Q9HSG2 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HSG2 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HSG2	Sequences: MKFIEEVVVEEFLPTFRSLLAADLRERGLTQHEVAELLGVSQSAVSKYAHGDVTTDDEIAADDRVQELVERTGSGLATGNVSQVQALVEAEVLVRELSTSSDILAERHEAANPALADYDGDFTVHDADSEVRVREHVLSSVRRGVRMLERTSGFATQIPAVGANLVECTPEADTVEDVAGVPGRVLDVMGRTEIPAEPEFGVSAYVATVLLDARAAGVDAHAALNIAYSADTVAALADAGYAVVEFEPEGESTTDDHHIRDAVRDADAVDVLYQTGGYGVEPIVYVLAENAPDAVRMARGLL	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	302 (292)
Sequences:	146 (108)
Seq/√Len:	6.3

HALSA - Q9HSG2
SULSO - Q97ZV8

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
166_V	180_G	8.420	1.00
288_A	294_A	6.518	1.00
141_V	291_A	4.699	0.98
23_D	73_G	3.597	0.90
172_A	214_R	2.900	0.77
34_V	166_V	2.841	0.76
138_L	179_A	2.766	0.74
138_L	200_F	2.756	0.73
4_I	105_A	2.638	0.70
270_D	297_M	2.635	0.70
40_V	192_T	2.556	0.67
105_A	120_G	2.492	0.65
241_Y	270_D	2.466	0.64
34_V	180_G	2.370	0.61
214_R	287_L	2.360	0.61
226_I	259_I	2.339	0.60
133_V	170_P	2.272	0.58
169_T	200_F	2.270	0.58
223_A	251_E	2.216	0.56
179_A	200_F	2.066	0.50
105_A	144_G	2.048	0.50
135_E	200_F	2.026	0.49
226_I	288_A	1.998	0.48
23_D	70_E	1.898	0.44
141_V	179_A	1.869	0.43
145_V	158_I	1.866	0.43
145_V	189_M	1.863	0.43
280_V	295_V	1.862	0.43
22_A	40_V	1.802	0.41
124_V	128_D	1.788	0.40
4_I	123_T	1.764	0.39
147_M	295_V	1.746	0.39
263_V	267_D	1.723	0.38
108_H	113_P	1.691	0.37
60_A	260_R	1.678	0.36
161_V	277_G	1.676	0.36
27_R	262_A	1.639	0.35
222_A	294_A	1.626	0.35
34_V	143_R	1.612	0.34
167_E	291_A	1.576	0.33
23_D	80_N	1.574	0.33
33_E	262_A	1.572	0.33
168_C	181_V	1.568	0.33
105_A	123_T	1.555	0.32
154_F	200_F	1.547	0.32
279_G	282_P	1.542	0.32
45_V	285_Y	1.529	0.32
72_T	112_N	1.499	0.31
137_V	200_F	1.494	0.31
286_V	296_R	1.492	0.30
31_Q	42_Q	1.484	0.30
276_G	281_E	1.475	0.30
14_P	17_R	1.470	0.30
32_H	288_A	1.454	0.29
241_Y	293_D	1.451	0.29
10_E	122_F	1.444	0.29
69_V	214_R	1.438	0.29
61_A	261_D	1.436	0.29
137_V	169_T	1.416	0.28
20_L	300_G	1.396	0.28
63_D	171_E	1.389	0.27
165_L	277_G	1.384	0.27
141_V	167_E	1.373	0.27
203_S	282_P	1.365	0.27
129_S	204_A	1.365	0.27
141_V	191_R	1.354	0.26
157_Q	229_S	1.348	0.26
121_D	286_V	1.339	0.26
154_F	189_M	1.335	0.26
66_Q	218_V	1.322	0.25
169_T	179_A	1.303	0.25
120_G	123_T	1.295	0.25
154_F	179_A	1.295	0.25
14_P	35_A	1.289	0.25
44_A	108_H	1.285	0.24
168_C	172_A	1.282	0.24
25_R	34_V	1.277	0.24
7_V	70_E	1.272	0.24
72_T	218_V	1.271	0.24
226_I	241_Y	1.267	0.24
18_S	284_V	1.266	0.24
16_F	208_T	1.262	0.24
234_A	241_Y	1.258	0.24
198_P	285_Y	1.256	0.24
136_H	227_A	1.248	0.23
149_E	194_I	1.246	0.23
201_G	282_P	1.245	0.23
65_V	68_L	1.244	0.23
106_E	269_V	1.241	0.23
40_V	196_A	1.241	0.23
104_L	257_H	1.239	0.23
40_V	80_N	1.239	0.23
159_P	183_G	1.237	0.23
67_E	171_E	1.215	0.23
87_L	139_S	1.203	0.22
40_V	254_T	1.195	0.22
164_N	281_E	1.191	0.22
208_T	289_E	1.179	0.22
39_G	45_V	1.175	0.22
201_G	210_L	1.151	0.21
52_D	147_M	1.145	0.21
96_E	112_N	1.143	0.21
147_M	288_A	1.142	0.21
23_D	74_S	1.137	0.21
158_I	286_V	1.135	0.21
141_V	294_A	1.134	0.21
177_D	272_L	1.132	0.21
218_V	226_I	1.123	0.20
3_F	25_R	1.116	0.20
46_S	200_F	1.112	0.20
133_V	301_L	1.112	0.20
57_D	60_A	1.110	0.20
10_E	66_Q	1.105	0.20
41_S	177_D	1.104	0.20
17_R	35_A	1.099	0.20
154_F	169_T	1.096	0.20
245_E	275_T	1.090	0.20
69_V	213_A	1.088	0.20
19_L	63_D	1.080	0.19
10_E	46_S	1.072	0.19
35_A	177_D	1.066	0.19
68_L	139_S	1.062	0.19
61_A	264_R	1.062	0.19
72_T	99_T	1.061	0.19
166_V	202_V	1.060	0.19
180_G	221_H	1.058	0.19
211_L	229_S	1.055	0.19
120_G	144_G	1.053	0.19
29_L	40_V	1.050	0.19
241_Y	267_D	1.049	0.19
35_A	41_S	1.049	0.19
178_V	190_G	1.040	0.18
32_H	40_V	1.039	0.18
161_V	246_F	1.032	0.18
185_V	229_S	1.031	0.18
168_C	178_V	1.024	0.18
206_V	247_E	1.021	0.18
73_G	286_V	1.021	0.18
4_I	120_G	1.019	0.18
80_N	119_D	1.019	0.18
42_Q	198_P	1.016	0.18
31_Q	198_P	1.016	0.18
46_S	137_V	1.014	0.18
34_V	293_D	1.012	0.18
4_I	144_G	1.010	0.18
40_V	219_D	1.002	0.18
178_V	240_G	1.001	0.18
192_T	301_L	0.999	0.18
49_A	139_S	0.998	0.18
87_L	273_Y	0.998	0.18
108_H	115_L	0.990	0.17
26_E	149_E	0.987	0.17
78_T	271_V	0.985	0.17
37_L	248_P	0.980	0.17
14_P	201_G	0.977	0.17
162_G	223_A	0.975	0.17
221_H	240_G	0.974	0.17
229_S	232_T	0.972	0.17
158_I	242_A	0.967	0.17
151_T	287_L	0.964	0.17
197_E	274_Q	0.962	0.17
184_R	225_N	0.960	0.17
10_E	19_L	0.958	0.17
87_L	115_L	0.956	0.17
182_P	200_F	0.955	0.17
168_C	214_R	0.953	0.17
10_E	231_D	0.950	0.17
230_A	287_L	0.950	0.17
147_M	283_I	0.949	0.17
24_L	285_Y	0.947	0.17
226_I	231_D	0.943	0.16
173_D	300_G	0.936	0.16
39_G	285_Y	0.934	0.16
18_S	272_L	0.926	0.16
117_D	233_V	0.921	0.16
30_T	51_G	0.921	0.16
173_D	191_R	0.917	0.16
41_S	293_D	0.913	0.16
224_L	286_V	0.912	0.16
161_V	198_P	0.911	0.16
252_S	280_V	0.909	0.16
18_S	244_V	0.909	0.16
37_L	270_D	0.908	0.16
55_T	60_A	0.907	0.16
158_I	222_A	0.899	0.16
102_D	253_T	0.896	0.16
141_V	165_L	0.893	0.15
74_S	254_T	0.892	0.15
181_V	235_A	0.891	0.15
101_S	240_G	0.891	0.15
86_A	89_E	0.889	0.15
37_L	112_N	0.889	0.15
150_R	239_A	0.882	0.15
75_G	212_D	0.882	0.15
192_T	294_A	0.877	0.15
158_I	165_L	0.872	0.15
170_P	199_E	0.871	0.15
42_Q	285_Y	0.871	0.15
31_Q	285_Y	0.871	0.15
83_Q	287_L	0.870	0.15
241_Y	297_M	0.867	0.15
164_N	276_G	0.856	0.15
11_E	59_I	0.853	0.15
147_M	160_A	0.853	0.15
11_E	56_D	0.848	0.15
180_G	202_V	0.847	0.15
72_T	272_L	0.845	0.15
223_A	232_T	0.845	0.15
249_E	260_R	0.844	0.15
205_Y	269_V	0.841	0.15
41_S	219_D	0.840	0.15
277_G	285_Y	0.840	0.15
109_E	246_F	0.835	0.14
259_I	296_R	0.829	0.14
150_R	252_S	0.828	0.14
159_P	164_N	0.826	0.14
164_N	183_G	0.826	0.14
145_V	181_V	0.825	0.14
24_L	31_Q	0.825	0.14
24_L	42_Q	0.825	0.14
152_S	176_E	0.824	0.14
179_A	224_L	0.823	0.14
130_E	224_L	0.815	0.14
286_V	298_A	0.814	0.14
179_A	225_N	0.812	0.14
127_A	204_A	0.811	0.14
36_E	226_I	0.807	0.14
87_L	228_Y	0.806	0.14
228_Y	277_G	0.805	0.14
93_L	190_G	0.803	0.14
32_H	251_E	0.801	0.14
224_L	244_V	0.801	0.14
218_V	222_A	0.799	0.14
293_D	297_M	0.798	0.14
212_D	294_A	0.797	0.14
117_D	259_I	0.795	0.14
187_D	204_A	0.790	0.14
173_D	259_I	0.789	0.14
182_P	198_P	0.788	0.14
225_N	279_G	0.788	0.14
24_L	164_N	0.779	0.13
161_V	285_Y	0.778	0.13
155_A	188_V	0.778	0.13
113_P	161_V	0.777	0.13
81_V	158_I	0.776	0.13
22_A	196_A	0.774	0.13
23_D	72_T	0.774	0.13
148_L	178_V	0.771	0.13
51_G	211_L	0.770	0.13
49_A	120_G	0.768	0.13
83_Q	274_Q	0.767	0.13
110_A	254_T	0.766	0.13
10_E	58_E	0.765	0.13
212_D	253_T	0.765	0.13
274_Q	287_L	0.760	0.13
41_S	172_A	0.759	0.13
14_P	210_L	0.754	0.13
74_S	260_R	0.754	0.13
172_A	210_L	0.754	0.13
7_V	112_N	0.753	0.13
33_E	80_N	0.752	0.13
18_S	22_A	0.749	0.13
195_P	291_A	0.749	0.13
4_I	49_A	0.743	0.13
180_G	196_A	0.742	0.13
99_T	243_V	0.740	0.13
97_L	275_T	0.740	0.13
72_T	278_Y	0.740	0.13
25_R	143_R	0.739	0.13
131_V	137_V	0.737	0.13
17_R	172_A	0.737	0.13
174_T	267_D	0.736	0.13
87_L	138_L	0.735	0.13
134_R	215_A	0.734	0.13
207_A	279_G	0.734	0.13
19_L	223_A	0.731	0.13
83_Q	152_S	0.731	0.13
10_E	45_V	0.730	0.13
185_V	205_Y	0.723	0.13
114_A	226_I	0.719	0.12
163_A	185_V	0.718	0.12
46_S	225_N	0.715	0.12
178_V	221_H	0.713	0.12
247_E	280_V	0.713	0.12
6_E	113_P	0.712	0.12
145_V	178_V	0.712	0.12
228_Y	289_E	0.711	0.12
241_Y	292_P	0.711	0.12
6_E	291_A	0.710	0.12
144_G	203_S	0.710	0.12
55_T	298_A	0.709	0.12
93_L	262_A	0.708	0.12
253_T	296_R	0.705	0.12
114_A	185_V	0.704	0.12
185_V	204_A	0.703	0.12
172_A	178_V	0.702	0.12
186_L	280_V	0.702	0.12
66_Q	234_A	0.701	0.12
159_P	184_R	0.701	0.12
241_Y	271_V	0.697	0.12
205_Y	210_L	0.697	0.12
29_L	181_V	0.695	0.12
47_K	200_F	0.693	0.12
29_L	32_H	0.692	0.12
166_V	196_A	0.690	0.12
42_Q	45_V	0.689	0.12
31_Q	45_V	0.689	0.12
144_G	269_V	0.688	0.12
165_L	168_C	0.688	0.12
192_T	230_A	0.679	0.12
142_R	162_G	0.676	0.12
183_G	281_E	0.675	0.12
159_P	281_E	0.675	0.12
57_D	80_N	0.671	0.12
227_A	260_R	0.666	0.12
122_F	260_R	0.664	0.12
51_G	217_G	0.663	0.12
141_V	168_C	0.660	0.12
87_L	94_V	0.655	0.11
208_T	290_N	0.654	0.11
49_A	105_A	0.653	0.11
173_D	232_T	0.652	0.11
174_T	244_V	0.651	0.11
90_A	96_E	0.649	0.11
177_D	181_V	0.648	0.11
86_A	94_V	0.647	0.11
110_A	232_T	0.647	0.11
24_L	45_V	0.645	0.11
156_T	196_A	0.645	0.11
43_S	105_A	0.643	0.11
34_V	149_E	0.642	0.11
152_S	192_T	0.641	0.11
54_T	80_N	0.640	0.11
108_H	162_G	0.639	0.11
95_R	240_G	0.639	0.11
65_V	292_P	0.637	0.11
36_E	138_L	0.635	0.11
216_A	264_R	0.635	0.11
160_A	242_A	0.632	0.11
22_A	103_I	0.631	0.11
78_T	234_A	0.630	0.11
177_D	237_A	0.630	0.11
250_G	253_T	0.630	0.11
34_V	189_M	0.628	0.11
111_A	284_V	0.627	0.11
172_A	260_R	0.626	0.11
69_V	179_A	0.624	0.11
149_E	269_V	0.620	0.11
232_T	260_R	0.619	0.11
229_S	251_E	0.618	0.11
34_V	49_A	0.617	0.11
146_R	301_L	0.616	0.11
162_G	206_V	0.615	0.11
185_V	294_A	0.612	0.11
154_F	227_A	0.611	0.11
30_T	206_V	0.609	0.11
288_A	301_L	0.608	0.11
85_Q	120_G	0.608	0.11
27_R	86_A	0.604	0.11
29_L	254_T	0.604	0.11
75_G	146_R	0.602	0.11
94_V	170_P	0.602	0.11
33_E	43_S	0.601	0.11
7_V	20_L	0.600	0.11
15_T	298_A	0.599	0.11
49_A	123_T	0.598	0.11
113_P	291_A	0.596	0.11
73_G	101_S	0.596	0.11
137_V	181_V	0.593	0.11
30_T	58_E	0.592	0.11
70_E	147_M	0.591	0.11
4_I	287_L	0.591	0.11
119_D	248_P	0.588	0.11
40_V	299_R	0.587	0.11
178_V	260_R	0.587	0.11
134_R	188_V	0.586	0.10
161_V	248_P	0.585	0.10
104_L	298_A	0.584	0.10
137_V	222_A	0.582	0.10
232_T	273_Y	0.582	0.10
88_V	91_E	0.573	0.10
43_S	109_E	0.569	0.10
140_S	167_E	0.568	0.10
209_V	274_Q	0.568	0.10
16_F	155_A	0.567	0.10
76_L	218_V	0.566	0.10
207_A	240_G	0.565	0.10
35_A	155_A	0.564	0.10
56_D	272_L	0.563	0.10
94_V	243_V	0.563	0.10
4_I	43_S	0.561	0.10
58_E	212_D	0.560	0.10
120_G	284_V	0.559	0.10
163_A	251_E	0.559	0.10
212_D	269_V	0.558	0.10
291_A	294_A	0.554	0.10
14_P	207_A	0.551	0.10
154_F	204_A	0.551	0.10
143_R	187_D	0.549	0.10
263_V	280_V	0.549	0.10
120_G	202_V	0.548	0.10
93_L	301_L	0.547	0.10
65_V	209_V	0.545	0.10
150_R	227_A	0.543	0.10
149_E	181_V	0.543	0.10
19_L	76_L	0.543	0.10
158_I	228_Y	0.541	0.10
19_L	110_A	0.538	0.10
5_E	258_H	0.536	0.10
151_T	172_A	0.535	0.10
68_L	91_E	0.534	0.10
204_A	293_D	0.532	0.10
101_S	146_R	0.531	0.10
38_L	49_A	0.531	0.10
27_R	30_T	0.530	0.10
57_D	253_T	0.530	0.10
107_R	157_Q	0.526	0.10
185_V	298_A	0.526	0.10
7_V	282_P	0.522	0.10
72_T	110_A	0.520	0.10
144_G	299_R	0.517	0.10
235_A	284_V	0.516	0.10
93_L	133_V	0.514	0.10
166_V	292_P	0.513	0.10
14_P	199_E	0.511	0.10
259_I	262_A	0.510	0.09
180_G	235_A	0.509	0.09
137_V	173_D	0.508	0.09
32_H	294_A	0.507	0.09
29_L	277_G	0.506	0.09
38_L	198_P	0.506	0.09
192_T	215_A	0.505	0.09
12_F	44_A	0.504	0.09
75_G	89_E	0.504	0.09
121_D	196_A	0.503	0.09
7_V	36_E	0.501	0.09
227_A	263_V	0.501	0.09
268_A	290_N	0.500	0.09

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2phpA	3	0.5695	100	0.519	Contact Map
2pb9A	3	0.5596	100	0.523	Contact Map
2cw1A	1	0.2119	98.2	0.915	Contact Map
3vwbA	1	0.3841	98	0.919	Contact Map
3kxaA	4	0.2748	97.7	0.924	Contact Map
1zugA	1	0.2252	97.3	0.929	Contact Map
2w7nA	2	0.2616	97.1	0.932	Contact Map
1neqA	1	0.2318	97.1	0.932	Contact Map
2mqkA	1	0.2086	97	0.933	Contact Map
3kz3A	2	0.2649	96.9	0.934	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0094 seconds.