AGAL - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

AGAL - Alpha-galactosidase

UniProt:	Q97U94	Sequences: MIWIEDENGNKYQCDSNGNCENLAIVKVNTKEYNNDGKIYSIEGKSFVKLSKFPITLKLNLKADQILSLTTQQIYSEVYGKAFTYYNQLAIDMEPVTEPPKELKYDIKSLDHEKYIRTYPCWLYPVFNNIPDYTVFALVKSGNSYEAFFTLSNNYVTAYLFGDSVRLYTGFNTDEIKRSYFLSIGTSDNPYKAIENAINIASKETFTFKLRKEKGFPDKVMNGLGWCSWNAFLTKDLNEENLIKVVKGIIERGLRLNWVIIDDGWQDQNNDRAIRSLNPDNKKFPNGFKNTVRAIKSLGVKYVGLWHAINAHWGGMSQELMKSLNVNGYFTNFLNSYVPSPNLEDAIGFYKAFDGNILRDFDLVKVDNQWVIHAIYDSFPIGLASRNIQIALQYSVGKDVINCMSMNPENYCNYFYSNVMRNSIDYVPFWKDGTKLHIMFNAYNSLLTSHIVYPDYDMFMSYDPYAKVHLVARVFSGGPIYITDRHPERTNIELLRMAVLPNGEVIRVDEPALITEDLLFKDPLRERVLLKLKGKVKGYNAIAFFNLNSGEVEEEYNNNEDYYYYKVFSGEFGVGKFNVKLRELDAEVVITFPKSNRVIGLREYILPPFTVIVSDNVVIPKADGTLLYVKDTELNEVKAREGIPVTIE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	648 (554)
Sequences:	414 (225)
Seq/√Len:	9.6

SULSO - AGAL

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
566_K	587_E	5.967	1.00
296_K	303_V	5.536	1.00
324_L	352_A	5.046	1.00
292_V	303_V	4.558	0.99
474_V	498_A	3.496	0.96
304_G	363_L	3.429	0.96
230_N	483_T	3.233	0.94
422_N	441_N	3.100	0.93
422_N	448_T	3.080	0.93
267_D	275_R	2.990	0.92
138_L	505_V	2.898	0.90
198_I	447_L	2.854	0.90
267_D	276_S	2.779	0.88
194_I	446_L	2.771	0.88
247_K	611_V	2.716	0.87
302_Y	362_D	2.670	0.86
307_H	354_D	2.622	0.85
603_E	625_T	2.615	0.85
246_V	259_V	2.585	0.84
288_F	292_V	2.579	0.84
308_A	368_N	2.570	0.84
469_H	473_R	2.356	0.78
369_Q	428_P	2.323	0.77
237_L	483_T	2.320	0.77
287_G	305_L	2.314	0.77
292_V	361_F	2.287	0.76
361_F	435_K	2.275	0.75
529_L	544_F	2.274	0.75
316_M	475_F	2.261	0.75
97_T	103_L	2.250	0.75
261_I	303_V	2.245	0.74
148_F	184_I	2.219	0.73
108_K	163_D	2.212	0.73
313_W	404_M	2.162	0.71
460_M	471_V	2.161	0.71
544_F	589_V	2.139	0.71
229_W	306_W	2.138	0.71
456_Y	477_G	2.092	0.69
564_Y	589_V	2.062	0.68
162_G	166_R	2.048	0.67
349_F	629_V	2.043	0.67
446_L	579_V	2.040	0.67
260_I	363_L	2.028	0.66
316_M	564_Y	2.008	0.65
434_T	468_V	2.005	0.65
92_D	603_E	2.005	0.65
238_N	309_I	1.945	0.63
361_F	385_S	1.930	0.62
96_V	109_S	1.927	0.62
300_V	502_N	1.911	0.61
424_I	433_G	1.907	0.61
354_D	395_S	1.880	0.60
151_L	201_A	1.880	0.60
190_P	519_L	1.869	0.60
233_L	237_L	1.866	0.60
114_K	583_E	1.865	0.59
316_M	556_Y	1.861	0.59
582_R	585_D	1.857	0.59
290_N	294_A	1.856	0.59
306_W	457_D	1.851	0.59
306_W	437_H	1.839	0.58
231_A	526_E	1.835	0.58
256_L	395_S	1.831	0.58
320_L	341_P	1.811	0.57
256_L	361_F	1.809	0.57
306_W	458_M	1.785	0.56
113_E	138_L	1.762	0.55
163_D	542_I	1.709	0.53
366_V	392_L	1.697	0.52
211_R	511_P	1.695	0.52
120_P	480_I	1.686	0.52
369_Q	437_H	1.674	0.51
481_Y	503_G	1.673	0.51
92_D	95_P	1.662	0.51
324_L	438_I	1.660	0.50
111_D	249_I	1.659	0.50
284_F	477_G	1.659	0.50
300_V	397_G	1.649	0.50
294_A	616_N	1.635	0.49
97_T	511_P	1.632	0.49
230_N	237_L	1.620	0.49
240_E	244_K	1.619	0.49
421_R	457_D	1.611	0.48
363_L	536_V	1.606	0.48
307_H	456_Y	1.599	0.48
151_L	447_L	1.598	0.48
472_A	487_P	1.596	0.48
307_H	545_F	1.584	0.47
428_P	437_H	1.584	0.47
102_E	105_Y	1.574	0.47
198_I	451_I	1.552	0.46
133_Y	339_P	1.548	0.45
421_R	458_M	1.545	0.45
96_V	108_K	1.541	0.45
87_N	90_A	1.536	0.45
233_L	408_P	1.535	0.45
447_L	475_F	1.524	0.44
403_C	423_S	1.512	0.44
441_N	478_G	1.500	0.43
241_N	354_D	1.487	0.43
125_P	428_P	1.481	0.42
475_F	603_E	1.477	0.42
297_S	611_V	1.473	0.42
306_W	421_R	1.464	0.42
123_L	406_M	1.461	0.42
114_K	585_D	1.450	0.41
310_N	368_N	1.448	0.41
364_V	442_A	1.446	0.41
602_R	627_L	1.445	0.41
320_L	323_S	1.443	0.41
102_E	393_Q	1.440	0.41
262_D	306_W	1.435	0.40
414_Y	420_M	1.431	0.40
313_W	437_H	1.421	0.40
502_N	565_Y	1.415	0.40
444_N	593_P	1.407	0.39
150_T	517_D	1.405	0.39
228_S	469_H	1.395	0.39
167_L	556_Y	1.392	0.39
427_V	433_G	1.378	0.38
185_G	196_N	1.374	0.38
405_S	420_M	1.373	0.38
578_N	611_V	1.368	0.38
138_L	190_P	1.368	0.38
463_D	488_E	1.368	0.38
400_V	417_S	1.363	0.37
265_W	473_R	1.362	0.37
97_T	104_K	1.359	0.37
228_S	490_T	1.359	0.37
351_K	491_N	1.354	0.37
309_I	372_I	1.349	0.37
217_P	231_A	1.348	0.37
187_S	192_K	1.338	0.36
103_L	106_D	1.336	0.36
494_L	605_I	1.336	0.36
329_Y	332_N	1.336	0.36
309_I	346_A	1.331	0.36
85_Y	108_K	1.331	0.36
471_V	545_F	1.328	0.36
194_I	449_S	1.328	0.36
129_N	569_S	1.325	0.36
480_I	553_E	1.323	0.36
229_W	457_D	1.323	0.36
305_L	424_I	1.322	0.36
365_K	457_D	1.318	0.36
308_A	456_Y	1.316	0.35
268_Q	586_A	1.316	0.35
367_D	457_D	1.306	0.35
365_K	425_D	1.302	0.35
134_T	138_L	1.300	0.35
453_Y	480_I	1.292	0.34
260_I	358_L	1.289	0.34
367_D	458_M	1.288	0.34
404_M	437_H	1.287	0.34
265_W	424_I	1.286	0.34
264_G	274_I	1.284	0.34
150_T	160_L	1.281	0.34
456_Y	460_M	1.280	0.34
139_V	309_I	1.267	0.33
397_G	422_N	1.265	0.33
120_P	123_L	1.264	0.33
367_D	455_D	1.264	0.33
405_S	426_Y	1.259	0.33
95_P	556_Y	1.259	0.33
365_K	458_M	1.253	0.33
147_A	480_I	1.251	0.33
190_P	354_D	1.251	0.33
229_W	458_M	1.250	0.33
305_L	361_F	1.249	0.33
506_I	591_T	1.249	0.33
398_K	442_A	1.249	0.33
341_P	447_L	1.236	0.32
527_R	611_V	1.235	0.32
613_V	641_E	1.229	0.32
324_L	627_L	1.227	0.32
140_K	268_Q	1.225	0.32
229_W	437_H	1.221	0.32
227_C	457_D	1.220	0.32
403_C	428_P	1.219	0.32
295_I	352_A	1.218	0.32
187_S	500_L	1.217	0.31
239_E	309_I	1.204	0.31
226_W	230_N	1.203	0.31
557_N	613_V	1.198	0.31
98_E	104_K	1.196	0.31
306_W	365_K	1.189	0.30
146_E	277_L	1.187	0.30
84_T	97_T	1.187	0.30
313_W	367_D	1.187	0.30
122_W	263_D	1.185	0.30
400_V	581_L	1.182	0.30
471_V	543_A	1.181	0.30
393_Q	483_T	1.176	0.30
306_W	367_D	1.175	0.30
230_N	456_Y	1.175	0.30
98_E	102_E	1.172	0.30
247_K	251_E	1.172	0.30
129_N	292_V	1.169	0.30
169_T	316_M	1.168	0.30
477_G	545_F	1.164	0.29
230_N	233_L	1.158	0.29
84_T	108_K	1.152	0.29
539_Y	544_F	1.151	0.29
268_Q	443_Y	1.150	0.29
359_R	640_R	1.147	0.29
158_A	244_K	1.145	0.29
633_E	638_K	1.145	0.29
177_K	611_V	1.141	0.29
152_S	587_E	1.133	0.28
194_I	450_H	1.132	0.28
227_C	458_M	1.129	0.28
178_R	569_S	1.128	0.28
254_L	566_K	1.126	0.28
151_L	468_V	1.126	0.28
287_G	479_P	1.125	0.28
611_V	617_V	1.124	0.28
359_R	564_Y	1.123	0.28
193_A	291_T	1.117	0.28
292_V	296_K	1.114	0.28
408_P	412_C	1.112	0.28
349_F	485_R	1.106	0.27
302_Y	316_M	1.106	0.27
98_E	107_I	1.105	0.27
145_Y	520_F	1.104	0.27
289_K	493_E	1.103	0.27
575_G	578_N	1.103	0.27
367_D	404_M	1.102	0.27
512_A	519_L	1.100	0.27
424_I	427_V	1.100	0.27
260_I	411_Y	1.097	0.27
178_R	348_G	1.093	0.27
221_M	419_V	1.093	0.27
599_I	602_R	1.092	0.27
427_V	465_Y	1.090	0.27
266_Q	454_P	1.086	0.27
532_L	595_S	1.086	0.27
236_D	244_K	1.084	0.27
559_N	619_I	1.082	0.27
284_F	287_G	1.079	0.26
563_Y	592_F	1.075	0.26
122_W	125_P	1.074	0.26
267_D	372_I	1.071	0.26
442_A	456_Y	1.070	0.26
92_D	579_V	1.062	0.26
209_K	577_F	1.061	0.26
202_S	213_E	1.060	0.26
241_N	395_S	1.057	0.26
249_I	487_P	1.052	0.25
284_F	307_H	1.051	0.25
283_K	307_H	1.050	0.25
280_D	283_K	1.049	0.25
227_C	306_W	1.046	0.25
230_N	245_V	1.043	0.25
118_T	121_C	1.040	0.25
363_L	472_A	1.040	0.25
306_W	313_W	1.037	0.25
87_N	92_D	1.033	0.25
150_T	264_G	1.032	0.25
590_I	618_V	1.030	0.25
367_D	421_R	1.030	0.25
411_Y	423_S	1.028	0.25
95_P	103_L	1.028	0.25
103_L	142_G	1.025	0.25
180_Y	587_E	1.023	0.25
114_K	478_G	1.021	0.24
206_F	563_Y	1.019	0.24
421_R	581_L	1.019	0.24
407_N	461_S	1.016	0.24
437_H	457_D	1.014	0.24
393_Q	410_N	1.012	0.24
267_D	620_P	1.012	0.24
175_E	329_Y	1.011	0.24
249_I	255_R	1.010	0.24
354_D	456_Y	1.007	0.24
227_C	423_S	1.007	0.24
325_N	621_K	1.005	0.24
216_F	453_Y	1.005	0.24
593_P	624_G	1.005	0.24
239_E	243_I	1.005	0.24
433_G	524_L	1.005	0.24
231_A	283_K	1.002	0.24
265_W	456_Y	0.999	0.24
350_Y	477_G	0.998	0.24
567_V	584_L	0.997	0.24
151_L	579_V	0.995	0.24
92_D	104_K	0.995	0.24
169_T	177_K	0.992	0.23
112_H	131_P	0.991	0.23
148_F	292_V	0.989	0.23
420_M	426_Y	0.989	0.23
158_A	289_K	0.985	0.23
491_N	601_L	0.984	0.23
87_N	580_K	0.984	0.23
284_F	350_Y	0.981	0.23
153_N	160_L	0.978	0.23
369_Q	423_S	0.975	0.23
97_T	100_P	0.975	0.23
460_M	490_T	0.975	0.23
91_I	100_P	0.975	0.23
495_L	549_S	0.975	0.23
345_D	589_V	0.974	0.23
455_D	458_M	0.973	0.23
143_N	285_P	0.972	0.23
98_E	101_K	0.971	0.23
124_Y	398_K	0.971	0.23
96_V	259_V	0.971	0.23
496_R	570_G	0.970	0.23
544_F	610_T	0.970	0.23
391_A	543_A	0.969	0.23
253_G	342_N	0.969	0.23
425_D	457_D	0.967	0.23
360_D	479_P	0.967	0.23
233_L	483_T	0.966	0.23
232_F	241_N	0.966	0.23
369_Q	403_C	0.964	0.23
475_F	537_K	0.964	0.23
229_W	262_D	0.963	0.23
310_N	372_I	0.963	0.23
358_L	557_N	0.963	0.23
184_I	581_L	0.963	0.23
577_F	589_V	0.963	0.23
121_C	135_V	0.962	0.23
245_V	353_F	0.961	0.23
285_P	405_S	0.958	0.22
366_V	406_M	0.956	0.22
228_S	471_V	0.955	0.22
198_I	406_M	0.954	0.22
441_N	476_S	0.951	0.22
260_I	423_S	0.951	0.22
183_S	547_L	0.950	0.22
539_Y	592_F	0.950	0.22
563_Y	572_F	0.949	0.22
225_G	439_M	0.949	0.22
465_Y	482_I	0.948	0.22
355_G	611_V	0.947	0.22
135_V	230_N	0.947	0.22
288_F	359_R	0.945	0.22
266_Q	434_T	0.945	0.22
471_V	586_A	0.944	0.22
130_I	446_L	0.944	0.22
202_S	305_L	0.943	0.22
570_G	579_V	0.942	0.22
437_H	458_M	0.942	0.22
365_K	421_R	0.941	0.22
388_I	490_T	0.940	0.22
493_E	582_R	0.938	0.22
91_I	95_P	0.938	0.22
217_P	226_W	0.937	0.22
312_H	627_L	0.935	0.22
227_C	263_D	0.935	0.22
318_Q	401_I	0.934	0.22
267_D	531_K	0.928	0.21
438_I	556_Y	0.928	0.21
96_V	106_D	0.926	0.21
420_M	452_V	0.925	0.21
263_D	367_D	0.924	0.21
558_N	562_Y	0.923	0.21
432_D	619_I	0.922	0.21
94_E	97_T	0.922	0.21
264_G	283_K	0.921	0.21
437_H	455_D	0.921	0.21
265_W	530_L	0.920	0.21
231_A	385_S	0.919	0.21
130_I	240_E	0.919	0.21
229_W	421_R	0.918	0.21
115_Y	123_L	0.918	0.21
231_A	303_V	0.916	0.21
228_S	258_W	0.913	0.21
313_W	457_D	0.913	0.21
395_S	634_L	0.913	0.21
254_L	371_V	0.909	0.21
124_Y	605_I	0.908	0.21
425_D	458_M	0.908	0.21
500_L	522_D	0.908	0.21
341_P	406_M	0.907	0.21
203_K	289_K	0.907	0.21
438_I	512_A	0.902	0.21
179_S	637_V	0.900	0.21
230_N	408_P	0.899	0.21
468_V	497_M	0.897	0.21
346_A	447_L	0.894	0.20
414_Y	472_A	0.892	0.20
313_W	458_M	0.892	0.20
92_D	108_K	0.891	0.20
329_Y	516_E	0.891	0.20
236_D	563_Y	0.890	0.20
199_N	480_I	0.888	0.20
323_S	352_A	0.888	0.20
228_S	459_F	0.886	0.20
194_I	375_I	0.886	0.20
424_I	434_T	0.885	0.20
187_S	495_L	0.885	0.20
284_F	545_F	0.884	0.20
325_N	579_V	0.883	0.20
493_E	567_V	0.883	0.20
254_L	479_P	0.883	0.20
346_A	420_M	0.882	0.20
361_F	611_V	0.881	0.20
360_D	413_N	0.881	0.20
370_W	478_G	0.877	0.20
313_W	455_D	0.876	0.20
148_F	286_N	0.876	0.20
225_G	363_L	0.875	0.20
175_E	582_R	0.873	0.20
181_F	282_K	0.872	0.20
160_L	322_K	0.872	0.20
210_L	213_E	0.871	0.20
226_W	258_W	0.869	0.20
272_R	440_F	0.867	0.20
619_I	632_T	0.866	0.20
623_D	640_R	0.862	0.20
169_T	309_I	0.860	0.20
398_K	475_F	0.859	0.19
443_Y	609_F	0.858	0.19
306_W	455_D	0.855	0.19
489_R	553_E	0.855	0.19
412_C	464_P	0.854	0.19
309_I	316_M	0.853	0.19
307_H	477_G	0.851	0.19
125_P	285_P	0.850	0.19
354_D	483_T	0.850	0.19
275_R	319_E	0.850	0.19
293_R	470_L	0.847	0.19
95_P	489_R	0.845	0.19
456_Y	534_G	0.843	0.19
206_F	485_R	0.841	0.19
408_P	483_T	0.841	0.19
456_Y	473_R	0.837	0.19
122_W	313_W	0.835	0.19
282_K	292_V	0.835	0.19
97_T	160_L	0.833	0.19
306_W	425_D	0.832	0.19
260_I	627_L	0.831	0.19
277_L	478_G	0.831	0.19
472_A	477_G	0.831	0.19
99_P	105_Y	0.830	0.19
108_K	596_N	0.828	0.19
372_I	406_M	0.828	0.19
264_G	268_Q	0.828	0.19
227_C	403_C	0.828	0.19
130_I	133_Y	0.826	0.19
303_V	377_D	0.825	0.19
268_Q	495_L	0.823	0.18
92_D	97_T	0.822	0.18
404_M	457_D	0.822	0.18
467_K	497_M	0.821	0.18
392_L	400_V	0.820	0.18
422_N	461_S	0.818	0.18
267_D	569_S	0.816	0.18
473_R	530_L	0.813	0.18
125_P	620_P	0.812	0.18
227_C	421_R	0.811	0.18
131_P	257_N	0.811	0.18
357_I	424_I	0.810	0.18
350_Y	460_M	0.809	0.18
158_A	406_M	0.808	0.18
249_I	546_N	0.807	0.18
432_D	542_I	0.806	0.18
284_F	484_D	0.805	0.18
577_F	580_K	0.804	0.18
307_H	601_L	0.804	0.18
190_P	480_I	0.804	0.18
151_L	309_I	0.804	0.18
265_W	469_H	0.804	0.18
265_W	426_Y	0.804	0.18
209_K	579_V	0.803	0.18
152_S	504_E	0.803	0.18
259_V	509_D	0.802	0.18
181_F	194_I	0.802	0.18
456_Y	545_F	0.802	0.18
466_A	491_N	0.802	0.18
294_A	619_I	0.801	0.18
404_M	458_M	0.799	0.18
239_E	286_N	0.799	0.18
305_L	434_T	0.799	0.18
310_N	340_S	0.795	0.18
191_Y	354_D	0.795	0.18
568_F	585_D	0.794	0.18
374_A	384_A	0.792	0.18
209_K	599_I	0.791	0.18
296_K	345_D	0.790	0.18
498_A	508_V	0.789	0.18
283_K	520_F	0.789	0.18
404_M	455_D	0.789	0.18
423_S	481_Y	0.787	0.18
456_Y	463_D	0.785	0.17
363_L	634_L	0.785	0.17
287_G	478_G	0.784	0.17
579_V	625_T	0.784	0.17
531_K	593_P	0.782	0.17
277_L	505_V	0.781	0.17
106_D	589_V	0.779	0.17
277_L	311_A	0.776	0.17
469_H	601_L	0.776	0.17
220_V	515_T	0.776	0.17
146_E	575_G	0.775	0.17
95_P	100_P	0.773	0.17
369_Q	405_S	0.773	0.17
357_I	456_Y	0.772	0.17
123_L	408_P	0.772	0.17
216_F	221_M	0.772	0.17
405_S	588_V	0.772	0.17
308_A	459_F	0.770	0.17
259_V	599_I	0.770	0.17
408_P	447_L	0.769	0.17
436_L	440_F	0.768	0.17
90_A	105_Y	0.766	0.17
568_F	587_E	0.765	0.17
464_P	602_R	0.765	0.17
162_G	349_F	0.762	0.17
474_V	605_I	0.762	0.17
289_K	325_N	0.759	0.17
234_T	317_S	0.756	0.17
288_F	361_F	0.754	0.17
295_I	494_L	0.753	0.17
164_S	542_I	0.752	0.17
497_M	605_I	0.752	0.17
441_N	461_S	0.751	0.17
187_S	193_A	0.749	0.17
104_K	142_G	0.747	0.17
542_I	616_N	0.747	0.17
362_D	411_Y	0.746	0.16
262_D	365_K	0.744	0.16
234_T	408_P	0.743	0.16
246_V	298_L	0.741	0.16
358_L	398_K	0.741	0.16
148_F	289_K	0.741	0.16
125_P	436_L	0.741	0.16
283_K	506_I	0.739	0.16
560_E	611_V	0.738	0.16
224_L	304_G	0.735	0.16
550_G	557_N	0.735	0.16
408_P	433_G	0.733	0.16
248_G	544_F	0.733	0.16
122_W	473_R	0.730	0.16
123_L	487_P	0.728	0.16
157_T	230_N	0.728	0.16
503_G	593_P	0.727	0.16
483_T	622_A	0.726	0.16
201_A	637_V	0.725	0.16
436_L	476_S	0.722	0.16
465_Y	584_L	0.722	0.16
245_V	252_R	0.722	0.16
89_L	104_K	0.721	0.16
477_G	481_Y	0.719	0.16
294_A	618_V	0.718	0.16
339_P	606_L	0.718	0.16
546_N	593_P	0.717	0.16
245_V	460_M	0.716	0.16
433_G	451_I	0.714	0.16
238_N	403_C	0.709	0.16
447_L	493_E	0.709	0.16
229_W	365_K	0.709	0.16
427_V	434_T	0.707	0.16
148_F	327_N	0.706	0.16
267_D	292_V	0.706	0.16
122_W	404_M	0.704	0.15
539_Y	577_F	0.703	0.15
260_I	304_G	0.702	0.15
388_I	494_L	0.702	0.15
602_R	611_V	0.701	0.15
284_F	456_Y	0.699	0.15
148_F	351_K	0.699	0.15
462_Y	588_V	0.699	0.15
324_L	529_L	0.698	0.15
535_K	556_Y	0.697	0.15
421_R	455_D	0.696	0.15
84_T	94_E	0.694	0.15
97_T	169_T	0.693	0.15
89_L	579_V	0.693	0.15
183_S	200_I	0.692	0.15
501_P	530_L	0.689	0.15
151_L	525_R	0.689	0.15
262_D	367_D	0.688	0.15
167_L	325_N	0.687	0.15
169_T	181_F	0.685	0.15
420_M	434_T	0.683	0.15
229_W	367_D	0.681	0.15
262_D	437_H	0.680	0.15
531_K	534_G	0.679	0.15
395_S	549_S	0.679	0.15
192_K	359_R	0.678	0.15
403_C	417_S	0.677	0.15
232_F	314_G	0.677	0.15
249_I	479_P	0.674	0.15
277_L	588_V	0.673	0.15
399_D	626_L	0.673	0.15
306_W	404_M	0.673	0.15
456_Y	608_P	0.668	0.15
208_F	214_K	0.667	0.15
227_C	367_D	0.664	0.15
388_I	405_S	0.664	0.15
274_I	474_V	0.663	0.15
422_N	604_Y	0.663	0.15
347_I	394_Y	0.662	0.15
357_I	428_P	0.661	0.14
220_V	635_N	0.661	0.14
150_T	170_G	0.661	0.14
166_R	194_I	0.660	0.14
361_F	424_I	0.657	0.14
403_C	457_D	0.657	0.14
282_K	561_D	0.654	0.14
405_S	414_Y	0.654	0.14
184_I	289_K	0.653	0.14
163_D	496_R	0.653	0.14
183_S	197_A	0.651	0.14
487_P	511_P	0.651	0.14
363_L	606_L	0.650	0.14
319_E	495_L	0.650	0.14
361_F	420_M	0.649	0.14
225_G	231_A	0.649	0.14
190_P	395_S	0.648	0.14
191_Y	449_S	0.648	0.14
341_P	388_I	0.648	0.14
418_N	543_A	0.647	0.14
263_D	457_D	0.647	0.14
199_N	621_K	0.646	0.14
118_T	420_M	0.645	0.14
364_V	543_A	0.644	0.14
405_S	487_P	0.643	0.14
246_V	251_E	0.643	0.14
516_E	629_V	0.643	0.14
84_T	91_I	0.642	0.14
133_Y	384_A	0.641	0.14
312_H	428_P	0.641	0.14
181_F	491_N	0.639	0.14
426_Y	434_T	0.638	0.14
130_I	137_A	0.636	0.14
228_S	312_H	0.636	0.14
142_G	580_K	0.635	0.14
312_H	421_R	0.634	0.14
259_V	499_V	0.633	0.14
313_W	421_R	0.632	0.14
292_V	633_E	0.632	0.14
454_P	469_H	0.631	0.14
95_P	361_F	0.631	0.14
423_S	479_P	0.630	0.14
306_W	403_C	0.630	0.14
96_V	387_N	0.629	0.14
534_G	558_N	0.628	0.14
446_L	619_I	0.628	0.14
317_S	452_V	0.626	0.14
408_P	428_P	0.625	0.14
289_K	582_R	0.624	0.14
259_V	417_S	0.623	0.14
295_I	586_A	0.623	0.14
138_L	510_E	0.622	0.14
461_S	609_F	0.622	0.14
341_P	402_N	0.621	0.14
522_D	526_E	0.621	0.14
372_I	491_N	0.620	0.14
263_D	455_D	0.619	0.14
288_F	545_F	0.619	0.14
200_I	338_V	0.619	0.14
403_C	452_V	0.619	0.14
263_D	458_M	0.618	0.14
108_K	571_E	0.618	0.14
238_N	434_T	0.618	0.14
410_N	417_S	0.616	0.14
410_N	514_I	0.615	0.14
360_D	365_K	0.615	0.14
442_A	476_S	0.613	0.13
441_N	473_R	0.613	0.13
162_G	534_G	0.610	0.13
402_N	405_S	0.609	0.13
186_T	569_S	0.608	0.13
95_P	615_D	0.608	0.13
140_K	526_E	0.608	0.13
143_N	558_N	0.607	0.13
155_Y	293_R	0.607	0.13
217_P	283_K	0.606	0.13
304_G	608_P	0.605	0.13
246_V	487_P	0.604	0.13
350_Y	472_A	0.603	0.13
228_S	252_R	0.602	0.13
125_P	403_C	0.601	0.13
336_S	476_S	0.600	0.13
321_M	324_L	0.600	0.13
421_R	437_H	0.599	0.13
403_C	410_N	0.599	0.13
154_N	247_K	0.599	0.13
167_L	206_F	0.598	0.13
122_W	265_W	0.598	0.13
350_Y	412_C	0.597	0.13
402_N	468_V	0.597	0.13
122_W	367_D	0.596	0.13
121_C	230_N	0.596	0.13
631_D	634_L	0.595	0.13
187_S	318_Q	0.594	0.13
206_F	572_F	0.594	0.13
245_V	368_N	0.592	0.13
344_E	611_V	0.591	0.13
632_T	636_E	0.590	0.13
167_L	293_R	0.590	0.13
502_N	594_K	0.589	0.13
167_L	332_N	0.586	0.13
125_P	423_S	0.585	0.13
227_C	365_K	0.584	0.13
328_G	331_T	0.584	0.13
421_R	425_D	0.583	0.13
252_R	490_T	0.582	0.13
596_N	636_E	0.582	0.13
162_G	554_E	0.581	0.13
316_M	489_R	0.580	0.13
541_A	622_A	0.579	0.13
245_V	454_P	0.579	0.13
233_L	517_D	0.578	0.13
95_P	109_S	0.577	0.13
260_I	447_L	0.577	0.13
169_T	615_D	0.577	0.13
289_K	293_R	0.577	0.13
101_K	161_F	0.576	0.13
262_D	455_D	0.576	0.13
262_D	425_D	0.576	0.13
266_Q	309_I	0.574	0.13
270_N	283_K	0.574	0.13
542_I	594_K	0.573	0.13
114_K	118_T	0.572	0.13
156_V	517_D	0.571	0.13
441_N	469_H	0.568	0.13
224_L	363_L	0.568	0.13
196_N	555_E	0.566	0.13
119_Y	370_W	0.566	0.13
468_V	610_T	0.564	0.12
413_N	611_V	0.563	0.12
85_Y	106_D	0.563	0.12
241_N	533_K	0.562	0.12
259_V	375_I	0.562	0.12
304_G	498_A	0.562	0.12
286_N	290_N	0.562	0.12
88_Q	91_I	0.561	0.12
265_W	364_V	0.561	0.12
319_E	635_N	0.560	0.12
256_L	515_T	0.560	0.12
105_Y	363_L	0.559	0.12
145_Y	149_F	0.559	0.12
407_N	497_M	0.558	0.12
288_F	296_K	0.558	0.12
209_K	574_V	0.555	0.12
312_H	457_D	0.555	0.12
228_S	360_D	0.554	0.12
125_P	481_Y	0.553	0.12
327_N	344_E	0.553	0.12
160_L	579_V	0.552	0.12
86_Y	89_L	0.551	0.12
233_L	264_G	0.551	0.12
201_A	291_T	0.551	0.12
188_D	197_A	0.551	0.12
95_P	611_V	0.550	0.12
189_N	204_E	0.550	0.12
445_S	626_L	0.549	0.12
188_D	566_K	0.549	0.12
493_E	571_E	0.548	0.12
403_C	458_M	0.548	0.12
88_Q	105_Y	0.548	0.12
277_L	317_S	0.547	0.12
214_K	526_E	0.547	0.12
106_D	272_R	0.546	0.12
335_N	585_D	0.546	0.12
92_D	188_D	0.545	0.12
390_I	562_Y	0.542	0.12
125_P	288_F	0.542	0.12
264_G	498_A	0.541	0.12
135_V	217_P	0.540	0.12
237_L	456_Y	0.540	0.12
433_G	447_L	0.539	0.12
146_E	578_N	0.538	0.12
424_I	463_D	0.536	0.12
404_M	421_R	0.535	0.12
149_F	545_F	0.533	0.12
88_Q	92_D	0.533	0.12
477_G	608_P	0.532	0.12
186_T	571_E	0.531	0.12
252_R	406_M	0.531	0.12
350_Y	388_I	0.530	0.12
243_I	294_A	0.529	0.12
151_L	618_V	0.529	0.12
559_N	575_G	0.529	0.12
395_S	515_T	0.529	0.12
319_E	564_Y	0.528	0.12
166_R	570_G	0.528	0.12
128_N	194_I	0.526	0.12
303_V	542_I	0.525	0.12
116_I	126_V	0.524	0.12
160_L	626_L	0.523	0.12
366_V	474_V	0.521	0.12
143_N	321_M	0.520	0.12
115_Y	125_P	0.520	0.12
97_T	105_Y	0.519	0.12
443_Y	614_S	0.519	0.12
187_S	297_S	0.519	0.12
242_L	392_L	0.519	0.12
254_L	478_G	0.518	0.12
215_G	259_V	0.518	0.12
301_K	438_I	0.518	0.12
556_Y	589_V	0.517	0.12
595_S	619_I	0.517	0.12
137_A	592_F	0.517	0.12
270_N	280_D	0.517	0.12
454_P	471_V	0.515	0.12
295_I	627_L	0.515	0.12
582_R	611_V	0.514	0.12
306_W	312_H	0.513	0.12
407_N	410_N	0.512	0.11
117_R	546_N	0.512	0.11
184_I	573_G	0.512	0.11
174_D	397_G	0.511	0.11
272_R	480_I	0.511	0.11
99_P	104_K	0.510	0.11
288_F	428_P	0.510	0.11
97_T	106_D	0.510	0.11
163_D	178_R	0.509	0.11
424_I	566_K	0.509	0.11
150_T	406_M	0.508	0.11
376_Y	426_Y	0.507	0.11
408_P	441_N	0.507	0.11
518_L	542_I	0.507	0.11
576_K	599_I	0.505	0.11
246_V	560_E	0.504	0.11
165_V	172_N	0.504	0.11
263_D	313_W	0.504	0.11
334_L	398_K	0.504	0.11
164_S	236_D	0.503	0.11
84_T	101_K	0.503	0.11
244_K	286_N	0.503	0.11
148_F	636_E	0.503	0.11
116_I	523_P	0.502	0.11
223_G	257_N	0.502	0.11
154_N	168_Y	0.501	0.11
263_D	306_W	0.500	0.11
201_A	212_K	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3cc1A	4	0.5602	100	0.793	Contact Map
4nzfA	5	0.5679	100	0.802	Contact Map
3a21A	2	0.6188	100	0.812	Contact Map
1uasA	1	0.5185	100	0.822	Contact Map
3hg3A	2	0.5262	100	0.825	Contact Map
4nzjA	2	0.6512	100	0.826	Contact Map
3lrkA	3	0.5895	100	0.826	Contact Map
3a5vA	3	0.534	100	0.834	Contact Map
1sznA	1	0.5463	100	0.844	Contact Map
1zy9A	1	0.7315	100	0.854	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0153 seconds.