Q97UY0 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97UY0 - Selenium-binding protein

UniProt:	Q97UY0	Sequences: MELPSVFAPFKRDPTFYPSPKMAMKSPPEDLAYVACLYTGTGINRPDFIAVVDVKPESETYSKVIHKVELSYVNDELHHFGWNACSSALCPNGRPNFERRFLVVPGLRSSRIYIVDTKLNPRQPNIVKTIEPEEVKKVTGYSRLHTVHCGPDGIYISAFGNENGEGPGGILMLDHYSFEPLGKWEIDRSDQYLAYDFWWNLPNEVMVTSEWAVPNTIENGLRLEHLKDRYGNRIHFWDLRRRKKVSSVTLGEENRMALELRPLHDPTKLMGFINMVVSLKDLSSSIWLWYYEDGKWNGEKVIEIPAEPTEGGLPEILKPFKAVPPLVTDIDLSLDDKFLYVSLWGIGEIRQYDVSNPFKPVLTGKVKLGGIFHRADHPSDHKLTGAPQMIEISRDGKRVYVTNSLYSTWDNQFYPEGLKGWMVKLNANPDGGLDVDKEFFVDFGEARSHQVRLRGGDASSDSYCYP	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	466 (438)
Sequences:	417 (199)
Seq/√Len:	9.5

SULSO - Q97UY0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
332_L	354_V	5.639	1.00
30_D	55_K	5.412	1.00
207_V	236_F	5.204	1.00
115_V	126_I	4.779	1.00
424_K	436_D	4.687	1.00
356_N	359_K	4.416	0.99
111_R	131_E	4.223	0.99
402_T	422_M	4.155	0.99
272_F	357_P	4.034	0.99
103_V	114_I	3.707	0.98
111_R	132_P	3.615	0.97
204_E	238_D	3.599	0.97
270_M	288_L	3.105	0.93
72_Y	113_Y	2.949	0.91
270_M	357_P	2.919	0.91
248_V	298_G	2.917	0.91
299_E	358_F	2.912	0.90
285_S	303_E	2.829	0.89
135_V	144_L	2.733	0.87
141_Y	169_G	2.720	0.87
235_H	244_K	2.710	0.87
271_G	289_W	2.698	0.87
32_A	422_M	2.682	0.86
451_V	459_S	2.632	0.85
323_V	371_I	2.626	0.85
161_N	165_E	2.577	0.84
70_L	115_V	2.519	0.82
340_Y	351_Q	2.514	0.82
72_Y	132_P	2.512	0.82
348_E	365_K	2.490	0.82
350_R	362_L	2.483	0.81
60_T	63_K	2.391	0.79
352_Y	362_L	2.355	0.78
49_I	115_V	2.349	0.78
251_G	271_G	2.329	0.77
397_K	429_P	2.318	0.77
68_V	115_V	2.317	0.77
351_Q	432_G	2.214	0.73
143_R	218_E	2.201	0.73
290_Y	299_E	2.144	0.71
236_F	248_V	2.114	0.69
49_I	104_V	2.053	0.67
346_I	459_S	2.052	0.67
238_D	338_F	2.040	0.67
383_L	421_W	2.026	0.66
290_Y	297_N	2.012	0.65
202_P	267_T	2.000	0.65
108_R	218_E	1.941	0.63
46_P	75_D	1.882	0.60
205_V	363_T	1.872	0.60
304_I	341_V	1.867	0.59
307_E	367_K	1.861	0.59
460_S	463_Y	1.859	0.59
114_I	130_I	1.851	0.59
113_Y	448_S	1.834	0.58
38_Y	43_I	1.798	0.56
110_S	136_K	1.793	0.56
274_N	286_I	1.786	0.56
138_V	185_E	1.777	0.55
253_E	287_W	1.765	0.55
22_M	25_K	1.743	0.54
157_S	197_F	1.742	0.54
119_L	125_N	1.724	0.53
389_M	405_L	1.724	0.53
126_I	253_E	1.713	0.53
53_D	58_S	1.708	0.52
104_V	115_V	1.694	0.52
145_H	389_M	1.675	0.51
112_I	233_R	1.665	0.50
238_D	241_R	1.665	0.50
366_V	435_V	1.660	0.50
63_K	117_T	1.644	0.50
206_M	407_S	1.632	0.49
88_A	97_F	1.631	0.49
392_I	399_V	1.627	0.49
210_E	235_H	1.625	0.49
151_P	206_M	1.615	0.48
290_Y	355_S	1.594	0.47
77_L	122_R	1.593	0.47
383_L	403_N	1.589	0.47
338_F	351_Q	1.589	0.47
422_M	448_S	1.580	0.47
206_M	253_E	1.570	0.46
103_V	234_I	1.535	0.45
139_T	169_G	1.533	0.45
113_Y	129_T	1.520	0.44
288_L	299_E	1.519	0.44
204_E	237_W	1.519	0.44
19_S	22_M	1.515	0.44
49_I	68_V	1.512	0.44
54_V	451_V	1.503	0.43
349_I	423_V	1.490	0.43
74_N	133_E	1.482	0.42
40_G	171_L	1.474	0.42
101_F	114_I	1.452	0.41
348_E	367_K	1.448	0.41
33_Y	68_V	1.441	0.41
30_D	57_E	1.432	0.40
80_F	104_V	1.417	0.40
427_A	433_L	1.415	0.39
207_V	422_M	1.403	0.39
103_V	163_N	1.399	0.39
300_K	303_E	1.397	0.39
169_G	185_E	1.394	0.39
33_Y	124_P	1.385	0.38
390_I	459_S	1.384	0.38
144_L	158_A	1.380	0.38
350_R	365_K	1.372	0.38
259_E	405_L	1.368	0.37
421_W	440_F	1.359	0.37
426_N	434_D	1.354	0.37
155_Y	206_M	1.344	0.36
46_P	71_S	1.340	0.36
204_E	240_R	1.329	0.36
156_I	246_S	1.322	0.36
453_L	462_S	1.318	0.35
363_T	433_L	1.303	0.35
142_S	173_L	1.296	0.34
159_F	357_P	1.292	0.34
35_A	97_F	1.289	0.34
48_F	446_A	1.284	0.34
64_V	126_I	1.278	0.34
110_S	159_F	1.276	0.34
403_N	421_W	1.271	0.33
145_H	195_Y	1.268	0.33
142_S	162_E	1.265	0.33
235_H	238_D	1.258	0.33
268_K	288_L	1.253	0.33
344_W	352_Y	1.253	0.33
401_V	451_V	1.253	0.33
217_I	293_D	1.251	0.33
204_E	299_E	1.246	0.32
257_A	273_I	1.243	0.32
288_L	357_P	1.238	0.32
195_Y	389_M	1.236	0.32
306_A	403_N	1.233	0.32
401_V	425_L	1.227	0.32
262_P	271_G	1.225	0.32
132_P	139_T	1.223	0.32
134_E	138_V	1.216	0.31
258_L	409_W	1.213	0.31
36_C	50_A	1.201	0.31
388_Q	405_L	1.183	0.30
135_V	139_T	1.182	0.30
144_L	212_A	1.179	0.30
206_M	228_D	1.177	0.30
155_Y	172_M	1.177	0.30
172_M	337_K	1.174	0.30
246_S	297_N	1.169	0.30
158_A	242_R	1.167	0.29
349_I	425_L	1.158	0.29
132_P	136_K	1.154	0.29
220_G	412_Q	1.154	0.29
138_V	169_G	1.151	0.29
103_V	161_N	1.143	0.29
204_E	268_K	1.132	0.28
85_C	211_W	1.131	0.28
174_D	212_A	1.122	0.28
259_E	389_M	1.110	0.27
364_G	432_G	1.109	0.27
307_E	372_F	1.106	0.27
171_L	209_S	1.105	0.27
51_V	66_H	1.105	0.27
34_V	107_L	1.102	0.27
79_H	259_E	1.102	0.27
402_T	448_S	1.101	0.27
20_P	208_T	1.087	0.27
62_S	459_S	1.080	0.26
389_M	449_H	1.078	0.26
304_I	325_P	1.074	0.26
208_T	260_L	1.072	0.26
19_S	372_F	1.071	0.26
151_P	155_Y	1.070	0.26
67_K	444_G	1.069	0.26
287_W	298_G	1.062	0.26
85_C	146_T	1.061	0.26
199_W	450_Q	1.061	0.26
61_Y	207_V	1.056	0.26
260_L	284_S	1.055	0.25
145_H	449_H	1.053	0.25
116_D	124_P	1.051	0.25
206_M	247_S	1.049	0.25
226_L	282_L	1.045	0.25
54_V	438_E	1.040	0.25
33_Y	251_G	1.037	0.25
170_I	206_M	1.035	0.25
209_S	301_V	1.033	0.25
75_D	113_Y	1.030	0.25
144_L	459_S	1.030	0.25
181_L	437_K	1.028	0.25
232_N	249_T	1.026	0.25
362_L	365_K	1.026	0.25
17_Y	23_A	1.012	0.24
126_I	252_E	1.009	0.24
384_T	416_E	1.006	0.24
57_E	359_K	1.004	0.24
140_G	372_F	0.998	0.24
255_R	283_S	0.997	0.24
198_W	264_H	0.995	0.23
242_R	270_M	0.994	0.23
313_L	353_D	0.992	0.23
145_H	405_L	0.990	0.23
117_T	194_A	0.987	0.23
57_E	228_D	0.984	0.23
86_S	211_W	0.984	0.23
106_G	134_E	0.981	0.23
256_M	326_L	0.973	0.23
378_P	382_K	0.971	0.23
379_S	382_K	0.971	0.23
154_I	269_L	0.971	0.23
115_V	294_G	0.970	0.23
273_I	288_L	0.962	0.22
72_Y	96_N	0.960	0.22
137_K	179_E	0.959	0.22
340_Y	432_G	0.958	0.22
194_A	257_A	0.956	0.22
157_S	362_L	0.956	0.22
26_S	334_L	0.954	0.22
167_P	447_R	0.947	0.22
179_E	421_W	0.942	0.22
185_E	271_G	0.938	0.22
60_T	438_E	0.937	0.22
195_Y	449_H	0.935	0.22
211_W	406_Y	0.934	0.22
22_M	186_I	0.933	0.22
274_N	327_V	0.931	0.22
232_N	252_E	0.927	0.21
304_I	350_R	0.921	0.21
19_S	152_D	0.920	0.21
120_N	430_D	0.917	0.21
97_F	375_A	0.916	0.21
169_G	238_D	0.914	0.21
131_E	328_T	0.914	0.21
14_P	17_Y	0.913	0.21
30_D	390_I	0.910	0.21
288_L	301_V	0.910	0.21
85_C	145_H	0.907	0.21
272_F	336_D	0.905	0.21
167_P	183_K	0.904	0.21
117_T	341_V	0.903	0.21
71_S	402_T	0.898	0.21
263_L	270_M	0.896	0.20
52_V	441_V	0.894	0.20
55_K	117_T	0.892	0.20
346_I	365_K	0.892	0.20
206_M	418_L	0.890	0.20
183_K	330_I	0.890	0.20
259_E	388_Q	0.890	0.20
299_E	359_K	0.889	0.20
348_E	370_G	0.888	0.20
28_P	380_D	0.886	0.20
146_T	329_D	0.885	0.20
204_E	242_R	0.885	0.20
205_V	403_N	0.883	0.20
333_S	336_D	0.881	0.20
57_E	125_N	0.880	0.20
272_F	354_V	0.880	0.20
144_L	303_E	0.879	0.20
177_S	181_L	0.877	0.20
360_P	427_A	0.876	0.20
89_L	209_S	0.875	0.20
199_W	452_R	0.873	0.20
169_G	237_W	0.872	0.20
334_L	458_A	0.871	0.20
325_P	459_S	0.869	0.20
52_V	422_M	0.869	0.20
35_A	403_N	0.868	0.20
125_N	166_G	0.865	0.20
115_V	120_N	0.865	0.20
86_S	145_H	0.864	0.20
120_N	154_I	0.861	0.19
288_L	358_F	0.861	0.19
69_E	386_A	0.858	0.19
116_D	360_P	0.856	0.19
83_N	149_C	0.856	0.19
108_R	142_S	0.854	0.19
95_P	290_Y	0.854	0.19
120_N	159_F	0.853	0.19
145_H	259_E	0.853	0.19
79_H	449_H	0.852	0.19
50_A	208_T	0.851	0.19
243_K	337_K	0.848	0.19
136_K	407_S	0.842	0.19
59_E	359_K	0.841	0.19
18_P	22_M	0.841	0.19
104_V	376_D	0.841	0.19
60_T	155_Y	0.839	0.19
434_D	438_E	0.839	0.19
347_G	369_G	0.837	0.19
50_A	64_V	0.834	0.19
254_N	276_V	0.829	0.19
123_Q	424_K	0.828	0.19
375_A	382_K	0.827	0.19
290_Y	358_F	0.825	0.18
396_G	410_D	0.824	0.18
425_L	435_V	0.824	0.18
331_D	392_I	0.823	0.18
360_P	432_G	0.821	0.18
426_N	460_S	0.819	0.18
103_V	331_D	0.819	0.18
209_S	303_E	0.818	0.18
130_I	451_V	0.817	0.18
304_I	337_K	0.814	0.18
155_Y	284_S	0.811	0.18
195_Y	259_E	0.810	0.18
55_K	59_E	0.809	0.18
106_G	167_P	0.808	0.18
271_G	302_I	0.805	0.18
245_V	294_G	0.805	0.18
195_Y	258_L	0.803	0.18
155_Y	239_L	0.799	0.18
286_I	302_I	0.798	0.18
286_I	368_L	0.796	0.18
72_Y	111_R	0.796	0.18
268_K	357_P	0.793	0.18
46_P	203_N	0.793	0.18
151_P	306_A	0.792	0.18
233_R	247_S	0.790	0.18
203_N	269_L	0.788	0.18
165_E	215_N	0.786	0.17
308_P	322_A	0.786	0.17
454_R	462_S	0.785	0.17
331_D	399_V	0.785	0.17
48_F	64_V	0.781	0.17
247_S	303_E	0.780	0.17
140_G	303_E	0.779	0.17
271_G	286_I	0.774	0.17
123_Q	343_L	0.774	0.17
95_P	120_N	0.771	0.17
63_K	72_Y	0.770	0.17
19_S	241_R	0.769	0.17
237_W	282_L	0.768	0.17
84_A	282_L	0.768	0.17
326_L	368_L	0.768	0.17
65_I	249_T	0.768	0.17
256_M	282_L	0.766	0.17
152_D	429_P	0.762	0.17
396_G	404_S	0.759	0.17
34_V	451_V	0.759	0.17
85_C	195_Y	0.758	0.17
422_M	439_F	0.758	0.17
170_I	239_L	0.756	0.17
34_V	77_L	0.755	0.17
430_D	445_E	0.754	0.17
123_Q	361_V	0.754	0.17
438_E	441_V	0.753	0.17
210_E	300_K	0.750	0.17
146_T	195_Y	0.749	0.17
368_L	401_V	0.749	0.17
66_H	441_V	0.745	0.16
142_S	163_N	0.745	0.16
221_L	448_S	0.744	0.16
376_D	380_D	0.742	0.16
162_E	236_F	0.741	0.16
61_Y	286_I	0.740	0.16
63_K	438_E	0.737	0.16
85_C	389_M	0.736	0.16
85_C	148_H	0.736	0.16
256_M	267_T	0.733	0.16
135_V	286_I	0.732	0.16
99_R	196_D	0.726	0.16
387_P	401_V	0.726	0.16
159_F	209_S	0.725	0.16
33_Y	51_V	0.725	0.16
52_V	297_N	0.724	0.16
286_I	362_L	0.724	0.16
120_N	349_I	0.722	0.16
398_R	410_D	0.722	0.16
160_G	214_P	0.722	0.16
325_P	346_I	0.722	0.16
313_L	355_S	0.722	0.16
172_M	186_I	0.721	0.16
441_V	444_G	0.719	0.16
207_V	234_I	0.717	0.16
12_R	65_I	0.716	0.16
174_D	366_V	0.715	0.16
453_L	458_A	0.714	0.16
265_D	291_Y	0.713	0.16
357_P	363_T	0.710	0.16
103_V	310_E	0.710	0.16
66_H	123_Q	0.709	0.16
333_S	351_Q	0.708	0.16
222_R	419_K	0.706	0.15
197_F	206_M	0.704	0.15
79_H	145_H	0.704	0.15
367_K	371_I	0.703	0.15
158_A	284_S	0.702	0.15
199_W	262_P	0.701	0.15
71_S	237_W	0.696	0.15
55_K	60_T	0.694	0.15
174_D	403_N	0.694	0.15
86_S	195_Y	0.693	0.15
216_T	226_L	0.692	0.15
85_C	149_C	0.691	0.15
429_P	442_D	0.686	0.15
113_Y	197_F	0.685	0.15
51_V	68_V	0.684	0.15
130_I	409_W	0.683	0.15
22_M	215_N	0.679	0.15
14_P	18_P	0.678	0.15
94_R	453_L	0.676	0.15
140_G	397_K	0.673	0.15
333_S	340_Y	0.673	0.15
145_H	388_Q	0.672	0.15
309_T	312_G	0.671	0.15
135_V	219_N	0.669	0.15
39_T	110_S	0.669	0.15
366_V	401_V	0.668	0.15
54_V	87_S	0.667	0.15
185_E	237_W	0.663	0.15
96_N	209_S	0.661	0.14
361_V	434_D	0.660	0.14
103_V	451_V	0.660	0.14
160_G	164_G	0.660	0.14
146_T	405_L	0.660	0.14
225_H	228_D	0.658	0.14
93_G	381_H	0.658	0.14
119_L	209_S	0.656	0.14
15_T	453_L	0.656	0.14
123_Q	433_L	0.656	0.14
108_R	143_R	0.655	0.14
344_W	348_E	0.653	0.14
113_Y	172_M	0.653	0.14
14_P	453_L	0.653	0.14
353_D	356_N	0.651	0.14
306_A	332_L	0.649	0.14
170_I	197_F	0.649	0.14
200_N	262_P	0.649	0.14
352_Y	360_P	0.646	0.14
52_V	361_V	0.643	0.14
106_G	336_D	0.640	0.14
380_D	392_I	0.639	0.14
27_P	31_L	0.639	0.14
155_Y	257_A	0.638	0.14
93_G	380_D	0.638	0.14
110_S	143_R	0.638	0.14
11_K	30_D	0.637	0.14
344_W	360_P	0.636	0.14
101_F	289_W	0.636	0.14
28_P	438_E	0.634	0.14
128_K	179_E	0.633	0.14
72_Y	129_T	0.633	0.14
105_P	220_G	0.633	0.14
189_S	355_S	0.632	0.14
70_L	75_D	0.630	0.14
285_S	331_D	0.630	0.14
226_L	276_V	0.630	0.14
176_Y	334_L	0.630	0.14
53_D	56_P	0.629	0.14
400_Y	404_S	0.629	0.14
235_H	256_M	0.627	0.14
250_L	260_L	0.626	0.14
86_S	389_M	0.624	0.14
48_F	417_G	0.623	0.14
338_F	363_T	0.622	0.14
117_T	445_E	0.622	0.14
256_M	345_G	0.621	0.14
70_L	77_L	0.621	0.14
110_S	169_G	0.621	0.14
382_K	419_K	0.621	0.14
286_I	341_V	0.618	0.14
357_P	406_Y	0.617	0.14
330_I	353_D	0.616	0.13
70_L	402_T	0.615	0.13
107_L	217_I	0.614	0.13
72_Y	243_K	0.614	0.13
272_F	358_F	0.614	0.13
38_Y	407_S	0.614	0.13
393_S	409_W	0.613	0.13
70_L	205_V	0.613	0.13
117_T	363_T	0.613	0.13
404_S	410_D	0.612	0.13
52_V	135_V	0.611	0.13
55_K	291_Y	0.611	0.13
426_N	438_E	0.611	0.13
125_N	209_S	0.610	0.13
396_G	400_Y	0.610	0.13
384_T	418_L	0.610	0.13
425_L	433_L	0.609	0.13
261_R	405_L	0.609	0.13
71_S	74_N	0.608	0.13
77_L	124_P	0.607	0.13
234_I	265_D	0.607	0.13
238_D	244_K	0.606	0.13
342_S	390_I	0.605	0.13
213_V	407_S	0.605	0.13
349_I	397_K	0.604	0.13
262_P	450_Q	0.604	0.13
132_P	368_L	0.602	0.13
126_I	228_D	0.601	0.13
64_V	269_L	0.600	0.13
139_T	197_F	0.600	0.13
369_G	443_F	0.599	0.13
428_N	435_V	0.599	0.13
57_E	338_F	0.598	0.13
53_D	61_Y	0.598	0.13
393_S	396_G	0.597	0.13
142_S	366_V	0.596	0.13
335_D	362_L	0.594	0.13
157_S	206_M	0.594	0.13
158_A	204_E	0.594	0.13
338_F	429_P	0.593	0.13
36_C	296_W	0.592	0.13
74_N	118_K	0.592	0.13
135_V	209_S	0.592	0.13
18_P	268_K	0.591	0.13
353_D	361_V	0.590	0.13
114_I	381_H	0.589	0.13
232_N	235_H	0.588	0.13
62_S	187_D	0.585	0.13
16_F	20_P	0.585	0.13
22_M	64_V	0.585	0.13
254_N	257_A	0.584	0.13
157_S	258_L	0.584	0.13
218_E	226_L	0.583	0.13
355_S	418_L	0.583	0.13
234_I	273_I	0.582	0.13
97_F	460_S	0.581	0.13
81_G	184_W	0.580	0.13
228_D	451_V	0.579	0.13
172_M	397_K	0.576	0.13
67_K	206_M	0.575	0.13
228_D	247_S	0.575	0.13
204_E	288_L	0.575	0.13
33_Y	184_W	0.572	0.13
396_G	409_W	0.572	0.13
195_Y	388_Q	0.572	0.13
56_P	223_L	0.570	0.13
263_L	288_L	0.570	0.13
227_K	361_V	0.569	0.13
286_I	401_V	0.568	0.13
393_S	410_D	0.567	0.13
238_D	245_V	0.567	0.13
453_L	464_C	0.567	0.13
294_G	311_G	0.566	0.12
146_T	149_C	0.566	0.12
171_L	341_V	0.566	0.12
232_N	256_M	0.566	0.12
123_Q	204_E	0.565	0.12
376_D	437_K	0.565	0.12
107_L	304_I	0.565	0.12
295_K	303_E	0.564	0.12
26_S	106_G	0.564	0.12
174_D	306_A	0.563	0.12
36_C	349_I	0.563	0.12
49_I	432_G	0.563	0.12
207_V	248_V	0.562	0.12
122_R	233_R	0.561	0.12
217_I	380_D	0.561	0.12
103_V	293_D	0.560	0.12
38_Y	446_A	0.559	0.12
123_Q	429_P	0.559	0.12
82_W	105_P	0.558	0.12
115_V	402_T	0.557	0.12
260_L	330_I	0.557	0.12
87_S	154_I	0.555	0.12
372_F	383_L	0.555	0.12
199_W	239_L	0.554	0.12
272_F	332_L	0.553	0.12
152_D	240_R	0.553	0.12
146_T	259_E	0.552	0.12
450_Q	462_S	0.552	0.12
129_T	132_P	0.552	0.12
28_P	56_P	0.552	0.12
121_P	145_H	0.552	0.12
307_E	365_K	0.552	0.12
179_E	252_E	0.551	0.12
84_A	459_S	0.551	0.12
452_R	461_D	0.550	0.12
223_L	227_K	0.550	0.12
204_E	301_V	0.550	0.12
237_W	324_P	0.550	0.12
344_W	370_G	0.549	0.12
395_D	410_D	0.549	0.12
328_T	342_S	0.549	0.12
338_F	432_G	0.549	0.12
223_L	372_F	0.548	0.12
64_V	130_I	0.548	0.12
43_I	65_I	0.547	0.12
332_L	340_Y	0.546	0.12
165_E	435_V	0.546	0.12
84_A	224_E	0.546	0.12
418_L	434_D	0.545	0.12
243_K	355_S	0.543	0.12
388_Q	450_Q	0.543	0.12
177_S	207_V	0.542	0.12
159_F	286_I	0.542	0.12
348_E	364_G	0.541	0.12
46_P	49_I	0.541	0.12
45_R	446_A	0.541	0.12
93_G	152_D	0.540	0.12
207_V	416_E	0.539	0.12
283_S	315_E	0.539	0.12
426_N	431_G	0.538	0.12
232_N	343_L	0.538	0.12
195_Y	405_L	0.538	0.12
177_S	291_Y	0.538	0.12
100_R	119_L	0.538	0.12
378_P	425_L	0.538	0.12
87_S	149_C	0.536	0.12
67_K	392_I	0.535	0.12
17_Y	20_P	0.535	0.12
225_H	245_V	0.534	0.12
117_T	139_T	0.534	0.12
103_V	375_A	0.534	0.12
200_N	264_H	0.533	0.12
337_K	361_V	0.533	0.12
85_C	210_E	0.532	0.12
193_L	260_L	0.532	0.12
392_I	395_D	0.531	0.12
65_I	437_K	0.531	0.12
194_A	276_V	0.530	0.12
50_A	221_L	0.530	0.12
140_G	165_E	0.529	0.12
170_I	276_V	0.528	0.12
28_P	66_H	0.527	0.12
22_M	74_N	0.527	0.12
34_V	424_K	0.527	0.12
187_D	282_L	0.526	0.12
326_L	341_V	0.526	0.12
128_K	154_I	0.526	0.12
40_G	446_A	0.525	0.12
102_L	332_L	0.524	0.12
234_I	426_N	0.524	0.12
325_P	464_C	0.524	0.12
66_H	217_I	0.524	0.12
113_Y	243_K	0.524	0.12
239_L	450_Q	0.522	0.12
148_H	388_Q	0.521	0.12
260_L	460_S	0.520	0.12
68_V	162_E	0.520	0.12
40_G	290_Y	0.520	0.12
93_G	166_G	0.520	0.12
27_P	107_L	0.519	0.12
140_G	169_G	0.519	0.12
374_R	429_P	0.517	0.12
204_E	270_M	0.516	0.12
21_K	374_R	0.516	0.12
200_N	391_E	0.516	0.12
93_G	303_E	0.516	0.12
184_W	198_W	0.514	0.12
93_G	186_I	0.510	0.11
37_L	100_R	0.510	0.11
11_K	406_Y	0.508	0.11
368_L	423_V	0.508	0.11
185_E	191_Q	0.507	0.11
328_T	388_Q	0.507	0.11
348_E	352_Y	0.506	0.11
427_A	448_S	0.505	0.11
71_S	142_S	0.505	0.11
239_L	331_D	0.505	0.11
124_P	360_P	0.504	0.11
166_G	301_V	0.503	0.11
12_R	270_M	0.502	0.11
223_L	285_S	0.501	0.11
95_P	376_D	0.500	0.11
80_F	184_W	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2eceA	1	0.9764	100	0.601	Contact Map
3vgzA	1	0.6738	99.7	0.921	Contact Map
3scyA	1	0.7017	99.5	0.931	Contact Map
3bwsA	2	0.6631	99.4	0.933	Contact Map
3dsmA	1	0.6695	99.3	0.936	Contact Map
3hfqA	1	0.676	99.3	0.937	Contact Map
4qrjA	1	0.6867	99.3	0.937	Contact Map
1ri6A	1	0.6845	99.3	0.939	Contact Map
1nirA	2	0.6652	99.2	0.939	Contact Map
1fwxA	2	0.8112	99.2	0.941	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0123 seconds.