Q97U12 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q97U12 - tRNA(Met) cytidine acetyltransferase TmcA

UniProt:	Q97U12	Sequences: MVNKEQFYDQIRKALEDGNTRYYRNLIYIERDDYFDHVKEIISLFLNFKSNPSVAYGFVPWASGSKERMRTIKEYFSKFDDIDYANAEYYLGNTYDLVILDTVDNFQPINIGRLVDLARGGGLIIIYTNNLIKDKTFRTSIMRNGLILDEYEKRFKRKLYEHEGIFIIDVNEYIPKPFSGNTMPKAEKKVPRNPLMPKEIHELSLSEDQNRVIESFTYLLSGGQRALVLTAARGRGKSAATGLSIAGLIEKLRERKEKSIRIIVTAPSIASASQVMSFAKLGLEALGEELSVKVSDTGHIKSLRGDYFKLEYVPPDAAIEDEGELLIIDEAAALGINYIDLALRAWKKVALVTTVHGYEGSNKAFLRYLRRLIESKRIRVKWVNMEQPLRYAKGDPIEKWLYDALLLDAEPSEPQYLNDTMIYEDVDKSELANDDNRLRAIYGIMVTAHYKNNPDDLMIMLDGIHHKIKAIRIGENSYIAACQIAEEGELSDNMVDIALKGGTFDGDLIPDRIIKHVRIKDFAKLRGWRIVRIAVAPELQDKGFGSELLKMIYEEARDKGVDWVGSSFMSDQKVLNFWIKNGFIPVHISPKKNEKLGDYPVVVIRPISDIATKIVKISAYMLKEKLLNTLHDVYFNMNPEVVRLMLTSTKIVSKTINVSPIILDKTISFLQGVSPYESSADGIHMLTLKYFWDGERDWSLTQDEELVLIAKVLQGKPWSYVSTVLSSNRTHIYELIYSAISKLMKKYYNLTADSKVGLTLKDVMNSQQYD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	770 (663)
Sequences:	717 (487)
Seq/√Len:	18.9

ECOLI - TMCA
HALSA - Q9HQH9
SULSO - Q97U12 Q980C5

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
553_Y	605_R	8.373	1.00
566_S	603_V	8.242	1.00
213_I	240_A	7.722	1.00
471_I	544_F	6.876	1.00
480_A	535_V	6.109	1.00
509_I	565_G	5.287	1.00
549_L	581_N	4.984	1.00
549_L	583_F	4.567	1.00
106_F	111_I	4.498	1.00
546_S	581_N	4.403	1.00
530_I	549_L	4.181	1.00
710_A	721_V	4.063	1.00
486_E	528_W	3.955	1.00
264_V	275_V	3.679	1.00
279_A	310_L	3.551	1.00
586_V	604_I	3.314	1.00
553_Y	583_F	3.183	0.99
569_M	574_V	3.179	0.99
272_A	275_V	3.071	0.99
509_I	602_V	3.049	0.99
445_M	481_A	3.040	0.99
569_M	598_D	3.020	0.99
527_G	563_W	2.955	0.99
96_D	119_R	2.935	0.99
154_R	435_D	2.900	0.99
626_L	645_M	2.895	0.99
326_L	346_W	2.866	0.99
245_I	327_I	2.854	0.99
267_P	333_A	2.845	0.99
239_A	278_F	2.830	0.99
482_C	552_I	2.814	0.99
53_S	56_Y	2.787	0.98
424_E	472_R	2.767	0.98
482_C	548_L	2.759	0.98
204_S	213_I	2.731	0.98
53_S	58_F	2.682	0.98
621_M	665_K	2.676	0.98
60_P	64_G	2.597	0.97
585_P	601_V	2.504	0.97
441_I	468_I	2.498	0.97
537_P	540_Q	2.489	0.97
508_L	567_S	2.477	0.97
716_K	724_V	2.433	0.96
497_I	502_G	2.424	0.96
513_I	586_V	2.410	0.96
421_M	544_F	2.402	0.96
363_K	569_M	2.397	0.96
441_I	478_Y	2.336	0.95
441_I	460_M	2.292	0.95
212_V	229_L	2.276	0.94
512_R	587_H	2.218	0.94
710_A	724_V	2.207	0.94
630_L	642_V	2.112	0.92
528_W	561_V	2.109	0.92
408_D	439_R	2.108	0.92
109_I	455_D	2.092	0.92
562_D	608_S	2.076	0.91
53_S	60_P	2.067	0.91
177_P	181_N	2.061	0.91
266_A	312_Y	2.046	0.91
708_L	732_I	2.045	0.91
584_I	619_A	2.039	0.90
441_I	481_A	2.033	0.90
431_L	434_D	2.006	0.90
710_A	716_K	2.001	0.90
721_V	732_I	1.993	0.89
351_L	368_Y	1.972	0.89
106_F	440_A	1.969	0.89
222_G	225_R	1.966	0.89
112_G	405_L	1.955	0.88
58_F	64_G	1.951	0.88
139_T	458_M	1.951	0.88
519_I	618_S	1.931	0.88
328_I	351_L	1.929	0.88
423_Y	467_K	1.917	0.87
711_K	718_W	1.892	0.87
94_T	120_G	1.891	0.87
676_Y	718_W	1.858	0.86
213_I	243_L	1.856	0.86
56_Y	59_V	1.851	0.85
325_L	350_A	1.841	0.85
466_H	483_Q	1.833	0.85
243_L	282_G	1.818	0.84
326_L	342_A	1.791	0.83
512_R	602_V	1.769	0.83
709_I	713_L	1.758	0.82
150_E	429_S	1.728	0.81
471_I	480_A	1.714	0.81
479_I	544_F	1.706	0.80
363_K	368_Y	1.680	0.79
53_S	69_M	1.669	0.79
409_A	443_G	1.666	0.79
219_L	227_L	1.665	0.79
213_I	692_W	1.646	0.78
228_V	369_L	1.628	0.77
449_H	532_R	1.628	0.77
407_L	575_L	1.626	0.77
216_F	227_L	1.620	0.77
100_L	120_G	1.614	0.76
71_T	75_Y	1.610	0.76
451_K	595_K	1.593	0.75
478_Y	648_S	1.577	0.75
729_R	737_Y	1.564	0.74
59_V	65_S	1.556	0.74
229_L	383_V	1.555	0.74
53_S	57_G	1.539	0.73
245_I	275_V	1.533	0.72
264_V	536_A	1.533	0.72
707_V	725_L	1.529	0.72
101_D	451_K	1.525	0.72
129_N	134_D	1.522	0.72
728_N	731_H	1.517	0.72
227_L	325_L	1.517	0.72
323_G	733_Y	1.509	0.71
624_E	662_I	1.508	0.71
622_L	626_L	1.504	0.71
111_I	401_L	1.503	0.71
334_L	708_L	1.492	0.70
244_S	325_L	1.490	0.70
152_E	230_T	1.485	0.70
353_T	365_F	1.484	0.70
115_V	401_L	1.480	0.70
216_F	225_R	1.476	0.70
446_V	585_P	1.468	0.69
154_R	565_G	1.466	0.69
440_A	477_S	1.463	0.69
53_S	64_G	1.454	0.68
480_A	548_L	1.448	0.68
339_I	368_Y	1.436	0.67
54_V	64_G	1.433	0.67
527_G	565_G	1.433	0.67
437_R	472_R	1.433	0.67
588_I	678_S	1.433	0.67
327_I	460_M	1.427	0.67
241_T	352_V	1.424	0.67
530_I	581_N	1.423	0.67
239_A	274_Q	1.421	0.66
229_L	588_I	1.419	0.66
326_L	349_V	1.416	0.66
589_S	593_N	1.411	0.66
267_P	334_L	1.410	0.66
451_K	593_N	1.407	0.66
363_K	574_V	1.406	0.66
65_S	69_M	1.399	0.65
87_A	113_R	1.399	0.65
63_S	68_R	1.398	0.65
392_A	396_P	1.385	0.64
676_Y	711_K	1.375	0.64
336_I	368_Y	1.372	0.64
437_R	478_Y	1.368	0.63
71_T	77_S	1.368	0.63
59_V	64_G	1.366	0.63
444_I	540_Q	1.352	0.63
62_A	70_R	1.348	0.62
266_A	355_V	1.340	0.62
431_L	461_L	1.337	0.62
70_R	564_V	1.336	0.62
334_L	361_S	1.328	0.61
107_Q	455_D	1.328	0.61
469_K	555_E	1.327	0.61
562_D	673_V	1.325	0.61
444_I	508_L	1.323	0.61
60_P	68_R	1.315	0.60
154_R	353_T	1.309	0.60
154_R	158_K	1.308	0.60
460_M	514_I	1.306	0.60
129_N	364_A	1.301	0.59
60_P	65_S	1.299	0.59
71_T	74_E	1.292	0.59
372_L	395_D	1.290	0.59
712_V	736_I	1.289	0.59
54_V	57_G	1.289	0.59
216_F	350_A	1.280	0.58
215_S	381_K	1.278	0.58
266_A	542_K	1.276	0.58
241_T	262_I	1.275	0.58
665_K	669_F	1.273	0.58
388_P	619_A	1.273	0.58
56_Y	64_G	1.268	0.57
387_Q	393_K	1.261	0.57
280_K	284_E	1.261	0.57
264_V	276_M	1.254	0.57
599_Y	634_Y	1.248	0.56
503_T	589_S	1.246	0.56
64_G	68_R	1.244	0.56
263_I	313_V	1.242	0.56
66_K	69_M	1.240	0.56
445_M	595_K	1.229	0.55
395_D	438_L	1.227	0.55
364_A	368_Y	1.222	0.55
530_I	607_I	1.218	0.54
609_D	613_K	1.217	0.54
587_H	593_N	1.214	0.54
739_A	743_L	1.209	0.54
229_L	468_I	1.206	0.54
539_L	542_K	1.205	0.54
399_K	403_D	1.202	0.53
343_L	557_R	1.201	0.53
96_D	122_G	1.200	0.53
515_K	528_W	1.199	0.53
540_Q	545_G	1.199	0.53
527_G	540_Q	1.194	0.53
54_V	59_V	1.194	0.53
530_I	655_T	1.194	0.53
435_D	565_G	1.192	0.53
568_F	668_S	1.191	0.53
225_R	348_K	1.190	0.53
707_V	713_L	1.188	0.52
410_E	439_R	1.186	0.52
60_P	444_I	1.179	0.52
55_A	60_P	1.177	0.52
359_E	390_R	1.171	0.51
471_I	479_I	1.170	0.51
464_I	543_G	1.170	0.51
60_P	72_I	1.167	0.51
583_F	710_A	1.161	0.51
546_S	549_L	1.161	0.51
54_V	58_F	1.153	0.50
103_V	127_Y	1.151	0.50
59_V	68_R	1.150	0.50
630_L	716_K	1.144	0.50
272_A	352_V	1.141	0.49
116_D	452_N	1.138	0.49
553_Y	564_V	1.135	0.49
163_E	554_E	1.130	0.49
639_P	724_V	1.129	0.49
696_R	699_S	1.126	0.49
73_K	76_F	1.125	0.48
363_K	389_L	1.125	0.48
686_L	743_L	1.122	0.48
154_R	462_D	1.120	0.48
216_F	222_G	1.117	0.48
68_R	72_I	1.110	0.48
423_Y	549_L	1.109	0.47
327_I	502_G	1.103	0.47
341_L	497_I	1.103	0.47
232_A	426_V	1.098	0.47
141_I	458_M	1.095	0.47
114_L	117_L	1.092	0.46
350_A	451_K	1.092	0.46
219_L	223_G	1.090	0.46
342_A	402_Y	1.088	0.46
700_L	705_E	1.088	0.46
576_N	580_K	1.088	0.46
556_A	564_V	1.088	0.46
359_E	449_H	1.087	0.46
390_R	449_H	1.087	0.46
339_I	596_L	1.085	0.46
326_L	606_P	1.085	0.46
548_L	552_I	1.080	0.46
574_V	598_D	1.079	0.46
229_L	573_K	1.079	0.46
69_M	737_Y	1.074	0.45
359_E	532_R	1.072	0.45
390_R	532_R	1.072	0.45
511_D	589_S	1.072	0.45
270_A	382_W	1.070	0.45
743_L	748_Y	1.067	0.45
494_M	498_A	1.065	0.45
57_G	61_W	1.065	0.45
541_D	573_K	1.062	0.45
159_L	666_T	1.061	0.44
582_G	726_S	1.054	0.44
717_P	732_I	1.052	0.44
360_G	390_R	1.050	0.44
72_I	76_F	1.045	0.43
106_F	463_G	1.044	0.43
63_S	75_Y	1.043	0.43
626_L	634_Y	1.043	0.43
339_I	364_A	1.042	0.43
54_V	68_R	1.040	0.43
553_Y	557_R	1.040	0.43
60_P	316_D	1.037	0.43
226_A	380_V	1.035	0.43
118_A	271_S	1.033	0.43
216_F	223_G	1.033	0.43
69_M	75_Y	1.031	0.43
701_T	704_E	1.031	0.43
437_R	441_I	1.030	0.43
273_S	480_A	1.027	0.42
155_F	380_V	1.027	0.42
686_L	747_Y	1.020	0.42
122_G	241_T	1.019	0.42
659_S	720_Y	1.019	0.42
460_M	468_I	1.018	0.42
509_I	527_G	1.017	0.42
503_T	721_V	1.016	0.42
92_G	359_E	1.014	0.42
92_G	390_R	1.014	0.42
705_E	709_I	1.014	0.42
67_E	74_E	1.011	0.41
510_P	531_V	1.010	0.41
343_L	540_Q	1.009	0.41
570_S	575_L	1.001	0.41
265_T	328_I	1.001	0.41
128_T	134_D	0.997	0.41
125_I	328_I	0.996	0.40
451_K	483_Q	0.993	0.40
668_S	678_S	0.993	0.40
370_R	374_E	0.992	0.40
431_L	460_M	0.989	0.40
459_I	463_G	0.987	0.40
383_V	408_D	0.986	0.40
353_T	435_D	0.986	0.40
340_D	679_S	0.982	0.40
98_V	219_L	0.982	0.40
391_Y	598_D	0.980	0.39
389_L	446_V	0.979	0.39
490_L	523_A	0.975	0.39
211_R	620_Y	0.973	0.39
460_M	671_Q	0.971	0.39
265_T	268_S	0.968	0.39
360_G	449_H	0.961	0.38
512_R	589_S	0.959	0.38
321_D	326_L	0.958	0.38
55_A	58_F	0.957	0.38
262_I	732_I	0.957	0.38
98_V	352_V	0.956	0.38
246_A	282_G	0.956	0.38
216_F	219_L	0.955	0.38
373_I	380_V	0.955	0.38
283_L	552_I	0.953	0.38
229_L	352_V	0.950	0.38
493_N	591_K	0.950	0.38
502_G	600_P	0.949	0.38
360_G	532_R	0.948	0.38
453_N	563_W	0.948	0.38
343_L	349_V	0.947	0.38
69_M	77_S	0.946	0.37
485_A	531_V	0.946	0.37
79_F	84_Y	0.945	0.37
62_A	67_E	0.943	0.37
373_I	382_W	0.943	0.37
226_A	507_D	0.940	0.37
608_S	611_A	0.940	0.37
111_I	349_V	0.939	0.37
489_E	514_I	0.939	0.37
158_K	437_R	0.938	0.37
116_D	483_Q	0.938	0.37
516_H	591_K	0.938	0.37
514_I	569_M	0.937	0.37
508_L	589_S	0.934	0.37
568_F	603_V	0.934	0.37
547_E	551_M	0.933	0.37
276_M	443_G	0.933	0.37
216_F	229_L	0.931	0.37
589_S	594_E	0.928	0.36
99_I	739_A	0.926	0.36
92_G	449_H	0.926	0.36
490_L	603_V	0.925	0.36
241_T	350_A	0.923	0.36
54_V	67_E	0.922	0.36
523_A	552_I	0.922	0.36
585_P	622_L	0.920	0.36
425_D	469_K	0.920	0.36
213_I	327_I	0.919	0.36
590_P	677_E	0.919	0.36
396_P	407_L	0.918	0.36
61_W	65_S	0.917	0.36
458_M	504_F	0.917	0.36
92_G	532_R	0.912	0.35
728_N	734_E	0.911	0.35
484_I	528_W	0.909	0.35
118_A	124_I	0.908	0.35
125_I	383_V	0.907	0.35
481_A	600_P	0.907	0.35
120_G	400_W	0.904	0.35
595_K	603_V	0.903	0.35
451_K	527_G	0.902	0.35
229_L	238_S	0.902	0.35
406_L	599_Y	0.902	0.35
57_G	62_A	0.901	0.35
262_I	720_Y	0.900	0.35
210_N	385_M	0.900	0.35
338_Y	342_A	0.897	0.35
588_I	679_S	0.895	0.34
463_G	569_M	0.895	0.34
117_L	239_A	0.892	0.34
683_I	744_M	0.892	0.34
601_V	682_G	0.891	0.34
116_D	364_A	0.888	0.34
283_L	723_T	0.887	0.34
92_G	360_G	0.885	0.34
115_V	341_L	0.885	0.34
683_I	736_I	0.883	0.34
227_L	545_G	0.883	0.34
503_T	511_D	0.882	0.34
227_L	397_I	0.881	0.34
452_N	483_Q	0.880	0.34
246_A	539_L	0.879	0.34
62_A	66_K	0.878	0.34
276_M	343_L	0.875	0.33
408_D	537_P	0.875	0.33
541_D	581_N	0.875	0.33
463_G	604_I	0.873	0.33
151_Y	385_M	0.872	0.33
70_R	161_E	0.869	0.33
53_S	72_I	0.868	0.33
490_L	510_P	0.867	0.33
665_K	681_D	0.867	0.33
700_L	704_E	0.863	0.33
349_V	582_G	0.863	0.33
459_I	471_I	0.862	0.33
361_S	512_R	0.862	0.33
349_V	353_T	0.861	0.33
518_R	589_S	0.858	0.32
53_S	61_W	0.854	0.32
718_W	733_Y	0.854	0.32
638_N	658_V	0.853	0.32
328_I	387_Q	0.852	0.32
124_I	397_I	0.850	0.32
208_D	386_E	0.850	0.32
641_V	679_S	0.849	0.32
438_L	443_G	0.848	0.32
134_D	367_R	0.846	0.32
164_G	396_P	0.846	0.32
229_L	433_N	0.844	0.32
396_P	550_K	0.844	0.32
211_R	476_N	0.842	0.32
366_L	675_P	0.841	0.31
563_W	705_E	0.840	0.31
233_R	450_Y	0.839	0.31
233_R	529_R	0.839	0.31
450_Y	529_R	0.839	0.31
135_K	156_K	0.836	0.31
364_A	596_L	0.835	0.31
88_E	361_S	0.835	0.31
378_I	540_Q	0.834	0.31
68_R	76_F	0.833	0.31
128_T	152_E	0.832	0.31
389_L	526_R	0.832	0.31
348_K	363_K	0.831	0.31
72_I	620_Y	0.830	0.31
155_F	211_R	0.827	0.31
118_A	677_E	0.826	0.31
246_A	327_I	0.825	0.31
245_I	312_Y	0.825	0.31
58_F	61_W	0.824	0.31
61_W	69_M	0.824	0.31
315_P	577_F	0.824	0.31
53_S	59_V	0.823	0.31
351_L	568_F	0.822	0.30
317_A	676_Y	0.822	0.30
591_K	721_V	0.820	0.30
228_V	266_A	0.819	0.30
161_E	370_R	0.816	0.30
579_I	644_L	0.816	0.30
491_S	636_N	0.815	0.30
456_D	488_G	0.811	0.30
216_F	325_L	0.810	0.30
277_S	281_L	0.809	0.30
740_I	744_M	0.809	0.30
391_Y	452_N	0.808	0.30
488_G	510_P	0.808	0.30
488_G	574_V	0.807	0.30
60_P	503_T	0.805	0.30
94_T	316_D	0.804	0.30
92_G	568_F	0.804	0.30
407_L	549_L	0.804	0.30
72_I	75_Y	0.803	0.29
516_H	587_H	0.803	0.29
340_D	371_R	0.801	0.29
451_K	599_Y	0.801	0.29
510_P	527_G	0.798	0.29
90_Y	322_E	0.797	0.29
267_P	522_F	0.797	0.29
521_D	542_K	0.797	0.29
271_S	353_T	0.795	0.29
467_K	486_E	0.795	0.29
346_W	451_K	0.792	0.29
743_L	747_Y	0.792	0.29
141_I	587_H	0.791	0.29
462_D	565_G	0.790	0.29
405_L	507_D	0.789	0.29
64_G	596_L	0.787	0.29
729_R	744_M	0.786	0.29
245_I	351_L	0.784	0.28
470_A	734_E	0.784	0.28
68_R	73_K	0.781	0.28
53_S	74_E	0.781	0.28
312_Y	442_Y	0.781	0.28
554_E	560_G	0.779	0.28
572_Q	717_P	0.778	0.28
739_A	744_M	0.777	0.28
350_A	481_A	0.777	0.28
90_Y	117_L	0.775	0.28
659_S	740_I	0.775	0.28
176_K	394_G	0.775	0.28
323_G	326_L	0.773	0.28
229_L	440_A	0.773	0.28
54_V	69_M	0.773	0.28
707_V	735_L	0.772	0.28
94_T	113_R	0.769	0.28
312_Y	485_A	0.769	0.28
707_V	716_K	0.768	0.28
645_M	702_Q	0.768	0.28
98_V	120_G	0.768	0.28
59_V	63_S	0.766	0.28
72_I	78_K	0.765	0.27
523_A	562_D	0.764	0.27
554_E	610_I	0.764	0.27
465_H	485_A	0.764	0.27
184_P	651_I	0.763	0.27
56_Y	61_W	0.761	0.27
314_P	388_P	0.759	0.27
108_P	122_G	0.759	0.27
665_K	674_S	0.758	0.27
554_E	657_N	0.754	0.27
470_A	478_Y	0.752	0.27
593_N	598_D	0.752	0.27
229_L	596_L	0.752	0.27
123_L	503_T	0.751	0.27
127_Y	574_V	0.751	0.27
719_S	729_R	0.751	0.27
145_G	383_V	0.750	0.27
271_S	531_V	0.749	0.27
111_I	402_Y	0.748	0.27
725_L	739_A	0.748	0.27
541_D	580_K	0.747	0.27
373_I	377_R	0.746	0.27
123_L	575_L	0.745	0.27
263_I	584_I	0.745	0.27
60_P	69_M	0.744	0.26
710_A	725_L	0.743	0.26
365_F	368_Y	0.742	0.26
232_A	356_H	0.742	0.26
316_D	480_A	0.742	0.26
416_Y	604_I	0.741	0.26
394_G	399_K	0.740	0.26
622_L	646_L	0.740	0.26
245_I	676_Y	0.739	0.26
386_E	636_N	0.739	0.26
123_L	373_I	0.739	0.26
502_G	523_A	0.739	0.26
109_I	509_I	0.739	0.26
668_S	674_S	0.737	0.26
417_L	474_G	0.736	0.26
464_I	622_L	0.736	0.26
535_V	715_G	0.736	0.26
404_A	482_C	0.735	0.26
363_K	598_D	0.733	0.26
233_R	358_Y	0.732	0.26
358_Y	450_Y	0.732	0.26
358_Y	529_R	0.732	0.26
536_A	540_Q	0.732	0.26
707_V	711_K	0.732	0.26
73_K	388_P	0.731	0.26
154_R	226_A	0.730	0.26
206_S	438_L	0.730	0.26
272_A	571_D	0.729	0.26
131_L	156_K	0.729	0.26
273_S	539_L	0.726	0.26
386_E	550_K	0.726	0.26
321_D	328_I	0.725	0.26
334_L	607_I	0.724	0.25
446_V	634_Y	0.724	0.25
341_L	658_V	0.724	0.25
110_N	266_A	0.724	0.25
353_T	744_M	0.724	0.25
610_I	613_K	0.721	0.25
225_R	397_I	0.720	0.25
98_V	114_L	0.719	0.25
133_K	137_F	0.719	0.25
262_I	679_S	0.718	0.25
432_A	461_L	0.717	0.25
247_G	353_T	0.716	0.25
443_G	446_V	0.716	0.25
141_I	504_F	0.716	0.25
88_E	512_R	0.716	0.25
108_P	725_L	0.715	0.25
391_Y	589_S	0.715	0.25
233_R	359_E	0.715	0.25
233_R	390_R	0.715	0.25
359_E	450_Y	0.715	0.25
359_E	529_R	0.715	0.25
390_R	450_Y	0.715	0.25
390_R	529_R	0.715	0.25
172_E	388_P	0.714	0.25
334_L	525_L	0.712	0.25
70_R	75_Y	0.712	0.25
75_Y	78_K	0.712	0.25
95_Y	239_A	0.711	0.25
229_L	546_S	0.711	0.25
442_Y	451_K	0.710	0.25
142_M	152_E	0.709	0.25
353_T	723_T	0.708	0.25
544_F	690_Y	0.706	0.25
112_G	662_I	0.704	0.25
406_L	530_I	0.704	0.25
493_N	651_I	0.703	0.24
54_V	60_P	0.703	0.24
204_S	387_Q	0.702	0.24
473_I	696_R	0.702	0.24
65_S	68_R	0.700	0.24
230_T	355_V	0.700	0.24
666_T	739_A	0.700	0.24
108_P	531_V	0.699	0.24
476_N	645_M	0.698	0.24
66_K	232_A	0.698	0.24
166_F	542_K	0.698	0.24
563_W	566_S	0.698	0.24
588_I	645_M	0.695	0.24
516_H	556_A	0.694	0.24
342_A	346_W	0.694	0.24
613_K	616_K	0.694	0.24
105_N	589_S	0.693	0.24
128_T	405_L	0.692	0.24
568_F	645_M	0.690	0.24
602_V	616_K	0.690	0.24
216_F	280_K	0.690	0.24
361_S	590_P	0.690	0.24
93_N	268_S	0.689	0.24
626_L	646_L	0.688	0.24
333_A	523_A	0.686	0.24
235_R	398_E	0.686	0.24
527_G	625_K	0.686	0.24
58_F	68_R	0.683	0.24
397_I	685_M	0.683	0.24
512_R	516_H	0.683	0.24
319_I	341_L	0.683	0.24
304_R	328_I	0.682	0.24
87_A	268_S	0.682	0.24
566_S	645_M	0.682	0.24
62_A	68_R	0.681	0.23
276_M	460_M	0.680	0.23
463_G	525_L	0.680	0.23
109_I	239_A	0.679	0.23
616_K	636_N	0.679	0.23
632_D	676_Y	0.677	0.23
64_G	67_E	0.677	0.23
372_L	461_L	0.677	0.23
61_W	64_G	0.677	0.23
312_Y	515_K	0.676	0.23
341_L	492_D	0.675	0.23
499_L	598_D	0.675	0.23
323_G	361_S	0.674	0.23
607_I	659_S	0.674	0.23
564_V	652_V	0.673	0.23
441_I	540_Q	0.672	0.23
393_K	710_A	0.670	0.23
213_I	350_A	0.669	0.23
351_L	461_L	0.669	0.23
438_L	588_I	0.669	0.23
151_Y	463_G	0.668	0.23
119_R	268_S	0.667	0.23
233_R	532_R	0.667	0.23
450_Y	532_R	0.667	0.23
529_R	532_R	0.667	0.23
605_R	664_D	0.667	0.23
568_F	637_M	0.667	0.23
566_S	607_I	0.666	0.23
313_V	530_I	0.666	0.23
388_P	649_T	0.665	0.23
125_I	549_L	0.664	0.23
98_V	385_M	0.664	0.23
405_L	605_R	0.663	0.23
112_G	443_G	0.663	0.23
491_S	494_M	0.663	0.23
440_A	641_V	0.658	0.22
546_S	580_K	0.658	0.22
66_K	70_R	0.657	0.22
227_L	383_V	0.657	0.22
65_S	77_S	0.656	0.22
394_G	530_I	0.656	0.22
503_T	508_L	0.656	0.22
716_K	725_L	0.656	0.22
573_K	637_M	0.655	0.22
64_G	69_M	0.654	0.22
359_E	456_D	0.652	0.22
390_R	456_D	0.652	0.22
204_S	388_P	0.651	0.22
575_L	581_N	0.651	0.22
116_D	461_L	0.650	0.22
147_I	586_V	0.650	0.22
571_D	574_V	0.649	0.22
233_R	449_H	0.649	0.22
449_H	529_R	0.649	0.22
95_Y	278_F	0.649	0.22
168_I	549_L	0.649	0.22
211_R	414_P	0.649	0.22
224_Q	284_E	0.647	0.22
323_G	530_I	0.646	0.22
619_A	649_T	0.646	0.22
466_H	681_D	0.645	0.22
196_M	326_L	0.643	0.22
298_G	396_P	0.640	0.22
58_F	72_I	0.640	0.22
241_T	245_I	0.640	0.22
246_A	383_V	0.639	0.22
106_F	392_A	0.639	0.22
106_F	239_A	0.638	0.22
267_P	454_P	0.637	0.22
87_A	110_N	0.637	0.22
355_V	655_T	0.637	0.22
536_A	604_I	0.634	0.21
134_D	468_I	0.634	0.21
625_K	681_D	0.634	0.21
104_D	140_S	0.634	0.21
220_L	599_Y	0.633	0.21
208_D	510_P	0.633	0.21
554_E	572_Q	0.632	0.21
324_E	408_D	0.632	0.21
62_A	75_Y	0.631	0.21
94_T	397_I	0.630	0.21
279_A	343_L	0.630	0.21
449_H	506_G	0.630	0.21
480_A	688_L	0.630	0.21
202_E	599_Y	0.629	0.21
527_G	536_A	0.629	0.21
610_I	692_W	0.629	0.21
356_H	402_Y	0.627	0.21
501_G	506_G	0.627	0.21
126_I	353_T	0.627	0.21
317_A	321_D	0.626	0.21
508_L	511_D	0.625	0.21
314_P	646_L	0.625	0.21
240_A	435_D	0.625	0.21
201_H	527_G	0.625	0.21
112_G	567_S	0.623	0.21
322_E	580_K	0.623	0.21
510_P	552_I	0.623	0.21
222_G	244_S	0.621	0.21
127_Y	545_G	0.620	0.21
246_A	268_S	0.620	0.21
352_V	459_I	0.619	0.21
83_D	273_S	0.619	0.21
346_W	528_W	0.619	0.21
58_F	74_E	0.618	0.21
378_I	589_S	0.618	0.21
564_V	573_K	0.618	0.21
275_V	627_L	0.618	0.21
530_I	741_S	0.617	0.21
267_P	516_H	0.617	0.21
515_K	518_R	0.617	0.21
74_E	78_K	0.616	0.21
125_I	393_K	0.616	0.21
82_I	319_I	0.616	0.21
217_T	658_V	0.615	0.21
705_E	713_L	0.615	0.21
62_A	71_T	0.614	0.21
166_F	636_N	0.613	0.21
126_I	536_A	0.613	0.21
207_E	303_L	0.613	0.21
646_L	669_F	0.612	0.20
426_V	437_R	0.612	0.20
99_I	728_N	0.611	0.20
156_K	732_I	0.611	0.20
352_V	417_L	0.610	0.20
583_F	655_T	0.610	0.20
59_V	62_A	0.610	0.20
349_V	426_V	0.609	0.20
86_N	271_S	0.609	0.20
358_Y	390_R	0.607	0.20
506_G	532_R	0.604	0.20
208_D	446_V	0.604	0.20
126_I	484_I	0.604	0.20
391_Y	587_H	0.602	0.20
211_R	636_N	0.601	0.20
195_L	199_E	0.601	0.20
389_L	536_A	0.601	0.20
106_F	352_V	0.601	0.20
80_D	95_Y	0.601	0.20
546_S	550_K	0.601	0.20
100_L	601_V	0.600	0.20
609_D	612_T	0.599	0.20
399_K	736_I	0.598	0.20
97_L	306_D	0.597	0.20
240_A	602_V	0.597	0.20
310_L	677_E	0.596	0.20
215_S	310_L	0.596	0.20
726_S	745_K	0.594	0.20
231_A	564_V	0.594	0.20
159_L	464_I	0.594	0.20
356_H	446_V	0.593	0.20
512_R	515_K	0.592	0.20
412_S	521_D	0.592	0.20
105_N	458_M	0.591	0.20
233_R	360_G	0.589	0.20
360_G	450_Y	0.589	0.20
360_G	529_R	0.589	0.20
120_G	483_Q	0.589	0.20
111_I	395_D	0.588	0.20
396_P	562_D	0.588	0.20
123_L	131_L	0.588	0.20
56_Y	65_S	0.587	0.19
62_A	69_M	0.587	0.19
586_V	611_A	0.587	0.19
604_I	723_T	0.587	0.19
73_K	78_K	0.587	0.19
443_G	515_K	0.586	0.19
590_P	681_D	0.582	0.19
582_G	683_I	0.582	0.19
241_T	507_D	0.581	0.19
119_R	353_T	0.580	0.19
352_V	528_W	0.579	0.19
103_V	108_P	0.579	0.19
169_D	712_V	0.578	0.19
721_V	745_K	0.578	0.19
305_G	658_V	0.578	0.19
352_V	447_T	0.576	0.19
532_R	597_G	0.576	0.19
592_K	729_R	0.575	0.19
61_W	170_V	0.575	0.19
177_P	535_V	0.575	0.19
88_E	530_I	0.573	0.19
435_D	598_D	0.573	0.19
583_F	668_S	0.573	0.19
66_K	73_K	0.573	0.19
113_R	336_I	0.572	0.19
62_A	73_K	0.572	0.19
147_I	588_I	0.571	0.19
59_V	67_E	0.571	0.19
166_F	182_T	0.570	0.19
552_I	708_L	0.569	0.19
337_N	732_I	0.569	0.19
337_N	408_D	0.568	0.19
108_P	435_D	0.568	0.19
69_M	72_I	0.567	0.19
196_M	216_F	0.567	0.19
229_L	319_I	0.566	0.19
498_A	504_F	0.566	0.19
511_D	517_V	0.566	0.19
744_M	748_Y	0.566	0.19
277_S	722_S	0.566	0.19
266_A	568_F	0.565	0.19
669_F	737_Y	0.565	0.19
92_G	233_R	0.565	0.19
92_G	450_Y	0.565	0.19
92_G	529_R	0.565	0.19
364_A	461_L	0.564	0.19
587_H	669_F	0.564	0.19
426_V	431_L	0.564	0.19
411_P	530_I	0.563	0.19
636_N	659_S	0.563	0.19
130_N	134_D	0.562	0.19
247_G	319_I	0.562	0.19
449_H	456_D	0.562	0.19
640_E	721_V	0.562	0.19
109_I	453_N	0.561	0.18
393_K	549_L	0.561	0.18
109_I	363_K	0.561	0.18
669_F	679_S	0.560	0.18
264_V	420_T	0.559	0.18
325_L	630_L	0.559	0.18
454_P	597_G	0.559	0.18
232_A	442_Y	0.559	0.18
298_G	302_S	0.559	0.18
334_L	573_K	0.558	0.18
358_Y	532_R	0.558	0.18
126_I	155_F	0.558	0.18
409_A	446_V	0.557	0.18
108_P	565_G	0.556	0.18
249_I	563_W	0.556	0.18
341_L	635_F	0.555	0.18
392_A	582_G	0.555	0.18
266_A	606_P	0.555	0.18
412_S	477_S	0.554	0.18
95_Y	602_V	0.554	0.18
303_L	538_E	0.554	0.18
259_S	324_E	0.553	0.18
665_K	679_S	0.553	0.18
489_E	730_T	0.553	0.18
545_G	577_F	0.553	0.18
134_D	141_I	0.553	0.18
82_I	261_R	0.552	0.18
120_G	454_P	0.552	0.18
245_I	548_L	0.552	0.18
391_Y	593_N	0.552	0.18
196_M	583_F	0.551	0.18
317_A	571_D	0.550	0.18
225_R	244_S	0.550	0.18
338_Y	620_Y	0.550	0.18
181_N	432_A	0.549	0.18
99_I	734_E	0.549	0.18
167_I	670_L	0.548	0.18
414_P	613_K	0.548	0.18
586_V	725_L	0.547	0.18
741_S	744_M	0.547	0.18
84_Y	120_G	0.547	0.18
509_I	539_L	0.547	0.18
118_A	596_L	0.546	0.18
65_S	71_T	0.546	0.18
495_V	576_N	0.545	0.18
456_D	532_R	0.545	0.18
611_A	614_I	0.544	0.18
183_M	554_E	0.544	0.18
421_M	526_R	0.544	0.18
314_P	317_A	0.544	0.18
516_H	519_I	0.544	0.18
400_W	404_A	0.543	0.18
433_N	638_N	0.543	0.18
492_D	612_T	0.543	0.18
326_L	508_L	0.543	0.18
493_N	723_T	0.541	0.18
215_S	602_V	0.541	0.18
517_V	522_F	0.540	0.18
353_T	740_I	0.540	0.18
358_Y	449_H	0.539	0.18
387_Q	547_E	0.539	0.18
260_I	324_E	0.539	0.18
486_E	526_R	0.539	0.18
61_W	503_T	0.538	0.18
65_S	72_I	0.538	0.18
109_I	122_G	0.538	0.18
110_N	512_R	0.538	0.18
367_R	442_Y	0.537	0.18
469_K	484_I	0.536	0.18
224_Q	287_G	0.535	0.18
449_H	597_G	0.535	0.18
411_P	479_I	0.535	0.18
408_D	455_D	0.535	0.18
355_V	447_T	0.535	0.18
352_V	355_V	0.534	0.17
56_Y	60_P	0.533	0.17
422_I	689_K	0.533	0.17
263_I	618_S	0.533	0.17
559_K	648_S	0.532	0.17
658_V	662_I	0.532	0.17
88_E	682_G	0.531	0.17
79_F	667_I	0.531	0.17
217_T	342_A	0.531	0.17
416_Y	464_I	0.530	0.17
222_G	350_A	0.530	0.17
245_I	279_A	0.530	0.17
579_I	585_P	0.530	0.17
151_Y	490_L	0.530	0.17
339_I	507_D	0.530	0.17
346_W	571_D	0.529	0.17
476_N	726_S	0.529	0.17
669_F	674_S	0.528	0.17
484_I	583_F	0.528	0.17
272_A	726_S	0.528	0.17
86_N	517_V	0.527	0.17
116_D	402_Y	0.527	0.17
409_A	435_D	0.527	0.17
400_W	537_P	0.526	0.17
596_L	675_P	0.526	0.17
108_P	208_D	0.526	0.17
249_I	489_E	0.526	0.17
406_L	528_W	0.526	0.17
337_N	421_M	0.525	0.17
372_L	442_Y	0.525	0.17
625_K	665_K	0.525	0.17
287_G	303_L	0.525	0.17
180_G	204_S	0.525	0.17
323_G	638_N	0.524	0.17
64_G	129_N	0.524	0.17
53_S	63_S	0.522	0.17
360_G	456_D	0.522	0.17
282_G	544_F	0.520	0.17
176_K	179_S	0.520	0.17
271_S	424_E	0.520	0.17
395_D	677_E	0.519	0.17
154_R	405_L	0.519	0.17
670_L	741_S	0.518	0.17
232_A	402_Y	0.518	0.17
312_Y	318_A	0.517	0.17
207_E	277_S	0.517	0.17
263_I	323_G	0.517	0.17
182_T	586_V	0.517	0.17
182_T	613_K	0.516	0.17
70_R	387_Q	0.516	0.17
479_I	535_V	0.516	0.17
675_P	678_S	0.515	0.17
198_K	261_R	0.515	0.17
264_V	355_V	0.515	0.17
137_F	140_S	0.513	0.17
221_S	412_S	0.512	0.17
264_V	453_N	0.511	0.17
494_M	744_M	0.511	0.17
74_E	492_D	0.511	0.17
341_L	405_L	0.510	0.17
336_I	367_R	0.510	0.17
442_Y	596_L	0.509	0.17
232_A	476_N	0.508	0.17
698_W	743_L	0.508	0.17
91_L	568_F	0.508	0.17
531_V	615_V	0.508	0.17
405_L	423_Y	0.507	0.17
175_P	504_F	0.506	0.16
458_M	669_F	0.506	0.16
608_S	612_T	0.506	0.16
414_P	493_N	0.506	0.16
445_M	448_A	0.506	0.16
102_T	105_N	0.505	0.16
279_A	592_K	0.505	0.16
152_E	346_W	0.504	0.16
128_T	367_R	0.503	0.16
239_A	563_W	0.502	0.16
55_A	59_V	0.502	0.16
125_I	421_M	0.501	0.16
202_E	388_P	0.500	0.16
328_I	650_K	0.500	0.16
56_Y	68_R	0.500	0.16

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zpaA	1	0.8455	100	0.479	Contact Map
2reeA	1	0.2182	99.6	0.934	Contact Map
3c26A	2	0.3065	99.4	0.94	Contact Map
1z4rA	1	0.2013	99.4	0.941	Contact Map
1kzfA	1	0.2312	99.3	0.945	Contact Map
1n71A	4	0.1948	99.2	0.945	Contact Map
3d8pA	1	0.1922	99.2	0.945	Contact Map
4znkA	1	0.2987	99.2	0.946	Contact Map
2g3aA	2	0.1779	99.2	0.946	Contact Map
2fiwA	2	0.1909	99.2	0.947	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0161 seconds.