	91_P	0.634	0.09
242_S	452_I	0.634	0.09
237_E	476_K	0.631	0.09
20_E	111_T	0.627	0.09
424_Q	456_I	0.627	0.09
28_E	239_Y	0.627	0.09
15_N	126_P	0.626	0.09
346_N	364_L	0.625	0.09
456_I	487_S	0.625	0.09
96_A	330_Y	0.624	0.09
250_Y	269_Y	0.624	0.09
50_W	61_V	0.624	0.09
474_S	500_L	0.624	0.09
301_I	429_F	0.623	0.09
290_Y	500_L	0.623	0.09
40_Y	347_D	0.623	0.09
243_E	247_F	0.621	0.09
357_A	484_F	0.621	0.09
127_V	449_I	0.621	0.09
83_F	287_A	0.619	0.09
27_I	184_V	0.618	0.09
221_N	376_L	0.618	0.09
239_Y	312_A	0.618	0.09
102_A	127_V	0.618	0.09
102_A	315_L	0.617	0.09
65_L	214_A	0.616	0.09
334_Y	510_L	0.616	0.09
144_V	383_V	0.615	0.09
279_V	312_A	0.615	0.09
31_D	62_V	0.614	0.09
33_V	337_I	0.613	0.09
83_F	268_N	0.613	0.09
128_F	214_A	0.612	0.09
248_E	284_I	0.612	0.09
367_Y	394_E	0.612	0.09
16_A	204_I	0.610	0.09
228_V	433_E	0.609	0.09
45_V	327_T	0.606	0.09
146_R	265_S	0.606	0.09
246_N	433_E	0.605	0.09
165_K	264_L	0.604	0.09
99_K	288_F	0.603	0.09
333_R	399_S	0.602	0.09
3_I	202_K	0.602	0.09
263_H	293_D	0.602	0.09
86_Y	189_S	0.600	0.09
126_P	289_K	0.600	0.09
92_K	137_S	0.599	0.09
7_T	336_P	0.598	0.09
45_V	282_Y	0.598	0.09
326_I	406_E	0.594	0.09
30_E	111_T	0.594	0.09
360_L	365_F	0.591	0.09
230_S	263_H	0.591	0.09
379_A	383_V	0.591	0.09
456_I	510_L	0.590	0.09
93_V	395_L	0.590	0.09
325_K	344_A	0.589	0.09
150_K	158_L	0.587	0.09
73_F	126_P	0.586	0.09
128_F	361_H	0.586	0.09
128_F	208_Y	0.585	0.09
58_D	76_H	0.585	0.09
88_L	104_T	0.585	0.09
29_G	175_P	0.584	0.09
151_A	263_H	0.583	0.09
311_P	504_A	0.582	0.09
36_A	46_H	0.582	0.09
327_T	496_S	0.581	0.09
68_N	284_I	0.581	0.09
406_E	453_K	0.581	0.09
40_Y	46_H	0.579	0.09
312_A	332_E	0.578	0.09
19_P	288_F	0.578	0.09
326_I	508_R	0.574	0.09
359_K	365_F	0.573	0.09
113_D	148_Y	0.572	0.09
50_W	113_D	0.571	0.09
290_Y	348_V	0.571	0.09
121_N	421_H	0.571	0.09
160_L	418_N	0.570	0.09
74_R	482_S	0.569	0.09
186_D	374_V	0.568	0.09
205_K	465_I	0.568	0.09
325_K	419_F	0.568	0.09
424_Q	448_T	0.566	0.09
160_L	384_G	0.564	0.09
50_W	266_P	0.564	0.09
212_F	366_G	0.562	0.09
74_R	474_S	0.561	0.09
504_A	510_L	0.561	0.09
207_K	287_A	0.559	0.09
200_Y	233_I	0.557	0.09
315_L	424_Q	0.557	0.09
208_Y	228_V	0.557	0.09
422_D	506_I	0.556	0.09
34_K	289_K	0.555	0.09
38_L	235_L	0.553	0.09
64_K	148_Y	0.552	0.09
139_L	284_I	0.551	0.08
16_A	323_L	0.551	0.08
330_Y	400_S	0.551	0.08
239_Y	389_I	0.549	0.08
394_E	422_D	0.548	0.08
57_V	65_L	0.548	0.08
134_M	510_L	0.547	0.08
421_H	497_K	0.547	0.08
115_A	304_I	0.546	0.08
90_N	101_F	0.546	0.08
263_H	438_I	0.546	0.08
98_R	102_A	0.545	0.08
63_R	165_K	0.544	0.08
273_L	452_I	0.542	0.08
435_F	438_I	0.542	0.08
277_K	295_D	0.542	0.08
186_D	229_L	0.540	0.08
50_W	232_K	0.540	0.08
67_S	287_A	0.539	0.08
270_E	295_D	0.539	0.08
430_L	456_I	0.538	0.08
263_H	406_E	0.538	0.08
76_H	317_K	0.537	0.08
242_S	500_L	0.535	0.08
240_K	338_I	0.535	0.08
48_V	173_I	0.535	0.08
274_E	348_V	0.535	0.08
179_E	192_N	0.534	0.08
355_R	365_F	0.534	0.08
161_Y	249_I	0.534	0.08
310_S	326_I	0.532	0.08
78_L	84_L	0.530	0.08
280_Y	348_V	0.530	0.08
24_S	139_L	0.529	0.08
58_D	113_D	0.529	0.08
106_E	145_A	0.527	0.08
21_W	213_L	0.523	0.08
140_E	293_D	0.522	0.08
317_K	395_L	0.522	0.08
178_I	244_S	0.522	0.08
73_F	148_Y	0.521	0.08
57_V	255_V	0.519	0.08
138_S	193_I	0.519	0.08
45_V	240_K	0.519	0.08
129_E	394_E	0.519	0.08
249_I	375_S	0.518	0.08
203_V	240_K	0.518	0.08
180_V	264_L	0.518	0.08
206_P	339_E	0.514	0.08
86_Y	383_V	0.514	0.08
367_Y	397_G	0.514	0.08
159_E	503_M	0.514	0.08
52_A	146_R	0.513	0.08
84_L	246_N	0.513	0.08
190_L	215_R	0.512	0.08
95_G	149_E	0.512	0.08
4_I	250_Y	0.511	0.08
29_G	376_L	0.511	0.08
33_V	144_V	0.511	0.08
48_V	56_D	0.511	0.08
96_A	104_T	0.510	0.08
345_I	482_S	0.509	0.08
152_V	199_G	0.508	0.08
425_T	501_Y	0.506	0.08
80_K	121_N	0.506	0.08
9_S	360_L	0.506	0.08
411_I	429_F	0.505	0.08
86_Y	134_M	0.504	0.08
373_K	489_K	0.503	0.08
381_S	452_I	0.501	0.08
25_E	159_E	0.501	0.08
91_P	359_K	0.501	0.08
149_E	180_V	0.500	0.08
234_A	376_L	0.500	0.08
59_T	357_A	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3odmA	6	0.9315	100	0.439	Contact Map
4bxhA	3	0.8219	100	0.79	Contact Map
1jqnA	3	0.8395	100	0.792	Contact Map
3qllA	3	0.3953	97.3	0.965	Contact Map
4roqA	5	0.546	97.2	0.965	Contact Map
3r4iA	5	0.5616	97.1	0.966	Contact Map
3qz6A	5	0.4892	97.1	0.966	Contact Map
1u5hA	3	0.3973	96.9	0.967	Contact Map
4l9zA	5	0.5382	96.4	0.969	Contact Map
4mf4A	5	0.4423	96.1	0.969	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0123 seconds.