Q97VY5 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97VY5 - ABC transporter, putative

UniProt:	Q97VY5	Sequences: MNEILLIFLASLASLGRVFLTIGLSIITGWFLGYIAIKSKAFENIYISVVEIFESVPVISFFPVVLIFFVYRIGGYIGIELAVDFLVFTAVVWNIWIGIYQAFKTVPSDLLEVSENYRLGFLGKMAKLYIPYSWPRIAANLIPSFADAIFYITVSEVFSIGSSSYHVFGIGTLIGEFTASQEYTLALDGLGILAIPIIIFTYLLRRFANYTVSKYGLDTEIKVTKRGRMRIRYATRMSNTIAPFVKLSKYVTRIGSRSASSEEETRRNLPWRYLGIGISVLLLGLLVYGAFSTISSVPKSVWLYLISTTPNVLFNLLIDYIRVLFIAIVSLVFSIFLGYFIATRERVEKVLIPAIQTYASFPAPAYFPLLFTATISFIHSVFGSWTDEFYVILLGFISTFYYVFYSYWLGIKNMPNQYWEIMKNYNFSFWHKLRYVIIPSTFPYIISGLSSTINSAWGGLAIGEYWEISNSYTLQVSHGIMKSIAVATANGNIPLAAWDSLIFGIVVMIYSIFFTRKMMDLAREKYVAEEGIYLA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	535 (509)
Sequences:	400 (288)
Seq/√Len:	12.8

SULSO - Q97VY5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
32_L	46_Y	7.388	1.00
58_V	90_A	4.790	1.00
63_P	496_A	4.588	1.00
388_E	478_H	4.312	1.00
202_Y	227_G	3.822	0.99
46_Y	49_V	3.811	0.99
310_P	314_F	3.716	0.99
60_S	500_S	3.716	0.99
29_G	96_W	3.385	0.98
122_L	126_A	3.298	0.98
90_A	148_A	3.166	0.97
70_V	79_I	3.104	0.97
111_L	115_E	3.104	0.97
50_V	97_I	3.051	0.97
492_N	495_L	3.041	0.97
98_G	136_R	3.015	0.96
145_F	200_F	2.920	0.96
11_S	196_P	2.818	0.95
43_E	104_K	2.694	0.93
187_L	191_G	2.686	0.93
340_F	347_V	2.646	0.93
314_F	318_I	2.611	0.92
98_G	102_A	2.483	0.90
22_I	141_L	2.402	0.89
339_Y	433_L	2.387	0.88
151_Y	462_I	2.351	0.87
135_P	390_Y	2.293	0.86
442_F	521_L	2.292	0.86
190_L	365_A	2.290	0.86
19_F	204_L	2.260	0.85
135_P	205_R	2.229	0.84
63_P	86_L	2.218	0.84
280_V	284_G	2.171	0.83
116_N	174_I	2.152	0.82
11_S	192_I	2.136	0.82
301_V	308_T	2.127	0.81
44_N	70_V	2.114	0.81
109_D	417_Q	2.110	0.81
64_V	432_K	2.095	0.80
80_E	83_V	2.082	0.80
205_R	390_Y	2.080	0.80
205_R	360_S	2.066	0.79
118_R	450_S	2.029	0.78
130_I	134_W	2.026	0.78
245_V	248_S	2.018	0.78
145_F	193_L	2.001	0.77
241_I	341_I	2.000	0.77
58_V	240_T	1.992	0.77
21_T	50_V	1.966	0.76
65_V	86_L	1.953	0.75
183_Y	187_L	1.941	0.75
28_T	88_F	1.925	0.74
33_G	133_S	1.920	0.74
308_T	311_N	1.914	0.74
181_Q	469_S	1.909	0.73
114_S	514_F	1.893	0.73
32_L	49_V	1.860	0.71
50_V	147_D	1.852	0.71
483_S	499_D	1.818	0.70
319_D	460_L	1.811	0.69
182_E	185_L	1.806	0.69
46_Y	229_M	1.804	0.69
174_I	365_A	1.801	0.69
136_R	480_I	1.793	0.69
19_F	23_G	1.782	0.68
174_I	366_Y	1.773	0.68
60_S	65_V	1.766	0.67
145_F	390_Y	1.759	0.67
445_I	449_L	1.759	0.67
51_E	54_E	1.727	0.66
68_F	71_Y	1.721	0.65
30_W	130_I	1.700	0.64
146_A	153_T	1.695	0.64
58_V	155_S	1.695	0.64
204_L	414_M	1.685	0.64
146_A	360_S	1.667	0.63
32_L	92_V	1.665	0.63
126_A	130_I	1.662	0.62
69_F	85_F	1.639	0.61
312_V	498_W	1.637	0.61
264_E	293_T	1.634	0.61
86_L	364_P	1.631	0.61
110_L	128_L	1.629	0.61
9_L	75_G	1.623	0.61
117_Y	425_Y	1.622	0.60
193_L	361_F	1.619	0.60
282_L	317_L	1.614	0.60
387_D	391_V	1.613	0.60
158_F	165_Y	1.612	0.60
22_I	365_A	1.608	0.60
45_I	514_F	1.608	0.60
476_V	486_V	1.605	0.60
126_A	229_M	1.569	0.58
231_I	417_Q	1.564	0.58
388_E	445_I	1.553	0.57
65_V	85_F	1.547	0.57
414_M	436_V	1.547	0.57
103_F	133_S	1.529	0.56
205_R	374_T	1.505	0.55
127_K	435_Y	1.498	0.54
23_G	180_S	1.481	0.53
297_V	308_T	1.475	0.53
446_I	509_I	1.470	0.53
52_I	348_E	1.469	0.53
425_Y	517_K	1.469	0.53
113_V	418_Y	1.466	0.53
130_I	174_I	1.456	0.52
24_L	70_V	1.453	0.52
83_V	167_V	1.452	0.52
337_L	340_F	1.451	0.52
432_K	517_K	1.449	0.52
199_I	293_T	1.447	0.52
326_I	445_I	1.435	0.51
152_I	360_S	1.425	0.50
98_G	214_K	1.414	0.50
225_K	413_N	1.407	0.50
92_V	335_I	1.407	0.50
241_I	426_N	1.402	0.49
106_V	129_Y	1.402	0.49
54_E	511_S	1.397	0.49
331_L	445_I	1.396	0.49
395_G	418_Y	1.395	0.49
140_N	402_Y	1.393	0.49
244_F	434_R	1.389	0.49
347_V	350_V	1.386	0.48
431_H	435_Y	1.379	0.48
326_I	396_F	1.377	0.48
285_L	292_S	1.366	0.47
293_T	497_A	1.363	0.47
45_I	277_G	1.362	0.47
360_S	385_W	1.361	0.47
60_S	209_N	1.354	0.47
105_T	522_A	1.348	0.46
198_I	318_I	1.338	0.46
521_L	526_Y	1.334	0.46
366_Y	428_S	1.329	0.45
60_S	158_F	1.325	0.45
56_V	417_Q	1.322	0.45
146_A	205_R	1.317	0.45
65_V	158_F	1.315	0.45
85_F	155_S	1.306	0.44
80_E	167_V	1.303	0.44
113_V	395_G	1.297	0.44
437_I	441_T	1.281	0.43
365_A	390_Y	1.281	0.43
16_G	66_L	1.275	0.43
29_G	99_I	1.271	0.43
189_G	361_F	1.256	0.42
64_V	414_M	1.256	0.42
480_I	504_G	1.246	0.41
258_S	264_E	1.237	0.41
501_L	517_K	1.228	0.40
122_L	125_M	1.226	0.40
46_Y	103_F	1.224	0.40
152_I	357_T	1.220	0.40
174_I	189_G	1.218	0.40
190_L	450_S	1.212	0.40
277_G	329_V	1.210	0.39
30_W	281_L	1.201	0.39
369_L	423_K	1.188	0.38
13_A	85_F	1.188	0.38
85_F	158_F	1.186	0.38
217_L	456_A	1.177	0.38
153_T	170_I	1.176	0.38
228_R	463_G	1.175	0.38
214_K	242_A	1.164	0.37
197_I	202_Y	1.164	0.37
128_L	421_I	1.164	0.37
146_A	365_A	1.160	0.37
129_Y	139_A	1.158	0.37
176_E	180_S	1.155	0.37
248_S	276_I	1.154	0.37
410_G	444_Y	1.153	0.37
282_L	289_G	1.151	0.37
78_G	420_E	1.149	0.36
395_G	475_Q	1.146	0.36
273_Y	276_I	1.146	0.36
157_V	175_G	1.145	0.36
344_R	449_L	1.145	0.36
278_I	296_S	1.141	0.36
164_S	346_R	1.135	0.36
99_I	504_G	1.132	0.36
226_R	409_L	1.129	0.36
28_T	96_W	1.127	0.35
105_T	514_F	1.125	0.35
109_D	421_I	1.122	0.35
219_T	437_I	1.122	0.35
301_V	440_S	1.122	0.35
338_G	444_Y	1.113	0.35
21_T	151_Y	1.112	0.35
27_I	311_N	1.111	0.35
153_T	205_R	1.110	0.35
167_V	406_S	1.102	0.34
208_A	220_E	1.098	0.34
16_G	42_F	1.095	0.34
191_G	486_V	1.094	0.34
136_R	214_K	1.091	0.34
311_N	315_N	1.089	0.34
27_I	267_R	1.088	0.34
119_L	318_I	1.087	0.34
68_F	436_V	1.083	0.33
390_Y	393_L	1.083	0.33
360_S	390_Y	1.082	0.33
374_T	387_D	1.079	0.33
462_I	466_W	1.075	0.33
388_E	513_F	1.074	0.33
294_I	310_P	1.073	0.33
15_L	360_S	1.067	0.33
387_D	497_A	1.066	0.33
235_T	238_S	1.065	0.33
29_G	103_F	1.061	0.32
274_L	332_V	1.061	0.32
186_A	445_I	1.059	0.32
121_F	125_M	1.057	0.32
260_S	277_G	1.055	0.32
14_S	101_Q	1.054	0.32
229_M	424_N	1.053	0.32
188_D	213_S	1.053	0.32
406_S	454_N	1.050	0.32
321_I	467_E	1.044	0.32
280_V	285_L	1.041	0.31
127_K	431_H	1.040	0.31
85_F	160_I	1.040	0.31
68_F	161_G	1.038	0.31
42_F	101_Q	1.037	0.31
146_A	200_F	1.036	0.31
69_F	445_I	1.035	0.31
318_I	478_H	1.035	0.31
20_L	47_I	1.034	0.31
189_G	364_P	1.032	0.31
385_W	429_F	1.029	0.31
10_A	342_A	1.028	0.31
76_Y	517_K	1.023	0.31
15_L	196_P	1.023	0.31
392_I	456_A	1.020	0.31
23_G	328_I	1.019	0.31
182_E	434_R	1.019	0.31
120_G	482_K	1.018	0.30
24_L	27_I	1.017	0.30
432_K	437_I	1.015	0.30
29_G	138_A	1.010	0.30
54_E	451_S	1.010	0.30
182_E	480_I	1.009	0.30
195_I	525_K	1.008	0.30
116_N	424_N	1.008	0.30
170_I	388_E	1.002	0.30
58_V	113_V	1.001	0.30
205_R	385_W	1.000	0.30
326_I	334_S	0.999	0.30
182_E	240_T	0.994	0.29
118_R	524_E	0.989	0.29
113_V	186_A	0.989	0.29
27_I	277_G	0.988	0.29
138_A	161_G	0.987	0.29
64_V	425_Y	0.985	0.29
128_L	213_S	0.985	0.29
174_I	369_L	0.984	0.29
128_L	433_L	0.984	0.29
51_E	511_S	0.984	0.29
60_S	365_A	0.979	0.29
237_M	329_V	0.979	0.29
264_E	286_L	0.979	0.29
98_G	133_S	0.979	0.29
170_I	339_Y	0.976	0.29
62_F	525_K	0.970	0.28
115_E	233_Y	0.970	0.28
94_N	402_Y	0.969	0.28
266_R	287_V	0.969	0.28
200_F	385_W	0.967	0.28
200_F	390_Y	0.964	0.28
352_I	408_W	0.960	0.28
38_K	152_I	0.957	0.28
96_W	355_I	0.955	0.28
135_P	146_A	0.955	0.28
219_T	517_K	0.955	0.28
247_L	505_I	0.954	0.28
257_R	328_I	0.953	0.28
64_V	436_V	0.952	0.28
351_L	354_A	0.951	0.28
274_L	290_A	0.951	0.28
9_L	204_L	0.950	0.28
342_A	404_F	0.950	0.28
135_P	360_S	0.947	0.27
231_I	525_K	0.945	0.27
261_S	446_I	0.943	0.27
137_I	342_A	0.941	0.27
9_L	13_A	0.931	0.27
109_D	524_E	0.930	0.27
105_T	388_E	0.923	0.26
339_Y	437_I	0.921	0.26
200_F	360_S	0.920	0.26
316_L	480_I	0.920	0.26
446_I	519_M	0.918	0.26
133_S	157_V	0.918	0.26
143_P	147_D	0.916	0.26
200_F	205_R	0.915	0.26
104_K	278_I	0.915	0.26
14_S	360_S	0.915	0.26
413_N	419_W	0.914	0.26
414_M	440_S	0.914	0.26
241_I	287_V	0.913	0.26
46_Y	50_V	0.912	0.26
153_T	390_Y	0.912	0.26
385_W	390_Y	0.911	0.26
51_E	151_Y	0.910	0.26
145_F	186_A	0.910	0.26
79_I	373_A	0.909	0.26
15_L	145_F	0.907	0.26
225_K	396_F	0.906	0.26
182_E	333_F	0.906	0.26
375_I	475_Q	0.905	0.26
159_S	220_E	0.905	0.26
61_F	189_G	0.904	0.26
277_G	347_V	0.903	0.26
139_A	408_W	0.902	0.26
124_K	427_F	0.902	0.26
339_Y	441_T	0.898	0.25
243_P	285_L	0.897	0.25
161_G	420_E	0.897	0.25
110_L	433_L	0.896	0.25
420_E	504_G	0.895	0.25
166_H	329_V	0.894	0.25
285_L	291_F	0.888	0.25
139_A	352_I	0.887	0.25
430_W	506_V	0.887	0.25
261_S	332_V	0.886	0.25
97_I	462_I	0.886	0.25
12_L	214_K	0.886	0.25
89_T	94_N	0.886	0.25
26_I	141_L	0.880	0.25
103_F	504_G	0.879	0.25
414_M	437_I	0.870	0.24
195_I	199_I	0.869	0.24
188_D	377_F	0.868	0.24
364_P	483_S	0.864	0.24
202_Y	399_T	0.862	0.24
357_T	360_S	0.862	0.24
229_M	365_A	0.860	0.24
49_V	190_L	0.860	0.24
230_R	243_P	0.858	0.24
60_S	86_L	0.856	0.24
139_A	484_I	0.856	0.24
89_T	402_Y	0.856	0.24
86_L	361_F	0.852	0.24
183_Y	365_A	0.851	0.24
97_I	151_Y	0.851	0.24
14_S	135_P	0.851	0.24
146_A	390_Y	0.850	0.24
123_G	126_A	0.849	0.24
347_V	351_L	0.847	0.24
33_G	189_G	0.845	0.23
65_V	364_P	0.840	0.23
19_F	450_S	0.839	0.23
118_R	366_Y	0.838	0.23
87_V	414_M	0.838	0.23
234_A	421_I	0.836	0.23
14_S	152_I	0.835	0.23
130_I	190_L	0.835	0.23
56_V	159_S	0.834	0.23
44_N	524_E	0.834	0.23
214_K	337_L	0.832	0.23
140_N	454_N	0.830	0.23
403_V	407_Y	0.830	0.23
274_L	282_L	0.829	0.23
27_I	52_I	0.829	0.23
97_I	147_D	0.825	0.23
143_P	366_Y	0.825	0.23
374_T	393_L	0.824	0.23
20_L	493_I	0.822	0.23
131_P	448_G	0.821	0.23
271_W	274_L	0.818	0.22
145_F	204_L	0.816	0.22
58_V	145_F	0.815	0.22
58_V	320_Y	0.814	0.22
130_I	414_M	0.813	0.22
186_A	196_P	0.812	0.22
46_Y	90_A	0.812	0.22
259_A	266_R	0.811	0.22
50_V	90_A	0.811	0.22
20_L	77_I	0.809	0.22
329_V	333_F	0.809	0.22
174_I	435_Y	0.807	0.22
141_L	205_R	0.806	0.22
426_N	429_F	0.806	0.22
201_T	227_G	0.806	0.22
157_V	178_T	0.805	0.22
266_R	290_A	0.804	0.22
247_L	267_R	0.801	0.22
47_I	288_Y	0.798	0.22
94_N	140_N	0.798	0.22
158_F	364_P	0.797	0.22
33_G	431_H	0.796	0.22
284_G	505_I	0.795	0.22
73_I	78_G	0.794	0.22
38_K	214_K	0.794	0.22
31_F	35_I	0.792	0.22
92_V	106_V	0.792	0.22
374_T	390_Y	0.791	0.21
260_S	337_L	0.790	0.21
109_D	234_A	0.790	0.21
80_E	322_R	0.785	0.21
159_S	473_T	0.784	0.21
294_I	369_L	0.783	0.21
155_S	364_P	0.783	0.21
64_V	391_V	0.783	0.21
54_E	87_V	0.782	0.21
293_T	297_V	0.779	0.21
203_L	487_A	0.779	0.21
198_I	426_N	0.779	0.21
119_L	126_A	0.777	0.21
13_A	80_E	0.776	0.21
42_F	343_T	0.772	0.21
15_L	282_L	0.770	0.21
323_V	456_A	0.770	0.21
154_V	326_I	0.768	0.21
37_I	400_F	0.768	0.21
226_R	523_R	0.766	0.21
190_L	229_M	0.766	0.21
137_I	147_D	0.766	0.21
270_P	311_N	0.766	0.21
54_E	151_Y	0.765	0.21
124_K	186_A	0.765	0.21
114_S	132_Y	0.764	0.21
365_A	500_S	0.760	0.20
56_V	488_T	0.759	0.20
14_S	205_R	0.759	0.20
54_E	59_I	0.758	0.20
86_L	157_V	0.757	0.20
176_E	212_V	0.756	0.20
138_A	416_N	0.755	0.20
146_A	385_W	0.755	0.20
329_V	521_L	0.753	0.20
179_A	190_L	0.753	0.20
159_S	369_L	0.751	0.20
109_D	467_E	0.750	0.20
465_Y	474_L	0.749	0.20
238_S	446_I	0.749	0.20
206_R	212_V	0.749	0.20
145_F	361_F	0.748	0.20
62_F	408_W	0.747	0.20
167_V	454_N	0.747	0.20
360_S	391_V	0.743	0.20
61_F	80_E	0.742	0.20
49_V	176_E	0.742	0.20
222_K	375_I	0.741	0.20
226_R	230_R	0.741	0.20
234_A	445_I	0.740	0.20
76_Y	496_A	0.739	0.20
427_F	436_V	0.737	0.20
78_G	99_I	0.737	0.20
292_S	525_K	0.736	0.20
167_V	409_L	0.736	0.20
68_F	152_I	0.734	0.20
91_V	400_F	0.732	0.19
267_R	346_R	0.730	0.19
175_G	500_S	0.730	0.19
64_V	485_A	0.727	0.19
216_G	297_V	0.726	0.19
174_I	465_Y	0.726	0.19
19_F	32_L	0.725	0.19
64_V	69_F	0.725	0.19
194_A	244_F	0.721	0.19
63_P	365_A	0.721	0.19
86_L	365_A	0.721	0.19
79_I	164_S	0.721	0.19
90_A	434_R	0.720	0.19
327_A	456_A	0.719	0.19
45_I	49_V	0.718	0.19
123_G	233_Y	0.717	0.19
205_R	392_I	0.716	0.19
366_Y	434_R	0.716	0.19
32_L	50_V	0.715	0.19
56_V	504_G	0.713	0.19
308_T	315_N	0.713	0.19
12_L	16_G	0.712	0.19
334_S	361_F	0.712	0.19
32_L	81_L	0.709	0.19
68_F	496_A	0.709	0.19
138_A	234_A	0.709	0.19
94_N	100_Y	0.707	0.19
436_V	440_S	0.703	0.19
69_F	309_T	0.703	0.19
87_V	90_A	0.702	0.19
290_A	328_I	0.702	0.19
70_V	524_E	0.700	0.18
67_I	81_L	0.699	0.18
38_K	129_Y	0.698	0.18
63_P	77_I	0.697	0.18
375_I	488_T	0.697	0.18
136_R	444_Y	0.696	0.18
70_V	424_N	0.696	0.18
208_A	219_T	0.696	0.18
62_F	494_P	0.695	0.18
60_S	364_P	0.695	0.18
118_R	250_Y	0.693	0.18
214_K	430_W	0.693	0.18
328_I	527_V	0.692	0.18
212_V	290_A	0.692	0.18
24_L	421_I	0.691	0.18
451_S	511_S	0.691	0.18
20_L	237_M	0.690	0.18
173_L	463_G	0.689	0.18
22_I	334_S	0.688	0.18
33_G	308_T	0.687	0.18
409_L	523_R	0.686	0.18
19_F	145_F	0.684	0.18
195_I	285_L	0.683	0.18
520_D	523_R	0.682	0.18
52_I	244_F	0.682	0.18
332_V	430_W	0.682	0.18
191_G	423_K	0.681	0.18
46_Y	450_S	0.681	0.18
183_Y	369_L	0.681	0.18
85_F	364_P	0.679	0.18
85_F	189_G	0.679	0.18
276_I	287_V	0.677	0.18
301_V	328_I	0.676	0.18
48_S	87_V	0.676	0.18
125_M	319_D	0.675	0.18
114_S	184_T	0.674	0.18
113_V	124_K	0.673	0.18
58_V	514_F	0.673	0.18
46_Y	147_D	0.672	0.18
244_F	521_L	0.672	0.18
280_V	346_R	0.671	0.18
460_L	519_M	0.670	0.18
40_K	354_A	0.670	0.18
335_I	356_Q	0.669	0.18
23_G	84_D	0.669	0.18
281_L	288_Y	0.669	0.18
63_P	153_T	0.668	0.18
228_R	435_Y	0.668	0.18
200_F	204_L	0.667	0.17
202_Y	228_R	0.665	0.17
63_P	71_Y	0.664	0.17
79_I	442_F	0.664	0.17
67_I	333_F	0.664	0.17
279_S	313_L	0.663	0.17
504_G	508_M	0.662	0.17
334_S	364_P	0.662	0.17
33_G	99_I	0.661	0.17
317_L	513_F	0.661	0.17
318_I	341_I	0.660	0.17
468_I	498_W	0.659	0.17
327_A	399_T	0.659	0.17
282_L	422_M	0.657	0.17
64_V	424_N	0.656	0.17
86_L	175_G	0.656	0.17
81_L	290_A	0.653	0.17
213_S	355_I	0.652	0.17
153_T	385_W	0.652	0.17
195_I	269_L	0.651	0.17
13_A	77_I	0.650	0.17
308_T	312_V	0.650	0.17
23_G	492_N	0.650	0.17
53_F	73_I	0.649	0.17
49_V	128_L	0.648	0.17
249_K	317_L	0.647	0.17
286_L	289_G	0.647	0.17
261_S	264_E	0.647	0.17
25_S	89_T	0.643	0.17
100_Y	402_Y	0.643	0.17
421_I	443_P	0.642	0.17
153_T	200_F	0.642	0.17
326_I	333_F	0.641	0.17
326_I	331_L	0.641	0.17
239_N	243_P	0.641	0.17
200_F	371_F	0.640	0.17
269_L	291_F	0.639	0.17
56_V	354_A	0.639	0.17
63_P	364_P	0.638	0.17
337_L	482_K	0.637	0.17
361_F	477_S	0.637	0.17
482_K	513_F	0.637	0.17
38_K	135_P	0.636	0.17
420_E	524_E	0.635	0.17
179_A	329_V	0.635	0.17
278_I	517_K	0.633	0.16
463_G	466_W	0.633	0.16
6_L	244_F	0.632	0.16
82_A	85_F	0.632	0.16
212_V	422_M	0.631	0.16
244_F	517_K	0.630	0.16
361_F	364_P	0.630	0.16
27_I	313_L	0.629	0.16
114_S	417_Q	0.626	0.16
81_L	421_I	0.626	0.16
74_G	78_G	0.626	0.16
35_I	47_I	0.624	0.16
274_L	277_G	0.624	0.16
438_I	443_P	0.623	0.16
31_F	301_V	0.623	0.16
144_S	402_Y	0.621	0.16
52_I	56_V	0.621	0.16
52_I	105_T	0.621	0.16
33_G	214_K	0.621	0.16
89_T	140_N	0.620	0.16
23_G	49_V	0.619	0.16
364_P	499_D	0.619	0.16
23_G	195_I	0.619	0.16
200_F	357_T	0.618	0.16
142_I	193_L	0.617	0.16
458_G	481_M	0.617	0.16
465_Y	489_A	0.617	0.16
291_F	294_I	0.617	0.16
280_V	328_I	0.617	0.16
422_M	427_F	0.616	0.16
118_R	134_W	0.616	0.16
325_F	337_L	0.615	0.16
150_F	323_V	0.614	0.16
26_I	98_G	0.614	0.16
189_G	483_S	0.614	0.16
115_E	337_L	0.613	0.16
64_V	517_K	0.613	0.16
330_S	456_A	0.613	0.16
241_I	244_F	0.611	0.16
149_I	452_T	0.611	0.16
153_T	374_T	0.610	0.16
309_T	498_W	0.609	0.16
243_P	268_N	0.608	0.16
87_V	97_I	0.608	0.16
156_E	171_G	0.606	0.16
156_E	169_G	0.606	0.16
23_G	52_I	0.605	0.16
322_R	410_G	0.605	0.16
145_F	148_A	0.605	0.16
19_F	186_A	0.604	0.16
247_L	329_V	0.604	0.16
139_A	356_Q	0.603	0.16
141_L	204_L	0.602	0.16
287_V	490_N	0.602	0.16
259_A	446_I	0.601	0.16
124_K	210_Y	0.600	0.16
263_E	307_S	0.597	0.15
66_L	487_A	0.594	0.15
132_Y	138_A	0.593	0.15
98_G	128_L	0.593	0.15
95_I	345_E	0.591	0.15
14_S	390_Y	0.590	0.15
12_L	525_K	0.590	0.15
63_P	67_I	0.589	0.15
127_K	187_L	0.588	0.15
129_Y	188_D	0.588	0.15
129_Y	177_F	0.587	0.15
22_I	63_P	0.587	0.15
211_T	395_G	0.585	0.15
179_A	293_T	0.582	0.15
281_L	287_V	0.581	0.15
173_L	177_F	0.581	0.15
145_F	205_R	0.581	0.15
386_T	446_I	0.580	0.15
264_E	295_S	0.579	0.15
196_P	354_A	0.574	0.15
205_R	414_M	0.574	0.15
371_F	443_P	0.572	0.15
214_K	387_D	0.572	0.15
257_R	294_I	0.571	0.15
347_V	525_K	0.571	0.15
317_L	416_N	0.570	0.15
19_F	22_I	0.569	0.15
138_A	208_A	0.568	0.15
389_F	393_L	0.568	0.15
327_A	497_A	0.568	0.15
338_G	408_W	0.564	0.15
101_Q	227_G	0.564	0.15
390_Y	432_K	0.564	0.15
127_K	350_V	0.564	0.15
33_G	74_G	0.564	0.15
258_S	274_L	0.564	0.15
132_Y	329_V	0.563	0.15
32_L	420_E	0.562	0.15
330_S	527_V	0.562	0.15
139_A	319_D	0.560	0.15
111_L	358_Y	0.557	0.14
117_Y	463_G	0.557	0.14
204_L	424_N	0.557	0.14
298_P	307_S	0.557	0.14
240_T	280_V	0.556	0.14
265_T	346_R	0.555	0.14
86_L	151_Y	0.554	0.14
70_V	78_G	0.554	0.14
174_I	445_I	0.553	0.14
116_N	517_K	0.553	0.14
51_E	97_I	0.552	0.14
418_Y	525_K	0.551	0.14
195_I	514_F	0.549	0.14
260_S	328_I	0.549	0.14
33_G	175_G	0.548	0.14
451_S	462_I	0.548	0.14
278_I	286_L	0.547	0.14
280_V	513_F	0.546	0.14
191_G	290_A	0.546	0.14
324_L	328_I	0.546	0.14
152_I	370_L	0.545	0.14
28_T	455_S	0.545	0.14
287_V	489_A	0.545	0.14
211_T	404_F	0.544	0.14
387_D	396_F	0.544	0.14
83_V	141_L	0.542	0.14
266_R	269_L	0.542	0.14
195_I	249_K	0.541	0.14
331_L	403_V	0.541	0.14
26_I	195_I	0.538	0.14
80_E	406_S	0.537	0.14
178_T	374_T	0.537	0.14
364_P	468_I	0.537	0.14
420_E	456_A	0.535	0.14
56_V	214_K	0.534	0.14
219_T	353_P	0.534	0.14
32_L	229_M	0.533	0.14
408_W	463_G	0.533	0.14
68_F	420_E	0.532	0.14
151_Y	442_F	0.531	0.14
101_Q	217_L	0.530	0.14
201_T	399_T	0.530	0.14
141_L	424_N	0.529	0.14
41_A	116_N	0.529	0.14
16_G	228_R	0.528	0.14
157_V	500_S	0.527	0.14
61_F	94_N	0.525	0.14
260_S	307_S	0.525	0.14
98_G	308_T	0.525	0.14
309_T	500_S	0.525	0.14
294_I	298_P	0.524	0.14
33_G	217_L	0.524	0.14
129_Y	468_I	0.523	0.14
427_F	435_Y	0.523	0.14
397_I	477_S	0.523	0.14
113_V	116_N	0.522	0.14
392_I	526_Y	0.522	0.14
230_R	488_T	0.521	0.14
114_S	421_I	0.518	0.13
114_S	238_S	0.518	0.13
80_E	94_N	0.517	0.13
19_F	418_Y	0.517	0.13
335_I	403_V	0.517	0.13
333_F	445_I	0.517	0.13
130_I	229_M	0.517	0.13
124_K	434_R	0.517	0.13
129_Y	520_D	0.513	0.13
151_Y	157_V	0.513	0.13
164_S	358_Y	0.513	0.13
269_L	278_I	0.512	0.13
369_L	494_P	0.510	0.13
329_V	494_P	0.508	0.13
106_V	199_I	0.508	0.13
169_G	457_W	0.507	0.13
156_E	457_W	0.507	0.13
171_G	457_W	0.507	0.13
153_T	157_V	0.506	0.13
90_A	147_D	0.505	0.13
32_L	463_G	0.505	0.13
403_V	441_T	0.505	0.13
337_L	501_L	0.504	0.13
193_L	316_L	0.504	0.13
62_F	433_L	0.504	0.13
352_I	433_L	0.503	0.13
21_T	148_A	0.503	0.13
501_L	505_I	0.503	0.13
200_F	330_S	0.503	0.13
142_I	342_A	0.501	0.13
40_K	77_I	0.501	0.13
237_M	240_T	0.501	0.13
186_A	517_K	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2onkC	2	0.4449	99.8	0.891	Contact Map
3d31C	2	0.4318	99.8	0.896	Contact Map
4tquN	1	0.4636	99.8	0.9	Contact Map
3tuiA	2	0.3832	99.8	0.9	Contact Map
4tquM	1	0.4692	99.7	0.902	Contact Map
3rlfG	1	0.4692	99.7	0.904	Contact Map
3rlfF	1	0.3701	99.7	0.904	Contact Map
4ymuD	2	0.3776	99.7	0.905	Contact Map
1b9uA	1	0.0636	19.7	0.984	Contact Map
3wu2K	1	0.0692	7.9	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0136 seconds.