Q97VK5 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97VK5 - Dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide binding protein (DppA)

UniProt:	Q97VK5	Sequences: MSSLKGLALLSIMLIGIILPSLFLLQTSAQTSLTISPPNSSILIDVSQTAPPDALDPATGFYVQDGPLYQAIFQELVEFNGSNYLQVVPVIAQNWSTTNYENWTFFIRHGVYFPDGVQVNASTVWFSFYRTILMGQGPGVANYIELLFNSTQYGQTGYALPWGVAAAIQNVTGLPTTKNATLAANVLASILSHFNAANTTIQKIMEYPYQAVVVKGPYEVEINTLEPYRYFLLDIASWWGAIVNPVFIDEHGGVQPNTPNSYINDNGMEGTGPYVIKSVGPSLSEIVLVKNPHYWAANLSNIPLVAQPGHIPVIDIKYGLSHNNRVEDFATNQAQISYVSLPFLQQMYSAYQYNKYVSFNQIFANLGYEAAVFYIAMNTQIFPTNITAFRQAIVHAINYTAELDIFKFQNQTLAIEYLGPISPVFPLYNEVMQLDKLHPYTYNLSLALHYLNEAGYEGHFYVVLPNGTTIGDTNGKQLGTLTIYALAPVNELEQEQLTIIQESLQKIGISTSIQYVLPSVTDNWITPSGTPALIDLGWFPDWPDPIFQELMAQTDVLYGGISGDLAWVNISTLQQIYENLPFLTNQTQQTLEVAKVYQILYQQAPYAWLPNPVVYYFVQPYVKGFVYNPFIGYYYNLMYYQPYTITISTSTSTTSSTTTTTLQTTTTSIVFGGATNITTSVTSMTTTTSSSSSTLIYAVIGIVIVIIIIVVAVVLLRGRGRGGPGF	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	726 (587)
Sequences:	310 (282)
Seq/√Len:	11.6

ECOLI - OPPA MPPA YGIS SAPA DPPA GSIB YEJA DDPA NIKA
BACSU - OPPA DPPE APPA
HALSA - Q9HMW4 Q9HMI3
SULSO - Q97VK5 Q97VF7 Q97UH5 Q97UG7

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
216_G	219_E	5.656	1.00
110_G	118_Q	4.997	1.00
277_K	289_V	4.903	1.00
544_D	589_Q	4.260	1.00
274_Y	311_I	4.153	0.99
290_K	312_P	3.769	0.99
56_D	130_R	3.486	0.98
545_P	589_Q	3.486	0.98
395_H	446_L	3.434	0.98
6_G	10_L	3.391	0.98
62_Y	65_D	3.339	0.98
111_V	119_V	3.317	0.97
106_F	219_E	3.299	0.97
11_S	18_I	3.275	0.97
213_V	223_N	3.273	0.97
116_G	120_N	3.259	0.97
68_L	288_L	3.137	0.96
125_W	214_V	3.041	0.96
22_L	25_L	2.975	0.95
112_Y	118_Q	2.917	0.94
388_A	453_E	2.775	0.93
80_N	86_Q	2.770	0.93
448_L	452_N	2.766	0.93
213_V	221_E	2.741	0.92
77_V	544_D	2.652	0.91
15_I	19_L	2.593	0.90
275_V	289_V	2.589	0.90
152_Q	585_N	2.583	0.90
14_L	18_I	2.575	0.90
125_W	212_V	2.502	0.88
501_Q	513_I	2.490	0.88
132_I	151_T	2.485	0.88
245_P	249_D	2.485	0.88
138_P	242_I	2.463	0.87
22_L	622_V	2.414	0.86
635_Y	639_Y	2.377	0.85
121_A	214_V	2.299	0.83
121_A	212_V	2.283	0.83
314_I	571_S	2.253	0.82
482_T	511_T	2.250	0.82
538_W	541_D	2.225	0.81
17_I	23_F	2.219	0.81
634_Y	638_M	2.194	0.80
181_T	189_S	2.176	0.80
449_H	453_E	2.146	0.79
57_P	113_F	2.137	0.78
585_N	588_Q	2.132	0.78
388_A	450_Y	2.111	0.77
11_S	21_S	2.098	0.77
76_L	92_A	2.091	0.77
501_Q	505_Q	2.088	0.77
119_V	271_T	2.071	0.76
446_L	449_H	2.065	0.76
12_I	24_L	2.063	0.76
113_F	267_G	2.053	0.75
451_L	509_I	2.041	0.75
9_L	31_T	2.022	0.74
375_I	607_A	2.021	0.74
92_A	95_W	2.014	0.74
18_I	24_L	1.992	0.73
94_N	99_N	1.990	0.73
77_V	232_L	1.989	0.73
74_Q	271_T	1.976	0.72
595_K	607_A	1.974	0.72
633_Y	636_N	1.942	0.71
57_P	130_R	1.941	0.71
113_F	270_G	1.927	0.70
272_G	390_R	1.908	0.70
116_G	396_A	1.905	0.70
153_Y	156_T	1.898	0.69
113_F	242_I	1.871	0.68
12_I	332_N	1.857	0.68
47_S	334_A	1.843	0.67
107_I	121_A	1.832	0.66
8_A	13_M	1.831	0.66
98_T	104_T	1.813	0.66
17_I	20_P	1.802	0.65
375_I	609_L	1.780	0.64
231_F	547_F	1.780	0.64
392_A	451_L	1.777	0.64
6_G	11_S	1.766	0.63
189_S	192_S	1.750	0.63
183_A	189_S	1.738	0.62
181_T	184_A	1.730	0.62
187_L	191_L	1.707	0.61
549_E	573_L	1.699	0.60
184_A	187_L	1.698	0.60
8_A	292_P	1.692	0.60
106_F	216_G	1.684	0.60
538_W	545_P	1.672	0.59
468_T	471_G	1.655	0.58
77_V	545_P	1.654	0.58
279_V	538_W	1.654	0.58
16_G	19_L	1.621	0.57
115_D	598_Q	1.619	0.57
451_L	455_G	1.595	0.55
7_L	14_L	1.585	0.55
447_A	450_Y	1.582	0.55
12_I	509_I	1.579	0.55
31_T	34_T	1.579	0.55
538_W	544_D	1.574	0.54
150_S	153_Y	1.561	0.54
244_N	247_F	1.559	0.54
113_F	421_I	1.559	0.54
340_S	533_L	1.555	0.53
107_I	118_Q	1.550	0.53
484_Y	513_I	1.545	0.53
121_A	220_V	1.531	0.52
572_T	575_Q	1.528	0.52
393_I	504_L	1.514	0.51
188_A	194_F	1.511	0.51
624_G	627_Y	1.495	0.50
132_I	234_D	1.493	0.50
447_A	508_G	1.480	0.50
634_Y	637_L	1.480	0.50
36_S	40_S	1.475	0.49
19_L	22_L	1.465	0.49
119_V	214_V	1.446	0.48
375_I	500_I	1.434	0.47
466_N	469_T	1.421	0.47
105_F	124_V	1.413	0.46
15_I	22_L	1.399	0.46
180_A	188_A	1.395	0.45
549_E	596_V	1.391	0.45
544_D	573_L	1.390	0.45
91_I	124_V	1.390	0.45
113_F	336_I	1.389	0.45
397_I	607_A	1.389	0.45
410_N	414_A	1.389	0.45
113_F	597_Y	1.386	0.45
406_F	602_Q	1.371	0.44
117_V	246_V	1.367	0.44
243_V	247_F	1.356	0.44
379_T	383_P	1.354	0.43
15_I	37_P	1.353	0.43
264_N	445_S	1.352	0.43
72_I	533_L	1.348	0.43
477_Q	510_S	1.343	0.43
8_A	14_L	1.337	0.43
89_P	92_A	1.330	0.42
23_F	93_Q	1.329	0.42
181_T	190_I	1.328	0.42
597_Y	608_W	1.327	0.42
15_I	445_S	1.324	0.42
180_A	186_V	1.323	0.42
568_V	603_Q	1.310	0.41
103_W	389_F	1.300	0.41
24_L	203_K	1.298	0.41
538_W	547_F	1.291	0.40
275_V	292_P	1.288	0.40
79_F	562_S	1.285	0.40
107_I	221_E	1.283	0.40
17_I	29_A	1.282	0.40
270_G	294_Y	1.281	0.40
54_A	76_L	1.281	0.40
629_P	636_N	1.274	0.40
98_T	101_E	1.273	0.40
162_W	166_A	1.273	0.40
583_L	592_E	1.270	0.39
535_D	610_P	1.268	0.39
211_A	508_G	1.265	0.39
180_A	184_A	1.264	0.39
368_Y	613_V	1.262	0.39
13_M	587_T	1.261	0.39
297_A	451_L	1.259	0.39
632_G	637_L	1.246	0.38
18_I	21_S	1.245	0.38
544_D	547_F	1.245	0.38
278_S	285_E	1.243	0.38
622_V	628_N	1.242	0.38
11_S	14_L	1.239	0.38
30_Q	37_P	1.231	0.38
188_A	191_L	1.229	0.38
393_I	452_N	1.228	0.37
406_F	600_L	1.228	0.37
288_L	480_T	1.227	0.37
42_I	312_P	1.226	0.37
392_A	447_A	1.225	0.37
375_I	498_T	1.223	0.37
113_F	119_V	1.223	0.37
621_Y	628_N	1.222	0.37
430_E	438_H	1.222	0.37
290_K	309_G	1.219	0.37
391_Q	604_A	1.212	0.37
190_I	193_H	1.211	0.37
297_A	309_G	1.208	0.37
281_P	481_L	1.201	0.36
10_L	14_L	1.198	0.36
20_P	27_T	1.197	0.36
148_F	154_G	1.188	0.36
288_L	375_I	1.185	0.35
184_A	195_N	1.180	0.35
214_V	220_V	1.179	0.35
158_Y	162_W	1.179	0.35
289_V	313_V	1.178	0.35
421_I	597_Y	1.173	0.35
56_D	419_G	1.169	0.35
185_N	190_I	1.166	0.35
580_L	596_V	1.165	0.35
113_F	124_V	1.164	0.35
632_G	636_N	1.164	0.35
242_I	597_Y	1.163	0.35
127_S	220_V	1.162	0.34
20_P	116_G	1.159	0.34
564_D	567_W	1.156	0.34
633_Y	638_M	1.154	0.34
104_T	127_S	1.153	0.34
537_G	542_W	1.149	0.34
104_T	274_Y	1.143	0.34
105_F	122_S	1.139	0.33
329_F	617_F	1.138	0.33
252_G	311_I	1.131	0.33
93_Q	106_F	1.127	0.33
445_S	449_H	1.126	0.33
76_L	124_V	1.123	0.33
417_Y	611_N	1.123	0.33
153_Y	225_L	1.120	0.33
422_S	568_V	1.117	0.32
62_Y	510_S	1.117	0.32
13_M	86_Q	1.115	0.32
25_L	608_W	1.114	0.32
267_G	270_G	1.114	0.32
314_I	365_N	1.113	0.32
398_N	500_I	1.112	0.32
180_A	183_A	1.111	0.32
30_Q	34_T	1.109	0.32
30_Q	33_L	1.104	0.32
274_Y	391_Q	1.104	0.32
94_N	106_F	1.101	0.32
82_S	86_Q	1.096	0.32
504_L	511_T	1.095	0.32
278_S	622_V	1.093	0.31
186_V	189_S	1.092	0.31
18_I	28_S	1.087	0.31
274_Y	312_P	1.085	0.31
398_N	403_L	1.084	0.31
557_L	569_N	1.083	0.31
199_T	202_Q	1.083	0.31
276_I	398_N	1.081	0.31
65_D	126_F	1.079	0.31
278_S	477_Q	1.078	0.31
397_I	500_I	1.077	0.31
163_G	314_I	1.076	0.31
52_P	72_I	1.076	0.31
493_E	535_D	1.075	0.31
77_V	589_Q	1.075	0.31
103_W	590_T	1.075	0.31
378_N	538_W	1.068	0.30
14_L	17_I	1.067	0.30
145_E	153_Y	1.064	0.30
159_A	316_I	1.057	0.30
57_P	73_F	1.049	0.30
633_Y	637_L	1.046	0.29
182_L	185_N	1.046	0.29
274_Y	504_L	1.044	0.29
509_I	609_L	1.043	0.29
12_I	344_L	1.039	0.29
195_N	198_N	1.039	0.29
75_E	91_I	1.039	0.29
537_G	549_E	1.038	0.29
626_V	630_F	1.037	0.29
388_A	391_Q	1.032	0.29
562_S	569_N	1.031	0.29
316_I	504_L	1.030	0.29
56_D	262_Y	1.029	0.29
53_D	108_R	1.028	0.29
59_T	372_V	1.026	0.29
24_L	207_Y	1.023	0.29
273_P	634_Y	1.022	0.29
24_L	27_T	1.022	0.29
184_A	193_H	1.020	0.28
529_G	552_A	1.020	0.28
222_I	228_Y	1.014	0.28
92_A	99_N	1.013	0.28
212_V	510_S	1.012	0.28
8_A	293_H	1.012	0.28
508_G	622_V	1.010	0.28
16_G	595_K	1.009	0.28
577_Y	596_V	1.009	0.28
125_W	296_A	1.009	0.28
54_A	492_L	1.008	0.28
418_L	503_S	1.006	0.28
7_L	11_S	1.004	0.28
420_P	597_Y	1.004	0.28
107_I	553_Q	1.003	0.28
13_M	17_I	1.002	0.28
92_A	443_N	1.002	0.28
26_Q	375_I	1.002	0.28
212_V	216_G	1.001	0.28
222_I	393_I	1.000	0.28
229_R	499_I	1.000	0.28
164_V	288_L	0.998	0.28
132_I	597_Y	0.997	0.28
99_N	466_N	0.996	0.27
326_V	350_A	0.996	0.27
8_A	11_S	0.995	0.27
182_L	188_A	0.990	0.27
10_L	15_I	0.990	0.27
134_M	211_A	0.985	0.27
49_T	64_Q	0.982	0.27
76_L	580_L	0.980	0.27
10_L	24_L	0.980	0.27
371_A	610_P	0.980	0.27
139_G	389_F	0.976	0.27
72_I	113_F	0.973	0.27
56_D	427_L	0.972	0.27
247_F	269_E	0.971	0.26
76_L	105_F	0.969	0.26
47_S	373_F	0.966	0.26
13_M	28_S	0.965	0.26
369_E	614_V	0.962	0.26
34_T	38_P	0.961	0.26
112_Y	169_Q	0.961	0.26
57_P	126_F	0.960	0.26
100_Y	425_F	0.960	0.26
102_N	223_N	0.958	0.26
49_T	316_I	0.957	0.26
22_L	27_T	0.954	0.26
547_F	550_L	0.953	0.26
466_N	470_I	0.950	0.26
625_F	628_N	0.950	0.26
484_Y	497_L	0.950	0.26
182_L	192_S	0.950	0.26
120_N	214_V	0.949	0.26
244_N	316_I	0.948	0.26
125_W	448_L	0.948	0.26
279_V	518_P	0.948	0.26
215_K	221_E	0.947	0.26
580_L	593_V	0.945	0.26
519_S	599_I	0.944	0.25
124_V	242_I	0.944	0.25
208_P	585_N	0.941	0.25
78_E	333_Q	0.941	0.25
541_D	547_F	0.939	0.25
479_G	512_S	0.935	0.25
121_A	125_W	0.933	0.25
56_D	334_A	0.933	0.25
426_P	546_I	0.933	0.25
158_Y	161_P	0.932	0.25
453_E	457_E	0.932	0.25
170_N	403_L	0.931	0.25
188_A	192_S	0.927	0.25
47_S	369_E	0.925	0.25
450_Y	455_G	0.924	0.25
121_A	216_G	0.924	0.25
18_I	29_A	0.924	0.25
314_I	339_V	0.924	0.25
125_W	328_D	0.923	0.25
253_G	294_Y	0.922	0.25
10_L	19_L	0.922	0.25
220_V	298_N	0.922	0.25
134_M	585_N	0.921	0.25
17_I	26_Q	0.920	0.25
193_H	196_A	0.920	0.25
16_G	452_N	0.920	0.25
65_D	484_Y	0.919	0.25
514_Q	564_D	0.919	0.25
273_P	309_G	0.918	0.24
273_P	288_L	0.917	0.24
171_V	274_Y	0.913	0.24
103_W	151_T	0.912	0.24
41_S	218_Y	0.911	0.24
83_N	92_A	0.908	0.24
196_A	212_V	0.908	0.24
321_S	393_I	0.908	0.24
17_I	591_L	0.904	0.24
455_G	466_N	0.904	0.24
192_S	197_A	0.904	0.24
101_E	635_Y	0.903	0.24
191_L	218_Y	0.903	0.24
10_L	276_I	0.903	0.24
20_P	25_L	0.903	0.24
224_T	548_Q	0.903	0.24
161_P	166_A	0.901	0.24
26_Q	278_S	0.900	0.24
329_F	515_Y	0.898	0.24
542_W	547_F	0.896	0.24
94_N	125_W	0.896	0.24
201_I	209_Y	0.895	0.24
183_A	188_A	0.894	0.24
33_L	40_S	0.893	0.24
16_G	289_V	0.892	0.24
57_P	270_G	0.892	0.24
52_P	56_D	0.889	0.23
417_Y	549_E	0.889	0.23
213_V	500_I	0.888	0.23
292_P	341_L	0.888	0.23
270_G	593_V	0.887	0.23
76_L	336_I	0.886	0.23
276_I	482_T	0.883	0.23
7_L	18_I	0.882	0.23
68_L	578_E	0.881	0.23
583_L	588_Q	0.881	0.23
511_T	622_V	0.875	0.23
270_G	309_G	0.874	0.23
333_Q	389_F	0.874	0.23
389_F	511_T	0.873	0.23
410_N	600_L	0.873	0.23
20_P	580_L	0.872	0.23
507_I	568_V	0.872	0.23
21_S	184_A	0.866	0.23
119_V	149_N	0.866	0.23
577_Y	593_V	0.865	0.23
572_T	576_I	0.865	0.23
68_L	128_F	0.863	0.23
74_Q	90_V	0.863	0.23
93_Q	349_S	0.863	0.23
575_Q	635_Y	0.862	0.23
399_Y	532_A	0.862	0.23
203_K	570_I	0.861	0.22
183_A	190_I	0.859	0.22
12_I	16_G	0.859	0.22
60_G	588_Q	0.859	0.22
21_S	25_L	0.858	0.22
59_T	274_Y	0.858	0.22
121_A	600_L	0.858	0.22
542_W	549_E	0.856	0.22
499_I	596_V	0.856	0.22
36_S	476_K	0.855	0.22
377_M	607_A	0.855	0.22
89_P	343_F	0.855	0.22
100_Y	107_I	0.854	0.22
24_L	187_L	0.851	0.22
379_T	382_F	0.850	0.22
54_A	571_S	0.849	0.22
80_N	589_Q	0.849	0.22
330_A	520_V	0.849	0.22
295_W	580_L	0.847	0.22
80_N	83_N	0.847	0.22
243_V	248_I	0.847	0.22
391_Q	601_Y	0.846	0.22
159_A	163_G	0.845	0.22
184_A	190_I	0.844	0.22
113_F	241_A	0.843	0.22
23_F	118_Q	0.843	0.22
443_N	574_Q	0.840	0.22
94_N	635_Y	0.838	0.22
98_T	224_T	0.836	0.22
371_A	552_A	0.835	0.22
101_E	223_N	0.835	0.22
51_P	451_L	0.834	0.22
54_A	543_P	0.834	0.22
7_L	20_P	0.834	0.22
575_Q	579_N	0.834	0.22
349_S	375_I	0.833	0.22
341_L	366_L	0.829	0.21
404_D	418_L	0.829	0.21
11_S	27_T	0.824	0.21
485_A	493_E	0.823	0.21
262_Y	294_Y	0.821	0.21
452_N	455_G	0.815	0.21
244_N	250_E	0.814	0.21
204_I	513_I	0.814	0.21
602_Q	632_G	0.814	0.21
22_L	28_S	0.812	0.21
629_P	632_G	0.812	0.21
222_I	231_F	0.812	0.21
373_F	610_P	0.811	0.21
10_L	25_L	0.811	0.21
44_I	506_K	0.810	0.21
65_D	485_A	0.810	0.21
553_Q	556_V	0.810	0.21
98_T	448_L	0.809	0.21
14_L	361_Q	0.809	0.21
600_L	608_W	0.808	0.21
131_T	294_Y	0.801	0.20
507_I	629_P	0.800	0.20
342_P	345_Q	0.798	0.20
287_V	605_P	0.798	0.20
290_K	313_V	0.797	0.20
273_P	607_A	0.796	0.20
309_G	455_G	0.796	0.20
107_I	263_I	0.795	0.20
631_I	636_N	0.789	0.20
111_V	271_T	0.783	0.20
271_T	550_L	0.781	0.20
86_Q	99_N	0.775	0.20
129_Y	547_F	0.773	0.20
185_N	191_L	0.772	0.20
66_G	528_S	0.770	0.19
231_F	544_D	0.769	0.19
477_Q	532_A	0.766	0.19
7_L	12_I	0.765	0.19
398_N	402_E	0.764	0.19
326_V	343_F	0.764	0.19
373_F	535_D	0.763	0.19
503_S	609_L	0.761	0.19
231_F	542_W	0.759	0.19
392_A	508_G	0.757	0.19
6_G	111_V	0.757	0.19
163_G	166_A	0.757	0.19
126_F	130_R	0.757	0.19
110_G	342_P	0.757	0.19
274_Y	453_E	0.756	0.19
182_L	194_F	0.755	0.19
10_L	17_I	0.755	0.19
182_L	186_V	0.754	0.19
634_Y	639_Y	0.750	0.19
13_M	444_L	0.750	0.19
83_N	115_D	0.749	0.19
292_P	457_E	0.748	0.19
513_I	553_Q	0.747	0.19
335_Q	454_A	0.746	0.19
195_N	219_E	0.745	0.19
447_A	454_A	0.743	0.19
8_A	120_N	0.742	0.19
20_P	169_Q	0.742	0.19
214_V	219_E	0.741	0.19
397_I	480_T	0.740	0.19
266_N	608_W	0.739	0.19
65_D	291_N	0.737	0.18
113_F	271_T	0.737	0.18
62_Y	637_L	0.736	0.18
93_Q	104_T	0.732	0.18
14_L	214_V	0.732	0.18
277_K	533_L	0.732	0.18
61_F	541_D	0.731	0.18
212_V	220_V	0.730	0.18
138_P	229_R	0.729	0.18
231_F	425_F	0.729	0.18
14_L	41_S	0.728	0.18
274_Y	390_R	0.727	0.18
47_S	62_Y	0.727	0.18
51_P	585_N	0.726	0.18
138_P	282_S	0.726	0.18
546_I	581_P	0.724	0.18
184_A	194_F	0.724	0.18
113_F	234_D	0.723	0.18
122_S	214_V	0.720	0.18
203_K	207_Y	0.719	0.18
113_F	210_Q	0.719	0.18
154_G	335_Q	0.717	0.18
121_A	296_A	0.716	0.18
384_T	540_P	0.716	0.18
143_Y	148_F	0.715	0.18
124_V	227_P	0.715	0.18
180_A	195_N	0.715	0.18
566_A	570_I	0.714	0.18
24_L	169_Q	0.712	0.18
402_E	504_L	0.712	0.18
74_Q	237_S	0.711	0.18
115_D	246_V	0.710	0.18
442_Y	446_L	0.710	0.18
445_S	575_Q	0.710	0.18
10_L	571_S	0.709	0.18
108_R	295_W	0.709	0.18
372_V	491_E	0.709	0.18
571_S	575_Q	0.708	0.18
16_G	445_S	0.704	0.18
45_D	414_A	0.704	0.18
18_I	41_S	0.703	0.17
19_L	162_W	0.701	0.17
154_G	533_L	0.700	0.17
224_T	231_F	0.699	0.17
205_M	209_Y	0.698	0.17
56_D	74_Q	0.696	0.17
95_W	427_L	0.696	0.17
510_S	571_S	0.696	0.17
142_N	505_Q	0.695	0.17
377_M	604_A	0.694	0.17
35_I	38_P	0.694	0.17
12_I	19_L	0.693	0.17
321_S	621_Y	0.689	0.17
171_V	616_Y	0.688	0.17
466_N	471_G	0.688	0.17
72_I	270_G	0.688	0.17
93_Q	578_E	0.688	0.17
94_N	97_T	0.688	0.17
42_I	120_N	0.688	0.17
445_S	448_L	0.687	0.17
629_P	634_Y	0.687	0.17
311_I	316_I	0.685	0.17
136_Q	500_I	0.684	0.17
77_V	618_V	0.684	0.17
148_F	152_Q	0.684	0.17
93_Q	313_V	0.681	0.17
123_T	538_W	0.681	0.17
180_A	187_L	0.680	0.17
629_P	638_M	0.679	0.17
537_G	552_A	0.679	0.17
115_D	210_Q	0.678	0.17
556_V	589_Q	0.677	0.17
211_A	216_G	0.677	0.17
54_A	391_Q	0.676	0.17
9_L	23_F	0.676	0.17
479_G	510_S	0.676	0.17
197_A	201_I	0.676	0.17
74_Q	294_Y	0.675	0.17
274_Y	616_Y	0.674	0.17
433_Q	443_N	0.674	0.17
248_I	294_Y	0.673	0.17
573_L	577_Y	0.673	0.17
628_N	637_L	0.672	0.17
33_L	41_S	0.671	0.17
580_L	592_E	0.671	0.17
377_M	414_A	0.669	0.17
57_P	421_I	0.669	0.17
123_T	332_N	0.667	0.16
252_G	328_D	0.667	0.16
130_R	334_A	0.667	0.16
26_Q	39_N	0.665	0.16
189_S	193_H	0.663	0.16
27_T	120_N	0.662	0.16
309_G	421_I	0.660	0.16
25_L	29_A	0.660	0.16
23_F	398_N	0.660	0.16
369_E	397_I	0.659	0.16
7_L	278_S	0.659	0.16
393_I	529_G	0.659	0.16
110_G	295_W	0.658	0.16
329_F	494_Q	0.657	0.16
368_Y	545_P	0.656	0.16
183_A	194_F	0.654	0.16
221_E	500_I	0.654	0.16
518_P	564_D	0.653	0.16
15_I	436_K	0.653	0.16
197_A	544_D	0.653	0.16
43_L	313_V	0.652	0.16
282_S	564_D	0.651	0.16
543_P	567_W	0.650	0.16
68_L	510_S	0.650	0.16
50_A	540_P	0.648	0.16
154_G	592_E	0.647	0.16
7_L	107_I	0.647	0.16
324_N	377_M	0.645	0.16
598_Q	602_Q	0.644	0.16
91_I	220_V	0.643	0.16
391_Q	602_Q	0.643	0.16
593_V	601_Y	0.643	0.16
416_E	452_N	0.640	0.16
73_F	279_V	0.638	0.16
200_T	203_K	0.638	0.16
32_S	225_L	0.638	0.16
10_L	16_G	0.637	0.16
214_V	443_N	0.635	0.16
41_S	582_F	0.635	0.16
326_V	347_M	0.634	0.16
95_W	98_T	0.633	0.16
55_L	605_P	0.631	0.16
436_K	592_E	0.631	0.16
77_V	105_F	0.630	0.16
286_I	607_A	0.630	0.16
237_S	538_W	0.628	0.15
79_F	552_A	0.628	0.15
6_G	21_S	0.628	0.15
56_D	155_Q	0.628	0.15
120_N	123_T	0.626	0.15
203_K	212_V	0.626	0.15
107_I	110_G	0.624	0.15
233_L	573_L	0.624	0.15
66_G	141_A	0.624	0.15
287_V	549_E	0.624	0.15
380_Q	383_P	0.623	0.15
68_L	227_P	0.623	0.15
145_E	149_N	0.622	0.15
601_Y	610_P	0.622	0.15
439_P	600_L	0.622	0.15
445_S	582_F	0.622	0.15
74_Q	295_W	0.621	0.15
134_M	589_Q	0.620	0.15
64_Q	448_L	0.620	0.15
134_M	219_E	0.619	0.15
46_V	573_L	0.618	0.15
527_P	609_L	0.618	0.15
381_I	384_T	0.617	0.15
622_V	636_N	0.617	0.15
269_E	417_Y	0.615	0.15
144_I	274_Y	0.615	0.15
28_S	37_P	0.615	0.15
182_L	189_S	0.614	0.15
273_P	444_L	0.612	0.15
223_N	480_T	0.612	0.15
78_E	327_E	0.611	0.15
401_A	416_E	0.611	0.15
311_I	329_F	0.610	0.15
187_L	197_A	0.610	0.15
288_L	390_R	0.609	0.15
11_S	15_I	0.608	0.15
343_F	411_Q	0.608	0.15
153_Y	441_T	0.607	0.15
502_E	587_T	0.607	0.15
549_E	552_A	0.607	0.15
206_E	281_P	0.607	0.15
22_L	51_P	0.606	0.15
313_V	638_M	0.605	0.15
373_F	584_T	0.605	0.15
363_F	620_P	0.605	0.15
55_L	612_P	0.603	0.15
318_Y	371_A	0.603	0.15
182_L	187_L	0.602	0.15
7_L	388_A	0.602	0.15
185_N	198_N	0.602	0.15
188_A	197_A	0.601	0.15
76_L	224_T	0.601	0.15
245_P	250_E	0.600	0.15
549_E	581_P	0.600	0.15
434_L	443_N	0.599	0.15
23_F	438_H	0.599	0.15
40_S	106_F	0.599	0.15
54_A	232_L	0.598	0.15
523_N	599_I	0.597	0.15
338_Y	498_T	0.597	0.15
435_D	507_I	0.597	0.15
212_V	287_V	0.596	0.15
79_F	337_S	0.596	0.15
341_L	587_T	0.595	0.15
195_N	445_S	0.595	0.15
55_L	65_D	0.593	0.15
505_Q	510_S	0.592	0.15
35_I	40_S	0.592	0.15
181_T	195_N	0.591	0.15
20_P	24_L	0.590	0.14
76_L	127_S	0.590	0.14
38_P	86_Q	0.590	0.14
82_S	222_I	0.590	0.14
107_I	614_V	0.590	0.14
183_A	191_L	0.589	0.14
21_S	26_Q	0.587	0.14
286_I	617_F	0.587	0.14
186_V	191_L	0.586	0.14
63_V	368_Y	0.584	0.14
10_L	21_S	0.582	0.14
270_G	347_M	0.581	0.14
327_E	330_A	0.581	0.14
94_N	210_Q	0.580	0.14
167_A	170_N	0.580	0.14
229_R	403_L	0.580	0.14
631_I	634_Y	0.580	0.14
526_T	552_A	0.579	0.14
379_T	384_T	0.578	0.14
635_Y	638_M	0.578	0.14
23_F	445_S	0.577	0.14
73_F	288_L	0.577	0.14
92_A	105_F	0.577	0.14
15_I	591_L	0.576	0.14
469_T	476_K	0.576	0.14
47_S	631_I	0.574	0.14
429_N	594_A	0.573	0.14
152_Q	156_T	0.573	0.14
363_F	572_T	0.573	0.14
191_L	196_A	0.573	0.14
453_E	510_S	0.573	0.14
211_A	214_V	0.573	0.14
329_F	343_F	0.570	0.14
62_Y	536_L	0.569	0.14
480_T	532_A	0.569	0.14
47_S	53_D	0.569	0.14
54_A	583_L	0.568	0.14
81_G	107_I	0.568	0.14
14_L	216_G	0.567	0.14
142_N	150_S	0.567	0.14
7_L	17_I	0.567	0.14
291_N	377_M	0.567	0.14
193_H	197_A	0.566	0.14
313_V	511_T	0.565	0.14
89_P	99_N	0.564	0.14
24_L	571_S	0.563	0.14
632_G	639_Y	0.563	0.14
140_V	144_I	0.562	0.14
551_M	610_P	0.561	0.14
188_A	196_A	0.560	0.14
38_P	445_S	0.558	0.14
163_G	168_I	0.558	0.14
427_L	443_N	0.558	0.14
9_L	17_I	0.558	0.14
229_R	373_F	0.556	0.14
184_A	189_S	0.556	0.14
146_L	150_S	0.555	0.14
392_A	416_E	0.555	0.14
58_A	130_R	0.555	0.14
289_V	477_Q	0.554	0.14
27_T	97_T	0.553	0.14
123_T	585_N	0.553	0.14
397_I	441_T	0.553	0.14
181_T	188_A	0.552	0.14
167_A	393_I	0.552	0.14
220_V	521_T	0.552	0.14
335_Q	606_Y	0.550	0.14
493_E	609_L	0.550	0.14
86_Q	595_K	0.549	0.14
151_T	362_I	0.549	0.14
165_A	400_T	0.549	0.14
168_I	284_S	0.548	0.13
263_I	506_K	0.548	0.13
138_P	529_G	0.546	0.13
231_F	541_D	0.546	0.13
30_Q	41_S	0.545	0.13
347_M	629_P	0.544	0.13
103_W	270_G	0.543	0.13
72_I	271_T	0.543	0.13
181_T	199_T	0.542	0.13
87_V	96_S	0.542	0.13
141_A	159_A	0.542	0.13
46_V	392_A	0.541	0.13
455_G	458_G	0.541	0.13
485_A	518_P	0.540	0.13
24_L	49_T	0.540	0.13
557_L	560_G	0.539	0.13
52_P	130_R	0.539	0.13
32_S	36_S	0.538	0.13
565_L	568_V	0.538	0.13
55_L	552_A	0.538	0.13
382_F	531_P	0.536	0.13
244_N	517_L	0.536	0.13
7_L	98_T	0.536	0.13
109_H	533_L	0.535	0.13
110_G	216_G	0.535	0.13
274_Y	629_P	0.534	0.13
10_L	169_Q	0.532	0.13
76_L	447_A	0.531	0.13
124_V	598_Q	0.530	0.13
269_E	275_V	0.529	0.13
56_D	541_D	0.528	0.13
220_V	533_L	0.528	0.13
229_R	544_D	0.527	0.13
218_Y	572_T	0.527	0.13
231_F	339_V	0.527	0.13
229_R	583_L	0.527	0.13
387_T	603_Q	0.526	0.13
556_V	614_V	0.526	0.13
23_F	449_H	0.526	0.13
633_Y	639_Y	0.525	0.13
9_L	86_Q	0.525	0.13
493_E	612_P	0.524	0.13
95_W	105_F	0.522	0.13
18_I	37_P	0.522	0.13
221_E	533_L	0.522	0.13
375_I	448_L	0.521	0.13
89_P	93_Q	0.520	0.13
426_P	504_L	0.520	0.13
13_M	42_I	0.519	0.13
149_N	225_L	0.519	0.13
15_I	98_T	0.519	0.13
123_T	390_R	0.519	0.13
276_I	527_P	0.518	0.13
291_N	508_G	0.518	0.13
324_N	518_P	0.518	0.13
248_I	590_T	0.518	0.13
326_V	397_I	0.518	0.13
16_G	184_A	0.517	0.13
500_I	547_F	0.517	0.13
59_T	403_L	0.516	0.13
122_S	405_I	0.516	0.13
159_A	165_A	0.515	0.13
448_L	458_G	0.515	0.13
33_L	39_N	0.515	0.13
223_N	600_L	0.515	0.13
6_G	68_L	0.515	0.13
552_A	555_D	0.513	0.13
57_P	537_G	0.512	0.13
22_L	578_E	0.512	0.13
402_E	513_I	0.511	0.13
180_A	192_S	0.511	0.13
326_V	589_Q	0.511	0.13
124_V	270_G	0.511	0.13
373_F	537_G	0.510	0.13
187_L	533_L	0.509	0.13
28_S	445_S	0.509	0.13
37_P	330_A	0.508	0.13
29_A	107_I	0.508	0.13
337_S	371_A	0.508	0.13
23_F	585_N	0.507	0.13
100_Y	446_L	0.507	0.13
66_G	623_K	0.507	0.13
259_P	393_I	0.505	0.13
188_A	195_N	0.505	0.13
62_Y	362_I	0.504	0.13
211_A	335_Q	0.504	0.13
383_P	389_F	0.504	0.13
309_G	414_A	0.503	0.12
121_A	443_N	0.503	0.12
570_I	599_I	0.503	0.12
414_A	534_I	0.503	0.12
66_G	238_W	0.503	0.12
331_T	501_Q	0.503	0.12
45_D	440_Y	0.502	0.12
488_P	622_V	0.502	0.12
119_V	597_Y	0.501	0.12
15_I	576_I	0.500	0.12
12_I	190_I	0.500	0.12

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4fajA	1	0.6818	100	0.447	Contact Map
3zs6A	1	0.6915	100	0.45	Contact Map
4qflA	1	0.686	100	0.453	Contact Map
4tozA	1	0.708	100	0.455	Contact Map
1jetA	1	0.7052	100	0.457	Contact Map
1xocA	2	0.6873	100	0.465	Contact Map
4gl8A	1	0.6763	100	0.466	Contact Map
3drfA	1	0.6956	100	0.472	Contact Map
4wedA	1	0.6488	100	0.476	Contact Map
3m8uA	1	0.686	100	0.478	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0164 seconds.