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GREMLIN Database |
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UPF0182 - Uncharacterised protein family (UPF0182)
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GREMLIN Results: Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength. Residue pairs sorted by coevolution strength:
Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5 Prob = P(contact | Sco, seq80/√len) seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity
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HHsearch Results:
Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.
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Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3) 
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