Q9HSE4 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HSE4 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HSE4	Sequences: MDYTQERVATLHDYGDADPPAPAGRAAVVVPMTDREYASLATERVFSELERVDPAAVVVPLRAPAERVPAFREWLAGFDLDLTLLWCDGPRVEGLLADAGLDGPRGKGRDVWLALGVAARHDFVVLHDADTDTYEARDVNKLLFPLADGFDFSKGYYARVENDRLYGRLFRLFYTPLVAALEDTHDHDVLDFLGSFRYALAGECGLTSEAARGLRVQREWGLEVGTLGEAFRLAGAAGVAQVDLGRYEHDHRAVSGPTGLSEMSRGVGAALLRAVADTGVDIAYDTVRERYREHATRLVDAYSADAAFNDLSYDAERERDQITTYAQAVQPPGADTRLPAWSTVSLTPGDVAAAARADAADTEE	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	364 (358)
Sequences:	274 (168)
Seq/√Len:	8.9

HALSA - Q9HSE4

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
95_L	351_V	4.776	0.99
68_V	72_R	4.601	0.99
64_P	67_R	4.565	0.99
3_Y	6_E	4.467	0.99
38_A	67_R	4.276	0.99
29_V	115_L	4.122	0.98
193_L	271_L	3.497	0.96
170_F	199_A	3.495	0.96
34_D	70_A	3.406	0.95
30_V	129_A	3.330	0.94
96_L	99_A	3.320	0.94
299_V	322_I	3.287	0.94
254_V	321_Q	3.244	0.93
27_A	121_H	2.993	0.90
40_L	43_E	2.967	0.90
26_A	143_L	2.906	0.89
153_S	205_G	2.879	0.88
85_L	92_V	2.873	0.88
68_V	84_L	2.860	0.88
32_M	42_T	2.825	0.87
12_H	305_D	2.807	0.87
14_Y	141_K	2.653	0.83
150_F	304_A	2.567	0.81
58_V	118_A	2.473	0.79
175_T	194_G	2.407	0.77
217_Q	225_G	2.310	0.74
3_Y	123_F	2.212	0.70
98_D	354_A	2.170	0.69
210_A	234_A	2.149	0.68
155_G	247_Y	2.140	0.68
102_D	113_L	2.120	0.67
27_A	308_F	2.119	0.67
126_L	204_C	2.081	0.65
211_A	308_F	2.074	0.65
173_F	211_A	2.039	0.64
224_V	270_A	2.017	0.63
179_A	194_G	2.017	0.63
58_V	79_D	2.004	0.62
27_A	55_A	1.969	0.61
29_V	118_A	1.945	0.60
52_V	55_A	1.931	0.59
47_S	77_G	1.892	0.58
72_R	84_L	1.888	0.57
264_S	328_A	1.888	0.57
350_D	354_A	1.877	0.57
60_P	110_D	1.872	0.57
231_F	278_T	1.762	0.52
11_L	261_S	1.736	0.51
105_R	235_G	1.697	0.49
261_S	328_A	1.650	0.47
29_V	99_A	1.599	0.45
152_F	156_Y	1.597	0.45
270_A	313_Y	1.592	0.45
299_V	350_D	1.579	0.44
272_L	275_V	1.572	0.44
173_F	268_G	1.568	0.44
303_S	315_A	1.563	0.43
122_D	209_E	1.557	0.43
46_F	243_D	1.551	0.43
43_E	47_S	1.547	0.43
206_L	210_A	1.533	0.42
13_D	141_K	1.529	0.42
205_G	298_L	1.523	0.42
92_V	270_A	1.521	0.42
89_G	350_D	1.516	0.41
180_A	184_T	1.514	0.41
81_D	120_R	1.500	0.41
68_V	303_S	1.500	0.41
56_A	83_T	1.498	0.41
44_R	156_Y	1.493	0.40
139_V	146_L	1.487	0.40
10_T	84_L	1.474	0.40
83_T	360_A	1.464	0.39
89_G	92_V	1.458	0.39
29_V	308_F	1.457	0.39
173_F	261_S	1.457	0.39
127_H	134_Y	1.448	0.39
43_E	77_G	1.443	0.38
15_G	224_V	1.436	0.38
8_V	192_F	1.421	0.38
18_D	287_V	1.417	0.37
24_G	105_R	1.404	0.37
84_L	322_I	1.401	0.37
37_Y	71_F	1.399	0.37
3_Y	8_V	1.388	0.36
257_P	351_V	1.384	0.36
131_T	247_Y	1.383	0.36
143_L	205_G	1.379	0.36
10_T	201_A	1.374	0.36
135_E	322_I	1.367	0.35
195_S	331_P	1.361	0.35
115_L	211_A	1.359	0.35
123_F	205_G	1.356	0.35
56_A	120_R	1.345	0.35
95_L	224_V	1.342	0.34
255_S	261_S	1.337	0.34
158_A	271_L	1.328	0.34
69_P	73_E	1.325	0.34
65_A	69_P	1.325	0.34
201_A	351_V	1.324	0.34
178_V	224_V	1.312	0.33
46_F	299_V	1.289	0.32
193_L	208_S	1.286	0.32
110_D	114_A	1.280	0.32
3_Y	7_R	1.278	0.32
44_R	50_E	1.276	0.32
48_E	209_E	1.262	0.31
230_A	239_V	1.261	0.31
23_A	268_G	1.253	0.31
58_V	350_D	1.250	0.31
138_D	247_Y	1.248	0.31
206_L	303_S	1.246	0.31
3_Y	196_F	1.246	0.31
39_S	74_W	1.246	0.31
282_I	328_A	1.241	0.31
276_A	344_V	1.238	0.30
25_R	238_G	1.236	0.30
352_A	356_R	1.231	0.30
12_H	101_L	1.226	0.30
52_V	139_V	1.190	0.29
3_Y	158_A	1.189	0.29
122_D	201_A	1.187	0.29
276_A	289_E	1.182	0.28
42_T	75_L	1.182	0.28
44_R	192_F	1.181	0.28
242_V	339_P	1.170	0.28
101_L	305_D	1.169	0.28
3_Y	205_G	1.159	0.28
189_V	228_G	1.156	0.28
9_A	342_S	1.134	0.27
29_V	262_E	1.130	0.27
96_L	143_L	1.123	0.26
76_A	79_D	1.122	0.26
124_V	208_S	1.117	0.26
208_S	253_A	1.113	0.26
195_S	360_A	1.111	0.26
92_V	322_I	1.110	0.26
9_A	119_A	1.105	0.26
67_R	99_A	1.102	0.26
234_A	287_V	1.101	0.26
87_C	110_D	1.088	0.25
48_E	51_R	1.080	0.25
218_R	248_E	1.078	0.25
83_T	120_R	1.073	0.25
278_T	287_V	1.071	0.25
41_A	186_D	1.068	0.25
65_A	180_A	1.064	0.24
303_S	313_Y	1.049	0.24
147_A	334_A	1.048	0.24
5_Q	195_S	1.047	0.24
129_A	269_A	1.044	0.24
149_G	209_E	1.041	0.24
299_V	315_A	1.040	0.24
67_R	93_E	1.037	0.24
158_A	178_V	1.032	0.23
160_V	248_E	1.019	0.23
61_L	68_V	1.017	0.23
281_D	284_Y	1.012	0.23
53_D	329_V	1.011	0.23
205_G	210_A	1.011	0.23
148_D	329_V	1.006	0.23
8_V	327_Q	1.006	0.23
178_V	194_G	0.999	0.22
9_A	95_L	0.998	0.22
73_E	322_I	0.998	0.22
96_L	113_L	0.997	0.22
178_V	209_E	0.995	0.22
59_V	75_L	0.994	0.22
297_R	319_R	0.989	0.22
229_E	232_R	0.988	0.22
75_L	174_Y	0.984	0.22
17_A	38_A	0.983	0.22
175_T	179_A	0.981	0.22
158_A	298_L	0.973	0.22
15_G	165_L	0.971	0.22
48_E	136_A	0.969	0.22
138_D	146_L	0.959	0.21
74_W	256_G	0.957	0.21
254_V	346_L	0.956	0.21
72_R	201_A	0.956	0.21
59_V	244_L	0.955	0.21
59_V	217_Q	0.950	0.21
17_A	67_R	0.947	0.21
135_E	256_G	0.945	0.21
27_A	56_A	0.943	0.21
178_V	199_A	0.942	0.21
64_P	77_G	0.942	0.21
256_G	320_D	0.940	0.21
193_L	230_A	0.939	0.21
208_S	357_A	0.936	0.21
39_S	210_A	0.934	0.21
156_Y	243_D	0.933	0.21
293_E	297_R	0.923	0.20
98_D	270_A	0.921	0.20
54_P	136_A	0.919	0.20
230_A	345_S	0.917	0.20
13_D	17_A	0.915	0.20
50_E	253_A	0.910	0.20
319_R	343_T	0.905	0.20
248_E	293_E	0.896	0.20
49_L	66_E	0.894	0.19
300_D	310_D	0.894	0.19
208_S	313_Y	0.894	0.19
60_P	114_A	0.891	0.19
77_G	253_A	0.891	0.19
183_D	280_V	0.888	0.19
93_E	299_V	0.887	0.19
14_Y	139_V	0.879	0.19
153_S	242_V	0.878	0.19
139_V	255_S	0.877	0.19
99_A	115_L	0.874	0.19
27_A	179_A	0.873	0.19
297_R	343_T	0.871	0.19
165_L	265_R	0.869	0.19
196_F	283_A	0.867	0.19
29_V	211_A	0.867	0.19
115_L	280_V	0.867	0.19
178_V	356_R	0.866	0.19
178_V	190_L	0.866	0.19
71_F	75_L	0.866	0.19
270_A	337_R	0.865	0.19
19_P	95_L	0.864	0.19
85_L	322_I	0.863	0.19
316_E	343_T	0.862	0.19
140_N	359_A	0.860	0.19
147_A	270_A	0.858	0.19
44_R	65_A	0.857	0.18
123_F	238_G	0.855	0.18
91_R	247_Y	0.854	0.18
353_A	360_A	0.854	0.18
149_G	175_T	0.850	0.18
135_E	280_V	0.848	0.18
146_L	224_V	0.845	0.18
197_R	273_R	0.843	0.18
45_V	332_P	0.842	0.18
164_R	292_R	0.841	0.18
248_E	319_R	0.839	0.18
150_F	246_R	0.838	0.18
86_W	116_G	0.835	0.18
81_D	132_D	0.835	0.18
57_V	144_F	0.832	0.18
92_V	291_Y	0.829	0.18
218_R	337_R	0.829	0.18
18_D	143_L	0.824	0.18
59_V	82_L	0.822	0.18
39_S	65_A	0.817	0.17
61_L	262_E	0.815	0.17
140_N	195_S	0.814	0.17
112_W	127_H	0.810	0.17
143_L	301_A	0.808	0.17
233_L	316_E	0.803	0.17
25_R	56_A	0.803	0.17
11_L	156_Y	0.799	0.17
226_T	246_R	0.799	0.17
98_D	327_Q	0.799	0.17
46_F	230_A	0.797	0.17
9_A	158_A	0.797	0.17
118_A	348_P	0.797	0.17
265_R	315_A	0.793	0.17
189_V	244_L	0.793	0.17
5_Q	149_G	0.792	0.17
70_A	236_A	0.790	0.17
123_F	141_K	0.787	0.17
59_V	228_G	0.785	0.17
85_L	109_R	0.785	0.17
96_L	164_R	0.785	0.17
131_T	262_E	0.784	0.17
93_E	230_A	0.783	0.17
32_M	71_F	0.782	0.17
55_A	195_S	0.781	0.17
85_L	134_Y	0.778	0.17
247_Y	324_T	0.778	0.17
115_L	193_L	0.777	0.16
109_R	190_L	0.774	0.16
205_G	230_A	0.772	0.16
42_T	59_V	0.772	0.16
332_P	338_L	0.767	0.16
40_L	193_L	0.765	0.16
231_F	270_A	0.763	0.16
214_L	360_A	0.760	0.16
140_N	146_L	0.756	0.16
63_A	279_G	0.755	0.16
287_V	304_A	0.755	0.16
9_A	212_R	0.751	0.16
25_R	262_E	0.749	0.16
195_S	351_V	0.749	0.16
197_R	222_L	0.744	0.16
127_H	142_L	0.744	0.16
11_L	320_D	0.743	0.16
110_D	189_V	0.741	0.16
14_Y	117_V	0.741	0.16
64_P	253_A	0.739	0.16
52_V	141_K	0.739	0.16
50_E	79_D	0.738	0.16
95_L	354_A	0.735	0.16
54_P	141_K	0.734	0.15
210_A	239_V	0.733	0.15
25_R	209_E	0.732	0.15
74_W	201_A	0.732	0.15
272_L	304_A	0.732	0.15
64_P	93_E	0.731	0.15
150_F	321_Q	0.731	0.15
255_S	266_G	0.729	0.15
158_A	360_A	0.728	0.15
5_Q	205_G	0.727	0.15
10_T	261_S	0.722	0.15
204_C	224_V	0.722	0.15
278_T	326_A	0.718	0.15
40_L	353_A	0.718	0.15
20_P	121_H	0.717	0.15
268_G	272_L	0.716	0.15
11_L	304_A	0.716	0.15
30_V	35_R	0.714	0.15
201_A	321_Q	0.714	0.15
7_R	210_A	0.712	0.15
117_V	141_K	0.712	0.15
74_W	245_G	0.712	0.15
210_A	231_F	0.710	0.15
71_F	199_A	0.710	0.15
180_A	281_D	0.708	0.15
16_D	46_F	0.703	0.15
7_R	205_G	0.702	0.15
173_F	180_A	0.700	0.15
206_L	265_R	0.700	0.15
59_V	305_D	0.699	0.15
164_R	243_D	0.697	0.15
135_E	257_P	0.695	0.15
95_L	321_Q	0.694	0.15
129_A	276_A	0.690	0.15
75_L	319_R	0.689	0.14
65_A	262_E	0.686	0.14
191_D	331_P	0.686	0.14
8_V	313_Y	0.683	0.14
74_W	99_A	0.681	0.14
68_V	262_E	0.680	0.14
27_A	115_L	0.679	0.14
92_V	277_D	0.678	0.14
8_V	320_D	0.678	0.14
74_W	258_T	0.676	0.14
79_D	322_I	0.675	0.14
60_P	264_S	0.674	0.14
26_A	299_V	0.670	0.14
277_D	316_E	0.667	0.14
99_A	185_H	0.666	0.14
160_V	243_D	0.666	0.14
213_G	293_E	0.666	0.14
205_G	262_E	0.665	0.14
149_G	278_T	0.663	0.14
174_Y	297_R	0.663	0.14
98_D	151_D	0.661	0.14
204_C	217_Q	0.661	0.14
75_L	217_Q	0.659	0.14
75_L	293_E	0.659	0.14
184_T	344_V	0.658	0.14
25_R	243_D	0.657	0.14
142_L	152_F	0.657	0.14
285_D	333_G	0.656	0.14
252_R	325_Y	0.654	0.14
243_D	305_D	0.652	0.14
84_L	178_V	0.651	0.14
265_R	271_L	0.649	0.14
56_A	148_D	0.648	0.14
206_L	211_A	0.647	0.14
270_A	314_D	0.647	0.14
274_A	296_T	0.646	0.14
43_E	74_W	0.645	0.14
217_Q	229_E	0.644	0.14
174_Y	293_E	0.643	0.14
96_L	298_L	0.643	0.14
44_R	253_A	0.643	0.14
132_D	355_A	0.642	0.14
250_D	325_Y	0.642	0.14
101_L	160_V	0.642	0.14
192_F	199_A	0.641	0.13
61_L	88_D	0.639	0.13
151_D	212_R	0.639	0.13
12_H	59_V	0.639	0.13
64_P	165_L	0.639	0.13
93_E	329_V	0.637	0.13
11_L	237_A	0.637	0.13
85_L	114_A	0.636	0.13
38_A	73_E	0.634	0.13
166_Y	248_E	0.634	0.13
89_G	247_Y	0.634	0.13
135_E	327_Q	0.633	0.13
158_A	278_T	0.632	0.13
6_E	195_S	0.631	0.13
261_S	264_S	0.631	0.13
209_E	301_A	0.630	0.13
21_A	340_A	0.627	0.13
92_V	161_E	0.627	0.13
187_H	299_V	0.625	0.13
97_A	201_A	0.624	0.13
123_F	149_G	0.622	0.13
96_L	335_D	0.618	0.13
265_R	331_P	0.617	0.13
139_V	326_A	0.617	0.13
244_L	272_L	0.617	0.13
133_T	319_R	0.617	0.13
206_L	253_A	0.616	0.13
188_D	333_G	0.616	0.13
294_H	298_L	0.615	0.13
50_E	77_G	0.613	0.13
208_S	231_F	0.613	0.13
209_E	352_A	0.612	0.13
229_E	295_A	0.610	0.13
96_L	195_S	0.609	0.13
13_D	308_F	0.609	0.13
104_P	211_A	0.609	0.13
112_W	222_L	0.608	0.13
174_Y	219_E	0.608	0.13
69_P	72_R	0.601	0.13
8_V	210_A	0.601	0.13
66_E	120_R	0.601	0.13
164_R	329_V	0.599	0.13
343_T	347_T	0.598	0.13
46_F	355_A	0.595	0.13
92_V	113_L	0.595	0.13
8_V	329_V	0.594	0.13
134_Y	155_G	0.593	0.13
214_L	313_Y	0.592	0.13
243_D	301_A	0.591	0.13
13_D	117_V	0.590	0.12
12_H	319_R	0.590	0.12
126_L	229_E	0.590	0.12
206_L	315_A	0.590	0.12
15_G	20_P	0.588	0.12
109_R	152_F	0.587	0.12
191_D	342_S	0.587	0.12
232_R	293_E	0.586	0.12
193_L	206_L	0.583	0.12
89_G	322_I	0.582	0.12
91_R	358_D	0.581	0.12
58_V	360_A	0.580	0.12
194_G	212_R	0.579	0.12
40_L	124_V	0.578	0.12
75_L	305_D	0.578	0.12
43_E	238_G	0.577	0.12
163_D	191_D	0.576	0.12
91_R	273_R	0.576	0.12
23_A	180_A	0.576	0.12
57_V	312_S	0.574	0.12
230_A	261_S	0.574	0.12
156_Y	308_F	0.573	0.12
246_R	312_S	0.571	0.12
56_A	121_H	0.571	0.12
26_A	138_D	0.571	0.12
71_F	174_Y	0.571	0.12
182_E	201_A	0.571	0.12
114_A	277_D	0.569	0.12
105_R	315_A	0.569	0.12
12_H	225_G	0.568	0.12
8_V	265_R	0.568	0.12
29_V	327_Q	0.567	0.12
14_Y	71_F	0.566	0.12
60_P	87_C	0.563	0.12
193_L	205_G	0.563	0.12
210_A	287_V	0.563	0.12
89_G	358_D	0.562	0.12
126_L	350_D	0.561	0.12
217_Q	316_E	0.561	0.12
273_R	297_R	0.560	0.12
5_Q	243_D	0.560	0.12
69_P	84_L	0.560	0.12
34_D	38_A	0.558	0.12
135_E	303_S	0.557	0.12
80_L	338_L	0.557	0.12
199_A	231_F	0.557	0.12
51_R	65_A	0.556	0.12
214_L	271_L	0.555	0.12
36_E	60_P	0.554	0.12
192_F	315_A	0.553	0.12
296_T	319_R	0.552	0.12
12_H	75_L	0.552	0.12
89_G	93_E	0.550	0.12
59_V	225_G	0.550	0.12
62_R	179_A	0.550	0.12
211_A	329_V	0.549	0.12
53_D	66_E	0.547	0.12
132_D	188_D	0.546	0.12
230_A	299_V	0.545	0.12
73_E	103_G	0.545	0.12
56_A	236_A	0.544	0.12
222_L	273_R	0.544	0.12
320_D	334_A	0.544	0.12
110_D	248_E	0.543	0.12
127_H	155_G	0.542	0.12
131_T	266_G	0.542	0.12
15_G	243_D	0.541	0.12
117_V	344_V	0.540	0.12
67_R	105_R	0.539	0.12
21_A	170_F	0.539	0.12
7_R	214_L	0.537	0.12
143_L	210_A	0.536	0.12
219_E	297_R	0.536	0.12
26_A	56_A	0.536	0.12
39_S	114_A	0.535	0.11
142_L	156_Y	0.534	0.11
94_G	271_L	0.534	0.11
257_P	357_A	0.533	0.11
43_E	280_V	0.533	0.11
142_L	302_Y	0.532	0.11
212_R	298_L	0.531	0.11
178_V	297_R	0.529	0.11
117_V	247_Y	0.528	0.11
226_T	342_S	0.528	0.11
187_H	280_V	0.525	0.11
206_L	352_A	0.525	0.11
81_D	354_A	0.525	0.11
28_V	54_P	0.524	0.11
50_E	299_V	0.524	0.11
206_L	294_H	0.524	0.11
125_V	240_A	0.522	0.11
189_V	288_R	0.521	0.11
165_L	331_P	0.521	0.11
230_A	348_P	0.520	0.11
9_A	355_A	0.520	0.11
345_S	348_P	0.519	0.11
40_L	72_R	0.518	0.11
79_D	82_L	0.518	0.11
92_V	153_S	0.516	0.11
213_G	326_A	0.515	0.11
138_D	206_L	0.512	0.11
47_S	64_P	0.511	0.11
71_F	219_E	0.510	0.11
43_E	214_L	0.510	0.11
92_V	114_A	0.509	0.11
174_Y	319_R	0.508	0.11
193_L	242_V	0.508	0.11
342_S	352_A	0.506	0.11
193_L	224_V	0.506	0.11
42_T	126_L	0.504	0.11
110_D	261_S	0.503	0.11
122_D	151_D	0.502	0.11
54_P	252_R	0.500	0.11
55_A	358_D	0.500	0.11
178_V	348_P	0.500	0.11

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
2zu9A	2	0.8049	100	0.784	Contact Map
2wvlA	2	0.8269	100	0.815	Contact Map
3f1yA	2	0.7445	99.9	0.855	Contact Map
3ckjA	2	0.7692	99.7	0.894	Contact Map
2bo4A	4	0.8297	99.7	0.898	Contact Map
4evwA	1	0.5632	86.1	0.971	Contact Map
4y7uA	1	0.5577	83.7	0.972	Contact Map
3jukA	3	0.6071	78.7	0.974	Contact Map
1qg8A	1	0.6126	75.1	0.974	Contact Map
4jd0A	1	0.5632	72.3	0.975	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.0109 seconds.