Q7LXZ6 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q7LXZ6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q7LXZ6	Sequences: MTIIGNPEIGLYTGKLPKGCELCRLGGKLVLFITGECDDNCYYCPVSDDRFGKNKIFANETEVNNSMDVIYEAYRMKALGAGITGGDPILEIGRVIEIIEELKNEFGYDFHIHLYTTGRYVNDDIMRELVNAGLDEMRFHPVKELYLNAVKVALKYDIDIGLELPAIPNEKDKIVRLIKWAEENNVKFVNLNELELNSRNYLNLNSKGFHAKHGITGVEGSFETALDVLKKFEDNKKITVHYCSSIYKDLVETRTRFFRIIKYSSKPYEEYTNEATVVRAIVKTKGEIPILENFGESTGSDEYSISPSIVGDLLNDYTNLINEIYIVEEHPDSRRLRVGEKLIYSKSKNS	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	350 (314)
Sequences:	187 (137)
Seq/√Len:	7.7

HALSA - Q9HNC8
SULSO - Q7LXZ6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
103_K	135_D	4.386	0.98
81_A	110_F	3.892	0.96
99_I	134_L	3.482	0.93
159_D	187_K	3.462	0.93
306_S	310_V	3.289	0.91
17_P	87_D	3.165	0.89
222_F	242_Y	2.932	0.85
161_G	188_F	2.912	0.85
20_C	23_C	2.793	0.82
54_N	106_F	2.716	0.80
203_N	206_S	2.605	0.77
309_I	313_L	2.601	0.77
309_I	312_D	2.574	0.76
42_Y	209_F	2.568	0.76
171_K	227_D	2.474	0.73
87_D	329_E	2.464	0.73
34_T	91_E	2.455	0.73
133_G	185_N	2.431	0.72
146_Y	269_E	2.409	0.71
126_M	131_N	2.407	0.71
17_P	242_Y	2.339	0.69
221_S	248_K	2.314	0.68
38_D	117_T	2.236	0.65
75_R	229_L	2.177	0.63
74_Y	105_E	2.175	0.63
137_M	186_V	2.169	0.63
79_L	126_M	2.042	0.58
139_F	150_V	1.964	0.55
30_V	113_H	1.930	0.53
169_N	241_H	1.923	0.53
68_D	101_E	1.912	0.53
113_H	192_N	1.895	0.52
59_N	76_M	1.877	0.51
43_Y	225_A	1.869	0.51
160_I	168_P	1.846	0.50
123_D	155_K	1.841	0.50
45_P	80_G	1.837	0.50
126_M	130_V	1.780	0.47
35_G	204_L	1.754	0.46
17_P	139_F	1.753	0.46
211_A	217_G	1.735	0.46
191_L	284_T	1.725	0.45
140_H	192_N	1.717	0.45
74_Y	187_K	1.714	0.45
17_P	153_A	1.711	0.45
113_H	140_H	1.678	0.43
164_L	174_I	1.668	0.43
317_Y	321_I	1.663	0.43
164_L	191_L	1.643	0.42
87_D	90_L	1.642	0.42
98_I	216_T	1.635	0.42
291_L	294_F	1.621	0.41
126_M	218_V	1.610	0.41
139_F	153_A	1.607	0.40
257_F	330_H	1.600	0.40
30_V	140_H	1.587	0.40
79_L	111_H	1.575	0.39
19_G	28_K	1.568	0.39
126_M	156_Y	1.543	0.38
30_V	256_R	1.543	0.38
129_L	185_N	1.539	0.38
118_G	153_A	1.517	0.37
28_K	113_H	1.507	0.37
193_E	208_G	1.505	0.37
30_V	192_N	1.500	0.36
82_G	217_G	1.495	0.36
45_P	195_E	1.495	0.36
140_H	256_R	1.494	0.36
127_R	218_V	1.493	0.36
34_T	84_T	1.472	0.35
100_E	128_E	1.464	0.35
174_I	197_N	1.453	0.35
139_F	146_Y	1.450	0.35
113_H	195_E	1.445	0.34
95_V	255_T	1.444	0.34
63_V	69_V	1.420	0.33
68_D	259_R	1.416	0.33
83_I	164_L	1.403	0.33
150_V	166_A	1.402	0.33
300_S	315_N	1.395	0.33
121_V	126_M	1.382	0.32
175_V	227_D	1.368	0.32
138_R	190_N	1.367	0.32
115_Y	138_R	1.367	0.32
115_Y	190_N	1.367	0.32
19_G	188_F	1.366	0.32
14_G	240_V	1.352	0.31
19_G	80_G	1.344	0.31
162_L	181_A	1.340	0.31
313_L	326_I	1.338	0.31
31_L	80_G	1.337	0.31
65_N	207_K	1.333	0.30
150_V	196_L	1.327	0.30
23_C	26_G	1.325	0.30
20_C	26_G	1.325	0.30
17_P	90_L	1.320	0.30
96_I	289_P	1.316	0.30
77_K	101_E	1.316	0.30
83_I	99_I	1.304	0.29
113_H	188_F	1.298	0.29
225_A	327_V	1.281	0.29
171_K	175_V	1.279	0.29
42_Y	261_I	1.268	0.28
188_F	192_N	1.263	0.28
89_I	150_V	1.256	0.28
140_H	195_E	1.250	0.28
113_H	256_R	1.245	0.27
31_L	58_A	1.243	0.27
310_V	313_L	1.234	0.27
30_V	195_E	1.231	0.27
57_F	249_D	1.229	0.27
162_L	244_S	1.227	0.27
311_G	317_Y	1.213	0.26
147_L	172_D	1.209	0.26
192_N	195_E	1.207	0.26
19_G	23_C	1.199	0.26
306_S	324_I	1.199	0.26
97_E	122_N	1.197	0.26
113_H	161_G	1.189	0.26
33_I	146_Y	1.183	0.26
226_L	242_Y	1.180	0.25
21_E	27_G	1.173	0.25
53_K	67_M	1.173	0.25
192_N	256_R	1.167	0.25
153_A	160_I	1.164	0.25
162_L	209_F	1.163	0.25
47_S	58_A	1.156	0.25
181_A	208_G	1.154	0.25
69_V	197_N	1.152	0.25
191_L	282_V	1.151	0.25
161_G	192_N	1.151	0.25
126_M	152_V	1.131	0.24
77_K	263_Y	1.119	0.24
172_D	268_Y	1.117	0.24
196_L	250_L	1.113	0.23
19_G	35_G	1.110	0.23
80_G	195_E	1.109	0.23
105_E	296_E	1.107	0.23
118_G	232_F	1.106	0.23
304_S	314_L	1.094	0.23
162_L	222_F	1.091	0.23
52_G	166_A	1.077	0.22
237_K	271_Y	1.066	0.22
51_F	280_A	1.066	0.22
140_H	188_F	1.065	0.22
28_K	161_G	1.057	0.22
129_L	133_G	1.047	0.22
316_D	323_E	1.044	0.22
188_F	256_R	1.035	0.21
76_M	260_I	1.035	0.21
137_M	254_R	1.030	0.21
81_A	99_I	1.022	0.21
229_L	240_V	1.018	0.21
68_D	167_I	1.018	0.21
147_L	162_L	1.016	0.21
99_I	133_G	1.016	0.21
130_V	152_V	1.015	0.21
324_I	330_H	1.014	0.21
95_V	112_I	1.009	0.21
29_L	56_I	1.008	0.21
54_N	265_S	1.008	0.21
111_H	159_D	1.005	0.20
19_G	161_G	1.004	0.20
170_E	191_L	1.004	0.20
132_A	183_E	0.997	0.20
82_G	253_T	0.996	0.20
134_L	242_Y	0.993	0.20
166_A	194_L	0.987	0.20
72_E	111_H	0.983	0.20
102_L	112_I	0.977	0.20
111_H	132_A	0.976	0.20
93_G	288_I	0.974	0.20
247_Y	257_F	0.970	0.20
46_V	199_R	0.970	0.20
154_L	247_Y	0.960	0.19
60_E	195_E	0.958	0.19
139_F	191_L	0.955	0.19
33_I	305_I	0.954	0.19
133_G	221_S	0.954	0.19
21_E	150_V	0.947	0.19
96_I	123_D	0.946	0.19
29_L	33_I	0.945	0.19
110_F	244_S	0.926	0.18
83_I	95_V	0.923	0.18
134_L	196_L	0.920	0.18
35_G	45_P	0.919	0.18
46_V	113_H	0.918	0.18
118_G	139_F	0.917	0.18
140_H	161_G	0.917	0.18
30_V	249_D	0.911	0.18
35_G	256_R	0.906	0.18
93_G	123_D	0.906	0.18
195_E	254_R	0.903	0.18
14_G	87_D	0.902	0.18
46_V	192_N	0.901	0.18
229_L	327_V	0.901	0.18
240_V	258_F	0.900	0.18
110_F	220_G	0.898	0.18
255_T	325_Y	0.897	0.18
89_I	152_V	0.886	0.18
43_Y	161_G	0.884	0.17
167_I	209_F	0.884	0.17
42_Y	133_G	0.883	0.17
112_I	238_I	0.882	0.17
191_L	196_L	0.882	0.17
323_E	326_I	0.882	0.17
207_K	230_K	0.882	0.17
324_I	327_V	0.877	0.17
26_G	32_F	0.876	0.17
30_V	188_F	0.875	0.17
27_G	112_I	0.870	0.17
134_L	164_L	0.863	0.17
72_E	140_H	0.860	0.17
30_V	161_G	0.860	0.17
131_N	145_L	0.859	0.17
72_E	256_R	0.859	0.17
71_Y	189_V	0.851	0.17
43_Y	80_G	0.851	0.17
30_V	84_T	0.848	0.17
40_N	52_G	0.848	0.17
50_R	62_E	0.845	0.17
35_G	192_N	0.842	0.17
84_T	113_H	0.842	0.17
87_D	120_Y	0.827	0.16
171_K	228_V	0.825	0.16
81_A	121_V	0.818	0.16
53_K	194_L	0.814	0.16
45_P	275_A	0.812	0.16
197_N	247_Y	0.811	0.16
100_E	150_V	0.810	0.16
134_L	167_I	0.807	0.16
35_G	161_G	0.806	0.16
81_A	102_L	0.803	0.16
49_D	164_L	0.801	0.16
228_V	326_I	0.799	0.16
228_V	325_Y	0.794	0.15
279_R	307_P	0.789	0.15
50_R	59_N	0.788	0.15
100_E	264_S	0.787	0.15
60_E	256_R	0.780	0.15
209_F	262_K	0.774	0.15
27_G	279_R	0.770	0.15
84_T	254_R	0.770	0.15
242_Y	270_E	0.768	0.15
93_G	146_Y	0.763	0.15
52_G	208_G	0.762	0.15
24_R	95_V	0.762	0.15
247_Y	258_F	0.761	0.15
301_D	314_L	0.761	0.15
17_P	281_I	0.758	0.15
302_E	309_I	0.756	0.15
205_N	285_K	0.754	0.15
35_G	275_A	0.753	0.15
130_V	219_E	0.753	0.15
294_F	298_T	0.753	0.15
81_A	269_E	0.751	0.15
35_G	80_G	0.748	0.15
304_S	310_V	0.747	0.15
89_I	93_G	0.747	0.15
145_L	201_Y	0.746	0.14
98_I	189_V	0.746	0.14
67_M	227_D	0.744	0.14
59_N	256_R	0.741	0.14
38_D	151_K	0.741	0.14
131_N	185_N	0.737	0.14
137_M	148_N	0.737	0.14
195_E	256_R	0.737	0.14
35_G	113_H	0.736	0.14
285_K	326_I	0.735	0.14
126_M	231_K	0.734	0.14
34_T	195_E	0.734	0.14
132_A	196_L	0.733	0.14
80_G	275_A	0.733	0.14
33_I	291_L	0.729	0.14
29_L	101_E	0.723	0.14
261_I	280_A	0.721	0.14
123_D	209_F	0.719	0.14
35_G	195_E	0.712	0.14
17_P	118_G	0.712	0.14
247_Y	284_T	0.711	0.14
305_I	314_L	0.710	0.14
34_T	254_R	0.710	0.14
88_P	221_S	0.709	0.14
269_E	277_V	0.709	0.14
209_F	274_E	0.704	0.14
29_L	58_A	0.703	0.14
89_I	156_Y	0.703	0.14
35_G	198_S	0.695	0.14
84_T	220_G	0.695	0.14
57_F	223_E	0.692	0.13
28_K	195_E	0.692	0.13
314_L	327_V	0.690	0.13
78_A	81_A	0.689	0.13
110_F	269_E	0.688	0.13
177_L	268_Y	0.685	0.13
68_D	303_Y	0.683	0.13
34_T	282_V	0.680	0.13
172_D	266_K	0.675	0.13
45_P	140_H	0.673	0.13
114_L	167_I	0.672	0.13
35_G	188_F	0.671	0.13
196_L	216_T	0.669	0.13
28_K	192_N	0.667	0.13
241_H	251_V	0.667	0.13
95_V	306_S	0.667	0.13
100_E	183_E	0.666	0.13
141_P	276_T	0.665	0.13
30_V	45_P	0.664	0.13
50_R	256_R	0.662	0.13
259_R	276_T	0.661	0.13
302_E	313_L	0.661	0.13
97_E	218_V	0.661	0.13
60_E	249_D	0.660	0.13
117_T	120_Y	0.660	0.13
107_G	279_R	0.659	0.13
301_D	321_I	0.657	0.13
54_N	102_L	0.657	0.13
78_A	113_H	0.655	0.13
37_C	163_E	0.655	0.13
37_C	165_P	0.655	0.13
37_C	243_C	0.655	0.13
41_C	136_E	0.655	0.13
41_C	163_E	0.655	0.13
41_C	85_G	0.655	0.13
136_E	163_E	0.655	0.13
136_E	165_P	0.655	0.13
136_E	243_C	0.655	0.13
86_G	165_P	0.655	0.13
41_C	86_G	0.655	0.13
41_C	165_P	0.655	0.13
41_C	243_C	0.655	0.13
37_C	136_E	0.655	0.13
37_C	86_G	0.655	0.13
86_G	163_E	0.655	0.13
86_G	243_C	0.655	0.13
165_P	243_C	0.655	0.13
163_E	243_C	0.655	0.13
86_G	136_E	0.655	0.13
85_G	243_C	0.655	0.13
85_G	165_P	0.655	0.13
85_G	163_E	0.655	0.13
37_C	41_C	0.655	0.13
37_C	85_G	0.655	0.13
85_G	136_E	0.655	0.13
146_Y	247_Y	0.653	0.13
214_G	246_I	0.651	0.13
192_N	245_S	0.651	0.13
126_M	153_A	0.650	0.13
113_H	276_T	0.650	0.13
290_I	295_G	0.650	0.13
130_V	158_I	0.649	0.13
301_D	304_S	0.648	0.13
148_N	205_N	0.647	0.13
46_V	188_F	0.647	0.13
134_L	158_I	0.643	0.13
66_S	193_E	0.643	0.13
121_V	149_A	0.642	0.13
301_D	315_N	0.641	0.13
304_S	327_V	0.640	0.13
30_V	60_E	0.639	0.12
46_V	140_H	0.639	0.12
284_T	322_N	0.638	0.12
300_S	329_E	0.633	0.12
145_L	151_K	0.631	0.12
226_L	282_V	0.629	0.12
103_K	106_F	0.629	0.12
32_F	289_P	0.626	0.12
82_G	195_E	0.626	0.12
69_V	257_F	0.626	0.12
305_I	326_I	0.624	0.12
127_R	303_Y	0.622	0.12
100_E	176_R	0.621	0.12
192_N	257_F	0.620	0.12
148_N	207_K	0.618	0.12
167_I	186_V	0.618	0.12
132_A	221_S	0.614	0.12
304_S	308_S	0.613	0.12
46_V	280_A	0.612	0.12
51_F	98_I	0.611	0.12
97_E	137_M	0.611	0.12
121_V	166_A	0.609	0.12
207_K	227_D	0.604	0.12
168_P	187_K	0.600	0.12
305_I	323_E	0.599	0.12
139_F	324_I	0.598	0.12
271_Y	303_Y	0.597	0.12
99_I	112_I	0.596	0.12
39_D	114_L	0.596	0.12
159_D	186_V	0.594	0.12
68_D	230_K	0.594	0.12
89_I	121_V	0.592	0.12
146_Y	257_F	0.591	0.12
35_G	103_K	0.588	0.12
45_P	113_H	0.588	0.12
77_K	133_G	0.586	0.12
66_S	97_E	0.583	0.12
161_G	256_R	0.583	0.12
171_K	288_I	0.582	0.12
45_P	249_D	0.579	0.11
297_S	302_E	0.574	0.11
307_P	310_V	0.572	0.11
152_V	242_Y	0.571	0.11
130_V	173_K	0.569	0.11
304_S	321_I	0.568	0.11
87_D	153_A	0.568	0.11
27_G	259_R	0.567	0.11
28_K	60_E	0.567	0.11
73_A	312_D	0.566	0.11
130_V	157_D	0.561	0.11
120_Y	126_M	0.561	0.11
149_A	152_V	0.560	0.11
292_E	312_D	0.560	0.11
304_S	312_D	0.560	0.11
17_P	239_T	0.559	0.11
78_A	249_D	0.558	0.11
63_V	101_E	0.557	0.11
80_G	272_T	0.556	0.11
33_I	92_I	0.551	0.11
65_N	98_I	0.547	0.11
29_L	276_T	0.546	0.11
137_M	258_F	0.546	0.11
166_A	174_I	0.543	0.11
121_V	156_Y	0.543	0.11
314_L	326_I	0.542	0.11
89_I	114_L	0.541	0.11
67_M	71_Y	0.536	0.11
198_S	251_V	0.534	0.11
301_D	309_I	0.534	0.11
206_S	326_I	0.532	0.11
71_Y	124_D	0.530	0.11
28_K	188_F	0.528	0.11
30_V	80_G	0.526	0.11
44_C	136_E	0.526	0.11
44_C	86_G	0.526	0.11
44_C	165_P	0.526	0.11
44_C	85_G	0.526	0.11
44_C	243_C	0.526	0.11
44_C	163_E	0.526	0.11
41_C	44_C	0.526	0.11
37_C	44_C	0.526	0.11
287_E	295_G	0.523	0.11
196_L	221_S	0.522	0.11
104_N	144_E	0.521	0.11
121_V	142_V	0.520	0.11
197_N	253_T	0.519	0.11
293_N	309_I	0.519	0.11
57_F	141_P	0.518	0.11
193_E	274_E	0.517	0.10
210_H	217_G	0.517	0.10
113_H	257_F	0.517	0.10
127_R	224_T	0.516	0.10
224_T	291_L	0.514	0.10
229_L	264_S	0.514	0.10
75_R	151_K	0.513	0.10
36_E	306_S	0.513	0.10
70_I	181_A	0.511	0.10
84_T	135_D	0.510	0.10
61_T	72_E	0.509	0.10
305_I	327_V	0.508	0.10
43_Y	255_T	0.506	0.10
17_P	137_M	0.505	0.10
77_K	217_G	0.505	0.10
18_K	118_G	0.505	0.10
168_P	207_K	0.504	0.10
104_N	303_Y	0.503	0.10
28_K	140_H	0.502	0.10
302_E	326_I	0.502	0.10
92_I	198_S	0.502	0.10
62_E	183_E	0.502	0.10
60_E	113_H	0.500	0.10
30_V	43_Y	0.500	0.10

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3c8fA	1	0.6343	99.8	0.849	Contact Map
2yx0A	1	0.6743	99.7	0.862	Contact Map
1tv8A	2	0.8086	99.7	0.865	Contact Map
2a5hA	4	0.8057	99.7	0.866	Contact Map
4k36A	1	0.7171	99.7	0.872	Contact Map
4u0oB	1	0.6514	99.6	0.875	Contact Map
2z2uA	1	0.6143	99.6	0.876	Contact Map
3iixA	1	0.7657	99.6	0.876	Contact Map
1oltA	1	0.9286	99.5	0.882	Contact Map
3rfaA	1	0.68	99.5	0.883	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0106 seconds.