Q97V40 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97V40 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q97V40	Sequences: MLNAGLIVSKKAREIIGDEILKEVFEEAKLSYVAEMGDYVIDDINNNELKALLLVSENGKERWMEDIDQKLGISPLAILTIPPKWFIGKSKEYIFTLLTAYSLRVELMDLAYRVQPTPTSSVSRRSLLKLKTYEYKPYPVLFDEVHAKREINKAIESCPQGLIVKAPEGPSVGYPEKCSVCGYCSASSYLGYLEIPTATTDQVLSFINTIVRHYRDKQAAILFTDSIIDDIPEGIFPFLMPCTAGVHDSFVLASYAAGITPIVHVSSKCESRDIALKRLDELPSHFPGTNFIISKVRNDEELKKTLSYIKPIQLSRSEIPLEVILQRSRRRALLIWSIEEMSKKVKLNEDDTVPGVYNVEVDPNKCVLCGVCVRACQMLVPELKGSSTLELSYNIPYCIGSQRCVKNCPEKAVIVTGYAKISDLKRKIVNKANVSKCRFCGKPLGSERIKNKVDTLLIQYGFAGTAQYTDVCNECKQKILTKIWLERLLSGKNDTVRY	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	498 (445)
Sequences:	144 (114)
Seq/√Len:	5.4

SULSO - Q97V40 Q97XY1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
101_Y	105_V	5.505	0.99
210_I	214_Y	5.100	0.98
125_R	128_L	4.960	0.98
125_R	129_K	4.523	0.96
124_R	128_L	4.275	0.94
100_A	105_V	4.201	0.93
157_S	187_S	3.900	0.91
101_Y	123_S	3.697	0.88
100_A	123_S	3.551	0.86
334_L	477_Q	3.498	0.85
365_K	412_A	3.348	0.82
100_A	109_D	3.319	0.81
101_Y	109_D	3.304	0.81
97_L	100_A	3.304	0.81
100_A	107_L	3.225	0.79
124_R	127_L	3.195	0.79
100_A	104_R	3.168	0.78
124_R	130_L	3.152	0.78
123_S	127_L	3.089	0.76
123_S	128_L	3.033	0.75
123_S	129_K	2.959	0.73
100_A	103_L	2.932	0.72
96_T	100_A	2.869	0.70
211_V	214_Y	2.834	0.69
160_Q	179_S	2.795	0.68
190_L	399_I	2.755	0.67
125_R	130_L	2.748	0.67
100_A	114_V	2.725	0.66
438_R	467_Q	2.718	0.66
420_K	427_K	2.687	0.65
101_Y	104_R	2.686	0.65
124_R	129_K	2.684	0.65
101_Y	125_R	2.654	0.64
123_S	130_L	2.592	0.62
101_Y	107_L	2.591	0.62
100_A	125_R	2.567	0.61
32_Y	35_E	2.412	0.56
90_S	430_N	2.369	0.55
109_D	123_S	2.360	0.54
201_D	205_S	2.345	0.54
109_D	114_V	2.305	0.53
206_F	214_Y	2.289	0.52
102_S	107_L	2.275	0.52
127_L	130_L	2.247	0.51
149_R	165_K	2.239	0.50
114_V	118_P	2.188	0.49
149_R	152_N	2.149	0.47
100_A	120_S	2.120	0.46
100_A	124_R	2.072	0.45
102_S	105_V	2.054	0.44
82_P	85_W	2.054	0.44
101_Y	124_R	2.041	0.44
206_F	210_I	2.027	0.43
100_A	118_P	2.026	0.43
45_N	333_L	2.006	0.43
107_L	114_V	1.972	0.41
101_Y	120_S	1.938	0.40
104_R	109_D	1.928	0.40
105_V	109_D	1.920	0.40
223_F	415_V	1.901	0.39
432_A	448_R	1.884	0.39
275_A	278_R	1.868	0.38
101_Y	106_E	1.864	0.38
447_E	480_L	1.862	0.38
268_K	272_R	1.860	0.38
454_D	470_D	1.821	0.37
208_N	211_V	1.817	0.36
165_K	291_F	1.791	0.36
30_L	39_Y	1.787	0.36
218_Q	225_D	1.772	0.35
101_Y	127_L	1.740	0.34
106_E	115_Q	1.727	0.34
102_S	109_D	1.725	0.34
97_L	114_V	1.707	0.33
100_A	128_L	1.695	0.33
97_L	101_Y	1.694	0.33
101_Y	108_M	1.680	0.32
101_Y	116_P	1.675	0.32
435_S	470_D	1.666	0.32
105_V	123_S	1.660	0.32
187_S	387_S	1.642	0.31
100_A	119_T	1.638	0.31
262_I	375_A	1.583	0.29
54_L	81_I	1.581	0.29
219_A	234_G	1.581	0.29
102_S	124_R	1.574	0.29
378_M	421_I	1.563	0.29
30_L	187_S	1.548	0.29
39_Y	339_E	1.545	0.28
210_I	462_F	1.539	0.28
56_S	83_P	1.532	0.28
171_S	451_N	1.529	0.28
100_A	129_K	1.529	0.28
101_Y	119_T	1.527	0.28
135_Y	140_V	1.523	0.28
435_S	451_N	1.510	0.27
395_I	418_Y	1.499	0.27
64_M	68_D	1.497	0.27
108_M	127_L	1.481	0.27
105_V	117_T	1.479	0.27
107_L	124_R	1.478	0.27
109_D	128_L	1.466	0.26
371_V	396_P	1.464	0.26
108_M	123_S	1.457	0.26
240_M	333_L	1.456	0.26
108_M	111_A	1.448	0.26
446_S	462_F	1.446	0.26
120_S	124_R	1.444	0.26
108_M	128_L	1.433	0.25
35_E	40_V	1.430	0.25
385_G	462_F	1.423	0.25
100_A	127_L	1.415	0.25
121_S	129_K	1.403	0.25
282_L	287_P	1.401	0.25
232_P	335_I	1.399	0.25
120_S	123_S	1.396	0.25
379_L	397_Y	1.391	0.24
102_S	123_S	1.387	0.24
101_Y	129_K	1.387	0.24
206_F	211_V	1.384	0.24
117_T	120_S	1.383	0.24
60_K	385_G	1.377	0.24
172_V	290_N	1.365	0.24
248_D	356_V	1.364	0.24
100_A	121_S	1.363	0.24
144_E	450_K	1.362	0.24
108_M	120_S	1.356	0.24
101_Y	121_S	1.340	0.23
96_T	114_V	1.324	0.23
104_R	128_L	1.323	0.23
206_F	326_Q	1.321	0.23
282_L	285_H	1.319	0.23
101_Y	128_L	1.316	0.23
344_K	420_K	1.314	0.23
252_L	390_E	1.312	0.22
105_V	114_V	1.312	0.22
211_V	259_I	1.306	0.22
96_T	107_L	1.305	0.22
100_A	108_M	1.304	0.22
333_L	340_E	1.293	0.22
132_T	218_Q	1.289	0.22
446_S	473_N	1.274	0.22
54_L	102_S	1.272	0.22
194_E	469_T	1.268	0.21
81_I	207_I	1.260	0.21
102_S	120_S	1.258	0.21
106_E	121_S	1.254	0.21
96_T	118_P	1.249	0.21
152_N	480_L	1.244	0.21
360_E	416_T	1.243	0.21
101_Y	111_A	1.243	0.21
48_E	422_S	1.240	0.21
387_S	479_I	1.236	0.21
120_S	125_R	1.226	0.21
100_A	106_E	1.221	0.20
99_T	105_V	1.202	0.20
217_K	236_F	1.201	0.20
436_K	443_P	1.196	0.20
70_K	342_S	1.195	0.20
171_S	218_Q	1.191	0.20
62_R	66_D	1.190	0.20
44_I	48_E	1.188	0.20
104_R	123_S	1.184	0.20
99_T	107_L	1.178	0.19
171_S	288_G	1.170	0.19
250_F	330_R	1.162	0.19
84_K	88_G	1.161	0.19
335_I	374_R	1.151	0.19
185_S	460_Y	1.149	0.19
483_I	486_E	1.141	0.19
120_S	128_L	1.131	0.19
120_S	127_L	1.131	0.19
44_I	474_E	1.115	0.18
254_S	469_T	1.114	0.18
207_I	257_A	1.114	0.18
268_K	271_S	1.111	0.18
81_I	99_T	1.109	0.18
91_K	293_I	1.107	0.18
140_V	234_G	1.102	0.18
119_T	123_S	1.094	0.18
111_A	123_S	1.093	0.18
42_D	46_N	1.086	0.18
262_I	288_G	1.078	0.17
117_T	121_S	1.070	0.17
102_S	125_R	1.069	0.17
105_V	111_A	1.061	0.17
385_G	390_E	1.057	0.17
210_I	213_H	1.057	0.17
192_Y	367_V	1.053	0.17
381_P	471_V	1.050	0.17
202_Q	362_D	1.050	0.17
98_L	103_L	1.050	0.17
54_L	83_P	1.049	0.17
109_D	129_K	1.047	0.17
455_T	458_I	1.046	0.17
252_L	453_V	1.045	0.17
169_G	449_I	1.045	0.17
30_L	339_E	1.042	0.17
96_T	99_T	1.041	0.17
133_Y	441_G	1.030	0.17
317_S	452_K	1.028	0.16
36_M	359_V	1.024	0.16
445_G	449_I	1.023	0.16
60_K	359_V	1.022	0.16
294_S	469_T	1.019	0.16
204_L	210_I	1.017	0.16
206_F	462_F	1.015	0.16
112_Y	115_Q	1.014	0.16
101_Y	114_V	1.013	0.16
61_E	66_D	1.009	0.16
99_T	103_L	1.008	0.16
218_Q	240_M	1.000	0.16
72_G	91_K	0.990	0.16
56_S	415_V	0.984	0.16
377_Q	476_K	0.980	0.16
211_V	236_F	0.980	0.16
63_W	244_A	0.977	0.16
350_D	354_P	0.976	0.16
359_V	441_G	0.973	0.15
344_K	407_N	0.965	0.15
65_E	416_T	0.963	0.15
276_L	280_D	0.961	0.15
62_R	208_N	0.955	0.15
109_D	125_R	0.954	0.15
194_E	481_T	0.952	0.15
120_S	129_K	0.952	0.15
247_H	471_V	0.951	0.15
185_S	194_E	0.951	0.15
216_D	347_L	0.950	0.15
104_R	125_R	0.948	0.15
101_Y	117_T	0.948	0.15
222_L	333_L	0.942	0.15
108_M	125_R	0.939	0.15
107_L	120_S	0.933	0.15
102_S	130_L	0.930	0.15
105_V	120_S	0.930	0.15
140_V	153_K	0.929	0.15
63_W	207_I	0.923	0.15
54_L	209_T	0.919	0.15
217_K	240_M	0.918	0.15
186_A	422_S	0.918	0.15
282_L	419_A	0.918	0.15
244_A	412_A	0.917	0.15
60_K	83_P	0.912	0.14
61_E	223_F	0.909	0.14
131_K	356_V	0.908	0.14
102_S	108_M	0.906	0.14
109_D	116_P	0.898	0.14
361_V	391_L	0.896	0.14
107_L	119_T	0.896	0.14
72_G	98_L	0.894	0.14
217_K	234_G	0.892	0.14
155_I	432_A	0.891	0.14
109_D	124_R	0.886	0.14
185_S	203_V	0.885	0.14
143_D	434_V	0.882	0.14
174_Y	359_V	0.878	0.14
315_S	411_K	0.876	0.14
32_Y	36_M	0.875	0.14
135_Y	193_L	0.873	0.14
187_S	371_V	0.863	0.14
370_G	374_R	0.862	0.14
278_R	284_S	0.861	0.14
160_Q	487_R	0.861	0.14
121_S	124_R	0.858	0.14
167_P	247_H	0.857	0.14
175_P	467_Q	0.852	0.13
208_N	214_Y	0.851	0.13
104_R	124_R	0.849	0.13
177_K	294_S	0.846	0.13
30_L	150_E	0.844	0.13
99_T	111_A	0.840	0.13
38_D	137_P	0.830	0.13
172_V	185_S	0.828	0.13
38_D	45_N	0.826	0.13
97_L	106_E	0.826	0.13
347_L	362_D	0.825	0.13
151_I	154_A	0.822	0.13
362_D	466_A	0.818	0.13
232_P	374_R	0.815	0.13
102_S	114_V	0.814	0.13
191_G	331_R	0.811	0.13
100_A	117_T	0.811	0.13
279_L	285_H	0.811	0.13
35_E	49_L	0.806	0.13
100_A	116_P	0.806	0.13
215_R	433_N	0.804	0.13
181_C	445_G	0.803	0.13
133_Y	172_V	0.799	0.13
53_L	447_E	0.799	0.13
72_G	428_I	0.798	0.13
169_G	179_S	0.797	0.13
104_R	118_P	0.796	0.13
102_S	127_L	0.795	0.13
216_D	438_R	0.793	0.13
380_V	401_S	0.793	0.13
105_V	125_R	0.791	0.13
151_I	189_Y	0.791	0.13
44_I	353_V	0.790	0.13
103_L	121_S	0.789	0.13
76_L	102_S	0.788	0.13
362_D	454_D	0.787	0.12
59_G	397_Y	0.786	0.12
76_L	98_L	0.784	0.12
42_D	477_Q	0.783	0.12
36_M	91_K	0.778	0.12
172_V	193_L	0.777	0.12
354_P	439_F	0.776	0.12
314_L	452_K	0.774	0.12
243_T	452_K	0.774	0.12
202_Q	205_S	0.772	0.12
179_S	432_A	0.771	0.12
280_D	411_K	0.770	0.12
114_V	124_R	0.770	0.12
411_K	467_Q	0.759	0.12
164_V	225_D	0.759	0.12
56_S	81_I	0.754	0.12
234_G	336_W	0.754	0.12
152_N	186_A	0.752	0.12
120_S	130_L	0.751	0.12
85_W	412_A	0.749	0.12
411_K	473_N	0.746	0.12
332_A	394_N	0.745	0.12
118_P	122_V	0.743	0.12
299_D	306_L	0.743	0.12
241_P	348_N	0.741	0.12
205_S	210_I	0.741	0.12
34_A	43_D	0.740	0.12
40_V	338_I	0.734	0.12
104_R	107_L	0.733	0.12
154_A	188_S	0.730	0.12
31_S	273_D	0.730	0.12
70_K	277_K	0.730	0.12
109_D	120_S	0.729	0.12
48_E	304_K	0.729	0.12
91_K	405_V	0.729	0.12
364_N	456_L	0.726	0.12
189_Y	401_S	0.725	0.12
189_Y	380_V	0.725	0.12
106_E	277_K	0.724	0.12
97_L	107_L	0.722	0.12
135_Y	245_G	0.720	0.12
447_E	456_L	0.718	0.12
107_L	129_K	0.716	0.11
224_T	227_I	0.714	0.11
55_V	81_I	0.714	0.11
411_K	429_V	0.714	0.11
99_T	109_D	0.714	0.11
143_D	400_G	0.711	0.11
97_L	118_P	0.710	0.11
208_N	356_V	0.709	0.11
72_G	297_R	0.707	0.11
202_Q	212_R	0.706	0.11
255_Y	321_L	0.703	0.11
203_V	427_K	0.702	0.11
439_F	467_Q	0.701	0.11
172_V	253_A	0.701	0.11
464_G	483_I	0.699	0.11
188_S	401_S	0.694	0.11
188_S	380_V	0.694	0.11
36_M	44_I	0.690	0.11
327_R	359_V	0.689	0.11
185_S	200_T	0.688	0.11
342_S	403_R	0.688	0.11
267_S	270_E	0.688	0.11
97_L	109_D	0.685	0.11
194_E	460_Y	0.684	0.11
107_L	118_P	0.684	0.11
247_H	381_P	0.684	0.11
38_D	149_R	0.683	0.11
157_S	452_K	0.683	0.11
354_P	482_K	0.683	0.11
154_A	401_S	0.683	0.11
154_A	380_V	0.683	0.11
400_G	459_Q	0.682	0.11
193_L	340_E	0.680	0.11
453_V	480_L	0.679	0.11
123_S	126_S	0.679	0.11
201_D	445_G	0.678	0.11
203_V	483_I	0.677	0.11
97_L	102_S	0.675	0.11
32_Y	63_W	0.674	0.11
477_Q	481_T	0.674	0.11
147_A	187_S	0.673	0.11
38_D	238_F	0.671	0.11
92_E	290_N	0.671	0.11
154_A	162_L	0.670	0.11
238_F	296_V	0.670	0.11
223_F	244_A	0.666	0.11
438_R	469_T	0.665	0.11
41_I	83_P	0.664	0.11
44_I	73_I	0.663	0.11
75_P	172_V	0.662	0.11
104_R	127_L	0.661	0.11
59_G	84_K	0.661	0.11
375_A	407_N	0.660	0.11
144_E	379_L	0.660	0.11
248_D	390_E	0.658	0.11
55_V	342_S	0.656	0.11
72_G	308_Y	0.654	0.11
370_G	397_Y	0.653	0.11
151_I	162_L	0.652	0.11
151_I	401_S	0.652	0.11
151_I	380_V	0.652	0.11
77_A	290_N	0.652	0.11
232_P	384_K	0.651	0.11
53_L	201_D	0.649	0.11
238_F	392_S	0.647	0.11
87_I	132_T	0.646	0.11
449_I	453_V	0.646	0.11
200_T	486_E	0.646	0.11
107_L	125_R	0.646	0.11
99_T	114_V	0.645	0.11
197_T	412_A	0.645	0.11
357_Y	444_L	0.644	0.11
367_V	401_S	0.643	0.11
367_V	380_V	0.643	0.11
190_L	378_M	0.643	0.11
419_A	464_G	0.639	0.10
177_K	336_W	0.637	0.10
32_Y	73_I	0.636	0.10
249_S	340_E	0.634	0.10
104_R	108_M	0.634	0.10
172_V	289_T	0.633	0.10
164_V	238_F	0.632	0.10
286_F	342_S	0.631	0.10
65_E	308_Y	0.630	0.10
126_S	325_L	0.630	0.10
151_I	188_S	0.628	0.10
281_E	285_H	0.628	0.10
150_E	406_K	0.627	0.10
69_Q	414_I	0.626	0.10
240_M	416_T	0.625	0.10
253_A	457_L	0.623	0.10
301_E	316_R	0.623	0.10
325_L	336_W	0.621	0.10
371_V	422_S	0.620	0.10
240_M	427_K	0.620	0.10
119_T	125_R	0.619	0.10
371_V	473_N	0.616	0.10
121_S	127_L	0.616	0.10
60_K	166_A	0.615	0.10
213_H	424_L	0.613	0.10
153_K	157_S	0.613	0.10
333_L	465_T	0.613	0.10
356_V	390_E	0.612	0.10
55_V	93_Y	0.612	0.10
201_D	296_V	0.612	0.10
100_A	130_L	0.610	0.10
133_Y	156_E	0.610	0.10
69_Q	362_D	0.604	0.10
104_R	147_A	0.604	0.10
134_E	177_K	0.603	0.10
138_Y	327_R	0.603	0.10
62_R	348_N	0.599	0.10
275_A	281_E	0.596	0.10
268_K	335_I	0.596	0.10
87_I	335_I	0.593	0.10
58_N	135_Y	0.593	0.10
205_S	214_Y	0.593	0.10
406_K	447_E	0.592	0.10
332_A	469_T	0.592	0.10
301_E	305_T	0.592	0.10
154_A	189_Y	0.591	0.10
290_N	442_K	0.591	0.10
257_A	336_W	0.591	0.10
72_G	90_S	0.589	0.10
291_F	420_K	0.588	0.10
187_S	251_V	0.588	0.10
237_P	475_C	0.588	0.10
99_T	102_S	0.586	0.10
72_G	305_T	0.584	0.10
201_D	240_M	0.582	0.10
143_D	459_Q	0.581	0.10
81_I	138_Y	0.579	0.10
55_V	61_E	0.579	0.10
209_T	213_H	0.578	0.10
143_D	395_I	0.577	0.10
429_V	463_A	0.573	0.10
264_H	329_R	0.572	0.10
189_Y	367_V	0.570	0.10
118_P	125_R	0.566	0.10
114_V	305_T	0.565	0.10
119_T	124_R	0.564	0.10
162_L	188_S	0.563	0.10
46_N	72_G	0.562	0.10
183_Y	206_F	0.561	0.10
251_V	446_S	0.561	0.10
157_S	209_T	0.559	0.09
400_G	434_V	0.558	0.09
293_I	362_D	0.558	0.09
294_S	297_R	0.555	0.09
114_V	128_L	0.555	0.09
162_L	401_S	0.555	0.09
162_L	380_V	0.555	0.09
103_L	112_Y	0.555	0.09
149_R	153_K	0.554	0.09
57_E	89_K	0.554	0.09
278_R	362_D	0.552	0.09
167_P	355_G	0.552	0.09
239_L	430_N	0.552	0.09
185_S	486_E	0.551	0.09
162_L	192_Y	0.551	0.09
230_D	281_E	0.549	0.09
203_V	292_I	0.549	0.09
163_I	456_L	0.547	0.09
143_D	389_L	0.547	0.09
69_Q	466_A	0.544	0.09
122_V	128_L	0.544	0.09
305_T	345_V	0.544	0.09
99_T	120_S	0.544	0.09
165_K	430_N	0.543	0.09
381_P	453_V	0.543	0.09
105_V	129_K	0.543	0.09
100_A	111_A	0.543	0.09
188_S	367_V	0.542	0.09
117_T	126_S	0.541	0.09
152_N	436_K	0.540	0.09
194_E	453_V	0.540	0.09
154_A	192_Y	0.540	0.09
86_F	480_L	0.539	0.09
203_V	274_I	0.539	0.09
108_M	124_R	0.538	0.09
39_Y	204_L	0.534	0.09
253_A	458_I	0.534	0.09
102_S	128_L	0.533	0.09
321_L	346_K	0.533	0.09
147_A	318_E	0.531	0.09
32_Y	40_V	0.531	0.09
214_Y	364_N	0.530	0.09
62_R	73_I	0.529	0.09
86_F	249_S	0.527	0.09
305_T	318_E	0.527	0.09
151_I	192_Y	0.527	0.09
115_Q	360_E	0.526	0.09
282_L	337_S	0.526	0.09
204_L	455_T	0.526	0.09
154_A	367_V	0.525	0.09
162_L	189_Y	0.524	0.09
190_L	439_F	0.524	0.09
109_D	118_P	0.523	0.09
134_E	171_S	0.522	0.09
82_P	412_A	0.522	0.09
241_P	407_N	0.521	0.09
385_G	423_D	0.521	0.09
261_P	339_E	0.521	0.09
353_V	407_N	0.515	0.09
82_P	375_A	0.514	0.09
262_I	478_K	0.511	0.09
146_H	375_A	0.511	0.09
97_L	105_V	0.511	0.09
142_F	254_S	0.511	0.09
80_T	245_G	0.510	0.09
400_G	461_G	0.509	0.09
106_E	172_V	0.506	0.09
366_C	369_C	0.505	0.09
366_C	372_C	0.505	0.09
366_C	376_C	0.505	0.09
366_C	398_C	0.505	0.09
366_C	404_C	0.505	0.09
366_C	408_C	0.505	0.09
366_C	410_E	0.505	0.09
366_C	437_C	0.505	0.09
178_C	184_C	0.505	0.09
369_C	404_C	0.505	0.09
184_C	437_C	0.505	0.09
182_G	472_C	0.505	0.09
178_C	404_C	0.505	0.09
440_C	472_C	0.505	0.09
398_C	472_C	0.505	0.09
398_C	440_C	0.505	0.09
398_C	437_C	0.505	0.09
184_C	410_E	0.505	0.09
398_C	410_E	0.505	0.09
184_C	366_C	0.505	0.09
398_C	408_C	0.505	0.09
178_C	182_G	0.505	0.09
398_C	404_C	0.505	0.09
366_C	440_C	0.505	0.09
366_C	472_C	0.505	0.09
372_C	398_C	0.505	0.09
372_C	404_C	0.505	0.09
372_C	408_C	0.505	0.09
372_C	410_E	0.505	0.09
372_C	437_C	0.505	0.09
372_C	440_C	0.505	0.09
372_C	472_C	0.505	0.09
376_C	398_C	0.505	0.09
376_C	404_C	0.505	0.09
376_C	408_C	0.505	0.09
376_C	410_E	0.505	0.09
376_C	437_C	0.505	0.09
376_C	440_C	0.505	0.09
372_C	376_C	0.505	0.09
184_C	372_C	0.505	0.09
178_C	366_C	0.505	0.09
369_C	372_C	0.505	0.09
184_C	376_C	0.505	0.09
369_C	376_C	0.505	0.09
369_C	398_C	0.505	0.09
369_C	408_C	0.505	0.09
369_C	410_E	0.505	0.09
369_C	437_C	0.505	0.09
369_C	440_C	0.505	0.09
369_C	472_C	0.505	0.09
178_C	369_C	0.505	0.09
178_C	372_C	0.505	0.09
178_C	376_C	0.505	0.09
376_C	472_C	0.505	0.09
184_C	398_C	0.505	0.09
158_C	372_C	0.505	0.09
182_G	372_C	0.505	0.09
408_C	440_C	0.505	0.09
437_C	440_C	0.505	0.09
408_C	437_C	0.505	0.09
182_G	398_C	0.505	0.09
158_C	408_C	0.505	0.09
158_C	437_C	0.505	0.09
184_C	404_C	0.505	0.09
158_C	366_C	0.505	0.09
182_G	376_C	0.505	0.09
178_C	440_C	0.505	0.09
182_G	369_C	0.505	0.09
158_C	369_C	0.505	0.09
184_C	472_C	0.505	0.09
158_C	376_C	0.505	0.09
410_E	472_C	0.505	0.09
178_C	472_C	0.505	0.09
158_C	398_C	0.505	0.09
158_C	404_C	0.505	0.09
410_E	440_C	0.505	0.09
410_E	437_C	0.505	0.09
182_G	366_C	0.505	0.09
408_C	472_C	0.505	0.09
182_G	404_C	0.505	0.09
178_C	408_C	0.505	0.09
437_C	472_C	0.505	0.09
404_C	410_E	0.505	0.09
182_G	440_C	0.505	0.09
158_C	182_G	0.505	0.09
182_G	408_C	0.505	0.09
182_G	410_E	0.505	0.09
184_C	408_C	0.505	0.09
178_C	398_C	0.505	0.09
182_G	437_C	0.505	0.09
158_C	178_C	0.505	0.09
158_C	184_C	0.505	0.09
404_C	408_C	0.505	0.09
158_C	440_C	0.505	0.09
404_C	472_C	0.505	0.09
404_C	440_C	0.505	0.09
158_C	410_E	0.505	0.09
184_C	440_C	0.505	0.09
178_C	437_C	0.505	0.09
184_C	369_C	0.505	0.09
178_C	410_E	0.505	0.09
158_C	472_C	0.505	0.09
404_C	437_C	0.505	0.09
136_K	199_T	0.505	0.09
80_T	458_I	0.504	0.09
248_D	338_I	0.504	0.09
133_Y	484_W	0.503	0.09
126_S	129_K	0.503	0.09
33_V	60_K	0.502	0.09
69_Q	450_K	0.501	0.09
54_L	272_R	0.501	0.09
481_T	485_L	0.501	0.09
114_V	120_S	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4z3xE	2	0.3293	99.5	0.919	Contact Map
1h0hB	1	0.3273	99.5	0.921	Contact Map
1q16B	2	0.5622	99.5	0.921	Contact Map
2ivfB	1	0.3815	99.4	0.923	Contact Map
1hfeL	2	0.3293	99.4	0.924	Contact Map
2vpzB	2	0.3333	99.3	0.925	Contact Map
3gyxB	1	0.241	99.2	0.929	Contact Map
1xerA	2	0.1928	99.2	0.929	Contact Map
1bc6A	1	0.1546	99.2	0.931	Contact Map
1h98A	1	0.1546	99.1	0.932	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0122 seconds.