Q7LXI4 - SULSO - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q7LXI4 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q7LXI4	Sequences: MMLKSLIDAIEILESKDPLNLLRSKLKGVEYEEKKIGEVTFVKVYYGSGGREKVEILGRLGAIQMQNASKGLVSDADGAIVTLAVLLELLNLKEKGIALDLDVSFVTNISLNAKLIPHQPFNFMVPLIGLDEALKEEVDPKAGLILSIDSTKGNRLAKFDDFALTHVIKDGYILKLKDEVIDIYNRVTGHEVYLVSLTTGDLTPLDFNVYHISTLISPWLYTDSPIIGIATVSKQMIPGYVTGVQDIEMLEHASRFCLEMLKYVEGGGKVYDENELKELKEKLGESNLQRVKKWKT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	296 (291)
Sequences:	157 (103)
Seq/√Len:	6.0

SULSO - Q7LXI4 Q97ZB8

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
72_L	76_A	4.437	0.97
199_T	289_Q	4.008	0.94
116_I	125_V	3.854	0.92
72_L	80_I	3.699	0.91
2_M	254_S	3.314	0.85
16_K	20_N	3.093	0.80
180_V	227_I	3.008	0.78
165_T	195_V	2.990	0.78
87_L	90_L	2.920	0.76
148_I	257_C	2.845	0.74
181_I	192_V	2.829	0.74
57_L	90_L	2.713	0.70
76_A	80_I	2.636	0.68
198_T	209_V	2.633	0.68
157_A	195_V	2.539	0.65
247_I	251_E	2.521	0.64
162_F	188_T	2.506	0.64
80_I	250_L	2.430	0.61
16_K	23_R	2.419	0.61
209_V	279_L	2.376	0.60
19_L	23_R	2.361	0.59
22_L	90_L	2.272	0.56
175_K	178_D	2.221	0.54
186_R	238_P	2.167	0.52
105_F	279_L	2.154	0.52
183_I	238_P	2.135	0.51
16_K	19_L	2.134	0.51
20_N	23_R	2.023	0.47
41_F	128_I	2.020	0.47
9_A	83_L	2.014	0.47
26_L	90_L	1.964	0.45
155_R	178_D	1.957	0.45
175_K	198_T	1.855	0.41
104_S	142_A	1.834	0.40
5_S	87_L	1.800	0.39
56_I	212_I	1.800	0.39
164_L	229_I	1.792	0.39
183_I	187_V	1.777	0.39
22_L	87_L	1.756	0.38
247_I	250_L	1.747	0.38
59_R	137_E	1.744	0.37
2_M	83_L	1.720	0.37
162_F	184_Y	1.709	0.36
175_K	275_E	1.685	0.35
13_L	83_L	1.648	0.34
100_D	265_E	1.639	0.34
3_L	247_I	1.636	0.34
76_A	158_K	1.610	0.33
91_N	95_K	1.601	0.33
122_N	241_V	1.596	0.33
6_L	84_A	1.595	0.33
81_V	250_L	1.585	0.32
36_I	125_V	1.571	0.32
199_T	286_S	1.555	0.31
43_K	271_Y	1.549	0.31
156_L	164_L	1.545	0.31
2_M	6_L	1.543	0.31
30_E	57_L	1.540	0.31
238_P	287_N	1.531	0.31
159_F	193_Y	1.513	0.30
83_L	109_I	1.511	0.30
194_L	241_V	1.499	0.30
152_K	231_T	1.487	0.29
69_S	122_N	1.464	0.29
6_L	250_L	1.460	0.29
162_F	229_I	1.444	0.28
4_K	8_D	1.442	0.28
245_Q	251_E	1.422	0.27
278_E	282_K	1.379	0.26
238_P	285_E	1.375	0.26
190_H	234_K	1.368	0.26
56_I	190_H	1.354	0.26
11_E	250_L	1.349	0.25
156_L	219_W	1.346	0.25
85_V	258_L	1.341	0.25
93_K	98_A	1.328	0.25
193_Y	196_S	1.316	0.25
23_R	26_L	1.295	0.24
41_F	142_A	1.295	0.24
220_L	254_S	1.291	0.24
240_Y	249_M	1.281	0.24
241_V	264_V	1.279	0.24
184_Y	195_V	1.270	0.23
119_Q	210_Y	1.269	0.23
6_L	122_N	1.259	0.23
122_N	182_D	1.255	0.23
143_G	164_L	1.243	0.23
63_I	76_A	1.228	0.22
24_S	266_G	1.224	0.22
57_L	119_Q	1.218	0.22
234_K	258_L	1.215	0.22
7_I	247_I	1.211	0.22
245_Q	250_L	1.206	0.22
110_S	240_Y	1.201	0.22
145_I	224_S	1.200	0.22
110_S	127_L	1.196	0.21
9_A	72_L	1.194	0.21
142_A	200_G	1.192	0.21
184_Y	187_V	1.189	0.21
133_A	194_L	1.185	0.21
20_N	26_L	1.174	0.21
63_I	72_L	1.160	0.21
34_K	37_G	1.156	0.21
140_P	145_I	1.153	0.20
54_V	143_G	1.150	0.20
117_P	238_P	1.148	0.20
57_L	136_E	1.131	0.20
199_T	288_L	1.130	0.20
19_L	26_L	1.129	0.20
146_L	208_N	1.127	0.20
148_I	197_L	1.126	0.20
62_A	110_S	1.118	0.20
192_V	250_L	1.115	0.20
6_L	251_E	1.113	0.20
156_L	210_Y	1.108	0.19
53_K	102_D	1.107	0.19
134_L	244_V	1.106	0.19
175_K	219_W	1.104	0.19
63_I	240_Y	1.104	0.19
22_L	26_L	1.099	0.19
83_L	209_V	1.094	0.19
15_S	95_K	1.092	0.19
35_K	236_M	1.081	0.19
30_E	56_I	1.072	0.19
33_E	116_I	1.060	0.18
266_G	277_K	1.058	0.18
80_I	247_I	1.051	0.18
117_P	289_Q	1.051	0.18
3_L	148_I	1.047	0.18
5_S	195_V	1.043	0.18
162_F	232_V	1.040	0.18
156_L	287_N	1.036	0.18
6_L	68_A	1.033	0.18
131_D	220_L	1.031	0.18
80_I	251_E	1.025	0.18
208_N	271_Y	1.020	0.18
187_V	246_D	1.019	0.18
151_T	212_I	1.017	0.17
72_L	250_L	1.015	0.17
122_N	238_P	1.013	0.17
25_K	87_L	1.010	0.17
169_K	271_Y	1.008	0.17
236_M	280_K	1.001	0.17
223_D	287_N	0.982	0.17
125_V	220_L	0.978	0.17
31_Y	38_E	0.974	0.17
194_L	197_L	0.964	0.16
45_Y	104_S	0.963	0.16
162_F	233_S	0.962	0.16
60_L	79_A	0.958	0.16
263_Y	276_L	0.957	0.16
62_A	111_L	0.954	0.16
16_K	44_V	0.952	0.16
195_V	212_I	0.951	0.16
6_L	187_V	0.949	0.16
80_I	245_Q	0.939	0.16
33_E	234_K	0.933	0.16
129_G	133_A	0.932	0.16
156_L	197_L	0.931	0.16
57_L	143_G	0.927	0.16
102_D	134_L	0.927	0.16
119_Q	267_G	0.926	0.16
62_A	126_P	0.926	0.16
32_E	81_V	0.923	0.16
168_I	216_I	0.923	0.16
54_V	142_A	0.922	0.16
48_S	102_D	0.917	0.16
68_A	122_N	0.914	0.15
133_A	136_E	0.914	0.15
57_L	145_I	0.912	0.15
162_F	257_C	0.911	0.15
243_G	284_G	0.911	0.15
276_L	286_S	0.908	0.15
7_I	84_A	0.908	0.15
258_L	270_V	0.905	0.15
76_A	216_I	0.905	0.15
109_I	146_L	0.905	0.15
3_L	185_N	0.904	0.15
157_A	254_S	0.904	0.15
22_L	25_K	0.903	0.15
111_L	126_P	0.898	0.15
24_S	125_V	0.898	0.15
220_L	264_V	0.895	0.15
114_K	126_P	0.895	0.15
13_L	155_R	0.888	0.15
46_Y	105_F	0.881	0.15
16_K	26_L	0.878	0.15
56_I	85_V	0.877	0.15
187_V	219_W	0.875	0.15
89_L	266_G	0.874	0.15
165_T	186_R	0.867	0.15
4_K	220_L	0.867	0.15
106_V	220_L	0.860	0.14
192_V	245_Q	0.860	0.14
143_G	162_F	0.858	0.14
248_E	263_Y	0.847	0.14
156_L	208_N	0.847	0.14
98_A	277_K	0.844	0.14
152_K	246_D	0.840	0.14
17_D	210_Y	0.839	0.14
79_A	243_G	0.838	0.14
18_P	260_M	0.835	0.14
86_L	276_L	0.834	0.14
63_I	148_I	0.831	0.14
197_L	209_V	0.830	0.14
80_I	238_P	0.829	0.14
114_K	206_D	0.828	0.14
54_V	286_S	0.826	0.14
175_K	197_L	0.824	0.14
165_T	247_I	0.821	0.14
277_K	281_E	0.818	0.14
49_G	53_K	0.814	0.14
95_K	145_I	0.811	0.14
35_K	212_I	0.809	0.14
155_R	182_D	0.807	0.14
81_V	162_F	0.805	0.14
56_I	148_I	0.804	0.14
240_Y	246_D	0.800	0.13
187_V	194_L	0.800	0.13
5_S	190_H	0.800	0.13
84_A	285_E	0.799	0.13
187_V	264_V	0.798	0.13
42_V	82_T	0.796	0.13
145_I	280_K	0.794	0.13
280_K	285_E	0.793	0.13
23_R	27_K	0.792	0.13
10_I	245_Q	0.791	0.13
22_L	27_K	0.791	0.13
142_A	257_C	0.790	0.13
157_A	234_K	0.790	0.13
76_A	250_L	0.789	0.13
182_D	251_E	0.787	0.13
172_Y	195_V	0.787	0.13
81_V	172_Y	0.785	0.13
116_I	155_R	0.779	0.13
142_A	220_L	0.777	0.13
143_G	233_S	0.776	0.13
9_A	250_L	0.772	0.13
4_K	105_F	0.772	0.13
9_A	80_I	0.771	0.13
68_A	264_V	0.771	0.13
146_L	162_F	0.771	0.13
235_Q	276_L	0.770	0.13
48_S	53_K	0.766	0.13
119_Q	175_K	0.761	0.13
14_E	134_L	0.761	0.13
170_D	290_R	0.760	0.13
49_G	102_D	0.757	0.13
126_P	151_T	0.756	0.13
14_E	244_V	0.756	0.13
156_L	176_L	0.752	0.13
264_V	274_N	0.752	0.13
2_M	7_I	0.748	0.13
6_L	195_V	0.747	0.13
146_L	268_G	0.745	0.13
51_R	146_L	0.744	0.13
160_D	249_M	0.737	0.12
29_V	162_F	0.737	0.12
60_L	243_G	0.737	0.12
69_S	183_I	0.730	0.12
145_I	273_E	0.730	0.12
165_T	198_T	0.729	0.12
18_P	164_L	0.727	0.12
2_M	212_I	0.726	0.12
179_E	268_G	0.724	0.12
34_K	62_A	0.723	0.12
22_L	91_N	0.723	0.12
10_I	268_G	0.722	0.12
130_L	254_S	0.720	0.12
11_E	72_L	0.718	0.12
17_D	91_N	0.716	0.12
85_V	132_E	0.716	0.12
194_L	255_R	0.715	0.12
197_L	250_L	0.714	0.12
192_V	206_D	0.711	0.12
194_L	251_E	0.709	0.12
9_A	84_A	0.708	0.12
69_S	238_P	0.708	0.12
15_S	236_M	0.705	0.12
7_I	251_E	0.704	0.12
113_A	284_G	0.701	0.12
157_A	184_Y	0.699	0.12
2_M	80_I	0.698	0.12
143_G	173_I	0.697	0.12
40_T	215_L	0.695	0.12
160_D	252_H	0.695	0.12
21_L	26_L	0.691	0.12
224_S	253_A	0.686	0.12
156_L	216_I	0.686	0.12
156_L	269_K	0.684	0.12
81_V	104_S	0.680	0.12
16_K	235_Q	0.679	0.12
79_A	151_T	0.677	0.12
43_K	142_A	0.677	0.12
28_G	273_E	0.673	0.11
165_T	290_R	0.672	0.11
7_I	254_S	0.672	0.11
45_Y	183_I	0.670	0.11
175_K	277_K	0.670	0.11
145_I	168_I	0.666	0.11
17_D	43_K	0.664	0.11
90_L	248_E	0.662	0.11
81_V	257_C	0.662	0.11
122_N	264_V	0.660	0.11
8_D	95_K	0.660	0.11
110_S	126_P	0.659	0.11
7_I	246_D	0.659	0.11
62_A	114_K	0.658	0.11
145_I	209_V	0.657	0.11
54_V	279_L	0.655	0.11
125_V	238_P	0.654	0.11
52_E	166_H	0.654	0.11
10_I	133_A	0.654	0.11
182_D	185_N	0.653	0.11
168_I	197_L	0.651	0.11
1_M	268_G	0.644	0.11
68_A	241_V	0.641	0.11
32_E	250_L	0.638	0.11
83_L	182_D	0.637	0.11
21_L	50_G	0.636	0.11
118_H	242_T	0.634	0.11
130_L	209_V	0.634	0.11
148_I	250_L	0.633	0.11
185_N	234_K	0.633	0.11
183_I	277_K	0.633	0.11
156_L	286_S	0.632	0.11
54_V	98_A	0.630	0.11
42_V	263_Y	0.630	0.11
132_E	194_L	0.628	0.11
44_V	172_Y	0.627	0.11
60_L	118_H	0.627	0.11
70_K	122_N	0.626	0.11
63_I	109_I	0.624	0.11
41_F	257_C	0.623	0.11
142_A	197_L	0.620	0.11
2_M	187_V	0.619	0.11
45_Y	238_P	0.619	0.11
278_E	289_Q	0.619	0.11
24_S	233_S	0.618	0.11
3_L	132_E	0.618	0.11
37_G	62_A	0.613	0.11
208_N	286_S	0.611	0.11
43_K	281_E	0.611	0.11
82_T	251_E	0.611	0.11
140_P	178_D	0.610	0.11
165_T	182_D	0.607	0.11
175_K	273_E	0.606	0.11
170_D	188_T	0.604	0.11
23_R	106_V	0.601	0.10
176_L	198_T	0.601	0.10
209_V	236_M	0.600	0.10
63_I	160_D	0.599	0.10
54_V	57_L	0.597	0.10
125_V	252_H	0.596	0.10
63_I	285_E	0.596	0.10
181_I	237_I	0.594	0.10
48_S	134_L	0.594	0.10
15_S	63_I	0.593	0.10
72_L	245_Q	0.586	0.10
50_G	112_N	0.586	0.10
11_E	95_K	0.585	0.10
185_N	192_V	0.585	0.10
46_Y	219_W	0.584	0.10
195_V	234_K	0.580	0.10
82_T	148_I	0.580	0.10
132_E	136_E	0.578	0.10
53_K	134_L	0.574	0.10
172_Y	199_T	0.574	0.10
251_E	255_R	0.574	0.10
112_N	237_I	0.572	0.10
57_L	142_A	0.572	0.10
13_L	103_V	0.571	0.10
175_K	285_E	0.571	0.10
192_V	251_E	0.571	0.10
60_L	284_G	0.570	0.10
17_D	135_K	0.570	0.10
90_L	106_V	0.569	0.10
114_K	151_T	0.565	0.10
57_L	253_A	0.563	0.10
111_L	114_K	0.561	0.10
29_V	42_V	0.561	0.10
85_V	223_D	0.560	0.10
186_R	250_L	0.560	0.10
255_R	291_V	0.557	0.10
184_Y	212_I	0.548	0.10
57_L	106_V	0.545	0.10
187_V	252_H	0.544	0.10
54_V	133_A	0.544	0.10
197_L	216_I	0.542	0.10
110_S	168_I	0.541	0.10
128_I	187_V	0.541	0.10
43_K	175_K	0.541	0.10
8_D	164_L	0.540	0.10
93_K	145_I	0.540	0.10
209_V	280_K	0.536	0.10
23_R	247_I	0.534	0.10
278_E	286_S	0.534	0.10
11_E	209_V	0.533	0.10
23_R	139_D	0.532	0.10
43_K	159_F	0.530	0.10
72_L	87_L	0.529	0.10
7_I	192_V	0.529	0.10
9_A	22_L	0.528	0.10
157_A	210_Y	0.528	0.10
63_I	265_E	0.527	0.10
187_V	285_E	0.527	0.10
162_F	253_A	0.525	0.10
6_L	90_L	0.525	0.10
230_A	239_G	0.524	0.10
8_D	31_Y	0.524	0.10
139_D	288_L	0.523	0.09
12_I	82_T	0.522	0.09
100_D	185_N	0.522	0.09
128_I	244_V	0.521	0.09
246_D	249_M	0.521	0.09
84_A	232_V	0.519	0.09
182_D	186_R	0.517	0.09
7_I	286_S	0.516	0.09
213_S	217_S	0.515	0.09
214_T	217_S	0.515	0.09
42_V	210_Y	0.515	0.09
160_D	199_T	0.514	0.09
18_P	185_N	0.514	0.09
195_V	257_C	0.514	0.09
91_N	129_G	0.513	0.09
210_Y	242_T	0.513	0.09
4_K	146_L	0.513	0.09
12_I	116_I	0.512	0.09
2_M	241_V	0.508	0.09
13_L	188_T	0.507	0.09
60_L	150_S	0.507	0.09
273_E	279_L	0.506	0.09
274_N	277_K	0.505	0.09
3_L	249_M	0.505	0.09
41_F	133_A	0.505	0.09
253_A	275_E	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2rb7A	2	0.8514	30.2	0.98	Contact Map
2w6rA	1	0.4122	25.6	0.98	Contact Map
2cujA	1	0.2399	15.5	0.982	Contact Map
1q7lA	2	0.5203	13.7	0.983	Contact Map
3gwmA	3	0.1858	10.7	0.983	Contact Map
1thfD	2	0.4426	9.4	0.984	Contact Map
4jqpA	2	0.5777	9.1	0.984	Contact Map
1yxoA	2	0.5811	8.8	0.984	Contact Map
1vmiA	2	0.5473	7.4	0.985	Contact Map
3bywA	5	0.25	7.1	0.985	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0099 seconds.