Q7LYL5 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q7LYL5 - mRNA 3'-end processing factor, putative

UniProt:	Q7LYL5	Sequences: MVNRLASLDRFNRISLIYSELKELGITRIEYEGPTIAVYVKKPALITEKGEVIKKIAKDIKKRIVIKADPSVRKDKKEAVEIIKNLVPAEAEIVDIKFDDDLGEVLIKAKKPGLVIGKGGSLQQRIFAETFWKAEIVREPPIKSRTYDSILEHIYNETEYRAKILKVFGERIHRETIFQDKYVRITALGGFLEVGRSAVLVETPESKVLLDVGLNPSANMFGEKLFPKLDIDQLKMEELDAVVITHAHLDHCGMVPFLFKYGYEGPVYTTVPTRDIMALMQLDSLDVAEKEGKPIPYSAKEVRKELLHTITLDYGEVTDIAPDIRLTFYNAGHILGSGMAHLHIGDGKHNIVYTGDFKYAKTKLLDKANTEFPRVDTLIMETTYGAQDQPNREESELELLEIINKTLNKGGKVLIPVLAVGRGQEIMLIINDFMKKKLIPEVPVYVTGLVDEVTAIHNAYPEWLGREVREEILYKDENPFTSEHFKRIEGYKEDIAKGEPSIILATSGMLNGGPAVEFFKTMAPDPKNAIIFVSYQAEGTLGRKVRDGAKEVQILDRDGRVESIQINMEVEAVEGFSGHSDKRQLLNFLRNIEPKPKNVILNHGEASSIRAFANYIREDRLGYKPNIYTPAILDSLRVA	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	639 (517)
Sequences:	333 (220)
Seq/√Len:	9.7

HALSA - Q9HS54
SULSO - Q7LYL5 Q980D0

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
206_S	240_D	4.853	1.00
210_L	342_L	4.471	0.99
210_L	245_T	4.419	0.99
183_V	351_I	4.251	0.99
418_L	534_S	3.416	0.96
208_V	324_I	3.314	0.95
187_A	191_F	3.203	0.94
377_T	600_I	3.196	0.94
186_T	231_I	3.167	0.94
75_D	78_E	3.137	0.94
341_H	350_N	3.030	0.92
472_I	517_E	2.783	0.89
242_V	259_F	2.741	0.88
190_G	253_G	2.722	0.88
255_V	267_V	2.599	0.85
357_F	380_M	2.587	0.85
63_R	67_K	2.546	0.84
80_V	84_K	2.538	0.84
363_K	396_E	2.527	0.83
503_I	522_M	2.495	0.82
113_G	117_G	2.495	0.82
586_L	615_Y	2.475	0.82
190_G	215_N	2.453	0.81
268_Y	320_I	2.398	0.80
404_N	433_F	2.311	0.77
580_S	584_Q	2.303	0.77
77_K	81_E	2.275	0.76
545_V	566_I	2.264	0.76
190_G	197_S	2.223	0.74
115_V	120_G	2.171	0.72
126_I	134_A	2.166	0.72
358_K	578_G	2.164	0.72
326_L	345_G	2.152	0.72
609_I	629_T	2.136	0.71
336_G	463_W	2.129	0.71
258_L	456_I	2.126	0.71
526_P	551_E	2.080	0.69
317_V	325_R	2.075	0.69
193_E	573_V	2.074	0.69
421_G	425_E	2.066	0.68
116_I	120_G	2.039	0.67
332_G	421_G	2.039	0.67
243_V	408_N	2.032	0.67
537_A	540_T	2.027	0.67
100_D	108_K	2.019	0.66
278_A	282_L	2.009	0.66
210_L	353_Y	2.006	0.66
81_E	85_N	1.998	0.66
77_K	80_V	1.947	0.64
329_Y	339_M	1.937	0.63
67_K	71_S	1.915	0.62
585_L	615_Y	1.905	0.62
197_S	414_L	1.896	0.61
91_A	94_V	1.890	0.61
279_L	456_I	1.880	0.61
225_L	228_K	1.878	0.61
350_N	576_F	1.862	0.60
197_S	253_G	1.847	0.59
215_N	601_L	1.822	0.58
200_L	258_L	1.806	0.57
113_G	116_I	1.786	0.57
354_T	357_F	1.785	0.57
269_T	277_M	1.784	0.56
216_P	382_T	1.780	0.56
364_L	421_G	1.772	0.56
243_V	585_L	1.772	0.56
111_K	117_G	1.755	0.55
422_R	508_G	1.754	0.55
206_S	323_D	1.752	0.55
468_V	472_I	1.748	0.55
525_D	531_I	1.720	0.54
426_I	503_I	1.710	0.53
91_A	98_F	1.706	0.53
519_F	566_I	1.690	0.52
111_K	114_L	1.674	0.52
119_G	125_R	1.672	0.51
354_T	605_E	1.663	0.51
81_E	84_K	1.655	0.51
87_V	93_I	1.655	0.51
244_I	255_V	1.650	0.50
408_N	614_N	1.645	0.50
228_K	418_L	1.632	0.50
244_I	277_M	1.625	0.49
62_K	111_K	1.606	0.48
113_G	118_K	1.606	0.48
203_T	607_S	1.596	0.48
88_P	105_V	1.596	0.48
383_T	603_H	1.595	0.48
363_K	522_M	1.595	0.48
88_P	104_E	1.588	0.48
186_T	635_S	1.587	0.48
201_V	210_L	1.584	0.48
458_N	470_E	1.584	0.48
280_M	449_L	1.583	0.47
111_K	118_K	1.579	0.47
156_N	171_R	1.574	0.47
88_P	92_E	1.574	0.47
127_F	133_K	1.571	0.47
407_L	442_V	1.547	0.46
259_F	308_H	1.546	0.46
378_L	399_L	1.545	0.46
343_H	373_P	1.543	0.46
203_T	323_D	1.536	0.45
99_D	104_E	1.534	0.45
201_V	614_N	1.531	0.45
113_G	132_W	1.531	0.45
241_A	337_S	1.526	0.45
201_V	492_K	1.523	0.45
197_S	601_L	1.521	0.45
104_E	144_S	1.519	0.45
191_F	199_V	1.512	0.44
586_L	616_I	1.512	0.44
352_V	638_V	1.509	0.44
427_M	459_A	1.496	0.44
192_L	632_I	1.496	0.44
94_V	104_E	1.494	0.43
84_K	88_P	1.476	0.43
115_V	118_K	1.470	0.42
332_G	425_E	1.464	0.42
98_F	105_V	1.460	0.42
614_N	627_I	1.454	0.42
352_V	378_L	1.452	0.42
422_R	577_S	1.450	0.42
111_K	125_R	1.449	0.41
111_K	116_I	1.447	0.41
104_E	112_P	1.443	0.41
197_S	215_N	1.442	0.41
80_V	85_N	1.441	0.41
77_K	82_I	1.440	0.41
349_H	377_T	1.434	0.41
579_H	603_H	1.429	0.41
314_Y	330_N	1.423	0.40
210_L	365_L	1.417	0.40
343_H	350_N	1.405	0.40
117_G	138_R	1.402	0.39
401_E	405_K	1.394	0.39
80_V	101_D	1.389	0.39
590_R	619_D	1.383	0.39
423_G	516_V	1.377	0.38
514_P	540_T	1.377	0.38
161_R	165_L	1.376	0.38
273_T	424_Q	1.375	0.38
70_P	80_V	1.373	0.38
137_V	140_P	1.365	0.38
506_T	522_M	1.362	0.38
444_V	530_I	1.360	0.38
495_I	592_I	1.359	0.38
91_A	113_G	1.354	0.37
247_A	546_R	1.349	0.37
276_I	419_A	1.345	0.37
95_D	566_I	1.338	0.37
243_V	342_L	1.332	0.36
88_P	91_A	1.325	0.36
93_I	113_G	1.325	0.36
93_I	96_I	1.318	0.36
352_V	375_V	1.312	0.36
468_V	632_I	1.310	0.36
82_I	85_N	1.302	0.35
141_P	566_I	1.299	0.35
519_F	523_A	1.298	0.35
93_I	118_K	1.296	0.35
99_D	128_A	1.293	0.35
583_R	586_L	1.283	0.34
119_G	122_L	1.278	0.34
529_A	609_I	1.277	0.34
124_Q	131_F	1.271	0.34
96_I	99_D	1.270	0.34
185_I	379_I	1.270	0.34
109_A	117_G	1.269	0.34
217_S	534_S	1.269	0.34
210_L	304_K	1.269	0.34
354_T	396_E	1.258	0.33
112_P	132_W	1.255	0.33
98_F	112_P	1.251	0.33
98_F	317_V	1.251	0.33
88_P	108_K	1.244	0.33
215_N	253_G	1.240	0.33
89_A	118_K	1.238	0.33
517_E	520_K	1.238	0.33
589_L	599_V	1.233	0.32
111_K	124_Q	1.231	0.32
109_A	116_I	1.231	0.32
317_V	413_V	1.220	0.32
534_S	599_V	1.215	0.32
158_T	162_A	1.209	0.32
109_A	113_G	1.203	0.31
406_T	529_A	1.203	0.31
431_N	446_V	1.202	0.31
114_L	127_F	1.201	0.31
88_P	98_F	1.199	0.31
597_K	627_I	1.196	0.31
130_T	210_L	1.192	0.31
177_I	636_L	1.191	0.31
104_E	117_G	1.188	0.31
214_L	225_L	1.188	0.31
530_I	554_I	1.186	0.31
80_V	89_A	1.185	0.31
92_E	125_R	1.185	0.31
142_I	444_V	1.184	0.31
313_D	316_E	1.183	0.31
159_E	627_I	1.182	0.30
462_E	602_N	1.182	0.30
96_I	118_K	1.178	0.30
490_G	502_I	1.175	0.30
88_P	117_G	1.169	0.30
107_I	115_V	1.168	0.30
400_L	425_E	1.167	0.30
80_V	83_I	1.163	0.30
237_E	378_L	1.161	0.30
317_V	503_I	1.160	0.30
107_I	134_A	1.157	0.30
242_V	255_V	1.156	0.29
260_K	516_V	1.151	0.29
616_I	625_P	1.146	0.29
190_G	358_K	1.145	0.29
109_A	115_V	1.145	0.29
406_T	445_Y	1.139	0.29
98_F	103_G	1.138	0.29
120_G	134_A	1.135	0.29
395_S	399_L	1.127	0.28
323_D	536_Q	1.123	0.28
599_V	612_F	1.121	0.28
546_R	613_A	1.116	0.28
443_P	449_L	1.114	0.28
508_G	577_S	1.113	0.28
62_K	66_I	1.100	0.27
93_I	98_F	1.095	0.27
307_L	600_I	1.095	0.27
523_A	540_T	1.093	0.27
185_I	378_L	1.087	0.27
549_A	553_Q	1.086	0.27
198_A	269_T	1.079	0.27
104_E	110_K	1.077	0.27
124_Q	128_A	1.073	0.26
451_D	611_A	1.066	0.26
332_G	416_P	1.061	0.26
373_P	446_V	1.060	0.26
342_L	415_I	1.055	0.26
253_G	505_A	1.055	0.26
60_I	66_I	1.052	0.26
83_I	98_F	1.051	0.26
378_L	588_F	1.049	0.26
126_I	140_P	1.049	0.26
130_T	138_R	1.044	0.25
92_E	118_K	1.035	0.25
322_P	337_S	1.033	0.25
365_L	421_G	1.033	0.25
426_I	470_E	1.032	0.25
258_L	409_K	1.031	0.25
125_R	128_A	1.030	0.25
470_E	530_I	1.028	0.25
431_N	472_I	1.025	0.25
85_N	88_P	1.024	0.25
390_P	520_K	1.019	0.25
116_I	123_Q	1.018	0.25
89_A	124_Q	1.017	0.25
105_V	126_I	1.016	0.25
67_K	70_P	1.014	0.24
189_G	256_P	1.010	0.24
106_L	124_Q	1.010	0.24
326_L	343_H	1.008	0.24
137_V	141_P	1.007	0.24
183_V	506_T	1.006	0.24
448_G	508_G	0.998	0.24
236_M	325_R	0.992	0.24
488_I	491_Y	0.989	0.24
191_F	602_N	0.989	0.24
242_V	413_V	0.989	0.24
401_E	409_K	0.988	0.24
196_R	536_Q	0.988	0.24
195_G	227_P	0.985	0.23
115_V	119_G	0.984	0.23
65_V	68_A	0.984	0.23
353_Y	365_L	0.983	0.23
542_G	550_K	0.983	0.23
205_E	530_I	0.982	0.23
100_D	145_R	0.982	0.23
119_G	124_Q	0.981	0.23
97_K	149_S	0.979	0.23
109_A	112_P	0.978	0.23
416_P	536_Q	0.972	0.23
212_V	418_L	0.967	0.23
101_D	566_I	0.962	0.23
243_V	263_Y	0.961	0.23
509_M	580_S	0.955	0.23
418_L	508_G	0.955	0.23
351_I	614_N	0.954	0.22
415_I	503_I	0.951	0.22
193_E	313_D	0.951	0.22
429_I	464_L	0.950	0.22
391_N	442_V	0.947	0.22
87_V	91_A	0.942	0.22
539_G	577_S	0.940	0.22
202_E	257_F	0.939	0.22
103_G	107_I	0.938	0.22
99_D	131_F	0.938	0.22
98_F	117_G	0.938	0.22
116_I	139_E	0.937	0.22
75_D	84_K	0.936	0.22
210_L	379_I	0.936	0.22
310_I	350_N	0.935	0.22
259_F	385_G	0.934	0.22
120_G	138_R	0.928	0.22
280_M	284_S	0.923	0.22
91_A	131_F	0.920	0.21
380_M	612_F	0.919	0.21
258_L	265_G	0.919	0.21
425_E	580_S	0.918	0.21
108_K	243_V	0.918	0.21
208_V	432_D	0.917	0.21
360_A	521_T	0.917	0.21
368_A	406_T	0.916	0.21
329_Y	378_L	0.914	0.21
112_P	126_I	0.913	0.21
179_Q	243_V	0.912	0.21
239_L	268_Y	0.911	0.21
115_V	140_P	0.910	0.21
110_K	121_S	0.908	0.21
210_L	232_D	0.907	0.21
214_L	361_K	0.907	0.21
98_F	113_G	0.907	0.21
579_H	604_G	0.907	0.21
508_G	539_G	0.905	0.21
198_A	209_L	0.904	0.21
91_A	108_K	0.901	0.21
367_K	413_V	0.901	0.21
542_G	549_A	0.900	0.21
422_R	448_G	0.900	0.21
101_D	112_P	0.897	0.21
339_M	352_V	0.896	0.21
111_K	115_V	0.895	0.21
260_K	362_T	0.893	0.21
472_I	546_R	0.893	0.21
156_N	566_I	0.892	0.21
416_P	424_Q	0.890	0.21
107_I	125_R	0.889	0.21
90_E	99_D	0.889	0.21
417_V	446_V	0.889	0.21
247_A	309_T	0.887	0.20
207_K	232_D	0.886	0.20
235_K	426_I	0.886	0.20
76_K	81_E	0.884	0.20
167_V	171_R	0.882	0.20
61_K	66_I	0.882	0.20
109_A	121_S	0.881	0.20
102_L	410_G	0.877	0.20
411_G	581_D	0.875	0.20
123_Q	130_T	0.874	0.20
228_K	534_S	0.873	0.20
101_D	210_L	0.872	0.20
571_E	634_D	0.870	0.20
517_E	580_S	0.870	0.20
370_T	537_A	0.863	0.20
274_R	309_T	0.861	0.20
118_K	140_P	0.861	0.20
212_V	276_I	0.861	0.20
75_D	79_A	0.861	0.20
113_G	123_Q	0.861	0.20
126_I	147_Y	0.860	0.20
341_H	353_Y	0.859	0.20
276_I	588_F	0.856	0.20
302_V	556_D	0.855	0.20
275_D	329_Y	0.851	0.19
94_V	111_K	0.849	0.19
415_I	426_I	0.849	0.19
280_M	450_V	0.849	0.19
83_I	86_L	0.848	0.19
106_L	134_A	0.845	0.19
275_D	279_L	0.843	0.19
255_V	273_T	0.837	0.19
95_D	103_G	0.834	0.19
360_A	363_K	0.834	0.19
91_A	117_G	0.830	0.19
218_A	502_I	0.828	0.19
504_L	588_F	0.827	0.19
193_E	365_L	0.826	0.19
167_V	255_V	0.825	0.19
89_A	93_I	0.823	0.19
97_K	103_G	0.822	0.19
126_I	149_S	0.822	0.19
284_S	492_K	0.820	0.19
447_T	488_I	0.820	0.19
310_I	364_L	0.818	0.19
196_R	314_Y	0.816	0.18
75_D	82_I	0.816	0.18
100_D	140_P	0.815	0.18
505_A	581_D	0.811	0.18
244_I	284_S	0.810	0.18
101_D	119_G	0.808	0.18
81_E	134_A	0.807	0.18
393_E	587_N	0.805	0.18
428_L	626_N	0.804	0.18
122_L	134_A	0.803	0.18
534_S	567_N	0.801	0.18
249_L	539_G	0.800	0.18
84_K	87_V	0.798	0.18
93_I	107_I	0.796	0.18
166_K	175_E	0.795	0.18
114_L	352_V	0.795	0.18
208_V	632_I	0.794	0.18
97_K	124_Q	0.793	0.18
117_G	123_Q	0.792	0.18
203_T	207_K	0.792	0.18
132_W	144_S	0.788	0.18
196_R	206_S	0.785	0.18
334_I	426_I	0.783	0.18
224_K	521_T	0.782	0.18
406_T	531_I	0.779	0.17
70_P	75_D	0.776	0.17
60_I	64_I	0.775	0.17
336_G	505_A	0.774	0.17
118_K	124_Q	0.773	0.17
156_N	180_D	0.772	0.17
315_G	419_A	0.772	0.17
396_E	519_F	0.771	0.17
190_G	199_V	0.768	0.17
87_V	92_E	0.767	0.17
253_G	358_K	0.766	0.17
86_L	89_A	0.766	0.17
193_E	258_L	0.765	0.17
337_S	537_A	0.765	0.17
89_A	92_E	0.762	0.17
375_V	592_I	0.760	0.17
248_H	579_H	0.758	0.17
339_M	588_F	0.758	0.17
250_D	579_H	0.758	0.17
504_L	602_N	0.756	0.17
87_V	90_E	0.756	0.17
342_L	362_T	0.755	0.17
353_Y	417_V	0.752	0.17
283_D	381_E	0.751	0.17
98_F	132_W	0.750	0.17
124_Q	145_R	0.750	0.17
105_V	138_R	0.749	0.17
286_D	363_K	0.746	0.17
517_E	529_A	0.746	0.17
100_D	132_W	0.746	0.17
172_I	325_R	0.743	0.17
183_V	204_P	0.743	0.17
119_G	126_I	0.742	0.17
195_G	250_D	0.741	0.17
195_G	248_H	0.741	0.17
113_G	122_L	0.741	0.17
82_I	90_E	0.740	0.16
158_T	171_R	0.739	0.16
507_S	575_G	0.736	0.16
91_A	119_G	0.736	0.16
78_E	84_K	0.734	0.16
109_A	120_G	0.733	0.16
201_V	254_M	0.733	0.16
95_D	133_K	0.731	0.16
96_I	113_G	0.731	0.16
81_E	87_V	0.731	0.16
127_F	209_L	0.729	0.16
580_S	602_N	0.727	0.16
120_G	124_Q	0.726	0.16
534_S	589_L	0.725	0.16
241_A	627_I	0.723	0.16
92_E	121_S	0.718	0.16
462_E	542_G	0.718	0.16
119_G	177_I	0.717	0.16
226_F	417_V	0.716	0.16
211_D	251_H	0.715	0.16
211_D	246_H	0.715	0.16
211_D	513_G	0.715	0.16
211_D	356_D	0.715	0.16
211_D	333_H	0.715	0.16
213_G	513_G	0.713	0.16
213_G	356_D	0.713	0.16
356_D	513_G	0.713	0.16
213_G	251_H	0.713	0.16
246_H	251_H	0.713	0.16
213_G	333_H	0.713	0.16
213_G	246_H	0.713	0.16
246_H	333_H	0.713	0.16
251_H	513_G	0.713	0.16
251_H	356_D	0.713	0.16
333_H	513_G	0.713	0.16
251_H	333_H	0.713	0.16
333_H	356_D	0.713	0.16
246_H	513_G	0.713	0.16
246_H	356_D	0.713	0.16
121_S	126_I	0.712	0.16
370_T	530_I	0.712	0.16
117_G	140_P	0.711	0.16
99_D	106_L	0.711	0.16
502_I	525_D	0.710	0.16
140_P	459_A	0.710	0.16
76_K	80_V	0.710	0.16
108_K	125_R	0.709	0.16
546_R	551_E	0.708	0.16
93_I	115_V	0.707	0.16
101_D	146_T	0.706	0.16
325_R	472_I	0.705	0.16
364_L	517_E	0.705	0.16
363_K	371_E	0.704	0.16
120_G	162_A	0.703	0.16
470_E	546_R	0.702	0.16
71_S	404_N	0.702	0.16
93_I	104_E	0.701	0.16
109_A	136_I	0.699	0.15
85_N	90_E	0.699	0.15
177_I	600_I	0.695	0.15
88_P	114_L	0.694	0.15
114_L	120_G	0.694	0.15
132_W	138_R	0.693	0.15
415_I	470_E	0.692	0.15
423_G	515_A	0.690	0.15
241_A	548_G	0.686	0.15
350_N	401_E	0.685	0.15
247_A	468_V	0.685	0.15
354_T	380_M	0.684	0.15
116_I	122_L	0.683	0.15
236_M	263_Y	0.681	0.15
225_L	229_L	0.680	0.15
79_A	89_A	0.679	0.15
82_I	128_A	0.676	0.15
112_P	144_S	0.676	0.15
369_N	413_V	0.676	0.15
90_E	93_I	0.676	0.15
105_V	112_P	0.675	0.15
250_D	383_T	0.674	0.15
248_H	383_T	0.674	0.15
497_K	534_S	0.673	0.15
208_V	571_E	0.672	0.15
117_G	132_W	0.671	0.15
414_L	519_F	0.671	0.15
165_L	169_G	0.671	0.15
99_D	166_K	0.670	0.15
260_K	584_Q	0.669	0.15
110_K	119_G	0.668	0.15
115_V	131_F	0.668	0.15
272_P	407_L	0.664	0.15
351_I	432_D	0.664	0.15
212_V	589_L	0.663	0.15
458_N	551_E	0.662	0.15
124_Q	127_F	0.661	0.15
414_L	523_A	0.660	0.15
239_L	408_N	0.659	0.15
115_V	135_E	0.659	0.15
101_D	114_L	0.659	0.15
422_R	578_G	0.658	0.15
542_G	556_D	0.658	0.15
338_G	526_P	0.658	0.15
124_Q	130_T	0.656	0.14
320_I	332_G	0.656	0.14
221_F	225_L	0.654	0.14
421_G	517_E	0.652	0.14
94_V	117_G	0.652	0.14
122_L	145_R	0.652	0.14
145_R	278_A	0.651	0.14
208_V	342_L	0.651	0.14
210_L	423_G	0.650	0.14
413_V	488_I	0.650	0.14
88_P	137_V	0.649	0.14
185_I	406_T	0.649	0.14
80_V	87_V	0.648	0.14
103_G	117_G	0.648	0.14
92_E	526_P	0.646	0.14
450_V	616_I	0.646	0.14
61_K	65_V	0.646	0.14
453_V	534_S	0.645	0.14
334_I	506_T	0.644	0.14
89_A	104_E	0.644	0.14
82_I	88_P	0.643	0.14
364_L	488_I	0.642	0.14
267_V	278_A	0.641	0.14
93_I	117_G	0.641	0.14
98_F	107_I	0.640	0.14
94_V	102_L	0.640	0.14
84_K	185_I	0.640	0.14
612_F	630_P	0.638	0.14
102_L	112_P	0.637	0.14
394_E	402_I	0.635	0.14
537_A	576_F	0.634	0.14
105_V	111_K	0.634	0.14
98_F	123_Q	0.633	0.14
84_K	129_E	0.631	0.14
344_I	349_H	0.630	0.14
327_T	580_S	0.628	0.14
275_D	459_A	0.627	0.14
247_A	392_R	0.626	0.14
113_G	133_K	0.626	0.14
224_K	228_K	0.625	0.14
553_Q	556_D	0.625	0.14
257_F	586_L	0.622	0.14
393_E	583_R	0.622	0.14
260_K	506_T	0.622	0.14
125_R	138_R	0.621	0.14
204_P	309_T	0.620	0.14
353_Y	423_G	0.620	0.14
286_D	396_E	0.620	0.14
546_R	572_A	0.619	0.14
408_N	618_E	0.619	0.14
352_V	400_L	0.618	0.14
107_I	126_I	0.618	0.14
195_G	448_G	0.617	0.14
144_S	147_Y	0.616	0.14
190_G	224_K	0.615	0.14
455_A	458_N	0.615	0.14
301_E	523_A	0.615	0.14
425_E	509_M	0.615	0.14
103_G	108_K	0.614	0.14
222_G	396_E	0.614	0.14
112_P	130_T	0.612	0.14
138_R	146_T	0.609	0.13
77_K	85_N	0.609	0.13
89_A	95_D	0.608	0.13
97_K	100_D	0.608	0.13
206_S	338_G	0.607	0.13
62_K	83_I	0.606	0.13
255_V	496_A	0.606	0.13
446_V	453_V	0.605	0.13
276_I	602_N	0.604	0.13
62_K	498_G	0.604	0.13
98_F	121_S	0.603	0.13
443_P	519_F	0.602	0.13
491_Y	537_A	0.602	0.13
387_Q	463_W	0.601	0.13
448_G	578_G	0.600	0.13
85_N	101_D	0.598	0.13
63_R	66_I	0.598	0.13
193_E	526_P	0.598	0.13
116_I	133_K	0.598	0.13
62_K	79_A	0.597	0.13
147_Y	151_L	0.596	0.13
111_K	127_F	0.595	0.13
103_G	138_R	0.595	0.13
223_E	284_S	0.595	0.13
601_L	627_I	0.592	0.13
133_K	145_R	0.592	0.13
589_L	612_F	0.591	0.13
113_G	120_G	0.591	0.13
577_S	596_P	0.590	0.13
105_V	134_A	0.590	0.13
128_A	139_E	0.589	0.13
449_L	519_F	0.589	0.13
270_T	338_G	0.589	0.13
534_S	550_K	0.589	0.13
105_V	144_S	0.588	0.13
77_K	89_A	0.587	0.13
444_V	502_I	0.587	0.13
73_R	76_K	0.586	0.13
127_F	147_Y	0.585	0.13
198_A	591_N	0.582	0.13
73_R	138_R	0.582	0.13
202_E	222_G	0.581	0.13
96_I	100_D	0.581	0.13
68_A	123_Q	0.580	0.13
90_E	140_P	0.580	0.13
82_I	89_A	0.579	0.13
117_G	130_T	0.578	0.13
87_V	125_R	0.578	0.13
196_R	338_G	0.577	0.13
191_F	591_N	0.576	0.13
145_R	149_S	0.576	0.13
119_G	123_Q	0.574	0.13
81_E	114_L	0.573	0.13
339_M	463_W	0.573	0.13
507_S	514_P	0.572	0.13
145_R	495_I	0.572	0.13
529_A	571_E	0.572	0.13
206_S	411_G	0.571	0.13
343_H	352_V	0.570	0.13
65_V	78_E	0.570	0.13
92_E	98_F	0.568	0.13
268_Y	536_Q	0.567	0.13
62_K	71_S	0.566	0.13
95_D	119_G	0.566	0.13
329_Y	459_A	0.565	0.13
193_E	531_I	0.564	0.13
252_C	369_N	0.563	0.13
107_I	117_G	0.563	0.13
111_K	123_Q	0.563	0.13
144_S	150_I	0.563	0.13
78_E	85_N	0.562	0.13
536_Q	542_G	0.562	0.13
454_T	494_D	0.562	0.13
166_K	244_I	0.562	0.13
409_K	569_E	0.561	0.12
193_E	585_L	0.561	0.12
84_K	99_D	0.560	0.12
69_D	72_V	0.560	0.12
187_A	190_G	0.560	0.12
228_K	633_L	0.559	0.12
140_P	153_H	0.558	0.12
86_L	107_I	0.557	0.12
375_V	547_D	0.556	0.12
103_G	310_I	0.555	0.12
331_A	339_M	0.555	0.12
139_E	145_R	0.554	0.12
96_I	136_I	0.554	0.12
263_Y	270_T	0.554	0.12
194_V	283_D	0.553	0.12
396_E	522_M	0.553	0.12
244_I	531_I	0.553	0.12
98_F	104_E	0.552	0.12
368_A	386_A	0.552	0.12
83_I	88_P	0.551	0.12
75_D	129_E	0.551	0.12
225_L	505_A	0.551	0.12
628_Y	636_L	0.550	0.12
549_A	556_D	0.550	0.12
190_G	463_W	0.550	0.12
143_K	148_D	0.548	0.12
214_L	358_K	0.547	0.12
138_R	163_K	0.546	0.12
107_I	142_I	0.546	0.12
227_P	354_T	0.546	0.12
402_I	571_E	0.545	0.12
111_K	132_W	0.545	0.12
358_K	584_Q	0.544	0.12
84_K	89_A	0.543	0.12
88_P	109_A	0.543	0.12
385_G	585_L	0.543	0.12
383_T	424_Q	0.543	0.12
413_V	593_E	0.542	0.12
601_L	609_I	0.542	0.12
598_N	606_A	0.542	0.12
378_L	600_I	0.541	0.12
106_L	156_N	0.538	0.12
233_Q	255_V	0.538	0.12
104_E	121_S	0.537	0.12
83_I	87_V	0.536	0.12
121_S	143_K	0.536	0.12
88_P	112_P	0.535	0.12
120_G	140_P	0.534	0.12
250_D	355_G	0.534	0.12
248_H	355_G	0.534	0.12
306_L	526_P	0.533	0.12
330_N	627_I	0.533	0.12
88_P	93_I	0.532	0.12
360_A	507_S	0.531	0.12
372_F	452_E	0.531	0.12
208_V	239_L	0.529	0.12
127_F	134_A	0.529	0.12
126_I	130_T	0.528	0.12
129_E	137_V	0.526	0.12
172_I	175_E	0.525	0.12
366_D	418_L	0.524	0.12
270_T	281_Q	0.524	0.12
189_G	211_D	0.523	0.12
189_G	513_G	0.523	0.12
189_G	333_H	0.523	0.12
189_G	251_H	0.523	0.12
189_G	246_H	0.523	0.12
189_G	213_G	0.523	0.12
189_G	356_D	0.523	0.12
160_Y	337_S	0.521	0.12
91_A	105_V	0.521	0.12
115_V	122_L	0.520	0.12
92_E	108_K	0.520	0.12
269_T	431_N	0.519	0.12
112_P	468_V	0.518	0.12
334_I	507_S	0.517	0.12
79_A	88_P	0.517	0.12
101_D	116_I	0.517	0.12
110_K	136_I	0.516	0.12
86_L	120_G	0.516	0.12
423_G	450_V	0.515	0.12
95_D	98_F	0.515	0.12
111_K	126_I	0.514	0.12
208_V	409_K	0.512	0.12
105_V	171_R	0.512	0.12
424_Q	566_I	0.510	0.12
86_L	136_I	0.510	0.12
631_A	634_D	0.508	0.11
124_Q	139_E	0.507	0.11
449_L	601_L	0.507	0.11
258_L	636_L	0.506	0.11
270_T	548_G	0.502	0.11
115_V	121_S	0.502	0.11
88_P	205_E	0.502	0.11
144_S	406_T	0.501	0.11
91_A	242_V	0.501	0.11
94_V	108_K	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2ycbA	2	0.9859	100	0.381	Contact Map
2xr1A	2	0.9656	100	0.384	Contact Map
3af5A	1	0.9812	100	0.391	Contact Map
2i7tA	1	0.6213	100	0.581	Contact Map
3iekA	3	0.6682	100	0.589	Contact Map
3bk2A	2	0.6244	100	0.617	Contact Map
3zq4A	3	0.6213	100	0.618	Contact Map
2i7xA	1	0.6698	100	0.646	Contact Map
2az4A	1	0.5915	100	0.694	Contact Map
5ahoA	1	0.4773	100	0.754	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0143 seconds.