Q9HSD6 - HALSA - GREMLIN Contacts

Home
GREMLIN
- Submit - Monomer
- Submit - Complex
Contacts
Metagenomics
- Contacts
- Structures
Structures
- List
Old Projects
- Complexes (2014)
- PFAM (2013)

Q9HSD6 - Uncharacterized protein

UniProt:	Q9HSD6	Sequences: MIAPEDLDVTLVDGYVDEPAHFGVPPYISTYPRYTAGALVDAGVDPANVTYHTIDELRGDTAKFNDVADADLFVYVGGMTVPGKYVGGTPAEPDEVRELAWLADGTSVMGGPVRFGVGEENAGAQEMERSDLDFDFLAMADIEAAAYDLVDNGLEGFEDRYRDNQEINRWAAKGAFVVEQHPNYPEYLICEMETSRGCAYRCSFCTEPMYGDPSFRSADAVVTEVGELYAHGARHFRLGRQADILAFGGDGEAPNPDALRDLYGGIREVAPELGTLHLDNMNPVTIVDYPEKSRDAIRVIAEHNTPGDTAAFGLESADPLVQEENHLLVSAEECLEAVRIVNEVGGWRPGESPADAPSWGEGSPDRLPKLLPGINLLHGLTGERAETFEHNKQFLHSLLDEGLMVRRINIRQVMAFEGTEMADTGVDLAQNHKQLFKQYKTDVRETIDNAMLQRVVPPGTVLKDVTLEYHQDGKTFGRQLGTYSLLVAIPGERELGQTIDVAITDHGYRSVTGVPHPLDLNDASMDELTAIPGIGSSTAGDILVARPHDSAPPVADADLAKFTQ	Download Alignment We filter this alignment to remove sites that have many gaps before running GREMLIN. Date: 2015_01
Length:	564 (528)
Sequences:	151 (98)
Seq/√Len:	4.2

HALSA - Q9HSD6

GREMLIN Results:

Legend: The darker and larger the blue dots, the higher coevolution strength.

Residue pairs sorted by coevolution strength:

i	j	Sco	Prob
339_R	401_E	5.750	0.98
178_V	233_A	5.085	0.95
456_V	485_L	4.056	0.86
336_E	339_R	4.042	0.86
408_I	447_I	4.013	0.85
36_A	177_V	3.573	0.77
245_L	297_I	3.462	0.75
312_F	341_V	3.394	0.74
329_V	334_C	3.384	0.73
168_N	220_A	3.329	0.72
378_H	439_Y	3.306	0.71
444_R	448_D	3.108	0.66
404_M	454_R	3.099	0.66
489_I	520_L	3.086	0.66
38_A	146_A	2.983	0.63
194_T	311_A	2.965	0.62
300_I	308_D	2.903	0.61
304_N	308_D	2.890	0.60
241_Q	311_A	2.879	0.60
412_Q	436_F	2.747	0.56
206_T	416_F	2.682	0.54
245_L	308_D	2.669	0.54
304_N	369_K	2.669	0.54
317_A	394_F	2.628	0.53
263_Y	278_L	2.619	0.52
253_A	292_K	2.615	0.52
177_V	332_E	2.570	0.51
81_V	300_I	2.465	0.48
194_T	241_Q	2.429	0.47
545_A	548_H	2.419	0.46
306_P	365_D	2.407	0.46
314_L	317_A	2.333	0.44
245_L	300_I	2.300	0.43
296_A	299_V	2.300	0.43
263_Y	439_Y	2.246	0.41
439_Y	443_V	2.227	0.41
243_D	285_T	2.226	0.41
501_V	513_G	2.210	0.40
217_S	220_A	2.188	0.40
243_D	311_A	2.182	0.40
88_G	245_L	2.181	0.39
21_H	30_T	2.180	0.39
278_L	310_A	2.179	0.39
467_L	475_T	2.179	0.39
16_V	21_H	2.178	0.39
319_P	394_F	2.177	0.39
520_L	536_S	2.124	0.38
297_I	300_I	2.123	0.38
397_S	401_E	2.108	0.37
34_Y	171_A	2.089	0.37
335_L	401_E	2.076	0.37
440_K	486_L	2.062	0.36
338_V	454_R	2.059	0.36
314_L	398_L	2.057	0.36
421_M	425_G	2.052	0.36
476_F	488_A	1.984	0.34
245_L	296_A	1.981	0.34
294_R	343_E	1.980	0.34
20_A	242_A	1.979	0.34
221_V	377_L	1.944	0.33
16_V	81_V	1.930	0.33
247_F	340_I	1.901	0.32
253_A	312_F	1.901	0.32
36_A	67_V	1.888	0.32
386_E	497_Q	1.864	0.31
531_I	534_I	1.846	0.30
29_S	185_P	1.840	0.30
243_D	304_N	1.838	0.30
317_A	376_L	1.837	0.30
476_F	507_G	1.833	0.30
108_V	433_K	1.831	0.30
319_P	390_H	1.819	0.30
93_P	454_R	1.807	0.29
86_V	249_G	1.793	0.29
116_G	122_A	1.793	0.29
194_T	310_A	1.789	0.29
297_I	308_D	1.745	0.28
290_P	336_E	1.738	0.28
488_A	507_G	1.714	0.27
113_V	137_L	1.694	0.27
60_D	499_I	1.682	0.26
116_G	121_N	1.675	0.26
273_L	462_L	1.672	0.26
16_V	29_S	1.669	0.26
30_T	113_V	1.661	0.26
299_V	405_V	1.645	0.26
220_A	281_M	1.644	0.26
116_G	515_P	1.642	0.26
86_V	241_Q	1.642	0.26
171_A	175_A	1.638	0.25
465_V	477_G	1.625	0.25
8_D	461_V	1.619	0.25
243_D	308_D	1.618	0.25
511_V	553_P	1.609	0.25
392_K	442_D	1.592	0.24
290_P	339_R	1.590	0.24
75_Y	91_A	1.586	0.24
34_Y	167_I	1.582	0.24
80_T	206_T	1.575	0.24
235_H	275_T	1.574	0.24
488_A	512_T	1.555	0.24
203_S	327_L	1.555	0.24
192_M	225_V	1.549	0.23
531_I	538_T	1.548	0.23
195_S	349_P	1.548	0.23
81_V	245_L	1.531	0.23
278_L	439_Y	1.529	0.23
308_D	369_K	1.528	0.23
74_V	287_V	1.515	0.23
389_E	393_Q	1.505	0.23
486_L	507_G	1.501	0.22
387_T	451_M	1.496	0.22
268_E	513_G	1.492	0.22
80_T	414_M	1.476	0.22
204_F	283_P	1.475	0.22
436_F	440_K	1.466	0.22
392_K	443_V	1.448	0.21
249_G	480_L	1.440	0.21
73_F	219_D	1.427	0.21
194_T	243_D	1.422	0.21
29_S	414_M	1.412	0.21
88_G	246_A	1.411	0.21
452_L	462_L	1.407	0.21
241_Q	310_A	1.401	0.20
243_D	310_A	1.400	0.20
367_L	456_V	1.399	0.20
376_L	394_F	1.398	0.20
389_E	514_V	1.396	0.20
504_T	513_G	1.392	0.20
188_L	536_S	1.379	0.20
381_T	398_L	1.378	0.20
110_G	206_T	1.375	0.20
396_H	400_D	1.368	0.20
539_A	542_I	1.368	0.20
45_D	405_V	1.368	0.20
521_N	546_R	1.366	0.20
143_E	245_L	1.358	0.20
35_T	125_Q	1.356	0.20
213_P	417_E	1.353	0.20
285_T	300_I	1.349	0.19
265_G	273_L	1.347	0.19
88_G	243_D	1.341	0.19
91_A	213_P	1.338	0.19
367_L	481_G	1.336	0.19
146_A	150_V	1.333	0.19
344_V	405_V	1.329	0.19
40_V	176_F	1.328	0.19
317_A	398_L	1.326	0.19
162_R	367_L	1.323	0.19
16_V	300_I	1.322	0.19
332_E	505_D	1.322	0.19
376_L	446_T	1.322	0.19
190_C	233_A	1.321	0.19
11_L	330_S	1.315	0.19
38_A	42_A	1.311	0.19
314_L	329_V	1.311	0.19
260_R	302_E	1.305	0.19
270_A	273_L	1.296	0.18
81_V	308_D	1.295	0.18
168_N	217_S	1.287	0.18
225_V	266_I	1.281	0.18
187_Y	365_D	1.275	0.18
31_Y	391_N	1.275	0.18
88_G	105_G	1.274	0.18
436_F	486_L	1.266	0.18
450_A	490_P	1.260	0.18
386_E	443_V	1.257	0.18
396_H	446_T	1.253	0.18
381_T	506_H	1.252	0.18
518_L	523_A	1.247	0.18
267_R	273_L	1.243	0.18
300_I	304_N	1.239	0.17
240_R	419_T	1.239	0.17
474_K	488_A	1.232	0.17
333_E	432_H	1.230	0.17
184_Y	504_T	1.229	0.17
335_L	398_L	1.228	0.17
227_E	408_I	1.211	0.17
275_T	344_V	1.204	0.17
30_T	185_P	1.202	0.17
320_L	324_E	1.201	0.17
178_V	190_C	1.200	0.17
42_A	301_A	1.200	0.17
110_G	517_P	1.197	0.17
74_V	489_I	1.195	0.17
49_V	72_L	1.195	0.17
99_L	309_T	1.192	0.17
59_G	453_Q	1.191	0.17
92_E	272_E	1.189	0.17
30_T	513_G	1.187	0.17
442_D	447_I	1.184	0.17
71_D	542_I	1.181	0.17
56_E	246_A	1.181	0.17
74_V	374_I	1.179	0.16
507_G	512_T	1.176	0.16
243_D	300_I	1.173	0.16
92_E	242_A	1.173	0.16
238_L	266_I	1.171	0.16
339_R	503_I	1.166	0.16
267_R	308_D	1.165	0.16
230_A	331_A	1.161	0.16
168_N	341_V	1.160	0.16
99_L	504_T	1.159	0.16
76_V	227_E	1.156	0.16
285_T	310_A	1.156	0.16
150_V	155_E	1.155	0.16
207_E	342_N	1.152	0.16
263_Y	304_N	1.151	0.16
16_V	31_Y	1.150	0.16
31_Y	419_T	1.150	0.16
213_P	263_Y	1.149	0.16
22_F	221_V	1.149	0.16
81_V	297_I	1.147	0.16
185_P	512_T	1.145	0.16
227_E	503_I	1.145	0.16
281_M	285_T	1.143	0.16
102_L	415_A	1.125	0.16
144_A	166_E	1.110	0.15
206_T	240_R	1.109	0.15
512_T	535_G	1.106	0.15
322_Q	327_L	1.106	0.15
121_N	177_V	1.103	0.15
489_I	499_I	1.095	0.15
396_H	501_V	1.089	0.15
367_L	485_L	1.084	0.15
200_Y	366_R	1.078	0.15
243_D	281_M	1.075	0.15
171_A	388_F	1.072	0.15
304_N	527_E	1.071	0.15
123_G	443_V	1.068	0.15
67_V	250_D	1.061	0.15
81_V	342_N	1.060	0.15
184_Y	329_V	1.053	0.14
20_A	240_R	1.053	0.14
331_A	387_T	1.052	0.14
227_E	447_I	1.051	0.14
179_E	340_I	1.049	0.14
200_Y	275_T	1.049	0.14
243_D	246_A	1.044	0.14
336_E	401_E	1.042	0.14
153_G	273_L	1.041	0.14
230_A	461_V	1.040	0.14
204_F	368_P	1.039	0.14
283_P	368_P	1.039	0.14
194_T	266_I	1.027	0.14
229_Y	234_R	1.027	0.14
29_S	80_T	1.025	0.14
9_V	488_A	1.024	0.14
274_G	464_D	1.023	0.14
249_G	462_L	1.017	0.14
285_T	328_L	1.016	0.14
242_A	304_N	1.016	0.14
332_E	524_S	1.012	0.14
332_E	511_V	1.011	0.14
36_A	414_M	1.011	0.14
348_R	368_P	1.010	0.14
117_V	238_L	1.009	0.14
346_G	477_G	1.007	0.14
284_V	328_L	1.003	0.14
21_H	77_G	1.002	0.14
531_I	542_I	1.001	0.14
16_V	113_V	0.999	0.14
142_I	226_G	0.996	0.14
160_R	166_E	0.996	0.14
440_K	507_G	0.992	0.14
10_T	405_V	0.990	0.14
376_L	520_L	0.986	0.14
294_R	476_F	0.984	0.14
218_A	384_R	0.983	0.13
415_A	475_T	0.981	0.13
494_E	497_Q	0.980	0.13
245_L	287_V	0.974	0.13
56_E	88_G	0.970	0.13
194_T	394_F	0.970	0.13
86_V	311_A	0.970	0.13
333_E	465_V	0.969	0.13
9_V	454_R	0.969	0.13
210_Y	242_A	0.969	0.13
322_Q	387_T	0.967	0.13
45_D	149_L	0.965	0.13
74_V	390_H	0.964	0.13
348_R	460_T	0.959	0.13
96_V	412_Q	0.956	0.13
259_L	440_K	0.954	0.13
11_L	76_V	0.953	0.13
433_K	482_T	0.948	0.13
246_A	308_D	0.942	0.13
211_G	327_L	0.937	0.13
151_D	338_V	0.936	0.13
92_E	340_I	0.936	0.13
96_V	549_D	0.931	0.13
187_Y	477_G	0.930	0.13
39_L	44_V	0.928	0.13
343_E	511_V	0.927	0.13
188_L	466_T	0.927	0.13
21_H	113_V	0.926	0.13
229_Y	487_V	0.922	0.13
56_E	405_V	0.921	0.13
516_H	523_A	0.919	0.13
221_V	514_V	0.916	0.13
521_N	547_P	0.909	0.12
235_H	310_A	0.909	0.12
441_T	445_E	0.908	0.12
195_S	311_A	0.908	0.12
22_F	504_T	0.907	0.12
110_G	465_V	0.905	0.12
77_G	376_L	0.904	0.12
540_G	549_D	0.904	0.12
21_H	29_S	0.902	0.12
316_S	342_N	0.902	0.12
250_D	433_K	0.897	0.12
388_F	523_A	0.892	0.12
477_G	488_A	0.892	0.12
243_D	317_A	0.892	0.12
443_V	499_I	0.891	0.12
36_A	211_G	0.888	0.12
298_R	344_V	0.886	0.12
275_T	511_V	0.883	0.12
121_N	125_Q	0.880	0.12
255_N	258_A	0.879	0.12
314_L	334_C	0.878	0.12
410_I	486_L	0.878	0.12
235_H	243_D	0.878	0.12
199_A	243_D	0.877	0.12
197_G	372_P	0.876	0.12
251_G	343_E	0.874	0.12
286_I	297_I	0.874	0.12
316_S	451_M	0.872	0.12
487_V	553_P	0.871	0.12
195_S	242_A	0.868	0.12
86_V	195_S	0.868	0.12
441_T	511_V	0.867	0.12
108_V	221_V	0.866	0.12
540_G	548_H	0.866	0.12
243_D	273_L	0.866	0.12
476_F	486_L	0.862	0.12
12_V	335_L	0.862	0.12
287_V	397_S	0.860	0.12
41_D	169_R	0.859	0.12
28_I	190_C	0.859	0.12
9_V	338_V	0.854	0.12
394_F	398_L	0.854	0.12
462_L	479_Q	0.854	0.12
226_G	269_V	0.853	0.12
16_V	263_Y	0.853	0.12
387_T	391_N	0.852	0.12
84_K	433_K	0.850	0.12
44_V	454_R	0.848	0.12
221_V	416_F	0.845	0.12
206_T	490_P	0.845	0.12
535_G	539_A	0.844	0.12
235_H	311_A	0.842	0.12
14_G	90_P	0.842	0.12
137_L	427_D	0.838	0.12
22_F	67_V	0.838	0.12
309_T	349_P	0.836	0.12
322_Q	405_V	0.836	0.12
223_T	247_F	0.830	0.11
165_Q	461_V	0.830	0.11
40_V	389_E	0.830	0.11
10_T	52_H	0.827	0.11
405_V	447_I	0.824	0.11
317_A	378_H	0.821	0.11
342_N	372_P	0.820	0.11
12_V	257_D	0.820	0.11
170_W	378_H	0.818	0.11
29_S	81_V	0.815	0.11
34_Y	408_I	0.814	0.11
38_A	44_V	0.812	0.11
188_L	544_V	0.812	0.11
165_Q	446_T	0.811	0.11
39_L	185_P	0.810	0.11
88_G	308_D	0.808	0.11
316_S	404_M	0.808	0.11
278_L	281_M	0.806	0.11
105_G	485_L	0.804	0.11
215_F	311_A	0.804	0.11
467_L	511_V	0.802	0.11
16_V	414_M	0.802	0.11
43_G	486_L	0.801	0.11
238_L	377_L	0.799	0.11
278_L	285_T	0.797	0.11
314_L	394_F	0.795	0.11
329_V	377_L	0.794	0.11
190_C	440_K	0.791	0.11
21_H	394_F	0.790	0.11
398_L	405_V	0.788	0.11
105_G	504_T	0.786	0.11
194_T	317_A	0.783	0.11
444_R	504_T	0.781	0.11
461_V	492_E	0.781	0.11
118_G	188_L	0.781	0.11
167_I	226_G	0.778	0.11
322_Q	331_A	0.775	0.11
370_L	481_G	0.775	0.11
22_F	519_D	0.774	0.11
236_F	399_L	0.774	0.11
505_D	513_G	0.773	0.11
241_Q	317_A	0.773	0.11
170_W	319_P	0.771	0.11
381_T	476_F	0.771	0.11
220_A	511_V	0.770	0.11
338_V	514_V	0.770	0.11
291_E	454_R	0.770	0.11
21_H	112_P	0.768	0.11
451_M	503_I	0.768	0.11
175_A	465_V	0.765	0.11
8_D	438_Q	0.764	0.11
206_T	210_Y	0.764	0.11
338_V	400_D	0.763	0.11
302_E	323_E	0.762	0.11
39_L	436_F	0.761	0.11
249_G	295_D	0.758	0.11
346_G	404_M	0.756	0.11
209_M	384_R	0.755	0.11
67_V	504_T	0.754	0.11
256_P	299_V	0.753	0.11
22_F	76_V	0.752	0.11
514_V	536_S	0.751	0.11
433_K	500_D	0.750	0.11
38_A	506_H	0.750	0.11
203_S	254_P	0.750	0.11
470_H	485_L	0.747	0.11
311_A	452_L	0.747	0.11
74_V	220_A	0.746	0.11
175_A	332_E	0.745	0.11
97_R	248_G	0.744	0.10
349_P	456_V	0.744	0.10
408_I	442_D	0.744	0.10
292_K	552_P	0.743	0.10
116_G	240_R	0.743	0.10
427_D	504_T	0.742	0.10
11_L	274_G	0.742	0.10
392_K	408_I	0.742	0.10
519_D	522_D	0.742	0.10
73_F	404_M	0.740	0.10
266_I	269_V	0.740	0.10
199_A	311_A	0.738	0.10
537_S	542_I	0.738	0.10
73_F	105_G	0.738	0.10
18_E	277_H	0.737	0.10
415_A	421_M	0.736	0.10
418_G	440_K	0.736	0.10
32_P	399_L	0.735	0.10
419_T	448_D	0.735	0.10
167_I	408_I	0.734	0.10
222_V	266_I	0.732	0.10
179_E	385_A	0.732	0.10
309_T	482_T	0.731	0.10
138_A	141_D	0.730	0.10
54_I	451_M	0.727	0.10
240_R	444_R	0.726	0.10
210_Y	240_R	0.726	0.10
96_V	259_L	0.725	0.10
142_I	245_L	0.724	0.10
249_G	495_L	0.724	0.10
263_Y	308_D	0.721	0.10
195_S	304_N	0.721	0.10
185_P	414_M	0.720	0.10
39_L	331_A	0.720	0.10
204_F	452_L	0.720	0.10
283_P	452_L	0.720	0.10
151_D	463_K	0.719	0.10
195_S	298_R	0.719	0.10
221_V	284_V	0.718	0.10
339_R	343_E	0.717	0.10
105_G	144_A	0.716	0.10
84_K	172_A	0.715	0.10
327_L	367_L	0.714	0.10
67_V	287_V	0.711	0.10
149_L	222_V	0.708	0.10
528_L	538_T	0.708	0.10
377_L	413_V	0.708	0.10
9_V	138_A	0.707	0.10
367_L	455_V	0.707	0.10
482_T	506_H	0.705	0.10
80_T	117_V	0.705	0.10
29_S	480_L	0.705	0.10
538_T	541_D	0.703	0.10
138_A	173_K	0.701	0.10
43_G	532_P	0.698	0.10
524_S	550_S	0.697	0.10
79_M	405_V	0.697	0.10
135_D	326_H	0.697	0.10
141_D	162_R	0.696	0.10
76_V	235_H	0.694	0.10
377_L	446_T	0.694	0.10
81_V	304_N	0.693	0.10
400_D	465_V	0.693	0.10
144_A	160_R	0.693	0.10
70_A	413_V	0.691	0.10
97_R	218_A	0.689	0.10
263_Y	286_I	0.688	0.10
171_A	314_L	0.688	0.10
68_A	289_Y	0.687	0.10
10_T	292_K	0.687	0.10
377_L	421_M	0.686	0.10
392_K	447_I	0.686	0.10
188_L	470_H	0.685	0.10
31_Y	236_F	0.685	0.10
412_Q	507_G	0.685	0.10
195_S	241_Q	0.685	0.10
242_A	246_A	0.684	0.10
86_V	412_Q	0.683	0.10
298_R	511_V	0.683	0.10
35_T	137_L	0.683	0.10
440_K	488_A	0.680	0.10
173_K	535_G	0.680	0.10
175_A	257_D	0.677	0.10
470_H	475_T	0.677	0.10
57_L	120_E	0.676	0.10
84_K	439_Y	0.676	0.10
398_L	487_V	0.675	0.10
222_V	269_V	0.675	0.10
96_V	201_R	0.674	0.10
185_P	477_G	0.673	0.10
70_A	314_L	0.673	0.10
88_G	148_D	0.673	0.10
192_M	374_I	0.672	0.10
199_A	213_P	0.670	0.10
88_G	437_K	0.669	0.10
110_G	477_G	0.669	0.10
195_S	199_A	0.663	0.10
261_D	531_I	0.663	0.10
143_E	297_I	0.662	0.10
113_V	134_F	0.662	0.10
42_A	304_N	0.662	0.10
77_G	192_M	0.661	0.10
335_L	501_V	0.660	0.10
69_D	487_V	0.659	0.10
64_F	374_I	0.659	0.10
432_H	487_V	0.658	0.10
295_D	440_K	0.654	0.10
317_A	412_Q	0.653	0.10
534_I	539_A	0.653	0.10
123_G	381_T	0.652	0.10
74_V	336_E	0.652	0.10
194_T	285_T	0.652	0.10
185_P	488_A	0.652	0.10
266_I	310_A	0.651	0.09
414_M	477_G	0.651	0.09
518_L	528_L	0.651	0.09
290_P	485_L	0.650	0.09
120_E	233_A	0.649	0.09
367_L	402_G	0.648	0.09
393_Q	447_I	0.648	0.09
278_L	328_L	0.647	0.09
372_P	419_T	0.646	0.09
154_L	173_K	0.643	0.09
49_V	431_N	0.642	0.09
275_T	281_M	0.639	0.09
238_L	243_D	0.638	0.09
281_M	284_V	0.638	0.09
210_Y	490_P	0.638	0.09
476_F	512_T	0.637	0.09
165_Q	212_D	0.636	0.09
74_V	225_V	0.636	0.09
184_Y	463_K	0.636	0.09
43_G	341_V	0.636	0.09
120_E	265_G	0.633	0.09
152_N	257_D	0.628	0.09
135_D	262_L	0.628	0.09
226_G	233_A	0.627	0.09
263_Y	378_H	0.627	0.09
99_L	519_D	0.626	0.09
77_G	527_E	0.626	0.09
72_L	338_V	0.625	0.09
229_Y	417_E	0.624	0.09
184_Y	386_E	0.623	0.09
123_G	246_A	0.622	0.09
327_L	448_D	0.622	0.09
148_D	168_N	0.622	0.09
28_I	473_G	0.621	0.09
87_G	159_D	0.620	0.09
124_A	443_V	0.620	0.09
71_D	466_T	0.620	0.09
392_K	396_H	0.615	0.09
285_T	308_D	0.615	0.09
117_V	242_A	0.615	0.09
177_V	288_D	0.614	0.09
476_F	500_D	0.613	0.09
50_T	70_A	0.613	0.09
227_E	293_S	0.613	0.09
534_I	551_A	0.612	0.09
142_I	188_L	0.611	0.09
34_Y	509_R	0.611	0.09
306_P	477_G	0.611	0.09
396_H	447_I	0.610	0.09
138_A	339_R	0.607	0.09
183_N	466_T	0.607	0.09
17_D	282_N	0.607	0.09
17_D	406_R	0.607	0.09
85_Y	406_R	0.607	0.09
37_G	85_Y	0.607	0.09
17_D	468_E	0.607	0.09
174_G	282_N	0.607	0.09
85_Y	468_E	0.607	0.09
174_G	406_R	0.607	0.09
174_G	468_E	0.607	0.09
37_G	468_E	0.607	0.09
83_G	174_G	0.607	0.09
37_G	406_R	0.607	0.09
37_G	282_N	0.607	0.09
37_G	174_G	0.607	0.09
37_G	83_G	0.607	0.09
85_Y	174_G	0.607	0.09
406_R	468_E	0.607	0.09
85_Y	282_N	0.607	0.09
83_G	282_N	0.607	0.09
282_N	406_R	0.607	0.09
17_D	37_G	0.607	0.09
282_N	468_E	0.607	0.09
17_D	83_G	0.607	0.09
17_D	85_Y	0.607	0.09
17_D	174_G	0.607	0.09
83_G	468_E	0.607	0.09
83_G	406_R	0.607	0.09
262_L	482_T	0.605	0.09
177_V	461_V	0.603	0.09
185_P	447_I	0.602	0.09
505_D	528_L	0.602	0.09
105_G	169_R	0.602	0.09
20_A	206_T	0.601	0.09
209_M	244_I	0.601	0.09
137_L	275_T	0.600	0.09
234_R	487_V	0.600	0.09
115_F	177_V	0.599	0.09
27_Y	368_P	0.596	0.09
179_E	184_Y	0.596	0.09
125_Q	511_V	0.595	0.09
400_D	477_G	0.595	0.09
521_N	548_H	0.595	0.09
167_I	446_T	0.595	0.09
263_Y	344_V	0.593	0.09
242_A	314_L	0.592	0.09
514_V	520_L	0.590	0.09
244_I	377_L	0.590	0.09
317_A	331_A	0.589	0.09
164_N	278_L	0.589	0.09
128_E	494_E	0.589	0.09
529_T	549_D	0.589	0.09
310_A	387_T	0.589	0.09
206_T	414_M	0.588	0.09
104_D	445_E	0.588	0.09
21_H	86_V	0.586	0.09
185_P	207_E	0.585	0.09
376_L	439_Y	0.584	0.09
91_A	415_A	0.582	0.09
35_T	135_D	0.582	0.09
243_D	278_L	0.581	0.09
448_D	504_T	0.581	0.09
100_A	394_F	0.579	0.09
173_K	541_D	0.578	0.09
177_V	389_E	0.577	0.09
148_D	160_R	0.577	0.09
319_P	517_P	0.577	0.09
142_I	233_A	0.576	0.09
134_F	234_R	0.576	0.09
21_H	441_T	0.575	0.09
116_G	140_A	0.574	0.09
253_A	377_L	0.574	0.09
393_Q	408_I	0.574	0.09
87_G	105_G	0.573	0.09
195_S	246_A	0.572	0.09
104_D	420_E	0.571	0.09
22_F	537_S	0.571	0.09
92_E	240_R	0.570	0.09
179_E	189_I	0.570	0.09
165_Q	218_A	0.570	0.09
278_L	378_H	0.568	0.09
281_M	310_A	0.568	0.09
291_E	464_D	0.568	0.09
73_F	107_S	0.568	0.09
36_A	398_L	0.567	0.09
447_I	479_Q	0.565	0.09
312_F	482_T	0.564	0.09
521_N	550_S	0.562	0.09
281_M	309_T	0.560	0.09
153_G	403_L	0.560	0.09
188_L	416_F	0.559	0.09
147_Y	485_L	0.559	0.09
56_E	155_E	0.557	0.09
339_R	392_K	0.557	0.09
546_R	552_P	0.556	0.09
213_P	244_I	0.556	0.09
108_V	250_D	0.555	0.09
194_T	398_L	0.555	0.09
444_R	486_L	0.555	0.09
143_E	300_I	0.555	0.09
322_Q	328_L	0.554	0.09
221_V	364_P	0.554	0.09
80_T	308_D	0.553	0.09
364_P	477_G	0.552	0.09
498_T	511_V	0.551	0.09
135_D	164_N	0.550	0.09
419_T	444_R	0.550	0.09
9_V	425_G	0.549	0.08
201_R	341_V	0.549	0.08
10_T	73_F	0.548	0.08
49_V	515_P	0.547	0.08
248_G	386_E	0.546	0.08
81_V	341_V	0.546	0.08
306_P	499_I	0.545	0.08
241_Q	285_T	0.544	0.08
550_S	553_P	0.544	0.08
421_M	513_G	0.543	0.08
298_R	331_A	0.543	0.08
420_E	502_A	0.543	0.08
271_P	399_L	0.542	0.08
105_G	166_E	0.542	0.08
243_D	378_H	0.542	0.08
387_T	503_I	0.542	0.08
215_F	534_I	0.541	0.08
218_A	269_V	0.540	0.08
180_Q	475_T	0.540	0.08
168_N	460_T	0.540	0.08
30_T	189_I	0.539	0.08
453_Q	463_K	0.539	0.08
10_T	304_N	0.538	0.08
67_V	249_G	0.538	0.08
93_P	439_Y	0.537	0.08
123_G	455_V	0.536	0.08
400_D	495_L	0.534	0.08
16_V	185_P	0.534	0.08
49_V	79_M	0.533	0.08
110_G	117_V	0.532	0.08
311_A	462_L	0.532	0.08
343_E	399_L	0.532	0.08
317_A	377_L	0.532	0.08
122_A	515_P	0.531	0.08
141_D	302_E	0.530	0.08
160_R	169_R	0.530	0.08
177_V	304_N	0.528	0.08
369_K	527_E	0.528	0.08
77_G	246_A	0.528	0.08
285_T	311_A	0.528	0.08
295_D	513_G	0.527	0.08
250_D	295_D	0.527	0.08
244_I	281_M	0.527	0.08
465_V	501_V	0.527	0.08
378_H	388_F	0.527	0.08
116_G	460_T	0.527	0.08
137_L	312_F	0.526	0.08
245_L	370_L	0.526	0.08
116_G	270_A	0.525	0.08
75_Y	263_Y	0.525	0.08
12_V	100_A	0.525	0.08
458_P	553_P	0.525	0.08
105_G	498_T	0.524	0.08
185_P	188_L	0.524	0.08
52_H	66_D	0.524	0.08
319_P	408_I	0.523	0.08
30_T	170_W	0.523	0.08
127_M	286_I	0.523	0.08
235_H	241_Q	0.522	0.08
256_P	511_V	0.522	0.08
59_G	165_Q	0.522	0.08
22_F	136_F	0.521	0.08
229_Y	236_F	0.520	0.08
122_A	177_V	0.519	0.08
234_R	333_E	0.519	0.08
301_A	314_L	0.518	0.08
213_P	467_L	0.518	0.08
200_Y	466_T	0.518	0.08
190_C	536_S	0.518	0.08
408_I	501_V	0.518	0.08
39_L	253_A	0.517	0.08
100_A	417_E	0.517	0.08
86_V	194_T	0.516	0.08
346_G	454_R	0.515	0.08
548_H	553_P	0.515	0.08
482_T	493_R	0.515	0.08
219_D	473_G	0.514	0.08
77_G	515_P	0.514	0.08
91_A	96_V	0.513	0.08
136_F	476_F	0.512	0.08
81_V	296_A	0.510	0.08
170_W	439_Y	0.510	0.08
260_R	550_S	0.510	0.08
121_N	381_T	0.508	0.08
88_G	166_E	0.508	0.08
87_G	245_L	0.508	0.08
235_H	388_F	0.507	0.08
201_R	454_R	0.506	0.08
154_L	223_T	0.503	0.08
81_V	526_D	0.502	0.08
189_I	250_D	0.502	0.08
96_V	453_Q	0.501	0.08
38_A	333_E	0.501	0.08
88_G	472_D	0.500	0.08
249_G	259_L	0.500	0.08
304_N	480_L	0.500	0.08

Legend: The i and j are positions as given in the UniProt sequence. Only predictions with Prob ≥ 0.7 are listed. For all 3L/2 predictions, click on one of the links below.

Sco = ((raw_sco - min_sco)/(avg_sco - min_sco))/2 + 0.5
Prob = P(contact | Sco, seq80/√len)
seq80 = effective number of sequences, after reducing redundancy to 80% identity

Text file of predictions (all 3L/2 predictions)
Generate restraints for ROSETTA Structure Modeling
Upload PDB model overlay contacts on the model

HHsearch Results:

Legend: GREMLIN results (Prob ≥ 0.7) overlaid on top PDB hits. The grey/red filled circles underneath are pdb residue contacts (min distance < 5 Angstroms). The shade of the circles is based on the top 10 (or top 20 if e-value < 1E-20) HHsearch results which uses the overall probability and per-site alignment prob. Inter oligomeric contacts in the pdb are in shades of red.

PDB	Chains	Cov	%	HHΔ
4jc0A	1	0.7376	100	0.866	Contact Map
2qgqA	1	0.4699	100	0.884	Contact Map
1oltA	1	0.6312	99.6	0.936	Contact Map
3iixA	1	0.5922	99.5	0.94	Contact Map
4u0oB	1	0.4663	99.5	0.941	Contact Map
1r30A	2	0.5284	99.5	0.941	Contact Map
3t7vA	1	0.5532	99.5	0.943	Contact Map
4wcxA	1	0.6684	99.4	0.944	Contact Map
4rtbA	2	0.6365	99.3	0.947	Contact Map
4fhdA	1	0.4876	99.2	0.949	Contact Map

Sequence Conservation (Image Generated using WebLogo v3)

Legend: Color is used to show Hydrophobicity (Blue: Hydrophilic, Green: Neutral and Black: Hydrophobic). Amount of gaps is represented by width.

Page generated in 0.014 seconds.