Q7LXZ3 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q7LXZ3 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q7LXZ3	Sequences: MPMTITILYLDIFLISKYIIRFVDQIYLAVALFLSFWLIIYVFRRRLEKYNLTVYPFFILWRKKSREYWFPKFSRSKGYRAYEKIALPIGFLLMIAGIVTILYIIIEMLTIKPNQTPTIALKPIIPGVTISISQLPYILLAIGVSVAIHEIFHALSATSNNVKVKNGGVLLLGIFPGAFVEPDEDDFNKSTSNAKLKIIAAGIVINLVLALIALPLSFELPYLPSALSQGIIIEGVLNNTPAANASLHTGDIIYSINGYRLTTLSQLHELLYNYSTITITLKHPNGSLSNVSVNIPNHFLGVYVTYYIPDYIAAILMFFTWLFIVNFSLAVFNAAPLIITDGGKLLTELLKRMLGESNGEKISYYLQSLFLLIFIFAIFLSNRPLG	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	386 (352)
Sequences:	277 (242)
Seq/√Len:	12.9

SULSO - Q7LXZ3

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
33_F	37_W	4.808	1.00
152_F	205_I	3.776	0.99
160_N	197_K	3.556	0.99
33_F	36_F	3.357	0.98
170_L	177_G	3.052	0.97
30_V	35_S	2.870	0.95
89_I	207_L	2.768	0.94
253_I	256_I	2.677	0.93
145_S	329_L	2.621	0.93
86_A	197_K	2.566	0.92
84_K	193_N	2.559	0.92
71_P	158_T	2.548	0.91
93_L	330_A	2.535	0.91
251_D	283_H	2.522	0.91
176_P	196_L	2.496	0.91
374_F	377_A	2.461	0.90
142_I	325_V	2.440	0.90
175_F	328_S	2.391	0.89
168_G	179_F	2.368	0.88
187_F	199_I	2.278	0.86
125_I	129_T	2.189	0.84
248_H	251_D	2.188	0.83
203_I	334_A	2.054	0.79
367_Q	374_F	1.994	0.77
236_V	245_A	1.958	0.76
54_V	132_I	1.950	0.75
47_L	61_W	1.927	0.75
36_F	40_I	1.920	0.74
166_N	181_E	1.915	0.74
66_R	74_S	1.908	0.74
30_V	34_L	1.902	0.74
138_I	142_I	1.898	0.73
147_A	293_V	1.864	0.72
183_D	208_V	1.851	0.71
86_A	160_N	1.848	0.71
177_G	328_S	1.803	0.69
195_K	348_E	1.789	0.69
62_R	181_E	1.788	0.69
34_L	37_W	1.787	0.69
175_F	324_I	1.779	0.68
201_A	336_P	1.767	0.68
70_F	164_V	1.746	0.67
259_Y	270_L	1.739	0.67
208_V	297_N	1.738	0.66
167_G	180_V	1.723	0.66
257_N	372_L	1.709	0.65
258_G	294_N	1.697	0.65
283_H	295_I	1.689	0.64
170_L	175_F	1.687	0.64
348_E	351_K	1.647	0.62
278_T	281_L	1.640	0.62
204_V	326_N	1.620	0.61
70_F	146_V	1.613	0.60
165_K	183_D	1.605	0.60
88_P	207_L	1.603	0.60
163_K	186_D	1.596	0.60
240_T	247_L	1.594	0.59
86_A	205_I	1.592	0.59
195_K	327_F	1.588	0.59
69_W	148_I	1.582	0.59
74_S	366_L	1.578	0.59
241_P	330_A	1.565	0.58
105_I	209_L	1.562	0.58
86_A	152_F	1.560	0.58
165_K	181_E	1.556	0.58
324_I	328_S	1.555	0.58
146_V	175_F	1.538	0.57
104_I	140_L	1.524	0.56
156_S	267_L	1.508	0.55
211_L	252_I	1.496	0.55
283_H	288_L	1.479	0.54
144_V	281_L	1.476	0.53
207_L	327_F	1.463	0.53
216_L	319_F	1.457	0.52
29_A	40_I	1.453	0.52
302_V	309_P	1.452	0.52
154_A	176_P	1.447	0.52
83_E	156_S	1.438	0.51
49_K	260_R	1.437	0.51
181_E	339_I	1.433	0.51
126_P	343_G	1.427	0.51
290_N	294_N	1.421	0.51
82_Y	86_A	1.418	0.50
160_N	196_L	1.408	0.50
63_K	67_E	1.396	0.49
109_L	261_L	1.396	0.49
30_V	43_F	1.392	0.49
200_A	345_L	1.389	0.49
339_I	343_G	1.383	0.49
302_V	305_T	1.382	0.49
86_A	187_F	1.379	0.48
138_I	328_S	1.377	0.48
300_L	304_V	1.372	0.48
246_S	334_A	1.368	0.48
96_A	375_I	1.347	0.47
101_I	340_T	1.344	0.47
48_E	233_I	1.332	0.46
139_L	318_F	1.324	0.46
84_K	197_K	1.323	0.46
29_A	32_L	1.319	0.45
346_L	374_F	1.316	0.45
335_A	340_T	1.314	0.45
285_N	291_V	1.306	0.45
233_I	256_I	1.304	0.45
127_G	230_G	1.286	0.44
256_I	360_E	1.286	0.44
181_E	343_G	1.260	0.42
367_Q	370_F	1.251	0.42
357_S	380_L	1.247	0.42
203_I	345_L	1.247	0.42
332_F	338_I	1.246	0.42
85_I	91_F	1.244	0.41
37_W	40_I	1.241	0.41
154_A	166_N	1.227	0.41
150_E	202_G	1.224	0.40
149_H	153_H	1.224	0.40
150_E	333_N	1.224	0.40
149_H	202_G	1.224	0.40
202_G	333_N	1.224	0.40
150_E	153_H	1.224	0.40
149_H	333_N	1.224	0.40
153_H	202_G	1.224	0.40
153_H	333_N	1.224	0.40
305_T	309_P	1.216	0.40
60_L	321_W	1.214	0.40
129_T	334_A	1.212	0.40
281_L	284_P	1.210	0.40
142_I	168_G	1.210	0.40
295_I	298_H	1.210	0.40
160_N	194_A	1.205	0.40
170_L	326_N	1.201	0.39
117_P	140_L	1.197	0.39
32_L	37_W	1.196	0.39
221_P	224_P	1.195	0.39
129_T	246_S	1.188	0.39
301_G	305_T	1.178	0.38
131_S	134_Q	1.173	0.38
236_V	261_L	1.170	0.38
130_I	158_T	1.169	0.38
278_T	282_K	1.159	0.37
72_K	76_S	1.158	0.37
134_Q	330_A	1.151	0.37
281_L	286_G	1.143	0.36
279_I	285_N	1.143	0.36
38_L	42_V	1.138	0.36
133_S	175_F	1.133	0.36
52_L	208_V	1.133	0.36
182_P	343_G	1.128	0.36
261_L	270_L	1.126	0.36
31_A	92_L	1.125	0.36
27_Y	33_F	1.123	0.36
292_S	295_I	1.117	0.35
129_T	270_L	1.113	0.35
88_P	369_L	1.111	0.35
160_N	176_P	1.107	0.35
187_F	198_I	1.100	0.34
62_R	321_W	1.098	0.34
140_L	212_I	1.097	0.34
165_K	321_W	1.096	0.34
75_R	362_I	1.096	0.34
35_S	42_V	1.096	0.34
111_I	114_N	1.094	0.34
73_F	85_I	1.088	0.34
288_L	291_V	1.086	0.34
185_D	287_S	1.077	0.33
28_L	33_F	1.070	0.33
216_L	252_I	1.069	0.33
177_G	340_T	1.061	0.33
374_F	381_S	1.058	0.32
202_G	342_G	1.057	0.32
333_N	341_D	1.057	0.32
333_N	342_G	1.057	0.32
149_H	342_G	1.057	0.32
202_G	341_D	1.057	0.32
149_H	341_D	1.057	0.32
153_H	341_D	1.057	0.32
153_H	342_G	1.057	0.32
150_E	342_G	1.057	0.32
150_E	341_D	1.057	0.32
278_T	290_N	1.054	0.32
278_T	283_H	1.043	0.32
33_F	40_I	1.035	0.31
171_L	319_F	1.033	0.31
74_S	251_D	1.022	0.31
124_I	250_G	1.016	0.31
198_I	285_N	1.013	0.30
176_P	240_T	1.013	0.30
184_E	301_G	1.012	0.30
322_L	348_E	1.009	0.30
140_L	260_R	1.008	0.30
90_G	334_A	1.006	0.30
63_K	66_R	1.006	0.30
47_L	51_N	1.004	0.30
138_I	330_A	1.004	0.30
280_T	315_I	1.002	0.30
199_I	258_G	0.990	0.29
149_H	206_N	0.989	0.29
150_E	206_N	0.989	0.29
153_H	206_N	0.989	0.29
206_N	333_N	0.989	0.29
202_G	206_N	0.989	0.29
209_L	215_P	0.987	0.29
75_R	276_T	0.986	0.29
62_R	331_V	0.985	0.29
70_F	261_L	0.976	0.29
130_I	345_L	0.974	0.29
87_L	256_I	0.972	0.29
132_I	274_Y	0.970	0.29
62_R	166_N	0.966	0.28
63_K	339_I	0.964	0.28
240_T	312_I	0.963	0.28
326_N	339_I	0.958	0.28
34_L	39_I	0.957	0.28
327_F	331_V	0.955	0.28
101_I	143_G	0.951	0.28
48_E	169_V	0.951	0.28
34_L	43_F	0.950	0.28
151_I	374_F	0.947	0.28
205_I	321_W	0.945	0.28
205_I	267_L	0.942	0.27
141_A	145_S	0.934	0.27
378_I	381_S	0.934	0.27
90_G	133_S	0.933	0.27
67_E	326_N	0.931	0.27
85_I	238_N	0.929	0.27
165_K	184_E	0.927	0.27
82_Y	200_A	0.921	0.27
324_I	332_F	0.918	0.26
38_L	95_I	0.916	0.26
373_I	382_N	0.915	0.26
141_A	154_A	0.915	0.26
82_Y	205_I	0.914	0.26
146_V	161_N	0.905	0.26
138_I	334_A	0.904	0.26
61_W	137_Y	0.901	0.26
30_V	39_I	0.898	0.26
258_G	321_W	0.897	0.26
141_A	209_L	0.896	0.26
279_I	373_I	0.893	0.25
283_H	286_G	0.890	0.25
145_S	154_A	0.888	0.25
101_I	197_K	0.887	0.25
259_Y	337_L	0.883	0.25
279_I	286_G	0.883	0.25
160_N	201_A	0.879	0.25
102_L	353_M	0.879	0.25
131_S	250_G	0.875	0.25
294_N	298_H	0.875	0.25
205_I	326_N	0.873	0.25
142_I	205_I	0.868	0.24
146_V	233_I	0.867	0.24
170_L	329_L	0.864	0.24
63_K	69_W	0.863	0.24
210_A	334_A	0.860	0.24
210_A	246_S	0.860	0.24
146_V	170_L	0.857	0.24
72_K	252_I	0.857	0.24
54_V	280_T	0.854	0.24
170_L	327_F	0.854	0.24
174_I	315_I	0.852	0.24
279_I	293_V	0.852	0.24
280_T	302_V	0.851	0.24
159_S	330_A	0.845	0.24
67_E	158_T	0.844	0.24
31_A	212_I	0.843	0.24
176_P	328_S	0.841	0.23
154_A	320_T	0.841	0.23
117_P	302_V	0.840	0.23
209_L	324_I	0.835	0.23
76_S	238_N	0.833	0.23
161_N	256_I	0.832	0.23
29_A	43_F	0.828	0.23
218_F	257_N	0.821	0.23
122_K	338_I	0.820	0.23
206_N	341_D	0.819	0.23
206_N	342_G	0.819	0.23
31_A	72_K	0.817	0.23
181_E	301_G	0.817	0.23
54_V	192_S	0.816	0.23
219_E	350_L	0.816	0.23
67_E	205_I	0.814	0.22
116_T	135_L	0.814	0.22
152_F	187_F	0.812	0.22
96_A	145_S	0.810	0.22
92_L	128_V	0.806	0.22
87_L	250_G	0.805	0.22
81_A	139_L	0.803	0.22
133_S	181_E	0.802	0.22
42_V	161_N	0.802	0.22
198_I	220_L	0.802	0.22
123_P	200_A	0.801	0.22
300_L	309_P	0.799	0.22
230_G	263_T	0.796	0.22
110_T	116_T	0.794	0.22
83_E	321_W	0.792	0.22
78_G	271_L	0.791	0.22
212_I	239_N	0.789	0.22
152_F	321_W	0.784	0.21
66_R	326_N	0.784	0.21
160_N	340_T	0.783	0.21
350_L	362_I	0.783	0.21
96_A	261_L	0.782	0.21
146_V	266_Q	0.781	0.21
156_S	345_L	0.781	0.21
181_E	327_F	0.780	0.21
30_V	33_F	0.779	0.21
328_S	337_L	0.777	0.21
242_A	321_W	0.776	0.21
146_V	323_F	0.774	0.21
94_M	239_N	0.770	0.21
180_V	339_I	0.769	0.21
239_N	362_I	0.767	0.21
128_V	163_K	0.764	0.21
93_L	337_L	0.762	0.21
129_T	139_L	0.762	0.21
239_N	243_A	0.762	0.21
28_L	315_I	0.759	0.21
112_K	349_L	0.759	0.21
63_K	334_A	0.758	0.20
131_S	142_I	0.757	0.20
172_L	199_I	0.756	0.20
152_F	204_V	0.752	0.20
82_Y	156_S	0.750	0.20
243_A	356_E	0.744	0.20
65_S	269_E	0.738	0.20
173_G	197_K	0.738	0.20
91_F	345_L	0.737	0.20
133_S	176_P	0.735	0.20
294_N	315_I	0.735	0.20
291_V	376_F	0.733	0.20
168_G	181_E	0.728	0.19
82_Y	204_V	0.728	0.19
162_V	198_I	0.727	0.19
325_V	330_A	0.727	0.19
92_L	95_I	0.724	0.19
249_T	369_L	0.723	0.19
78_G	144_V	0.717	0.19
34_L	38_L	0.716	0.19
175_F	191_T	0.713	0.19
221_P	251_D	0.711	0.19
157_A	251_D	0.710	0.19
191_T	263_T	0.709	0.19
61_W	122_K	0.708	0.19
137_Y	207_L	0.705	0.19
37_W	41_Y	0.704	0.19
161_N	315_I	0.701	0.19
290_N	298_H	0.699	0.19
246_S	346_L	0.692	0.18
239_N	252_I	0.689	0.18
139_L	328_S	0.689	0.18
28_L	39_I	0.688	0.18
368_S	372_L	0.688	0.18
249_T	299_F	0.687	0.18
297_N	378_I	0.685	0.18
179_F	336_P	0.685	0.18
59_I	126_P	0.684	0.18
61_W	94_M	0.681	0.18
78_G	91_F	0.679	0.18
328_S	340_T	0.679	0.18
57_F	131_S	0.677	0.18
270_L	285_N	0.676	0.18
200_A	284_P	0.676	0.18
333_N	336_P	0.672	0.18
71_P	203_I	0.672	0.18
149_H	336_P	0.672	0.18
150_E	336_P	0.672	0.18
153_H	336_P	0.672	0.18
202_G	336_P	0.672	0.18
146_V	177_G	0.671	0.18
170_L	340_T	0.667	0.18
76_S	208_V	0.665	0.18
148_I	329_L	0.665	0.18
69_W	315_I	0.662	0.17
52_L	256_I	0.661	0.17
79_Y	142_I	0.659	0.17
143_G	198_I	0.659	0.17
101_I	199_I	0.657	0.17
231_I	248_H	0.654	0.17
291_V	294_N	0.654	0.17
222_Y	226_A	0.653	0.17
218_F	362_I	0.653	0.17
29_A	33_F	0.653	0.17
142_I	195_K	0.652	0.17
128_V	318_F	0.651	0.17
282_K	285_N	0.650	0.17
126_P	206_N	0.645	0.17
275_S	368_S	0.644	0.17
129_T	167_G	0.644	0.17
166_N	343_G	0.642	0.17
210_A	350_L	0.641	0.17
162_V	186_D	0.639	0.17
217_S	370_F	0.638	0.17
38_L	44_R	0.636	0.17
142_I	247_L	0.635	0.17
72_K	239_N	0.635	0.17
125_I	381_S	0.634	0.17
169_V	338_I	0.634	0.17
42_V	89_I	0.631	0.17
41_Y	105_I	0.631	0.17
187_F	367_Q	0.630	0.16
231_I	237_L	0.628	0.16
102_L	219_E	0.627	0.16
205_I	242_A	0.626	0.16
301_G	321_W	0.626	0.16
373_I	381_S	0.626	0.16
198_I	352_R	0.625	0.16
70_F	151_I	0.623	0.16
125_I	327_F	0.616	0.16
139_L	171_L	0.616	0.16
83_E	175_F	0.615	0.16
220_L	228_S	0.613	0.16
165_K	339_I	0.611	0.16
363_S	376_F	0.611	0.16
123_P	377_A	0.610	0.16
72_K	358_N	0.609	0.16
157_A	176_P	0.608	0.16
28_L	34_L	0.606	0.16
27_Y	35_S	0.603	0.16
86_A	196_L	0.600	0.16
67_E	154_A	0.599	0.16
90_G	203_I	0.599	0.16
180_V	346_L	0.598	0.16
94_M	354_L	0.598	0.16
209_L	351_K	0.598	0.16
97_G	129_T	0.598	0.16
235_G	272_Y	0.597	0.16
35_S	38_L	0.596	0.16
208_V	325_V	0.596	0.16
191_T	256_I	0.595	0.16
152_F	326_N	0.595	0.16
83_E	200_A	0.592	0.15
368_S	377_A	0.590	0.15
62_R	335_A	0.589	0.15
148_I	322_L	0.588	0.15
233_I	249_T	0.587	0.15
265_S	281_L	0.586	0.15
246_S	259_Y	0.585	0.15
67_E	204_V	0.584	0.15
51_N	61_W	0.583	0.15
75_R	272_Y	0.583	0.15
152_F	182_P	0.582	0.15
35_S	157_A	0.580	0.15
136_P	213_A	0.577	0.15
212_I	323_F	0.577	0.15
112_K	208_V	0.575	0.15
271_L	304_V	0.574	0.15
127_G	147_A	0.574	0.15
31_A	39_I	0.572	0.15
85_I	382_N	0.571	0.15
144_V	213_A	0.570	0.15
151_I	208_V	0.569	0.15
172_L	197_K	0.569	0.15
179_F	195_K	0.569	0.15
73_F	79_Y	0.567	0.15
91_F	332_F	0.567	0.15
32_L	39_I	0.565	0.15
175_F	203_I	0.564	0.15
27_Y	30_V	0.564	0.15
196_L	203_I	0.563	0.15
61_W	164_V	0.561	0.15
164_V	218_F	0.561	0.15
178_A	329_L	0.560	0.15
82_Y	152_F	0.560	0.15
223_L	226_A	0.559	0.15
91_F	95_I	0.558	0.15
293_V	296_P	0.558	0.15
121_L	205_I	0.557	0.15
204_V	370_F	0.556	0.14
255_S	258_G	0.554	0.14
175_F	332_F	0.554	0.14
83_E	203_I	0.553	0.14
92_L	253_I	0.552	0.14
45_R	49_K	0.552	0.14
318_F	322_L	0.551	0.14
167_G	175_F	0.548	0.14
29_A	36_F	0.548	0.14
216_L	238_N	0.548	0.14
171_L	217_S	0.548	0.14
80_R	185_D	0.548	0.14
122_K	125_I	0.544	0.14
203_I	329_L	0.544	0.14
179_F	250_G	0.541	0.14
227_L	330_A	0.541	0.14
205_I	329_L	0.540	0.14
208_V	253_I	0.539	0.14
43_F	46_R	0.539	0.14
87_L	164_V	0.538	0.14
166_N	326_N	0.538	0.14
357_S	372_L	0.538	0.14
96_A	329_L	0.537	0.14
200_A	204_V	0.537	0.14
114_N	256_I	0.536	0.14
43_F	86_A	0.536	0.14
301_G	309_P	0.536	0.14
59_I	128_V	0.534	0.14
286_G	298_H	0.534	0.14
91_F	233_I	0.534	0.14
298_H	304_V	0.534	0.14
190_S	360_E	0.533	0.14
29_A	119_I	0.533	0.14
377_A	381_S	0.530	0.14
59_I	144_V	0.529	0.14
372_L	379_F	0.529	0.14
125_I	141_A	0.527	0.14
53_T	100_T	0.524	0.14
175_F	321_W	0.524	0.14
151_I	192_S	0.524	0.14
175_F	198_I	0.523	0.14
32_L	109_L	0.523	0.14
218_F	269_E	0.522	0.14
152_F	267_L	0.522	0.14
255_S	273_N	0.522	0.14
63_K	340_T	0.520	0.14
261_L	362_I	0.518	0.14
181_E	210_A	0.518	0.14
92_L	302_V	0.517	0.14
212_I	325_V	0.516	0.13
70_F	380_L	0.515	0.13
124_I	136_P	0.514	0.13
209_L	352_R	0.512	0.13
280_T	290_N	0.511	0.13
28_L	35_S	0.508	0.13
217_S	319_F	0.508	0.13
50_Y	182_P	0.505	0.13
299_F	304_V	0.505	0.13
155_L	169_V	0.505	0.13
88_P	97_G	0.503	0.13
38_L	357_S	0.500	0.13

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3b4rA	2	0.487	99.8	0.821	Contact Map
2vz5A	1	0.2668	99.1	0.883	Contact Map
1v5lA	1	0.2591	99.1	0.885	Contact Map
3i18A	1	0.2228	98.9	0.895	Contact Map
2kl1A	1	0.1995	98.8	0.898	Contact Map
2hgaA	1	0.2461	98.7	0.9	Contact Map
1v5qA	1	0.3005	98.7	0.9	Contact Map
2kjpA	1	0.2098	98.7	0.9	Contact Map
2i4sA	1	0.2642	98.7	0.901	Contact Map
2zpmA	2	0.1865	98.7	0.901	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.011 seconds.