Q97V75 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97V75 - Molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit

UniProt:	Q97V75	Sequences: MLLTYLTRYYHMERKLGFIFDHNKCIICNACVDACNKAYGDLNWRSLIVMTHGESKTALSIACNHCDNPTCMQVCPANAIEKNEMGIVRIRDDKCIGCGFCTWACPYEALKFNNEGVMSKCHFCYDRLAEGKGIPYCVEACPTGALAFGWIEKGEAEVNYLPPSEITKPRIVIKQPESKETLNASVLHTKKEENYLGLLAFTIGSEFALGYSLFKLPLWSIVSVILLVASLLLSVNHARKTDRFYRVIYNLKTSWLSREVLFSSIAILFYILSIAEPLFYYPAILFLTVGVISSIMIYMLKSRPSWYNVDTPVSFIGSIFTMSLPIVYFFSHNLTTIIPLIITLVIEIISNNRRSNVRMSLNVASIVISLISIVFPEIIIITEIINIVSEVTHRREFYEKVVYYGLPKV	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	409 (344)
Sequences:	107 (88)
Seq/√Len:	4.7

SULSO - Q97V75

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
271_I	275_A	4.206	0.91
69_P	258_R	2.951	0.67
348_I	355_S	2.945	0.67
198_L	234_S	2.927	0.66
20_F	60_S	2.885	0.65
279_F	330_F	2.883	0.65
202_T	301_K	2.858	0.64
238_A	241_T	2.748	0.61
60_S	64_N	2.653	0.58
28_C	31_C	2.645	0.58
25_C	31_C	2.645	0.58
25_C	28_C	2.645	0.58
350_S	354_R	2.582	0.56
288_T	324_L	2.538	0.55
351_N	357_V	2.502	0.53
16_L	240_K	2.474	0.53
224_V	268_L	2.280	0.46
77_A	195_Y	2.276	0.46
268_L	329_F	2.219	0.45
20_F	64_N	2.218	0.44
285_L	341_I	1.974	0.37
353_R	356_N	1.966	0.37
350_S	355_S	1.965	0.37
15_K	239_R	1.950	0.36
346_I	356_N	1.949	0.36
260_V	283_A	1.935	0.36
103_W	119_S	1.895	0.35
80_I	195_Y	1.883	0.34
39_Y	69_P	1.859	0.34
29_N	32_V	1.840	0.33
69_P	246_R	1.836	0.33
208_A	221_I	1.828	0.33
188_H	191_K	1.828	0.33
99_G	201_F	1.819	0.33
20_F	36_N	1.816	0.33
25_C	35_C	1.787	0.32
31_C	35_C	1.787	0.32
28_C	35_C	1.787	0.32
336_T	354_R	1.776	0.31
279_F	319_I	1.771	0.31
60_S	103_W	1.749	0.31
96_I	247_V	1.739	0.30
18_F	65_H	1.725	0.30
213_L	278_L	1.703	0.29
21_D	142_P	1.687	0.29
74_V	104_A	1.680	0.29
332_H	337_I	1.667	0.29
20_F	202_T	1.666	0.29
96_I	253_T	1.663	0.28
221_I	313_V	1.625	0.27
285_L	339_P	1.611	0.27
280_Y	283_A	1.603	0.27
222_V	281_Y	1.598	0.27
20_F	103_W	1.593	0.27
284_I	316_I	1.576	0.26
17_G	30_A	1.574	0.26
51_T	145_A	1.570	0.26
115_E	346_I	1.560	0.26
33_D	37_K	1.555	0.26
272_L	329_F	1.543	0.25
69_P	212_S	1.542	0.25
344_L	358_R	1.541	0.25
52_H	267_I	1.540	0.25
116_G	246_R	1.532	0.25
167_T	306_W	1.522	0.25
36_N	60_S	1.516	0.25
351_N	356_N	1.502	0.24
257_S	261_L	1.489	0.24
348_I	353_R	1.479	0.24
26_I	64_N	1.470	0.24
223_S	319_I	1.464	0.24
21_D	264_S	1.451	0.23
339_P	357_V	1.448	0.23
15_K	199_L	1.437	0.23
222_V	329_F	1.415	0.23
40_G	193_E	1.403	0.22
286_F	332_H	1.398	0.22
39_Y	136_Y	1.395	0.22
329_F	334_L	1.392	0.22
333_N	356_N	1.378	0.22
343_T	348_I	1.369	0.22
254_S	306_W	1.367	0.21
228_V	324_L	1.362	0.21
66_C	71_C	1.353	0.21
63_C	66_C	1.353	0.21
63_C	71_C	1.353	0.21
155_E	284_I	1.349	0.21
30_A	169_P	1.343	0.21
328_Y	351_N	1.338	0.21
198_L	297_I	1.337	0.21
268_L	347_E	1.334	0.21
222_V	278_L	1.332	0.21
59_L	80_I	1.331	0.21
19_I	42_L	1.322	0.21
47_L	238_A	1.321	0.21
352_N	358_R	1.320	0.20
109_A	122_H	1.309	0.20
338_I	350_S	1.305	0.20
268_L	348_I	1.302	0.20
116_G	128_L	1.301	0.20
87_I	255_W	1.291	0.20
14_R	152_E	1.288	0.20
336_T	352_N	1.281	0.20
337_I	349_I	1.269	0.19
235_V	272_L	1.266	0.19
47_L	241_T	1.266	0.19
24_K	143_T	1.264	0.19
347_E	354_R	1.259	0.19
339_P	348_I	1.256	0.19
45_R	237_H	1.250	0.19
213_L	349_I	1.242	0.19
237_H	259_E	1.239	0.19
268_L	271_I	1.236	0.19
231_L	257_S	1.235	0.19
21_D	25_C	1.234	0.19
21_D	28_C	1.234	0.19
21_D	31_C	1.234	0.19
337_I	348_I	1.223	0.19
201_F	244_F	1.220	0.19
182_L	220_S	1.218	0.18
198_L	237_H	1.218	0.18
69_P	82_K	1.218	0.18
15_K	123_F	1.213	0.18
346_I	357_V	1.211	0.18
268_L	340_L	1.210	0.18
338_I	342_I	1.207	0.18
272_L	275_A	1.205	0.18
18_F	103_W	1.194	0.18
90_I	146_L	1.184	0.18
42_L	60_S	1.183	0.18
354_R	357_V	1.182	0.18
199_L	291_V	1.180	0.18
352_N	356_N	1.179	0.18
352_N	355_S	1.176	0.18
268_L	344_L	1.168	0.18
270_Y	339_P	1.168	0.18
237_H	257_S	1.167	0.18
157_E	322_M	1.166	0.18
45_R	259_E	1.162	0.17
343_T	346_I	1.155	0.17
344_L	350_S	1.152	0.17
108_E	143_T	1.144	0.17
238_A	323_S	1.141	0.17
200_A	291_V	1.138	0.17
51_T	114_N	1.135	0.17
334_L	342_I	1.134	0.17
329_F	353_R	1.121	0.17
146_L	201_F	1.121	0.17
69_P	203_I	1.119	0.17
146_L	255_W	1.112	0.17
208_A	224_V	1.110	0.17
259_E	298_Y	1.094	0.16
198_L	259_E	1.091	0.16
225_I	281_Y	1.086	0.16
145_A	197_G	1.085	0.16
82_K	258_R	1.081	0.16
335_T	345_V	1.081	0.16
116_G	315_F	1.080	0.16
328_Y	350_S	1.079	0.16
192_E	234_S	1.078	0.16
185_S	239_R	1.072	0.16
77_A	100_F	1.069	0.16
77_A	238_A	1.065	0.16
234_S	297_I	1.063	0.16
241_T	323_S	1.062	0.16
80_I	110_L	1.055	0.16
35_C	71_C	1.044	0.15
35_C	63_C	1.044	0.15
35_C	66_C	1.044	0.15
87_I	146_L	1.035	0.15
33_D	68_N	1.021	0.15
32_V	138_V	1.015	0.15
20_F	119_S	1.013	0.15
212_S	282_P	1.012	0.15
213_L	320_F	1.012	0.15
96_I	142_P	1.011	0.15
82_K	298_Y	0.995	0.15
330_F	342_I	0.995	0.15
16_L	65_H	0.989	0.15
178_S	330_F	0.986	0.14
319_I	353_R	0.981	0.14
246_R	258_R	0.978	0.14
345_V	356_N	0.969	0.14
276_E	338_I	0.964	0.14
36_N	64_N	0.964	0.14
332_H	348_I	0.963	0.14
222_V	327_V	0.962	0.14
331_S	335_T	0.958	0.14
32_V	257_S	0.958	0.14
69_P	223_S	0.957	0.14
131_G	167_T	0.949	0.14
104_A	300_L	0.945	0.14
130_E	286_F	0.939	0.14
222_V	227_L	0.935	0.14
104_A	156_A	0.934	0.14
178_S	229_A	0.934	0.14
200_A	288_T	0.933	0.14
213_L	338_I	0.926	0.14
270_Y	282_P	0.920	0.13
24_K	253_T	0.919	0.13
276_E	344_L	0.918	0.13
69_P	72_M	0.914	0.13
229_A	334_L	0.912	0.13
96_I	255_W	0.911	0.13
271_I	344_L	0.909	0.13
328_Y	357_V	0.906	0.13
313_V	339_P	0.904	0.13
234_S	261_L	0.901	0.13
223_S	267_I	0.896	0.13
51_T	91_R	0.895	0.13
22_H	134_I	0.890	0.13
290_G	307_Y	0.889	0.13
210_G	323_S	0.888	0.13
315_F	319_I	0.883	0.13
235_V	267_I	0.875	0.13
126_D	297_I	0.873	0.13
142_P	256_L	0.872	0.13
209_L	287_L	0.872	0.13
344_L	351_N	0.872	0.13
167_T	173_I	0.868	0.13
298_Y	311_T	0.867	0.13
31_C	66_C	0.864	0.13
28_C	66_C	0.864	0.13
25_C	71_C	0.864	0.13
25_C	63_C	0.864	0.13
25_C	66_C	0.864	0.13
28_C	63_C	0.864	0.13
28_C	71_C	0.864	0.13
31_C	63_C	0.864	0.13
31_C	71_C	0.864	0.13
275_A	332_H	0.855	0.13
45_R	198_L	0.855	0.13
317_G	321_T	0.852	0.12
171_I	182_L	0.851	0.12
224_V	319_I	0.847	0.12
342_I	355_S	0.845	0.12
329_F	336_T	0.839	0.12
164_S	169_P	0.839	0.12
60_S	119_S	0.834	0.12
336_T	351_N	0.834	0.12
214_F	222_V	0.833	0.12
27_I	31_C	0.833	0.12
169_P	174_K	0.829	0.12
110_L	239_R	0.828	0.12
348_I	351_N	0.822	0.12
37_K	144_G	0.817	0.12
65_H	103_W	0.816	0.12
269_F	352_N	0.816	0.12
107_Y	303_R	0.812	0.12
18_F	303_R	0.811	0.12
64_N	91_R	0.809	0.12
235_V	339_P	0.809	0.12
180_E	329_F	0.806	0.12
77_A	122_H	0.805	0.12
42_L	64_N	0.805	0.12
275_A	285_L	0.803	0.12
99_G	204_G	0.802	0.12
285_L	289_V	0.802	0.12
341_I	347_E	0.797	0.12
286_F	289_V	0.797	0.12
48_I	80_I	0.796	0.12
76_P	101_C	0.795	0.12
75_C	121_C	0.795	0.12
86_G	141_C	0.795	0.12
76_P	124_C	0.795	0.12
76_P	105_C	0.795	0.12
76_P	121_C	0.795	0.12
124_C	135_P	0.795	0.12
76_P	120_K	0.795	0.12
75_C	97_G	0.795	0.12
75_C	101_C	0.795	0.12
75_C	105_C	0.795	0.12
120_K	124_C	0.795	0.12
76_P	97_G	0.795	0.12
120_K	137_C	0.795	0.12
76_P	86_G	0.795	0.12
76_P	95_C	0.795	0.12
124_C	141_C	0.795	0.12
124_C	137_C	0.795	0.12
75_C	86_G	0.795	0.12
75_C	120_K	0.795	0.12
137_C	141_C	0.795	0.12
121_C	141_C	0.795	0.12
121_C	137_C	0.795	0.12
75_C	95_C	0.795	0.12
75_C	137_C	0.795	0.12
121_C	135_P	0.795	0.12
135_P	141_C	0.795	0.12
75_C	135_P	0.795	0.12
75_C	124_C	0.795	0.12
121_C	124_C	0.795	0.12
120_K	141_C	0.795	0.12
75_C	141_C	0.795	0.12
120_K	135_P	0.795	0.12
86_G	97_G	0.795	0.12
95_C	135_P	0.795	0.12
95_C	137_C	0.795	0.12
95_C	141_C	0.795	0.12
86_G	95_C	0.795	0.12
86_G	124_C	0.795	0.12
97_G	105_C	0.795	0.12
97_G	120_K	0.795	0.12
97_G	121_C	0.795	0.12
95_C	124_C	0.795	0.12
95_C	121_C	0.795	0.12
95_C	120_K	0.795	0.12
86_G	101_C	0.795	0.12
86_G	105_C	0.795	0.12
86_G	120_K	0.795	0.12
86_G	121_C	0.795	0.12
86_G	135_P	0.795	0.12
86_G	137_C	0.795	0.12
95_C	101_C	0.795	0.12
95_C	105_C	0.795	0.12
97_G	124_C	0.795	0.12
97_G	101_C	0.795	0.12
101_C	141_C	0.795	0.12
101_C	124_C	0.795	0.12
101_C	135_P	0.795	0.12
101_C	137_C	0.795	0.12
105_C	137_C	0.795	0.12
105_C	135_P	0.795	0.12
76_P	141_C	0.795	0.12
76_P	137_C	0.795	0.12
105_C	124_C	0.795	0.12
105_C	120_K	0.795	0.12
101_C	121_C	0.795	0.12
105_C	121_C	0.795	0.12
97_G	135_P	0.795	0.12
97_G	137_C	0.795	0.12
97_G	141_C	0.795	0.12
76_P	135_P	0.795	0.12
101_C	105_C	0.795	0.12
101_C	120_K	0.795	0.12
105_C	141_C	0.795	0.12
93_D	288_T	0.794	0.12
59_L	170_R	0.794	0.12
343_T	353_R	0.793	0.12
77_A	321_T	0.793	0.12
23_N	39_Y	0.793	0.12
178_S	353_R	0.792	0.12
26_I	149_G	0.789	0.12
286_F	329_F	0.787	0.12
237_H	298_Y	0.782	0.12
77_A	241_T	0.779	0.12
342_I	350_S	0.775	0.11
190_K	304_P	0.766	0.11
39_Y	197_G	0.765	0.11
104_A	149_G	0.764	0.11
100_F	199_L	0.762	0.11
109_A	243_R	0.757	0.11
218_L	226_L	0.756	0.11
272_L	291_V	0.756	0.11
87_I	142_P	0.756	0.11
281_Y	330_F	0.755	0.11
22_H	250_N	0.755	0.11
273_S	301_K	0.754	0.11
56_K	64_N	0.753	0.11
339_P	342_I	0.753	0.11
193_E	247_V	0.753	0.11
213_L	344_L	0.752	0.11
108_E	233_L	0.750	0.11
112_F	244_F	0.749	0.11
169_P	173_I	0.748	0.11
18_F	240_K	0.746	0.11
99_G	148_F	0.746	0.11
20_F	26_I	0.741	0.11
157_E	180_E	0.736	0.11
340_L	351_N	0.734	0.11
142_P	255_W	0.730	0.11
298_Y	315_F	0.725	0.11
99_G	146_L	0.724	0.11
26_I	51_T	0.723	0.11
345_V	349_I	0.717	0.11
110_L	123_F	0.716	0.11
342_I	347_E	0.711	0.11
29_N	47_L	0.711	0.11
284_I	288_T	0.710	0.11
17_G	43_N	0.709	0.11
324_L	344_L	0.708	0.11
90_I	201_F	0.706	0.11
22_H	64_N	0.705	0.11
341_I	346_I	0.703	0.11
69_P	145_A	0.703	0.11
269_F	351_N	0.702	0.11
208_A	313_V	0.702	0.11
16_L	21_D	0.700	0.11
339_P	353_R	0.696	0.10
178_S	355_S	0.696	0.10
214_F	266_A	0.695	0.10
36_N	59_L	0.690	0.10
283_A	335_T	0.682	0.10
136_Y	238_A	0.682	0.10
167_T	303_R	0.681	0.10
346_I	349_I	0.680	0.10
48_I	118_M	0.680	0.10
65_H	119_S	0.678	0.10
333_N	346_I	0.678	0.10
61_I	80_I	0.677	0.10
74_V	290_G	0.675	0.10
123_F	239_R	0.675	0.10
341_I	345_V	0.672	0.10
282_P	351_N	0.670	0.10
21_D	233_L	0.666	0.10
131_G	224_V	0.661	0.10
27_I	136_Y	0.658	0.10
190_K	216_L	0.658	0.10
214_F	278_L	0.657	0.10
221_I	326_I	0.657	0.10
37_K	61_I	0.655	0.10
19_I	147_A	0.650	0.10
93_D	331_S	0.650	0.10
348_I	352_N	0.648	0.10
52_H	123_F	0.648	0.10
68_N	275_A	0.646	0.10
123_F	315_F	0.644	0.10
55_S	346_I	0.641	0.10
33_D	41_D	0.641	0.10
249_Y	293_S	0.641	0.10
18_F	107_Y	0.641	0.10
341_I	357_V	0.641	0.10
73_Q	89_R	0.640	0.10
145_A	166_I	0.639	0.10
80_I	206_E	0.637	0.10
327_V	338_I	0.634	0.10
145_A	258_R	0.633	0.10
45_R	60_S	0.630	0.10
100_F	110_L	0.628	0.10
26_I	31_C	0.628	0.10
130_E	342_I	0.627	0.10
32_V	122_H	0.627	0.10
295_I	308_N	0.624	0.10
223_S	280_Y	0.623	0.10
51_T	64_N	0.623	0.10
30_A	34_A	0.620	0.10
272_L	340_L	0.620	0.10
346_I	358_R	0.615	0.10
45_R	298_Y	0.608	0.09
350_S	357_V	0.607	0.09
233_L	327_V	0.606	0.09
92_D	314_S	0.604	0.09
208_A	326_I	0.604	0.09
42_L	114_N	0.597	0.09
257_S	315_F	0.597	0.09
281_Y	334_L	0.594	0.09
72_M	81_E	0.593	0.09
32_V	89_R	0.592	0.09
61_I	64_N	0.591	0.09
26_I	171_I	0.586	0.09
328_Y	336_T	0.581	0.09
181_T	316_I	0.581	0.09
259_E	311_T	0.581	0.09
154_G	288_T	0.580	0.09
344_L	357_V	0.579	0.09
20_F	42_L	0.579	0.09
344_L	347_E	0.577	0.09
246_R	257_S	0.576	0.09
122_H	243_R	0.576	0.09
54_E	207_F	0.573	0.09
277_P	329_F	0.567	0.09
255_W	303_R	0.567	0.09
36_N	62_A	0.559	0.09
208_A	264_S	0.559	0.09
26_I	56_K	0.552	0.09
68_N	233_L	0.552	0.09
207_F	322_M	0.552	0.09
338_I	356_N	0.550	0.09
288_T	357_V	0.550	0.09
41_D	111_K	0.549	0.09
82_K	306_W	0.547	0.09
64_N	103_W	0.546	0.09
122_H	203_I	0.546	0.09
334_L	353_R	0.546	0.09
214_F	332_H	0.546	0.09
224_V	336_T	0.544	0.09
29_N	64_N	0.543	0.09
197_G	239_R	0.543	0.09
269_F	275_A	0.542	0.09
349_I	353_R	0.540	0.09
33_D	80_I	0.540	0.09
253_T	287_L	0.537	0.09
201_F	259_E	0.534	0.09
102_T	227_L	0.534	0.09
65_H	71_C	0.534	0.09
208_A	235_V	0.531	0.09
175_Q	178_S	0.531	0.09
54_E	320_F	0.530	0.09
200_A	271_I	0.527	0.09
161_L	296_M	0.525	0.09
110_L	118_M	0.524	0.09
87_I	117_V	0.523	0.09
285_L	337_I	0.522	0.09
232_L	275_A	0.522	0.09
64_N	119_S	0.522	0.09
38_A	60_S	0.521	0.09
338_I	344_L	0.518	0.09
107_Y	167_T	0.518	0.09
218_L	222_V	0.518	0.09
187_L	325_P	0.517	0.09
23_N	246_R	0.517	0.09
65_H	240_K	0.515	0.09
337_I	341_I	0.515	0.09
341_I	350_S	0.514	0.09
255_W	294_S	0.513	0.09
106_P	167_T	0.511	0.08
27_I	241_T	0.511	0.08
25_C	30_A	0.510	0.08
61_I	77_A	0.509	0.08
222_V	344_L	0.509	0.08
267_I	274_I	0.506	0.08
60_S	250_N	0.506	0.08
150_W	317_G	0.505	0.08
148_F	185_S	0.503	0.08
48_I	237_H	0.502	0.08
211_Y	235_V	0.501	0.08
42_L	162_P	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2ivfB	1	0.5844	100	0.74	Contact Map
1ti6B	2	0.5746	100	0.746	Contact Map
1kqfB	3	0.5746	100	0.751	Contact Map
1h0hB	1	0.423	100	0.761	Contact Map
2vpzB	2	0.4303	100	0.766	Contact Map
1q16B	2	0.6993	100	0.816	Contact Map
4z3xE	2	0.3936	100	0.823	Contact Map
2vpzC	2	0.5061	99.8	0.871	Contact Map
3mm5B	2	0.4743	99.8	0.871	Contact Map
1jnrB	1	0.357	99.5	0.904	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0109 seconds.