Q7LXU1 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q7LXU1 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q7LXU1	Sequences: MGIRILNDLMLDKSALLFGVSKYLEKGIITGNILIHKSLLAELEKESNDGLVSAEIALDEVKKLKDITERILVNFEIVGENSKKGEANELSREYCLEKGCIMVTADETQKKICDVMGIQYSFLQPLEQSLSFESFFDDETMSLHIKEDTVPRAKKGKPGNWKFVNLSNKPMLSVDVKRIANEIINGVRFIKGSFIEIERKGSLIIQLGNYRVVITRPPLSDGWEITITRPVVRKRLEDYGLDERLIKRLEERAEGIIIAGAPGMGKTTFAQALSEYYMRLGKIVKTIESPRDMHLPPEITQYSKNYAEIGELHDILLLSRPDYTVYDEMRNDEDFKLYIDLRLAGIGMVGVVHATSPIDAIHRFVNRVDIGTIPNILDTIIFINSGNVSKVYTLEITVKVPAGLKEADLARPVVEIKDLVTGNTEYEIYVFGEQTMIVPVNRGITLNNMEFKISKIVNNIIPKATVKYEDGEYVIVIPKEEIGKYNRKLVQRLKRLEKKNNIKIKIKLSD	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	510 (500)
Sequences:	155 (114)
Seq/√Len:	5.1

HALSA - Q9HMB8
SULSO - Q7LXU1

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
258_I	270_A	6.122	0.99
390_K	425_E	5.435	0.98
269_F	383_I	3.721	0.86
135_F	167_S	3.003	0.71
267_T	293_M	2.894	0.68
253_A	277_Y	2.849	0.67
402_A	415_E	2.705	0.63
415_E	424_T	2.607	0.60
31_G	259_A	2.601	0.60
145_I	151_P	2.580	0.59
17_L	33_I	2.563	0.58
108_T	112_I	2.532	0.57
287_I	309_I	2.517	0.57
254_E	277_Y	2.492	0.56
90_L	205_I	2.472	0.55
234_K	431_F	2.461	0.55
204_I	404_L	2.448	0.55
158_P	253_A	2.438	0.54
289_S	303_S	2.415	0.54
132_F	227_I	2.405	0.53
453_I	475_I	2.391	0.53
326_Y	331_N	2.388	0.53
241_L	388_V	2.328	0.51
158_P	277_Y	2.319	0.50
158_P	254_E	2.308	0.50
199_R	311_E	2.279	0.49
456_I	476_V	2.223	0.47
287_I	312_L	2.186	0.46
135_F	179_I	2.153	0.45
307_A	388_V	2.097	0.43
234_K	364_F	2.075	0.43
17_L	184_I	2.030	0.41
158_P	282_K	2.028	0.41
366_N	369_D	2.014	0.41
293_M	319_S	2.013	0.41
137_D	155_K	2.003	0.40
289_S	304_K	1.975	0.39
16_L	62_K	1.971	0.39
172_L	175_D	1.959	0.39
387_N	485_Y	1.953	0.39
167_S	172_L	1.926	0.38
383_I	388_V	1.924	0.38
434_Q	460_I	1.916	0.38
65_K	381_I	1.899	0.37
402_A	424_T	1.888	0.37
62_K	114_D	1.877	0.36
168_N	421_T	1.872	0.36
277_Y	282_K	1.854	0.36
34_L	55_E	1.846	0.35
35_I	184_I	1.833	0.35
147_E	197_I	1.826	0.35
449_M	488_K	1.814	0.34
307_A	325_V	1.791	0.34
82_S	85_G	1.790	0.34
16_L	440_V	1.786	0.34
281_G	424_T	1.780	0.33
216_R	496_L	1.768	0.33
166_L	210_Y	1.758	0.33
119_Q	195_I	1.748	0.33
10_M	100_C	1.745	0.32
102_M	182_E	1.743	0.32
33_I	184_I	1.710	0.31
42_E	48_N	1.696	0.31
487_R	490_V	1.692	0.31
249_L	275_E	1.691	0.31
155_K	213_V	1.680	0.31
244_R	277_Y	1.677	0.31
163_F	283_I	1.674	0.30
304_K	318_L	1.658	0.30
16_L	114_D	1.652	0.30
287_I	341_L	1.638	0.29
13_K	88_N	1.610	0.29
259_A	499_K	1.606	0.29
254_E	282_K	1.590	0.28
65_K	105_A	1.588	0.28
183_I	214_I	1.587	0.28
237_E	279_R	1.583	0.28
460_I	496_L	1.578	0.28
336_K	424_T	1.567	0.28
63_K	66_D	1.564	0.27
147_E	199_R	1.559	0.27
192_G	416_I	1.555	0.27
135_F	171_M	1.543	0.27
269_F	358_I	1.540	0.27
8_D	388_V	1.536	0.27
81_N	86_E	1.526	0.26
225_I	413_V	1.520	0.26
232_V	326_Y	1.510	0.26
233_R	315_I	1.501	0.26
70_R	99_G	1.499	0.26
141_M	272_A	1.482	0.25
149_T	172_L	1.477	0.25
329_M	364_F	1.473	0.25
158_P	177_K	1.472	0.25
332_D	346_I	1.472	0.25
118_I	393_T	1.465	0.25
101_I	119_Q	1.461	0.25
241_L	381_I	1.461	0.25
57_A	115_V	1.454	0.25
251_E	426_Y	1.453	0.25
160_N	465_T	1.448	0.25
16_L	65_K	1.447	0.25
109_Q	497_E	1.445	0.24
304_K	341_L	1.444	0.24
364_F	435_T	1.443	0.24
64_L	502_I	1.440	0.24
142_S	429_Y	1.438	0.24
105_A	392_Y	1.432	0.24
42_E	88_N	1.428	0.24
242_D	420_V	1.418	0.24
128_Q	453_I	1.415	0.24
249_L	311_E	1.409	0.24
46_E	87_A	1.406	0.24
304_K	438_V	1.406	0.24
16_L	160_N	1.405	0.24
326_Y	341_L	1.403	0.23
380_I	439_P	1.403	0.23
35_I	110_K	1.399	0.23
15_A	123_L	1.399	0.23
253_A	282_K	1.389	0.23
118_I	181_N	1.385	0.23
45_K	431_F	1.381	0.23
20_V	220_S	1.380	0.23
82_S	87_A	1.378	0.23
391_V	425_E	1.374	0.23
58_L	466_V	1.371	0.23
267_T	435_T	1.371	0.23
319_S	493_L	1.370	0.23
219_L	346_I	1.364	0.23
16_L	61_V	1.363	0.23
102_M	210_Y	1.363	0.23
219_L	319_S	1.361	0.23
137_D	140_T	1.359	0.22
147_E	289_S	1.359	0.22
183_I	460_I	1.358	0.22
213_V	341_L	1.356	0.22
41_A	86_E	1.348	0.22
110_K	114_D	1.348	0.22
110_K	120_Y	1.347	0.22
24_L	33_I	1.342	0.22
325_V	496_L	1.341	0.22
148_D	426_Y	1.341	0.22
35_I	469_E	1.338	0.22
36_H	219_L	1.336	0.22
42_E	87_A	1.333	0.22
158_P	273_L	1.322	0.22
369_D	373_I	1.318	0.22
233_R	275_E	1.314	0.21
35_I	381_I	1.312	0.21
39_L	325_V	1.309	0.21
43_L	57_A	1.306	0.21
366_N	477_I	1.305	0.21
80_E	247_K	1.305	0.21
75_F	168_N	1.297	0.21
172_L	179_I	1.293	0.21
125_P	393_T	1.291	0.21
146_K	222_G	1.289	0.21
172_L	388_V	1.287	0.21
99_G	233_R	1.285	0.21
417_K	424_T	1.278	0.21
207_L	214_I	1.278	0.21
381_I	507_K	1.277	0.21
24_L	388_V	1.272	0.21
171_M	261_A	1.270	0.21
289_S	433_E	1.269	0.20
219_L	487_R	1.268	0.20
295_L	486_N	1.264	0.20
43_L	339_I	1.257	0.20
204_I	306_Y	1.257	0.20
123_L	376_I	1.253	0.20
457_V	502_I	1.245	0.20
303_S	337_L	1.238	0.20
43_L	326_Y	1.236	0.20
13_K	91_S	1.233	0.20
102_M	188_R	1.229	0.20
183_I	207_L	1.225	0.20
237_E	382_F	1.223	0.20
31_G	125_P	1.222	0.20
137_D	232_V	1.222	0.20
215_T	341_L	1.213	0.19
202_S	295_L	1.213	0.19
53_S	308_E	1.211	0.19
219_L	305_N	1.209	0.19
58_L	349_V	1.206	0.19
289_S	361_I	1.200	0.19
65_K	276_Y	1.200	0.19
331_N	341_L	1.197	0.19
254_E	273_L	1.196	0.19
257_I	380_I	1.196	0.19
436_M	477_I	1.195	0.19
264_M	434_Q	1.194	0.19
222_G	417_K	1.193	0.19
369_D	391_V	1.180	0.19
59_D	189_F	1.176	0.19
361_I	470_D	1.176	0.19
273_L	338_Y	1.170	0.18
473_Y	502_I	1.170	0.18
75_F	102_M	1.168	0.18
173_S	242_D	1.161	0.18
404_L	438_V	1.158	0.18
99_G	103_V	1.157	0.18
303_S	438_V	1.150	0.18
80_E	93_E	1.146	0.18
33_I	68_T	1.142	0.18
35_I	236_L	1.137	0.18
18_F	33_I	1.136	0.18
310_G	332_D	1.132	0.18
377_L	435_T	1.131	0.18
42_E	497_E	1.131	0.18
276_Y	392_Y	1.131	0.18
253_A	273_L	1.128	0.18
11_L	488_K	1.128	0.18
180_A	205_I	1.126	0.18
313_H	319_S	1.125	0.18
92_R	109_Q	1.123	0.18
307_A	505_K	1.123	0.18
11_L	44_E	1.122	0.18
112_I	475_I	1.116	0.17
10_M	112_I	1.116	0.17
210_Y	468_Y	1.113	0.17
81_N	85_G	1.108	0.17
44_E	92_R	1.107	0.17
466_V	473_Y	1.106	0.17
219_L	312_L	1.098	0.17
10_M	225_I	1.098	0.17
71_I	120_Y	1.094	0.17
237_E	467_K	1.093	0.17
297_P	308_E	1.092	0.17
213_V	436_M	1.089	0.17
38_S	457_V	1.083	0.17
163_F	434_Q	1.078	0.17
42_E	79_G	1.076	0.17
172_L	199_R	1.076	0.17
384_N	394_L	1.073	0.17
120_Y	132_F	1.073	0.17
349_V	425_E	1.072	0.17
193_S	208_G	1.072	0.17
213_V	505_K	1.071	0.17
103_V	329_M	1.066	0.16
38_S	85_G	1.066	0.16
197_I	289_S	1.065	0.16
22_K	498_K	1.062	0.16
95_C	362_H	1.059	0.16
20_V	43_L	1.053	0.16
142_S	409_L	1.051	0.16
409_L	429_Y	1.051	0.16
35_I	231_V	1.050	0.16
183_I	205_I	1.050	0.16
362_H	372_T	1.046	0.16
310_G	339_I	1.041	0.16
305_N	319_S	1.040	0.16
271_Q	295_L	1.040	0.16
29_I	33_I	1.039	0.16
43_L	112_I	1.036	0.16
431_F	438_V	1.036	0.16
293_M	305_N	1.036	0.16
174_V	252_R	1.034	0.16
364_F	502_I	1.032	0.16
213_V	338_Y	1.032	0.16
31_G	474_V	1.029	0.16
158_P	415_E	1.029	0.16
179_I	283_I	1.028	0.16
246_I	277_Y	1.026	0.16
9_L	450_E	1.026	0.16
279_R	341_L	1.025	0.16
48_N	79_G	1.024	0.16
356_S	434_Q	1.024	0.16
414_V	436_M	1.020	0.16
9_L	208_G	1.020	0.16
176_V	182_E	1.015	0.16
13_K	46_E	1.015	0.16
144_H	429_Y	1.014	0.16
377_L	384_N	1.014	0.16
324_T	434_Q	1.013	0.16
103_V	176_V	1.011	0.16
172_L	453_I	1.010	0.16
346_I	479_K	1.009	0.15
252_R	426_Y	1.005	0.15
58_L	502_I	1.005	0.15
272_A	355_T	1.003	0.15
133_E	198_E	1.001	0.15
202_S	432_G	1.000	0.15
249_L	357_P	0.999	0.15
85_G	91_S	0.999	0.15
139_E	460_I	0.994	0.15
75_F	86_E	0.992	0.15
48_N	81_N	0.990	0.15
346_I	404_L	0.980	0.15
305_N	490_V	0.978	0.15
132_F	264_M	0.978	0.15
46_E	91_S	0.977	0.15
137_D	271_Q	0.976	0.15
418_D	421_T	0.975	0.15
473_Y	496_L	0.972	0.15
365_V	477_I	0.970	0.15
118_I	183_I	0.970	0.15
366_N	436_M	0.970	0.15
287_I	319_S	0.967	0.15
261_A	271_Q	0.966	0.15
416_I	496_L	0.959	0.15
134_S	280_L	0.958	0.15
44_E	287_I	0.957	0.15
273_L	282_K	0.957	0.15
37_K	490_V	0.957	0.15
120_Y	440_V	0.956	0.15
161_W	434_Q	0.952	0.15
202_S	404_L	0.952	0.15
245_L	419_L	0.952	0.15
137_D	357_P	0.951	0.15
371_G	378_D	0.950	0.15
51_L	394_L	0.948	0.14
38_S	91_S	0.945	0.14
250_E	280_L	0.945	0.14
79_G	91_S	0.944	0.14
305_N	312_L	0.943	0.14
287_I	332_D	0.939	0.14
326_Y	434_Q	0.937	0.14
11_L	257_I	0.936	0.14
40_L	166_L	0.934	0.14
400_V	404_L	0.933	0.14
179_I	357_P	0.933	0.14
215_T	331_N	0.926	0.14
94_Y	325_V	0.925	0.14
45_K	385_S	0.922	0.14
70_R	256_I	0.921	0.14
147_E	222_G	0.920	0.14
293_M	312_L	0.919	0.14
432_G	437_I	0.918	0.14
66_D	231_V	0.917	0.14
234_K	326_Y	0.917	0.14
132_F	343_L	0.917	0.14
14_S	79_G	0.915	0.14
99_G	119_Q	0.910	0.14
312_L	341_L	0.910	0.14
326_Y	377_L	0.904	0.14
141_M	217_P	0.904	0.14
21_S	483_G	0.900	0.14
144_H	409_L	0.900	0.14
138_D	192_G	0.899	0.14
63_K	256_I	0.898	0.14
287_I	346_I	0.897	0.14
85_G	109_Q	0.896	0.14
343_L	355_T	0.894	0.14
202_S	493_L	0.892	0.14
378_D	409_L	0.892	0.14
175_D	207_L	0.891	0.14
57_A	105_A	0.890	0.14
91_S	109_Q	0.889	0.14
303_S	361_I	0.887	0.14
72_L	75_F	0.886	0.14
105_A	215_T	0.886	0.14
310_G	407_A	0.884	0.13
264_M	355_T	0.882	0.13
192_G	259_A	0.882	0.13
325_V	349_V	0.877	0.13
303_S	326_Y	0.872	0.13
46_E	88_N	0.865	0.13
232_V	303_S	0.865	0.13
40_L	493_L	0.865	0.13
91_S	490_V	0.864	0.13
269_F	409_L	0.863	0.13
207_L	210_Y	0.862	0.13
397_T	437_I	0.862	0.13
140_T	436_M	0.859	0.13
497_E	506_I	0.859	0.13
339_I	487_R	0.857	0.13
397_T	433_E	0.856	0.13
256_I	432_G	0.855	0.13
48_N	91_S	0.855	0.13
190_I	208_G	0.851	0.13
244_R	254_E	0.848	0.13
304_K	326_Y	0.847	0.13
251_E	383_I	0.846	0.13
134_S	192_G	0.846	0.13
364_F	377_L	0.845	0.13
408_D	477_I	0.844	0.13
57_A	329_M	0.842	0.13
261_A	471_G	0.842	0.13
283_I	388_V	0.839	0.13
267_T	319_S	0.838	0.13
332_D	367_R	0.837	0.13
39_L	89_E	0.836	0.13
271_Q	435_T	0.835	0.13
113_C	421_T	0.833	0.13
387_N	422_G	0.832	0.13
375_N	435_T	0.830	0.13
148_D	357_P	0.829	0.13
219_L	302_Y	0.829	0.13
109_Q	201_G	0.827	0.13
312_L	319_S	0.824	0.13
21_S	349_V	0.822	0.13
119_Q	184_I	0.819	0.13
398_V	409_L	0.815	0.12
264_M	435_T	0.813	0.12
61_V	501_N	0.813	0.12
48_N	87_A	0.813	0.12
83_K	381_I	0.811	0.12
150_V	276_Y	0.811	0.12
64_L	151_P	0.811	0.12
253_A	376_I	0.807	0.12
383_I	434_Q	0.806	0.12
259_A	382_F	0.806	0.12
400_V	408_D	0.806	0.12
101_I	458_N	0.805	0.12
118_I	256_I	0.804	0.12
111_K	455_K	0.803	0.12
75_F	191_K	0.798	0.12
272_A	503_K	0.797	0.12
15_A	97_E	0.795	0.12
259_A	276_Y	0.795	0.12
213_V	420_V	0.794	0.12
19_G	92_R	0.793	0.12
105_A	276_Y	0.791	0.12
79_G	85_G	0.790	0.12
453_I	463_K	0.789	0.12
129_S	210_Y	0.786	0.12
149_T	152_R	0.786	0.12
98_K	238_D	0.785	0.12
80_E	243_E	0.784	0.12
225_I	264_M	0.784	0.12
88_N	91_S	0.779	0.12
361_I	457_V	0.778	0.12
315_I	390_K	0.778	0.12
287_I	367_R	0.776	0.12
11_L	61_V	0.776	0.12
97_E	227_I	0.776	0.12
53_S	326_Y	0.773	0.12
346_I	420_V	0.773	0.12
142_S	378_D	0.772	0.12
378_D	429_Y	0.772	0.12
85_G	490_V	0.771	0.12
32_N	74_N	0.770	0.12
380_I	425_E	0.770	0.12
154_K	379_T	0.765	0.12
135_F	310_G	0.762	0.12
20_V	52_V	0.762	0.12
71_I	198_E	0.761	0.12
295_L	306_Y	0.760	0.12
223_W	496_L	0.759	0.12
452_K	488_K	0.759	0.12
42_E	46_E	0.759	0.12
488_K	499_K	0.758	0.12
204_I	431_F	0.758	0.12
373_I	414_V	0.757	0.12
132_F	440_V	0.754	0.12
84_K	258_I	0.753	0.12
267_T	346_I	0.753	0.12
144_H	154_K	0.752	0.12
227_I	485_Y	0.752	0.12
192_G	208_G	0.752	0.12
54_A	91_S	0.749	0.12
390_K	439_P	0.747	0.12
46_E	490_V	0.747	0.12
456_I	460_I	0.745	0.11
252_R	474_V	0.744	0.11
272_A	358_I	0.742	0.11
153_A	258_I	0.742	0.11
83_K	193_S	0.740	0.11
94_Y	223_W	0.739	0.11
295_L	305_N	0.738	0.11
451_F	502_I	0.736	0.11
37_K	332_D	0.735	0.11
313_H	341_L	0.735	0.11
257_I	349_V	0.734	0.11
343_L	431_F	0.733	0.11
48_N	309_I	0.733	0.11
359_D	373_I	0.732	0.11
21_S	35_I	0.732	0.11
235_R	388_V	0.732	0.11
42_E	109_Q	0.727	0.11
187_V	228_T	0.727	0.11
362_H	369_D	0.725	0.11
207_L	494_K	0.724	0.11
114_D	162_K	0.724	0.11
267_T	493_L	0.723	0.11
46_E	487_R	0.720	0.11
35_I	462_P	0.719	0.11
142_S	324_T	0.719	0.11
324_T	429_Y	0.719	0.11
61_V	105_A	0.717	0.11
309_I	331_N	0.715	0.11
189_F	435_T	0.715	0.11
396_I	438_V	0.713	0.11
54_A	57_A	0.713	0.11
293_M	435_T	0.712	0.11
338_Y	341_L	0.711	0.11
370_I	373_I	0.711	0.11
201_G	302_Y	0.711	0.11
313_H	331_N	0.710	0.11
311_E	319_S	0.709	0.11
82_S	113_C	0.709	0.11
55_E	122_F	0.708	0.11
279_R	405_K	0.707	0.11
19_G	205_I	0.707	0.11
31_G	78_V	0.705	0.11
99_G	471_G	0.703	0.11
264_M	356_S	0.700	0.11
142_S	398_V	0.699	0.11
398_V	429_Y	0.699	0.11
261_A	394_L	0.698	0.11
251_E	323_Y	0.697	0.11
309_I	367_R	0.697	0.11
19_G	109_Q	0.696	0.11
210_Y	438_V	0.695	0.11
381_I	393_T	0.695	0.11
87_A	91_S	0.693	0.11
405_K	453_I	0.692	0.11
277_Y	396_I	0.691	0.11
161_W	311_E	0.691	0.11
85_G	400_V	0.690	0.11
217_P	272_A	0.688	0.11
292_D	371_G	0.688	0.11
220_S	388_V	0.688	0.11
124_Q	166_L	0.688	0.11
305_N	337_L	0.687	0.11
44_E	367_R	0.687	0.11
341_L	438_V	0.686	0.11
295_L	339_I	0.686	0.11
389_S	423_N	0.685	0.11
90_L	311_E	0.685	0.11
17_L	376_I	0.683	0.11
64_L	352_V	0.683	0.11
110_K	150_V	0.681	0.11
398_V	433_E	0.680	0.11
95_C	100_C	0.679	0.11
111_K	227_I	0.678	0.11
67_I	276_Y	0.676	0.11
123_L	414_V	0.675	0.11
150_V	170_P	0.673	0.11
21_S	34_L	0.673	0.11
17_L	329_M	0.671	0.11
119_Q	174_V	0.671	0.11
54_A	95_C	0.671	0.11
138_D	232_V	0.670	0.11
202_S	433_E	0.670	0.11
257_I	264_M	0.670	0.11
378_D	408_D	0.670	0.11
179_I	393_T	0.667	0.10
34_L	78_V	0.666	0.10
13_K	487_R	0.663	0.10
210_Y	396_I	0.662	0.10
314_D	324_T	0.662	0.10
396_I	404_L	0.662	0.10
54_A	370_I	0.661	0.10
175_D	281_G	0.660	0.10
48_N	82_S	0.659	0.10
221_D	474_V	0.659	0.10
41_A	434_Q	0.656	0.10
182_E	185_N	0.655	0.10
164_V	448_N	0.653	0.10
329_M	341_L	0.653	0.10
131_S	134_S	0.652	0.10
77_I	105_A	0.651	0.10
91_S	487_R	0.651	0.10
245_L	383_I	0.651	0.10
135_F	339_I	0.650	0.10
164_V	170_P	0.650	0.10
67_I	114_D	0.649	0.10
323_Y	431_F	0.649	0.10
39_L	90_L	0.646	0.10
44_E	309_I	0.644	0.10
42_E	91_S	0.644	0.10
144_H	371_G	0.643	0.10
99_G	215_T	0.642	0.10
48_N	228_T	0.640	0.10
38_S	81_N	0.640	0.10
365_V	506_I	0.638	0.10
477_I	506_I	0.638	0.10
310_G	325_V	0.637	0.10
219_L	337_L	0.637	0.10
48_N	85_G	0.635	0.10
38_S	109_Q	0.634	0.10
231_V	494_K	0.634	0.10
277_Y	462_P	0.633	0.10
146_K	220_S	0.633	0.10
152_R	179_I	0.633	0.10
48_N	375_N	0.632	0.10
331_N	337_L	0.632	0.10
10_M	14_S	0.631	0.10
324_T	355_T	0.629	0.10
13_K	490_V	0.628	0.10
100_C	228_T	0.627	0.10
122_F	179_I	0.627	0.10
311_E	337_L	0.626	0.10
41_A	361_I	0.625	0.10
293_M	493_L	0.624	0.10
116_M	312_L	0.624	0.10
267_T	337_L	0.623	0.10
143_L	410_A	0.623	0.10
53_S	186_G	0.623	0.10
90_L	188_R	0.623	0.10
307_A	319_S	0.623	0.10
68_T	466_V	0.622	0.10
61_V	103_V	0.622	0.10
10_M	473_Y	0.622	0.10
250_E	376_I	0.621	0.10
219_L	287_I	0.620	0.10
220_S	283_I	0.620	0.10
191_K	243_E	0.619	0.10
261_A	434_Q	0.619	0.10
398_V	426_Y	0.619	0.10
16_L	123_L	0.618	0.10
62_K	455_K	0.618	0.10
441_N	453_I	0.618	0.10
159_G	409_L	0.617	0.10
103_V	193_S	0.616	0.10
161_W	319_S	0.616	0.10
13_K	95_C	0.615	0.10
416_I	425_E	0.614	0.10
237_E	259_A	0.614	0.10
276_Y	407_A	0.613	0.10
271_Q	304_K	0.612	0.10
58_L	112_I	0.611	0.10
246_I	435_T	0.611	0.10
244_R	253_A	0.611	0.10
202_S	293_M	0.610	0.10
169_K	444_I	0.610	0.10
203_L	223_W	0.610	0.10
195_I	423_N	0.610	0.10
245_L	415_E	0.610	0.10
316_L	439_P	0.609	0.10
434_Q	482_I	0.609	0.10
457_V	475_I	0.608	0.10
63_K	488_K	0.607	0.10
21_S	504_I	0.606	0.10
26_K	503_K	0.606	0.10
304_K	406_E	0.605	0.10
305_N	493_L	0.603	0.10
171_M	210_Y	0.603	0.10
435_T	442_R	0.601	0.10
161_W	256_I	0.601	0.10
215_T	220_S	0.599	0.10
450_E	454_S	0.599	0.10
195_I	447_N	0.599	0.10
175_D	451_F	0.599	0.10
101_I	467_K	0.598	0.10
358_I	383_I	0.598	0.10
277_Y	375_N	0.596	0.10
193_S	498_K	0.596	0.10
59_D	233_R	0.595	0.10
393_T	456_I	0.594	0.10
167_S	444_I	0.594	0.10
180_A	492_R	0.586	0.10
33_I	194_F	0.586	0.10
33_I	168_N	0.585	0.10
219_L	311_E	0.585	0.10
368_V	381_I	0.585	0.10
64_L	452_K	0.585	0.10
366_N	408_D	0.582	0.09
185_N	416_I	0.582	0.09
40_L	121_S	0.580	0.09
209_N	503_K	0.580	0.09
293_M	356_S	0.580	0.09
47_S	416_I	0.580	0.09
11_L	14_S	0.578	0.09
337_L	505_K	0.578	0.09
244_R	256_I	0.577	0.09
434_Q	497_E	0.576	0.09
443_G	467_K	0.576	0.09
436_M	439_P	0.575	0.09
273_L	277_Y	0.573	0.09
282_K	415_E	0.573	0.09
205_I	475_I	0.570	0.09
415_E	462_P	0.569	0.09
198_E	278_M	0.569	0.09
37_K	310_G	0.568	0.09
144_H	378_D	0.568	0.09
167_S	171_M	0.568	0.09
271_Q	358_I	0.567	0.09
490_V	493_L	0.564	0.09
9_L	252_R	0.563	0.09
296_P	407_A	0.563	0.09
10_M	185_N	0.563	0.09
264_M	271_Q	0.561	0.09
17_L	299_I	0.561	0.09
219_L	295_L	0.561	0.09
355_T	376_I	0.559	0.09
222_G	296_P	0.558	0.09
305_N	313_H	0.557	0.09
52_V	220_S	0.556	0.09
219_L	293_M	0.555	0.09
303_S	313_H	0.553	0.09
315_I	432_G	0.553	0.09
86_E	244_R	0.553	0.09
358_I	409_L	0.552	0.09
356_S	414_V	0.551	0.09
68_T	174_V	0.549	0.09
227_I	309_I	0.548	0.09
15_A	163_F	0.547	0.09
168_N	172_L	0.546	0.09
275_E	355_T	0.545	0.09
453_I	458_N	0.545	0.09
277_Y	464_A	0.542	0.09
142_S	159_G	0.541	0.09
159_G	429_Y	0.541	0.09
107_E	361_I	0.540	0.09
79_G	109_Q	0.540	0.09
63_K	453_I	0.537	0.09
310_G	486_N	0.537	0.09
76_E	336_K	0.535	0.09
194_F	302_Y	0.533	0.09
293_M	337_L	0.533	0.09
162_K	507_K	0.531	0.09
370_I	398_V	0.531	0.09
63_K	333_E	0.530	0.09
171_M	175_D	0.530	0.09
46_E	229_R	0.530	0.09
359_D	379_T	0.529	0.09
220_S	300_T	0.528	0.09
42_E	82_S	0.528	0.09
410_A	454_S	0.528	0.09
76_E	133_E	0.526	0.09
304_K	337_L	0.525	0.09
250_E	444_I	0.525	0.09
324_T	408_D	0.524	0.09
343_L	364_F	0.523	0.09
261_A	304_K	0.523	0.09
150_V	164_V	0.522	0.09
105_A	393_T	0.522	0.09
67_I	160_N	0.522	0.09
289_S	337_L	0.521	0.09
132_F	208_G	0.520	0.09
394_L	456_I	0.519	0.09
40_L	331_N	0.519	0.09
147_E	415_E	0.519	0.09
366_N	373_I	0.518	0.09
16_L	103_V	0.517	0.09
279_R	441_N	0.517	0.09
182_E	258_I	0.516	0.09
219_L	309_I	0.516	0.09
161_W	287_I	0.516	0.09
333_E	355_T	0.515	0.09
22_K	475_I	0.515	0.09
329_M	336_K	0.515	0.09
123_L	443_G	0.513	0.09
293_M	346_I	0.511	0.09
169_K	279_R	0.511	0.09
131_S	175_D	0.510	0.09
296_P	454_S	0.510	0.09
10_M	176_V	0.510	0.09
137_D	249_L	0.508	0.09
201_G	434_Q	0.508	0.09
139_E	155_K	0.505	0.09
41_A	48_N	0.503	0.09
493_L	506_I	0.503	0.09
53_S	75_F	0.502	0.09
149_T	326_Y	0.502	0.09
346_I	408_D	0.501	0.09
13_K	42_E	0.500	0.09
33_I	124_Q	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
3i8oA	2	0.251	99.8	0.916	Contact Map
4bwyA	3	0.4667	99.8	0.919	Contact Map
4blqA	3	0.4608	99.8	0.923	Contact Map
3jvvA	3	0.6118	99.8	0.923	Contact Map
2oap1	3	0.8529	99.7	0.925	Contact Map
2ewvA	3	0.6118	99.7	0.925	Contact Map
4cr2I	1	0.5745	99.7	0.928	Contact Map
4ihqA	3	0.849	99.7	0.928	Contact Map
3ix7A	2	0.2451	99.6	0.932	Contact Map
2gzaA	3	0.5627	99.6	0.932	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.014 seconds.