Q97V30 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97V30 - Quinol oxidase (SoxABC), cytochrome B subunit, putative (SoxC-like)

UniProt:	Q97V30	Sequences: MTSFILMSSKLSDWFKERLGLDDLPFFRTPDYMYKVDYWLGALVASAFIYTVITGLILLLYYNAQAGYNSTEFVINSVPYGSVVLYSHLYGAYAMIILAYIHMFRNYFAGAYKKPRELLWIIGVIMLILTLGTAFLGYSLIGDALATSAVDVGEGIISSVPGLSIFIPFLFGNYDAGDYGRVLAWHIILTALIGLLFVFHFFLAEHYGMMPSRKVKDKVPAVYAKEEWQKFNPWWPRNFVYMMSLIFLTWGFILIIPNAFAYLNGLPQQLNPFLNPKPAPPPNSPAAAHITTYPPWFFLFLYKIADFTSDVVIFLFIGVIIPLIYLIIVPFLDRTEYLHPMKRKVFVGIGILIVTYLTQTTIWGDLTPGVEIPVSQQVLVYLPPAIIVALGLAAIRPKTDNKGNIKGTIGPITALAFILVSSLFIIAGIELLANPTILTVGVFIPIAGIFILTTKKIAPIALNAEQRSENASVSEERAPEWKKKLAEGLVALLFIYAIILAAQIWTIPATGYFSNLFGIDLGLILLMLGEGISLYHYVIYRK	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	542 (417)
Sequences:	499 (201)
Seq/√Len:	9.9

SULSO - Q97V30 Q97VH0 Q97UN3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
355_T	392_L	5.095	1.00
355_T	388_V	4.763	1.00
184_A	187_I	4.564	1.00
351_I	392_L	4.398	0.99
384_P	388_V	4.310	0.99
356_Y	385_A	3.776	0.98
99_A	130_T	3.694	0.98
13_D	17_E	3.106	0.94
201_F	204_A	3.086	0.93
423_L	429_I	3.011	0.93
69_N	73_F	2.987	0.92
255_I	259_A	2.747	0.89
114_K	334_R	2.712	0.88
48_F	197_F	2.697	0.88
423_L	427_A	2.666	0.87
104_F	354_V	2.623	0.86
383_P	387_I	2.570	0.85
71_T	273_F	2.485	0.83
50_Y	257_P	2.469	0.82
136_L	182_V	2.469	0.82
301_L	319_V	2.451	0.82
366_L	378_V	2.447	0.82
320_I	324_I	2.430	0.81
96_I	130_T	2.428	0.81
170_L	185_W	2.415	0.81
243_M	246_I	2.344	0.79
302_Y	364_G	2.319	0.78
99_A	127_L	2.269	0.76
152_V	156_I	2.260	0.76
87_S	253_I	2.207	0.74
133_T	136_L	2.181	0.73
363_W	381_Y	2.152	0.72
20_G	207_Y	2.150	0.72
106_N	111_A	2.133	0.72
380_V	384_P	2.096	0.70
167_I	170_L	2.082	0.70
379_L	382_L	2.082	0.70
243_M	250_W	2.068	0.69
70_S	74_V	2.033	0.68
103_M	260_F	1.985	0.66
157_I	170_L	1.957	0.65
45_A	197_F	1.921	0.63
290_I	302_Y	1.917	0.63
21_L	74_V	1.892	0.62
132_G	319_V	1.846	0.60
304_I	360_T	1.833	0.59
64_A	180_G	1.820	0.59
63_N	180_G	1.813	0.59
388_V	392_L	1.811	0.58
121_I	331_F	1.800	0.58
215_V	218_K	1.799	0.58
232_N	237_R	1.780	0.57
156_I	323_L	1.767	0.57
377_Q	381_Y	1.758	0.56
167_I	310_D	1.756	0.56
43_L	245_L	1.741	0.55
351_I	354_V	1.735	0.55
132_G	153_G	1.704	0.54
131_L	298_F	1.701	0.54
304_I	318_G	1.681	0.53
106_N	199_F	1.660	0.52
17_E	114_K	1.653	0.51
280_P	283_N	1.644	0.51
103_M	253_I	1.639	0.51
133_T	144_A	1.626	0.50
379_L	383_P	1.626	0.50
387_I	437_I	1.611	0.49
234_W	239_F	1.604	0.49
238_N	377_Q	1.592	0.49
320_I	326_L	1.575	0.48
308_T	313_I	1.575	0.48
307_F	359_Q	1.575	0.48
124_V	326_L	1.564	0.47
406_K	409_I	1.557	0.47
20_G	169_F	1.555	0.47
144_A	299_L	1.546	0.46
155_G	171_F	1.535	0.46
52_V	320_I	1.528	0.46
21_L	315_L	1.515	0.45
352_L	390_L	1.509	0.45
52_V	189_L	1.485	0.44
252_F	257_P	1.483	0.44
52_V	194_G	1.467	0.43
381_Y	393_A	1.466	0.43
260_F	285_P	1.455	0.42
124_V	327_I	1.446	0.42
187_I	365_D	1.445	0.42
299_L	361_T	1.445	0.42
427_A	431_L	1.439	0.42
112_Y	408_T	1.421	0.41
71_T	354_V	1.404	0.40
51_T	197_F	1.401	0.40
148_S	365_D	1.400	0.40
198_V	275_N	1.393	0.40
9_S	251_G	1.389	0.39
166_F	169_F	1.380	0.39
422_S	428_G	1.377	0.39
342_K	412_I	1.374	0.39
144_A	283_N	1.371	0.39
233_P	338_L	1.371	0.39
187_I	406_K	1.365	0.38
51_T	91_G	1.365	0.38
94_A	260_F	1.361	0.38
425_I	431_L	1.344	0.38
288_A	302_Y	1.344	0.38
78_V	191_A	1.343	0.38
423_L	431_L	1.337	0.37
52_V	197_F	1.332	0.37
66_A	390_L	1.329	0.37
78_V	353_I	1.324	0.37
191_A	239_F	1.312	0.36
54_T	182_V	1.312	0.36
184_A	406_K	1.306	0.36
305_A	363_W	1.305	0.36
351_I	355_T	1.305	0.36
399_T	428_G	1.298	0.36
96_I	101_I	1.297	0.36
130_T	419_L	1.273	0.35
13_D	21_L	1.272	0.35
121_I	125_I	1.271	0.34
256_I	260_F	1.260	0.34
77_S	358_T	1.259	0.34
39_W	106_N	1.258	0.34
373_P	420_V	1.256	0.34
154_E	168_P	1.255	0.34
122_I	199_F	1.252	0.34
54_T	87_S	1.251	0.34
357_L	360_T	1.251	0.34
77_S	96_I	1.249	0.34
406_K	410_G	1.242	0.33
45_A	51_T	1.227	0.33
54_T	427_A	1.225	0.33
28_R	205_E	1.225	0.33
56_L	94_A	1.223	0.33
315_L	360_T	1.222	0.33
77_S	118_L	1.221	0.32
66_A	178_D	1.218	0.32
160_V	429_I	1.214	0.32
14_W	19_L	1.206	0.32
182_V	280_P	1.202	0.32
127_L	276_P	1.198	0.32
415_L	433_A	1.184	0.31
244_S	247_F	1.183	0.31
232_N	238_N	1.182	0.31
304_I	315_L	1.182	0.31
318_G	360_T	1.174	0.31
20_G	405_I	1.168	0.30
39_W	242_M	1.165	0.30
14_W	118_L	1.162	0.30
260_F	288_A	1.158	0.30
87_S	212_S	1.155	0.30
345_V	397_P	1.154	0.30
121_I	327_I	1.146	0.30
348_G	388_V	1.145	0.30
183_L	187_I	1.144	0.29
198_V	205_E	1.141	0.29
156_I	298_F	1.139	0.29
124_V	128_I	1.139	0.29
118_L	386_I	1.137	0.29
152_V	304_I	1.132	0.29
124_V	369_G	1.131	0.29
103_M	127_L	1.130	0.29
52_V	191_A	1.130	0.29
386_I	390_L	1.129	0.29
46_S	238_N	1.129	0.29
156_I	305_A	1.129	0.29
56_L	406_K	1.125	0.29
68_Y	391_G	1.120	0.29
39_W	131_L	1.118	0.28
30_P	33_M	1.118	0.28
153_G	156_I	1.117	0.28
148_S	283_N	1.113	0.28
37_D	40_L	1.113	0.28
83_V	258_N	1.113	0.28
54_T	275_N	1.111	0.28
61_Y	285_P	1.111	0.28
53_I	104_F	1.107	0.28
97_I	272_P	1.107	0.28
56_L	189_L	1.104	0.28
436_T	439_T	1.100	0.28
100_Y	127_L	1.096	0.28
328_I	354_V	1.093	0.28
10_K	178_D	1.083	0.27
78_V	273_F	1.083	0.27
96_I	127_L	1.080	0.27
402_K	431_L	1.076	0.27
52_V	324_I	1.068	0.27
193_I	436_T	1.066	0.27
244_S	377_Q	1.065	0.27
68_Y	192_L	1.065	0.27
29_T	132_G	1.063	0.26
12_S	386_I	1.059	0.26
393_A	402_K	1.058	0.26
425_I	429_I	1.048	0.26
311_V	314_F	1.048	0.26
94_A	167_I	1.044	0.26
393_A	397_P	1.034	0.25
129_L	188_I	1.031	0.25
154_E	158_S	1.030	0.25
301_L	304_I	1.029	0.25
156_I	320_I	1.029	0.25
310_D	386_I	1.024	0.25
97_I	197_F	1.016	0.25
296_W	355_T	1.008	0.25
324_I	327_I	1.007	0.25
52_V	56_L	1.006	0.25
125_I	327_I	1.003	0.24
305_A	314_F	1.000	0.24
106_N	201_F	0.997	0.24
96_I	99_A	0.992	0.24
132_G	152_V	0.990	0.24
160_V	301_L	0.990	0.24
50_Y	201_F	0.989	0.24
184_A	197_F	0.986	0.24
126_M	312_V	0.986	0.24
78_V	379_L	0.983	0.24
87_S	180_G	0.983	0.24
358_T	361_T	0.976	0.24
56_L	59_L	0.975	0.23
100_Y	296_W	0.975	0.23
152_V	312_V	0.974	0.23
233_P	313_I	0.973	0.23
374_V	377_Q	0.972	0.23
247_F	412_I	0.968	0.23
281_P	289_H	0.968	0.23
237_R	405_I	0.967	0.23
313_I	317_I	0.966	0.23
60_L	421_S	0.965	0.23
101_I	351_I	0.965	0.23
15_F	60_L	0.961	0.23
162_G	187_I	0.960	0.23
156_I	319_V	0.960	0.23
131_L	178_D	0.958	0.23
322_P	326_L	0.958	0.23
29_T	33_M	0.951	0.23
211_P	229_Q	0.949	0.23
281_P	412_I	0.944	0.22
54_T	290_I	0.943	0.22
321_I	353_I	0.942	0.22
108_F	350_G	0.941	0.22
367_T	373_P	0.940	0.22
358_T	392_L	0.940	0.22
323_L	326_L	0.937	0.22
123_G	200_H	0.932	0.22
78_V	317_I	0.930	0.22
83_V	199_F	0.929	0.22
53_I	399_T	0.924	0.22
135_F	284_S	0.919	0.22
280_P	361_T	0.918	0.22
304_I	319_V	0.913	0.22
27_F	205_E	0.913	0.22
124_V	183_L	0.910	0.21
178_D	300_F	0.907	0.21
53_I	198_V	0.906	0.21
20_G	54_T	0.905	0.21
249_T	362_I	0.904	0.21
281_P	326_L	0.903	0.21
17_E	193_I	0.901	0.21
356_Y	387_I	0.900	0.21
56_L	188_I	0.898	0.21
59_L	317_I	0.894	0.21
132_G	185_W	0.893	0.21
52_V	84_V	0.884	0.21
207_Y	238_N	0.880	0.21
118_L	372_I	0.879	0.20
39_W	235_W	0.875	0.20
156_I	370_V	0.875	0.20
366_L	373_P	0.873	0.20
132_G	160_V	0.871	0.20
54_T	288_A	0.866	0.20
133_T	148_S	0.864	0.20
192_L	355_T	0.859	0.20
124_V	156_I	0.857	0.20
404_N	407_G	0.856	0.20
254_L	257_P	0.853	0.20
127_L	354_V	0.852	0.20
315_L	319_V	0.850	0.20
34_Y	238_N	0.846	0.20
169_F	233_P	0.838	0.19
117_E	123_G	0.835	0.19
57_I	283_N	0.835	0.19
12_S	437_I	0.833	0.19
128_I	198_V	0.832	0.19
19_L	251_G	0.830	0.19
112_Y	329_V	0.828	0.19
157_I	198_V	0.827	0.19
324_I	357_L	0.823	0.19
130_T	193_I	0.819	0.19
377_Q	424_F	0.818	0.19
334_R	420_V	0.818	0.19
234_W	327_I	0.818	0.19
87_S	250_W	0.817	0.19
46_S	242_M	0.817	0.19
56_L	420_V	0.817	0.19
356_Y	390_L	0.814	0.19
192_L	273_F	0.813	0.19
44_V	98_L	0.813	0.19
49_I	362_I	0.811	0.19
153_G	319_V	0.809	0.18
189_L	428_G	0.809	0.18
317_I	437_I	0.809	0.18
87_S	254_L	0.808	0.18
33_M	241_Y	0.802	0.18
152_V	298_F	0.801	0.18
156_I	315_L	0.800	0.18
179_Y	393_A	0.799	0.18
83_V	226_E	0.799	0.18
331_F	348_G	0.796	0.18
253_I	257_P	0.796	0.18
102_H	123_G	0.794	0.18
152_V	364_G	0.794	0.18
154_E	160_V	0.793	0.18
84_V	328_I	0.792	0.18
356_Y	386_I	0.790	0.18
191_A	195_L	0.789	0.18
32_Y	243_M	0.789	0.18
153_G	191_A	0.787	0.18
73_F	395_I	0.786	0.18
156_I	353_I	0.786	0.18
87_S	184_A	0.785	0.18
335_T	352_L	0.785	0.18
247_F	276_P	0.783	0.18
343_R	391_G	0.783	0.18
136_L	185_W	0.781	0.18
59_L	188_I	0.781	0.18
26_F	258_N	0.779	0.18
304_I	381_Y	0.776	0.18
191_A	319_V	0.775	0.18
234_W	283_N	0.775	0.18
68_Y	256_I	0.775	0.18
29_T	354_V	0.774	0.18
296_W	364_G	0.773	0.18
203_L	331_F	0.772	0.18
48_F	194_G	0.770	0.17
70_S	118_L	0.769	0.17
93_Y	270_L	0.768	0.17
184_A	325_Y	0.767	0.17
131_L	170_L	0.767	0.17
56_L	321_I	0.766	0.17
60_L	184_A	0.765	0.17
299_L	335_T	0.765	0.17
34_Y	241_Y	0.764	0.17
20_G	233_P	0.764	0.17
349_I	354_V	0.763	0.17
49_I	60_L	0.762	0.17
151_D	400_D	0.762	0.17
424_F	431_L	0.761	0.17
184_A	323_L	0.761	0.17
64_A	68_Y	0.761	0.17
257_P	373_P	0.760	0.17
239_F	417_F	0.757	0.17
54_T	248_L	0.756	0.17
15_F	317_I	0.755	0.17
104_F	353_I	0.752	0.17
402_K	435_P	0.751	0.17
11_L	178_D	0.750	0.17
152_V	314_F	0.749	0.17
334_R	353_I	0.748	0.17
336_E	438_L	0.747	0.17
66_A	354_V	0.747	0.17
50_Y	326_L	0.747	0.17
103_M	442_V	0.746	0.17
50_Y	428_G	0.746	0.17
132_G	312_V	0.745	0.17
307_F	440_V	0.745	0.17
284_S	302_Y	0.745	0.17
66_A	310_D	0.744	0.17
102_H	105_R	0.743	0.17
103_M	170_L	0.743	0.17
421_S	431_L	0.742	0.17
155_G	189_L	0.742	0.17
260_F	300_F	0.741	0.17
30_P	233_P	0.741	0.17
17_E	171_F	0.739	0.17
124_V	193_I	0.738	0.17
121_I	304_I	0.738	0.17
343_R	348_G	0.738	0.17
25_P	54_T	0.737	0.17
259_A	345_V	0.735	0.17
332_L	362_I	0.734	0.17
44_V	135_F	0.734	0.17
371_E	395_I	0.733	0.17
19_L	174_Y	0.733	0.17
53_I	87_S	0.732	0.16
398_K	404_N	0.729	0.16
290_I	323_L	0.728	0.16
376_Q	379_L	0.727	0.16
202_F	205_E	0.725	0.16
56_L	428_G	0.724	0.16
163_L	351_I	0.723	0.16
369_G	431_L	0.723	0.16
68_Y	96_I	0.717	0.16
103_M	357_L	0.716	0.16
163_L	167_I	0.716	0.16
234_W	301_L	0.716	0.16
125_I	170_L	0.716	0.16
284_S	377_Q	0.715	0.16
129_L	192_L	0.714	0.16
256_I	269_Q	0.714	0.16
156_I	304_I	0.712	0.16
252_F	383_P	0.711	0.16
218_K	227_E	0.709	0.16
52_V	167_I	0.709	0.16
26_F	84_V	0.707	0.16
108_F	177_G	0.707	0.16
421_S	441_G	0.706	0.16
185_W	195_L	0.705	0.16
70_S	434_N	0.703	0.16
24_L	30_P	0.701	0.16
29_T	249_T	0.700	0.16
132_G	157_I	0.699	0.16
17_E	52_V	0.698	0.16
114_K	397_P	0.698	0.16
281_P	362_I	0.697	0.16
128_I	328_I	0.696	0.16
152_V	302_Y	0.694	0.16
127_L	326_L	0.691	0.15
39_W	334_R	0.690	0.15
325_Y	345_V	0.689	0.15
19_L	441_G	0.687	0.15
312_V	317_I	0.686	0.15
318_G	357_L	0.686	0.15
272_P	299_L	0.684	0.15
332_L	380_V	0.682	0.15
301_L	364_G	0.682	0.15
34_Y	232_N	0.681	0.15
359_Q	380_V	0.680	0.15
312_V	388_V	0.679	0.15
14_W	298_F	0.679	0.15
187_I	258_N	0.678	0.15
329_V	354_V	0.678	0.15
217_D	375_S	0.678	0.15
290_I	366_L	0.675	0.15
59_L	187_I	0.671	0.15
299_L	365_D	0.668	0.15
348_G	392_L	0.667	0.15
26_F	30_P	0.663	0.15
156_I	321_I	0.662	0.15
28_R	234_W	0.661	0.15
114_K	436_T	0.659	0.15
260_F	397_P	0.657	0.15
354_V	390_L	0.655	0.15
185_W	332_L	0.655	0.15
352_L	357_L	0.653	0.15
438_L	441_G	0.652	0.15
440_V	444_I	0.652	0.15
235_W	249_T	0.652	0.15
433_A	439_T	0.651	0.15
159_S	331_F	0.650	0.15
125_I	387_I	0.650	0.15
128_I	187_I	0.649	0.14
83_V	331_F	0.648	0.14
160_V	319_V	0.647	0.14
83_V	313_I	0.646	0.14
155_G	197_F	0.644	0.14
77_S	357_L	0.643	0.14
24_L	205_E	0.642	0.14
20_G	127_L	0.640	0.14
77_S	386_I	0.639	0.14
43_L	65_Q	0.639	0.14
163_L	312_V	0.638	0.14
313_I	371_E	0.638	0.14
276_P	305_A	0.634	0.14
14_W	386_I	0.634	0.14
84_V	247_F	0.633	0.14
315_L	318_G	0.632	0.14
63_N	70_S	0.632	0.14
54_T	84_V	0.631	0.14
381_Y	397_P	0.630	0.14
100_Y	104_F	0.629	0.14
131_L	290_I	0.626	0.14
153_G	185_W	0.624	0.14
153_G	377_Q	0.624	0.14
136_L	153_G	0.624	0.14
290_I	364_G	0.624	0.14
87_S	103_M	0.624	0.14
193_I	345_V	0.623	0.14
185_W	189_L	0.623	0.14
215_V	238_N	0.623	0.14
125_I	185_W	0.623	0.14
60_L	325_Y	0.623	0.14
305_A	365_D	0.622	0.14
387_I	391_G	0.620	0.14
68_Y	91_G	0.619	0.14
214_K	413_T	0.618	0.14
10_K	355_T	0.617	0.14
23_D	191_A	0.617	0.14
233_P	352_L	0.617	0.14
29_T	364_G	0.616	0.14
296_W	299_L	0.616	0.14
234_W	364_G	0.615	0.14
101_I	185_W	0.612	0.14
318_G	334_R	0.611	0.14
194_G	429_I	0.611	0.14
23_D	343_R	0.610	0.14
215_V	357_L	0.609	0.14
46_S	212_S	0.607	0.14
151_D	236_P	0.606	0.14
24_L	275_N	0.605	0.14
9_S	280_P	0.603	0.13
135_F	298_F	0.603	0.13
10_K	63_N	0.598	0.13
179_Y	198_V	0.598	0.13
78_V	194_G	0.598	0.13
160_V	320_I	0.597	0.13
19_L	255_I	0.596	0.13
318_G	420_V	0.595	0.13
51_T	194_G	0.594	0.13
194_G	197_F	0.593	0.13
206_H	283_N	0.593	0.13
281_P	353_I	0.592	0.13
375_S	417_F	0.592	0.13
49_I	243_M	0.591	0.13
168_P	174_Y	0.591	0.13
248_L	332_L	0.585	0.13
195_L	391_G	0.585	0.13
22_D	355_T	0.584	0.13
189_L	213_R	0.584	0.13
168_P	388_V	0.581	0.13
351_I	399_T	0.581	0.13
125_I	128_I	0.580	0.13
131_L	300_F	0.580	0.13
352_L	363_W	0.579	0.13
24_L	28_R	0.579	0.13
193_I	298_F	0.577	0.13
128_I	323_L	0.577	0.13
13_D	29_T	0.576	0.13
188_I	191_A	0.574	0.13
185_W	300_F	0.574	0.13
13_D	127_L	0.572	0.13
19_L	256_I	0.571	0.13
59_L	299_L	0.571	0.13
198_V	255_I	0.570	0.13
15_F	70_S	0.568	0.13
98_L	227_E	0.567	0.13
329_V	350_G	0.566	0.13
34_Y	247_F	0.565	0.13
13_D	99_A	0.565	0.13
247_F	436_T	0.565	0.13
104_F	326_L	0.565	0.13
60_L	254_L	0.564	0.13
127_L	314_F	0.563	0.13
17_E	99_A	0.563	0.13
61_Y	402_K	0.563	0.13
256_I	428_G	0.563	0.13
207_Y	377_Q	0.563	0.13
238_N	412_I	0.562	0.13
352_L	388_V	0.561	0.13
83_V	254_L	0.560	0.13
408_T	435_P	0.560	0.13
62_Y	325_Y	0.560	0.13
208_G	228_W	0.560	0.13
184_A	226_E	0.560	0.13
25_P	30_P	0.557	0.13
97_I	422_S	0.556	0.13
121_I	259_A	0.555	0.13
71_T	379_L	0.555	0.13
152_V	301_L	0.555	0.13
63_N	437_I	0.555	0.13
97_I	104_F	0.552	0.12
326_L	356_Y	0.551	0.12
139_S	236_P	0.550	0.12
349_I	364_G	0.549	0.12
329_V	349_I	0.547	0.12
166_F	313_I	0.546	0.12
195_L	198_V	0.545	0.12
20_G	411_P	0.544	0.12
9_S	25_P	0.543	0.12
211_P	217_D	0.543	0.12
66_A	433_A	0.542	0.12
33_M	229_Q	0.542	0.12
13_D	22_D	0.542	0.12
205_E	441_G	0.541	0.12
366_L	375_S	0.541	0.12
102_H	200_H	0.539	0.12
380_V	385_A	0.539	0.12
48_F	94_A	0.539	0.12
160_V	387_I	0.537	0.12
29_T	314_F	0.536	0.12
332_L	434_N	0.536	0.12
413_T	422_S	0.535	0.12
410_G	415_L	0.535	0.12
114_K	422_S	0.533	0.12
52_V	428_G	0.533	0.12
21_L	332_L	0.533	0.12
45_A	79_P	0.532	0.12
105_R	123_G	0.529	0.12
227_E	235_W	0.529	0.12
195_L	315_L	0.529	0.12
269_Q	419_L	0.528	0.12
101_I	235_W	0.527	0.12
28_R	207_Y	0.526	0.12
433_A	436_T	0.525	0.12
171_F	189_L	0.525	0.12
335_T	358_T	0.525	0.12
25_P	169_F	0.523	0.12
238_N	444_I	0.521	0.12
339_H	403_G	0.518	0.12
235_W	318_G	0.517	0.12
162_G	192_L	0.517	0.12
68_Y	356_Y	0.517	0.12
15_F	328_I	0.515	0.12
275_N	372_I	0.511	0.12
114_K	374_V	0.511	0.12
144_A	206_H	0.510	0.12
15_F	77_S	0.510	0.12
167_I	324_I	0.510	0.12
43_L	237_R	0.509	0.12
21_L	192_L	0.508	0.12
103_M	415_L	0.507	0.12
33_M	48_F	0.507	0.12
45_A	48_F	0.507	0.12
106_N	202_F	0.506	0.12
99_A	317_I	0.505	0.12
59_L	400_D	0.505	0.12
52_V	227_E	0.504	0.12
114_K	122_I	0.504	0.12
96_I	205_E	0.504	0.12
8_S	193_I	0.504	0.12
118_L	121_I	0.503	0.12
153_G	201_F	0.503	0.12
133_T	283_N	0.503	0.12
322_P	349_I	0.503	0.12
149_A	306_D	0.502	0.11
258_N	342_K	0.500	0.11
215_V	439_T	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qjyA	2	0.7232	100	0.574	Contact Map
3cx5C	2	0.6882	100	0.609	Contact Map
1pp9C	2	0.6624	100	0.624	Contact Map
4ogqA	2	0.3782	100	0.722	Contact Map
4ogqB	1	0.2897	99.8	0.905	Contact Map
4gd3A	2	0.2915	95.7	0.969	Contact Map
1kqfC	3	0.3192	95	0.97	Contact Map
4e0tA	4	0.1199	29.7	0.984	Contact Map
4ld7A	5	0.131	17.1	0.986	Contact Map
3vouA	4	0.2325	13.8	0.987	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0124 seconds.