Q97W25 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97W25 - AAA family ATPase

UniProt:	Q97W25	Sequences: MIEPVLNLAIIFISLAVLVIILMKIFGKSTAKFAYSDKALQLQNKSQKKKVEIEDKKITWDDIGGYEDAKKEIREYIELPLKNKDVATKYGLKPPKGMLLFGPPGCGKTMMMRALANESKLNFLYVNISDIMSKWYGESEARLRELFNNARKNAPCILFFDEIDTIGVKRESHTGDSVTPRLLSLMLSEIDGLHSEDGVIVVGSTNVPQMLDKALLRAGRFDKLIYIGPPNKEARKQILQIHCRGKPLAEDVDFDKLAEITERYSGADLANLCQEAARKVASEAIEKGADRKITMADFIELIKKYKPSITLQMIEDYEKFRLDFERRVRKGEEENELEEKLTLNDIGGYNEIKTELKELLELQLYHYKLLEQLRVPPIRGILLYGPPGVGKTMMAKALAKTLNVKLIALSGAEIMYKGYEGAIAAIKEVFNRARENKPAIILLDELDAIASKRSYKSYGDSSKIVNQLLTEMDGIRSLKEVVVIGTTNRLKAIDPALLRPGRFDKIIHMPLPNREERLDILMKYIGKEECEKVDCGILADQTEGYSGADLAALAREAKMKVLKSILRGESNRTLTREDLIDALNKIHPSVKKRLSKGSSSNSDHETR	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	607 (495)
Sequences:	337 (214)
Seq/√Len:	9.6

SULSO - Q97W25

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
480_E	484_I	3.988	0.99
340_K	344_N	3.605	0.97
344_N	347_G	3.361	0.96
339_E	344_N	3.140	0.94
479_K	484_I	3.135	0.94
319_K	326_R	3.017	0.92
364_L	369_L	2.912	0.91
481_V	484_I	2.875	0.90
365_Y	369_L	2.857	0.90
325_E	329_R	2.833	0.89
346_I	353_K	2.756	0.88
341_L	344_N	2.753	0.88
364_L	371_E	2.593	0.85
344_N	351_E	2.576	0.84
344_N	349_Y	2.507	0.83
320_F	327_R	2.499	0.82
347_G	351_E	2.486	0.82
551_A	555_R	2.477	0.82
236_K	255_D	2.419	0.80
548_A	551_A	2.395	0.79
409_L	433_A	2.373	0.79
548_A	554_A	2.345	0.78
346_I	351_E	2.336	0.78
346_I	350_N	2.336	0.78
342_T	346_I	2.335	0.78
124_L	153_N	2.312	0.77
345_D	348_G	2.286	0.76
420_E	425_A	2.281	0.76
347_G	353_K	2.269	0.75
148_N	293_I	2.209	0.73
340_K	351_E	2.175	0.72
481_V	485_G	2.133	0.71
484_I	488_N	2.114	0.70
347_G	352_I	2.080	0.69
92_L	471_E	2.073	0.68
443_L	483_V	2.064	0.68
346_I	349_Y	2.049	0.67
352_I	355_E	2.047	0.67
546_S	552_A	2.028	0.67
551_A	554_A	2.027	0.67
338_E	341_L	1.997	0.65
538_L	549_D	1.983	0.65
350_N	353_K	1.940	0.63
344_N	348_G	1.924	0.62
342_T	348_G	1.909	0.62
493_I	503_F	1.908	0.62
338_E	347_G	1.907	0.62
317_Y	320_F	1.900	0.61
320_F	328_V	1.882	0.61
340_K	345_D	1.878	0.60
355_E	359_L	1.858	0.59
359_L	362_L	1.836	0.59
96_K	225_I	1.834	0.58
196_E	204_S	1.831	0.58
59_T	62_D	1.816	0.58
493_I	496_A	1.809	0.57
395_A	461_S	1.808	0.57
119_S	131_I	1.801	0.57
547_G	551_A	1.787	0.56
87_A	280_V	1.780	0.56
320_F	326_R	1.779	0.56
348_G	351_E	1.756	0.55
552_A	555_R	1.753	0.55
549_D	555_R	1.749	0.55
543_E	555_R	1.748	0.55
546_S	549_D	1.744	0.54
338_E	346_I	1.734	0.54
68_D	231_N	1.724	0.54
349_Y	352_I	1.722	0.53
340_K	346_I	1.711	0.53
240_Q	254_F	1.709	0.53
240_Q	251_D	1.705	0.53
408_A	509_M	1.699	0.52
480_E	485_G	1.691	0.52
546_S	553_L	1.688	0.52
284_A	383_L	1.687	0.52
237_Q	240_Q	1.686	0.52
339_E	346_I	1.683	0.52
69_A	111_M	1.671	0.51
319_K	327_R	1.664	0.51
350_N	355_E	1.663	0.51
86_V	281_A	1.637	0.50
547_G	554_A	1.634	0.50
283_E	297_D	1.631	0.49
426_I	464_I	1.628	0.49
317_Y	328_V	1.627	0.49
386_P	440_I	1.625	0.49
105_G	108_K	1.624	0.49
533_V	536_G	1.618	0.49
338_E	345_D	1.602	0.48
102_G	107_G	1.600	0.48
481_V	487_T	1.587	0.47
315_E	327_R	1.587	0.47
548_A	555_R	1.576	0.47
339_E	342_T	1.571	0.47
154_A	198_G	1.568	0.47
315_E	320_F	1.564	0.46
345_D	354_T	1.562	0.46
479_K	485_G	1.545	0.46
313_M	326_R	1.545	0.46
339_E	348_G	1.540	0.45
340_K	348_G	1.539	0.45
347_G	350_N	1.532	0.45
317_Y	327_R	1.529	0.45
549_D	552_A	1.527	0.45
180_P	193_L	1.523	0.45
346_I	352_I	1.504	0.44
244_R	519_D	1.500	0.44
341_L	351_E	1.496	0.43
56_K	86_V	1.495	0.43
313_M	317_Y	1.491	0.43
321_R	327_R	1.487	0.43
460_D	464_I	1.483	0.43
339_E	347_G	1.483	0.43
105_G	109_T	1.483	0.43
365_Y	371_E	1.463	0.42
544_G	549_D	1.447	0.41
317_Y	326_R	1.446	0.41
547_G	553_L	1.440	0.41
319_K	328_V	1.429	0.40
341_L	346_I	1.424	0.40
544_G	551_A	1.423	0.40
341_L	347_G	1.411	0.40
547_G	555_R	1.401	0.39
448_A	469_L	1.401	0.39
394_M	398_L	1.401	0.39
325_E	333_E	1.398	0.39
143_L	272_L	1.391	0.39
549_D	554_A	1.390	0.39
542_T	546_S	1.389	0.39
345_D	351_E	1.387	0.39
67_E	71_K	1.377	0.38
314_I	318_E	1.376	0.38
314_I	319_K	1.370	0.38
517_R	521_L	1.364	0.38
547_G	550_L	1.364	0.38
512_P	517_R	1.360	0.37
131_I	152_K	1.357	0.37
402_L	433_A	1.357	0.37
549_D	553_L	1.357	0.37
355_E	362_L	1.356	0.37
493_I	502_R	1.356	0.37
541_Q	544_G	1.355	0.37
225_I	430_F	1.350	0.37
147_F	201_V	1.344	0.37
534_D	551_A	1.339	0.37
210_M	475_I	1.338	0.37
469_L	481_V	1.338	0.37
272_L	434_R	1.338	0.37
461_S	469_L	1.338	0.37
402_L	409_L	1.333	0.36
548_A	552_A	1.330	0.36
102_G	108_K	1.329	0.36
102_G	105_G	1.329	0.36
546_S	555_R	1.329	0.36
544_G	548_A	1.324	0.36
313_M	319_K	1.321	0.36
534_D	549_D	1.317	0.36
542_T	549_D	1.310	0.35
338_E	344_N	1.303	0.35
351_E	355_E	1.299	0.35
86_V	121_L	1.298	0.35
313_M	321_R	1.296	0.35
100_L	213_K	1.295	0.35
151_R	154_A	1.294	0.35
363_Q	366_H	1.280	0.34
71_K	152_K	1.279	0.34
139_S	154_A	1.276	0.34
119_S	124_L	1.274	0.34
87_A	476_R	1.274	0.34
533_V	537_I	1.272	0.34
69_A	117_N	1.271	0.34
362_L	369_L	1.268	0.34
342_T	347_G	1.267	0.34
56_K	281_A	1.266	0.34
129_S	199_V	1.264	0.34
96_K	471_E	1.259	0.33
341_L	345_D	1.257	0.33
292_K	296_A	1.253	0.33
118_E	149_N	1.247	0.33
537_I	540_D	1.246	0.33
479_K	488_N	1.243	0.33
342_T	349_Y	1.241	0.33
139_S	198_G	1.241	0.33
313_M	320_F	1.240	0.33
100_L	278_R	1.233	0.32
87_A	480_E	1.227	0.32
69_A	468_L	1.223	0.32
345_D	350_N	1.215	0.32
301_L	468_L	1.212	0.31
161_D	220_R	1.211	0.31
291_R	416_Y	1.205	0.31
362_L	365_Y	1.201	0.31
538_L	547_G	1.199	0.31
526_G	529_E	1.196	0.31
232_K	259_E	1.195	0.31
102_G	109_T	1.195	0.31
51_V	120_K	1.185	0.30
310_T	433_A	1.185	0.30
101_F	226_Y	1.181	0.30
87_A	448_A	1.173	0.30
341_L	348_G	1.171	0.30
130_D	150_A	1.168	0.30
342_T	345_D	1.168	0.30
447_D	461_S	1.162	0.30
404_V	433_A	1.161	0.30
340_K	350_N	1.160	0.29
91_G	416_Y	1.156	0.29
547_G	552_A	1.155	0.29
534_D	546_S	1.149	0.29
175_G	179_T	1.147	0.29
296_A	460_D	1.144	0.29
350_N	356_L	1.143	0.29
355_E	358_E	1.139	0.29
58_I	452_K	1.136	0.29
416_Y	434_R	1.131	0.28
398_L	499_R	1.130	0.28
539_A	542_T	1.124	0.28
344_N	354_T	1.124	0.28
89_K	280_V	1.122	0.28
253_D	256_K	1.121	0.28
352_I	357_K	1.121	0.28
262_E	308_S	1.120	0.28
210_M	437_K	1.120	0.28
208_P	265_S	1.115	0.28
544_G	555_R	1.115	0.28
350_N	362_L	1.113	0.28
480_E	488_N	1.110	0.28
543_E	546_S	1.105	0.27
545_Y	548_A	1.104	0.27
251_D	508_H	1.102	0.27
351_E	356_L	1.101	0.27
350_N	354_T	1.093	0.27
176_D	200_I	1.091	0.27
539_A	547_G	1.090	0.27
332_E	344_N	1.089	0.27
317_Y	321_R	1.088	0.27
68_D	71_K	1.086	0.27
237_Q	440_I	1.085	0.27
334_E	446_L	1.084	0.27
321_R	326_R	1.082	0.27
124_L	433_A	1.082	0.27
548_A	553_L	1.080	0.27
128_I	146_L	1.078	0.27
522_M	526_G	1.073	0.26
340_K	356_L	1.072	0.26
63_I	429_V	1.069	0.26
355_E	363_Q	1.068	0.26
534_D	539_A	1.066	0.26
279_K	403_N	1.065	0.26
538_L	548_A	1.062	0.26
378_I	472_M	1.056	0.26
339_E	343_L	1.053	0.26
149_N	154_A	1.050	0.26
348_G	353_K	1.049	0.26
445_E	474_G	1.045	0.25
434_R	487_T	1.043	0.25
314_I	320_F	1.040	0.25
171_E	432_R	1.037	0.25
71_K	478_L	1.032	0.25
343_L	349_Y	1.028	0.25
353_K	356_L	1.027	0.25
336_E	495_P	1.026	0.25
286_E	289_A	1.019	0.24
274_Q	434_R	1.018	0.24
69_A	87_A	1.016	0.24
184_S	283_E	1.015	0.24
470_T	486_T	1.013	0.24
384_Y	515_E	1.011	0.24
335_N	344_N	1.011	0.24
253_D	295_M	1.010	0.24
117_N	486_T	1.008	0.24
373_L	468_L	1.008	0.24
193_L	265_S	1.005	0.24
264_Y	354_T	1.004	0.24
344_N	359_L	1.003	0.24
475_I	509_M	1.001	0.24
321_R	328_V	1.000	0.24
413_E	434_R	0.998	0.24
63_I	488_N	0.993	0.24
143_L	234_A	0.993	0.24
193_L	282_S	0.990	0.24
543_E	548_A	0.987	0.23
546_S	551_A	0.984	0.23
342_T	351_E	0.982	0.23
497_L	502_R	0.980	0.23
484_I	489_R	0.980	0.23
421_G	462_S	0.975	0.23
360_L	365_Y	0.972	0.23
88_T	101_F	0.971	0.23
291_R	441_I	0.965	0.23
325_E	328_V	0.961	0.23
122_N	148_N	0.955	0.22
91_G	310_T	0.952	0.22
237_Q	461_S	0.948	0.22
315_E	319_K	0.946	0.22
542_T	548_A	0.945	0.22
69_A	378_I	0.945	0.22
338_E	342_T	0.942	0.22
469_L	474_G	0.940	0.22
410_S	428_E	0.940	0.22
534_D	537_I	0.937	0.22
201_V	309_I	0.935	0.22
534_D	540_D	0.933	0.22
395_A	418_G	0.930	0.22
526_G	533_V	0.929	0.22
534_D	555_R	0.928	0.22
364_L	462_S	0.926	0.22
339_E	350_N	0.926	0.22
424_A	486_T	0.926	0.22
363_Q	368_K	0.924	0.21
265_S	308_S	0.922	0.21
89_K	502_R	0.922	0.21
343_L	513_N	0.922	0.21
313_M	328_V	0.920	0.21
62_D	68_D	0.917	0.21
96_K	101_F	0.914	0.21
53_I	437_K	0.914	0.21
545_Y	549_D	0.913	0.21
460_D	463_K	0.913	0.21
239_L	254_F	0.913	0.21
78_E	86_V	0.910	0.21
77_I	394_M	0.909	0.21
129_S	155_P	0.908	0.21
340_K	352_I	0.905	0.21
338_E	351_E	0.900	0.21
532_K	536_G	0.899	0.21
542_T	547_G	0.897	0.21
538_L	546_S	0.897	0.21
448_A	488_N	0.889	0.20
539_A	548_A	0.889	0.20
62_D	475_I	0.888	0.20
338_E	349_Y	0.888	0.20
138_E	143_L	0.887	0.20
119_S	433_A	0.881	0.20
301_L	429_V	0.880	0.20
313_M	327_R	0.872	0.20
484_I	487_T	0.872	0.20
485_G	488_N	0.871	0.20
208_P	226_Y	0.868	0.20
57_K	486_T	0.868	0.20
472_M	509_M	0.866	0.20
146_L	222_D	0.862	0.20
335_N	339_E	0.861	0.20
380_G	472_M	0.858	0.20
169_K	209_Q	0.855	0.19
71_K	416_Y	0.853	0.19
195_S	409_L	0.852	0.19
364_L	367_Y	0.851	0.19
347_G	358_E	0.851	0.19
542_T	545_Y	0.849	0.19
151_R	180_P	0.848	0.19
322_L	526_G	0.846	0.19
271_N	399_A	0.845	0.19
101_F	265_S	0.845	0.19
133_S	143_L	0.844	0.19
62_D	394_M	0.843	0.19
368_K	371_E	0.842	0.19
345_D	349_Y	0.842	0.19
464_I	514_R	0.842	0.19
225_I	468_L	0.841	0.19
198_G	208_P	0.836	0.19
343_L	347_G	0.831	0.19
349_Y	353_K	0.830	0.19
167_G	171_E	0.828	0.19
534_D	553_L	0.828	0.19
340_K	347_G	0.827	0.19
182_L	194_H	0.827	0.19
420_E	428_E	0.826	0.19
394_M	413_E	0.824	0.19
420_E	447_D	0.824	0.19
314_I	324_F	0.823	0.19
100_L	180_P	0.822	0.19
247_P	504_D	0.817	0.18
254_F	522_M	0.817	0.18
149_N	198_G	0.814	0.18
165_T	194_H	0.812	0.18
242_H	256_K	0.812	0.18
537_I	541_Q	0.811	0.18
398_L	461_S	0.811	0.18
200_I	234_A	0.806	0.18
542_T	552_A	0.804	0.18
120_K	176_D	0.802	0.18
78_E	210_M	0.802	0.18
129_S	146_L	0.800	0.18
52_E	198_G	0.798	0.18
497_L	504_D	0.793	0.18
303_K	352_I	0.793	0.18
250_E	396_K	0.793	0.18
433_A	468_L	0.791	0.18
381_I	504_D	0.790	0.18
265_S	282_S	0.790	0.18
371_E	416_Y	0.789	0.18
347_G	359_L	0.789	0.18
543_E	553_L	0.789	0.18
87_A	468_L	0.787	0.18
350_N	357_K	0.786	0.18
292_K	447_D	0.785	0.18
159_F	214_A	0.784	0.18
139_S	417_K	0.784	0.18
420_E	423_I	0.783	0.18
210_M	247_P	0.782	0.17
314_I	317_Y	0.781	0.17
402_L	473_D	0.780	0.17
364_L	368_K	0.780	0.17
366_H	370_L	0.779	0.17
290_D	302_I	0.779	0.17
519_D	522_M	0.779	0.17
141_A	428_E	0.779	0.17
133_S	307_P	0.778	0.17
408_A	483_V	0.776	0.17
320_F	325_E	0.775	0.17
172_S	379_R	0.773	0.17
270_A	282_S	0.773	0.17
125_Y	307_P	0.772	0.17
332_E	335_N	0.771	0.17
159_F	220_R	0.770	0.17
392_T	486_T	0.769	0.17
262_E	282_S	0.766	0.17
333_E	343_L	0.765	0.17
100_L	103_P	0.765	0.17
249_A	254_F	0.765	0.17
292_K	400_K	0.764	0.17
141_A	425_A	0.759	0.17
348_G	352_I	0.757	0.17
473_D	488_N	0.757	0.17
403_N	436_N	0.755	0.17
532_K	541_Q	0.755	0.17
211_L	412_A	0.754	0.17
418_G	428_E	0.754	0.17
325_E	394_M	0.753	0.17
339_E	345_D	0.752	0.17
436_N	472_M	0.750	0.17
322_L	412_A	0.747	0.17
359_L	365_Y	0.747	0.17
106_C	110_M	0.746	0.17
177_S	273_C	0.746	0.17
536_G	539_A	0.745	0.17
52_E	139_S	0.743	0.16
251_D	519_D	0.742	0.16
408_A	474_G	0.741	0.16
193_L	375_V	0.740	0.16
540_D	548_A	0.739	0.16
62_D	131_I	0.739	0.16
89_K	497_L	0.739	0.16
351_E	354_T	0.738	0.16
265_S	407_I	0.737	0.16
211_L	395_A	0.737	0.16
244_R	409_L	0.736	0.16
111_M	245_G	0.732	0.16
208_P	407_I	0.732	0.16
146_L	188_S	0.731	0.16
415_M	425_A	0.730	0.16
291_R	383_L	0.727	0.16
72_E	262_E	0.726	0.16
293_I	507_I	0.725	0.16
88_T	461_S	0.723	0.16
125_Y	209_Q	0.722	0.16
251_D	257_L	0.722	0.16
148_N	155_P	0.721	0.16
100_L	111_M	0.720	0.16
236_K	240_Q	0.719	0.16
202_V	278_R	0.719	0.16
187_L	220_R	0.718	0.16
161_D	187_L	0.718	0.16
290_D	522_M	0.715	0.16
371_E	507_I	0.715	0.16
98_M	269_L	0.713	0.16
533_V	540_D	0.711	0.16
210_M	249_A	0.710	0.16
300_E	401_T	0.710	0.16
320_F	329_R	0.707	0.16
440_I	531_E	0.707	0.16
211_L	428_E	0.705	0.16
451_S	465_V	0.704	0.16
159_F	212_D	0.702	0.15
133_S	298_F	0.700	0.15
352_I	356_L	0.700	0.15
104_P	109_T	0.700	0.15
100_L	107_G	0.698	0.15
429_V	433_A	0.698	0.15
202_V	221_F	0.694	0.15
535_C	543_E	0.692	0.15
421_G	461_S	0.691	0.15
70_K	92_L	0.689	0.15
150_A	176_D	0.688	0.15
334_E	398_L	0.688	0.15
71_K	461_S	0.688	0.15
127_N	132_M	0.685	0.15
429_V	468_L	0.685	0.15
86_V	89_K	0.683	0.15
430_F	434_R	0.679	0.15
542_T	551_A	0.678	0.15
133_S	432_R	0.677	0.15
340_K	354_T	0.676	0.15
347_G	355_E	0.673	0.15
280_V	400_K	0.673	0.15
348_G	354_T	0.673	0.15
413_E	425_A	0.671	0.15
193_L	262_E	0.670	0.15
166_I	273_C	0.670	0.15
344_N	353_K	0.669	0.15
346_I	356_L	0.669	0.15
68_D	461_S	0.667	0.15
337_L	491_K	0.667	0.15
412_A	434_R	0.666	0.15
129_S	150_A	0.665	0.15
369_L	374_R	0.664	0.15
128_I	222_D	0.664	0.15
78_E	392_T	0.663	0.15
125_Y	135_W	0.663	0.15
394_M	443_L	0.663	0.15
232_K	469_L	0.662	0.15
509_M	521_L	0.662	0.15
347_G	356_L	0.661	0.15
69_A	195_S	0.660	0.15
340_K	353_K	0.659	0.15
422_A	466_N	0.658	0.14
230_P	272_L	0.658	0.14
434_R	479_K	0.657	0.14
349_Y	359_L	0.657	0.14
546_S	550_L	0.657	0.14
92_L	248_L	0.656	0.14
299_I	487_T	0.652	0.14
52_E	154_A	0.652	0.14
348_G	358_E	0.652	0.14
208_P	269_L	0.651	0.14
542_T	550_L	0.649	0.14
324_F	327_R	0.648	0.14
96_K	274_Q	0.647	0.14
531_E	548_A	0.645	0.14
188_S	278_R	0.644	0.14
88_T	91_G	0.643	0.14
437_K	475_I	0.642	0.14
175_G	184_S	0.641	0.14
490_L	498_L	0.641	0.14
71_K	408_A	0.641	0.14
117_N	149_N	0.640	0.14
383_L	448_A	0.638	0.14
225_I	295_M	0.637	0.14
469_L	486_T	0.637	0.14
230_P	241_I	0.634	0.14
434_R	447_D	0.630	0.14
534_D	547_G	0.629	0.14
381_I	422_A	0.629	0.14
317_Y	325_E	0.627	0.14
321_R	331_G	0.627	0.14
545_Y	552_A	0.625	0.14
272_L	441_I	0.624	0.14
394_M	499_R	0.624	0.14
502_R	520_I	0.624	0.14
463_K	487_T	0.624	0.14
387_P	497_L	0.621	0.14
496_A	502_R	0.620	0.14
313_M	316_D	0.620	0.14
255_D	332_E	0.620	0.14
533_V	538_L	0.619	0.14
509_M	520_I	0.619	0.14
104_P	108_K	0.617	0.14
295_M	469_L	0.617	0.14
405_K	424_A	0.616	0.14
320_F	323_D	0.615	0.14
298_F	301_L	0.614	0.14
336_E	344_N	0.613	0.14
59_T	408_A	0.613	0.14
534_D	554_A	0.612	0.13
207_V	273_C	0.610	0.13
389_V	429_V	0.606	0.13
405_K	436_N	0.605	0.13
546_S	554_A	0.604	0.13
148_N	237_Q	0.603	0.13
362_L	371_E	0.603	0.13
434_R	439_A	0.602	0.13
512_P	521_L	0.602	0.13
381_I	485_G	0.600	0.13
491_K	515_E	0.600	0.13
175_G	278_R	0.598	0.13
346_I	362_L	0.598	0.13
533_V	539_A	0.596	0.13
540_D	546_S	0.596	0.13
256_K	420_E	0.596	0.13
426_I	441_I	0.596	0.13
534_D	538_L	0.595	0.13
124_L	310_T	0.594	0.13
412_A	415_M	0.593	0.13
355_E	360_L	0.593	0.13
167_G	277_A	0.592	0.13
541_Q	546_S	0.592	0.13
330_K	525_I	0.592	0.13
339_E	349_Y	0.591	0.13
545_Y	550_L	0.591	0.13
383_L	499_R	0.590	0.13
462_S	465_V	0.588	0.13
412_A	474_G	0.587	0.13
125_Y	171_E	0.587	0.13
256_K	471_E	0.586	0.13
224_L	287_K	0.584	0.13
285_I	435_E	0.584	0.13
139_S	151_R	0.584	0.13
532_K	535_C	0.582	0.13
237_Q	310_T	0.582	0.13
193_L	270_A	0.581	0.13
89_K	437_K	0.581	0.13
357_K	362_L	0.581	0.13
537_I	545_Y	0.580	0.13
101_F	208_P	0.578	0.13
261_T	403_N	0.578	0.13
412_A	416_Y	0.577	0.13
286_E	311_L	0.577	0.13
336_E	352_I	0.575	0.13
208_P	308_S	0.574	0.13
169_K	178_V	0.574	0.13
358_E	522_M	0.572	0.13
299_I	420_E	0.572	0.13
540_D	543_E	0.571	0.13
302_I	305_Y	0.570	0.13
408_A	472_M	0.567	0.13
55_D	305_Y	0.566	0.13
231_N	461_S	0.566	0.13
303_K	441_I	0.565	0.13
345_D	363_Q	0.565	0.13
52_E	149_N	0.565	0.13
411_G	462_S	0.565	0.13
412_A	420_E	0.564	0.13
339_E	362_L	0.563	0.12
56_K	429_V	0.562	0.12
335_N	398_L	0.562	0.12
265_S	270_A	0.561	0.12
265_S	281_A	0.561	0.12
366_H	371_E	0.560	0.12
55_D	242_H	0.559	0.12
153_N	281_A	0.558	0.12
239_L	300_E	0.558	0.12
125_Y	169_K	0.558	0.12
317_Y	322_L	0.557	0.12
497_L	519_D	0.556	0.12
354_T	398_L	0.556	0.12
226_Y	375_V	0.554	0.12
538_L	551_A	0.554	0.12
283_E	401_T	0.554	0.12
447_D	465_V	0.553	0.12
360_L	394_M	0.553	0.12
127_N	188_S	0.553	0.12
448_A	470_T	0.552	0.12
499_R	502_R	0.552	0.12
193_L	281_A	0.551	0.12
129_S	521_L	0.550	0.12
536_G	540_D	0.549	0.12
125_Y	146_L	0.548	0.12
538_L	544_G	0.548	0.12
262_E	265_S	0.546	0.12
67_E	237_Q	0.546	0.12
62_D	468_L	0.546	0.12
338_E	352_I	0.545	0.12
157_I	264_Y	0.545	0.12
299_I	304_K	0.543	0.12
370_L	386_P	0.543	0.12
251_D	256_K	0.542	0.12
58_I	442_L	0.542	0.12
138_E	277_A	0.542	0.12
90_Y	288_G	0.542	0.12
394_M	460_D	0.541	0.12
249_A	253_D	0.540	0.12
298_F	307_P	0.540	0.12
522_M	535_C	0.539	0.12
362_L	367_Y	0.539	0.12
171_E	307_P	0.539	0.12
68_D	247_P	0.538	0.12
539_A	546_S	0.538	0.12
133_S	234_A	0.538	0.12
231_N	474_G	0.537	0.12
138_E	229_P	0.537	0.12
361_E	416_Y	0.537	0.12
132_M	178_V	0.536	0.12
139_S	193_L	0.536	0.12
339_E	354_T	0.536	0.12
392_T	473_D	0.535	0.12
92_L	416_Y	0.534	0.12
434_R	474_G	0.531	0.12
62_D	78_E	0.531	0.12
79_L	199_V	0.531	0.12
340_K	349_Y	0.530	0.12
498_L	502_R	0.530	0.12
534_D	544_G	0.529	0.12
51_V	271_N	0.527	0.12
62_D	386_P	0.527	0.12
87_A	122_N	0.526	0.12
342_T	522_M	0.526	0.12
322_L	460_D	0.525	0.12
131_I	151_R	0.524	0.12
395_A	446_L	0.524	0.12
170_R	266_G	0.524	0.12
346_I	357_K	0.524	0.12
147_F	258_A	0.523	0.12
111_M	429_V	0.522	0.12
93_K	226_Y	0.522	0.12
484_I	504_D	0.521	0.12
79_L	393_M	0.521	0.12
111_M	393_M	0.521	0.12
400_K	494_D	0.521	0.12
259_E	412_A	0.521	0.12
143_L	155_P	0.520	0.12
538_L	555_R	0.520	0.12
147_F	199_V	0.520	0.12
344_N	352_I	0.519	0.12
77_I	439_A	0.518	0.12
92_L	249_A	0.518	0.12
397_A	432_R	0.517	0.12
334_E	481_V	0.517	0.12
534_D	541_Q	0.516	0.12
77_I	242_H	0.516	0.12
143_L	235_R	0.516	0.12
540_D	549_D	0.513	0.12
310_T	412_A	0.513	0.12
148_N	298_F	0.512	0.12
362_L	368_K	0.511	0.12
356_L	363_Q	0.511	0.12
53_I	71_K	0.511	0.12
59_T	92_L	0.511	0.12
535_C	540_D	0.510	0.11
271_N	430_F	0.510	0.11
167_G	521_L	0.509	0.11
53_I	461_S	0.509	0.11
144_R	201_V	0.508	0.11
540_D	551_A	0.508	0.11
356_L	368_K	0.506	0.11
195_S	429_V	0.505	0.11
232_K	398_L	0.504	0.11
60_W	234_A	0.503	0.11
544_G	553_L	0.503	0.11
333_E	513_N	0.503	0.11
212_D	220_R	0.502	0.11
161_D	212_D	0.502	0.11
163_I	467_Q	0.502	0.11
150_A	213_K	0.502	0.11
161_D	214_A	0.501	0.11
214_A	220_R	0.501	0.11
58_I	195_S	0.501	0.11
262_E	375_V	0.501	0.11
143_L	230_P	0.501	0.11
360_L	369_L	0.501	0.11
360_L	363_Q	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cf2A	3	0.8402	100	0.652	Contact Map
1r6bX	1	0.8501	100	0.665	Contact Map
3cmuA	1	0.8847	100	0.683	Contact Map
1qvrA	3	0.855	100	0.684	Contact Map
4d2uA	3	0.8468	100	0.686	Contact Map
3pxiA	3	0.8287	100	0.691	Contact Map
3j94A	3	0.7397	100	0.698	Contact Map
4ciuA	1	0.8023	100	0.704	Contact Map
4cr2J	1	0.4909	100	0.739	Contact Map
4ko8A	3	0.5074	100	0.75	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0135 seconds.