Q9HSH3 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HSH3 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HSH3	Sequences: MTETQGELASLSKYIFRAPRWYSSVALSLVIAALAGVAAFDSQYVLADAWQGVFFIGVPTAVASMATTTVDRHFGGQLTYNRSSLLAVACEIVVVTVLVAAGVAAILTPRLSQNFVFDALIAALALVFAVRFLVVLAVSRNTLAVSVLPASIQTATAGVLLFVYGGTLNYVTSGGGSLLGAFLARPSHAPPEIQYAFAPRDFLLLVAMTALYGSVAYGFVVVIDRPWQRSLGVSVLDFIGGFIGHIAEGTRELEDFFEQIGEEAVVPVTVLSFRRTSDETEKARFVLPMIHPGPMGEIGGGNLPQRVADATDGLAFPPHATAGHDFNLVTEREVDTLVDAAADAHDRITYTDTATAPVRATDGEATLFGQAFDDDAFLVSTYAPNFADDISYAVGLSAAAEARVAGLETVLLADAHNCNNGLDGDDLGHIYPGSERSFQLIQAAGSAARDLADAPEHALRMGVAWDPTDWQPCDGIGPLGVRVAVVETGTTRTAYVLIDGNNMEPGLRERLLDAVGGLGIDHAEVMTTDTHIVNTVESSNQVGAAIDWGALTDVVVALTEAATDDLDPVEAGVATERAEVTVFGNDRTETLASHANAVIAMGGAVAGLAVLATVTISVLVFFLT	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	624 (522)
Sequences:	132 (114)
Seq/√Len:	5.0

HALSA - Q9HSH3
SULSO - Q97W82

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
481_V	555_V	4.405	0.94
292_P	499_D	4.195	0.92
500_G	542_V	3.704	0.86
460_R	487_E	3.494	0.82
499_D	543_G	3.366	0.79
261_G	329_V	3.090	0.73
292_P	543_G	2.918	0.68
290_I	341_A	2.835	0.66
477_G	480_G	2.831	0.66
462_G	562_A	2.758	0.64
499_D	528_T	2.739	0.63
290_I	392_Y	2.595	0.59
480_G	543_G	2.575	0.58
485_V	494_A	2.503	0.56
559_T	581_T	2.481	0.55
394_V	530_T	2.471	0.55
416_H	508_R	2.460	0.54
104_A	610_V	2.457	0.54
214_S	243_I	2.425	0.53
292_P	528_T	2.410	0.53
485_V	562_A	2.340	0.50
288_P	296_G	2.336	0.50
458_A	525_V	2.334	0.50
260_I	418_C	2.260	0.48
93_V	130_V	2.253	0.48
214_S	337_L	2.205	0.46
480_G	499_D	2.204	0.46
528_T	543_G	2.134	0.44
489_G	549_G	2.134	0.44
293_G	389_D	2.105	0.43
389_D	531_H	2.105	0.43
300_G	328_L	2.105	0.43
389_D	501_N	2.105	0.43
389_D	529_D	2.105	0.43
293_G	531_H	2.105	0.43
293_G	501_N	2.105	0.43
293_G	529_D	2.105	0.43
291_H	501_N	2.105	0.43
291_H	389_D	2.105	0.43
501_N	529_D	2.105	0.43
501_N	531_H	2.105	0.43
291_H	529_D	2.105	0.43
291_H	531_H	2.105	0.43
483_V	558_L	2.061	0.42
472_P	476_I	2.025	0.40
557_A	561_A	2.021	0.40
320_A	382_Y	2.009	0.40
241_G	388_D	1.996	0.39
155_A	455_P	1.954	0.38
327_N	583_F	1.926	0.37
79_T	82_R	1.925	0.37
243_I	390_I	1.925	0.37
292_P	530_T	1.913	0.37
211_L	372_F	1.895	0.36
324_H	416_H	1.894	0.36
218_G	360_A	1.886	0.36
214_S	343_D	1.873	0.36
304_P	327_N	1.847	0.35
247_A	317_P	1.839	0.35
346_D	561_A	1.834	0.35
530_T	543_G	1.815	0.34
477_G	543_G	1.812	0.34
322_A	530_T	1.785	0.33
321_T	436_R	1.774	0.33
481_V	511_L	1.770	0.33
288_P	319_H	1.691	0.31
499_D	530_T	1.685	0.30
327_N	503_M	1.685	0.30
320_A	538_S	1.683	0.30
484_A	515_V	1.678	0.30
292_P	300_G	1.671	0.30
155_A	223_I	1.670	0.30
294_P	528_T	1.669	0.30
299_G	416_H	1.654	0.30
327_N	541_Q	1.632	0.29
319_H	388_D	1.631	0.29
294_P	499_D	1.630	0.29
58_V	61_A	1.616	0.28
294_P	543_G	1.615	0.28
477_G	499_D	1.614	0.28
335_D	549_G	1.612	0.28
257_F	591_L	1.611	0.28
413_A	552_T	1.606	0.28
123_A	619_L	1.598	0.28
498_I	555_V	1.585	0.28
168_L	217_Y	1.581	0.28
120_L	205_L	1.581	0.28
549_G	615_T	1.581	0.28
477_G	530_T	1.574	0.27
95_V	218_G	1.569	0.27
212_Y	388_D	1.569	0.27
254_E	502_N	1.561	0.27
93_V	107_L	1.558	0.27
292_P	462_G	1.554	0.27
506_G	524_E	1.540	0.27
481_V	610_V	1.538	0.26
322_A	382_Y	1.537	0.26
446_S	509_E	1.534	0.26
415_A	524_E	1.533	0.26
228_Q	413_A	1.519	0.26
215_V	250_T	1.513	0.26
414_D	501_N	1.507	0.26
293_G	414_D	1.507	0.26
389_D	414_D	1.507	0.26
414_D	529_D	1.507	0.26
414_D	531_H	1.507	0.26
291_H	414_D	1.507	0.26
292_P	562_A	1.504	0.26
162_F	339_D	1.502	0.26
257_F	395_G	1.501	0.26
58_V	62_V	1.494	0.25
127_V	132_F	1.494	0.25
330_T	476_I	1.484	0.25
74_F	77_Q	1.480	0.25
445_G	616_I	1.479	0.25
123_A	511_L	1.477	0.25
503_M	530_T	1.474	0.25
123_A	152_I	1.469	0.25
462_G	530_T	1.465	0.25
273_F	486_V	1.463	0.25
206_V	611_L	1.448	0.24
492_R	563_T	1.445	0.24
513_D	579_E	1.442	0.24
66_A	148_L	1.439	0.24
474_D	481_V	1.438	0.24
282_K	569_V	1.419	0.24
309_D	522_H	1.416	0.24
74_F	80_Y	1.409	0.23
476_I	542_V	1.406	0.23
300_G	542_V	1.402	0.23
172_T	610_V	1.382	0.23
375_D	447_A	1.377	0.23
507_L	569_V	1.368	0.22
212_Y	583_F	1.361	0.22
395_G	533_V	1.359	0.22
325_D	475_G	1.358	0.22
530_T	533_V	1.355	0.22
395_G	591_L	1.344	0.22
224_D	320_A	1.344	0.22
207_A	610_V	1.335	0.22
296_G	540_N	1.330	0.22
503_M	525_V	1.329	0.22
271_L	411_L	1.320	0.21
219_F	327_N	1.318	0.21
291_H	299_G	1.317	0.21
299_G	531_H	1.317	0.21
299_G	389_D	1.317	0.21
299_G	529_D	1.317	0.21
293_G	299_G	1.317	0.21
299_G	501_N	1.317	0.21
344_A	525_V	1.314	0.21
103_V	170_Y	1.312	0.21
461_M	612_A	1.311	0.21
363_G	443_A	1.308	0.21
481_V	550_A	1.304	0.21
128_F	223_I	1.301	0.21
499_D	542_V	1.292	0.21
148_L	551_L	1.290	0.21
392_Y	500_G	1.287	0.21
390_I	491_T	1.284	0.21
235_V	337_L	1.284	0.21
348_I	572_G	1.284	0.21
300_G	354_A	1.280	0.20
53_V	103_V	1.279	0.20
171_V	618_V	1.274	0.20
282_K	567_D	1.272	0.20
583_F	592_A	1.261	0.20
261_G	320_A	1.260	0.20
395_G	497_L	1.260	0.20
63_A	73_H	1.259	0.20
261_G	583_F	1.257	0.20
295_M	326_F	1.256	0.20
62_V	279_E	1.253	0.20
206_V	594_H	1.251	0.20
292_P	480_G	1.250	0.20
210_A	572_G	1.236	0.20
325_D	533_V	1.230	0.19
410_V	416_H	1.229	0.19
58_V	280_T	1.228	0.19
299_G	324_H	1.222	0.19
239_I	377_F	1.218	0.19
319_H	529_D	1.213	0.19
319_H	501_N	1.213	0.19
293_G	319_H	1.213	0.19
319_H	389_D	1.213	0.19
319_H	531_H	1.213	0.19
291_H	319_H	1.213	0.19
159_V	513_D	1.211	0.19
254_E	328_L	1.211	0.19
99_V	455_P	1.208	0.19
284_R	320_A	1.205	0.19
327_N	432_P	1.203	0.19
61_A	413_A	1.196	0.19
337_L	481_V	1.195	0.19
303_L	499_D	1.194	0.19
290_I	507_L	1.194	0.19
135_V	500_G	1.187	0.19
324_H	413_A	1.185	0.19
324_H	508_R	1.180	0.18
127_V	156_T	1.179	0.18
86_L	288_P	1.179	0.18
107_L	489_G	1.179	0.18
333_E	416_H	1.177	0.18
121_I	618_V	1.176	0.18
300_G	413_A	1.169	0.18
370_Q	533_V	1.169	0.18
247_A	288_P	1.166	0.18
226_P	565_D	1.164	0.18
330_T	584_G	1.161	0.18
300_G	562_A	1.143	0.18
511_L	555_V	1.130	0.17
62_V	73_H	1.128	0.17
103_V	390_I	1.126	0.17
247_A	311_T	1.123	0.17
223_I	575_T	1.122	0.17
378_L	443_A	1.122	0.17
489_G	517_G	1.121	0.17
459_L	584_G	1.120	0.17
391_S	534_N	1.119	0.17
250_T	290_I	1.119	0.17
435_E	525_V	1.117	0.17
300_G	499_D	1.110	0.17
131_R	256_F	1.109	0.17
288_P	462_G	1.104	0.17
144_A	453_D	1.102	0.17
525_V	616_I	1.098	0.17
294_P	327_N	1.097	0.17
287_L	328_L	1.097	0.17
216_A	602_G	1.096	0.17
455_P	612_A	1.096	0.17
285_F	484_A	1.094	0.17
286_V	617_S	1.091	0.17
235_V	528_T	1.090	0.17
477_G	533_V	1.087	0.17
373_D	559_T	1.086	0.17
370_Q	495_Y	1.084	0.17
122_A	208_M	1.081	0.17
566_L	579_E	1.077	0.17
268_V	388_D	1.075	0.16
95_V	206_V	1.074	0.16
266_V	507_L	1.072	0.16
292_P	322_A	1.069	0.16
162_F	561_A	1.067	0.16
344_A	507_L	1.066	0.16
500_G	525_V	1.065	0.16
237_D	290_I	1.063	0.16
373_D	480_G	1.062	0.16
307_V	320_A	1.060	0.16
147_V	430_I	1.058	0.16
443_A	530_T	1.057	0.16
212_Y	387_A	1.056	0.16
366_T	522_H	1.053	0.16
266_V	582_V	1.048	0.16
292_P	542_V	1.048	0.16
157_A	554_V	1.046	0.16
290_I	386_F	1.044	0.16
135_V	211_L	1.037	0.16
223_I	556_V	1.037	0.16
242_F	534_N	1.036	0.16
123_A	344_A	1.033	0.16
365_A	530_T	1.032	0.16
257_F	524_E	1.027	0.16
355_T	444_A	1.024	0.16
327_N	534_N	1.024	0.16
294_P	303_L	1.024	0.16
88_V	192_E	1.021	0.16
149_P	154_T	1.020	0.16
300_G	538_S	1.012	0.15
282_K	484_A	1.008	0.15
359_R	506_G	1.008	0.15
288_P	302_N	1.006	0.15
436_R	619_L	1.005	0.15
220_V	496_V	1.003	0.15
523_A	558_L	1.003	0.15
301_G	372_F	1.002	0.15
544_A	608_L	1.000	0.15
301_G	603_G	0.994	0.15
220_V	600_A	0.994	0.15
573_V	578_A	0.994	0.15
334_V	541_Q	0.993	0.15
483_V	511_L	0.993	0.15
327_N	494_A	0.989	0.15
292_P	533_V	0.979	0.15
339_D	492_R	0.978	0.15
129_A	223_I	0.975	0.15
207_A	510_R	0.973	0.15
513_D	575_T	0.972	0.15
213_G	564_D	0.972	0.15
360_A	367_L	0.970	0.15
156_T	171_V	0.970	0.15
170_Y	614_V	0.968	0.15
81_N	379_V	0.967	0.15
309_D	515_V	0.966	0.15
243_I	444_A	0.964	0.15
62_V	615_T	0.963	0.15
477_G	503_M	0.961	0.15
373_D	490_T	0.961	0.15
352_D	513_D	0.961	0.15
525_V	608_L	0.959	0.15
230_S	235_V	0.958	0.15
143_L	377_F	0.952	0.14
498_I	523_A	0.951	0.14
335_D	517_G	0.948	0.14
363_G	500_G	0.946	0.14
292_P	477_G	0.944	0.14
77_Q	215_V	0.939	0.14
364_E	388_D	0.939	0.14
104_A	409_T	0.934	0.14
73_H	452_A	0.930	0.14
459_L	582_V	0.928	0.14
269_T	456_E	0.927	0.14
327_N	372_F	0.927	0.14
214_S	614_V	0.925	0.14
515_V	610_V	0.924	0.14
219_F	494_A	0.924	0.14
105_A	307_V	0.923	0.14
388_D	419_N	0.923	0.14
107_L	337_L	0.922	0.14
322_A	541_Q	0.922	0.14
82_R	327_N	0.922	0.14
130_V	360_A	0.920	0.14
315_A	410_V	0.919	0.14
257_F	359_R	0.917	0.14
287_L	320_A	0.917	0.14
289_M	295_M	0.916	0.14
495_Y	524_E	0.914	0.14
306_R	335_D	0.913	0.14
220_V	527_T	0.912	0.14
291_H	502_N	0.912	0.14
293_G	502_N	0.912	0.14
389_D	502_N	0.912	0.14
502_N	531_H	0.912	0.14
502_N	529_D	0.912	0.14
257_F	534_N	0.912	0.14
471_Q	555_V	0.912	0.14
58_V	564_D	0.911	0.14
124_L	162_F	0.910	0.14
492_R	566_L	0.906	0.14
161_L	487_E	0.905	0.14
466_D	558_L	0.905	0.14
155_A	564_D	0.904	0.14
465_W	542_V	0.903	0.14
212_Y	327_N	0.901	0.14
506_G	511_L	0.900	0.14
257_F	261_G	0.900	0.14
214_S	504_E	0.899	0.14
294_P	531_H	0.897	0.14
294_P	389_D	0.897	0.14
294_P	529_D	0.897	0.14
291_H	294_P	0.897	0.14
294_P	501_N	0.897	0.14
141_N	161_L	0.896	0.14
296_G	533_V	0.893	0.13
99_V	372_F	0.891	0.13
126_L	582_V	0.889	0.13
210_A	471_Q	0.888	0.13
249_G	272_S	0.887	0.13
100_A	206_V	0.885	0.13
568_P	579_E	0.884	0.13
466_D	483_V	0.881	0.13
149_P	377_F	0.881	0.13
337_L	489_G	0.880	0.13
107_L	148_L	0.876	0.13
100_A	336_T	0.875	0.13
324_H	501_N	0.875	0.13
324_H	389_D	0.875	0.13
291_H	324_H	0.875	0.13
324_H	529_D	0.875	0.13
293_G	324_H	0.875	0.13
324_H	531_H	0.875	0.13
290_I	591_L	0.873	0.13
368_F	487_E	0.873	0.13
64_S	74_F	0.872	0.13
287_L	365_A	0.868	0.13
267_P	415_A	0.864	0.13
151_S	283_A	0.863	0.13
62_V	102_G	0.863	0.13
361_T	435_E	0.859	0.13
211_L	618_V	0.857	0.13
585_N	589_E	0.856	0.13
301_G	608_L	0.854	0.13
108_T	155_A	0.854	0.13
300_G	383_A	0.850	0.13
385_N	489_G	0.849	0.13
161_L	286_V	0.849	0.13
62_V	97_V	0.849	0.13
497_L	534_N	0.849	0.13
158_G	220_V	0.849	0.13
322_A	613_T	0.846	0.13
555_V	559_T	0.843	0.13
191_P	460_R	0.843	0.13
56_I	78_L	0.841	0.13
149_P	167_T	0.840	0.13
467_P	511_L	0.840	0.13
343_D	568_P	0.840	0.13
114_N	206_V	0.839	0.13
434_S	596_N	0.835	0.13
266_V	544_A	0.834	0.13
320_A	583_F	0.833	0.13
258_E	372_F	0.829	0.13
80_Y	83_S	0.828	0.13
220_V	361_T	0.824	0.12
395_G	594_H	0.824	0.12
243_I	258_E	0.824	0.12
548_W	608_L	0.823	0.12
161_L	341_A	0.817	0.12
494_A	520_I	0.816	0.12
104_A	159_V	0.814	0.12
56_I	406_G	0.814	0.12
259_Q	458_A	0.810	0.12
65_M	431_Y	0.810	0.12
216_A	220_V	0.810	0.12
211_L	560_E	0.809	0.12
160_L	388_D	0.809	0.12
316_F	462_G	0.809	0.12
319_H	584_G	0.807	0.12
387_A	480_G	0.807	0.12
416_H	531_H	0.805	0.12
389_D	416_H	0.805	0.12
416_H	529_D	0.805	0.12
291_H	416_H	0.805	0.12
416_H	501_N	0.805	0.12
293_G	416_H	0.805	0.12
444_A	580_V	0.803	0.12
553_D	614_V	0.802	0.12
127_V	515_V	0.801	0.12
334_V	338_V	0.801	0.12
103_V	509_E	0.800	0.12
132_F	210_A	0.800	0.12
203_L	351_T	0.798	0.12
379_V	526_M	0.798	0.12
517_G	556_V	0.796	0.12
324_H	328_L	0.796	0.12
226_P	302_N	0.796	0.12
130_V	168_L	0.794	0.12
370_Q	395_G	0.794	0.12
217_Y	481_V	0.793	0.12
107_L	460_R	0.792	0.12
98_L	156_T	0.790	0.12
367_L	500_G	0.790	0.12
239_I	266_V	0.788	0.12
122_A	349_T	0.787	0.12
391_S	539_S	0.783	0.12
430_I	443_A	0.781	0.12
61_A	553_D	0.780	0.12
119_A	492_R	0.779	0.12
373_D	477_G	0.779	0.12
328_L	416_H	0.777	0.12
86_L	148_L	0.776	0.12
367_L	405_A	0.775	0.12
395_G	534_N	0.774	0.12
250_T	309_D	0.773	0.12
242_F	502_N	0.770	0.12
377_F	569_V	0.769	0.12
493_T	583_F	0.769	0.12
235_V	523_A	0.768	0.12
340_A	362_D	0.767	0.12
227_W	233_V	0.767	0.12
310_A	337_L	0.764	0.12
352_D	446_S	0.762	0.12
372_F	515_V	0.762	0.12
108_T	616_I	0.762	0.12
485_V	492_R	0.762	0.12
351_T	464_A	0.762	0.12
525_V	549_G	0.761	0.12
66_A	136_L	0.760	0.12
359_R	381_T	0.760	0.12
59_P	66_A	0.759	0.12
290_I	408_E	0.759	0.12
214_S	452_A	0.758	0.12
388_D	447_A	0.758	0.12
382_Y	387_A	0.757	0.12
446_S	449_R	0.757	0.12
302_N	384_P	0.757	0.12
387_A	539_S	0.756	0.12
462_G	477_G	0.756	0.12
499_D	533_V	0.755	0.12
261_G	298_I	0.755	0.12
500_G	603_G	0.753	0.12
502_N	527_T	0.752	0.11
508_R	591_L	0.751	0.11
108_T	156_T	0.751	0.11
104_A	447_A	0.750	0.11
486_V	552_T	0.750	0.11
78_L	84_S	0.750	0.11
77_Q	377_F	0.746	0.11
485_V	521_D	0.746	0.11
275_R	559_T	0.745	0.11
254_E	324_H	0.743	0.11
380_S	600_A	0.742	0.11
387_A	538_S	0.739	0.11
338_V	557_A	0.739	0.11
390_I	589_E	0.737	0.11
298_I	586_D	0.736	0.11
300_G	324_H	0.735	0.11
261_G	301_G	0.731	0.11
150_A	253_L	0.729	0.11
203_L	563_T	0.728	0.11
290_I	304_P	0.727	0.11
446_S	516_G	0.723	0.11
207_A	218_G	0.721	0.11
149_P	295_M	0.720	0.11
247_A	537_E	0.720	0.11
416_H	475_G	0.718	0.11
80_Y	280_T	0.717	0.11
322_A	479_L	0.717	0.11
509_E	549_G	0.716	0.11
301_G	317_P	0.716	0.11
104_A	511_L	0.715	0.11
320_A	323_G	0.714	0.11
334_V	376_A	0.712	0.11
318_P	463_V	0.712	0.11
93_V	620_V	0.711	0.11
506_G	509_E	0.711	0.11
76_G	281_E	0.710	0.11
232_G	569_V	0.710	0.11
384_P	543_G	0.710	0.11
250_T	340_A	0.708	0.11
503_M	512_L	0.707	0.11
79_T	84_S	0.706	0.11
243_I	489_G	0.706	0.11
288_P	540_N	0.704	0.11
79_T	322_A	0.703	0.11
317_P	372_F	0.699	0.11
117_F	406_G	0.697	0.11
300_G	493_T	0.696	0.11
106_I	214_S	0.696	0.11
65_M	88_V	0.696	0.11
120_L	125_A	0.695	0.11
372_F	390_I	0.693	0.11
317_P	371_A	0.693	0.11
497_L	533_V	0.691	0.11
412_L	481_V	0.691	0.11
97_V	100_A	0.691	0.11
285_F	374_D	0.690	0.11
162_F	492_R	0.687	0.11
370_Q	526_M	0.687	0.11
310_A	390_I	0.687	0.11
327_N	533_V	0.685	0.11
360_A	498_I	0.684	0.11
296_G	395_G	0.683	0.11
421_G	513_D	0.683	0.11
208_M	211_L	0.683	0.11
557_A	564_D	0.681	0.11
145_V	489_G	0.681	0.11
290_I	598_V	0.680	0.11
271_L	516_G	0.679	0.11
333_E	526_M	0.679	0.11
406_G	409_T	0.678	0.11
75_G	250_T	0.677	0.11
64_S	305_Q	0.677	0.11
298_I	366_T	0.677	0.11
509_E	524_E	0.676	0.11
300_G	535_T	0.676	0.11
389_D	527_T	0.676	0.11
527_T	531_H	0.676	0.11
291_H	527_T	0.676	0.11
501_N	527_T	0.676	0.11
293_G	527_T	0.676	0.11
241_G	387_A	0.675	0.11
123_A	151_S	0.675	0.11
340_A	483_V	0.675	0.11
206_V	492_R	0.674	0.11
266_V	321_T	0.669	0.10
273_F	327_N	0.668	0.10
458_A	486_V	0.667	0.10
64_S	119_A	0.667	0.10
106_I	206_V	0.666	0.10
562_A	572_G	0.665	0.10
320_A	588_T	0.665	0.10
298_I	329_V	0.662	0.10
102_G	113_Q	0.661	0.10
384_P	503_M	0.661	0.10
125_A	233_V	0.659	0.10
349_T	561_A	0.658	0.10
100_A	130_V	0.658	0.10
171_V	312_D	0.656	0.10
511_L	552_T	0.655	0.10
297_E	363_G	0.655	0.10
324_H	584_G	0.654	0.10
498_I	582_V	0.651	0.10
101_A	129_A	0.649	0.10
62_V	337_L	0.649	0.10
129_A	283_A	0.649	0.10
155_A	260_I	0.649	0.10
96_T	307_V	0.649	0.10
418_C	528_T	0.648	0.10
335_D	481_V	0.644	0.10
413_A	483_V	0.644	0.10
100_A	460_R	0.642	0.10
475_G	565_D	0.641	0.10
107_L	560_E	0.641	0.10
449_R	545_A	0.641	0.10
349_T	409_T	0.640	0.10
312_D	512_L	0.640	0.10
65_M	511_L	0.639	0.10
92_I	351_T	0.638	0.10
218_G	555_V	0.636	0.10
317_P	333_E	0.636	0.10
73_H	312_D	0.635	0.10
151_S	355_T	0.635	0.10
517_G	608_L	0.634	0.10
370_Q	391_S	0.634	0.10
437_S	601_M	0.631	0.10
328_L	538_S	0.631	0.10
337_L	513_D	0.630	0.10
526_M	591_L	0.628	0.10
86_L	285_F	0.628	0.10
373_D	462_G	0.627	0.10
273_F	333_E	0.625	0.10
322_A	327_N	0.625	0.10
128_F	226_P	0.625	0.10
476_I	596_N	0.625	0.10
283_A	503_M	0.622	0.10
255_D	312_D	0.621	0.10
333_E	415_A	0.620	0.10
239_I	372_F	0.620	0.10
219_F	595_A	0.620	0.10
304_P	542_V	0.620	0.10
353_T	366_T	0.619	0.10
271_L	309_D	0.619	0.10
58_V	447_A	0.617	0.10
172_T	347_R	0.616	0.10
354_A	488_T	0.616	0.10
236_L	542_V	0.616	0.10
319_H	483_V	0.614	0.10
300_G	584_G	0.614	0.10
214_S	217_Y	0.613	0.10
208_M	536_V	0.611	0.10
441_I	560_E	0.611	0.10
316_F	541_Q	0.611	0.10
409_T	472_P	0.610	0.10
255_D	364_E	0.610	0.10
299_G	414_D	0.609	0.10
388_D	578_A	0.609	0.10
405_A	552_T	0.609	0.10
149_P	455_P	0.608	0.10
389_D	417_N	0.607	0.10
417_N	501_N	0.607	0.10
417_N	529_D	0.607	0.10
417_N	531_H	0.607	0.10
291_H	417_N	0.607	0.10
293_G	417_N	0.607	0.10
90_C	93_V	0.603	0.10
92_I	255_D	0.599	0.10
280_T	440_L	0.597	0.10
242_F	297_E	0.597	0.10
286_V	502_N	0.595	0.10
360_A	545_A	0.594	0.10
63_A	550_A	0.594	0.10
56_I	391_S	0.593	0.10
227_W	261_G	0.593	0.10
288_P	317_P	0.592	0.10
260_I	340_A	0.592	0.10
463_V	482_R	0.591	0.10
77_Q	155_A	0.591	0.10
554_V	561_A	0.590	0.10
134_V	145_V	0.590	0.10
104_A	525_V	0.590	0.10
83_S	613_T	0.589	0.10
171_V	489_G	0.587	0.09
416_H	503_M	0.587	0.09
538_S	599_I	0.587	0.09
548_W	614_V	0.587	0.09
304_P	317_P	0.585	0.09
171_V	554_V	0.584	0.09
487_E	610_V	0.584	0.09
320_A	325_D	0.584	0.09
319_H	417_N	0.582	0.09
66_A	446_S	0.582	0.09
248_E	576_E	0.581	0.09
170_Y	430_I	0.581	0.09
71_D	332_R	0.581	0.09
352_D	515_V	0.581	0.09
163_V	440_L	0.581	0.09
215_V	290_I	0.580	0.09
363_G	498_I	0.579	0.09
84_S	370_Q	0.579	0.09
477_G	528_T	0.578	0.09
456_E	516_G	0.578	0.09
120_L	147_V	0.574	0.09
591_L	594_H	0.574	0.09
203_L	467_P	0.572	0.09
309_D	607_G	0.571	0.09
212_Y	478_P	0.569	0.09
257_F	500_G	0.568	0.09
108_T	523_A	0.568	0.09
99_V	559_T	0.568	0.09
71_D	234_S	0.568	0.09
315_A	390_I	0.566	0.09
327_N	416_H	0.565	0.09
530_T	562_A	0.564	0.09
287_L	437_S	0.563	0.09
135_V	270_V	0.563	0.09
295_M	374_D	0.563	0.09
477_G	524_E	0.562	0.09
86_L	134_V	0.559	0.09
96_T	108_T	0.559	0.09
409_T	564_D	0.559	0.09
274_R	571_A	0.558	0.09
464_A	483_V	0.558	0.09
387_A	419_N	0.558	0.09
220_V	448_A	0.558	0.09
443_A	544_A	0.557	0.09
143_L	390_I	0.557	0.09
230_S	604_A	0.554	0.09
164_Y	219_F	0.554	0.09
362_D	390_I	0.553	0.09
207_A	343_D	0.553	0.09
210_A	483_V	0.552	0.09
213_G	505_P	0.551	0.09
296_G	304_P	0.551	0.09
145_V	346_D	0.550	0.09
321_T	387_A	0.549	0.09
324_H	391_S	0.549	0.09
123_A	556_V	0.548	0.09
65_M	73_H	0.548	0.09
88_V	552_T	0.546	0.09
384_P	493_T	0.545	0.09
210_A	610_V	0.545	0.09
307_V	341_A	0.545	0.09
104_A	129_A	0.544	0.09
54_F	392_Y	0.542	0.09
89_A	418_C	0.541	0.09
471_Q	610_V	0.541	0.09
150_A	333_E	0.540	0.09
354_A	418_C	0.540	0.09
211_L	377_F	0.540	0.09
533_V	543_G	0.539	0.09
287_L	382_Y	0.539	0.09
392_Y	433_G	0.538	0.09
274_R	534_N	0.538	0.09
218_G	367_L	0.537	0.09
221_V	556_V	0.536	0.09
66_A	280_T	0.536	0.09
73_H	123_A	0.535	0.09
258_E	581_T	0.535	0.09
341_A	437_S	0.534	0.09
167_T	552_T	0.532	0.09
533_V	540_N	0.532	0.09
471_Q	515_V	0.531	0.09
327_N	395_G	0.531	0.09
62_V	618_V	0.531	0.09
108_T	483_V	0.530	0.09
361_T	550_A	0.530	0.09
305_Q	476_I	0.528	0.09
583_F	593_S	0.528	0.09
483_V	551_L	0.528	0.09
66_A	221_V	0.528	0.09
301_G	354_A	0.525	0.09
288_P	533_V	0.524	0.09
61_A	355_T	0.522	0.09
354_A	542_V	0.522	0.09
495_Y	509_E	0.520	0.09
370_Q	515_V	0.520	0.09
303_L	595_A	0.519	0.09
249_G	571_A	0.518	0.09
83_S	443_A	0.517	0.09
292_P	497_L	0.517	0.09
296_G	495_Y	0.517	0.09
347_R	561_A	0.515	0.09
227_W	287_L	0.515	0.09
324_H	526_M	0.515	0.09
503_M	527_T	0.514	0.09
241_G	538_S	0.513	0.09
354_A	530_T	0.513	0.09
237_D	484_A	0.513	0.09
458_A	561_A	0.510	0.09
300_G	530_T	0.509	0.09
453_D	489_G	0.508	0.09
409_T	518_L	0.508	0.09
191_P	561_A	0.507	0.09
288_P	483_V	0.506	0.09
309_D	511_L	0.506	0.09
413_A	560_E	0.506	0.09
85_L	415_A	0.506	0.09
328_L	510_R	0.505	0.09
357_P	418_C	0.504	0.09
319_H	414_D	0.504	0.09
241_G	507_L	0.503	0.09
320_A	475_G	0.503	0.09
122_A	487_E	0.502	0.09
477_G	525_V	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zwsA	2	0.2644	98	0.949	Contact Map
4wgkA	2	0.2821	97.7	0.952	Contact Map
3v8eA	2	0.2548	55.6	0.978	Contact Map
1im5A	1	0.2436	51.7	0.979	Contact Map
3pl1A	1	0.2484	49.3	0.979	Contact Map
1nf9A	2	0.2885	46.7	0.979	Contact Map
3eefA	4	0.2436	37.5	0.98	Contact Map
1yzvA	6	0.2885	32.6	0.981	Contact Map
1hi9A	5	0.3542	29.5	0.981	Contact Map
2pr7A	1	0.1907	28.4	0.981	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0132 seconds.