Q97VR1 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97VR1 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97VR1	Sequences: MRKNIALILLFSILAGIIVVPISSSQTSSSISHPLILGNISVLNSGKIPYDPTYYSFEAYQIHPPNVTPVVIRIATNAVFNNSGLTPYIVHVNIPKGNYSMEILNVSIAESNGAQYDRPVYIFANGVPIFWGSTQEFFNSTAETDVTMFENLLSGNVTFQLVLENFYDAKIGITGIYKMNVTLYLYPGNPPKGLPNYFIPLFLNNHNYSYIILNPLNDYISQNVTIPNGTYRMTLLLYEEGGGLDEFWYANEPATREIQVFYDNRLVGVVNPYQTIYTGGIDLFWWKPVTSINTLSFHSPYIIDLTPLLAISLPNNTIAVTVTNLETALQLTGTAAYDWDIAGVLMLWVNESNPLVSAKLLTAYNRFIDSSPIFNSGLVGEYYQEGGAYLLNYSAILQFKDGIEYSDVVQQGRFYAYQTFNALYEKAYLGEKFMEYASERGSLYNATLYYNIYYPIFMQFSVFEAPISNPHVIPFNLSYAQNGTLDLWLYYNYTNIFDKQNLTIRTMENVSAVGGFSGIIEVINRYGGAVLVSITSNNAVTAKNLINYILLNGNGYKEIFSAKGLQNSTSHFAGYYIYYKVQFIPITNGDPPNAHSEFLIEPIHFLRIIV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	610 (492)
Sequences:	402 (293)
Seq/√Len:	13.2

SULSO - Q97VR1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
516_F	520_I	5.680	1.00
276_I	456_I	4.690	1.00
518_G	524_N	4.251	1.00
516_F	524_N	4.218	1.00
136_E	247_F	3.962	1.00
532_V	544_N	3.765	0.99
52_P	57_F	3.735	0.99
57_F	60_Y	3.735	0.99
124_A	129_I	3.600	0.99
520_I	524_N	3.422	0.99
119_P	241_G	3.325	0.98
249_Y	281_I	3.298	0.98
512_A	516_F	3.127	0.98
117_D	279_G	2.965	0.97
56_S	60_Y	2.949	0.96
128_P	131_W	2.804	0.95
241_G	245_D	2.779	0.95
120_V	132_G	2.705	0.94
272_P	339_W	2.688	0.94
70_V	97_G	2.603	0.93
350_N	402_G	2.598	0.93
242_G	338_D	2.592	0.93
119_P	245_D	2.558	0.92
497_F	501_N	2.552	0.92
247_F	278_T	2.534	0.92
168_D	173_I	2.493	0.91
52_P	56_S	2.456	0.90
511_S	520_I	2.402	0.89
512_A	518_G	2.388	0.89
416_A	431_E	2.372	0.89
228_N	355_L	2.345	0.88
305_L	318_I	2.318	0.88
175_G	248_W	2.311	0.87
263_D	316_N	2.242	0.86
144_T	296_S	2.222	0.85
54_Y	58_E	2.211	0.85
233_M	347_L	2.113	0.82
117_D	247_F	2.064	0.81
290_T	294_T	2.049	0.80
116_Y	322_V	2.047	0.80
136_E	279_G	2.043	0.80
136_E	278_T	2.022	0.79
106_V	161_L	2.000	0.78
107_S	141_T	1.974	0.77
147_T	415_Y	1.970	0.77
234_T	348_W	1.964	0.77
94_I	125_N	1.954	0.77
130_F	242_G	1.928	0.76
164_E	427_A	1.910	0.75
213_L	341_I	1.910	0.75
494_T	498_D	1.884	0.74
128_P	544_N	1.846	0.72
473_I	477_L	1.825	0.71
199_I	226_I	1.796	0.70
131_W	240_E	1.795	0.70
114_A	173_I	1.790	0.70
300_P	344_V	1.787	0.70
247_F	279_G	1.785	0.70
257_E	389_Y	1.784	0.70
276_I	280_G	1.780	0.69
227_P	316_N	1.778	0.69
512_A	520_I	1.765	0.69
237_L	260_V	1.765	0.69
395_A	406_S	1.722	0.67
70_V	257_E	1.721	0.67
236_L	344_V	1.704	0.66
180_N	183_L	1.701	0.66
92_V	124_A	1.699	0.66
131_W	272_P	1.695	0.66
240_E	339_W	1.679	0.65
132_G	294_T	1.676	0.65
113_G	136_E	1.669	0.64
257_E	316_N	1.668	0.64
511_S	516_F	1.665	0.64
117_D	136_E	1.639	0.63
136_E	280_G	1.637	0.63
116_Y	278_T	1.626	0.62
138_F	454_Y	1.620	0.62
260_V	397_L	1.615	0.62
159_F	199_I	1.610	0.61
109_A	135_Q	1.606	0.61
144_T	544_N	1.580	0.60
182_T	291_S	1.578	0.60
52_P	60_Y	1.573	0.60
239_E	245_D	1.570	0.59
119_P	242_G	1.563	0.59
82_N	86_T	1.555	0.59
195_P	346_M	1.555	0.59
123_F	310_A	1.553	0.59
281_I	306_T	1.550	0.58
79_V	176_I	1.546	0.58
129_I	146_V	1.546	0.58
259_Q	321_T	1.544	0.58
376_S	380_G	1.543	0.58
226_I	230_T	1.541	0.58
374_F	380_G	1.541	0.58
52_P	58_E	1.537	0.58
235_L	260_V	1.533	0.58
122_I	161_L	1.527	0.57
102_E	294_T	1.522	0.57
70_V	316_N	1.511	0.56
186_Y	345_L	1.500	0.56
122_I	179_M	1.483	0.55
257_E	263_D	1.481	0.55
92_V	348_W	1.476	0.55
97_G	316_N	1.472	0.54
114_A	170_K	1.470	0.54
133_S	272_P	1.468	0.54
167_Y	174_T	1.461	0.54
131_W	339_W	1.460	0.54
104_L	146_V	1.430	0.52
320_V	536_S	1.425	0.52
236_L	240_E	1.418	0.51
225_T	373_I	1.417	0.51
235_L	245_D	1.409	0.51
274_Q	312_S	1.409	0.51
118_R	165_N	1.394	0.50
153_L	186_Y	1.394	0.50
294_T	539_A	1.389	0.50
80_F	83_S	1.385	0.50
118_R	279_G	1.384	0.50
79_V	178_K	1.375	0.49
429_L	458_M	1.374	0.49
75_A	88_Y	1.372	0.49
240_E	249_Y	1.366	0.49
117_D	278_T	1.366	0.49
198_F	277_Y	1.359	0.48
536_S	539_A	1.356	0.48
133_S	241_G	1.353	0.48
534_I	546_I	1.351	0.48
81_N	84_G	1.349	0.48
55_Y	534_I	1.348	0.48
240_E	293_N	1.343	0.48
136_E	165_N	1.335	0.47
144_T	240_E	1.329	0.47
97_G	257_E	1.328	0.47
131_W	544_N	1.327	0.47
104_L	249_Y	1.323	0.46
129_I	515_G	1.323	0.46
394_S	407_D	1.319	0.46
292_I	431_E	1.316	0.46
350_N	397_L	1.312	0.46
118_R	283_L	1.311	0.46
246_E	279_G	1.308	0.46
146_V	249_Y	1.304	0.45
116_Y	136_E	1.301	0.45
131_W	144_T	1.300	0.45
113_G	280_G	1.297	0.45
42_V	46_G	1.281	0.44
268_G	410_Q	1.281	0.44
263_D	268_G	1.271	0.44
133_S	339_W	1.269	0.44
399_F	402_G	1.269	0.44
84_G	162_V	1.261	0.43
151_N	197_Y	1.260	0.43
104_L	305_L	1.257	0.43
234_T	302_I	1.251	0.43
231_Y	399_F	1.248	0.43
147_T	421_N	1.245	0.42
42_V	45_S	1.243	0.42
125_N	157_V	1.233	0.42
77_N	251_N	1.230	0.42
117_D	165_N	1.224	0.41
124_A	159_F	1.224	0.41
104_L	345_L	1.221	0.41
144_T	295_L	1.218	0.41
106_V	294_T	1.215	0.41
88_Y	125_N	1.213	0.41
530_V	544_N	1.207	0.40
93_N	371_S	1.200	0.40
164_E	168_D	1.197	0.40
118_R	136_E	1.191	0.40
376_S	381_E	1.184	0.39
511_S	518_G	1.182	0.39
117_D	280_G	1.172	0.39
298_H	522_V	1.172	0.39
74_I	407_D	1.170	0.39
95_P	134_T	1.168	0.39
305_L	345_L	1.167	0.38
291_S	303_I	1.165	0.38
102_E	185_L	1.160	0.38
75_A	240_E	1.159	0.38
514_G	524_N	1.155	0.38
268_G	307_P	1.155	0.38
350_N	395_A	1.152	0.38
454_Y	536_S	1.151	0.38
116_Y	280_G	1.144	0.37
104_L	240_E	1.141	0.37
159_F	304_D	1.140	0.37
118_R	246_E	1.138	0.37
113_G	279_G	1.130	0.37
148_M	236_L	1.130	0.37
293_N	300_P	1.128	0.37
174_T	279_G	1.127	0.36
221_S	319_A	1.125	0.36
165_N	278_T	1.125	0.36
390_L	415_Y	1.121	0.36
414_F	433_F	1.119	0.36
174_T	278_T	1.116	0.36
129_I	426_K	1.115	0.36
277_Y	297_F	1.112	0.36
137_F	280_G	1.110	0.36
113_G	118_R	1.099	0.35
116_Y	279_G	1.085	0.34
113_G	174_T	1.083	0.34
70_V	263_D	1.081	0.34
460_F	528_G	1.080	0.34
519_I	524_N	1.079	0.34
201_L	303_I	1.078	0.34
106_V	387_G	1.077	0.34
259_Q	324_N	1.070	0.34
201_L	502_L	1.069	0.34
247_F	280_G	1.065	0.34
320_V	351_E	1.065	0.34
65_P	407_D	1.063	0.33
251_N	339_W	1.056	0.33
265_R	347_L	1.055	0.33
97_G	314_P	1.055	0.33
77_N	116_Y	1.055	0.33
154_S	262_Y	1.052	0.33
228_N	315_N	1.048	0.33
57_F	64_P	1.046	0.33
60_Y	70_V	1.046	0.33
240_E	286_W	1.045	0.33
350_N	356_V	1.022	0.32
132_G	296_S	1.017	0.31
293_N	301_Y	1.015	0.31
376_S	379_V	1.014	0.31
286_W	481_Q	1.012	0.31
135_Q	518_G	1.011	0.31
140_S	174_T	1.010	0.31
288_P	455_P	1.008	0.31
151_N	198_F	1.004	0.31
153_L	222_Q	1.002	0.31
350_N	399_F	1.002	0.31
276_I	393_Y	0.996	0.30
293_N	298_H	0.994	0.30
260_V	318_I	0.994	0.30
264_N	405_Y	0.993	0.30
177_Y	405_Y	0.989	0.30
286_W	431_E	0.987	0.30
275_T	542_A	0.983	0.30
56_S	59_A	0.979	0.30
153_L	277_Y	0.978	0.30
132_G	536_S	0.978	0.30
56_S	62_I	0.977	0.30
406_S	439_E	0.977	0.30
257_E	314_P	0.970	0.29
241_G	248_W	0.968	0.29
316_N	350_N	0.966	0.29
229_G	358_A	0.966	0.29
309_L	403_I	0.965	0.29
123_F	126_G	0.964	0.29
137_F	283_L	0.964	0.29
236_L	300_P	0.963	0.29
147_T	348_W	0.963	0.29
477_L	482_N	0.963	0.29
117_D	246_E	0.962	0.29
246_E	280_G	0.961	0.29
303_I	461_S	0.961	0.29
115_Q	249_Y	0.960	0.29
102_E	120_V	0.960	0.29
261_F	321_T	0.956	0.29
186_Y	426_K	0.953	0.28
356_V	389_Y	0.952	0.28
74_I	296_S	0.952	0.28
240_E	272_P	0.951	0.28
88_Y	182_T	0.949	0.28
163_L	455_P	0.947	0.28
251_N	272_P	0.946	0.28
235_L	343_G	0.941	0.28
73_R	180_N	0.939	0.28
273_Y	292_I	0.939	0.28
165_N	279_G	0.938	0.28
75_A	346_M	0.938	0.28
103_I	395_A	0.934	0.28
119_P	131_W	0.934	0.28
122_I	342_A	0.934	0.28
249_Y	286_W	0.932	0.28
230_T	444_Y	0.928	0.27
298_H	325_L	0.928	0.27
276_I	414_F	0.926	0.27
117_D	175_G	0.926	0.27
253_P	383_Y	0.923	0.27
159_F	183_L	0.922	0.27
145_D	248_W	0.922	0.27
50_Y	460_F	0.919	0.27
254_A	541_T	0.919	0.27
100_S	237_L	0.918	0.27
152_L	277_Y	0.918	0.27
73_R	166_F	0.912	0.27
125_N	182_T	0.911	0.27
107_S	341_I	0.909	0.27
183_L	310_A	0.908	0.27
119_P	133_S	0.907	0.27
115_Q	136_E	0.907	0.27
286_W	301_Y	0.905	0.26
107_S	317_T	0.903	0.26
153_L	286_W	0.903	0.26
41_S	44_N	0.903	0.26
243_G	420_F	0.902	0.26
116_Y	168_D	0.901	0.26
87_P	174_T	0.900	0.26
281_I	455_P	0.899	0.26
432_K	457_F	0.897	0.26
240_E	346_M	0.896	0.26
395_A	402_G	0.896	0.26
243_G	337_Y	0.892	0.26
475_F	485_L	0.892	0.26
291_S	534_I	0.890	0.26
198_F	251_N	0.889	0.26
266_L	269_V	0.887	0.26
120_V	345_L	0.887	0.26
214_N	239_E	0.884	0.26
116_Y	170_K	0.876	0.25
217_N	312_S	0.873	0.25
259_Q	266_L	0.870	0.25
227_P	257_E	0.869	0.25
205_N	210_Y	0.868	0.25
124_A	151_N	0.868	0.25
275_T	298_H	0.867	0.25
142_A	201_L	0.867	0.25
268_G	316_N	0.864	0.25
80_F	85_L	0.864	0.25
85_L	241_G	0.863	0.25
298_H	301_Y	0.863	0.25
226_I	488_W	0.861	0.25
135_Q	291_S	0.860	0.25
71_V	184_Y	0.860	0.25
149_F	213_L	0.858	0.25
194_L	348_W	0.855	0.24
117_D	283_L	0.854	0.24
435_E	452_I	0.854	0.24
287_K	389_Y	0.854	0.24
159_F	181_V	0.853	0.24
74_I	159_F	0.853	0.24
513_V	516_F	0.852	0.24
316_N	389_Y	0.848	0.24
199_I	224_V	0.846	0.24
100_S	187_P	0.844	0.24
242_G	293_N	0.840	0.24
249_Y	306_T	0.840	0.24
303_I	408_V	0.840	0.24
124_A	142_A	0.837	0.24
142_A	406_S	0.835	0.24
230_T	503_T	0.835	0.24
286_W	433_F	0.835	0.24
85_L	164_E	0.833	0.24
76_T	79_V	0.828	0.23
261_F	343_G	0.827	0.23
125_N	264_N	0.827	0.23
117_D	174_T	0.826	0.23
198_F	482_N	0.825	0.23
390_L	543_K	0.824	0.23
344_V	439_E	0.822	0.23
174_T	297_F	0.819	0.23
90_V	413_R	0.818	0.23
118_R	278_T	0.818	0.23
72_I	195_P	0.817	0.23
277_Y	355_L	0.817	0.23
83_S	162_V	0.816	0.23
177_Y	345_L	0.815	0.23
114_A	157_V	0.814	0.23
338_D	458_M	0.812	0.23
197_Y	349_V	0.812	0.23
127_V	230_T	0.811	0.23
135_Q	271_N	0.809	0.23
161_L	181_V	0.809	0.23
514_G	518_G	0.807	0.23
128_P	275_T	0.805	0.23
499_K	505_R	0.804	0.23
74_I	124_A	0.804	0.23
113_G	278_T	0.804	0.23
314_P	350_N	0.802	0.22
197_Y	200_P	0.802	0.22
364_Y	411_Q	0.800	0.22
307_P	402_G	0.799	0.22
146_V	183_L	0.799	0.22
516_F	545_L	0.798	0.22
80_F	241_G	0.796	0.22
165_N	283_L	0.794	0.22
157_V	228_N	0.791	0.22
231_Y	349_V	0.791	0.22
86_T	306_T	0.790	0.22
323_T	345_L	0.789	0.22
138_F	539_A	0.787	0.22
364_Y	417_Y	0.787	0.22
132_G	272_P	0.787	0.22
210_Y	342_A	0.787	0.22
128_P	273_Y	0.787	0.22
341_I	462_V	0.786	0.22
97_G	201_L	0.786	0.22
285_W	457_F	0.781	0.22
233_M	305_L	0.780	0.22
115_Q	279_G	0.778	0.22
146_V	153_L	0.775	0.21
271_N	433_F	0.773	0.21
268_G	273_Y	0.773	0.21
237_L	537_N	0.773	0.21
164_E	173_I	0.772	0.21
240_E	344_V	0.771	0.21
226_I	483_G	0.771	0.21
203_L	277_Y	0.769	0.21
104_L	186_Y	0.768	0.21
162_V	245_D	0.768	0.21
80_F	346_M	0.767	0.21
211_I	295_L	0.765	0.21
124_A	135_Q	0.765	0.21
90_V	173_I	0.764	0.21
84_G	245_D	0.763	0.21
114_A	287_K	0.762	0.21
493_Y	497_F	0.760	0.21
213_L	487_L	0.759	0.21
134_T	163_L	0.759	0.21
113_G	247_F	0.758	0.21
267_V	435_E	0.753	0.21
211_I	220_I	0.752	0.21
212_I	243_G	0.750	0.21
63_H	143_E	0.749	0.21
186_Y	529_A	0.748	0.21
295_L	539_A	0.747	0.21
117_D	137_F	0.747	0.21
279_G	283_L	0.746	0.20
360_L	363_A	0.746	0.20
381_E	395_A	0.744	0.20
154_S	451_N	0.744	0.20
118_R	137_F	0.743	0.20
41_S	50_Y	0.742	0.20
182_T	337_Y	0.741	0.20
137_F	278_T	0.740	0.20
118_R	247_F	0.739	0.20
130_F	342_A	0.739	0.20
116_Y	247_F	0.737	0.20
435_E	455_P	0.737	0.20
94_I	297_F	0.736	0.20
106_V	121_Y	0.734	0.20
236_L	293_N	0.733	0.20
461_S	478_S	0.731	0.20
397_L	451_N	0.729	0.20
243_G	338_D	0.728	0.20
99_Y	150_E	0.728	0.20
111_S	232_R	0.727	0.20
382_Y	543_K	0.727	0.20
115_Q	118_R	0.726	0.20
211_I	322_V	0.725	0.20
51_D	57_F	0.725	0.20
257_E	350_N	0.724	0.20
398_Q	403_I	0.722	0.20
210_Y	245_D	0.721	0.20
104_L	153_L	0.720	0.20
65_P	360_L	0.719	0.20
131_W	275_T	0.719	0.20
175_G	283_L	0.718	0.20
409_V	503_T	0.717	0.19
199_I	306_T	0.717	0.19
165_N	247_F	0.717	0.19
144_T	348_W	0.716	0.19
314_P	399_F	0.707	0.19
80_F	119_P	0.706	0.19
84_G	160_Q	0.705	0.19
251_N	288_P	0.704	0.19
119_P	240_E	0.703	0.19
113_G	117_D	0.703	0.19
157_V	300_P	0.703	0.19
103_I	143_E	0.703	0.19
231_Y	400_K	0.702	0.19
316_N	402_G	0.702	0.19
105_N	385_E	0.701	0.19
83_S	241_G	0.701	0.19
396_I	403_I	0.701	0.19
152_L	248_W	0.699	0.19
273_Y	419_T	0.699	0.19
126_G	129_I	0.697	0.19
81_N	167_Y	0.697	0.19
181_V	230_T	0.695	0.19
83_S	160_Q	0.693	0.19
227_P	402_G	0.692	0.19
430_G	457_F	0.691	0.19
275_T	339_W	0.691	0.19
141_T	159_F	0.691	0.19
354_P	397_L	0.690	0.19
197_Y	380_G	0.688	0.19
74_I	153_L	0.688	0.19
126_G	302_I	0.685	0.18
240_E	298_H	0.680	0.18
168_D	174_T	0.680	0.18
97_G	263_D	0.678	0.18
253_P	257_E	0.677	0.18
53_T	60_Y	0.677	0.18
249_Y	293_N	0.675	0.18
316_N	399_F	0.671	0.18
42_V	48_I	0.669	0.18
102_E	290_T	0.668	0.18
66_N	438_S	0.667	0.18
56_S	61_Q	0.663	0.18
126_G	245_D	0.663	0.18
238_Y	242_G	0.663	0.18
144_T	532_V	0.662	0.18
417_Y	492_N	0.660	0.18
106_V	122_I	0.660	0.18
201_L	459_Q	0.659	0.18
116_Y	166_F	0.657	0.18
99_Y	236_L	0.653	0.17
118_R	175_G	0.651	0.17
80_F	86_T	0.650	0.17
194_L	405_Y	0.650	0.17
245_D	342_A	0.650	0.17
236_L	363_A	0.650	0.17
199_I	451_N	0.650	0.17
190_P	451_N	0.650	0.17
281_I	291_S	0.649	0.17
227_P	307_P	0.648	0.17
185_L	322_V	0.647	0.17
341_I	480_A	0.644	0.17
190_P	225_T	0.642	0.17
74_I	469_N	0.642	0.17
235_L	305_L	0.641	0.17
179_M	344_V	0.640	0.17
308_L	313_L	0.640	0.17
351_E	362_T	0.638	0.17
131_W	245_D	0.636	0.17
77_N	88_Y	0.636	0.17
289_V	320_V	0.635	0.17
284_F	342_A	0.633	0.17
80_F	342_A	0.632	0.17
57_F	61_Q	0.632	0.17
312_S	357_S	0.632	0.17
511_S	519_I	0.632	0.17
240_E	300_P	0.631	0.17
237_L	505_R	0.629	0.17
122_I	203_L	0.629	0.17
92_V	147_T	0.628	0.17
320_V	341_I	0.628	0.17
534_I	541_T	0.627	0.17
230_T	287_K	0.627	0.17
224_V	345_L	0.627	0.17
479_Y	541_T	0.626	0.17
111_S	120_V	0.626	0.17
85_L	161_L	0.625	0.17
94_I	117_D	0.625	0.17
310_A	415_Y	0.625	0.17
102_E	141_T	0.625	0.17
70_V	268_G	0.623	0.17
301_Y	431_E	0.622	0.17
206_H	527_G	0.622	0.17
236_L	302_I	0.622	0.17
144_T	272_P	0.622	0.17
92_V	532_V	0.622	0.17
153_L	365_N	0.621	0.17
272_P	275_T	0.621	0.17
120_V	209_S	0.620	0.16
110_E	297_F	0.620	0.16
106_V	179_M	0.619	0.16
136_E	174_T	0.617	0.16
125_N	368_I	0.615	0.16
429_L	464_E	0.614	0.16
46_G	225_T	0.614	0.16
146_V	364_Y	0.614	0.16
84_G	173_I	0.612	0.16
200_P	227_P	0.611	0.16
386_G	411_Q	0.611	0.16
263_D	322_V	0.611	0.16
145_D	246_E	0.611	0.16
121_Y	242_G	0.610	0.16
79_V	82_N	0.608	0.16
80_F	252_E	0.608	0.16
487_L	527_G	0.608	0.16
150_E	448_L	0.606	0.16
52_P	59_A	0.605	0.16
40_I	43_L	0.605	0.16
208_Y	345_L	0.605	0.16
89_I	183_L	0.604	0.16
149_F	232_R	0.604	0.16
198_F	412_G	0.603	0.16
233_M	341_I	0.603	0.16
450_Y	456_I	0.602	0.16
253_P	402_G	0.601	0.16
460_F	534_I	0.601	0.16
146_V	219_Y	0.600	0.16
168_D	284_F	0.599	0.16
283_L	341_I	0.598	0.16
291_S	392_N	0.597	0.16
213_L	365_N	0.596	0.16
98_N	191_P	0.596	0.16
149_F	258_I	0.596	0.16
241_G	338_D	0.595	0.16
185_L	469_N	0.595	0.16
111_S	135_Q	0.595	0.16
417_Y	430_G	0.593	0.16
243_G	305_L	0.591	0.16
169_A	456_I	0.591	0.16
184_Y	454_Y	0.590	0.16
202_F	233_M	0.590	0.16
63_H	237_L	0.590	0.16
110_E	180_N	0.589	0.16
245_D	324_N	0.588	0.16
227_P	350_N	0.588	0.16
253_P	310_A	0.587	0.16
255_T	274_Q	0.587	0.16
275_T	293_N	0.587	0.16
159_F	272_P	0.586	0.16
163_L	250_A	0.586	0.16
226_I	347_L	0.585	0.15
154_S	449_Y	0.584	0.15
227_P	314_P	0.583	0.15
99_Y	408_V	0.583	0.15
116_Y	291_S	0.583	0.15
80_F	245_D	0.583	0.15
153_L	298_H	0.582	0.15
43_L	49_P	0.582	0.15
40_I	45_S	0.582	0.15
150_E	310_A	0.580	0.15
321_T	341_I	0.580	0.15
416_A	538_N	0.580	0.15
132_G	339_W	0.580	0.15
251_N	309_L	0.579	0.15
421_N	426_K	0.579	0.15
210_Y	242_G	0.577	0.15
100_S	238_Y	0.577	0.15
528_G	542_A	0.577	0.15
234_T	273_Y	0.576	0.15
47_K	50_Y	0.576	0.15
427_A	475_F	0.575	0.15
80_F	358_A	0.575	0.15
54_Y	57_F	0.574	0.15
293_N	342_A	0.574	0.15
138_F	185_L	0.569	0.15
128_P	272_P	0.568	0.15
116_Y	133_S	0.567	0.15
274_Q	290_T	0.566	0.15
175_G	247_F	0.566	0.15
92_V	233_M	0.565	0.15
122_I	337_Y	0.565	0.15
164_E	207_N	0.562	0.15
58_E	235_L	0.562	0.15
58_E	62_I	0.561	0.15
436_Y	462_V	0.561	0.15
359_K	398_Q	0.558	0.15
307_P	350_N	0.558	0.15
100_S	306_T	0.557	0.15
219_Y	319_A	0.556	0.15
102_E	420_F	0.556	0.15
159_F	185_L	0.556	0.15
83_S	245_D	0.555	0.15
55_Y	60_Y	0.555	0.15
116_Y	205_N	0.553	0.15
478_S	521_E	0.553	0.15
162_V	427_A	0.553	0.15
298_H	345_L	0.553	0.15
159_F	337_Y	0.553	0.15
272_P	544_N	0.552	0.15
133_S	294_T	0.551	0.15
82_N	160_Q	0.549	0.15
181_V	305_L	0.549	0.15
88_Y	157_V	0.548	0.14
296_S	514_G	0.548	0.14
47_K	467_I	0.548	0.14
83_S	89_I	0.548	0.14
240_E	301_Y	0.547	0.14
312_S	372_P	0.547	0.14
232_R	349_V	0.546	0.14
77_N	94_I	0.546	0.14
163_L	297_F	0.546	0.14
74_I	136_E	0.546	0.14
138_F	318_I	0.545	0.14
474_P	483_G	0.544	0.14
373_I	388_A	0.543	0.14
285_W	289_V	0.543	0.14
233_M	288_P	0.541	0.14
114_A	285_W	0.541	0.14
379_V	383_Y	0.540	0.14
242_G	300_P	0.540	0.14
136_E	167_Y	0.538	0.14
75_A	195_P	0.538	0.14
70_V	350_N	0.538	0.14
202_F	341_I	0.537	0.14
136_E	163_L	0.536	0.14
134_T	147_T	0.536	0.14
464_E	491_Y	0.536	0.14
130_F	183_L	0.535	0.14
221_S	225_T	0.535	0.14
149_F	236_L	0.535	0.14
362_T	517_S	0.534	0.14
175_G	297_F	0.533	0.14
142_A	160_Q	0.533	0.14
312_S	358_A	0.531	0.14
130_F	396_I	0.531	0.14
449_Y	541_T	0.530	0.14
103_I	385_E	0.530	0.14
386_G	505_R	0.530	0.14
272_P	296_S	0.530	0.14
144_T	283_L	0.529	0.14
208_Y	530_V	0.529	0.14
169_A	276_I	0.528	0.14
418_Q	458_M	0.528	0.14
111_S	297_F	0.527	0.14
72_I	273_Y	0.527	0.14
77_N	133_S	0.526	0.14
206_H	430_G	0.525	0.14
54_Y	60_Y	0.525	0.14
136_E	254_A	0.525	0.14
232_R	348_W	0.525	0.14
125_N	237_L	0.525	0.14
395_A	399_F	0.524	0.14
246_E	278_T	0.524	0.14
214_N	245_D	0.524	0.14
258_I	272_P	0.524	0.14
351_E	417_Y	0.522	0.14
116_Y	246_E	0.522	0.14
51_D	55_Y	0.522	0.14
355_L	411_Q	0.522	0.14
46_G	486_D	0.522	0.14
262_Y	408_V	0.522	0.14
505_R	519_I	0.521	0.14
89_I	322_V	0.521	0.14
276_I	458_M	0.520	0.14
121_Y	210_Y	0.520	0.14
236_L	242_G	0.520	0.14
174_T	290_T	0.519	0.14
238_Y	344_V	0.519	0.14
61_Q	135_Q	0.518	0.14
298_H	302_I	0.518	0.14
87_P	246_E	0.517	0.14
45_S	91_H	0.517	0.14
517_S	520_I	0.517	0.14
237_L	305_L	0.516	0.14
133_S	544_N	0.514	0.14
338_D	406_S	0.512	0.14
97_G	142_A	0.512	0.14
92_V	139_N	0.511	0.14
311_I	366_R	0.508	0.13
104_L	148_M	0.508	0.13
185_L	382_Y	0.505	0.13
157_V	315_N	0.504	0.13
277_Y	352_S	0.503	0.13
126_G	135_Q	0.501	0.13
166_F	173_I	0.500	0.13
106_V	152_L	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3ks7A	3	0.4279	99.2	0.927	Contact Map
3pmsA	1	0.4328	99	0.934	Contact Map
4r4xA	1	0.5197	98.8	0.94	Contact Map
4aw7A	1	0.282	6.1	0.987	Contact Map
2pptA	2	0.2393	3.3	0.989	Contact Map
2vzpA	1	0.2016	2.9	0.989	Contact Map
3pe9A	1	0.1443	2.6	0.989	Contact Map
2rddB	1	0.0607	2.6	0.989	Contact Map
1m56D	1	0.0328	2.5	0.989	Contact Map
3hf5A	2	0.1623	2.4	0.989	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0134 seconds.