Q97VZ2 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97VZ2 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97VZ2	Sequences: MEVEGIADLPLHTGHVPPWLVPIMKRLAKAIVEIMILELGPQKVVERFSNPLWFQGFNNIIGMDWDSSGSTTVTLGILKDITNPKVHGFAVLGGKGKNALKVPDEVDMLIFDVDKNKIKNISKIVAKVDSTLVQDGHQLYHHTMLVTEDGKWSIIQQGMNLEIKFARRYHWKETDNFVVEPHSAISGIKTNVVVNVIDRDKDRTRKLILDLLRENPNKIVSLYTQAMAMLKGQSTLDMWIKGGSIAFVSKEARLIYMKPVDVNRIKQVLREMYESNPLTFEEALINGLGPSTARALYLIADLIYNEPPSYKDPMNYPYDPFKYAFAIGGKDGIPYPVNRKAAWEVIYTLEDFITRAKLEEGDKRLALRKLKELSKGIEK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	379 (344)
Sequences:	249 (174)
Seq/√Len:	9.4

SULSO - Q97VZ2

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
23_I	343_W	4.884	1.00
202_D	205_R	4.085	0.99
57_F	91_V	3.549	0.97
16_V	63_M	3.386	0.95
299_I	345_V	3.350	0.95
58_N	70_S	3.273	0.95
211_L	288_L	3.212	0.94
106_V	146_V	3.189	0.94
42_Q	151_K	3.070	0.92
32_V	44_V	2.884	0.90
180_E	197_I	2.825	0.89
114_D	117_K	2.696	0.86
127_K	131_T	2.565	0.83
45_V	147_T	2.547	0.83
101_K	104_D	2.453	0.80
120_N	124_I	2.440	0.80
253_R	259_P	2.365	0.78
63_M	187_G	2.362	0.77
63_M	146_V	2.358	0.77
31_I	179_V	2.341	0.77
59_N	66_D	2.319	0.76
119_K	144_M	2.297	0.75
11_L	17_P	2.258	0.74
58_N	66_D	2.103	0.68
9_L	12_H	2.089	0.68
138_Q	290_P	2.088	0.68
16_V	146_V	2.063	0.67
97_K	300_A	2.037	0.66
43_K	46_E	2.033	0.66
340_K	344_E	1.967	0.63
41_P	147_T	1.958	0.63
178_V	205_R	1.945	0.62
122_S	142_H	1.944	0.62
145_L	155_I	1.886	0.60
250_K	253_R	1.850	0.58
31_I	60_I	1.847	0.58
58_N	321_F	1.839	0.58
19_W	103_P	1.833	0.57
252_A	255_I	1.816	0.57
142_H	156_Q	1.813	0.56
110_I	119_K	1.791	0.55
43_K	60_I	1.752	0.54
63_M	70_S	1.719	0.52
344_E	347_Y	1.718	0.52
10_P	20_L	1.706	0.52
12_H	20_L	1.688	0.51
66_D	321_F	1.681	0.51
338_N	341_A	1.666	0.50
17_P	20_L	1.662	0.50
128_V	178_V	1.659	0.50
126_A	156_Q	1.657	0.50
198_D	201_K	1.628	0.48
201_K	309_S	1.599	0.47
44_V	48_F	1.597	0.47
92_L	144_M	1.592	0.47
21_V	77_I	1.591	0.47
176_N	179_V	1.575	0.46
12_H	17_P	1.544	0.45
16_V	187_G	1.539	0.44
11_L	20_L	1.538	0.44
274_E	282_E	1.523	0.44
16_V	70_S	1.522	0.44
10_P	17_P	1.520	0.43
179_V	202_D	1.520	0.43
92_L	141_H	1.509	0.43
23_I	342_A	1.492	0.42
92_L	102_V	1.487	0.42
214_E	306_E	1.484	0.42
155_I	347_Y	1.472	0.41
82_T	91_V	1.437	0.40
75_L	141_H	1.435	0.40
133_V	190_T	1.433	0.40
70_S	321_F	1.428	0.40
352_F	356_A	1.424	0.39
179_V	197_I	1.418	0.39
25_K	81_I	1.415	0.39
14_G	17_P	1.410	0.39
35_M	44_V	1.403	0.38
49_S	180_E	1.398	0.38
49_S	83_N	1.398	0.38
48_F	128_V	1.394	0.38
219_I	269_L	1.393	0.38
132_L	284_L	1.379	0.37
164_K	199_R	1.379	0.37
130_S	183_S	1.366	0.37
49_S	120_N	1.361	0.37
36_I	200_D	1.344	0.36
355_R	362_D	1.328	0.35
66_D	70_S	1.328	0.35
50_N	348_T	1.326	0.35
353_I	358_L	1.325	0.35
203_R	206_K	1.314	0.35
16_V	21_V	1.312	0.35
146_V	216_P	1.311	0.35
30_A	356_A	1.301	0.34
291_S	335_Y	1.299	0.34
28_A	31_I	1.296	0.34
43_K	47_R	1.287	0.34
280_F	361_G	1.278	0.33
77_I	81_I	1.275	0.33
39_L	304_Y	1.272	0.33
13_T	205_R	1.260	0.33
76_G	366_A	1.259	0.33
11_L	14_G	1.259	0.33
126_A	142_H	1.254	0.32
212_L	272_M	1.254	0.32
10_P	67_S	1.243	0.32
64_D	156_Q	1.242	0.32
327_I	345_V	1.238	0.32
15_H	155_I	1.238	0.32
45_V	154_I	1.235	0.32
70_S	73_V	1.230	0.32
64_D	126_A	1.228	0.31
74_T	310_Y	1.228	0.31
120_N	281_E	1.223	0.31
56_G	337_V	1.221	0.31
279_T	286_N	1.218	0.31
58_N	265_I	1.216	0.31
36_I	87_H	1.199	0.30
212_L	248_V	1.198	0.30
99_A	144_M	1.198	0.30
4_E	297_Y	1.196	0.30
10_P	14_G	1.192	0.30
322_K	333_I	1.182	0.30
112_D	335_Y	1.173	0.29
14_G	20_L	1.160	0.29
185_I	214_E	1.158	0.29
12_H	67_S	1.146	0.28
327_I	342_A	1.143	0.28
291_S	338_N	1.142	0.28
63_M	106_V	1.139	0.28
59_N	63_M	1.137	0.28
132_L	335_Y	1.134	0.28
52_L	184_A	1.133	0.28
72_T	142_H	1.131	0.28
58_N	61_I	1.130	0.28
187_G	344_E	1.130	0.28
89_F	299_I	1.126	0.28
123_K	182_H	1.117	0.27
359_E	368_R	1.115	0.27
45_V	177_F	1.114	0.27
155_I	251_E	1.112	0.27
155_I	303_I	1.107	0.27
102_V	144_M	1.102	0.27
49_S	221_S	1.099	0.27
279_T	311_K	1.098	0.27
352_F	366_A	1.098	0.27
58_N	63_M	1.092	0.26
21_V	106_V	1.089	0.26
63_M	321_F	1.086	0.26
30_A	366_A	1.081	0.26
41_P	149_D	1.075	0.26
21_V	63_M	1.073	0.26
16_V	66_D	1.073	0.26
176_N	281_E	1.072	0.26
73_V	187_G	1.064	0.26
295_A	308_P	1.064	0.26
16_V	106_V	1.063	0.25
279_T	282_E	1.061	0.25
83_N	176_N	1.060	0.25
131_T	290_P	1.057	0.25
186_S	325_F	1.056	0.25
86_V	352_F	1.052	0.25
7_A	128_V	1.049	0.25
160_N	170_H	1.045	0.25
56_G	165_F	1.039	0.25
250_K	259_P	1.039	0.25
61_I	66_D	1.038	0.25
79_K	346_I	1.036	0.25
128_V	176_N	1.035	0.25
301_D	322_K	1.034	0.25
204_T	297_Y	1.025	0.24
147_T	160_N	1.020	0.24
26_R	178_V	1.010	0.24
36_I	224_T	1.010	0.24
44_V	121_I	1.010	0.24
114_D	183_S	1.008	0.24
299_I	335_Y	1.003	0.24
15_H	61_I	1.003	0.24
36_I	185_I	0.997	0.23
293_A	323_Y	0.995	0.23
58_N	327_I	0.992	0.23
196_V	321_F	0.986	0.23
222_L	225_Q	0.985	0.23
75_L	308_P	0.982	0.23
53_W	309_S	0.981	0.23
57_F	219_I	0.979	0.23
109_L	303_I	0.973	0.23
184_A	194_V	0.969	0.22
261_D	293_A	0.966	0.22
49_S	357_K	0.966	0.22
77_I	253_R	0.962	0.22
38_E	49_S	0.961	0.22
192_V	205_R	0.958	0.22
5_G	205_R	0.953	0.22
34_I	41_P	0.953	0.22
214_E	357_K	0.952	0.22
124_I	335_Y	0.950	0.22
9_L	17_P	0.950	0.22
138_Q	286_N	0.944	0.22
13_T	192_V	0.942	0.22
265_I	321_F	0.940	0.22
143_T	353_I	0.939	0.22
143_T	285_I	0.939	0.22
44_V	95_K	0.937	0.21
108_M	340_K	0.936	0.21
79_K	105_E	0.933	0.21
8_D	16_V	0.929	0.21
73_V	291_S	0.927	0.21
59_N	321_F	0.922	0.21
310_Y	322_K	0.922	0.21
61_I	321_F	0.918	0.21
250_K	283_A	0.918	0.21
95_K	141_H	0.913	0.21
95_K	270_R	0.912	0.21
184_A	354_T	0.911	0.21
103_P	141_H	0.909	0.21
155_I	286_N	0.907	0.21
82_T	123_K	0.903	0.20
42_Q	147_T	0.899	0.20
57_F	174_T	0.898	0.20
42_Q	86_V	0.893	0.20
185_I	344_E	0.886	0.20
8_D	307_P	0.884	0.20
266_K	295_A	0.881	0.20
28_A	74_T	0.876	0.20
153_S	194_V	0.872	0.20
121_I	125_V	0.869	0.20
106_V	190_T	0.867	0.19
55_Q	122_S	0.867	0.19
77_I	333_I	0.866	0.19
133_V	293_A	0.865	0.19
59_N	70_S	0.863	0.19
207_L	304_Y	0.863	0.19
31_I	145_L	0.860	0.19
50_N	311_K	0.859	0.19
291_S	297_Y	0.857	0.19
55_Q	142_H	0.857	0.19
201_K	204_T	0.855	0.19
120_N	151_K	0.854	0.19
342_A	346_I	0.846	0.19
278_L	282_E	0.845	0.19
209_L	288_L	0.844	0.19
267_Q	353_I	0.842	0.19
15_H	270_R	0.840	0.19
356_A	366_A	0.839	0.19
66_D	327_I	0.837	0.19
171_W	182_H	0.835	0.19
73_V	95_K	0.833	0.19
42_Q	205_R	0.832	0.18
16_V	58_N	0.830	0.18
268_V	272_M	0.828	0.18
105_E	114_D	0.826	0.18
184_A	353_I	0.823	0.18
210_D	293_A	0.820	0.18
16_V	59_N	0.818	0.18
214_E	223_Y	0.817	0.18
73_V	141_H	0.815	0.18
7_A	16_V	0.815	0.18
39_L	305_N	0.814	0.18
144_M	259_P	0.813	0.18
193_V	284_L	0.812	0.18
100_L	299_I	0.811	0.18
60_I	226_A	0.810	0.18
101_K	163_I	0.810	0.18
63_M	66_D	0.809	0.18
265_I	310_Y	0.808	0.18
10_P	331_D	0.807	0.18
359_E	364_R	0.806	0.18
28_A	207_L	0.806	0.18
99_A	123_K	0.806	0.18
148_E	302_L	0.805	0.18
196_V	293_A	0.802	0.18
186_S	306_E	0.801	0.18
277_P	282_E	0.800	0.18
163_I	324_A	0.800	0.18
99_A	127_K	0.800	0.18
10_P	329_G	0.798	0.18
42_Q	127_K	0.792	0.17
110_I	115_K	0.792	0.17
120_N	323_Y	0.791	0.17
62_G	67_S	0.791	0.17
265_I	270_R	0.790	0.17
32_V	180_E	0.788	0.17
64_D	142_H	0.788	0.17
176_N	189_K	0.787	0.17
133_V	185_I	0.787	0.17
99_A	103_P	0.785	0.17
73_V	333_I	0.784	0.17
253_R	291_S	0.784	0.17
121_I	346_I	0.783	0.17
130_S	297_Y	0.783	0.17
196_V	323_Y	0.782	0.17
25_K	63_M	0.782	0.17
208_I	280_F	0.782	0.17
19_W	122_S	0.778	0.17
133_V	357_K	0.777	0.17
116_N	197_I	0.775	0.17
12_H	331_D	0.772	0.17
347_Y	367_L	0.772	0.17
130_S	194_V	0.772	0.17
39_L	146_V	0.769	0.17
278_L	353_I	0.768	0.17
199_R	303_I	0.768	0.17
126_A	154_I	0.767	0.17
175_D	202_D	0.766	0.17
101_K	357_K	0.761	0.17
353_I	367_L	0.761	0.17
12_H	329_G	0.758	0.17
247_F	250_K	0.757	0.17
58_N	74_T	0.756	0.17
114_D	220_V	0.755	0.17
46_E	81_I	0.754	0.16
201_K	308_P	0.754	0.16
303_I	353_I	0.754	0.16
273_Y	276_N	0.753	0.16
101_K	346_I	0.752	0.16
277_P	369_K	0.752	0.16
4_E	311_K	0.751	0.16
213_R	368_R	0.748	0.16
95_K	267_Q	0.748	0.16
49_S	161_L	0.744	0.16
25_K	304_Y	0.738	0.16
253_R	333_I	0.737	0.16
252_A	259_P	0.737	0.16
24_M	72_T	0.735	0.16
173_E	283_A	0.735	0.16
77_I	274_E	0.734	0.16
56_G	287_G	0.733	0.16
103_P	272_M	0.729	0.16
99_A	255_I	0.728	0.16
215_N	353_I	0.721	0.16
35_M	175_D	0.717	0.16
149_D	276_N	0.716	0.16
44_V	123_K	0.715	0.16
18_P	22_P	0.713	0.16
174_T	220_V	0.711	0.15
43_K	369_K	0.709	0.15
195_N	299_I	0.709	0.15
288_L	304_Y	0.708	0.15
204_T	268_V	0.704	0.15
107_D	119_K	0.698	0.15
215_N	268_V	0.697	0.15
49_S	151_K	0.696	0.15
66_D	253_R	0.694	0.15
72_T	122_S	0.694	0.15
196_V	280_F	0.692	0.15
92_L	301_D	0.692	0.15
128_V	337_V	0.691	0.15
42_Q	123_K	0.690	0.15
81_I	285_I	0.687	0.15
43_K	280_F	0.686	0.15
280_F	310_Y	0.684	0.15
133_V	340_K	0.680	0.15
165_F	288_L	0.679	0.15
29_K	297_Y	0.678	0.15
20_L	23_I	0.678	0.15
321_F	325_F	0.677	0.15
103_P	152_W	0.673	0.15
266_K	335_Y	0.672	0.15
8_D	63_M	0.671	0.15
306_E	337_V	0.669	0.15
102_V	122_S	0.667	0.14
267_Q	294_R	0.667	0.14
188_I	324_A	0.663	0.14
163_I	278_L	0.662	0.14
48_F	155_I	0.662	0.14
209_L	260_V	0.656	0.14
99_A	119_K	0.656	0.14
97_K	344_E	0.653	0.14
144_M	253_R	0.652	0.14
213_R	275_S	0.651	0.14
86_V	175_D	0.651	0.14
7_A	170_H	0.650	0.14
30_A	268_V	0.649	0.14
117_K	203_R	0.649	0.14
141_H	207_L	0.648	0.14
201_K	338_N	0.648	0.14
10_P	35_M	0.647	0.14
29_K	349_L	0.647	0.14
112_D	321_F	0.646	0.14
38_E	142_H	0.645	0.14
80_D	291_S	0.644	0.14
41_P	148_E	0.643	0.14
34_I	264_R	0.641	0.14
52_L	154_I	0.638	0.14
76_G	141_H	0.636	0.14
59_N	327_I	0.635	0.14
147_T	325_F	0.634	0.14
49_S	52_L	0.634	0.14
9_L	156_Q	0.633	0.14
137_H	255_I	0.633	0.14
85_K	175_D	0.632	0.14
3_V	9_L	0.632	0.14
324_A	337_V	0.631	0.14
225_Q	340_K	0.630	0.14
223_Y	303_I	0.629	0.14
130_S	325_F	0.626	0.14
7_A	209_L	0.625	0.14
45_V	99_A	0.622	0.14
31_I	146_V	0.622	0.14
55_Q	298_L	0.621	0.13
122_S	156_Q	0.620	0.13
28_A	81_I	0.619	0.13
130_S	184_A	0.619	0.13
64_D	67_S	0.618	0.13
86_V	197_I	0.617	0.13
151_K	164_K	0.616	0.13
62_G	370_L	0.615	0.13
77_I	342_A	0.612	0.13
12_H	16_V	0.612	0.13
47_R	91_V	0.612	0.13
147_T	154_I	0.611	0.13
29_K	369_K	0.610	0.13
67_S	331_D	0.608	0.13
337_V	342_A	0.607	0.13
32_V	202_D	0.607	0.13
85_K	272_M	0.607	0.13
199_R	204_T	0.605	0.13
50_N	138_Q	0.601	0.13
59_N	73_V	0.601	0.13
7_A	91_V	0.600	0.13
199_R	339_R	0.599	0.13
31_I	261_D	0.596	0.13
26_R	130_S	0.596	0.13
40_G	47_R	0.590	0.13
219_I	224_T	0.588	0.13
73_V	259_P	0.586	0.13
16_V	321_F	0.586	0.13
113_V	323_Y	0.586	0.13
80_D	214_E	0.586	0.13
64_D	72_T	0.585	0.13
110_I	205_R	0.583	0.13
332_G	370_L	0.583	0.13
182_H	335_Y	0.582	0.13
9_L	16_V	0.580	0.13
190_T	345_V	0.579	0.13
75_L	295_A	0.578	0.13
78_L	269_L	0.576	0.13
191_N	310_Y	0.575	0.13
298_L	335_Y	0.575	0.13
142_H	298_L	0.573	0.13
9_L	62_G	0.572	0.13
219_I	355_R	0.572	0.13
57_F	248_V	0.570	0.12
117_K	339_R	0.569	0.12
151_K	204_T	0.567	0.12
26_R	213_R	0.566	0.12
56_G	349_L	0.564	0.12
42_Q	149_D	0.564	0.12
25_K	77_I	0.562	0.12
220_V	225_Q	0.562	0.12
85_K	163_I	0.559	0.12
91_V	288_L	0.557	0.12
288_L	293_A	0.554	0.12
41_P	44_V	0.553	0.12
183_S	205_R	0.553	0.12
292_T	301_D	0.552	0.12
213_R	297_Y	0.552	0.12
102_V	301_D	0.551	0.12
304_Y	308_P	0.550	0.12
70_S	77_I	0.548	0.12
54_F	158_G	0.548	0.12
184_A	371_K	0.547	0.12
366_A	369_K	0.547	0.12
9_L	14_G	0.547	0.12
61_I	70_S	0.544	0.12
10_P	62_G	0.544	0.12
41_P	145_L	0.543	0.12
13_T	56_G	0.543	0.12
133_V	202_D	0.542	0.12
259_P	342_A	0.541	0.12
24_M	55_Q	0.540	0.12
143_T	341_A	0.539	0.12
76_G	252_A	0.538	0.12
297_Y	308_P	0.538	0.12
101_K	155_I	0.537	0.12
21_V	70_S	0.535	0.12
302_L	322_K	0.535	0.12
109_L	355_R	0.534	0.12
29_K	80_D	0.533	0.12
146_V	187_G	0.533	0.12
64_D	331_D	0.532	0.12
6_I	56_G	0.531	0.12
250_K	370_L	0.531	0.12
60_I	263_N	0.531	0.12
35_M	303_I	0.531	0.12
164_K	188_I	0.530	0.12
44_V	362_D	0.530	0.12
324_A	369_K	0.529	0.12
73_V	193_V	0.529	0.12
194_V	308_P	0.529	0.12
123_K	252_A	0.528	0.12
132_L	272_M	0.526	0.12
74_T	132_L	0.525	0.12
149_D	299_I	0.524	0.12
165_F	283_A	0.522	0.12
28_A	91_V	0.522	0.12
132_L	256_Y	0.520	0.12
125_V	186_S	0.520	0.12
125_V	263_N	0.519	0.12
97_K	101_K	0.519	0.12
135_D	196_V	0.519	0.12
104_D	107_D	0.519	0.12
77_I	321_F	0.518	0.11
311_K	356_A	0.516	0.11
198_D	260_V	0.516	0.11
47_R	299_I	0.515	0.11
164_K	213_R	0.512	0.11
341_A	353_I	0.510	0.11
171_W	177_F	0.506	0.11
266_K	298_L	0.506	0.11
4_E	209_L	0.505	0.11
89_F	354_T	0.504	0.11
58_N	322_K	0.502	0.11
7_A	17_P	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3h6eA	1	0.3061	37.6	0.981	Contact Map
3ll3A	2	0.3087	35	0.981	Contact Map
2bcqA	1	0.3588	32.6	0.981	Contact Map
2w40A	3	0.3377	32.6	0.981	Contact Map
3mtuE	2	0.0897	31.9	0.981	Contact Map
1pu6A	1	0.4749	27.2	0.982	Contact Map
3b0xA	1	0.4354	25.1	0.982	Contact Map
3fhgA	2	0.5356	24.6	0.982	Contact Map
2abkA	1	0.4274	23.8	0.983	Contact Map
3wxlA	2	0.3377	22.8	0.983	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0106 seconds.