Q97W28 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97W28 - Dihydropteroate synthase, putative

UniProt:	Q97W28	Sequences: MKVLVVTGTLAAPILSEVAKNIKDTKVEIKVLNYPVASLMSTKFIAENLKQTKFDADYILLPGLVYGDAKIVEEVTGVRTFKGTEEAWDLPRVIEALKNGIQLSTTESADKIIGKMDNIEEKLRKMEEEAKISFEINGIKITTYPPPFRIFLEIDNKQEFEKLDRIRKNVDVVVLGFPVGHYDLDEVKNKVKQLVDYGYVVGIDAESPRELKEGVRAGASFVFNLNENNFEELEEIRKEAAFVVAPFNTENRGEITIDLVKKAKQKGFDKLIADPVLSPPLRGLVSSIIGYKYVRETLQDIPILMGILNVTELIDADSIGMNALLTAIAGELGISNLLIMEKGKTRWSSWEVSQATKMISVALKENRLPKDIGIDLLVLKDKRRFRESFNADVIVNRRIEPEMDNTGFAKIFVSEDGFGVEWIGKNKITIKGKDGLSIGRELIRRVKDISKEHAVYIGYELAKAEIAYQLDKNYIQDKPLFKKIINDNLHTEHDKKRG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	498 (470)
Sequences:	108 (91)
Seq/√Len:	4.2

SULSO - Q97W28

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
409_A	442_L	4.209	0.88
28_E	56_A	4.166	0.87
152_L	349_S	3.672	0.79
12_A	16_S	3.566	0.77
29_I	203_I	3.494	0.75
175_L	275_P	3.413	0.74
439_G	455_V	3.030	0.64
339_I	352_V	3.010	0.63
174_V	202_G	2.942	0.61
12_A	31_V	2.871	0.59
306_G	370_K	2.752	0.56
305_M	338_L	2.737	0.55
381_D	473_N	2.650	0.53
379_L	470_L	2.625	0.52
142_T	174_V	2.597	0.51
304_L	338_L	2.587	0.51
188_K	213_E	2.549	0.50
150_I	338_L	2.470	0.48
381_D	472_K	2.424	0.46
19_A	466_I	2.394	0.45
12_A	459_Y	2.387	0.45
2_K	469_Q	2.273	0.42
204_D	306_G	2.241	0.41
110_D	290_G	2.217	0.40
280_P	327_A	2.207	0.40
322_N	339_I	2.183	0.39
154_I	350_W	2.174	0.39
204_D	370_K	2.164	0.39
2_K	5_V	2.151	0.38
419_G	466_I	2.103	0.37
86_E	143_T	2.091	0.37
426_N	469_Q	2.079	0.36
310_V	465_E	2.058	0.36
33_N	189_N	2.044	0.35
435_G	465_E	2.044	0.35
142_T	202_G	1.982	0.34
121_E	124_R	1.982	0.34
82_K	147_P	1.976	0.34
68_D	191_V	1.961	0.33
175_L	208_P	1.954	0.33
304_L	340_M	1.946	0.33
105_T	172_V	1.932	0.32
8_G	37_A	1.895	0.31
89_D	318_S	1.881	0.31
204_D	315_D	1.880	0.31
103_L	353_S	1.865	0.31
206_E	337_L	1.864	0.31
38_S	366_N	1.857	0.30
315_D	382_K	1.852	0.30
90_L	284_L	1.848	0.30
104_S	371_D	1.829	0.30
404_D	407_G	1.819	0.29
81_F	426_N	1.815	0.29
307_I	337_L	1.813	0.29
430_I	442_L	1.813	0.29
170_V	256_T	1.809	0.29
3_V	321_M	1.805	0.29
40_M	110_D	1.799	0.29
36_V	442_L	1.798	0.29
267_G	316_A	1.793	0.29
151_F	172_V	1.791	0.29
268_F	304_L	1.788	0.29
164_D	221_F	1.752	0.28
160_F	363_L	1.748	0.28
172_V	245_A	1.748	0.28
29_I	446_V	1.746	0.28
68_D	362_A	1.730	0.27
89_D	104_S	1.729	0.27
175_L	211_L	1.728	0.27
170_V	342_K	1.727	0.27
42_T	142_T	1.708	0.27
82_K	110_D	1.702	0.27
199_Y	288_I	1.695	0.27
94_I	233_L	1.690	0.26
263_A	381_D	1.636	0.25
142_T	146_P	1.631	0.25
202_G	206_E	1.622	0.25
81_F	244_V	1.614	0.25
260_V	301_I	1.603	0.24
242_F	304_L	1.594	0.24
33_N	76_T	1.580	0.24
56_A	441_E	1.579	0.24
94_I	362_A	1.577	0.24
204_D	382_K	1.556	0.23
89_D	306_G	1.552	0.23
201_V	321_M	1.538	0.23
46_A	75_V	1.537	0.23
305_M	477_D	1.523	0.23
103_L	478_K	1.519	0.23
204_D	313_L	1.516	0.23
85_E	245_A	1.501	0.22
242_F	457_I	1.493	0.22
308_L	339_I	1.492	0.22
28_E	173_V	1.490	0.22
322_N	348_S	1.483	0.22
163_L	194_L	1.481	0.22
271_L	288_I	1.477	0.22
463_K	472_K	1.465	0.22
6_V	381_D	1.464	0.22
280_P	397_R	1.461	0.21
152_L	170_V	1.457	0.21
38_S	76_T	1.454	0.21
5_V	19_A	1.451	0.21
442_L	457_I	1.450	0.21
110_D	288_I	1.428	0.21
429_T	438_I	1.425	0.21
104_S	204_D	1.424	0.21
206_E	245_A	1.424	0.21
353_S	410_K	1.423	0.21
284_L	329_A	1.417	0.21
440_R	459_Y	1.417	0.21
65_V	450_S	1.415	0.21
158_Q	177_F	1.403	0.20
242_F	268_F	1.399	0.20
42_T	224_N	1.397	0.20
281_L	466_I	1.391	0.20
39_L	157_K	1.387	0.20
89_D	370_K	1.382	0.20
169_N	220_S	1.375	0.20
211_L	219_A	1.369	0.20
180_G	377_L	1.367	0.20
308_L	342_K	1.364	0.20
455_V	477_D	1.363	0.20
211_L	303_I	1.361	0.20
169_N	342_K	1.360	0.20
45_I	147_P	1.359	0.19
170_V	468_Y	1.356	0.19
172_V	408_F	1.353	0.19
40_M	81_F	1.349	0.19
3_V	225_L	1.349	0.19
315_D	370_K	1.346	0.19
306_G	315_D	1.334	0.19
112_I	431_K	1.331	0.19
37_A	370_K	1.329	0.19
229_N	310_V	1.325	0.19
119_I	148_F	1.319	0.19
123_L	286_S	1.315	0.19
181_H	210_E	1.311	0.19
174_V	338_L	1.311	0.19
139_I	192_K	1.308	0.19
279_P	302_P	1.307	0.19
74_E	438_I	1.301	0.18
150_I	305_M	1.300	0.18
31_V	93_V	1.298	0.18
336_N	349_S	1.297	0.18
393_V	443_I	1.290	0.18
9_T	58_Y	1.284	0.18
272_I	325_L	1.273	0.18
294_V	337_L	1.269	0.18
313_L	370_K	1.264	0.18
74_E	428_I	1.258	0.18
117_D	433_K	1.257	0.18
117_D	195_V	1.253	0.18
119_I	273_A	1.252	0.18
280_P	291_Y	1.250	0.18
162_K	205_A	1.243	0.17
251_N	450_S	1.243	0.17
85_E	151_F	1.238	0.17
2_K	328_I	1.233	0.17
32_L	39_L	1.227	0.17
60_L	331_E	1.222	0.17
309_N	315_D	1.219	0.17
435_G	474_Y	1.218	0.17
148_F	338_L	1.216	0.17
177_F	202_G	1.210	0.17
94_I	438_I	1.209	0.17
40_M	305_M	1.203	0.17
8_G	87_A	1.200	0.17
213_E	316_A	1.197	0.17
207_S	281_L	1.197	0.17
390_N	466_I	1.195	0.17
409_A	457_I	1.192	0.17
138_G	479_P	1.191	0.17
302_P	477_D	1.183	0.16
29_I	297_T	1.181	0.16
221_F	437_S	1.181	0.16
341_E	380_K	1.178	0.16
221_F	307_I	1.170	0.16
279_P	407_G	1.167	0.16
85_E	111_K	1.166	0.16
230_F	423_I	1.164	0.16
141_I	211_L	1.159	0.16
239_E	438_I	1.158	0.16
10_L	36_V	1.151	0.16
90_L	199_Y	1.148	0.16
85_E	228_N	1.144	0.16
45_I	133_S	1.137	0.16
72_V	191_V	1.137	0.16
61_L	214_G	1.137	0.16
441_E	445_R	1.133	0.16
151_F	304_L	1.133	0.16
456_Y	476_Q	1.130	0.16
216_R	386_R	1.130	0.16
334_I	449_I	1.129	0.16
154_I	319_I	1.124	0.15
62_P	278_S	1.123	0.15
206_E	223_F	1.122	0.15
257_I	301_I	1.122	0.15
75_V	303_I	1.121	0.15
224_N	342_K	1.121	0.15
312_E	320_G	1.120	0.15
163_L	413_V	1.119	0.15
39_L	42_T	1.119	0.15
104_S	315_D	1.116	0.15
224_N	308_L	1.112	0.15
73_E	321_M	1.108	0.15
308_L	352_V	1.102	0.15
20_K	394_I	1.099	0.15
141_I	187_V	1.095	0.15
45_I	80_T	1.094	0.15
15_L	29_I	1.092	0.15
127_E	359_I	1.090	0.15
62_P	90_L	1.080	0.15
42_T	223_F	1.079	0.15
210_E	410_K	1.077	0.15
318_S	461_L	1.076	0.15
60_L	276_V	1.075	0.15
194_L	227_E	1.073	0.15
256_T	342_K	1.072	0.15
313_L	358_M	1.071	0.15
207_S	210_E	1.069	0.15
36_V	113_I	1.068	0.15
123_L	394_I	1.067	0.15
87_A	149_R	1.064	0.15
89_D	204_D	1.063	0.15
244_V	465_E	1.062	0.15
452_E	477_D	1.058	0.14
49_L	135_E	1.058	0.14
306_G	313_L	1.050	0.14
36_V	189_N	1.050	0.14
79_R	140_K	1.042	0.14
151_F	223_F	1.041	0.14
39_L	174_V	1.041	0.14
3_V	420_V	1.036	0.14
72_V	81_F	1.031	0.14
45_I	61_L	1.029	0.14
43_K	191_V	1.028	0.14
102_Q	431_K	1.026	0.14
5_V	324_L	1.021	0.14
113_I	477_D	1.004	0.14
74_E	124_R	1.003	0.14
4_L	337_L	1.002	0.14
197_Y	321_M	1.000	0.14
2_K	296_E	1.000	0.14
152_L	213_E	0.999	0.14
66_Y	214_G	0.998	0.14
306_G	382_K	0.996	0.14
5_V	354_Q	0.996	0.14
236_I	239_E	0.981	0.13
36_V	316_A	0.981	0.13
309_N	382_K	0.978	0.13
94_I	435_G	0.978	0.13
127_E	246_P	0.977	0.13
321_M	332_L	0.975	0.13
39_L	205_A	0.975	0.13
275_P	383_R	0.971	0.13
82_K	472_K	0.971	0.13
142_T	224_N	0.968	0.13
229_N	244_V	0.967	0.13
56_A	229_N	0.967	0.13
370_K	382_K	0.965	0.13
466_I	472_K	0.965	0.13
100_G	106_T	0.964	0.13
150_I	451_K	0.960	0.13
246_P	481_F	0.959	0.13
49_L	455_V	0.959	0.13
362_A	479_P	0.957	0.13
91_P	468_Y	0.953	0.13
324_L	391_A	0.951	0.13
85_E	278_S	0.947	0.13
165_R	207_S	0.945	0.13
152_L	233_L	0.944	0.13
359_I	421_E	0.942	0.13
369_P	372_I	0.941	0.13
37_A	246_P	0.941	0.13
106_T	261_K	0.938	0.13
202_G	365_E	0.937	0.13
37_A	204_D	0.930	0.13
109_A	310_V	0.930	0.13
73_E	141_I	0.929	0.13
437_S	440_R	0.927	0.13
172_V	336_N	0.927	0.13
222_V	468_Y	0.927	0.13
290_G	439_G	0.926	0.13
90_L	106_T	0.926	0.13
2_K	307_I	0.922	0.13
63_G	341_E	0.920	0.13
4_L	371_D	0.919	0.13
16_S	31_V	0.919	0.13
256_T	275_P	0.919	0.13
142_T	155_D	0.916	0.13
119_I	304_L	0.914	0.12
202_G	352_V	0.913	0.12
204_D	358_M	0.911	0.12
150_I	356_T	0.907	0.12
74_E	211_L	0.904	0.12
163_L	469_Q	0.903	0.12
103_L	264_K	0.901	0.12
163_L	201_V	0.900	0.12
346_R	471_D	0.900	0.12
100_G	338_L	0.898	0.12
31_V	384_R	0.897	0.12
89_D	315_D	0.891	0.12
263_A	353_S	0.891	0.12
39_L	273_A	0.891	0.12
9_T	436_L	0.889	0.12
154_I	205_A	0.887	0.12
335_S	454_A	0.882	0.12
79_R	244_V	0.881	0.12
147_P	210_E	0.881	0.12
83_G	267_G	0.880	0.12
63_G	456_Y	0.879	0.12
240_A	451_K	0.879	0.12
340_M	365_E	0.876	0.12
340_M	367_R	0.875	0.12
64_L	352_V	0.873	0.12
100_G	434_D	0.872	0.12
300_D	383_R	0.870	0.12
268_F	359_I	0.869	0.12
209_R	216_R	0.868	0.12
230_F	400_E	0.866	0.12
62_P	67_G	0.863	0.12
304_L	336_N	0.862	0.12
59_I	408_F	0.862	0.12
192_K	201_V	0.861	0.12
318_S	411_I	0.859	0.12
226_N	241_A	0.858	0.12
9_T	81_F	0.857	0.12
8_G	352_V	0.857	0.12
11_A	474_Y	0.857	0.12
302_P	465_E	0.856	0.12
233_L	242_F	0.853	0.12
175_L	475_I	0.852	0.12
5_V	321_M	0.852	0.12
369_P	407_G	0.849	0.12
178_P	214_G	0.849	0.12
430_I	438_I	0.848	0.12
83_G	108_S	0.847	0.12
358_M	375_D	0.846	0.12
174_V	367_R	0.845	0.12
62_P	93_V	0.841	0.12
90_L	185_D	0.840	0.12
155_D	202_G	0.834	0.11
323_A	329_A	0.833	0.11
38_S	328_I	0.829	0.11
33_N	48_N	0.828	0.11
101_I	270_K	0.827	0.11
150_I	304_L	0.825	0.11
42_T	174_V	0.825	0.11
158_Q	290_G	0.823	0.11
39_L	142_T	0.822	0.11
60_L	81_F	0.819	0.11
188_K	270_K	0.817	0.11
224_N	347_W	0.816	0.11
315_D	373_G	0.815	0.11
333_G	407_G	0.814	0.11
280_P	440_R	0.811	0.11
58_Y	79_R	0.811	0.11
183_D	234_E	0.810	0.11
154_I	162_K	0.809	0.11
16_S	366_N	0.808	0.11
172_V	449_I	0.807	0.11
104_S	306_G	0.806	0.11
380_K	461_L	0.805	0.11
229_N	273_A	0.805	0.11
45_I	146_P	0.804	0.11
163_L	446_V	0.804	0.11
254_E	392_D	0.803	0.11
28_E	441_E	0.803	0.11
62_P	110_D	0.802	0.11
406_T	470_L	0.802	0.11
219_A	462_A	0.802	0.11
399_I	463_K	0.795	0.11
293_Y	296_E	0.795	0.11
203_I	435_G	0.794	0.11
394_I	415_E	0.794	0.11
87_A	142_T	0.794	0.11
158_Q	202_G	0.794	0.11
223_F	304_L	0.790	0.11
34_Y	265_Q	0.788	0.11
430_I	446_V	0.788	0.11
126_M	452_E	0.787	0.11
264_K	301_I	0.787	0.11
58_Y	90_L	0.787	0.11
381_D	410_K	0.786	0.11
437_S	445_R	0.784	0.11
45_I	65_V	0.784	0.11
217_A	402_E	0.784	0.11
204_D	309_N	0.783	0.11
146_P	174_V	0.782	0.11
108_S	303_I	0.782	0.11
5_V	108_S	0.780	0.11
6_V	340_M	0.780	0.11
43_K	94_I	0.780	0.11
263_A	270_K	0.779	0.11
27_V	192_K	0.779	0.11
257_I	298_L	0.778	0.11
446_V	451_K	0.778	0.11
123_L	130_A	0.778	0.11
5_V	316_A	0.777	0.11
460_E	464_A	0.776	0.11
453_H	464_A	0.776	0.11
453_H	460_E	0.776	0.11
253_G	389_F	0.774	0.11
261_K	328_I	0.774	0.11
11_A	82_K	0.772	0.11
125_K	270_K	0.772	0.11
169_N	224_N	0.771	0.11
205_A	294_V	0.769	0.11
344_K	380_K	0.768	0.11
353_S	394_I	0.764	0.11
264_K	416_D	0.761	0.11
39_L	440_R	0.759	0.11
374_I	393_V	0.758	0.11
191_V	195_V	0.758	0.11
150_I	408_F	0.758	0.11
175_L	411_I	0.757	0.11
167_R	416_D	0.755	0.11
157_K	383_R	0.753	0.11
210_E	252_R	0.752	0.11
137_N	141_I	0.751	0.11
142_T	339_I	0.751	0.11
195_V	362_A	0.750	0.11
141_I	212_K	0.748	0.10
55_D	379_L	0.748	0.10
192_K	296_E	0.747	0.10
19_A	375_D	0.746	0.10
292_K	438_I	0.746	0.10
3_V	348_S	0.745	0.10
204_D	308_L	0.743	0.10
5_V	73_E	0.741	0.10
69_A	143_T	0.741	0.10
201_V	288_I	0.740	0.10
207_S	276_V	0.740	0.10
169_N	349_S	0.739	0.10
174_V	308_L	0.739	0.10
45_I	247_F	0.737	0.10
334_I	433_K	0.736	0.10
165_R	345_T	0.736	0.10
102_Q	154_I	0.735	0.10
192_K	428_I	0.734	0.10
33_N	311_T	0.733	0.10
8_G	370_K	0.733	0.10
18_V	413_V	0.733	0.10
223_F	361_V	0.732	0.10
162_K	436_L	0.732	0.10
153_E	312_E	0.732	0.10
104_S	382_K	0.729	0.10
163_L	333_G	0.729	0.10
146_P	149_R	0.726	0.10
59_I	241_A	0.724	0.10
60_L	394_I	0.722	0.10
81_F	139_I	0.722	0.10
85_E	110_D	0.722	0.10
179_V	290_G	0.722	0.10
59_I	194_L	0.721	0.10
116_M	258_D	0.720	0.10
311_T	322_N	0.719	0.10
118_N	258_D	0.719	0.10
84_T	152_L	0.717	0.10
83_G	470_L	0.716	0.10
127_E	477_D	0.714	0.10
160_F	394_I	0.713	0.10
417_G	433_K	0.712	0.10
89_D	176_G	0.711	0.10
12_A	116_M	0.709	0.10
156_N	263_A	0.708	0.10
75_V	452_E	0.708	0.10
31_V	39_L	0.707	0.10
176_G	287_S	0.707	0.10
136_I	353_S	0.707	0.10
191_V	217_A	0.707	0.10
31_V	157_K	0.707	0.10
371_D	382_K	0.705	0.10
34_Y	47_E	0.702	0.10
127_E	302_P	0.701	0.10
123_L	305_M	0.701	0.10
21_N	185_D	0.700	0.10
193_Q	433_K	0.698	0.10
82_K	146_P	0.697	0.10
163_L	441_E	0.697	0.10
83_G	311_T	0.696	0.10
302_P	362_A	0.694	0.10
11_A	218_G	0.693	0.10
150_I	466_I	0.693	0.10
80_T	83_G	0.689	0.10
274_D	287_S	0.688	0.10
201_V	211_L	0.688	0.10
59_I	348_S	0.688	0.10
168_K	478_K	0.688	0.10
210_E	481_F	0.685	0.10
58_Y	81_F	0.685	0.10
244_V	313_L	0.685	0.10
103_L	354_Q	0.682	0.10
257_I	293_Y	0.680	0.10
292_K	296_E	0.678	0.10
436_L	462_A	0.678	0.10
149_R	210_E	0.678	0.10
225_L	263_A	0.677	0.10
82_K	112_I	0.676	0.10
307_I	375_D	0.673	0.10
466_I	477_D	0.672	0.10
246_P	370_K	0.672	0.10
68_D	477_D	0.671	0.10
183_D	189_N	0.670	0.10
330_G	359_I	0.670	0.10
89_D	382_K	0.669	0.10
410_K	470_L	0.669	0.10
39_L	459_Y	0.665	0.10
315_D	358_M	0.662	0.10
288_I	332_L	0.662	0.10
203_I	465_E	0.661	0.10
38_S	261_K	0.658	0.10
166_I	201_V	0.658	0.10
165_R	401_P	0.655	0.09
124_R	235_E	0.653	0.09
93_V	215_V	0.653	0.09
134_F	141_I	0.652	0.09
222_V	431_K	0.649	0.09
65_V	226_N	0.648	0.09
102_Q	276_V	0.648	0.09
103_L	420_V	0.646	0.09
209_R	233_L	0.646	0.09
40_M	291_Y	0.646	0.09
468_Y	471_D	0.646	0.09
69_A	472_K	0.645	0.09
147_P	425_K	0.645	0.09
272_I	444_R	0.645	0.09
289_I	296_E	0.644	0.09
86_E	149_R	0.644	0.09
313_L	382_K	0.642	0.09
184_L	471_D	0.642	0.09
154_I	300_D	0.641	0.09
287_S	458_G	0.641	0.09
87_A	352_V	0.640	0.09
282_R	368_L	0.639	0.09
199_Y	203_I	0.638	0.09
372_I	385_F	0.637	0.09
149_R	247_F	0.637	0.09
61_L	431_K	0.632	0.09
42_T	342_K	0.632	0.09
63_G	476_Q	0.632	0.09
229_N	313_L	0.632	0.09
379_L	415_E	0.631	0.09
62_P	83_G	0.630	0.09
22_I	101_I	0.628	0.09
49_L	191_V	0.628	0.09
160_F	352_V	0.626	0.09
204_D	246_P	0.625	0.09
365_E	447_K	0.625	0.09
45_I	154_I	0.625	0.09
39_L	339_I	0.621	0.09
178_P	276_V	0.620	0.09
117_D	232_E	0.620	0.09
9_T	280_P	0.619	0.09
375_D	472_K	0.618	0.09
139_I	210_E	0.617	0.09
16_S	62_P	0.617	0.09
9_T	55_D	0.617	0.09
306_G	381_D	0.617	0.09
94_I	241_A	0.615	0.09
401_P	450_S	0.614	0.09
441_E	479_P	0.612	0.09
147_P	207_S	0.612	0.09
42_T	459_Y	0.611	0.09
148_F	229_N	0.610	0.09
161_E	198_G	0.608	0.09
257_I	297_T	0.607	0.09
2_K	118_N	0.606	0.09
66_Y	178_P	0.606	0.09
70_K	393_V	0.604	0.09
32_L	75_V	0.602	0.09
348_S	411_I	0.601	0.09
374_I	410_K	0.600	0.09
36_V	291_Y	0.600	0.09
220_S	224_N	0.600	0.09
82_K	425_K	0.599	0.09
321_M	471_D	0.598	0.09
205_A	260_V	0.598	0.09
253_G	470_L	0.597	0.09
52_T	271_L	0.596	0.09
418_F	471_D	0.596	0.09
140_K	212_K	0.595	0.09
62_P	108_S	0.594	0.09
353_S	357_K	0.594	0.09
219_A	469_Q	0.592	0.09
204_D	224_N	0.590	0.09
104_S	345_T	0.590	0.09
169_N	256_T	0.589	0.09
16_S	239_E	0.589	0.09
55_D	399_I	0.588	0.09
340_M	465_E	0.587	0.09
358_M	370_K	0.586	0.09
82_K	381_D	0.586	0.09
66_Y	469_Q	0.586	0.09
239_E	442_L	0.584	0.09
139_I	179_V	0.584	0.09
36_V	183_D	0.583	0.09
442_L	447_K	0.582	0.09
370_K	381_D	0.582	0.09
223_F	246_P	0.581	0.09
11_A	68_D	0.581	0.09
61_L	197_Y	0.580	0.09
43_K	49_L	0.580	0.09
124_R	161_E	0.579	0.09
219_A	424_G	0.579	0.09
148_F	205_A	0.579	0.09
275_P	371_D	0.579	0.09
56_A	163_L	0.578	0.09
152_L	156_N	0.578	0.09
374_I	430_I	0.577	0.09
69_A	80_T	0.577	0.09
45_I	149_R	0.576	0.09
278_S	345_T	0.575	0.09
58_Y	211_L	0.574	0.09
214_G	478_K	0.574	0.09
187_V	329_A	0.573	0.09
317_D	351_E	0.573	0.09
268_F	305_M	0.571	0.09
268_F	324_L	0.569	0.09
124_R	128_E	0.569	0.09
87_A	174_V	0.569	0.09
202_G	308_L	0.568	0.09
229_N	465_E	0.567	0.09
188_K	296_E	0.566	0.09
222_V	428_I	0.565	0.09
354_Q	357_K	0.565	0.09
259_L	304_L	0.564	0.09
93_V	468_Y	0.563	0.09
233_L	304_L	0.562	0.09
40_M	66_Y	0.561	0.09
341_E	456_Y	0.560	0.09
60_L	365_E	0.559	0.09
157_K	339_I	0.558	0.09
15_L	27_V	0.558	0.09
368_L	478_K	0.557	0.09
75_V	427_K	0.556	0.09
91_P	212_K	0.555	0.09
61_L	65_V	0.554	0.09
156_N	224_N	0.553	0.09
342_K	347_W	0.553	0.09
70_K	94_I	0.550	0.08
192_K	217_A	0.549	0.08
82_K	149_R	0.549	0.08
69_A	82_K	0.549	0.08
128_E	444_R	0.549	0.08
295_R	379_L	0.546	0.08
62_P	218_G	0.546	0.08
126_M	241_A	0.545	0.08
142_T	308_L	0.543	0.08
156_N	347_W	0.541	0.08
302_P	407_G	0.540	0.08
63_G	380_K	0.540	0.08
204_D	373_G	0.539	0.08
404_D	449_I	0.538	0.08
292_K	390_N	0.538	0.08
77_G	267_G	0.537	0.08
51_Q	102_Q	0.537	0.08
181_H	207_S	0.536	0.08
153_E	176_G	0.535	0.08
280_P	324_L	0.534	0.08
164_D	415_E	0.534	0.08
120_E	372_I	0.533	0.08
33_N	68_D	0.531	0.08
116_M	231_E	0.530	0.08
318_S	467_A	0.529	0.08
42_T	308_L	0.529	0.08
37_A	306_G	0.528	0.08
27_V	259_L	0.528	0.08
441_E	481_F	0.527	0.08
123_L	448_D	0.527	0.08
407_G	449_I	0.525	0.08
43_K	123_L	0.524	0.08
147_P	181_H	0.522	0.08
98_K	273_A	0.521	0.08
57_D	63_G	0.519	0.08
97_L	105_T	0.518	0.08
375_D	423_I	0.518	0.08
240_A	437_S	0.517	0.08
136_I	264_K	0.517	0.08
202_G	340_M	0.516	0.08
27_V	236_I	0.516	0.08
33_N	79_R	0.515	0.08
113_I	455_V	0.515	0.08
161_E	400_E	0.512	0.08
116_M	285_V	0.512	0.08
88_W	449_I	0.512	0.08
272_I	440_R	0.512	0.08
304_L	408_F	0.511	0.08
147_P	252_R	0.510	0.08
184_L	357_K	0.509	0.08
68_D	72_V	0.509	0.08
80_T	210_E	0.509	0.08
148_F	339_I	0.508	0.08
327_A	359_I	0.508	0.08
335_S	353_S	0.507	0.08
17_E	397_R	0.506	0.08
12_A	435_G	0.505	0.08
140_K	259_L	0.504	0.08
151_F	408_F	0.504	0.08
260_V	294_V	0.504	0.08
398_R	429_T	0.503	0.08
84_T	90_L	0.501	0.08
73_E	77_G	0.501	0.08
127_E	408_F	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4s39A	2	0.6265	100	0.815	Contact Map
4mwaA	4	0.4558	100	0.834	Contact Map
3noyA	2	0.5924	100	0.846	Contact Map
2yciX	2	0.4699	100	0.847	Contact Map
4o1eA	2	0.4679	100	0.852	Contact Map
4cczA	1	0.6667	100	0.855	Contact Map
3k13A	1	0.4699	100	0.859	Contact Map
2dqwA	2	0.4297	100	0.859	Contact Map
1f6yA	2	0.4458	100	0.86	Contact Map
2y5sA	2	0.4578	99.9	0.861	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0129 seconds.