Q97UN3 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97UN3 - Quinol oxidase-2, cytochrome b (SoxG)

UniProt:	Q97UN3	Sequences: MLHISVHQYPELLQLITCFTILDIVTVYPQIRLVVRVVSVADEQSNGLFDRFMKWLDDRLGIYGHTLRPAPRYAYSIDYWLGGLVLSAFILEVITGALVALYYTPSDPYTSTTYLISKVPYGAFLFSLHSWGAYAMVFLLLVHMTRNFFVGAYRQPREIMWIVGAGLAGLTLTEAYLGYSLPYNLISWVATTTGLNLFSYMPFNLGYLISLFTVVNPDQPGIMSGVDPLVQRFFVFHWIVGGLILALIGLHLYIFEKHGITPPVSQVKPGDPELIDEYQDKLKSDPKWELQPLMRSIGMVIMIFLLTFGAIFLIAGAIPFNIVIIGGTPKYIMPAFNPVEAAQTPPVPDWYFLFIYFFYKSVSPTNASLIFLGWVVVTVLFPFIEEYVFRHKAPHPALRPASIAIGTGFIVSFIVNSVWAALTPGRDIGPIGTEVDGVIFLVCFAVIWPLLRYVAQPRVLAKWQSSPLTDGGVVIEYKERRILSGLLVLLINGLVLSGLIYSLYEVFILSNNPIINQFLIGQYLGFSLVLFSISIFINVVMGIGKSKNI	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	549 (417)
Sequences:	417 (170)
Seq/√Len:	8.3

SULSO - Q97UN3 Q97V30 Q97VH0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
411_V	452_R	5.636	1.00
235_V	238_W	4.965	1.00
140_L	171_T	4.335	0.99
411_V	448_W	4.184	0.98
145_T	410_I	3.613	0.96
407_T	452_R	3.591	0.95
137_V	171_T	3.443	0.94
412_S	444_F	3.391	0.94
155_Q	386_E	3.339	0.93
443_C	448_W	3.312	0.93
442_V	447_I	3.309	0.93
483_L	487_L	3.102	0.90
110_T	114_Y	3.057	0.89
54_K	58_D	2.794	0.85
356_Y	420_A	2.792	0.84
313_L	317_A	2.596	0.80
209_I	213_T	2.572	0.79
353_L	417_S	2.524	0.78
193_T	197_L	2.461	0.76
483_L	489_L	2.425	0.75
140_L	168_A	2.395	0.74
162_I	383_F	2.331	0.72
61_G	258_H	2.319	0.71
147_N	152_A	2.293	0.70
208_L	212_F	2.275	0.70
58_D	155_Q	2.259	0.69
285_D	291_Q	2.240	0.68
252_L	255_F	2.231	0.68
301_I	304_F	2.205	0.67
373_G	376_V	2.192	0.67
173_T	372_L	2.138	0.65
128_L	311_I	2.133	0.64
408_G	450_L	2.113	0.64
105_P	231_Q	2.099	0.63
422_L	437_G	2.097	0.63
86_L	248_I	2.060	0.62
340_E	343_Q	2.053	0.61
177_L	233_F	1.993	0.59
97_A	100_A	1.983	0.58
119_V	409_F	1.968	0.58
436_D	440_F	1.967	0.58
174_E	177_L	1.960	0.58
147_N	250_L	1.956	0.57
197_L	375_V	1.954	0.57
144_M	311_I	1.917	0.56
124_F	316_G	1.903	0.55
61_G	212_F	1.900	0.55
355_I	372_L	1.898	0.55
310_A	315_A	1.891	0.55
197_L	359_Y	1.887	0.55
466_S	469_T	1.848	0.53
438_V	442_V	1.810	0.51
439_I	443_C	1.798	0.51
358_F	416_N	1.795	0.51
92_E	132_G	1.790	0.50
174_E	185_L	1.770	0.50
138_F	322_I	1.769	0.50
92_E	248_I	1.751	0.49
94_I	145_T	1.744	0.49
305_L	336_F	1.723	0.48
165_A	379_V	1.706	0.47
95_T	425_G	1.705	0.47
185_L	353_L	1.703	0.47
119_V	323_V	1.700	0.47
287_K	292_P	1.697	0.47
361_S	415_V	1.682	0.46
162_I	356_Y	1.666	0.45
62_I	354_F	1.649	0.45
135_A	209_I	1.641	0.44
398_L	472_G	1.635	0.44
112_T	323_V	1.634	0.44
264_V	393_A	1.612	0.43
109_Y	243_L	1.594	0.42
350_W	411_V	1.589	0.42
58_D	93_V	1.577	0.42
419_W	440_F	1.576	0.42
95_T	233_F	1.571	0.41
198_F	374_W	1.570	0.41
198_F	213_T	1.562	0.41
448_W	452_R	1.562	0.41
197_L	372_L	1.555	0.41
109_Y	314_I	1.548	0.40
376_V	379_V	1.535	0.40
153_Y	468_L	1.534	0.40
55_W	60_L	1.531	0.40
104_T	231_Q	1.530	0.40
102_Y	345_P	1.524	0.40
119_V	438_V	1.512	0.39
145_T	409_F	1.510	0.39
95_T	125_L	1.497	0.38
453_Y	462_K	1.495	0.38
162_I	166_G	1.495	0.38
91_L	315_A	1.486	0.38
80_W	147_N	1.479	0.38
189_V	421_A	1.476	0.38
438_V	441_L	1.471	0.37
447_I	469_T	1.459	0.37
101_L	312_F	1.458	0.37
170_L	243_L	1.435	0.36
144_M	318_I	1.435	0.36
189_V	343_Q	1.432	0.36
344_T	356_Y	1.432	0.36
392_K	477_Y	1.421	0.35
244_I	352_F	1.421	0.35
286_P	394_P	1.418	0.35
266_Q	278_Y	1.414	0.35
48_L	240_V	1.413	0.35
373_G	378_T	1.410	0.35
196_N	214_V	1.408	0.35
440_F	453_Y	1.405	0.35
58_D	244_I	1.404	0.35
316_G	398_L	1.394	0.34
311_I	315_A	1.383	0.34
240_V	375_V	1.374	0.34
172_L	362_V	1.370	0.34
252_L	311_I	1.352	0.33
353_L	387_Y	1.349	0.33
172_L	227_D	1.345	0.33
264_V	392_K	1.340	0.32
93_V	239_I	1.336	0.32
291_Q	436_D	1.331	0.32
197_L	358_F	1.320	0.32
111_S	115_L	1.307	0.31
89_F	248_I	1.296	0.31
93_V	97_A	1.283	0.30
70_A	307_T	1.277	0.30
444_F	450_L	1.268	0.30
159_I	431_I	1.263	0.30
194_G	372_L	1.255	0.29
90_I	384_I	1.246	0.29
119_V	242_G	1.244	0.29
401_A	457_P	1.241	0.29
61_G	471_G	1.235	0.29
318_I	345_P	1.233	0.29
213_T	236_F	1.232	0.29
418_V	436_D	1.226	0.28
243_L	323_V	1.219	0.28
174_E	189_V	1.218	0.28
47_G	279_Q	1.213	0.28
233_F	239_I	1.212	0.28
286_P	442_V	1.197	0.27
115_L	455_A	1.196	0.27
162_I	379_V	1.194	0.27
193_T	428_I	1.193	0.27
54_K	168_A	1.190	0.27
253_Y	466_S	1.189	0.27
137_V	142_V	1.188	0.27
194_G	236_F	1.187	0.27
43_E	253_Y	1.174	0.27
485_G	489_L	1.163	0.26
433_T	453_Y	1.147	0.26
201_M	372_L	1.146	0.26
137_V	140_L	1.145	0.26
285_D	290_L	1.144	0.26
173_T	193_T	1.143	0.26
386_E	488_V	1.142	0.26
249_G	335_A	1.138	0.26
69_P	256_E	1.135	0.25
128_L	235_V	1.129	0.25
238_W	246_A	1.129	0.25
301_I	308_F	1.127	0.25
51_R	411_V	1.126	0.25
153_Y	381_F	1.121	0.25
85_V	139_L	1.112	0.25
55_W	159_I	1.108	0.25
413_F	416_N	1.105	0.24
293_L	300_V	1.101	0.24
51_R	209_I	1.100	0.24
140_L	370_I	1.097	0.24
205_L	213_T	1.095	0.24
47_G	51_R	1.086	0.24
173_T	236_F	1.082	0.24
234_F	255_F	1.080	0.24
97_A	135_A	1.075	0.24
361_S	419_W	1.065	0.23
359_Y	368_S	1.062	0.23
291_Q	472_G	1.062	0.23
466_S	470_D	1.059	0.23
227_D	243_L	1.058	0.23
288_W	307_T	1.056	0.23
387_Y	408_G	1.053	0.23
70_A	420_A	1.053	0.23
236_F	246_A	1.049	0.23
358_F	371_F	1.047	0.23
212_F	286_P	1.045	0.23
362_V	367_A	1.042	0.23
414_I	452_R	1.041	0.23
193_T	420_A	1.037	0.22
305_L	472_G	1.035	0.22
344_T	436_D	1.034	0.22
165_A	169_G	1.033	0.22
94_I	425_G	1.033	0.22
233_F	340_E	1.032	0.22
44_Q	48_L	1.026	0.22
118_K	414_I	1.025	0.22
172_L	352_F	1.020	0.22
185_L	343_Q	1.018	0.22
165_A	234_F	1.011	0.22
102_Y	462_K	1.005	0.22
141_L	369_L	1.004	0.22
69_P	287_K	1.001	0.21
193_T	352_F	0.996	0.21
244_I	481_R	0.993	0.21
194_G	197_L	0.992	0.21
346_P	356_Y	0.990	0.21
84_L	303_I	0.990	0.21
62_I	384_I	0.990	0.21
124_F	383_F	0.989	0.21
165_A	378_T	0.988	0.21
43_E	46_N	0.988	0.21
195_L	210_S	0.987	0.21
212_F	353_L	0.985	0.21
203_F	238_W	0.983	0.21
235_V	375_V	0.982	0.21
321_N	385_E	0.979	0.21
227_D	354_F	0.970	0.21
56_L	370_I	0.969	0.21
91_L	352_F	0.967	0.20
67_L	125_L	0.965	0.20
93_V	125_L	0.960	0.20
312_F	315_A	0.959	0.20
171_T	479_E	0.959	0.20
424_P	428_I	0.957	0.20
410_I	414_I	0.957	0.20
387_Y	414_I	0.955	0.20
92_E	279_Q	0.955	0.20
266_Q	413_F	0.953	0.20
100_A	238_W	0.953	0.20
54_K	62_I	0.952	0.20
51_R	227_D	0.952	0.20
436_D	484_S	0.948	0.20
177_L	194_G	0.945	0.20
415_V	420_A	0.941	0.20
90_I	101_L	0.938	0.20
433_T	460_L	0.938	0.20
196_N	248_I	0.937	0.20
173_T	201_M	0.936	0.20
194_G	311_I	0.932	0.20
213_T	370_I	0.932	0.20
78_D	184_N	0.932	0.20
439_I	444_F	0.930	0.19
302_M	305_L	0.920	0.19
200_Y	445_A	0.919	0.19
52_F	455_A	0.919	0.19
109_Y	418_V	0.915	0.19
212_F	362_V	0.914	0.19
358_F	440_F	0.913	0.19
60_L	314_I	0.912	0.19
193_T	214_V	0.910	0.19
239_I	401_A	0.909	0.19
445_A	450_L	0.907	0.19
111_S	364_P	0.907	0.19
47_G	240_V	0.903	0.19
193_T	358_F	0.903	0.19
287_K	420_A	0.902	0.19
318_I	354_F	0.902	0.19
63_Y	72_R	0.901	0.19
134_Y	320_F	0.900	0.19
46_N	50_D	0.900	0.19
371_F	410_I	0.899	0.19
371_F	416_N	0.898	0.19
405_I	410_I	0.896	0.19
195_L	199_S	0.894	0.19
95_T	487_L	0.893	0.19
61_G	398_L	0.890	0.18
353_L	421_A	0.887	0.18
110_T	244_I	0.886	0.18
191_T	233_F	0.884	0.18
55_W	197_L	0.883	0.18
361_S	444_F	0.880	0.18
56_L	353_L	0.877	0.18
90_I	369_L	0.875	0.18
55_W	193_T	0.874	0.18
235_V	466_S	0.873	0.18
54_K	144_M	0.872	0.18
138_F	248_I	0.871	0.18
145_T	378_T	0.869	0.18
201_M	355_I	0.868	0.18
433_T	436_D	0.860	0.18
372_L	375_V	0.858	0.18
234_F	238_W	0.856	0.18
118_K	137_V	0.856	0.18
101_L	451_L	0.855	0.18
208_L	253_Y	0.854	0.18
86_L	92_E	0.852	0.18
242_G	346_P	0.850	0.17
197_L	373_G	0.847	0.17
115_L	125_L	0.845	0.17
399_R	451_L	0.845	0.17
201_M	240_V	0.843	0.17
98_L	366_N	0.842	0.17
196_N	223_M	0.841	0.17
55_W	246_A	0.839	0.17
193_T	356_Y	0.838	0.17
304_F	307_T	0.838	0.17
240_V	384_I	0.836	0.17
159_I	280_D	0.836	0.17
168_A	378_T	0.835	0.17
198_F	201_M	0.834	0.17
101_L	238_W	0.832	0.17
137_V	407_T	0.831	0.17
316_G	364_P	0.831	0.17
78_D	81_L	0.829	0.17
80_W	288_W	0.827	0.17
194_G	352_F	0.827	0.17
91_L	354_F	0.826	0.17
118_K	353_L	0.825	0.17
323_V	410_I	0.822	0.17
147_N	252_L	0.819	0.17
105_P	109_Y	0.815	0.17
431_I	436_D	0.815	0.17
51_R	451_L	0.812	0.17
229_L	233_F	0.812	0.17
249_G	256_E	0.811	0.17
366_N	481_R	0.809	0.17
144_M	168_A	0.807	0.16
95_T	288_W	0.804	0.16
193_T	372_L	0.802	0.16
394_P	399_R	0.800	0.16
233_F	416_N	0.798	0.16
145_T	372_L	0.797	0.16
72_R	258_H	0.797	0.16
141_L	350_W	0.792	0.16
165_A	228_P	0.789	0.16
137_V	168_A	0.788	0.16
381_F	410_I	0.787	0.16
359_Y	419_W	0.784	0.16
194_G	355_I	0.783	0.16
65_H	335_A	0.782	0.16
165_A	197_L	0.781	0.16
64_G	242_G	0.776	0.16
305_L	388_V	0.776	0.16
125_L	380_L	0.776	0.16
43_E	47_G	0.773	0.16
211_L	249_G	0.773	0.16
228_P	238_W	0.772	0.16
50_D	309_G	0.772	0.16
173_T	194_G	0.772	0.16
98_L	102_Y	0.765	0.16
132_G	370_I	0.764	0.16
60_L	212_F	0.764	0.16
286_P	387_Y	0.764	0.16
386_E	409_F	0.763	0.15
197_L	378_T	0.762	0.15
279_Q	392_K	0.758	0.15
470_D	475_I	0.758	0.15
314_I	368_S	0.757	0.15
258_H	291_Q	0.753	0.15
146_R	202_P	0.751	0.15
267_V	389_F	0.751	0.15
56_L	444_F	0.749	0.15
254_I	481_R	0.748	0.15
442_V	477_Y	0.746	0.15
176_Y	233_F	0.743	0.15
172_L	354_F	0.741	0.15
65_H	249_G	0.739	0.15
171_T	361_S	0.738	0.15
111_S	369_L	0.738	0.15
56_L	377_V	0.736	0.15
414_I	417_S	0.735	0.15
369_L	373_G	0.734	0.15
166_G	452_R	0.734	0.15
291_Q	307_T	0.731	0.15
245_L	248_I	0.729	0.15
355_I	420_A	0.728	0.15
62_I	383_F	0.727	0.15
459_V	488_V	0.722	0.15
197_L	409_F	0.722	0.15
244_I	310_A	0.722	0.15
300_V	303_I	0.722	0.15
194_G	250_L	0.722	0.15
58_D	311_I	0.721	0.15
292_P	468_L	0.720	0.15
432_G	480_R	0.715	0.14
54_K	244_I	0.713	0.14
205_L	407_T	0.712	0.14
48_L	168_A	0.711	0.14
163_V	249_G	0.710	0.14
310_A	455_A	0.710	0.14
80_W	424_P	0.709	0.14
454_V	480_R	0.704	0.14
98_L	417_S	0.703	0.14
98_L	364_P	0.703	0.14
384_I	439_I	0.701	0.14
411_V	418_V	0.700	0.14
194_G	418_V	0.699	0.14
97_A	159_I	0.699	0.14
75_Y	291_Q	0.698	0.14
177_L	236_F	0.696	0.14
51_R	317_A	0.694	0.14
323_V	443_C	0.694	0.14
95_T	365_T	0.693	0.14
155_Q	313_L	0.693	0.14
193_T	427_D	0.692	0.14
245_L	420_A	0.692	0.14
209_I	249_G	0.691	0.14
58_D	140_L	0.690	0.14
207_Y	366_N	0.690	0.14
48_L	137_V	0.688	0.14
388_V	428_I	0.688	0.14
287_K	291_Q	0.687	0.14
114_Y	399_R	0.687	0.14
323_V	421_A	0.687	0.14
106_S	200_Y	0.683	0.14
244_I	386_E	0.683	0.14
90_I	235_V	0.681	0.14
398_L	457_P	0.678	0.14
266_Q	291_Q	0.677	0.14
90_I	203_F	0.676	0.14
135_A	318_I	0.674	0.14
362_V	437_G	0.673	0.14
64_G	165_A	0.671	0.14
236_F	239_I	0.671	0.14
55_W	364_P	0.668	0.14
62_I	388_V	0.668	0.14
144_M	310_A	0.667	0.13
166_G	236_F	0.660	0.13
189_V	195_L	0.660	0.13
66_T	70_A	0.657	0.13
291_Q	309_G	0.657	0.13
229_L	450_L	0.656	0.13
87_S	291_Q	0.655	0.13
65_H	69_P	0.654	0.13
201_M	445_A	0.652	0.13
115_L	207_Y	0.651	0.13
60_L	481_R	0.651	0.13
384_I	418_V	0.651	0.13
191_T	209_I	0.647	0.13
238_W	394_P	0.647	0.13
95_T	306_L	0.645	0.13
58_D	475_I	0.644	0.13
203_F	280_D	0.644	0.13
137_V	311_I	0.643	0.13
223_M	228_P	0.643	0.13
172_L	244_I	0.642	0.13
197_L	355_I	0.642	0.13
305_L	469_T	0.637	0.13
240_V	250_L	0.637	0.13
442_V	450_L	0.636	0.13
66_T	420_A	0.636	0.13
109_Y	171_T	0.634	0.13
169_G	244_I	0.634	0.13
285_D	292_P	0.634	0.13
238_W	421_A	0.634	0.13
418_V	454_V	0.632	0.13
361_S	420_A	0.631	0.13
55_W	386_E	0.629	0.13
173_T	466_S	0.629	0.13
377_V	424_P	0.628	0.13
257_K	366_N	0.628	0.13
201_M	378_T	0.627	0.13
312_F	352_F	0.627	0.13
239_I	365_T	0.627	0.13
207_Y	410_I	0.626	0.13
407_T	411_V	0.625	0.13
61_G	388_V	0.624	0.13
280_D	311_I	0.622	0.13
292_P	477_Y	0.622	0.13
159_I	335_A	0.621	0.13
44_Q	203_F	0.615	0.13
95_T	335_A	0.614	0.12
55_W	466_S	0.613	0.12
125_L	305_L	0.611	0.12
242_G	292_P	0.609	0.12
199_S	307_T	0.609	0.12
257_K	343_Q	0.608	0.12
192_T	460_L	0.608	0.12
371_F	462_K	0.607	0.12
119_V	245_L	0.607	0.12
142_V	288_W	0.607	0.12
358_F	372_L	0.605	0.12
61_G	472_G	0.605	0.12
51_R	58_D	0.603	0.12
167_L	207_Y	0.603	0.12
93_V	145_T	0.603	0.12
180_S	192_T	0.602	0.12
101_L	409_F	0.601	0.12
56_L	200_Y	0.599	0.12
48_L	238_W	0.599	0.12
144_M	413_F	0.598	0.12
412_S	445_A	0.597	0.12
359_Y	421_A	0.596	0.12
61_G	286_P	0.595	0.12
124_F	279_Q	0.595	0.12
70_A	189_V	0.595	0.12
300_V	307_T	0.593	0.12
149_F	406_G	0.592	0.12
318_I	417_S	0.590	0.12
436_D	470_D	0.590	0.12
408_G	413_F	0.590	0.12
80_W	172_L	0.589	0.12
101_L	125_L	0.589	0.12
205_L	306_L	0.588	0.12
145_T	234_F	0.587	0.12
58_D	163_V	0.586	0.12
43_E	244_I	0.585	0.12
124_F	439_I	0.584	0.12
137_V	352_F	0.583	0.12
464_Q	467_P	0.579	0.12
268_K	434_E	0.579	0.12
58_D	172_L	0.578	0.12
463_W	467_P	0.578	0.12
484_S	490_L	0.578	0.12
287_K	355_I	0.576	0.12
76_S	79_Y	0.576	0.12
49_F	257_K	0.576	0.12
93_V	376_V	0.574	0.12
97_A	244_I	0.573	0.12
87_S	263_P	0.573	0.12
66_T	287_K	0.573	0.12
211_L	454_V	0.572	0.12
286_P	408_G	0.571	0.12
131_W	154_R	0.570	0.12
457_P	472_G	0.570	0.12
165_A	428_I	0.570	0.12
355_I	358_F	0.570	0.12
193_T	359_Y	0.569	0.12
398_L	431_I	0.569	0.12
48_L	51_R	0.569	0.12
305_L	346_P	0.568	0.12
147_N	253_Y	0.568	0.12
236_F	421_A	0.567	0.12
144_M	180_S	0.565	0.12
128_L	135_A	0.565	0.12
168_A	336_F	0.565	0.12
56_L	162_I	0.562	0.12
248_I	373_G	0.562	0.12
235_V	248_I	0.562	0.12
109_Y	165_A	0.562	0.12
159_I	383_F	0.560	0.12
185_L	189_V	0.557	0.11
352_F	422_L	0.557	0.11
89_F	92_E	0.557	0.11
172_L	246_A	0.555	0.11
64_G	399_R	0.554	0.11
306_L	445_A	0.553	0.11
229_L	411_V	0.553	0.11
102_Y	173_T	0.552	0.11
244_I	355_I	0.552	0.11
246_A	345_P	0.551	0.11
173_T	355_I	0.551	0.11
405_I	420_A	0.551	0.11
336_F	359_Y	0.551	0.11
70_A	101_L	0.550	0.11
128_L	248_I	0.549	0.11
51_R	67_L	0.549	0.11
194_G	242_G	0.548	0.11
45_S	388_V	0.547	0.11
55_W	196_N	0.547	0.11
383_F	388_V	0.545	0.11
48_L	140_L	0.543	0.11
213_T	459_V	0.542	0.11
75_Y	285_D	0.542	0.11
318_I	488_V	0.541	0.11
139_L	350_W	0.540	0.11
407_T	410_I	0.540	0.11
208_L	394_P	0.540	0.11
48_L	414_I	0.538	0.11
44_Q	454_V	0.538	0.11
367_A	373_G	0.538	0.11
322_I	353_L	0.538	0.11
242_G	245_L	0.537	0.11
95_T	104_T	0.536	0.11
207_Y	257_K	0.535	0.11
317_A	401_A	0.535	0.11
486_L	490_L	0.534	0.11
105_P	465_S	0.532	0.11
91_L	369_L	0.532	0.11
172_L	378_T	0.530	0.11
66_T	256_E	0.530	0.11
393_A	477_Y	0.529	0.11
68_R	256_E	0.527	0.11
169_G	379_V	0.527	0.11
166_G	169_G	0.525	0.11
48_L	203_F	0.525	0.11
368_S	372_L	0.524	0.11
171_T	245_L	0.524	0.11
292_P	308_F	0.524	0.11
141_L	168_A	0.523	0.11
265_S	268_K	0.522	0.11
388_V	436_D	0.522	0.11
244_I	419_W	0.520	0.11
71_P	192_T	0.520	0.11
388_V	394_P	0.519	0.11
162_I	420_A	0.519	0.11
163_V	247_L	0.518	0.11
132_G	384_I	0.518	0.11
162_I	414_I	0.517	0.11
458_R	464_Q	0.517	0.11
69_P	195_L	0.517	0.11
301_I	305_L	0.517	0.11
62_I	66_T	0.516	0.11
45_S	155_Q	0.516	0.11
453_Y	471_G	0.516	0.11
93_V	248_I	0.515	0.11
109_Y	310_A	0.515	0.11
112_T	203_F	0.515	0.11
171_T	312_F	0.514	0.11
244_I	378_T	0.514	0.11
233_F	364_P	0.513	0.11
135_A	384_I	0.513	0.11
80_W	356_Y	0.512	0.11
94_I	459_V	0.512	0.11
94_I	249_G	0.512	0.11
456_Q	460_L	0.511	0.11
196_N	359_Y	0.510	0.11
69_P	258_H	0.510	0.11
168_A	393_A	0.509	0.11
408_G	419_W	0.509	0.11
93_V	280_D	0.509	0.11
228_P	249_G	0.509	0.11
194_G	436_D	0.508	0.11
370_I	405_I	0.507	0.11
80_W	88_A	0.507	0.11
60_L	254_I	0.507	0.11
235_V	377_V	0.506	0.11
248_I	315_A	0.505	0.11
194_G	252_L	0.504	0.11
44_Q	376_V	0.504	0.11
203_F	384_I	0.504	0.11
166_G	451_L	0.503	0.11
293_L	391_H	0.503	0.11
223_M	242_G	0.502	0.11
139_L	369_L	0.502	0.11
102_Y	138_F	0.500	0.11
258_H	263_P	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2qjyA	2	0.7304	100	0.624	Contact Map
3cx5C	2	0.6849	100	0.658	Contact Map
1pp9C	2	0.6576	100	0.67	Contact Map
4ogqA	2	0.3789	100	0.744	Contact Map
4ogqB	1	0.2823	99.6	0.924	Contact Map
1kqfC	3	0.3643	86.8	0.977	Contact Map
4gd3A	2	0.2769	80.4	0.979	Contact Map
2iiiA	2	0.0965	27.9	0.985	Contact Map
1vr7A	2	0.102	24.6	0.986	Contact Map
1zoyC	1	0.2222	9.8	0.988	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0121 seconds.